Martin Laviale

114
Documents

Publications

Publications

Deposit thumbnail

Best practices for AI-based image analysis applications in aquatic sciences: The iMagine case study

Elnaz Azmi , Khadijeh Alibabaei , Valentin Kozlov , Tjerk Krijger , Gabriele Accarino et al.

Ecological Informatics, 2025, 91, pp.103306. ⟨10.1016/j.ecoinf.2025.103306⟩

Article dans une revue hal-05157921v1
Deposit thumbnail

Long-term effects of the herbicide glyphosate and its main metabolite (aminomethylphosphonic acid) on the growth, chlorophyll a and morphology of freshwater benthic diatoms

Sarah Chéron , Vincent Felten , Aishwarya Venkataramanan , Carlos Eduardo Wetzel , David Heudre et al. Article dans une revue hal-05168372v1

Ecotoxicological insights into biodegradable and compostable plastic bags in freshwater systems: hidden environmental risks of a green alternative

Saúl Blanco , María Borrego-Ramos , Michael Feuchter , Katharina Resch-Fauster , Alexia Tischberger-Aldrian et al.

Hydrobiologia, 2025, ⟨10.1007/s10750-025-06044-4⟩

Article dans une revue hal-05364282v1

DIATLAS - The French freshwater DIatom ATLAS image dataset

Corentin Galinier , Pierre Villefourceix-Gimenez , Clément Bojic , Carlos Eduardo Wetzel , Jeremy Fix et al. Article dans une revue (data paper) hal-05505612v1
Deposit thumbnail

Ecophysiological modeling of the impact of light intensity and quality on microalgal growth in outdoor high-density open ponds

Philippe Le Noac’h , Sakina-Dorothée Ayata , Eric Pruvost , Sabine Marty , Olivier Bernard et al.

Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2025, 91, pp.104248. ⟨10.1016/j.algal.2025.104248⟩

Article dans une revue hal-05285974v1
Deposit thumbnail

Development of a collaborative web platform documenting the diversity and extent of diatom deformities

Iane Vallanzasca , Sébastien Boutry , Martin Laviale , Eric Quinton , Soizic Morin

Botany Letters, 2024, 171 (1), pp.50-53. ⟨10.1080/23818107.2023.2183898⟩

Article dans une revue hal-04019816v1
Deposit thumbnail

“UDE DIATOMS in the Wild 2024”: a new image dataset of freshwater diatoms for training deep learning models

Aishwarya Venkataramanan , Michael Kloster , Andrea Burfeid-Castellanos , Mimoza Dani , Ntambwe Mayombo et al.

GigaScience, 2024, 13, pp.1-15. ⟨10.1093/gigascience/giae087⟩

Article dans une revue hal-04811929v1

Concurrent bioimaging of microalgal photophysiology and oxidative stress

João Ezequiel , Matthew Nitschke , Martin Laviale , João Serôdio , Jörg Frommlet

Photosynthesis Research, 2023, ⟨10.1007/s11120-022-00989-6⟩

Article dans une revue hal-03879842v1
Deposit thumbnail

Disentangling the effects of microalgal diversity and thermal history on freshwater phototrophic biofilms facing heat stress: A thermal dose approach

Camille Courcoul , Martin Laviale , Vincent Baillard , Elise Billoir , Joséphine Leflaive et al.

Journal of Ecology, 2023, ⟨10.1111/1365-2745.14058⟩

Article dans une revue hal-03895245v1
Deposit thumbnail

Usefulness of synthetic datasets for diatom automatic detection using a deep-learning approach

Aishwarya Venkataramanan , Pierre Faure-Giovagnoli , Cyril Regan , David Heudre , Cécile Figus et al.

Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2023, 117, pp.105594. ⟨10.1016/j.engappai.2022.105594⟩

Article dans une revue hal-03852321v1
Deposit thumbnail

Multiple-stressor exposure of aquatic food webs: Nitrate and warming modulate the effect of pesticides

Vinita Vijayaraj , Martin Laviale , Joey Allen , Nellya Amoussou , Sabine Hilt et al.

Water Research, 2022, 216, pp.118325. ⟨10.1016/j.watres.2022.118325⟩

Article dans une revue hal-03718545v1
Deposit thumbnail

Evaluating Multiple Stressor Effects on Benthic–Pelagic Freshwater Communities in Systems of Different Complexities: Challenges in Upscaling

Vinita Vijayaraj , Nora Kipferler , Herwig Stibor , Joey Allen , Franz Hölker et al.

Water, 2022, 14 (4), pp.581. ⟨10.3390/w14040581⟩

Article dans une revue hal-03718544v1
Deposit thumbnail

Microalgal food sources greatly improve macroinvertebrate growth in detritus‐based headwater streams: Evidence from an instream experiment

Tiphaine Labed-Veydert , Michael Danger , Vincent Felten , Alexandre Bec , Martin Laviale et al.

Freshwater Biology, 2022, 67 (8), pp.1380-1394. ⟨10.1111/fwb.13924⟩

Article dans une revue hal-03717000v1
Deposit thumbnail

Machine learning techniques to characterize functional traits of plankton from image data

Eric C. Orenstein , Sakina-Dorothée Ayata , Frédéric Maps , Érica C. Becker , Fabio Benedetti et al.

Limnology and Oceanography, 2022, 67 (8), pp.1647-1669. ⟨10.1002/lno.12101⟩

Article dans une revue hal-03482282v2
Deposit thumbnail

A glance at the French-speaking diatomist community (ADLaF 2019 meeting)

Martin Laviale , Camille Noûs

Botany Letters, 2021, 168 (1), pp.3-5. ⟨10.1080/23818107.2020.1779811⟩

Article dans une revue hal-02877132v1
Deposit thumbnail

Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists

Severine Martini , Floriane Larras , Aurélien Boyé , Emile Faure , Nicole Aberle et al.

Limnology and Oceanography, 2021, 66 (3), pp.965-994. ⟨10.1002/lno.11655⟩

Article dans une revue hal-02996072v1
Deposit thumbnail

Disentangling the direct and indirect effects of agricultural runoff on freshwater ecosystems subject to global warming: A microcosm study

Joey Allen , Elisabeth M. Gross , Camille Courcoul , Stéphanie Boulêtreau , Arthur Compin et al.

Water Research, 2021, 190, pp.116713. ⟨10.1016/j.watres.2020.116713⟩

Article dans une revue hal-03031007v1

Do leaf‐litter decomposers control biofilm primary production and benthic algal community structure in forest streams? Insights from an outdoor mesocosm experiment

Joey Allen , Martin Laviale , Maria Cellamare , Quentin Bachelet , Vincent Felten et al.

Freshwater Biology, 2020, ⟨10.1111/fwb.13475⟩

Article dans une revue hal-02526187v1
Deposit thumbnail

Temperature and nutrient effects on the relative importance of brown and green pathways for stream ecosystem functioning: A mesocosm approach

Alice Gossiaux , Marc Rollin , Francois Guerold , Vincent Felten , Martin Laviale et al.

Freshwater Biology, 2020, 65 (7), pp.1239-1255. ⟨10.1111/fwb.13474⟩

Article dans une revue hal-02526210v1
Deposit thumbnail

Probing the Adhesion of the Common Freshwater Diatom Nitzschia palea at the Nanoscale

Martin Laviale , Audrey Beaussart , Joey Allen , Fabienne Quilès , Sofiane El-Kirat-Chatel

ACS Applied Materials & Interfaces, 2019, 11 (51), pp.48574-48582. ⟨10.1021/acsami.9b17821⟩

Article dans une revue hal-02396296v1
Deposit thumbnail

Modeling the impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity

Quentin Béchet , Martin Laviale , Nicolas Arsapin , Hubert Bonnefond , Olivier Bernard

Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.136. ⟨10.1186/s13068-017-0823-z⟩

Article dans une revue hal-01530933v1

The importance of being fast: comparative kinetics of vertical migration and non-photochemical quenching of benthic diatoms under light stress

Martin Laviale , Silja Frankenbach , João Serôdio

Marine Biology, 2016, 163 (1), ⟨10.1007/s00227-015-2793-7⟩

Article dans une revue hal-03502980v1
Deposit thumbnail

Response of intertidal benthic microalgal biofilms to a coupled light-temperature stress: evidence for latitudinal adaptation along the Atlantic coast of Southern Europe.

Martin Laviale , Alexandre Barnett , João Ezequiel , Bernard Lepetit , Silja Frankenbach et al.

Environmental Microbiology, 2015, pp.3662-3677. ⟨10.1111/1462-2920.12728⟩

Article dans une revue hal-01097838v1

Herbicide toxicity on river biofilms assessed by pulse amplitude modulated (PAM) fluorometry

S. Kim Tiam , M. Laviale , A. Feurtet Mazel , G. Jan , P. Gonzalez et al.

Aquatic Toxicology, 2015, 165, pp.160-171. ⟨10.1016/j.aquatox.2015.05.001⟩

Article dans une revue istex hal-02601382v1

The ``creme brulee'' sampler: A new high-resolution method for the fast vertical sampling of intertidal fine sediments

Martin Laviale , João Ezequiel , Catarina Pais , Paulo Cartaxana , João Serôdio

Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2015, 468, pp.37-44. ⟨10.1016/j.jembe.2015.03.013⟩

Article dans une revue istex hal-03502733v1
Deposit thumbnail

A Method for the Rapid Generation of Nonsequential Light-Response Curves of Chlorophyll Fluorescence

Joao Serôdio , Joao Ezequiel , Jörg Frommlet , Martin Laviale , Johann Lavaud

Plant Physiology, 2013, 163, pp.1089-1102. ⟨10.1104/pp.113.225243⟩

Article dans une revue hal-01096588v1
Deposit thumbnail

In vivo estimation of pigment composition and optical absorption cross-sectionby spectroradiometry in four aquatic photosynthetic micro-organisms

Vona Méléder , Martin Laviale , Bruno Jesus , Jean-Luc Mouget , Johann Lavaud et al.

Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2013, 129, pp.115-124. ⟨10.1016/j.jphotobiol.2013.10.005⟩

Article dans une revue istex hal-01096511v1
Deposit thumbnail

Efficiency of photoprotection in microphytobenthos: role of vertical migration and the xanthophyll cycle against photoinhibition

Joao Serôdio , Joao Ezequiel , Alexandre Barnett , Jean-Luc Mouget , Vona Méléder et al.

Aquatic Microbial Ecology, 2012, 67, pp.161-175. ⟨10.3354/ame01591⟩

Article dans une revue hal-01096446v2

Short term recovery of periphyton photosynthesis after pulse exposition to the photosystem II inhibitors atrazine and isoproturon

M. Laviale , Soizic Morin , A. Créach

Chemosphere, 2011, 84 (5), pp.731-734. ⟨10.1016/j.chemosphere.2011.03.035⟩

Article dans une revue istex hal-02595305v1

Light modulated toxicity of isoproturon toward natural stream periphyton photosynthesis: a comparison between constant and dynamic light conditions.

M. Laviale , J. Prygiel , A. Créach

Aquatic Toxicology, 2010, 97, pp.334-342. ⟨10.1016/j.aquatox.2010.01.004⟩

Article dans une revue istex hal-00482901v1

Stream periphyton photoacclimation response in field conditions: effect of community development and seasonal changes

M. Laviale , J. Prygiel , Yves Lemoine , Adeline Courseaux , A. Créach

Journal of Phycology, 2009, 45 (45), pp.1072-1082

Article dans une revue hal-00418786v1

De l’intérêt de l’approche participative entre diatomistes : de l’exploitation des atlas taxonomiques à la mise à disposition d’outils informatiques à l’usage de la communauté

Pierre Villefourceix-Gimenez , Corentin Galinier , Carlos E. Wetzel , Clément Bojic , Jérémy Fix et al.

43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France

Communication dans un congrès hal-05254580v1

L’altitude structure la diversité et la composition fonctionnelle des communautés de diatomées benthiques des rivières en France métropolitaine

Philippe Le Noac’h , Paul Mairand , David Heudre , Philippe Usseglio-Polatera , Martin Laviale

43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France

Communication dans un congrès hal-05256375v1

Citizen Science to Assess the Environmental Impact of Biodegradable Packaging: A Step Towards Sustainable Consumption and Production

María Borrego-Ramos , Saúl Blanco , Paula García-Llamas , Michael Feuchter , Katharina Resch-Fauster et al.

4th International Conference on Responsible Consumption and Production, EURECA-PRO, Sep 2025, Chania (Crète), Greece

Communication dans un congrès hal-05343714v1

Reconnaissance automatique des diatomées : défis, limites et applications possibles pour le suivi écologique des cours d’eau

Martin Laviale

WEBINAIRE SGS 2025 DE L’AFL - Bio-indication et biosurveillance des milieux aquatiques continentaux, Association Française de Limnologie (AFL), Jun 2025, En ligne, France

Communication dans un congrès hal-05124554v1

Assessing the effect of abiotic predictors on river diatom co-occurrence networks’ metrics in the context of bioindication

Philippe Le Noac’h , Philippe Usseglio-Polatera , Sakina-Dorothée Ayata , Martin Laviale

Journées 2025 du Réseau Thématique d’Écologie Statistique, RT Ecostat, Apr 2025, Metz (France), France

Communication dans un congrès hal-05429209v1

Bridging education and research to investigate biodegradable packaging materials’ impact on aquatic health: A citizen science approach

María Borrego-Ramos , Saúl Blanco , Paula García-Llamas , Michael Feuchter , Katharina Resch-Fauster et al.

III meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), Jun 2025, Pontevedra, Spain

Communication dans un congrès hal-05343826v1

Rôle des interactions entre diatomées et hyphomycètes dans la décomposition de la matière organique en conditions stressantes (carence nutritive, fongicide)

Titouan Dionet , Daphnée Caux , Mohamed Ali Mazouzi , Andrea Cappella , Aurélie Cébron et al.

43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France

Communication dans un congrès hal-05256091v1
Deposit thumbnail

Characterizing the potential effects of a complex textile industry contamination on structure, function and nutritional quality of phototrophic biofilms: the case study of the Cleurie River

Chloé Bonnineau , Sarah Chéron , Morgane Jean , Landry Ughetto , Nicolas Creusot et al.

Ecotoxicomic 2024 : 4th international conference on microbial ecotoxicology, Nov 2024, Gothenburg, Sweden

Communication dans un congrès hal-04807763v1

Reconnaissance automatique des diatomées : quantification de l’incertitude associée aux erreurs d’identification et influence sur l’estimation de l’état écologique des cours d’eau du bassin Rhin-Meuse

Aishwarya Venkataramanan , Philippe Usseglio-Polatera , David Heudre , Cedric Pradalier , Martin Laviale

6èmes Journées Internationales de Limnologie et d'Océanographie (JILO6), Oct 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04703930v1

Evaluation des effets multiples (environnementaux et sociétaux) d’une contamination chimique complexe d’un écosystème aquatique : premier bilan sur le site atelier de la Cleurie (Vosges)

Marie-Noëlle Pons , V. Felten , Sarah Chéron , David Heudre , Chloé Bonnineau et al.

6e colloque Du Réseau des Zones Ateliers CNRS (RZA). Co-construire la recherche sur les socio-écosystèmes, Réseau des zones ateliers (RZA, CNRS), Sep 2024, Sainte-Menehould, France

Communication dans un congrès hal-04703984v1

Les déformations des diatomées pour évaluer les effets d’une contamination complexe : le cas de la Cleurie.

Martin Laviale , David Heudre , V. Felten , Aishwarya Venkataramanan , Cedric Pradalier et al.

42ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2024, Limoges, France

Communication dans un congrès hal-04703962v1

La qualité nutritive du biofilm pour évaluer les effets d’une contamination complexe : le cas de la Cleurie

Morgane Jean , Martin Laviale , Sarah Chéron , Amandine Zahm , Valérie Goncalves et al.

42ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2024, Limoges, France

Communication dans un congrès hal-04703944v1

Can we Predict Regime Shifts in Shallow Aquatic Systems Exposed to Multiple Stressors? – Conclusions from Micro- and Mesocosm Experiments

Elisabeth Maria Gross , Joey Allen , Vinita Vijayaraj , Martin Laviale , Nora Kipferler et al.

SETAC EUROPE 33RD ANNUAL MEETING, SETAC, Apr 2023, Dublin, Ireland

Communication dans un congrès hal-04133275v1

La réponse des biofilms phototrophes au stress thermique dépend-elle de leur complexité, de leur histoire thermique, ou des deux ?

Camille Courcoul , Martin Laviale , Vincent Baillard , Elise Billoir , Joséphine Leflaive et al.

41ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-04208741v1

Reconnaissance automatique des diatomées : évaluation de l’influence des erreurs d’identification sur l’IBD et de l’état écologique des cours d’eau. Exemple du bassin Rhin-Meuse

Aishwarya Venkataramanan , Philippe Usseglio-Polatera , David Heudre , Cedric Pradalier , Martin Laviale

41ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-04208711v1

Development of a collaborative web-based approach for quantifying diatom deformities

Martin Laviale , Iane Vallanzasca , Eric Quinton , Sébastien Boutry , Soizic Morin

14th European Diatom Meeting (EDM 14), May 2023, Meise, Belgium

Communication dans un congrès hal-04092991v1

Gaussian Latent Representations for Uncertainty Estimation using Mahalanobis Distance in Deep Classifiers

Aishwarya Venkataramanan , Assia Benbihi , Martin Laviale , Cédric Pradalier

2023 IEEE/CVF International Conference on Computer Vision Workshops (ICCVW), Oct 2023, Paris, France. pp.4490-4499, ⟨10.1109/ICCVW60793.2023.00483⟩

Communication dans un congrès hal-04423169v1
Deposit thumbnail

Integrating Visual and Semantic Similarity Using Hierarchies for Image Retrieval

Aishwarya Venkataramanan , Martin Laviale , Cédric Pradalier

Computer Vision Systems. ICVS 2023, Sep 2023, Vienne (AUT), Austria. pp.422-431, ⟨10.1007/978-3-031-44137-0_35⟩

Communication dans un congrès hal-04423201v1

Effect of heat stress on phototrophic biofilm photosynthesis in the context of climate change: a thermal dose approach

Martin Laviale , Camille Courcoul , Lorraine Guyot , Vincent Baillard , Elise Billoir et al.

8th European Phycological Congress - EPC8, Aug 2023, Brest, France

Communication dans un congrès hal-04187554v1

Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists: Synthesis and recent results

Sakina-Dorothée Ayata , Séverine Martini , Martin Laviale , Beatrix E Beisner , Floriane Larras et al.

ALSO Aquatic Sciences Meeting, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO), Jun 2023, Palma de Mallorca, Spain. ⟨10.1002/lno.11655⟩

Communication dans un congrès hal-04117032v1

Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies

Iane Vallanzasca , Martin Laviale , Cyril Regan , David Heudre , Carlos E. Wetzel et al.

40ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2022, Clermont-Ferrand, France

Communication dans un congrès hal-03791615v1

Impact combiné du ruissellement agricole et du réchauffement climatique sur les producteurs et consommateurs primaires dans les cours d'eau agricoles

Elisabeth Maria Gross , Joey Allen , Didier Ortiz , Vinita Vijayaraj , Vincent Felten et al.

Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03718543v1

Évaluation des effets d'une contamination chimique complexe d'origine industrielle d'un petit cours d'eau forestier (Vosges, France) : une approche interdisciplinaire

Martin Laviale , Sarah Chéron , David Heudre , Marie-Noëlle Pons , Chloé Bonnineau et al.

Colloque Le développement durable : où en sommes-nous ?, EcotoQ - Centre de recherche en écotoxicologie du Québec; Chapitre Saint-Laurent, Jun 2022, Québec, Canada

Communication dans un congrès hal-03718513v1

Combined effect of agricultural run-off and warming on agricultural streams: a mesocosm experiment

Joey Allen , Didier Ortiz , V. Felten , Vinita Vijayaraj , Martin Laviale et al.

SFE2 GFÖ EEF Joint Meeting, International Conference on Ecological Sciences : "Ecology and Evolution: New Perspectives and societal challenges", Nov 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03925694v1

Perception of the scientific expertise within an environmental controversy due to pesticides contamination: the Cleurie River (France) case study

Martin Laviale , Pénélope Selhausen-Kosinski , Sarah Chéron , Simon Devin , V. Felten et al.

SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Ecology and Evolution : New perspectives and societal challenges, Laboratoire interdisciplinaire des environnements continentaux (Liec, Université de Lorraine), Nov 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03879414v1

Regime shifts in shallow aquatic systems caused by agricultural run-off and warming – Insights from micro- and mesocosms experiments

Elisabeth Maria Gross , Joey Allen , Vinita Vijayaraj , Martin Laviale , Nora Kipferler et al.

SFE2 GFÖ EEF Joint Meeting, International Conference on Ecological Sciences : "Ecology and Evolution: New Perspectives and societal challenges", Nov 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03925617v1

Can the functional stability of microbial communities exposed to multiple disturbances of the same nature be predicted?

Camille Courcoul , Stéphanie Boulêtreau , Vincent Baillard , Martin Laviale , Elise Billoir et al.

SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03879385v1

Regards croisés: Using artificial intelligence for ecology, perspectives from a computer scientist and an ecologist

Martin Laviale , Cedric Pradalier

SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03879398v1

Evaluation de l'impact d'une contamination chronique par micropolluants sur les communautés de diatomées d'un petit cours d'eau Vosgien

David Heudre , Sarah Chéron , Vincent Felten , Martin Laviale

39ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2021, Aix-en-Provence, France

Communication dans un congrès hal-03341737v1

Estimating metabolic rates in a mesocosm experiment to investigate the effects of increased water temperature and agricultural run-off on shallow lake ecosystem functioning and resilience

Gregorio Alejandro López Moreira Mazacotte , Nora Kipferler , Vinita Vijayaraj , Bastian Herbert Polst , Joey Allen et al.

2nd International Aquatic Mesocosm Research Symposium - From local processes to cross-domain interactions, Apr 2021, Virtual, Greece

Communication dans un congrès hal-03925497v1

Investigating the effects of increased water temperature and agricultural run-off on shallow lake ecosystem metabolism using a mesocosm approach

Gregorio Alejandro López Moreira Mazacotte , Nora Kipferler , Vinita Vijayaraj , Bastian Herbert Polst , Joey Allen et al.

10th International Shallow Lakes Conference, Mar 2021, virtual, Brazil

Communication dans un congrès hal-03925554v1

Étude interdisciplinaire de l'évolution d'une rivière urbaine héritant d'un lourd passé industriel, l'Orne

Sandrine Pain-Devin , Laurine Malardier , Alice Le Merrer , Xavier Bellanger , Alain Geffard et al.

Congrès Conjoint en Ecotoxicologie : "Les enjeux de la contamination urbaine sur la santé environnementale", Chapitre Saint Laurent; Foncer PURE; Regroupement Ecotoq; Réseau Ecobim, May 2021, Montréal, Canada

Communication dans un congrès hal-03245587v1

In situ exposure to glyphosate induces tolerance acquisition by phototrophic biofilms: the case study of the Cleurie river (France, Vosges mountains)

Sarah Chéron , Vincent Felten , Chloé Bonnineau , Marie-Noëlle Pons , David Heudre et al.

First international webinar of young microbial ecotoxicology researchers (ecotoxicomicYR), Dec 2021, Virtual conference, France

Communication dans un congrès hal-03468924v1

Alors, elle est polluée ma rivière ? Enjeux et opportunités de l’expertise scientifique interdisciplinaire

Simon Devin , Vincent Felten , Sandrine Pain-Devin , Elisabeth Maria Gross , Martin Laviale

Science & You, Université de Lorraine, Nov 2021, Metz, France. pp.384-385

Communication dans un congrès hal-03438852v1

Direct and indirect effects of agricultural run-off and climate warming on regime shifts in shallow aquatic systems

Elisabeth Maria Gross , Joey Allen , Vinita Vijayaraj , Nellya Amoussou , Nora Kipferler et al.

SETAC Europe 31th Annual Meeting, May 2021, virtual, Belgium

Communication dans un congrès hal-03925719v1

Caractérisation des effets d'une contamination complexe par les pesticides d'un petit cours d'eau vosgien emblématique (Cleurie) : une approche interdisciplinaire basée sur les biofilms phototrophes

Sarah Chéron , David Heudre , Chloé Bonnineau , Soizic Morin , Marie-Noëlle Pons et al.

Colloque SEFA2021 (Société d’Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée), Jun 2021, Virtuel, France

Communication dans un congrès hal-03350562v1

Reconnaissance automatique des diatomées par ordinateur : un défi toujours d’actualité

Martin Laviale

39ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2021, Aix-en-Provence, France

Communication dans un congrès hal-03341733v1

Tackling inter-class similarity and intra-class variance for microscopic image-based classification

Aishwarya Venkataramanan , Martin Laviale , Cécile Figus , Philippe Usseglio-Polatera , Cedric Pradalier

13th International Conference on Computer Vision Systems (ICVS 2021), Sep 2021, Virtual Event, Austria. ⟨10.1007/978-3-030-87156-7_8⟩

Communication dans un congrès hal-03341742v1

Mise en place d’un site atelier interdisciplinaire pour l’évaluation des effets multiples (environnementaux et sociétaux) d’une contamination chimique complexe des écosystèmes aquatiques : le cas d’un petit cours d’eau vosgien (Cleurie)

Martin Laviale , Sarah Chéron , David Heudre , Marie-Noëlle Pons , Chloé Bonnineau et al.

5e colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Réseau des Zones Ateliers; CNRS, Nov 2020, Blois, France

Communication dans un congrès hal-02961671v1

Vers un site atelier de ruisseaux de plaine : la forêt de la Reine

Michael Danger , Martin Laviale , Manon Grange , Vincent Felten , Sylvie Dousset et al.

5ème colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Nov 2020, Blois, France

Communication dans un congrès hal-02998427v1

Characterizing the effects of a complex contamination by pesticides: Preliminary results on the Cleurie River (France), a pilot site for an interdisciplinary approach based on phototrophic biofilms

Martin Laviale , Sarah Chéron , David Heudre , Chloé Bonnineau , Soizic Morin et al.

EcotoxicoMic 2020 - Second International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02950221v1

A question of complexity: Investigating regime shifts caused by agricultural run-off and climate warming between aquatic plants and microalgae in micro- and mesocosms

Elisabeth Maria Gross , Vinita Vijayaraj , Nellya Amoussou , Nora Kipferler , Joey Allen et al.

SETAC SciCON, SETAC.org, May 2020, Dublin, Ireland

Communication dans un congrès hal-03189447v1

Assessment of biomarkers in macrophytes exposed to individual and combined pollutants of agricultural run-off and climate change

Vinita Vijayaraj , Sabine Hilt , Joséphine Leflaive , Mechthild Schmitt-Jansen , Herwig Stibor et al.

SETAC Helsinki, SETAC.org, May 2019, Helsinki, Finland

Communication dans un congrès hal-03189451v1

Effet du stress thermique sur les diatomées benthiques dans le contexte du changement climatique : le cas du microphytobenthos intertidal

Martin Laviale , Lorraine Guyot , Sakina-Dorothée Ayata , Elise Billoir , Bruno Jesus

38e colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03234362v1

Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution)

Vincent Baillard , Laurine Malardier , Marie Laure Delignette-Muller , Eva Roubeau Dumont , Arnaud Elger et al.

38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03172724v1

Effets des microorganismes décomposeurs sur les producteurs primaires dans les ruisseaux : allélopathie, stimulation ou compétition ?

Joey Allen , Martin Laviale , Maria Cellamare , V. Felten , Joséphine Leflaive et al.

38e colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03234378v1

Caractérisation des propriétés d’adhésion d’une diatomée benthique (Nitzschia palea) à l’échelle nanométrique.

Martin Laviale , Audrey Beaussart , Joey Allen , Fabienne Quilès , Sofiane El-Kirat-Chatel

38e colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03005464v1

Can microbial functions mediate the impact of multiple stressors on regime shift in lake ecosystems?

Joey Allen , Elisabeth Maria Gross , Stéphanie Boulêtreau , Arthur Compin , Camille Courcoul et al.

11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia

Communication dans un congrès hal-03232613v1

Evaluation du potentiel tératogène du glyphosate sur les diatomées benthiques d’eau douce : le cas d’un petit cours d’eau vosgien (Cleurie)

Sarah Chéron , David Heudre , C. Bonnineau , Soizic Morin , François Guérold et al.

38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France

Communication dans un congrès hal-03184113v1

Probing the adhesion of the common freshwater diatom Nitzschia palea at the nanoscale

Martin Laviale , Audrey Beaussart , Joey Allen , Fabienne Quilès , Sofiane El-Kirat-Chatel

Réunion annuelle Bruker des utilisateurs de microscopies à force atomique et surfacique, Nov 2019, Grenoble, France

Communication dans un congrès hal-03005471v1

Etude multi-échelle du potentiel indicateur des biofilms phototrophes en zones agricoles: du bassin versant au micro-habitat

Chloé Oliger , Joey Allen , Quentin Bachelet , Audrey Beaussart , Michael Danger et al.

37ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2018, Meise, Belgique

Communication dans un congrès hal-03184152v1

Multi-scale study of the potential of phototrophic biofilm as functional indicators in agricultural areas: from catchment basin to micro-habitat

Chloé Oliger , Joey Allen , Quentin Bachelet , Audrey Beaussart , Michael Danger et al.

International Conference of Ecological Sciences SFE², Oct 2018, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03184165v1

Etude préliminaire du rôle potentiel du biofilm épiphytique dans la réponse des plantes aquatiques aux herbicides

Martin Laviale , Céline Chung , Léa Campagna , Elisabeth Maria Gross

35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2017, Belvaux, Luxembourg

Communication dans un congrès hal-03231648v1

Impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity: consequence for mass cultivation

Quentin Béchet , Martin Laviale , Nicolas Arsapin , Hubert Bonnefond , Olivier Bernard

6th congress of the International Society for Applied Phycology (ISAP), Jun 2017, Nantes, France

Communication dans un congrès hal-03231822v1

Caractérisation des substances polymériques extracellulaires (EPS) de biofilms de diatomées benthiques marines

Steven G Daniel , Cédric Hubas , Hubert Bonnefond , Sophie Sablé , Olivier Bernard et al.

35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Belvaux, Luxembourg

Communication dans un congrès hal-03231652v1

Effets combinés de la lumière et des herbicides sur la diatomée Gomphonema gracile : étude d’un cas de stress multiples et perspectives en écotoxicologie

Martin Laviale , Evane Thorel , Nicolas Mazzella , Johann Lavaud , Soizic Morin

35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Luxembourg, Luxembourg

Communication dans un congrès hal-03136744v1

Contrasted short term recovery of periphyton photosynthesis after pulse exposition to the similarly acting herbicides: The photosystem II inhibitors atrazine and isoproturon

M. Laviale , Soizic Morin

7th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2011, Girona, Spain. pp.1

Communication dans un congrès hal-02595201v1

Leveraging co-occurrence networks’ features to improve diatom-based diagnostic tools of river ecological quality

Philippe Le Noac’h , Philippe Usseglio-Polatera , Sakina-Dorothée Ayata , Martin Laviale

International Congress in Ecology and Evolution (SFE2 2024), Oct 2024, Lyon, France

Poster de conférence hal-04715745v1

Assessing the validity of a large-scale joint Species Distribution Model in the marine realm

Elena Berhocoïrigoin , Philippe Le Noac’h , Sakina-Dorothée Ayata , Martin Laviale , Jérémy Fix et al.

International Congress in Ecology and Evolution (SFE2 2024), Oct 2024, Lyon, France

Poster de conférence hal-04729185v1
Deposit thumbnail

Characterization of the metabolomic response of freshwater periphytic biofilm exposed to a serial dilution of glyphosate

Mélissa Eon , Landry Ughetto , Chloé Bonnineau , Soizic Morin , Sarah Chéron et al.

16èmes Journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF 2024), Jun 2024, Saint Malo, France.

Poster de conférence hal-04669371v1

The new University of Duisburg-Essen diatom digital image training data set (UDE did it v1.0)

Michael Kloster , Andrea Burfeid-Castellanos , Danijela Vidacović , Ntambwe Albert Serge Mayombo , Mimoza Dani et al.

16th International Diatom Symposium, Aug 2023, Yamagata, Japan

Poster de conférence hal-04187561v1

Link between glyphosate exposure and teratological forms in freshwater benthic diatoms

Sarah Chéron , Vincent Felten , David Heudre , Aishwarya Venkataramanan , Simon Devin et al.

SETAC Europe 32nd annual meeting, May 2022, Copenhaguen, Denmark.

Poster de conférence hal-03718551v1

Effet des pesticides sur la morphologie des diatomées benthiques d'eau douce : le cas du glyphosate

Sarah Chéron , Aishwarya Venkataramanan , Clara Martinez , Huyên Phong Hamon , David Heudre et al.

Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France.

Poster de conférence hal-03718531v1

Dynamique d'acquisition de la tolérance au glyphosate chez les communautés microbiennes périphytiques : étude en microcosmes.

Landry Ughetto , Sarah Chéron , Martin Laviale , Chloé Bonnineau

Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France. , 2022

Poster de conférence hal-03718539v1

Development of a collaborative web platform documenting the diversity and extent of diatom deformities

Iane Vallanzasca , Sébastien Boutry , Martin Laviale , Eric Quinton , Soizic Morin

EcotoxicoMic 2022- Third International Conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpellier, France. pp.1-4

Poster de conférence hal-03990070v1

Suivi multi-descripteurs des réponses de microorganismes et de leurs consommateurs à une contamination en azurants optiques

Antoine Tourret , Isabelle Lavoie , Martin Laviale , Philippe Juneau , Soizic Morin

Colloque conjoint en écotoxicologie (CCE 2022), Jun 2022, Québec, Canada.

Poster de conférence hal-03718519v1

Fluorescence-based detection of optical brighteners in a peatland

Marie-Noëlle Pons , Martin Laviale , Vincent Felten

SETAC Europe 31st annual meeting, May 2021, Virtual conference, France

Poster de conférence hal-03328298v1

Classification automatique des diatomées par apprentissage profond pour l’amélioration du diagnostic écologique des milieux aquatiques

Pierre Faure-Giovagnoli , Aishwarya Venkataramanan , Cécile Figus , David Heudre , Thibault de Garidel-Thoron et al.

5ème colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Nov 2020, Blois, France.

Poster de conférence hal-02961595v1

Utilisation d’images microscopiques artificielles en complément d’images réelles pour la détection automatique de diatomées par apprentissage profond

Pierre Faure-Giovagnoli , Aishwarya Venkataramanan , David Heudre , Thibault de Garidel-Thoron , Philippe Usseglio-Polatera et al.

Deep Learning pour le traitement et l'analyse d'image et de son en écologie, Nov 2020, Lyon, France

Poster de conférence hal-02995246v1

Impact of agricultural run-off and climate warming on shallow aquatic ecosystems – possible effects on a regime shift between aquatic primary producers

Elisabeth Maria Gross , Vinita Vijayaraj , Joséphine Leflaive , Bastian H. Polst , Joey Allen et al.

SETAC Helsinki, May 2019, Helsinki, Finland

Poster de conférence hal-03189450v1
Deposit thumbnail

Characterization of diatom adhesion properties on different substrates: from population to individual scale

Martin Laviale , Joey Allen , Cédric Hubas , Audrey Beaussart , Sofiane El-Kirat-Chatel

11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia

Poster de conférence hal-03232063v1
Deposit thumbnail

Functional trait-based approaches as a common framework for freshwater and marine ecologists

Severine Martini , Floriane Larras , Aurélien Boyé , Emile Faure , Nicole Aberle et al.

11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia

Poster de conférence hal-03232606v1

Do leaf litter decomposers control benthic algae production and community structure? Insights from an outdoor mesocosm experiment

Joey Allen , Martin Laviale , Maria Cellamare , Quentin Bachelet , V. Felten et al.

11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia

Poster de conférence hal-03232127v1

Ecophysiological modeling of the impact of light quantity and quality on microalgae growth in high-density open ponds

Philippe Le Noac'H , Sakina Dorothée Ayata , Antoine Sciandra , Olivier Bernard , Martin Laviale

Sfecologie 2018 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France

Poster de conférence hal-02368696v1

Restauration contrastée de la photosynthèse du périphyton suite à l'exposition à deux herbicides présentant le même mode d'action (atrazine et isoproturon)

M. Laviale , Soizic Morin , A. Créach

30ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2011, Boulogne sur mer, France. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595784v1

Consistency in diatom response to metal-contaminated environments

Soizic Morin , A. Cordonier , I. Lavoie , A. Arini , Saúl A. Blanco et al.

21st SETAC Europe Annual Meeting, May 2011, Milan, Italy. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595063v1

Diatom primary production in headwater streams: a limited but essential process

Joey Allen , Michael Danger , Carlos E. Wetzel , Vincent Felten , Martin Laviale

Johannes W Goesling; João Serôdio; Johann Lavaud. Diatoms: Biology & Applications Series, Scrivener Publishing, 2024, Diatoms: Biology & Applications Series, 9781119842088. ⟨10.1002/9781119842156.ch11⟩

Chapitre d'ouvrage hal-03879928v1

A free ride: Diatoms attached on motile diatoms

Vincent Roubeix , Martin Laviale

S.A. Cohn; K.M. Manoylov; R. Gordon. Diatoms: Biology & Applications, Wiley-Scrivener, 2021, DIGM - Diatom Gliding Motility, ⟨10.1002/9781119526483.ch9⟩

Chapitre d'ouvrage hal-03006190v1

Consistency in diatom response to metal-contaminated environments

Soizic Morin , A. Cordonier , I. Lavoie , Adeline Arini , Saul Blanco et al.

H. Guasch; A. Ginebreda; A. Geiszinger. Emerging and priority pollutants in rivers: bringing science into river management plans, Springer, pp.117-146, 2012, The Handbook of Environmental Chemistry 19, 978-3-642-25721-6. ⟨10.1007/978-3-642-25722-3_5⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02596950v1