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Antibody-secreting cell repertoires hold high-affinity anti-rocuronium specificities that can induce anaphylaxis in vivo
Alice Dejoux
,
Qianqian Zhu
,
Adam Woolfe
,
Ophélie Godon
,
Sami Ellouze
et al.
Article dans une revue
pasteur-04961215
v1
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Accurate Detection of Convergent Mutations in Large Protein Alignments With ConDor
Marie Morel
,
Anna Zhukova
,
Frédéric Lemoine
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
pasteur-04601784
v2
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BioFlow-Insight: facilitating reuse of Nextflow workflows with structure reconstruction and visualization
George Marchment
,
Bryan Brancotte
,
Marie Schmit
,
Frédéric Lemoine
,
Sarah Cohen-Boulakia
Article dans une revue
pasteur-04670359
v1
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The Bayesian Phylogenetic Bootstrap and its Application to Short Trees and Branches
Frédéric Lemoine
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
pasteur-04967436
v1
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Distinct evolution of SARS-CoV-2 Omicron XBB and BA.2.86/JN.1 lineages combining increased fitness and antibody evasion
Delphine Planas
,
Isabelle Staropoli
,
Vincent Michel
,
Frederic Lemoine
,
Flora Donati
et al.
Article dans une revue
pasteur-04530809
v1
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Integron cassettes commonly integrate into bacterial genomes via widespread non-classical attG sites
Céline Loot
,
Gael A Millot
,
Egill Richard
,
Eloi Littner
,
Claire Vit
et al.
Article dans une revue
pasteur-04384854
v1
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Robustness of Felsenstein’s Versus Transfer Bootstrap Supports With Respect to Taxon Sampling
Paul Zaharias
,
Frédéric Lemoine
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
hal-04296245
v1
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BioConvert: a comprehensive format converter for life sciences
Hugo Caro
,
Sulyvan Dollin
,
Anne Biton
,
Bryan Brancotte
,
Dimitri Desvillechabrol
et al.
Article dans une revue
pasteur-04279554
v2
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In-Depth Characterization of Full-Length Archived Viral Genomes after Nine Years of Posttreatment HIV Control
Pauline Trémeaux
,
Frédéric Lemoine
,
Adeline Mélard
,
Marine Gousset
,
Faroudy Boufassa
et al.
Article dans une revue
pasteur-04296534
v1
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Reprohackathons: promoting reproducibility in bioinformatics through training
Thomas Cokelaer
,
Sarah Cohen-Boulakia
,
Frédéric Lemoine
Article dans une revue
hal-04402365
v1
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APOBEC3F Is a Mutational Driver of the Human Monkeypox Virus Identified in the 2022 Outbreak
Rodolphe Suspène
,
Kyle A Raymond
,
Laetitia Boutin
,
Sophie Guillier
,
Frédéric Lemoine
et al.
Article dans une revue
pasteur-04328451
v1
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Developing and reusing bioinformatics data analysis pipelines using scientific workflow systems
Marine Djaffardjy
,
George Marchment
,
Clémence Sebe
,
Raphaël Blanchet
,
Khalid Belhajjame
et al.
Article dans une revue
hal-04037221
v2
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Considerable escape of SARS-CoV-2 Omicron to antibody neutralization
Delphine Planas
,
Nell Saunders
,
Piet Maes
,
Florence Guivel-Benhassine
,
Cyril Planchais
et al.
Article dans une revue
pasteur-03654259
v1
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Deep Learning From Phylogenies To Uncover The Epidemiological Dynamics Of Outbreaks
J. Voznica
,
A. Zhukova
,
V. Boskova
,
E. Saulnier
,
F. Lemoine
et al.
Article dans une revue
hal-03861407
v1
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Deciphering RNA G-quadruplex function during the early steps of HIV-1 infection
Samir Amrane
,
Chloé Jaubert
,
Amina Bedrat
,
Tiffany Rundstadler
,
Patricia Recordon-Pinson
et al.
Article dans une revue
hal-03874577
v1
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Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2
Anna Zhukova
,
Luc Blassel
,
Frédéric Lemoine
,
Marie Morel
,
Jakub Voznica
et al.
Article dans une revue
pasteur-03038752
v1
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COVID-Align: Accurate online alignment of hCoV-19 genomes using a profile HMM
Frédéric Lemoine
,
Luc Blassel
,
Jakub Voznica
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
pasteur-02995703
v1
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Gotree/Goalign: toolkit and Go API to facilitate the development of phylogenetic workflows
Frédéric Lemoine
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
pasteur-03427582
v1
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Genomic Epidemiology of 2015–2016 Zika Virus Outbreak in Cape Verde
Oumar Faye
,
Maria de Lourdes Monteiro
,
Bram Vrancken
,
Matthieu Prot
,
Sebastian Lequime
et al.
Article dans une revue
pasteur-02862296
v1
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Distribution and asymptotic behavior of the phylogenetic transfer distance
Miraine Dávila Felipe
,
Jean-Baka Domelevo Entfellner
,
Frédéric Lemoine
,
Jakub Truszkowski
,
Olivier Gascuel
Article dans une revue
pasteur-02404376
v1
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NGPhylogeny.fr: new generation phylogenetic services for non-specialists
Frédéric Lemoine
,
Damien Correia
,
Vincent Lefort
,
Olivia Doppelt-Azeroual
,
Fabien Mareuil
et al.
Article dans une revue
hal-02341225
v1
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SpliceLauncher: a tool for detection, annotation and relative quantification of alternative junctions from RNAseq data
Raphaël Leman
,
Valentin Harter
,
Alexandre Atkinson
,
Grégoire Davy
,
Antoine Rousselin
et al.
Article dans une revue
pasteur-02862337
v1
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Identification of novel recurrent ETV6-IgH fusions in primary central nervous system lymphoma
Aurélie Bruno
,
Karim Labreche
,
Mailys Daniau
,
Blandine Boisselier
,
Guillaume Gauchotte
et al.
Article dans une revue
pasteur-02862388
v1
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Renewing Felsenstein’s phylogenetic bootstrap in the era of big data
Fréderic Lemoine
,
Jean-Baka Domelevo Entfellner
,
Eduan K. Wilkinson
,
Damien Correia
,
Miraine Dávila Felipe
et al.
Article dans une revue
lirmm-02078445
v1
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Scientific workflows for computational reproducibility in the life sciences: Status, challenges and opportunities
Sarah Cohen-Boulakia
,
Khalid Belhajjame
,
Olivier Collin
,
Jérôme Chopard
,
Christine Froidevaux
et al.
Article dans une revue
hal-01516082
v1
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Detecting splicing patterns in genes involved in hereditary breast and ovarian cancer
Grégoire Davy
,
Antoine Rousselin
,
Nicolas Goardon
,
Laurent Castéra
,
Valentin Harter
et al.
Article dans une revue
hal-02336114
v1
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Molecular analyses of juvenile granulosa cell tumors bearing AKT1 mutations provide insights into tumor biology and therapeutic leads.
Aurélie Auguste
,
Laurianne Bessière
,
Anne-Laure Todeschini
,
Sandrine Caburet
,
Sabine Sarnacki
et al.
Article dans une revue
hal-01266741
v1
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Amplicon rearrangements during the extrachromosomal and intrachromosomal amplification process in a glioma
Nicolas Vogt
,
Anne Gibaud
,
Fréderic Lemoine
,
Pierre de La Grange
,
Michelle Debatisse
et al.
Article dans une revue
hal-01332776
v1
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Lipocalin 2, the TNF-like receptor TWEAKR and its ligand TWEAK act downstream of NFAT1 to regulate breast cancer cell invasion.
Benoît Gaudineau
,
Marjorie Fougère
,
Frédéric Guaddachi
,
Frédéric Lemoine
,
Pierre de La Grange
et al.
Article dans une revue
inserm-00715876
v1
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GenoQuery: a new querying module for functional annotation in a genomic warehouse.
Frédéric Lemoine
,
Bernard Labedan
,
Christine Froidevaux
Article dans une revue
hal-00297225
v1
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SynteBase/SynteView: a tool to visualize gene order conservation in prokaryotic genomes.
Frederic Lemoine
,
Bernard Labedan
,
Olivier Lespinet
Article dans une revue
hal-00354657
v1
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The multiple facets of homology and their use in comparative genomics to study the evolution of genes, genomes, and species.
Stéphane Descorps-Declère
,
Frédéric Lemoine
,
Quentin Sculo
,
Olivier Lespinet
,
Bernard Labedan
Article dans une revue
istex
hal-00195158
v1
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Assessing the evolutionary rate of positional orthologous genes in prokaryotes using synteny data.
Frederic Lemoine
,
Olivier Lespinet
,
Bernard Labedan
Article dans une revue
hal-00194466
v1
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