Louis-Stéphane IV Le Clercq Post-Doctorant

Identifiants chercheurs

IdHAL :

louis-stephane-iv-le-clercq

VIAF :

472162664553655002597

ISNI :

0000000502704324

ResearcherID :

AAO-9057-2021

Présentation

Mon intérêt pour une carrière en biologie s'est manifesté lorsque mon professeur de biologie au lycée m'a recommandé de participer à l'Olympiade scientifique Mittal ou j’ai classe dans le top 50 au niveau national. J'ai commencé mes études formelles avec un baccalauréat ès sciences (B.Sc.) de l'Université de Pretoria, après quoi j'ai complété un B.Sc. Honneurs dont j'ai obtenu mon diplôme avec distinction et reçu les couleurs honorifiques académiques. Mon superviseur principal était le professeur Duncan Cromarty pour un mini-projet sur la mesure de l'activation des facteurs de transcription et de la translocation nucléaire dans des cellules en culture de type macrophage. Cela a été suivi par une maîtrise ès sciences (M.Sc.) basée sur la recherche comme formation postuniversitaire complémentaire sous la supervision du Dr Sheila Bowyer et du professeur Sim Mayaphi, sur un projet axé sur l'amplification complète du génome et le séquençage de masse et parallèle de métapopulations virales dans les infections chroniques. Ce projet a été financé grâce à des subventions de la National Research Foundation (NRF) et du Poliomyelitis Research Fund (PRF). Au cours de ce diplôme, j'ai également suivi des cours supplémentaires en phylogénétique, bioinformatique et automatisation de laboratoire. Par suite de mon master, j'ai effectué un stage/stage d'un an par la DST-NRF au Jardin Zoologique National, SANBI. Cette période a permis une exposition significative à des domaines tels que la génétique de la conservation, la zoologie et la science animale, y compris un atelier sur la génétique des populations. J'ai récemment terminé une thèse en vue d'un doctorat diplôme en génétique à l'Université de l'État libre (UFS), sous la direction de mon directeur principal, le Dr Desire Dalton (Teesside), en collaboration avec le professeur Paul Grobler (UFS) et le professeur Antoinette Kotze (SANBI). Mon projet s'est concentré sur les horloges moléculaires, les modèles de migration aviaire et les horloges biologiques telles que la méthylation comme marqueurs d'âge pour la faune. Cette étude a été financée par des subventions du NRF et une subvention de base du SANBI. Je suis actuellement inscrit auprès du conseil sud-africain des professions scientifiques naturelles en tant que candidat scientifique en biologie moléculaire et je poursuis un stage postdoctoral au sein de l'unité de recherche en épigénétique et destin cellulaire du CNRS à Paris, France.

Publications

Article dans une revue (7)

Phenotypic correlates between clock genes and phenology among populations of Diederik cuckoo, Chrysococcyx caprius Louis-Stéphane Le Clercq,Veronica Phetla,Samuel T Osinubi,Antoinette Kotzé,J. Paul Grobleret al. Ecology and Evolution, 2024, 14 (8), pp.e70117. ⟨10.1002/ece3.70117⟩ Article dans une revue hal-04667229v1
Methylation-based markers for the estimation of age in African cheetah, Acinonyx jubatus Louis-Stéphane Le Clercq,Antoinette Kotzé,J. Paul Grobler,Desire Lee Dalton Molecular Ecology Resources, 2024, 24, ⟨10.1111/1755-0998.13940⟩ Article dans une revue hal-04474850v1
Time trees and clock genes: a systematic review and comparative analysis of contemporary avian migration genetics Louis‐Stéphane Le Clercq,Gaia Bazzi,Jacopo G Cecere,Luca Gianfranceschi,Johannes Paul Grobleret al. Biological Reviews, 2023, 98 (4), pp.1051-1080. ⟨10.1111/brv.12943⟩ Article dans une revue hal-04116625v1
PAReTT: A Python Package for the Automated Retrieval and Management of Divergence Time Data from the TimeTree Resource for Downstream Analyses Louis-Stéphane Le Clercq,Antoinette Kotzé,J. Paul Grobler,Desiré Lee Dalton Journal of Molecular Evolution, 2023, 91 (4), pp.502-513. ⟨10.1007/s00239-023-10106-3⟩ Article dans une revue hal-04116629v1
Dataset generated in a systematic review and meta-analysis of biological clocks as age estimation markers in animal ecology Louis-Stéphane Le Clercq,J Paul Grobler,Antoinette Kotzé,Desiré Lee Dalton Data in Brief, 2023, 51 (109615), ⟨10.1016/j.dib.2023.109615⟩ Article dans une revue hal-04229681v1
Biological clocks as age estimation markers in animals: a systematic review and meta‐analysis Louis‐Stéphane Le Clercq,Antoinette Kotzé,J. Paul Grobler,Desiré Lee Dalton Biological Reviews, 2023, ⟨10.1111/brv.12992⟩ Article dans une revue hal-04142813v1
ABCal: a Python package for author bias computation and scientometric plotting for reviews and meta-analyses Louis-Stéphane Le Clercq Scientometrics, 2023, 129, pp.581-600. ⟨10.1007/s11192-023-04880-6⟩ Article dans une revue hal-04308276v1

Poster de conférence (2)

Molecular age estimation based on promotor CpG methylation using Methylation Sensitive PCR Louis Stéphane Le Clercq,Desiré Lee Dalton,Antoinette Kotzé 9th Annual Research Symposium of the National Zoological Gardens of South Africa, Nov 2018, Pretoria, South Africa. ScienceOpen Posters, 2022, ⟨10.14293/S2199-1006.1.SOR-.PPROAEF.v1⟩ Poster de conférence hal-03337417v1
Full Genome Amplification and Quasispecies Reconstruction of the Hepatitis B Virus from Next Generation Sequencing Data Louis-Stéphane Le Clercq,Sheila M Bowyer,Sim H Mayaphi Faculty Day 2014, Aug 2014, Pretoria, South Africa. ⟨10.13140/RG.2.2.24117.04322⟩ Poster de conférence hal-04179539v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Intra-host quasispecies reconstructions resemble inter-host variability of transmitted chronic hepatitis B virus strains Louis Stéphane Le Clercq,Sheila Bowyer,Simnikiwe Mayaphi 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04099060v1

Thèse (2)

Biological clock measures: Assessing the association between the circadian and epigenetic clock as predictors of migration phenology and biological aging in wildlife Louis‐Stéphane Le Clercq Genetics. University of the Free State, 2024. English. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-04667231v1
Molecular characterization of full genome hepatitis b virus sequences from an urban hospital cohort in Pretoria, South Africa Louis Stephanus Le Clercq Virology. University of Pretoria, 2014. English. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-03334742v1

Logiciel (2)

ABCal: Author Bias Computation and Scientometric Plotting Louis‐Stéphane Le Clercq 2023, ⟨swh:1:dir:d44dc134c187e1d0dc76f85b749ebc7dc46f27de;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04179544;visit=swh:1:snp:4974e3e7a43b0a1c8ff757321968c028753630ed;anchor=swh:1:rel:daad35b15eff1a7c42f5047b0851113ef13f22dc;path=/⟩ Logiciel hal-04179544v1
PAReTT: Python Automated Retrieval of TimeTree data Louis‐Stéphane Le Clercq 2023, ⟨swh:1:dir:d1a89d4e517e74d8abb389e79e1dc782c9efda36;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04159611;visit=swh:1:snp:589f8dab0c43b5303ecb1ae6ca1e585765e45442;anchor=swh:1:rel:969183278a1d6585d6b2bbd8d3744b539f9482bc;path=/⟩ Logiciel hal-04159611v1