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Mathilde Causse

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Identifiants chercheurs

Présentation

Personal details ================ Dr Mathilde Causse Work department: INRAE Genetics and Breeding of Fruit and vegetables Address:CS60094 84143 Montfavet France E-mail:Mathilde.Causse@inrae.fr Tel:33 4 32 72 28 03 Website: http://w3.avignon.inra.fr/gafl/fr/personnes/mathilde\_causse Work experience ================ Leader of the research group "Diversity Quality and Environment of Tomato " in the INRAE research unit on Genetics and Breeding of Fruit and Vegetables (GAFL). The group works on Tomato fruit quality (sensory and nutritional), genetic diversity and the impact of environment stress. It is composed of 4 scientists, 1 assistant engineers, 4 technicians and 2 PhD. Main themes of research over the last five years ================================================= Genetic control of tomato fruit quality traits (QTL mapping and cloning; GWAS) Impact of environmental stress on fruit quality; G x E interaction History of tomato domestication; Natural diversity and association genetics in tomato Integrative systems biology and genomic approaches (resequencing) Methodology of selection **Other academic activities** Deputy head of the Plant Biology and Breeding Division (since 2022) Head of the GAFL research unit for 8 years (2004-2012) Coordinator of the Cluster for Integrated Horticulture Research of INRA Avignon Center Coordinator of several research projects on tomato quality; Co-chair of the SOL (Solanaceae genomic) meetings; Co-chair of the Solanaceae workshop at Plant and Animal Genome Conference (San Diego) Member of the French Academy of Agriculture
Directrice de Recherche à INRAE – Centre PACA (DR1) **Coordonnées professionnelles** ``` <pre style="margin-left: 91.6pt;"><span style="mso-bidi-font-size: 11.0pt; font-family: 'Calibri',sans-serif; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman';">INRAE, UR 1052, GAFL - Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes CS60094 - 84143 MONTFAVET CEDEX (France)<br></br><span style="mso-spacerun: yes;"> </span>email : mathilde.causse@inrae.fr<br style="mso-special-character: line-break;"></br> <br style="mso-special-character: line-break;"></br> </span> ``` **Formation** Habilitation à Diriger des Recherches (HDR), Université de Montpellier, avril 2001 Doctorat de l’Université Paris XI, soutenu en mars 1989, préparé au Laboratoire d'Amélioration des Plantes Tropicales de l'ORSTOM, Côte d'Ivoire **Carrière** Depuis 2002, responsable de l’équipe Qualité Diversité Environnement chez la Tomate De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL (90 permanents) Depuis le 1er février 2010, Directrice de Recherche 1ère Classe à l'INRA. De 2000 à 2010, Directrice de Recherche DR2 à l'INRA. Affectée à l’UR GAFL de Montfavet en 1995 Recrutée en 1990, CR2 à l'INRA. Station de Génétique Végétale du Moulon, Gif/Yvette De 1989 à 1990, post-doc du Ministère des Affaires Etrangères au Département d'Amélioration des Plantes (Pr. S.D. TANKSLEY) de l'Université Cornell, U.S.A **Domaines d’expertises** Génétique, physiologie et génomique de la qualité de la tomate Impact des stress environnementaux sur la production et la qualité de la tomate Méthodologie de la sélection **Formation, jurys** · Encadrement de plus de 10 thèses depuis 1995 et de 5 postdoc ; en moyenne un étudiant de Master chaque année · Rapporteur de 2 à 5 thèses ou HDR chaque année **ACTIVITES AUTRES QUE LA RECHERCHE (**depuis 2010)**:** · Depuis 2022, Chef de Département Adjoint du Département BAP . De 2004 à 2012, Directrice de l’UR GAFL · Membre du bureau de la CSS « Génétique Végétale et Animale » de 2011 à 2020 · Présidente ou membre de plusieurs commissions AERES/HCERES · Elue au Conseils Scientifique de l’INRA de 2007 à 2010 · Elue au CS du Département DGAP puis BAP de 2010 à 2020 · Co-animatrice du Comité « Méthodologie de la sélection» du GIS Biotechnologie Verte de 2014 à 2019 · Co-animatrice du GT « matériel végétal » du GIS PicLeg de 2012 à 2018 · Membre du Conseil Scientifique Unique des filières fruits et légumes frais et transformés depuis 2010 · Membre du comité scientifique des congrès annuels Solanaceae Genome de 2004 à 2018 · Co-chair du Solanaceae workshop au Plant and Animal Meeting (San Diego) de 2016 à 2020 · Co-animatrice du GT « Biologie Végétale » d’Allenvi depuis 2017 **Prix et distinction** - Prix Dufresnoy de l’Académie d’Agriculture de France en 2004 - Chevalier de l’Ordre du Mérite Agricole, 2015 - Elue Membre correspondante de l’Académie d’Agriculture de France en 2017 - Prix Dujarric de la Rivière de l’Académie des Sciences en 2018

Publications

"marie-christine-le-paslier"
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Dissecting quantitative trait variation in the resequencing era: Complementarity of bi-parental, multi-parental and association panels

Laura Pascual , Elise Albert , Christopher Sauvage , Janejira Duangjit , Jean-Paul Bouchet
Plant Science, 2016, 242, pp.120-130. ⟨10.1016/j.plantsci.2015.06.017⟩
Article dans une revue hal-02635859v1

A multi-Ievel omic approach of tomato fruit quality

Jiaxin Xu , Laura Pascual-Banuls , Nelly Desplat , Mireille Faurobert , Yves Gibon
Acta Horticulturae, 2015, 1099, pp.793-800. ⟨10.17660/ActaHortic.2015.1099.100⟩
Article dans une revue hal-01543456v1
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Whole genome resequencing in tomato reveals variation associated with introgression and breeding events

Mathilde M. Causse , Nelly Desplat , Laura Pascual-Banuls , Marie-Christine Le Paslier , Christopher Sauvage
BMC Genomics, 2013, 14 (791), 14 p. ⟨10.1186/1471-2164-14-791⟩
Article dans une revue hal-02652747v1

Phenotypic diversity and association mapping for fruit quality traits in cultivated tomato and related species

Jiaxin Xu , Nicolas N. Ranc , Stephane Munos , Sophie Rolland , Jean-Paul Bouchet
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2013, 126 (3), pp.567 - 581. ⟨10.1007/s00122-012-2002-8⟩
Article dans une revue hal-02651895v1
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Genome-Wide Association Mapping in Tomato (Solanum lycopersicum) Is Possible Using Genome Admixture of Solanum lycopersicum var. cerasiforme

Nicolas N. Ranc , Stephane Munos , Jiaxin Xu , Marie-Christine Le Paslier , Aurelie A. Chauveau
G3, 2012, 2 (8), pp.853 - 864. ⟨10.1534/g3.112.002667⟩
Article dans une revue hal-02652089v1
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Increase in tomato locule number is controlled by two single-nucleotide polymorphisms located near WUSCHEL

Stephane Munos , Nicolas N. Ranc , Emmanuel Botton , Aurélie A. Berard , Sophie Rolland
Plant Physiology, 2011, 156 (4), pp.2244-2254. ⟨10.1104/pp.111.173997⟩
Article dans une revue hal-02647706v1

Deciphering the genetic control of tomato fruit composition in flavonoids in the resequencing Era

Mathilde M. Causse , Laura Pascual , Christopher Sauvage , Elise Albert , Jean-Paul Bouchet
24. International Plant and Animal Genome Conference, Jan 2016, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02794431v1
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Deciphering the genetic control of tomato fruit quality in the resequencing era

Laura Pascual , Christopher Sauvage , Guillaume Bauchet , Nelly Desplat , Jean-Paul Bouchet
3. annual conference of the COST ACTION FA 1106, Mediterranean Agronomic Institute. GRC., Sep 2014, Chania, Greece
Communication dans un congrès hal-02744187v1
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Approaches of the genetic control of tomato fruit composition in the resequencing era

Laura Pascual , Christopher Sauvage , Guillaume Bauchet , Nelly Desplat , Jean-Paul Bouchet
11. Solanaceae conference SOL 2014, Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). BRA., Nov 2014, Bahia, Brazil
Communication dans un congrès hal-02741967v1

Valorization of the natural variation available in tomato accessions to decipher the genetic control of quantitative traits

Laura Pascual-Banuls , J. Xu , Christopher Sauvage , Guillaume Bauchet , Nelly Desplat
57. Annual Congress SIGA, Sep 2013, Foggia, Italy
Communication dans un congrès hal-02804060v1
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Combining systems biology, genome resequencing and MAGIC population to decipher the genetic variation of tomato fruit quality

Laura Pascual , Jiaxin Xu , Nelly Desplat , Yves Y. Gibon , Annick Moing
10. Solanaceae conference (SOL 2013), Oct 2013, Beijing, China
Communication dans un congrès hal-02750138v1

Genetic diversity, inheritance and integration of multi-level omic data in tomato fruit

Jiaxin Xu , Laura Pascual-Banuls , Nelly Desplat , Jean-Paul Bouchet , Yves Y. Gibon
20. Plant and Animal Genome, Jan 2012, San Diego, United States. pp.W643
Communication dans un congrès hal-02810053v1
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A multi-Ievel omic approach of tomato fruit quality

Jiaxin Xu , Laura Pascual , Nelly Desplat , Mireille Faurobert , Yves Y. Gibon
2. Symposium on Horticulture in Europe, Jul 2012, Angers, France
Communication dans un congrès hal-02748459v1

Genome admixture of Solanum lycopersicum var cerasiforme allows successful association mapping in tomato

Nicolas N. Ranc , Stephane Munos , Marie-Christine Le Paslier , Aurelie A. Chauveau , Rémi Bounon
7. Solanaceae Conference, Sep 2010, Dundee, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02753097v1

Linkage disequilibrium mapping for tomato fruit quality traits

Nicolas N. Ranc , Marie-Christine Le Paslier , Stephane Munos , Sophie Rolland , Esther Pelpoir
17. Plant & Animal Genomes Conference, Jan 2009, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02758045v1
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Linkage disequilibrium mapping for tomato fruit quality traits

Mathilde M. Causse , Nicolas N. Ranc , Stephane Munos , Sophie Rolland , Marie-Christine Le Paslier
5. Solanaceae Genome Workshop, Oct 2008, Cologne, Germany
Communication dans un congrès hal-02751766v1

Structure of molecular polymorphism in wild and cultivated tomato species (Solanum sp.) towards LD mapping for quality traits

Nicolas N. Ranc , Stephane Munos , Sophie Rolland , Marie-Christine Le Paslier , Esther Pelpoir
International conference, Feb 2008, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-02755997v1