Léo Gerlin

Publications

Article dans une revue (9)

Quantifying supply and demand in the pea aphid-Buchnera symbiosis reveals the metabolic Achilles’ heels of this interaction Léo Gerlin,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Yohann Quivet,Patrice Baa-Puyouletet al. Metabolic Engineering, 2025, 92, pp.284 - 299. ⟨10.1016/j.ymben.2025.07.011⟩ Article dans une revue hal-05368482v1
ArtSymbioCyc, a metabolic network database collection dedicated to arthropod symbioses: a case study, the tripartite cooperation in Sipha maydis Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Nicolas Parisot,Sergio Peignier,François Renozet al. mSystems, 2025, 10 (4), ⟨10.1128/msystems.00140-25⟩ Article dans une revue hal-04987746v1
Unraveling the in planta population dynamics of the plant pathogen Ralstonia pseudosolanacearum by mathematical modeling Caroline Baroukh,Léo Gerlin,Antoine Escourrou,Stéphane Genin New Phytologist, 2025, 246, pp.251-261. ⟨10.1111/nph.20216⟩ Article dans une revue hal-04782291v1
PacBio Hi-Fi genome assembly of Sipha maydis, a model for the study of multipartite mutualism in insects François Renoz,Nicolas Parisot,Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Samir Fakhouret al. Scientific Data , 2024, 11 (1), pp.450. ⟨10.1038/s41597-024-03297-x⟩ Article dans une revue hal-04632873v1
A multi-organ metabolic model of tomato predicts plant responses to nutritional and genetic perturbations Léo Gerlin,Ludovic Cottret,Antoine Escourrou,Stéphane Genin,Caroline Baroukh Plant Physiology, 2022, 188 (3), pp.1709-1723. ⟨10.1093/plphys/kiab548⟩ Article dans une revue hal-03727243v1
Polyamines: double agents in disease and plant immunity Léo Gerlin,Caroline Baroukh,Stéphane Genin Trends in Plant Science, 2021, 26 (10), pp.1061-1071. ⟨10.1016/j.tplants.2021.05.007⟩ Article dans une revue hal-03259585v1
Unravelling physiological signatures of tomato bacterial wilt and xylem metabolites exploited by Ralstonia solanacearum Léo Gerlin,Antoine Escourrou,Cédric Cassan,Felicià Maviane Macia,Nemo Peeterset al. Environmental Microbiology, 2021, 23 (10), pp.5962-5978. ⟨10.1111/1462-2920.15535⟩ Article dans une revue hal-03211148v1
Genome-Scale Investigation of the Metabolic Determinants Generating Bacterial Fastidious Growth Léo Gerlin,Ludovic Cottret,Sophie Cesbron,Geraldine G. Taghouti,Marie-Agnès Jacqueset al. mSystems, 2020, 5 (2), 15 p. ⟨10.1128/mSystems.00698-19⟩ Article dans une revue hal-02901652v1
Physiological responses of three mono-species phototrophic biofilms exposed to copper and zinc Emilie Loustau,Jessica Ferriol,Shams Koteiche,Léo Gerlin,Joséphine Leflaiveet al. Environmental Science and Pollution Research, 2019, 26 (34), pp.35107-35120. ⟨10.1007/s11356-019-06560-6⟩ Article dans une revue hal-04158925v1

Communication dans un congrès (11)

Métabolisme d'une bactérie symbiotique et besoins nutritionnels de son hôte : une question d'offre et de demande ? Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Karen Gaget,Garance Lapetoule,Isabelle Rahiouiet al. 2nd Workshop Modélisation du Métabolisme, Mar 2024, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-04524685v1
Analysis of matter fluxes between insect pests and symbionts through metabolic modeling Léo Gerlin Rencontres 2023 des Jeunes Chercheur.se.s et Ingénieur.e.s SPE, Oct 2024, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04788788v1
Utilisation de l'IA et des modèles dynamiques à BF2I Léo Gerlin,Sergio Peignier Journée SPE-Num - Nouvelles approches hybrides couplant IA et modèles dynamiques, Dec 2024, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04788764v1
Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Karen Gaget,Isabelle Rahioui,Marie-Gabrielle Duportet al. 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Communication dans un congrès hal-04524579v1
Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les pucerons Léo Gerlin,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevro,Hubert Charles Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbane, France Communication dans un congrès hal-04121080v1
MULTI-ORGAN GENOME-SCALE METABOLIC MODELING OF A TOMATO PLANT AT VEGETATIVE GROWTH STAGE Léo Gerlin,Antoine Escourrou,Ludovic Cottret,Stéphane Genin,Caroline Baroukh 13ème Congrès international de la SFBV, Société Française de la Biologie Végétale, Aug 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04718279v1
Investigation of the metabolic network of Xylella fastidiosa responsible of its fastidious growth Leo Gerlin,Ludovic Cottret,Sophie Cesbron,Geraldine G. Taghouti,Marie-Agnès Jacqueset al. 3rd European Conference on Xylella fastidiosa and the final meeting of the XF-ACTORS project, Apr 2021, Virtual, France Communication dans un congrès hal-03350588v1
Multi-organ genome-scale metabolic modeling of tomato plant Leo Gerlin,Antoine Escourrou,Ludovic Cottret,Stephane Genin,Caroline Baroukh 7th Conference on Constraint-Based Reconstruction and Analysis (COBRA 2021), Mar 2021, Virtual, France Communication dans un congrès hal-03350567v1
iGEMINI: a coculture for food supplements production in space Brice Enjalbert,Yves Roméo,Pierre Millard,Régis Fauré,Anthony Henraset al. iGEM 2020, Oct 2020, Virtual conference, France Communication dans un congrès hal-04757186v1
Genome-scale investigation of the metabolic determinants generating bacterial fastidious growth Leo Gerlin,Ludovic Cottret,Sophie Cesbron,Géraldine Taghouti,Marie-Agnès Jacqueset al. Symposium on Synthetic and Systemic Biology, Nov 2019, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-03350558v1
CROC'N CHOLERA: a synthetic microbial consortium against cholera Brice Enjalbert,Stephanie Heux,Florence Bordes,Pierre Millard,Régis Fauréet al. iGEM 2017, Oct 2017, Boston, United States Communication dans un congrès hal-04757170v1

Poster de conférence (2)

Mathematical modeling of pea aphid metabolism Ariane Paradan,Patrice Baa-Puyoulet,Federica Calevro,Hubert Charles,Léo Gerlin 14èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France Poster de conférence hal-04788746v1
Genome assembly of the cereal aphid Sipha maydis, a model for the study of dual endosymbiosis in insects François Renoz,Nicolas Parisot,Patrice Baa-Puyoulet,Léo Gerlin,Samir Fakhouret al. 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France Poster de conférence hal-04524568v1

Chapitre d'ouvrage (1)

Plant genome-scale metabolic networks Léo Gerlin,Clément Frainay,Fabien Jourdan,Caroline Baroukh,Sylvain Prigent Science Direct. Plant Metabolomics in full swing, 98, 2021, Advances in Botanical Research, ⟨10.1016/bs.abr.2020.09.021⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03149497v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Metabolic modeling of a plant-pathogen interaction quantifies the metabolic bottlenecks underlying bacterial wilt Léo Gerlin,Stéphane Genin,Caroline Baroukh 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04904052v1

Thèse (1)

Study of metabolic interactions between plant and xylem-colonizing bacteria using constraint-based modeling Léo Gerlin Life Sciences [q-bio]. Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2021. English. ⟨NNT : 2021TOU30177⟩ Thèse tel-04839734v1