Marianne De Paepe

45
Documents

Publications

Publications

Deposit thumbnail

Le verre réutilisable au laboratoire a-t-il un impact environnemental moindre que le plastique à usage unique ? Analyse avec l’outil EcoLabWare

Sophie Schbath , Max-Henri Chanut , Marianne De Paepe

NOV'AE, 2025, spécial 04 NOV'AE, pp.125-133. ⟨10.20870/Revue-NOVAE.2025.9691⟩

Article dans une revue hal-05316745v1

T7 DNA polymerase treatment improves quantitative sequencing of both double-stranded and single-stranded DNA viruses

Maud Billaud , Ilias Theodorou , Quentin Lamy-Besnier , Shiraz Shah , François Lecointe et al.

Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e63. ⟨10.24072/pcjournal.437⟩

Article dans une revue hal-04662155v1
Deposit thumbnail

Purchases dominate the carbon footprint of research laboratories

Marianne de Paepe , Laurent Jeanneau , Jerôme Mariette , Olivier Aumont , André Estevez-Torres

PLOS Sustainability and Transformation, 2024, 3 (7), pp.e0000116. ⟨10.1371/journal.pstr.0000116⟩

Article dans une revue (data paper) hal-04666497v2
Deposit thumbnail

Genetic manipulation of bacteriophage T4 utilizing the CRISPR-Cas13b system

Yuvaraj Bhoobalan-Chitty , Mathieu Stouf , Marianne De Paepe

Frontiers in Genome Editing, 2024, 6, ⟨10.3389/fgeed.2024.1495968⟩

Article dans une revue hal-05144201v1
Deposit thumbnail

Comparison of interferometric light microscopy with nanoparticle tracking analysis for the study of extracellular vesicles and bacteriophages

Romain Sausset , Zuzana Krupova , Eric Guédon , Sandrine Peron , Alice Grangier et al.

Journal of Extracellular Biology, 2023, 2 (2), pp.e75. ⟨10.1002/jex2.75⟩

Article dans une revue hal-04003317v2
Deposit thumbnail

Viruses of Microbes 2020: The Latest Conquest on Viruses of Microbes

Tessa E F Quax , Marianne de Paepe , Karin Holmfeldt

Viruses, 2021, 13 (5), pp.802. ⟨10.3390/v13050802⟩

Article dans une revue hal-04127728v1

The enemy from within: a prophage of Roseburia intestinalis systematically turns lytic in the mouse gut, driving bacterial adaptation by CRISPR spacer acquisition

Jeffrey Cornuault , Elisabeth Moncaut , Valentin Loux , Aurélie Mathieu , Harry Sokol et al.

The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2020, 14 (3), pp.771-787. ⟨10.1038/s41396-019-0566-x⟩

Article dans une revue hal-02504597v1
Deposit thumbnail

New insights into intestinal phages

Romain Sausset , Marie-Agnès Petit , V. Gaboriau-Routhiau , Marianne de Paepe

Mucosal Immunology, 2020, 13 (2), pp.205-215. ⟨10.1038/s41385-019-0250-5⟩

Article dans une revue hal-02912995v1
Deposit thumbnail

Viral metagenomic analysis of the cheese surface: A comparative study of rapid procedures for extracting viral particles

Eric Dugat-Bony , Julien Lossouarn , Marianne de Paepe , Anne-Sophie Sarthou , Yasmina Fedala et al.

Food Microbiology, 2020, 85 (103278), ⟨10.1016/j.fm.2019.103278⟩

Article dans une revue hal-02623156v1
Deposit thumbnail

Phages infecting Faecalibacterium prausnitzii belong to novel viral genera that help to decipher intestinal viromes

Jeffrey K. Cornuault , Marie-Agnès Petit , Mahendra Mariadassou , Leandro Benevides , Elisabeth Moncaut et al.

Microbiome, 2018, 6 (1), 14 p. ⟨10.1186/s40168-018-0452-1⟩

Article dans une revue hal-01774632v1

Inflammation boosts bacteriophage transfer between Salmonella spp.

Mederic Diard , Erik Bakkeren , Jeffrey Cornuault , Kathrin Moor , Annika Hausmann et al.

Science, 2017, 355 (6330), pp.1-5. ⟨10.1126/science.aaf8451⟩

Article dans une revue hal-01607431v1
Deposit thumbnail

Carriage of λ latent virus is costly for its bacterial host due to frequent reactivation in monoxenic mouse intestine

Marianne de Paepe , Laurent Tournier , Elisabeth Moncaut , Olivier Son , Philippe P. Langella et al.

PLoS Genetics, 2016, 12 (2), ⟨10.1371/journal.pgen.1005861⟩

Article dans une revue hal-02637844v1

Bactériophages et dysbioses intestinales

Marianne de Paepe , Jeffrey Cornuault , Marie-Agnès Petit

Bulletin de l'Association des Anciens Elèves de l'Institut Pasteur, 2016, 58 (226), pp.7-10

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01533893v1

Bactériophages et microbiote intestinal

Marianne de Paepe , Marie-Agnès Petit

Bulletin de l'Association des Anciens Elèves de l'Institut Pasteur, 2016, 58 (226), pp.4-6

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01533892v1
Deposit thumbnail

Killing the killers

Marianne de Paepe , Marie Agnes Petit

eLife, 2014, 3, pp.e04168. ⟨10.7554/eLife.04168⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01204493v1
Deposit thumbnail

Bacteriophages: an underestimated role in human and animal health?

Marianne de Paepe , Marion Leclerc , Colin R. Tinsley , Marie Agnes Petit

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2014, 4, ⟨10.3389/fcimb.2014.00039⟩

Article dans une revue hal-01204359v1
Deposit thumbnail

Temperate phages acquire DNA from defective prophages by relaxed homologous recombination: the role of rad52-like recombinases.

Marianne de Paepe , Geoffrey Hutinet , Olivier Son , Jihane Amarir , Sophie Schbath et al.

PLoS Genetics, 2014, 10 (3), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pgen.1004181⟩

Article dans une revue hal-01134590v1
Deposit thumbnail

Bacteriophages: an underestimated role in human and animal health ?

Marianne de Paepe , Marion Leclerc , Marie-Agnès Petit , Colin R. Tinsley

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2014, 4, p. 39. ⟨10.3389/fcimb.2014.00039⟩

Article dans une revue hal-03665153v1

Respiratory complex I deficiency induces drought tolerance by impacting leaf stomatal and hydraulic conductances.

Reda Djebbar , Touhami Rzigui , Pierre Pétriacq , Caroline Mauve , Pierrick Priault et al.

Planta, 2012, 235 (3), pp.603-614. ⟨10.1007/s00425-011-1524-7⟩

Article dans une revue istex hal-02648980v1
Deposit thumbnail

Trade-off between bile resistance and nutritional competence drives Escherichia coli diversification in the mouse gut.

Marianne de Paepe , Valérie Gaboriau-Routhiau , Dominique Rainteau , Sabine Rakotobe , François Taddei et al.

PLoS Genetics, 2011, 7 (6), pp.e1002107. ⟨10.1371/journal.pgen.1002107⟩

Article dans une revue inserm-00709328v1
Deposit thumbnail

Emergence of variability in isogenic <em>Escherichia coli</em> populations infected by a filamentous virus

Marianne de Paepe , Lydia Robert , Ariel B. Lindner , François Taddei , Silvia de Monte

PLoS ONE, 2010, 5 (7), pp.e11823. ⟨10.1371/journal.pone.0011823⟩

Article dans une revue hal-02668951v1

The key role of segmented filamentous bacteria in the coordinated maturation of gut helper T cell responses

Valérie Gaboriau Routhiau , Sabine Rakotobe , Emelyne Lécuyer , Imke Mulder , Annaig Lan et al.

Immunity, 2009, 31 (4), pp.677-689. ⟨10.1016/j.immuni.2009.08.020⟩

Article dans une revue hal-02666267v1
Deposit thumbnail

Dissecting the genetic components of adaptation of Escherichia coli to the mouse gut

Antoine Giraud , Safia Arous , Marianne de Paepe , Valérie Gaboriau Routhiau , Jean-Christophe Bambou et al.

PLoS Genetics, 2008, 4 (1), pp.e2. ⟨10.1371/journal.pgen.0040002⟩

Article dans une revue hal-02661984v1
Deposit thumbnail

Viruses' Life History: Towards a Mechanistic Basis of a Trade-Off between Survival and Reproduction among Phages.

Marianne de Paepe , François Taddei

PLoS Biology, 2006, 4 (7), pp.e193. ⟨10.1371/journal.pbio.0040193⟩

Article dans une revue inserm-00080125v1

Ecology of microbial invasions: amplification allows virus carriers to invade more rapidly when rare

Sam P. Brown , Ludovic L. Le Chat , Marianne de Paepe , François Taddei

Current Biology, 2006, 16 (20), pp.2048-2052. ⟨10.1016/j.cub.2006.08.089⟩

Article dans une revue hal-02666343v1

Ecolabware: Carbon Footprint Comparator of Lab Single-Use Plasticware and Reusable Glassware

Marianne De Paepe , Sophie Schbath

Colloque du GDR Labos 1point5, Nov 2024, Paris, France

Communication dans un congrès hal-05305119v1

Origins and rate of mutations in bacteriophage Lambda

Julien Lopez , Mahendra Mariadassou , Valentin Loux , Rafael Sanjuán , Marina Elez et al.

Phages in Lyon 2023, phages.fr, Nov 2023, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-04321371v1

Intestinal Virions in Crohn's disease patients

Marianne de Paepe

XXIVème Journées Francophones de Virologie, Apr 2022, Strasbourg, France

Communication dans un congrès hal-04321039v1

Intestinal Virions in Crohn's disease patients

Marianne De Paepe

Viruses of Microbes 2022, Jul 2022, Guimaraes, Portugal

Communication dans un congrès hal-04321104v1

The use of Interferometric Light Microscopy (ILM, Videodrop) for the quantification of EVs purified from stool samples

Romain Sausset , Céline Henry , Marie-Agnès Petit , Luisa de Sordi , Marianne de Paepe

Grand-Ouest Extracellular Vesicle Network: Innovation, Cancer & Therapy, Jun 2021, On line, France

Communication dans un congrès hal-04320485v1

Roseburia intestinalis resistance to phage predation by CRISPR spacer acquisition in the mouse gut

Marianne de Paepe

CRISPR 2021, Jun 2021, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04321056v1

Recombinaison homologue chez les phages tempérés: impacts sur l’évolution de leur variabilité génétique

Marianne de Paepe

XXIIèmes Journées Francophones de Virologie, Mar 2019, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-04321075v1

Prophages of Roseburia intestinalis: the enemy from within

Jeffrey K. Cornuault , Elisabeth Moncaut , Marie-Agnès Petit , Harry Sokol , Marianne De Paepe

Virus of Microbes, Wrocław, Jul 2018, Wrocław, Poland

Communication dans un congrès hal-05393362v1

Effet délétère d’un prophage sur la stabilité de Roseburia intestinalis

Jeffrey K. Cornuault , Elisabeth Moncaut , Marie-Agnès Petit , Harry Sokol , Marianne De Paepe

Société Française de Microbiologie, Oct 2017, Paris, France

Communication dans un congrès hal-05393337v1

Accessing virus genomes out of metagenomic data: improving statistical and bioinformatics analytic tools to better assess the contribution of phages on microbial ecosystems

Marianne de Paepe , Eric Dugat-Bony , Jérôme Hamelin , Mahendra Mariadassou , Kim Milferstedt et al.

Phages On Marseille, Nov 2016, Marseille, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-01531724v1

Role of prophages in intestinal microbiota stability

Jeffrey K. Cornuault , Marianne De Paepe , Harry Sokol

Phages.fr : Interactions phages-bactéries : du fondamental à l'appliqué, Nov 2015, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-05393300v1

P60 - Bile salts as a source of strain diversification in the mouse gut

Marianne de Paepe , François Taddei , Nadine Cerf - Bensussan

Journées des Microbiologistes de l'INRA, May 2010, Poitiers, France

Communication dans un congrès hal-01204244v1