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A systematic analysis of the genomic features involved in specificities of transcription factor binding
Raphaël Romero
,
Jean-Michel Marin
,
Sophie Lèbre
,
Charles-Henri Lecellier
,
Laurent Brehelin
JOBIM 2021 - 21èmes Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2021, Paris, France
Conference papers
hal-03385869v1
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Modélisation de l'expression des gènes à partir de données de séquence ADN
May Taha
,
Chloé Bessière
,
Florent Petitprez
,
Jimmy Vandel
,
Jean-Michel Marin
JdS 2017, 49èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2017, Avignon, France
Conference papers
hal-02068289v1
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Méthodes bioinformatiques pour la prédiction de la fonction des gènes : identification des domaines protéiques dans les génomes de pathogènes
Laurent Brehelin
JFMPM: Journées Franco-Maghrébines de Parasitologie-Mycologie, Oct 2015, Tunis, Tunisie
Conference papers
lirmm-01397412v1
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Recherche de motifs de régulation à l'aide de donner d'expression
Laurent Brehelin
SeqBio, Nov 2014, Montpellier, France
Conference papers
lirmm-01397396v1
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Identification of Regulatory Elements from Gene Expression Data without Clustering
Mathieu Lajoie
,
Olivier Gascuel
,
Laurent Brehelin
JOBIM: Journées Ouvertes Biologie, Informatique, Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. pp.89-90
Conference papers
lirmm-00725490v1
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Fitting Hidden Markov Models of Protein Domains to a Target Species
Nicolas Terrapon
,
Olivier Gascuel
,
Laurent Brehelin
JOBIM: Journées Ouvertes Biologie, Informatique, Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. pp.193-194
Conference papers
lirmm-00725501v1
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Détection de nouveaux domaines protéiques par co-occurence : Application à P. falciparum
Nicolas Terrapon
,
Olivier Gascuel
,
Laurent Brehelin
JOBIM'09 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2009, Nantes, France. pp.43-48
Conference papers
lirmm-00414954v1
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Estimation of Sequence Errors and Prediction Capacity in Transcriptomic and DNA-Protein Interaction Assays
Nicolas Philippe
,
Anthony Boureux
,
Laurent Brehelin
,
Jorma Tarhio
,
Thérèse Commes
SMPGD'09: Statistical Methods for Post-genomic Data Workshop, Jan 2009, Paris, France. pp.3
Conference papers
lirmm-00375005v1
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GONNA: a Gene Ontology Nearest Neighbor Approach for the Functional Prediction of P.falciparum Orphan Genes
Laurent Brehelin
,
Olivier Gascuel
International Conference on the Bioinformatics of African Pathogens and Disease Vectors, May 2007, Nairobi, Kenya
Conference papers
lirmm-00195264v1
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Bias and Benefit Induced by Intra-Species Paralogy in Guilt by Association Methods to Predict Protein Function
Laurent Brehelin
,
Olivier Gascuel
SMPGD'07: Statistical Methods for Post-Genomic Data, Jan 2007, Paris, France
Conference papers
lirmm-00195262v1
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A new type of Hidden Markov Models to predict complex domain architecture in protein sequences
Raluca Uricaru
,
Laurent Brehelin
,
Eric Rivals
JOBIM: Journées Ouvertes Biologie, Informatique, Mathématiques, Jul 2007, Marseille, France. pp.97-102
Conference papers
lirmm-00195493v1
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Bias and benefit induced by intra-species homologies in guilt by association methods to predict protein function
Laurent Brehelin
,
Olivier Gascuel
JOBIM'06 : Journées ouvertes de Biologie, Informatique, Mathématiques, Jul 2006, pp.59-66
Conference papers
lirmm-00113353v1
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A new type of Hidden Markov Models to predict complex motif organization in protein sequences
Raluca Uricaru
,
Laurent Brehelin
,
Eric Rivals
Integrative Post-Genomics, 2006, Lyon, pp.43
Conference papers
lirmm-00120171v1
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Clustering Gene Expression Series with Prior Knowledge
Laurent Brehelin
WABI'05: 5th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, Oct 2005, Mallorca, Spain. pp.27-38, ⟨10.1007/11557067_3⟩
Conference papers
lirmm-00327792v1
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Evaluation des Classes d'une Hiérarchie par la Prise en Compte des Répétitions Expérimentales
Laurent Brehelin
,
Olivier C. Martin
JOBIM: Journées Ouvertes Biologie, Informatique, Mathématiques, Jul 2005, Lyon, France. pp.125-134
Conference papers
lirmm-00106135v1
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Une Approche Bayésienne pour la Classification de Cinétiques d'Expression de Gènes
Laurent Brehelin
JOBIM: Journées Ouvertes Biologie, Informatique, Mathématiques, Jun 2004, Montreal, Canada
Conference papers
lirmm-00108938v1
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Outlier Detection in Gene Expression Data Improves Classification Accuracy
Laurent Brehelin
,
F. Major
IRIS Machine Learning Workshop, 2004
Conference papers
lirmm-00108666v1
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