
Marouane BEN JELLOUL
Présentation
MAROUANE BEN JELLOUL 31 octobre 1974 Ingénieur d’études – Ingénieur en calcul scientifique et instrumentation
Antony, France marouanebj@yahoo.fr https://www.linkedin.com/in/marouanebenjelloul/
Développeur d’applications scientifiques, modélisateur de données, intéressé par le développement et l’intégration d’algorithmes efficaces. Je me place à l’interface entre les chercheurs mathématiciens et les chercheurs qui veulent identifier et exploiter les méthodes mathématiques et les systèmes informatiques.
EXPERIENCES PROFESSIONNELLES
6/2019 – Présent Ingénieur d’études CNRS/IPANEMA, France • Conception et développement d’une base de données de suivi de l’utilisation des équipements de laboratoire • Conception et développement d’une base de données en vue d’analiser l’historique et les techniques des peintures de Soulages - Projet NOIRoeS • Développement du contrôle commande et de l’interface utilisateur pour un instrument de mesure de diffraction et de fluorescence de rayons X • Conception et développement d’algorithmes de traitement de données de cartographies de diffraction X • Préparation d’expériences et accueil des scientifiques utilisateurs des plateformes du laboratoire • Traitement de données
5/2015 – 5/2019 Développeur Logiciel Dassault Systèmes, France • Integration dans l’environnement de Dassault Systèmes et développement d’un logiciel de génération de systèmes d’équations différentielles pour la pharmacodynamique et pharmacocinétique en utilisant le C++, Java, HTML5, Javascript, Angular2 • Intégration d’un solveur d’équations différentielles pour simuler les modèles générés et calibrer les constantes à l’aide de données expérimentales
12/2011 – 5/2015 Développeur Logiciel Sobios SA, France • Développement d’un logiciel de génération de systèmes d’équations différentielles pour la pharmacodynamique et pharmacocinétique en utilisant le C++, le HTML5 et Javascript
11/2007 – 10/2011 Ingénieur d’études Medit SA, France • Conception et Développement d’un nouvel outil de visualisation 3D des Protéines et autre molécules en C++ et C# utilisant les APIs .Net, OpenGL et SWIG • Programmation d’une libraire de calculs des surfaces des protéines en C++ • Refactoring du code C# de l’interface utilisateur MED-SuMo
7/2007 Ingénieur d’études INRIA/Scilab, France • Construction d’interfaces graphiques utilisateurs à l’aide du framework Java Swing
1/2007 – 3/2007 Chef de Projet Junior MTB Ingénierie générative - Mission BNP PARIBAS, France • Développement des états pour les Activités de gestion des grands comptes de la banque avec Jasper-Reports dans l’environnement Rational Application Developer for WebSphere 6 (RAD6)
10/2003 – 11/2006 Ingénieur de recherche Netherlands Kanker Institut - Laboratoire de Biologie Structurale, Pays-Bas • Conception et développement en Python d’un système d’intégration de logiciels de cristallographie • Conception, développement et mise en place du LIMS (Laboratory Information Management System) • Conception et développement de la première base de données concernant l’enregistrement d’expériences sur les complexes de protéines dans le cadre du projet Européen 3DRepertoire – MySQL, Java WebObjects • Consultant pour la modélisation et étude de l’intégration de PIMS (Proteomic Information Management System) dans le cadre des projets européens SPINE-2 et BIOXHIT
4/2003 – 6/2003 Consultant CIRIEL - Mission ALSTOM, France • Conception d’un système de supervision de servomoteur pour centrale électrique. Capteurs, ligne d’acquisition et développement de logiciel (LABVIEW)
10/2001 – 9/2002 Ingénieur d’études CNRS/Laboratoire de Météorologie Dynamique, France • Conception et réalisation des nacelles atmosphérique et océanique d’une station météorologique mobile et autonome L’Aéroclipper • Sélection des capteurs • Conception et programmation de cartes pour l’acquisition de données et la communication entre les nacelles • Encadrement de stagiaires BTS mécanique
9/1999 – 9/2001 Ingénieur informatique UNILOG (SSII), France Crédit Lyonnais • Intégration des modules AP, PO et GL d’Oracle Application pour la mise en œuvre d’un Système d’informations Achats – Intégration du module Internet SSP d’Oracle Application – Conception et réalisation des fonctionnalités spécifiques • Encadrement des développeurs chargés de la maintenance applicative Société Générale • Spécification et réalisation du portail de présentation des offres de la banque développé avec Vignette Story Server • Organisation, conception et mise en place des statistiques du site Cityvox (Portail Internet) • Modélisation des données. Conception et Réalisation du BackOffice d’un portail multilingue de type CityGuide. Développement avec Vignette Story Server (HTML,TCL/Tk) et SGBDR Oracle. • Gestion des partenaires, automatisation des flux de données, code en PL/SQL, SQLLoader et Script Shell.
2/1997 – 7/1997 Stagiaire DEA DGA/Centre d’études de Gramat, France • Étude et modélisation d’une ligne de transmission en régime d’isolement magnétique. Développement d’un code en Fortran et validation par un Logiciel de simulation Particles In Cell. • Étude, modélisation et validation d’un “Plasma Opening Switch” sous isolement magnétique.
FORMATIONS
2024 (≈ 50h) Fidle Introduction au Deep Learning, saison 2023/24 CNRS - Formation FIDLE (en ligne), France • Bases, concepts et enjeux - L’IA comme un outils - Acteurs de l’IA
4/2001 (1 semaine) IBM WebSphere développement avec VisualAge for Java - UNILOG Formation, France
7/2000 (1 semaine) Modélisation de Base de données Relationnelle - UNILOG Formation, France
8/1999 (1 mois) Techniques de développement en architecture Client/Serveur - UNILOG Formation, France • Générale : Algorithmique – Programmation événementielle – ORACLE SQL et PL/SQL • Spécialisée : ORACLE 2000 Forms et Reports
INFORMATIQUE
Systèmes d’exploitation UNIX, LINUX, Windows, Mac OSX Langages Python, C++, C, R, Haskell, Java, C#, .NET, OpenGL, Fortran, PL/SQL, Assembleur, Javascript. Frameworks Tango, Taurus, Sardana, Java WebObjects, Yesod Web, PyQt, SWIG. SGBDR ORACLE, MySQL, PostgreSQL, ACCESS. Outils de développement Git, Visual Studio Code, RStudio, LABVIEW. Progiciels ORACLE Applications (Modules: GL, AP, PO, SSP).
ETUDES
1997 - 1998 Cours du DEA de Mécanique - Université de Paris VI, Jussieu 1996 - 1997 DEA Modélisation et Instrumentation en Physique - Option Capteurs - Université de Paris XI, Orsay 1994 - 1996 Licence et Maîtrise de Physique Fondamentale - Option Electronique - Université de Paris XI, Orsay 1992 Baccalauréat Série C - Lycée Pierre Mendès France, Tunis
LANGUES
Français (maternelle), Anglais (courant), Arabe (parlé), Italien (parlé)
CENTRES D’INTÉRÊTS
Escalade (Initiateur escalade) Apnée (CMAS N2), Plongée sous-marine (CMAS N3) Voile, Batterie
PUBLICATIONS
Identify drug repurposing candidates by mining the Protein Data Bank. Fabrice Moriaud, Stéphane B. Richard, Stewart A. Adcock, Laetitia Chanas-Martin, Jean-Sébastien Surgand, Marouane Ben Jelloul, François Delfaud. 2011. Briefings Bioinform. 12(4), 336-340 accéder à l’article
ARP/wARP and molecular replacement: the next generation. Serge X. Cohen, Marouane Ben Jelloul, Fei Long, Alexei Vagin, Puck Knipscheer, Joyce Lebbink, Titia K. Sixma, Victor S. Lamzin, Garib N. Murshudov, Anastassis Perrakis. 2008. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 64, 49-60
SPINE bioinformatics and data-management aspects of high-throughput structural biology. Albeck S., Alzari P., Andreini C., Banci L, Berry I. M., Bertini I., Cambillau C., Canard B., Carter L., Cohen S. X. Diprose J. M., Dym O., Esnouf R. M., Felder C., Ferron F., Guillemot F., Hamer R., Ben Jelloul M., et al. 2006. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 62, 1184-95.
Co-expression of protein complexes in prokaryotic and eukaryotic hosts: experimental procedures, database tracking and case studies. Romier C., Ben Jelloul M., Albeck S., Buchwald G., Busso D., Celie P. H., Christodoulou E., De Marco V., van Gerwen S., et al. 2006. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 62, 1232-42.
Towards rationalization of crystallization screening for small- to medium-sized academic laboratories: the PACT/JCSG+ strategy. Newman J., Egan D., Walter T. S., Meged R., Berry I., Ben Jelloul M., Sussman J. L., Stuart D. I. and Perrakis A. 2005. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 61, 1426-31.
Towards complete validated models in the next generation of ARP/wARP. Cohen S. X., Morris R. J., Fernandez F. J., Ben Jelloul M., Kakaris M., Parthasarathy V., Lamzin V. S., Kleywegt G. J. & Perrakis A. 2004. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60, 2222-9.
COMMUNICATIONS ORALES
SR2A 10th international conference on synchrotron radiation and neutrons in art and archaeology Comprehensive synchrotron-based technical analysis of the practice of Pierre Soulages at the end of the 1950s C.Coustet, P.Hélou-de La Grandière, S.Schöder, M.Ben Jelloul, M.Thoury 21st-24th November 2023 Pinakothek der Moderne, Munich, Germany
3D-Repertoire Workshop: The Experimental Database The Experimental Database presentation and practical courses by Marouane Ben Jelloul October 2006 NKI, Amsterdam, The Netherlands
PIMS, BIOXHIT, EMBL Joint Meeting: Establishing a working relationship on LIMS devel. for molecular biology Contribution to discussions for futur developments and NKI strategy March 2005 Exchange Avenue Conference Center, Schiphol International Airport, The Netherlands
BIOXHIT/eHTPX/CCP4 Joint Workshop: Automation standards and frameworks: from data reduction to structure Applications of pyWARP a Control System toolbox by Marouane Ben Jelloul February 2005 Jesus College, Cambridge, UK
Spine Workshop - Workpackage 8: Macromolecular Structure Database Group Workshop A Protein Complex Database by Marouane Ben Jelloul April 2004 EBI, Hinxton, UK
POSTERS
Multimodal analysis of the practice of Pierre Soulages at the end of the 1950s and perspectives on the softening of modern oil paints C.Coustet, P.Hélou-de La Grandière, S.Schöder, F.Jamme, I.Bonaduce, S.Pizzimenti, L.Beck, M.Ben Jelloul, M.Thoury. Gordon Research Conference and Seminar, 6th-12th July 2024 Les Diablerets, Suisse.
NOIRoeS project: Total study of the historical and technical background of Soulages’ paintings to define the conservation strategy Pauline Helou-de la Grandière, Shadé ALAO AFOLABI, Marouane Ben Jelloul, Serge X. Cohen, Lionel Simonot, Mathieu Thoury. 5th international conference on Innovation in Art Research and Technology, June 2022 Paris. accéder à l’article
ARP/wARP Development Serge Cohen, Krista Joosten, Marouane Ben Jelloul, Anastassis Perrakis. Department review & evaluation, 15 May 2006 Amsterdam.
NKI Crystallisation Facility: Development and improvement of high throughput macro-molecular crystallization Patrick Celie, Marouane Ben Jelloul, Diederick de Vries, Anastassis Perrakis. Department review & evaluation, 15 May 2006 Amsterdam.
pyWARP: An automation development workbench for X-ray crystallography and a versatile decision making control system for ARP/wARP Marouane Ben Jelloul, Serge X Cohen, Anastassis Perrakis. BIOXHIT 2nd annual meeting, 18-19 January 2006 Grenoble.
Towards crystallization PIMS-LIMS: a crystallization experiment viewing and annotation interface Diederick de Vries, Marouane Ben Jelloul, John Diprose, Chris Morris, Serge Cohen, Patrick Celie, Anastassis Perrakis. BIOXHIT 2nd annual meeting, 18-19 January 2006 Grenoble.
Towards LIMS for 3D repertoire, X-ray crystallisation and beyond : Complex3D and XtalHit Marouane Ben Jelloul, Serge X Cohen, Patrick Celie, Anastassis Perrakis. 3D-Repertoire 1st annual meeting, 17-18 January 2006 Grenoble.