Martin Laviale

Publications

Article dans une revue (31)

Best practices for AI-based image analysis applications in aquatic sciences: The iMagine case study Elnaz Azmi,Khadijeh Alibabaei,Valentin Kozlov,Tjerk Krijger,Gabriele Accarinoet al. Ecological Informatics, 2025, 91, pp.103306. ⟨10.1016/j.ecoinf.2025.103306⟩ Article dans une revue hal-05157921v1
Ecotoxicological insights into biodegradable and compostable plastic bags in freshwater systems: hidden environmental risks of a green alternative Saúl Blanco,María Borrego-Ramos,Michael Feuchter,Katharina Resch-Fauster,Alexia Tischberger-Aldrianet al. Hydrobiologia, 2025, ⟨10.1007/s10750-025-06044-4⟩ Article dans une revue hal-05364282v1
Long-term effects of the herbicide glyphosate and its main metabolite (aminomethylphosphonic acid) on the growth, chlorophyll a and morphology of freshwater benthic diatoms Sarah Chéron,Vincent Felten,Aishwarya Venkataramanan,Carlos Eduardo Wetzel,David Heudreet al. Heliyon, 2025, ⟨10.1016/j.heliyon.2025.e43680⟩ Article dans une revue hal-05168372v1
DIATLAS - The French freshwater DIatom ATLAS image dataset Corentin Galinier,Pierre Villefourceix-Gimenez,Clément Bojic,Carlos Eduardo Wetzel,Jeremy Fixet al. Zenodo, 2025, ⟨10.5281/zenodo.16260887⟩ Article dans une revue (data paper) hal-05505612v1
Ecophysiological modeling of the impact of light intensity and quality on microalgal growth in outdoor high-density open ponds Philippe Le Noac’h,Sakina-Dorothée Ayata,Eric Pruvost,Sabine Marty,Olivier Bernardet al. Algal Research - Biomass, Biofuels and Bioproducts, 2025, 91, pp.104248. ⟨10.1016/j.algal.2025.104248⟩ Article dans une revue hal-05285974v1
Development of a collaborative web platform documenting the diversity and extent of diatom deformities Iane Vallanzasca,Sébastien Boutry,Martin Laviale,Eric Quinton,Soizic Morin Botany Letters, 2024, 171 (1), pp.50-53. ⟨10.1080/23818107.2023.2183898⟩ Article dans une revue hal-04019816v1
“UDE DIATOMS in the Wild 2024”: a new image dataset of freshwater diatoms for training deep learning models Aishwarya Venkataramanan,Michael Kloster,Andrea Burfeid-Castellanos,Mimoza Dani,Ntambwe Mayomboet al. GigaScience, 2024, 13, pp.1-15. ⟨10.1093/gigascience/giae087⟩ Article dans une revue hal-04811929v1
Concurrent bioimaging of microalgal photophysiology and oxidative stress João Ezequiel,Matthew Nitschke,Martin Laviale,João Serôdio,Jörg Frommlet Photosynthesis Research, 2023, ⟨10.1007/s11120-022-00989-6⟩ Article dans une revue hal-03879842v1
Disentangling the effects of microalgal diversity and thermal history on freshwater phototrophic biofilms facing heat stress: A thermal dose approach Camille Courcoul,Martin Laviale,Vincent Baillard,Elise Billoir,Joséphine Leflaiveet al. Journal of Ecology, 2023, ⟨10.1111/1365-2745.14058⟩ Article dans une revue hal-03895245v1
Usefulness of synthetic datasets for diatom automatic detection using a deep-learning approach Aishwarya Venkataramanan,Pierre Faure-Giovagnoli,Cyril Regan,David Heudre,Cécile Figuset al. Engineering Applications of Artificial Intelligence, 2023, 117, pp.105594. ⟨10.1016/j.engappai.2022.105594⟩ Article dans une revue hal-03852321v1
Multiple-stressor exposure of aquatic food webs: Nitrate and warming modulate the effect of pesticides Vinita Vijayaraj,Martin Laviale,Joey Allen,Nellya Amoussou,Sabine Hiltet al. Water Research, 2022, 216, pp.118325. ⟨10.1016/j.watres.2022.118325⟩ Article dans une revue hal-03718545v1
Evaluating Multiple Stressor Effects on Benthic–Pelagic Freshwater Communities in Systems of Different Complexities: Challenges in Upscaling Vinita Vijayaraj,Nora Kipferler,Herwig Stibor,Joey Allen,Franz Hölkeret al. Water, 2022, 14 (4), pp.581. ⟨10.3390/w14040581⟩ Article dans une revue hal-03718544v1
Machine learning techniques to characterize functional traits of plankton from image data Eric C. Orenstein,Sakina-Dorothée Ayata,Frédéric Maps,Érica C. Becker,Fabio Benedettiet al. Limnology and Oceanography, 2022, 67 (8), pp.1647-1669. ⟨10.1002/lno.12101⟩ Article dans une revue hal-03482282v2
Microalgal food sources greatly improve macroinvertebrate growth in detritus‐based headwater streams: Evidence from an instream experiment Tiphaine Labed-Veydert,Michael Danger,Vincent Felten,Alexandre Bec,Martin Lavialeet al. Freshwater Biology, 2022, 67 (8), pp.1380-1394. ⟨10.1111/fwb.13924⟩ Article dans une revue hal-03717000v1
A glance at the French-speaking diatomist community (ADLaF 2019 meeting) Martin Laviale,Camille Noûs Botany Letters, 2021, 168 (1), pp.3-5. ⟨10.1080/23818107.2020.1779811⟩ Article dans une revue hal-02877132v1
Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists Severine Martini,Floriane Larras,Aurélien Boyé,Emile Faure,Nicole Aberleet al. Limnology and Oceanography, 2021, 66 (3), pp.965-994. ⟨10.1002/lno.11655⟩ Article dans une revue hal-02996072v1
Disentangling the direct and indirect effects of agricultural runoff on freshwater ecosystems subject to global warming: A microcosm study Joey Allen,Elisabeth M. Gross,Camille Courcoul,Stéphanie Boulêtreau,Arthur Compinet al. Water Research, 2021, 190, pp.116713. ⟨10.1016/j.watres.2020.116713⟩ Article dans une revue hal-03031007v1
Temperature and nutrient effects on the relative importance of brown and green pathways for stream ecosystem functioning: A mesocosm approach Alice Gossiaux,Marc Rollin,Francois Guerold,Vincent Felten,Martin Lavialeet al. Freshwater Biology, 2020, 65 (7), pp.1239-1255. ⟨10.1111/fwb.13474⟩ Article dans une revue hal-02526210v1
Do leaf‐litter decomposers control biofilm primary production and benthic algal community structure in forest streams? Insights from an outdoor mesocosm experiment Joey Allen,Martin Laviale,Maria Cellamare,Quentin Bachelet,Vincent Feltenet al. Freshwater Biology, 2020, ⟨10.1111/fwb.13475⟩ Article dans une revue hal-02526187v1
Probing the Adhesion of the Common Freshwater Diatom Nitzschia palea at the Nanoscale Martin Laviale,Audrey Beaussart,Joey Allen,Fabienne Quilès,Sofiane El-Kirat-Chatel ACS Applied Materials & Interfaces, 2019, 11 (51), pp.48574-48582. ⟨10.1021/acsami.9b17821⟩ Article dans une revue hal-02396296v1
Modeling the impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity Quentin Béchet,Martin Laviale,Nicolas Arsapin,Hubert Bonnefond,Olivier Bernard Biotechnology for Biofuels, 2017, 10 (1), pp.136. ⟨10.1186/s13068-017-0823-z⟩ Article dans une revue hal-01530933v1
The importance of being fast: comparative kinetics of vertical migration and non-photochemical quenching of benthic diatoms under light stress Martin Laviale,Silja Frankenbach,João Serôdio Marine Biology, 2016, 163 (1), ⟨10.1007/s00227-015-2793-7⟩ Article dans une revue hal-03502980v1
Response of intertidal benthic microalgal biofilms to a coupled light-temperature stress: evidence for latitudinal adaptation along the Atlantic coast of Southern Europe. Martin Laviale,Alexandre Barnett,João Ezequiel,Bernard Lepetit,Silja Frankenbachet al. Environmental Microbiology, 2015, pp.3662-3677. ⟨10.1111/1462-2920.12728⟩ Article dans une revue hal-01097838v1
Herbicide toxicity on river biofilms assessed by pulse amplitude modulated (PAM) fluorometry S. Kim Tiam,M. Laviale,A. Feurtet Mazel,G. Jan,P. Gonzalezet al. Aquatic Toxicology, 2015, 165, pp.160-171. ⟨10.1016/j.aquatox.2015.05.001⟩ Article dans une revue istex hal-02601382v1
The ``creme brulee'' sampler: A new high-resolution method for the fast vertical sampling of intertidal fine sediments Martin Laviale,João Ezequiel,Catarina Pais,Paulo Cartaxana,João Serôdio Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2015, 468, pp.37-44. ⟨10.1016/j.jembe.2015.03.013⟩ Article dans une revue istex hal-03502733v1
A Method for the Rapid Generation of Nonsequential Light-Response Curves of Chlorophyll Fluorescence Joao Serôdio,Joao Ezequiel,Jörg Frommlet,Martin Laviale,Johann Lavaud Plant Physiology, 2013, 163, pp.1089-1102. ⟨10.1104/pp.113.225243⟩ Article dans une revue hal-01096588v1
In vivo estimation of pigment composition and optical absorption cross-sectionby spectroradiometry in four aquatic photosynthetic micro-organisms Vona Méléder,Martin Laviale,Bruno Jesus,Jean-Luc Mouget,Johann Lavaudet al. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2013, 129, pp.115-124. ⟨10.1016/j.jphotobiol.2013.10.005⟩ Article dans une revue istex hal-01096511v1
Efficiency of photoprotection in microphytobenthos: role of vertical migration and the xanthophyll cycle against photoinhibition Joao Serôdio,Joao Ezequiel,Alexandre Barnett,Jean-Luc Mouget,Vona Méléderet al. Aquatic Microbial Ecology, 2012, 67, pp.161-175. ⟨10.3354/ame01591⟩ Article dans une revue hal-01096446v2
Short term recovery of periphyton photosynthesis after pulse exposition to the photosystem II inhibitors atrazine and isoproturon M. Laviale,Soizic Morin,A. Créach Chemosphere, 2011, 84 (5), pp.731-734. ⟨10.1016/j.chemosphere.2011.03.035⟩ Article dans une revue istex hal-02595305v1
Light modulated toxicity of isoproturon toward natural stream periphyton photosynthesis: a comparison between constant and dynamic light conditions. M. Laviale,J. Prygiel,A. Créach Aquatic Toxicology, 2010, 97, pp.334-342. ⟨10.1016/j.aquatox.2010.01.004⟩ Article dans une revue istex hal-00482901v1
Stream periphyton photoacclimation response in field conditions: effect of community development and seasonal changes M. Laviale,J. Prygiel,Yves Lemoine,Adeline Courseaux,A. Créach Journal of Phycology, 2009, 45 (45), pp.1072-1082 Article dans une revue hal-00418786v1

Communication dans un congrès (59)

De l’intérêt de l’approche participative entre diatomistes : de l’exploitation des atlas taxonomiques à la mise à disposition d’outils informatiques à l’usage de la communauté Pierre Villefourceix-Gimenez,Corentin Galinier,Carlos E. Wetzel,Clément Bojic,Jérémy Fixet al. 43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France Communication dans un congrès hal-05254580v1
L’altitude structure la diversité et la composition fonctionnelle des communautés de diatomées benthiques des rivières en France métropolitaine Philippe Le Noac’h,Paul Mairand,David Heudre,Philippe Usseglio-Polatera,Martin Laviale 43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France Communication dans un congrès hal-05256375v1
Citizen Science to Assess the Environmental Impact of Biodegradable Packaging: A Step Towards Sustainable Consumption and Production María Borrego-Ramos,Saúl Blanco,Paula García-Llamas,Michael Feuchter,Katharina Resch-Fausteret al. 4th International Conference on Responsible Consumption and Production, EURECA-PRO, Sep 2025, Chania (Crète), Greece Communication dans un congrès hal-05343714v1
Spore-tacular automation: deep learning analysis for aquatic hyphomycete ecotoxicological assessment Titouan Dionet,Daphnée Caux,Jérémy Jabiol,Martin Laviale,Michael Danger EcotoxicoMic YR 2025, Oct 2025, En ligne, France Communication dans un congrès hal-05565888v1
Assessing the effect of abiotic predictors on river diatom co-occurrence networks’ metrics in the context of bioindication Philippe Le Noac’h,Philippe Usseglio-Polatera,Sakina-Dorothée Ayata,Martin Laviale Journées 2025 du Réseau Thématique d’Écologie Statistique, RT Ecostat, Apr 2025, Metz (France), France Communication dans un congrès hal-05429209v1
Reconnaissance automatique des diatomées : défis, limites et applications possibles pour le suivi écologique des cours d’eau Martin Laviale WEBINAIRE SGS 2025 DE L’AFL - Bio-indication et biosurveillance des milieux aquatiques continentaux, Association Française de Limnologie (AFL), Jun 2025, En ligne, France Communication dans un congrès hal-05124554v1
Bridging education and research to investigate biodegradable packaging materials’ impact on aquatic health: A citizen science approach María Borrego-Ramos,Saúl Blanco,Paula García-Llamas,Michael Feuchter,Katharina Resch-Fausteret al. III meeting of the Iberian Ecological Society (SIBECOL), Jun 2025, Pontevedra, Spain Communication dans un congrès hal-05343826v1
Responses of aquatic hyphomycetes to nutrient limitation and tebuconazole exposure: quantitative assessment using deep learning models Titouan Dionet,Daphnée Caux,Mohamed Ali Mazouzi,Jérémy Jabiol,Martin Lavialeet al. 10th Plant Litter Processing in Freshwaters Meeting, Alexander Feckler; Mirco Bundschuh, Aug 2025, Landau in der Pfalz, Germany Communication dans un congrès hal-05565874v1
Rôle des interactions entre diatomées et hyphomycètes dans la décomposition de la matière organique en conditions stressantes (carence nutritive, fongicide) Titouan Dionet,Daphnée Caux,Mohamed Ali Mazouzi,Andrea Cappella,Aurélie Cébronet al. 43ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2025, Rouen, France Communication dans un congrès hal-05256091v1
Characterizing the potential effects of a complex textile industry contamination on structure, function and nutritional quality of phototrophic biofilms: the case study of the Cleurie River Chloé Bonnineau,Sarah Chéron,Morgane Jean,Landry Ughetto,Nicolas Creusotet al. Ecotoxicomic 2024 : 4th international conference on microbial ecotoxicology, Nov 2024, Gothenburg, Sweden Communication dans un congrès hal-04807763v1
Reconnaissance automatique des diatomées : quantification de l’incertitude associée aux erreurs d’identification et influence sur l’estimation de l’état écologique des cours d’eau du bassin Rhin-Meuse Aishwarya Venkataramanan,Philippe Usseglio-Polatera,David Heudre,Cedric Pradalier,Martin Laviale 6èmes Journées Internationales de Limnologie et d'Océanographie (JILO6), Oct 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04703930v1
Evaluation des effets multiples (environnementaux et sociétaux) d’une contamination chimique complexe d’un écosystème aquatique : premier bilan sur le site atelier de la Cleurie (Vosges) Marie-Noëlle Pons,V. Felten,Sarah Chéron,David Heudre,Chloé Bonnineauet al. 6e colloque Du Réseau des Zones Ateliers CNRS (RZA). Co-construire la recherche sur les socio-écosystèmes, Réseau des zones ateliers (RZA, CNRS), Sep 2024, Sainte-Menehould, France Communication dans un congrès hal-04703984v1
La qualité nutritive du biofilm pour évaluer les effets d’une contamination complexe : le cas de la Cleurie Morgane Jean,Martin Laviale,Sarah Chéron,Amandine Zahm,Valérie Goncalveset al. 42ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2024, Limoges, France Communication dans un congrès hal-04703944v1
Les déformations des diatomées pour évaluer les effets d’une contamination complexe : le cas de la Cleurie. Martin Laviale,David Heudre,V. Felten,Aishwarya Venkataramanan,Cedric Pradalieret al. 42ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2024, Limoges, France Communication dans un congrès hal-04703962v1
Development of a collaborative web-based approach for quantifying diatom deformities Martin Laviale,Iane Vallanzasca,Eric Quinton,Sébastien Boutry,Soizic Morin 14th European Diatom Meeting (EDM 14), May 2023, Meise, Belgium Communication dans un congrès hal-04092991v1
La réponse des biofilms phototrophes au stress thermique dépend-elle de leur complexité, de leur histoire thermique, ou des deux ? Camille Courcoul,Martin Laviale,Vincent Baillard,Elise Billoir,Joséphine Leflaiveet al. 41ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France Communication dans un congrès hal-04208741v1
Reconnaissance automatique des diatomées : évaluation de l’influence des erreurs d’identification sur l’IBD et de l’état écologique des cours d’eau. Exemple du bassin Rhin-Meuse Aishwarya Venkataramanan,Philippe Usseglio-Polatera,David Heudre,Cedric Pradalier,Martin Laviale 41ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France Communication dans un congrès hal-04208711v1
Can we Predict Regime Shifts in Shallow Aquatic Systems Exposed to Multiple Stressors? – Conclusions from Micro- and Mesocosm Experiments Elisabeth Maria Gross,Joey Allen,Vinita Vijayaraj,Martin Laviale,Nora Kipferleret al. SETAC EUROPE 33RD ANNUAL MEETING, SETAC, Apr 2023, Dublin, Ireland Communication dans un congrès hal-04133275v1
Gaussian Latent Representations for Uncertainty Estimation using Mahalanobis Distance in Deep Classifiers Aishwarya Venkataramanan,Assia Benbihi,Martin Laviale,Cédric Pradalier 2023 IEEE/CVF International Conference on Computer Vision Workshops (ICCVW), Oct 2023, Paris, France. pp.4490-4499, ⟨10.1109/ICCVW60793.2023.00483⟩ Communication dans un congrès hal-04423169v1
Integrating Visual and Semantic Similarity Using Hierarchies for Image Retrieval Aishwarya Venkataramanan,Martin Laviale,Cédric Pradalier Computer Vision Systems. ICVS 2023, Sep 2023, Vienne (AUT), Austria. pp.422-431, ⟨10.1007/978-3-031-44137-0_35⟩ Communication dans un congrès hal-04423201v1
Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists: Synthesis and recent results Sakina-Dorothée Ayata,Séverine Martini,Martin Laviale,Beatrix E Beisner,Floriane Larraset al. ALSO Aquatic Sciences Meeting, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO), Jun 2023, Palma de Mallorca, Spain. ⟨10.1002/lno.11655⟩ Communication dans un congrès hal-04117032v1
Effect of heat stress on phototrophic biofilm photosynthesis in the context of climate change: a thermal dose approach Martin Laviale,Camille Courcoul,Lorraine Guyot,Vincent Baillard,Elise Billoiret al. 8th European Phycological Congress - EPC8, Aug 2023, Brest, France Communication dans un congrès hal-04187554v1
Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies Iane Vallanzasca,Martin Laviale,Cyril Regan,David Heudre,Carlos E. Wetzelet al. 40ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2022, Clermont-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-03791615v1
Impact combiné du ruissellement agricole et du réchauffement climatique sur les producteurs et consommateurs primaires dans les cours d'eau agricoles Elisabeth Maria Gross,Joey Allen,Didier Ortiz,Vinita Vijayaraj,Vincent Feltenet al. Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03718543v1
Perception of the scientific expertise within an environmental controversy due to pesticides contamination: the Cleurie River (France) case study Martin Laviale,Pénélope Selhausen-Kosinski,Sarah Chéron,Simon Devin,V. Feltenet al. SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Ecology and Evolution : New perspectives and societal challenges, Laboratoire interdisciplinaire des environnements continentaux (Liec, Université de Lorraine), Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03879414v1
Combined effect of agricultural run-off and warming on agricultural streams: a mesocosm experiment Joey Allen,Didier Ortiz,V. Felten,Vinita Vijayaraj,Martin Lavialeet al. SFE2 GFÖ EEF Joint Meeting, International Conference on Ecological Sciences : "Ecology and Evolution: New Perspectives and societal challenges", Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03925694v1
Évaluation des effets d'une contamination chimique complexe d'origine industrielle d'un petit cours d'eau forestier (Vosges, France) : une approche interdisciplinaire Martin Laviale,Sarah Chéron,David Heudre,Marie-Noëlle Pons,Chloé Bonnineauet al. Colloque Le développement durable : où en sommes-nous ?, EcotoQ - Centre de recherche en écotoxicologie du Québec; Chapitre Saint-Laurent, Jun 2022, Québec, Canada Communication dans un congrès hal-03718513v1
Regime shifts in shallow aquatic systems caused by agricultural run-off and warming – Insights from micro- and mesocosms experiments Elisabeth Maria Gross,Joey Allen,Vinita Vijayaraj,Martin Laviale,Nora Kipferleret al. SFE2 GFÖ EEF Joint Meeting, International Conference on Ecological Sciences : "Ecology and Evolution: New Perspectives and societal challenges", Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03925617v1
Can the functional stability of microbial communities exposed to multiple disturbances of the same nature be predicted? Camille Courcoul,Stéphanie Boulêtreau,Vincent Baillard,Martin Laviale,Elise Billoiret al. SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03879385v1
Regards croisés: Using artificial intelligence for ecology, perspectives from a computer scientist and an ecologist Martin Laviale,Cedric Pradalier SFE²-GfÖ-EEF Joint meeting, International Conference on Ecological Sciences, Nov 2022, Metz, France Communication dans un congrès hal-03879398v1
Estimating metabolic rates in a mesocosm experiment to investigate the effects of increased water temperature and agricultural run-off on shallow lake ecosystem functioning and resilience Gregorio Alejandro López Moreira Mazacotte,Nora Kipferler,Vinita Vijayaraj,Bastian Herbert Polst,Joey Allenet al. 2nd International Aquatic Mesocosm Research Symposium - From local processes to cross-domain interactions, Apr 2021, Virtual, Greece Communication dans un congrès hal-03925497v1
Evaluation de l'impact d'une contamination chronique par micropolluants sur les communautés de diatomées d'un petit cours d'eau Vosgien David Heudre,Sarah Chéron,Vincent Felten,Martin Laviale 39ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2021, Aix-en-Provence, France Communication dans un congrès hal-03341737v1
Investigating the effects of increased water temperature and agricultural run-off on shallow lake ecosystem metabolism using a mesocosm approach Gregorio Alejandro López Moreira Mazacotte,Nora Kipferler,Vinita Vijayaraj,Bastian Herbert Polst,Joey Allenet al. 10th International Shallow Lakes Conference, Mar 2021, virtual, Brazil Communication dans un congrès hal-03925554v1
Étude interdisciplinaire de l'évolution d'une rivière urbaine héritant d'un lourd passé industriel, l'Orne Sandrine Pain-Devin,Laurine Malardier,Alice Le Merrer,Xavier Bellanger,Alain Geffardet al. Congrès Conjoint en Ecotoxicologie : "Les enjeux de la contamination urbaine sur la santé environnementale", Chapitre Saint Laurent; Foncer PURE; Regroupement Ecotoq; Réseau Ecobim, May 2021, Montréal, Canada Communication dans un congrès hal-03245587v1
In situ exposure to glyphosate induces tolerance acquisition by phototrophic biofilms: the case study of the Cleurie river (France, Vosges mountains) Sarah Chéron,Vincent Felten,Chloé Bonnineau,Marie-Noëlle Pons,David Heudreet al. First international webinar of young microbial ecotoxicology researchers (ecotoxicomicYR), Dec 2021, Virtual conference, France Communication dans un congrès hal-03468924v1
Alors, elle est polluée ma rivière ? Enjeux et opportunités de l’expertise scientifique interdisciplinaire Simon Devin,Vincent Felten,Sandrine Pain-Devin,Elisabeth Maria Gross,Martin Laviale Science & You, Université de Lorraine, Nov 2021, Metz, France. pp.384-385 Communication dans un congrès hal-03438852v1
Tackling inter-class similarity and intra-class variance for microscopic image-based classification Aishwarya Venkataramanan,Martin Laviale,Cécile Figus,Philippe Usseglio-Polatera,Cedric Pradalier 13th International Conference on Computer Vision Systems (ICVS 2021), Sep 2021, Virtual Event, Austria. ⟨10.1007/978-3-030-87156-7_8⟩ Communication dans un congrès hal-03341742v1
Caractérisation des effets d'une contamination complexe par les pesticides d'un petit cours d'eau vosgien emblématique (Cleurie) : une approche interdisciplinaire basée sur les biofilms phototrophes Sarah Chéron,David Heudre,Chloé Bonnineau,Soizic Morin,Marie-Noëlle Ponset al. Colloque SEFA2021 (Société d’Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée), Jun 2021, Virtuel, France Communication dans un congrès hal-03350562v1
Reconnaissance automatique des diatomées par ordinateur : un défi toujours d’actualité Martin Laviale 39ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2021, Aix-en-Provence, France Communication dans un congrès hal-03341733v1
Direct and indirect effects of agricultural run-off and climate warming on regime shifts in shallow aquatic systems Elisabeth Maria Gross,Joey Allen,Vinita Vijayaraj,Nellya Amoussou,Nora Kipferleret al. SETAC Europe 31th Annual Meeting, May 2021, virtual, Belgium Communication dans un congrès hal-03925719v1
Vers un site atelier de ruisseaux de plaine : la forêt de la Reine Michael Danger,Martin Laviale,Manon Grange,Vincent Felten,Sylvie Doussetet al. 5ème colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Nov 2020, Blois, France Communication dans un congrès hal-02998427v1
Mise en place d’un site atelier interdisciplinaire pour l’évaluation des effets multiples (environnementaux et sociétaux) d’une contamination chimique complexe des écosystèmes aquatiques : le cas d’un petit cours d’eau vosgien (Cleurie) Martin Laviale,Sarah Chéron,David Heudre,Marie-Noëlle Pons,Chloé Bonnineauet al. 5e colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Réseau des Zones Ateliers; CNRS, Nov 2020, Blois, France Communication dans un congrès hal-02961671v1
A question of complexity: Investigating regime shifts caused by agricultural run-off and climate warming between aquatic plants and microalgae in micro- and mesocosms Elisabeth Maria Gross,Vinita Vijayaraj,Nellya Amoussou,Nora Kipferler,Joey Allenet al. SETAC SciCON, SETAC.org, May 2020, Dublin, Ireland Communication dans un congrès hal-03189447v1
Characterizing the effects of a complex contamination by pesticides: Preliminary results on the Cleurie River (France), a pilot site for an interdisciplinary approach based on phototrophic biofilms Martin Laviale,Sarah Chéron,David Heudre,Chloé Bonnineau,Soizic Morinet al. EcotoxicoMic 2020 - Second International Conference on Microbial Ecotoxicology, Oct 2020, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02950221v1
Effet du stress thermique sur les diatomées benthiques dans le contexte du changement climatique : le cas du microphytobenthos intertidal Martin Laviale,Lorraine Guyot,Sakina-Dorothée Ayata,Elise Billoir,Bruno Jesus 38e colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03234362v1
Assessment of biomarkers in macrophytes exposed to individual and combined pollutants of agricultural run-off and climate change Vinita Vijayaraj,Sabine Hilt,Joséphine Leflaive,Mechthild Schmitt-Jansen,Herwig Stiboret al. SETAC Helsinki, SETAC.org, May 2019, Helsinki, Finland Communication dans un congrès hal-03189451v1
Importance de la variabilité intraspécifique de la polluosensibilité pour l’évaluation du risque ecotoxicologique basée sur l’approche SSD (Species Sensitivity Distribution) Vincent Baillard,Laurine Malardier,Marie Laure Delignette-Muller,Eva Roubeau Dumont,Arnaud Elgeret al. 38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03172724v1
Effets des microorganismes décomposeurs sur les producteurs primaires dans les ruisseaux : allélopathie, stimulation ou compétition ? Joey Allen,Martin Laviale,Maria Cellamare,V. Felten,Joséphine Leflaiveet al. 38e colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03234378v1
Caractérisation des propriétés d’adhésion d’une diatomée benthique (Nitzschia palea) à l’échelle nanométrique. Martin Laviale,Audrey Beaussart,Joey Allen,Fabienne Quilès,Sofiane El-Kirat-Chatel 38e colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03005464v1
Can microbial functions mediate the impact of multiple stressors on regime shift in lake ecosystems? Joey Allen,Elisabeth Maria Gross,Stéphanie Boulêtreau,Arthur Compin,Camille Courcoulet al. 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia Communication dans un congrès hal-03232613v1
Evaluation du potentiel tératogène du glyphosate sur les diatomées benthiques d’eau douce : le cas d’un petit cours d’eau vosgien (Cleurie) Sarah Chéron,David Heudre,C. Bonnineau,Soizic Morin,François Guéroldet al. 38ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France Communication dans un congrès hal-03184113v1
Probing the adhesion of the common freshwater diatom Nitzschia palea at the nanoscale Martin Laviale,Audrey Beaussart,Joey Allen,Fabienne Quilès,Sofiane El-Kirat-Chatel Réunion annuelle Bruker des utilisateurs de microscopies à force atomique et surfacique, Nov 2019, Grenoble, France Communication dans un congrès hal-03005471v1
Etude multi-échelle du potentiel indicateur des biofilms phototrophes en zones agricoles: du bassin versant au micro-habitat Chloé Oliger,Joey Allen,Quentin Bachelet,Audrey Beaussart,Michael Dangeret al. 37ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2018, Meise, Belgique Communication dans un congrès hal-03184152v1
Multi-scale study of the potential of phototrophic biofilm as functional indicators in agricultural areas: from catchment basin to micro-habitat Chloé Oliger,Joey Allen,Quentin Bachelet,Audrey Beaussart,Michael Dangeret al. International Conference of Ecological Sciences SFE², Oct 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03184165v1
Etude préliminaire du rôle potentiel du biofilm épiphytique dans la réponse des plantes aquatiques aux herbicides Martin Laviale,Céline Chung,Léa Campagna,Elisabeth Maria Gross 35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2017, Belvaux, Luxembourg Communication dans un congrès hal-03231648v1
Impact of high temperatures on microalgal viability and photosynthetic activity: consequence for mass cultivation Quentin Béchet,Martin Laviale,Nicolas Arsapin,Hubert Bonnefond,Olivier Bernard 6th congress of the International Society for Applied Phycology (ISAP), Jun 2017, Nantes, France Communication dans un congrès hal-03231822v1
Caractérisation des substances polymériques extracellulaires (EPS) de biofilms de diatomées benthiques marines Steven G Daniel,Cédric Hubas,Hubert Bonnefond,Sophie Sablé,Olivier Bernardet al. 35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Belvaux, Luxembourg Communication dans un congrès hal-03231652v1
Effets combinés de la lumière et des herbicides sur la diatomée Gomphonema gracile : étude d’un cas de stress multiples et perspectives en écotoxicologie Martin Laviale,Evane Thorel,Nicolas Mazzella,Johann Lavaud,Soizic Morin 35ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2016, Luxembourg, Luxembourg Communication dans un congrès hal-03136744v1
Contrasted short term recovery of periphyton photosynthesis after pulse exposition to the similarly acting herbicides: The photosystem II inhibitors atrazine and isoproturon M. Laviale,Soizic Morin 7th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2011, Girona, Spain. pp.1 Communication dans un congrès hal-02595201v1

Poster de conférence (21)

Prior stress exposure influences microbial community assembly and litter decomposition in headwater streams Daphnée Caux,Titouan Dionet,Joséphine Leflaive,Jérémy Jabiol,Aurélie Cébronet al. EcotoxicoMic YR 2025, Oct 2025, En ligne, France Poster de conférence hal-05565927v1
Les dessous de la litière : capacité d'adhésion et dynamique de décomposition en conditions stressantes Titouan Dionet,Daphnée Caux,Joséphine Leflaive,Jérémy Jabiol,Aurélie Cébronet al. 12ème colloque de l’Association Francophone d’Ecologie Microbienne, Nov 2025, Beaune, France Poster de conférence hal-05565898v1
Leveraging co-occurrence networks’ features to improve diatom-based diagnostic tools of river ecological quality Philippe Le Noac’h,Philippe Usseglio-Polatera,Sakina-Dorothée Ayata,Martin Laviale International Congress in Ecology and Evolution (SFE2 2024), Oct 2024, Lyon, France Poster de conférence hal-04715745v1
Assessing the validity of a large-scale joint Species Distribution Model in the marine realm Elena Berhocoïrigoin,Philippe Le Noac’h,Sakina-Dorothée Ayata,Martin Laviale,Jérémy Fixet al. International Congress in Ecology and Evolution (SFE2 2024), Oct 2024, Lyon, France Poster de conférence hal-04729185v1
Characterization of the metabolomic response of freshwater periphytic biofilm exposed to a serial dilution of glyphosate Mélissa Eon,Landry Ughetto,Chloé Bonnineau,Soizic Morin,Sarah Chéronet al. 16èmes Journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF 2024), Jun 2024, Saint Malo, France. Poster de conférence hal-04669371v1
The new University of Duisburg-Essen diatom digital image training data set (UDE did it v1.0) Michael Kloster,Andrea Burfeid-Castellanos,Danijela Vidacović,Ntambwe Albert Serge Mayombo,Mimoza Daniet al. 16th International Diatom Symposium, Aug 2023, Yamagata, Japan Poster de conférence hal-04187561v1
Link between glyphosate exposure and teratological forms in freshwater benthic diatoms Sarah Chéron,Vincent Felten,David Heudre,Aishwarya Venkataramanan,Simon Devinet al. SETAC Europe 32nd annual meeting, May 2022, Copenhaguen, Denmark. Poster de conférence hal-03718551v1
Effet des pesticides sur la morphologie des diatomées benthiques d'eau douce : le cas du glyphosate Sarah Chéron,Aishwarya Venkataramanan,Clara Martinez,Huyên Phong Hamon,David Heudreet al. Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France. Poster de conférence hal-03718531v1
Dynamique d'acquisition de la tolérance au glyphosate chez les communautés microbiennes périphytiques : étude en microcosmes. Landry Ughetto,Sarah Chéron,Martin Laviale,Chloé Bonnineau Colloque annuel de la Société d'Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA 2022), Jun 2022, Metz, France. , 2022 Poster de conférence hal-03718539v1
Development of a collaborative web platform documenting the diversity and extent of diatom deformities Iane Vallanzasca,Sébastien Boutry,Martin Laviale,Eric Quinton,Soizic Morin EcotoxicoMic 2022- Third International Conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2022, Montpellier, France. pp.1-4 Poster de conférence hal-03990070v1
Suivi multi-descripteurs des réponses de microorganismes et de leurs consommateurs à une contamination en azurants optiques Antoine Tourret,Isabelle Lavoie,Martin Laviale,Philippe Juneau,Soizic Morin Colloque conjoint en écotoxicologie (CCE 2022), Jun 2022, Québec, Canada. Poster de conférence hal-03718519v1
Fluorescence-based detection of optical brighteners in a peatland Marie-Noëlle Pons,Martin Laviale,Vincent Felten SETAC Europe 31st annual meeting, May 2021, Virtual conference, France Poster de conférence hal-03328298v1
Classification automatique des diatomées par apprentissage profond pour l’amélioration du diagnostic écologique des milieux aquatiques Pierre Faure-Giovagnoli,Aishwarya Venkataramanan,Cécile Figus,David Heudre,Thibault de Garidel-Thoronet al. 5ème colloque biennal des Zones Ateliers-CNRS, Nov 2020, Blois, France. Poster de conférence hal-02961595v1
Utilisation d’images microscopiques artificielles en complément d’images réelles pour la détection automatique de diatomées par apprentissage profond Pierre Faure-Giovagnoli,Aishwarya Venkataramanan,David Heudre,Thibault de Garidel-Thoron,Philippe Usseglio-Polateraet al. Deep Learning pour le traitement et l'analyse d'image et de son en écologie, Nov 2020, Lyon, France Poster de conférence hal-02995246v1
Impact of agricultural run-off and climate warming on shallow aquatic ecosystems – possible effects on a regime shift between aquatic primary producers Elisabeth Maria Gross,Vinita Vijayaraj,Joséphine Leflaive,Bastian H. Polst,Joey Allenet al. SETAC Helsinki, May 2019, Helsinki, Finland Poster de conférence hal-03189450v1
Characterization of diatom adhesion properties on different substrates: from population to individual scale Martin Laviale,Joey Allen,Cédric Hubas,Audrey Beaussart,Sofiane El-Kirat-Chatel 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia Poster de conférence hal-03232063v1
Functional trait-based approaches as a common framework for freshwater and marine ecologists Severine Martini,Floriane Larras,Aurélien Boyé,Emile Faure,Nicole Aberleet al. 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia Poster de conférence hal-03232606v1
Do leaf litter decomposers control benthic algae production and community structure? Insights from an outdoor mesocosm experiment Joey Allen,Martin Laviale,Maria Cellamare,Quentin Bachelet,V. Feltenet al. 11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia Poster de conférence hal-03232127v1
Ecophysiological modeling of the impact of light quantity and quality on microalgae growth in high-density open ponds Philippe Le Noac'H,Sakina Dorothée Ayata,Antoine Sciandra,Olivier Bernard,Martin Laviale Sfecologie 2018 - International Conference on Ecological Sciences, Oct 2018, Rennes, France Poster de conférence hal-02368696v1
Restauration contrastée de la photosynthèse du périphyton suite à l'exposition à deux herbicides présentant le même mode d'action (atrazine et isoproturon) M. Laviale,Soizic Morin,A. Créach 30ème colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2011, Boulogne sur mer, France. pp.1, 2011 Poster de conférence hal-02595784v1
Consistency in diatom response to metal-contaminated environments Soizic Morin,A. Cordonier,I. Lavoie,A. Arini,Saúl A. Blancoet al. 21st SETAC Europe Annual Meeting, May 2011, Milan, Italy. pp.1, 2011 Poster de conférence hal-02595063v1

Ouvrages (1)

38ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF) : Programme et livre des résumés Martin Laviale,David Heudre,Laura Moreau,Soizic Morin 2019 Ouvrages hal-02549502v1

Chapitre d'ouvrage (3)

Diatom primary production in headwater streams: a limited but essential process Joey Allen,Michael Danger,Carlos E. Wetzel,Vincent Felten,Martin Laviale Johannes W Goesling; João Serôdio; Johann Lavaud. Diatoms: Biology & Applications Series, Scrivener Publishing, 2024, Diatoms: Biology & Applications Series, 9781119842088. ⟨10.1002/9781119842156.ch11⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03879928v1
A free ride: Diatoms attached on motile diatoms Vincent Roubeix,Martin Laviale S.A. Cohn; K.M. Manoylov; R. Gordon. Diatoms: Biology & Applications, Wiley-Scrivener, 2021, DIGM - Diatom Gliding Motility, ⟨10.1002/9781119526483.ch9⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03006190v1
Consistency in diatom response to metal-contaminated environments Soizic Morin,A. Cordonier,I. Lavoie,Adeline Arini,Saul Blancoet al. H. Guasch; A. Ginebreda; A. Geiszinger. Emerging and priority pollutants in rivers: bringing science into river management plans, Springer, pp.117-146, 2012, The Handbook of Environmental Chemistry 19, 978-3-642-25721-6. ⟨10.1007/978-3-642-25722-3_5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02596950v1

Autre publication scientifique (1)

Effets des polluants sur les communautés périphytiques naturelles : apport des mesures de fluorescence chlorophyllienne en lumière modulée (PAM) Martin Laviale 2008 Autre publication scientifique hal-00305322v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Gaussian Latent Representations for Uncertainty Estimation using Mahalanobis Distance in Deep Classifiers Aishwarya Venkataramanan,Assia Benbihi,Martin Laviale,Cedric Pradalier 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04034465v2

Rapport (1)

Projets DIAFORM et QUANTIMORPH Martin Laviale,V. Felten Université de lorraine. 2024 Rapport hal-04631125v1