manon thomas

Publications

Article dans une revue (6)

3D imaging and quantitative analysis of adipocytes in situ and ex situ Isabelle Hue,Adèle Branthonne,Manon Thomas,Violette Thermes,Jérôme Bugeon Adipocyte, 2025, 14 (1), pp.2558573. ⟨10.1080/21623945.2025.2558573⟩ Article dans une revue hal-05273506v1
An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of ovaries Manon Lesage,Manon Thomas,Thierry Pécot,Tu-Ky Ly,Nathalie Hinfrayet al. Development (Cambridge, England), 2023, 150 (7), pp.dev201185. ⟨10.1242/dev.201185⟩ Article dans une revue hal-04062159v1
Primordial germ cell migration and histological and molecular characterization of gonadal differentiation in Pachón Cavefish Astyanax mexicanus Boudjema Imarazene,Séverine Beille,Elodie Jouanno,Adèle Branthonne,Violette Thermeset al. Sexual Development, 2021, pp.1-18. ⟨10.1159/000513378⟩ Article dans une revue hal-03166084v1
Non-thalamic origin of zebrafish sensory nuclei implies convergent evolution of visual pathways in amniotes and teleosts Solal Bloch,Hanako Hagio,Manon Thomas,Aurélie Heuzé,Jean-Michel Hermelet al. eLife, 2020, 9, pp.e54945. ⟨10.7554/eLife.54945⟩ Article dans une revue hal-02936377v1
C-ECi: a CUBIC-ECi combined clearing method for three-dimensional follicular content analysis in the fish ovary Manon Lesage,Manon Thomas,Jérôme Bugeon,Adèle Branthonne,Stéphanie Gayet al. Biology of Reproduction, 2020, 103 (5), pp.1099-1109. ⟨10.1093/biolre/ioaa142⟩ Article dans une revue hal-02935099v1
Mesencephalic origin of the inferior lobe in zebrafish Solal Bloch,Manon Thomas,Ingrid Colin,Sonya Galant,Elodie Machadoet al. BMC Biology, 2019, 17:22 (1), pp.1-16. ⟨10.1186/s12915-019-0631-y⟩ Article dans une revue hal-02191231v1

Communication dans un congrès (12)

Unveiling the role of mir-187 in promoting adult ovarian follicle growth and female fecundity in medaka (Oryzias latipes) Stéphanie Gay,Marlène Davilma,Sully Heng,Fabrice Mahé,Manon Thomaset al. Différenciation et fonctions des gonades, Mar 2025, Paris, France Communication dans un congrès hal-05107315v1
Hippo mediated regulation of gonad function by miR-202 Sarah JANATI IDRISSI,Mariana Roza de Abreu,Cervin Guyomar,Sylwia Judycka,Thaovi Nguyenet al. Colloque différenciation et fonction des gonades, Mar 2025, Paris, France Communication dans un congrès hal-05084613v1
Fsh regulates the proliferation of embryonic-like germ stem cells in adult zebrafish testes Rafael Henrique Nobrega,Benites Doretto Lucas,Manon Thomas,Nathalie Chenais,Jean-Jacques Lareyre 12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, May 2023, Heraklion, Greece Communication dans un congrès hal-04102885v1
Quantitative analysis of asynchronous oogenesis dynamics in fish: Application of a modern 3D analysis approach to an old problem Manon Lesage,Mak Sully,Jérôme Bugeon,Manon Thomas,Stéphanie Gayet al. 12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish (ISRPF), May 2023, Chersonissos, Greece Communication dans un congrès hal-04187726v1
Rfsh regulates the proliferation of embryonic-like germ stem cells in adult zebrafish testes Rafael Henrique Nobrega,Lucas Benites Doretto,Manon Thomas,Nathalie Chenais,Jean-Jacques Lareyre 8. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2022, Gdansk, France Communication dans un congrès hal-03911919v1
Contrôle de la maturation sexuelle des poissons d’élevage: mise en évidence d’une action directe de la FSH dans le processus de différentiation des cellules souches spermatogoniales Jean-Jacques Lareyre,Lucas Benites Doretto,Manon Thomas,Nathalie Chenais,Rafael Henrique Nóbrega 7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France Communication dans un congrès hal-03911814v1
Mise en application d'algorithmes open-source de Deep-Learning pour l'analyse d'images 3D d'ovaires de Médaka Manon Lesage,Jérôme Bugeon,Manon Thomas,Thierry Pécot,Violette Thermes 11. Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRAE, Nov 2022, Rennes, France Communication dans un congrès hal-04046034v1
A comprehensive 3D approach to unravel follicular growth dynamics that governs fecundity in medaka fish (Oryzias latipes) Manon Lesage,Jérôme Bugeon,Manon Thomas,Stéphanie Gay,Thierry Pécotet al. 14. International Congress on the Biology of Fish, Jun 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-03764407v1
Testicular organoids in teleost fish: current progress and perspectives Nathalie Chenais,Rafael Henriquenobrega,Manon Thomas,Beatrice Porcon,Adèle Branthonneet al. 8. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2022, Gdansk, Poland Communication dans un congrès hal-03911854v1
Vers la production d'organoïdes testiculaires chez les poissons : stratégies et avancées Nathalie Chênais,Rafael Nóbrega,Manon Thomas,Béatrice Porcon,Adèle Branthonneet al. Organoïdes et recherche agronomique, Jun 2022, Paris, France Communication dans un congrès hal-03911859v1
Using 3D imaging to study ovarian development in Medaka Manon Lesage,Manon Thomas,Jérôme Bugeon,Adèle Branthonne,Violette Thermes 12. Journées Scientifiques et Techniques du Rµi, Nov 2022, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03892521v1
Utilisation d’outils d’intelligence artificielle pour la segmentation d’images 3D d’ovaire de poisson Manon Lesage,Jérôme Bugeon,Manon Thomas,Violette Thermes 17. Colloque de la Société Française de Microscopies, Jul 2021, Reims, France Communication dans un congrès hal-03299572v1

Poster de conférence (7)

3D imaging-based analysis of the germline in teleost Marlène Davilma,Stéphanie Gay,Manon Thomas,Laurence Dubreil,Frédérique Clémentet al. AI and imaging for cell and developmental biology: insights, limits and perspectives, Sep 2024, Paris, France Poster de conférence hal-04745237v1
3D imaging-based analysis of the germline in teleost Marlène Davilma,Stéphanie Gay,Manon Thomas,Laurence Dubreil,Frédérique Clémentet al. From cell to organism: When cell biology meets development, Oct 2024, Paris, France Poster de conférence hal-04745244v1
Composition of the rainbow trout testicular extracellular matrix and progress towards the development of testicular organoids Nathalie Chenais,Rafael Henrique Nobrega,Régis Lavigne,Aurélien Brionne,Manon Thomaset al. 12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, May 2023, Heraklion, Greece. Poster de conférence hal-04102161v1
Utilisation de l'imagerie en 3D pour caractériser l'organisation des tissus adipeux chez la truite arc-en-ciel Adèle Branthonne,Manon Thomas,Violette Thermes,Isabelle Hue,Jérôme Bugeon Mettez un peu de piquant dans vos recherches, Jun 2023, Dijon, France Poster de conférence hal-04288888v1
Monitoring the Oogenesis Dynamics in the Medaka Ovary Using a Quantitative 3D Image Analysis Approach Manon Lesage,Mak Sully,Manon Thomas,Stéphanie Gay,Thierry Pécotet al. 12. European Zebrafish Meeting, Jul 2023, Krakow, Poland Poster de conférence hal-04187761v1
Développement d'une nouvelle méthode pour l'analyse 3D de la dynamique ovarienne chez le poisson : Transparisation, microscopie, analyse d'image et modélisation Manon Thomas,Stéphanie Gay,Jérôme Bugeon,Marie Haghebaert,Fabrice Mahéet al. Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. 85 p., 2019, Recueil des résumés Poster de conférence hal-02735123v1
Utilisation de l’Eci pour la transparisation chez le poisson : exemples d’applications pour l’imagerie 3D Adèle Branthonne,Manon Thomas,Jérôme Bugeon,Jean-Charles Gabillard,Manon Lesageet al. 32. Congrès de l'Association Française d'Histotechnologie, Jun 2019, Strasbourg, France. , 2019 Poster de conférence hal-02786189v1

Pré-publication, Document de travail (2)

An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of Medaka ovaries Manon Lesage,Jérôme Bugeon,Manon Thomas,Thierry Pécot,Violette Thermes 2022 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03759490v1
C-Eci: A Cubic-Eci combined clearing method for 3D follicular content analysis In the ovary Manon Lesage,Manon Thomas,Jérôme Bugeon,Adèle Branthonne,Stéphanie Gayet al. 2020 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02790859v1