Marie Brut Marie BRUT

Identifiants chercheurs

IdHAL :

marie-brut

ORCID :

0000-0002-2218-052X

IdRef :

137660553

Présentation

Publications

Article dans une revue (22)

A Computational Structural Analysis of Host Insertions in the Polyproline Region of the Hepatitis E Virus pORF1 Polyprotein Nicolas Jeanne,Olivia Paronetto,Chloé Dimeglio,Florence Abravanel,Sébastien Lhommeet al. Viruses, 2026, 18 (3), pp.341. ⟨10.3390/v18030341⟩ Article dans une revue hal-05558660v1
Deciphering the Impact of Mutations on PfDHPS Active Site and Sulfadoxine Binding: Structural Insights from Molecular Dynamics Simulations Emilie Guémas,Sandie Ménard,Nicolas Jeanne,Georges Landa,Antoine Berryet al. Molecules, 2025, 30 (20), pp.4118. ⟨10.3390/molecules30204118⟩ Article dans une revue hal-05481763v1
Catalytic Cycle of Type II 4′-Phosphopantetheinyl Transferases Sabine Gavalda,Alexandre Faille,Simone Fioccola,Minh Chau Nguyen,Coralie Carivencet al. ACS Catalysis, 2024, 14 (11), pp.8561-8575. ⟨10.1021/acscatal.3c06249⟩ Article dans une revue hal-04732713v1
Caractériser les cinétiques des diffusions atomiques - ART : l’explorateur de surfaces d’énergie potentielle Antoine Jay,Normand Mousseau,Nicolas Salles,Miha Gunde,Matic Poberžniket al. Les Techniques de l'Ingenieur, 2023, pp.Réf : RE192 v1. ⟨10.51257/a-v1-re192⟩ Article dans une revue hal-04467976v1
Enhancing DFT-based energy landscape exploration by coupling quantum mechanics and static modes Lionel Foulon,Anne Hémeryck,Georges Landa,Marie Brut Physical Chemistry Chemical Physics, 2022, 24 (19), pp.12011-12026. ⟨10.1039/d1cp03562b⟩ Article dans une revue hal-03674113v1
Unraveling cGAS catalytic mechanism upon DNA activation through molecular dynamics simulations Jordi Soler,Pedro Paiva,Maria Joao Joao Ramos,Pedro Alexandrino Fernandes,Marie Brut Physical Chemistry Chemical Physics, 2021, 23 (15), pp.9524-9531. ⟨10.1039/D1CP00378J⟩ Article dans une revue hal-03195928v1
Hybrid QM/MM vs Pure MM Molecular Dynamics for Evaluating Water Distribution within p21 N-ras and the Resulting GTP Electronic Density Ruth Elena Tichauer,Gilles Favre,Stéphanie Cabantous,Marie Brut Journal of Physical Chemistry B, 2019, 123 (18), pp.3935-3944. ⟨10.1021/acs.jpcb.9b02660⟩ Article dans une revue hal-02634170v1
Water Distribution within Wild-Type NRas Protein and Q61 Mutants during Unrestrained QM/MM Dynamics Ruth Elena Tichauer,Gilles Favre,Stéphanie Cabantous,Georges Landa,Anne Hémerycket al. Biophysical Journal, 2018, 115 (8), pp.1417-1430. ⟨10.1016/j.bpj.2018.07.042⟩ Article dans une revue hal-01880032v1
Spatial Analysis of Nanofluidic-Embedded Biosensors for Wash-Free Single-Nucleotide Difference Discrimination Jean Cacheux,Marie Brut,Aurélien Bancaud,Pierre Cordelier,Thierry Leichle ACS Sensors, 2018, 3 (3), pp.606 - 611. ⟨10.1021/acssensors.7b00667⟩ Article dans une revue hal-01762631v1
Modeling of the interface formation during CuO deposition on Al(111) substrate: linking material design and elaboration process parameters through multi-levels approach Mathilde Guiltat,Nicolas Salles,Marie Brut,Georges Landa,Nicolas Richardet al. Modelling and Simulation in Materials Science and Engineering, 2017, Focus on MMM 2016, 25 (6), pp.064005. ⟨10.1088/1361-651X/aa7bbc⟩ Article dans une revue hal-01574744v1
Dioxygen molecule adsorption and oxygen atom diffusion on clean and defective Aluminum (111) surface using first principles calculations Mathilde Guiltat,Marie Brut,Sébastien Vizzini,Anne Hémeryck Surface Science : A Journal Devoted to the Physics and Chemistry of Interfaces, 2017, 657, pp.79-89. ⟨10.1016/j.susc.2016.11.010⟩ Article dans une revue hal-01407658v1
Binding modes of thrombin binding aptamers investigated by simulations and experiments Ana Trapaidze,Aurélien Bancaud,Marie Brut Applied Physics Letters, 2015, 106 (4), pp.043702. ⟨10.1063/1.4906594⟩ Article dans une revue hal-01137420v1
Thrombin detection in murine plasma using engineered fluorescence resonance energy transfer aptadimers Marie Brut,Ana Trapaidze,Serge Mazères,Daniel Estève,Anne Marie Guéet al. Applied Physics Letters, 2015, 107 (23), pp.233701-1-233701-4. ⟨10.1063/1.4937351⟩ Article dans une revue hal-01801826v1
Toward in Silico Biomolecular Manipulation through Static Modes: Atomic Scale Characterization of HIV-1 Protease Flexibility Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Mehdi Djafari-Rouhani Journal of Physical Chemistry B, 2014, 118 (11), pp.2821-2830. ⟨10.1021/jp4113156⟩ Article dans une revue hal-01481802v1
Mimicking DNA stretching with the Static Mode method: Shear stress versus transverse pulling stress Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Mehdi Djafari-Rouhani European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2012, 35 (8), pp.art ID 75. ⟨10.1140/epje/i2012-12075-0⟩ Article dans une revue istex hal-01801823v1
Bringing aptamers into technologies: Impact of spacer terminations Marie Brut,Ana Trapaidze,Alain Estève,Aurélien Bancaud,Damien Estèveet al. Applied Physics Letters, 2012, 100 (16), pp.163702. ⟨10.1063/1.4704658⟩ Article dans une revue hal-01801821v1
Atomic Scale Determination of Enzyme Flexibility and Active Site Stability through Static Modes: Case of Dihydrofolate Reductase Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Guillaume Renvez,Mehdi Djafari-Rouhaniet al. Journal of Physical Chemistry B, 2011, 115 (7), pp.1616-1622. ⟨10.1021/jp109874z⟩ Article dans une revue hal-01481808v1
The electrostatic probe: a tool for the investigation of the A beta(1-16) peptide deformations using the static modes Guillaume Renvez,Alain Estève,Georges Landa,Marie Brut,Mehdi Djafari-Rouhaniet al. Physical Chemistry Chemical Physics, 2011, 13 (32), pp.14611-14616. ⟨10.1039/c1cp20603f⟩ Article dans une revue hal-01481810v1
Deformation of thiolated nucleic acid deposited on a silicon surface: A Static Mode approach Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Guillaume Renvez,Mehdi Djafari-Rouhaniet al. Materials Science and Engineering: B, 2010, 169 (1-3), pp.23-27. ⟨10.1016/j.mseb.2009.11.014⟩ Article dans une revue istex hal-01481814v1
Atomic-scale determination of DNA conformational response to strained furanose a static mode approach Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Ahmed Dkhissi,Guillaume Renvezet al. Tetrahedron, 2010, 66 (47), pp.9123-9128. ⟨10.1016/j.tet.2010.09.083⟩ Article dans une revue istex hal-01481815v1
The Static Modes: An alternative approach for the treatment of macro- and bio-molecular induced-fit flexibility Marie Brut,Alain Estève,Georges Landa,Guillaume Renvez,Mehdi Djafari-Rouhani European Physical Journal E: Soft matter and biological physics, 2009, 28 (1), pp.17 - 25. ⟨10.1140/epje/i2008-10397-0⟩ Article dans une revue istex hal-01801802v1
A new insight into the understanding of poly(N-isopropylacrylamide) the collapsed form of molecules Alain Estève,Adeline Bail,Georges Landa,Ahmed Dkhissi,Marie Brutet al. Chemical Physics, 2007, 340 (1-3), pp.12-16. ⟨10.1016/j.chemphys.2007.06.054⟩ Article dans une revue istex hal-01481821v1

Thèse (1)

Nouvelle approche méthodologique pour la prise en compte de la flexibilité dans les interactions entre molecules biologiques: les Modes Statiques Marie Brut Micro et nanotechnologies/Microélectronique. Université Paul Sabatier - Toulouse III, 2009. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00377792v1