Accéder directement au contenu

Mathilde Causse

23
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Personal details ================ Dr Mathilde Causse Work department: INRAE Genetics and Breeding of Fruit and vegetables Address:CS60094 84143 Montfavet France E-mail:Mathilde.Causse@inrae.fr Tel:33 4 32 72 28 03 Website: http://w3.avignon.inra.fr/gafl/fr/personnes/mathilde\_causse Work experience ================ Leader of the research group "Diversity Quality and Environment of Tomato " in the INRAE research unit on Genetics and Breeding of Fruit and Vegetables (GAFL). The group works on Tomato fruit quality (sensory and nutritional), genetic diversity and the impact of environment stress. It is composed of 4 scientists, 1 assistant engineers, 4 technicians and 2 PhD. Main themes of research over the last five years ================================================= Genetic control of tomato fruit quality traits (QTL mapping and cloning; GWAS) Impact of environmental stress on fruit quality; G x E interaction History of tomato domestication; Natural diversity and association genetics in tomato Integrative systems biology and genomic approaches (resequencing) Methodology of selection **Other academic activities** Deputy head of the Plant Biology and Breeding Division (since 2022) Head of the GAFL research unit for 8 years (2004-2012) Coordinator of the Cluster for Integrated Horticulture Research of INRA Avignon Center Coordinator of several research projects on tomato quality; Co-chair of the SOL (Solanaceae genomic) meetings; Co-chair of the Solanaceae workshop at Plant and Animal Genome Conference (San Diego) Member of the French Academy of Agriculture
Directrice de Recherche à INRAE – Centre PACA (DR1) **Coordonnées professionnelles** ``` <pre style="margin-left: 91.6pt;"><span style="mso-bidi-font-size: 11.0pt; font-family: 'Calibri',sans-serif; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman';">INRAE, UR 1052, GAFL - Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes CS60094 - 84143 MONTFAVET CEDEX (France)<br></br><span style="mso-spacerun: yes;"> </span>email : mathilde.causse@inrae.fr<br style="mso-special-character: line-break;"></br> <br style="mso-special-character: line-break;"></br> </span> ``` **Formation** Habilitation à Diriger des Recherches (HDR), Université de Montpellier, avril 2001 Doctorat de l’Université Paris XI, soutenu en mars 1989, préparé au Laboratoire d'Amélioration des Plantes Tropicales de l'ORSTOM, Côte d'Ivoire **Carrière** Depuis 2002, responsable de l’équipe Qualité Diversité Environnement chez la Tomate De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL (90 permanents) Depuis le 1er février 2010, Directrice de Recherche 1ère Classe à l'INRA. De 2000 à 2010, Directrice de Recherche DR2 à l'INRA. Affectée à l’UR GAFL de Montfavet en 1995 Recrutée en 1990, CR2 à l'INRA. Station de Génétique Végétale du Moulon, Gif/Yvette De 1989 à 1990, post-doc du Ministère des Affaires Etrangères au Département d'Amélioration des Plantes (Pr. S.D. TANKSLEY) de l'Université Cornell, U.S.A **Domaines d’expertises** Génétique, physiologie et génomique de la qualité de la tomate Impact des stress environnementaux sur la production et la qualité de la tomate Méthodologie de la sélection **Formation, jurys** · Encadrement de plus de 10 thèses depuis 1995 et de 5 postdoc ; en moyenne un étudiant de Master chaque année · Rapporteur de 2 à 5 thèses ou HDR chaque année **ACTIVITES AUTRES QUE LA RECHERCHE (**depuis 2010)**:** · Depuis 2022, Chef de Département Adjoint du Département BAP . De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL · Membre du bureau de la CSS « Génétique Végétale et Animale » de 2011 à 2020 · Présidente ou membre de plusieurs commissions AERES/HCERES · Elue au Conseils Scientifique de l’INRA de 2007 à 2010 · Elue au CS du Département DGAP puis BAP de 2010 à 2020 · Co-animatrice du Comité « Méthodologie de la sélection» du GIS Biotechnologie Verte de 2014 à 2019 · Co-animatrice du GT « matériel végétal » du GIS PicLeg de 2012 à 2018 · Membre du Conseil Scientifique Unique des filières fruits et légumes frais et transformés depuis 2010 · Membre du comité scientifique des congrès annuels Solanaceae Genome de 2004 à 2018 · Co-chair du Solanaceae workshop au Plant and Animal Meeting (San Diego) de 2016 à 2020 · Co-animatrice du GT « Biologie Végétale » d’Allenvi depuis 2017 **Prix et distinction** - Prix Dufresnoy de l’Académie d’Agriculture de France en 2004 - Chevalier de l’Ordre du Mérite Agricole, 2015 - Elue Membre correspondante de l’Académie d’Agriculture de France en 2017 - Prix Dujarric de la Rivière de l’Académie des Sciences en 2018

Publications

"frederique-bitton"
Image document

Genetic Variability in Seed Longevity and Germination Traits in a Tomato MAGIC Population in Contrasting Environments

Elise Bizouerne , Joseph Ly Vu , Benoît Ly Vu , Isidore Diouf , F. Bitton
Plants, 2023, 12 (20), pp.3632. ⟨10.3390/plants12203632⟩
Article dans une revue hal-04258504v1

Multiple haplotype-based analyses provide genetic and evolutionary insights into tomato fruit weight and composition

Jiantao Zhao , Christopher Sauvage , Frédérique Bitton , Mathilde Causse
Horticulture research, 2022, 9 (uhab009), pp.1-14. ⟨10.1093/hr/uhab009⟩
Article dans une revue hal-03657384v1
Image document

Inheritance of Secondary Metabolites and Gene Expression Related to Tomato Fruit Quality

Estelle Bineau , José Luis Rambla , Renaud Duboscq , Marie-Noëlle Corre , Frédérique Bitton
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (11), pp.6163. ⟨10.3390/ijms23116163⟩
Article dans une revue hal-03842733v1
Image document

Genetic control of tomato fruit quality: from QTL mapping to Genome Wide Association studies and breeding

Mathilde Causse , Juliette Bénéjam , Frédérique Bitton , Marie Brault , Yolande Carretero
Comptes Rendus. Biologies, 2022, 345 (4), pp.3-13. ⟨10.5802/crbiol.99⟩
Article dans une revue hal-04169924v1
Image document

Breeding Tomato Hybrids for Flavour: Comparison of GWAS Results Obtained on Lines and F1 Hybrids

Estelle Bineau , José Luis Rambla , Santiago Priego-Cubero , Alexandre Hereil , Frédérique Bitton
Genes, 2021, 12 (9), pp.1443. ⟨10.3390/genes12091443⟩
Article dans une revue hal-03543122v1

Genetic diversity of tomato response to heat stress at the QTL and transcriptome levels

Estelle Bineau , Isidore Diouf , Yolande Carretero , Renaud Duboscq , Frédérique Bitton
Plant Journal, inPress, ⟨10.1111/tpj.15379⟩
Article dans une revue hal-03334159v1

Genetic basis of phenotypic plasticity and genotype × environment interactions in a multi-parental tomato population

Isidore Diouf , Laurent Derivot , Shai Koussevitzky , Yolande Carretero , Frédérique Bitton
Journal of Experimental Botany, 2020, 71 (18), pp.5365-5376. ⟨10.1093/jxb/eraa265⟩
Article dans une revue hal-02952485v1
Image document

Integration of QTL, Transcriptome and Polymorphism Studies Reveals Candidate Genes for Water Stress Response in Tomato

Isidore Diouf , Elise Albert , Renaud Duboscq , Sylvain Santoni , Frédérique Bitton
Genes, 2020, 11 (8), pp.900. ⟨10.3390/genes11080900⟩
Article dans une revue hal-02952488v1
Image document

Meta-analysis of genome-wide association studies provides insights into genetic control of tomato flavor.

Jiantao Zhao , Christopher Sauvage , Jinghua Zhao , Frederique Bitton , Guillaume Bauchet
Nature Communications, 2019, 10 (1), pp.1534. ⟨10.1038/s41467-019-09462-w⟩
Article dans une revue hal-02628913v1
Image document

Allele-specific expression and genetic determinants of transcriptomic variations in response to mild water deficit in tomato

Elise Albert , Renaud Duboscq , Muriel Latreille , Sylvain Santoni , Matthieu Beukers
Plant Journal, 2018, 96 (3), pp.635-650. ⟨10.1111/tpj.14057⟩
Article dans une revue hal-02620940v1
Image document

Water Deficit and Salinity Stress Reveal Many Specific QTL for Plant Growth and Fruit Quality Traits in Tomato.

Isidore Diouf , Laurent Derivot , Frederique Bitton , Laura Pascual , Mathilde Causse
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, pp.1-13. ⟨10.3389/fpls.2018.00279⟩
Article dans une revue hal-02626981v1
Image document

Dissecting quantitative trait variation in the resequencing era: Complementarity of bi-parental, multi-parental and association panels

Laura Pascual , Elise Albert , Christopher Sauvage , Janejira Duangjit , Jean-Paul Bouchet
Plant Science, 2016, 242, pp.120-130. ⟨10.1016/j.plantsci.2015.06.017⟩
Article dans une revue hal-02635859v1

Genotype by watering regime interaction in cultivated tomato: lessons from linkage mapping and gene expression

Elise Albert , Justine Gricourt , Nadia Bertin , Julien Bonnefoi , Stephanie Pateyron
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2016, 129 (2), pp.395-418. ⟨10.1007/s00122-015-2635-5⟩
Article dans une revue hal-01353279v1

Genome-wide association study of salt tolerance in tomato

Alexandre Héreil , Maxime Guillaume , F. Bitton , Mathilde Causse
Solanaceae genome 2022, Thessaloniki University, Oct 2022, Thessaloniki, Greece
Communication dans un congrès hal-04559710v1
Image document

Breeding tomato hybrids for flavour: comparison of GWAS on lines and F1 hybrids

Estelle Bineau , José Luis Rambla , Santiago Priego , Alexandre Hereil , Frédérique Bitton
Online EUCARPIA congress 2021 - Breeding: the key to innovative solutions, WUR, Aug 2021, Online, Netherlands
Communication dans un congrès hal-03562573v1
Image document

Meta-analysis of GWAS provides new insights into genetic control of tomato flavor

Jiantao Zhao , Christopher Sauvage , Frédérique Bitton , Mathilde Causse
Plant Genome and genomics Conference, Mar 2020, Rotterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-03562688v1
Image document

Meta-analysis of GWAS provides new insights into genetic control of tomato flavor.

Jiantao Zhao , Christopher Sauvage , Frédérique Bitton , Mathilde Causse
Plant and Animal Genome 2020, 2020, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-03542371v1
Image document

Genotype by environment interaction in tomato grown under several abiotic stresses and the genetic basis of plasticity

Isidore Diouf , Laurent Derivot , Shai Koussevitzky , Yolande Carretero , Frédérique Bitton
XIX EUCARPIA Meeting of the Tomato Working Group, May 2018, Napoli, Italy
Communication dans un congrès hal-03562885v1

Integration of QTL, eQTL and allele specific expression to unravel genotype by watering regime interaction in cultivated tomato

Elise Albert , Christopher Sauvage , Jean-Paul Bouchet , Frederique Bitton , Matthieu Beukers
24. Plant and Animal Genome Conference (PAG), Plant & Animal Genome (PAG). USA., Jan 2017, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01603138v1
Image document

Genetic diversity and architecture of gene expression in response to water deficit in tomato

Elise Albert , Christopher Sauvage , Jean-Paul Bouchet , Frederique Bitton , Matthieu Beukers
Improving Agriculture through Genomics CROPS 2017, Jun 2017, Huntsville, United States
Communication dans un congrès hal-01607155v1
Image document

Genotype by watering regime interaction in cultivated tomato: from phenotypes to genes

Elise Albert , Yolande Carretero , Justine Gricourt , Esther Pelpoir , Romain Novaretti
12. Solanaceae Conference, Oct 2015, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-02743885v1