Mouhamadou Ba
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Documents
Publications
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MilkOligoThesaurus, a dataset of mammalian milk oligosaccharide synonymsData in Brief, 2024, 54, pp.110404. ⟨10.1016/j.dib.2024.1104042352-3409/⟩
Article dans une revue
hal-04552648v1
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Omnicrobe, an open-access database of microbial habitats and phenotypes using a comprehensive text mining and data fusion approachPLoS ONE, 2023, 18 (1), pp.e0272473. ⟨10.1371/journal.pone.0272473⟩
Article dans une revue
hal-03984703v1
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Improving methods for normalizing biomedical text entities with concepts from an ontology with (almost) no training data at BLAH5 the CONTESGenomics & Informatics, 2019, 17 (2), pp.e20. ⟨10.5808/GI.2019.17.2.e20⟩
Article dans une revue
hal-02947689v1
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Solving Data Mismatches in Bioinformatics Workflows by Generating Data ConvertersTransactions on Large-Scale Data- and Knowledge-Centered Systems, 2016, LNCS, 9510, pp.88-115
Article dans une revue
hal-01485059v1
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Migale et son offre de service de text-miningJournées du PEPI IBIS, INRAE, Sep 2023, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04294052v1
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Handling Entity Normalization with no Annotated Corpus: Weakly Supervised Methods Based on Distributional Representation and Ontological Information12th Conference on Language Resources and Evaluation, May 2020, Marseille, France. pp.1959-1966
Communication dans un congrès
hal-02866789v1
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Bacteria Biotope at BioNLP Open Shared Tasks 20195th Workshop on BioNLP Open Shared Tasks BioNLP-OST@EMNLP-IJCNLP 2019, Association for Computational Linguistics, Jin-Dong Kim; Claire Nédellec; Robert Bossy; Louise Deléger, Nov 2019, Hong-Kong, Hong Kong SAR China. ⟨10.18653/v1/D19-5719⟩
Communication dans un congrès
hal-02437609v1
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Relier automatiquement des entités textuelles à des concepts d'une ontologie par apprentissage avec (presque) aucune donnéeAtelier IN-OVIVE 7ème édition, des 30èmes Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jul 2019, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-03530148v1
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Data Exchange Solution between PubAnnotation and AlvisAEBLAH4, Jan 2018, Tokyo, Japan. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02785063v1
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Florilège: a database gathering microbial phenotypes of food interest2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01607327v1
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Customized automatic corpus annotations using AlvisNLP/MLBLAH3, Jan 2017, Tokyo, Japan. 11 diapos
Communication dans un congrès
hal-02790613v1
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Integration of Alvis within the OpenMinTeD platform as Galaxy utilitiesGalaxy Community Conference, Jun 2017, Montpellier, France. pp.1, ⟨10.5281/zenodo.200370⟩
Communication dans un congrès
hal-01556276v1
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OntoBiotope: une ontologie pour croiser les habitats microbiens avec les analyses de génomes.Les journées Bioinformatique de l'Inra, Mar 2016, Montpellier, France. pp.1
Communication dans un congrès
hal-01455856v1
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Overview of the regulatory network of plant seed development (SeeDev) task at the BioNLP shared task 2016BioNLP Shared Task, Aug 2016, Berlin, Germany. pp.113
Communication dans un congrès
hal-01455854v1
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Interoperability of corpus processing workflow engines: the case of. AlvisNLP/ML in OpenMinTeDMeeting of working Group Medicago sativa, May 2016, Portoroz, Slovenia
Communication dans un congrès
hal-01455853v1
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Overview of the bacteria biotope task at BioNLP shared taskBioNLP Shared Task, Aug 2016, Berlin, Germany. pp.101
Communication dans un congrès
hal-01455857v1
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Safe Suggestions Based on Type Convertibility to Guide Workflow CompositionFoundations of Intelligent Systems (ISMIS), Oct 2015, Lyon, France. ⟨10.1007/978-3-319-25252-0_25⟩
Communication dans un congrès
hal-01252775v1
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Generating Data Converters to Help Compose Services in Bioinformatics WorkflowsInt. Conf. Database and Expert Systems Applications (DEXA), 2014, Munich, Germany. pp.15
Communication dans un congrès
hal-01122399v1
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Convertibility between input and output types to help compose services in bioinformaticsColloque africain sur la recherche en informatique et mathématiques appliquées (CARI),, 2014, Saint-Louis, Senegal
Communication dans un congrès
hal-01122403v1
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Convertibilité entre types d'entrée et de sortie pour la composition de services en bio-informatiqueReconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, France
Communication dans un congrès
hal-00989229v1
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Temperature Effects on Photovoltaic Energy Output Under Real Conditions: Weibull ModelData-Driven Modeling for Sustainable Engineering, pp.267-284, 2019, 978-3-030-13697-0. ⟨10.1007/978-3-030-13697-0_21⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03059453v1
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Bacteria biotope annotation guidelines2019, 30 p
Autre publication scientifique
hal-02787110v1
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Omnicrobe, an open-access database of microbial habitats and phenotypes using a comprehensive text mining and data fusion approach2022
Pré-publication, Document de travail
hal-03828105v1
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Composition guidée de services : application aux workflows d’analyse de données en bio-informatiqueBio-informatique [q-bio.QM]. INSA de Rennes, 2015. Français. ⟨NNT : 2015ISAR0024⟩
Thèse
tel-01301681v1
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