Lise Pomiès

Publications

Autre publication scientifique (3)

Échanges autour des recherches, des métiers, des parcours de formation et visite (UMR BOA, INRAE) Magali Chesse,Nicolas Guyot,Pauline Javaloyes,Elisabeth Le Bihan-Duval,Xavier Lerayet al. 2026 Autre publication scientifique hal-05543673v1
Réponse transcriptomique du Peuplier à une sollicitation mécanique : inférence de réseaux de régulations géniques à partir de données d’expression Lise Pomies 2013, 25 p. + annexes Autre publication scientifique hal-01269061v1
Mise en place d'un outil d'analyse de résultats de puces ADN (Affymetrix 61K Poplar) pour l'étude de la mécanoperception chez le Peuplier Lise Pomies 2012, 20 p. + annexes Autre publication scientifique hal-01269067v1

Article dans une revue (5)

Transcriptome profiling reveals stress-responsive gene networks in cattle muscles Isabelle Cassar-Malek,Lise Pomiès,Anne de La Foye,Jérémy Tournayre,Céline Bobyet al. PeerJ, 2022, 10, pp.e13150. ⟨10.7717/peerj.13150⟩ Article dans une revue hal-03632213v1
Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals Lise Pomiès,Celine Brouard,Harold Duruflé,Élise Maigné,Clément Carréet al. Bioinformatics, 2022, 38 (17), pp.4127-4134. ⟨10.1093/bioinformatics/btac445⟩ Article dans une revue hal-03776333v1
Données transcriptomiques de feuilles de huit lignées de tournesol et de leurs 16 hybrides soumis à un stress hydrique Louise Gody,Harold Duruflé,Nicolas Blanchet,Clément Carré,Ludovic Legrandet al. OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.48. ⟨10.1051/ocl/2020044⟩ Article dans une revue (data paper) hal-02974900v1
RNA expression dataset of 384 sunflower hybrids in field condition Charlotte Penouilh-Suzette,Lise Pomies,Harold Duruflé,Nicolas Blanchet,Fanny Bonnafouset al. OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.36. ⟨10.1051/ocl/2020027⟩ Article dans une revue (data paper) hal-02912579v1
Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli Lise Pomies,Mélanie Decourteix,Jérôme Franchel,Bruno Moulia,Nathalie Leblanc-Fournier BMC Genomics, 2017, 18, 16 p. ⟨10.1186/s12864-017-3670-1⟩ Article dans une revue hal-01528849v1

Communication dans un congrès (2)

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods Lise Pomies,Louise Gody,Charlotte Penouilh-Suzette,Nicolas Langlade,Brigitte Manginet al. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Jul 2018, Marseille, France. 664 p Communication dans un congrès hal-02733671v1
Strategy for infering gene regulatory network from kinetic expression with unfavorable data-to-variables ratio. Lise Pomies,Mélanie M. Decourteix,Jérôme Franchel,Bruno Moulia,Nathalie Leblanc-Fournier Journées Ouvertes en Biologie, Informatique & Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). Clermont-Ferrand, FRA., Jul 2015, Clermont-Fd, France. 1 p Communication dans un congrès hal-01269089v1

Poster de conférence (3)

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods Lise Pomies,Louise Gody,Charlotte Penouilh-Suzette,Nicolas Langlade,Brigitte Manginet al. 17th European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. 2018 Poster de conférence hal-02734486v1
Acclimation of Populus to wind: kinetic of the transcriptomic response to single or repeated stem bending Lise Pomies,Mélanie M. Decourteix,Jérôme J. Franchel,Bruno B. Moulia,Nathalie Leblanc-Fournier IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics Conference, May 2016, Arcachon, France. IUFRO, 1 p., 2016 Poster de conférence hal-02739238v1
La réponse transcriptomique au stress décortiquée a l'aide de la bioinformatique Isabelle Cassar-Malek,Lise Pomies,Brigitte B. Picard 14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2012, Caen, France. Institut de l'Elevage - INRA, Viandes et Produits Carnés, 2012, 14èmes Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes Poster de conférence hal-02745567v1

Thèse (1)

Sensibilité des peupliers à la flexion : analyse transcriptomique et inférence de réseau de gènes Lise Pomiès Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université Clermont Auvergne (UCA), 2017. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-05461412v1