Nadia Goué

Publications

Article dans une revue (10)

The Galaxy platform for accessible, reproducible, and collaborative data analyses: 2024 update Linelle Ann L Abueg,Enis Afgan,Olivier Allart,Ahmed Awan,Wendi Baconet al. Nucleic Acids Research, 2024, 52 (W1), pp.W83-W94. ⟨10.1093/nar/gkae410⟩ Article dans une revue hal-04645009v1
Galaxy Training: A powerful framework for teaching! Saskia Hiltemann,Helena Rasche,Simon Gladman,Hans-Rudolf Hotz,Delphine Larivièreet al. PLoS Computational Biology, 2023, 19 (1), pp.e1010752. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010752⟩ Article dans une revue hal-04069041v1
Tracing the ancestry of modern bread wheats Caroline Pont,Thibault Leroy,Michael Seidel,Alessandro Tondelli,Wandrille Ducheminet al. Nature Genetics, 2019, 51 (5), pp.905-911. ⟨10.1038/s41588-019-0393-z⟩ Article dans une revue hal-02154676v1
Identification of novel transcription factors regulating secondary cell wall formation in Arabidopsis Hua Cassan-Wang,Nadia Goue,Mohammed N Saidi,Sylvain Legay,Pierre Sivadonet al. Frontiers in Plant Science, 2013, 4, pp.189. ⟨10.3389/fpls.2013.00189⟩ Article dans une revue hal-04723619v1
Secondary cell wall characterization in a BY-2 inductive system Nadia Goué,Jenny Mortimer,Yoshimi Nakano,Zhinong Zhang,Morgane Josserandet al. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 2013, 115 (2), pp.223-232. ⟨10.1007/s11240-013-0354-7⟩ Article dans une revue hal-04723556v1
QTL for floral stem lignin content and degradabililty in three recombinant inbred line (RIL) progenies of Arabidopsis thaliana and search for candidate genes involved in cell wall biosynthesis and degradability. Hélène Chavigneau,Nadia Goué,Sabrina Delaunay,Audrey Courtial,Lise Jouaninet al. Open Journal of Genetics, 2012, 2 (01), pp.7-30. ⟨10.4236/ojgen.2012.21002⟩ Article dans une revue hal-04770794v1
Microdissection to Isolate Vascular Cambium Cells in Poplar Nadia Goue,Nathalie Boizot,Michel Vallance,Elisabeth Magel,Philippe Label Silva Fennica, 2012, 46 (1), pp.5 - 16 Article dans une revue hal-01268376v1
Microgenomic analysis reveals cell type-specific gene expression patterns between ray and fusiform initials within the cambial meristem of Populus Nadia Goué,Marie-Claude Lesage Descauses,Ewa J. Mellerowicz,Elisabeth Magel,Philippe Labelet al. New Phytologist, 2008, 180 (1), pp.45-56. ⟨10.1111/j.1469-8137.2008.02556.x⟩ Article dans une revue hal-02666497v1
Physiologie et génomique de la formation du bois Jean-Charles Leplé,Annabelle Dejardin,Françoise F. Laurans,Gilles G. Pilate,Nadia Gouéet al. Biofutur, 2004, 247, pp.43-48 Article dans une revue hal-02679521v1
CDKA orthologue isolation and its expression during cambial activity in hybrid walnut (Juglans nigra X Juglans regia) Nadia Goué,Gregory Montiel,Isabelle Levert,Muriel Gaudet,Christian Jay-Allemandet al. Trees - Structure and Function, 2003, 17 (4), pp.316-324. ⟨10.1007/s00468-002-0241-z⟩ Article dans une revue istex hal-02678804v1

Communication dans un congrès (13)

WORKSHOP - Data storage and curation - Biology and Health Community (OMERO) Sophie Desset,Nadia Goué,Francis Ogereau Printemps de la donnée, Université Clermont Auvergne, May 2025, Clermont Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05095849v1
Towards an integrated OMERO infrastructure for FAIR management of imaging data: advances and perspectives Nadia Goue,Francis Ogereau,Sophie Desset,Pierre Pouchin,Sami Safarbatiet al. Journée des Microscopistes Clermontois (JMC), Sophie Desset, Nov 2025, Clermont - Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05362753v1
ATELIER - Dépôt et curation de données - Communauté Biologie et Santé (plateforme de bioanalyses Galaxy) Cléa Siguret,Bérénice Batut,Nadia Goué Printemps de la donnée 2025, Université Clermont-Auvergne, May 2025, Clermont-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05095680v1
PRESENTATION - Discovering and best practices for research data in the context of open science Nadia Goué,Francis Ogereau Printemps de la donnée, Université Clermont Auvergne, May 2025, Clermont - Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05095887v1
PRESENTATION - Discovering and best practices for research data in the context of open science - part 2 Nadia Goué,Francis Ogereau Printemps de la donnée UCA, Université Clermont Auvergne, Jun 2025, Clermont-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05095927v1
FAIRing Research Data to Live Nadia Goué Journée "Cycle de vie des données en biologie", Apr 2024, Sophia Antipolis (06), France Communication dans un congrès hal-04529741v1
Combiner analyses statistiques intégratives et prédiction bioinformatique du sécrétome et du surfacéome pour comprendre le dialogue inter-organes Jérémy Tournayre,Alyssa Imbert,Emile Mardoc,James Broadbent,Keren Byrneet al. Journées d'Animation Scientifique et 20 ans du département PHASE, Nov 2024, Poitiers, France Communication dans un congrès hal-04873121v1
ABRomics : Une plateforme basée sur Galaxy pour la recherche sur la résistance aux antibiotiques et la santé publique Cléa Siguret,Bérénice Batut,Raphaël Tackx,Julie Lao,Amanda Dieuaideet al. Journée d’animation annuelle de la plateforme AuBi 2024, Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), Dec 2024, Aubière / Clermont-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-05084079v1
ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health Julie Lao,Pierre Marin,Romain Dallet,Fabien Mareuil,Alix De Toisyet al. 18ème congrès national de la SFM: MICROBES 2023, Société Français de Microbiologie, Oct 2023, Le couvant des Jacobins, Rennes, France Communication dans un congrès hal-04369101v1
Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types Manon Connault,Jérémy Tournayre,Céline Boby,Muriel Bonnet,Nadia Goué JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France Communication dans un congrès hal-03332116v1
Déterminismes biophysiques et moléculaires de la vulnérabilité à l'embolie chez le peuplier Nadia N. Goue,Eric Badel,Tete Severien T. S. Barigah,Hervé H. Cochard GDR 3544 " Sciences du Bois ", Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). LMGC, Montpellier, FRA., Nov 2012, Montpellier, France. 1 p Communication dans un congrès hal-00964756v1
First insight into micro-genomics of cambial activity per cell type in poplar Nadia Goué,Björn Sundberg,Ewa Mellerowicz,Marie-Claude Lesage Descauses,Philippe Label Population genetics and genomics of forest trees : from gene function to evolutionary dynamics and conservation; A joint conference of IUFRO working groups 2.04.01 (population, ecological and conservation genetics) and 2.04.10 (genomics), and COST Action E-28 (genosilva : european forest genomics network), Oct 2006, Madrid, Spain Communication dans un congrès hal-02755673v1
Exploration of gene expression per cell type in the cambium of poplar Nadia Goué,Björn Sundberg,Ewa Mellerowicz,Marie-Claude Lesage Descauses,Philippe Label European project Alfa-GEMA and COST-E28 WG1 joint meeting, Oct 2005, Orléans, France. n.p Communication dans un congrès hal-02829592v1

Poster de conférence (21)

FORVM Plants Guillaume Laisney,David Benaben,Thomas Bellembois,Kevin Billet,Alain Bouchereauet al. RFMF 2025 - 17èmes journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2025, Paris, France. pp.1-1, 2025 Poster de conférence hal-05121234v1
Building a standardized database for honey bee microbiome: Addressing metadata and data comparability gaps Bérénice Batut,Cléa Siguret,Hugo Serville,Geraldine Piot,Ivan Wawrzyniaket al. JOBIM 2025, Jul 2025, Bordeaux, France. Poster de conférence hal-05132669v1
FAIRing Research Data to Live @AuBi Platform Francis Ogereau,Mateo Hiriart,Pierre Marin,Bérénice Batut,Cléa Siguretet al. JOBIM, Jun 2024, Toulouse (FR), France Poster de conférence hal-04643973v1
MetaboCloud : A catalog of microservices hosted on a Cloud infrastructure and addressing issues linked to FAIR principles and open science Faustine Souc,Thomas Bellembois,Nils Paulhe,Érina Point,Antoine Mahulet al. JOBIM2024 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France Poster de conférence hal-04632161v1
Orchestrating data flows throughout their whole life cycle Konogan Bourhy,Laurent Bouri,Christophe Bruley,Olivier Collin,Frédéric De Lamotteet al. JOBIM 2024 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. , 2024 Poster de conférence hal-04618277v1
Services deployed on the IFB National Network of Computing Resources (NNCR) David Benaben,Christophe Blanchet,Matéo Boudet,Guillaume Brysbaert,Anthony Bretaudeauet al. JOBIM 2024 - Journées ouvertes en biologie, informatique, et mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. , 2024 Poster de conférence hal-04618059v1
The ABRomics platform — a One Health Antimicrobial resistance analysis service Julie Lao,Raphael Tackx,Pierre Marin,Amanda Dieuaide,Thomas Mignonet al. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France Poster de conférence hal-04618645v1
ABRomics: A Galaxy-based one health antimicrobial resistance platform Pierre Marin,Bérénice Batut,Kenzo-Hugo Hillion,Clea Siguret,Raphael Tackxet al. GCC 2024 - Galaxy Community Conference 2024, Jun 2024, Brno, Czech Republic. , ⟨10.7490/f1000research.1119762.1⟩ Poster de conférence hal-04619528v1
ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health Julie Lao,Pierre Marin,Romain Dallet,Fabien Mareuil,Alix De Toisyet al. 9ème symposium sur la résistance aux antimicrobiens chez les animaux et dans l'environnement (ARAE 2023), Jul 2023, Vinci International Convention Centre, Tours, France Poster de conférence hal-04369175v1
ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health Julie Lao,Pierre Marin,Romain Dallet,Fabien Mareuil,Alix De Thoisyet al. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM ) 2023, Jun 2023, Plouzané, France Poster de conférence hal-04369161v1
ABRomics - an open access online platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data Julie Lao,Pierre Marin,Romain Dallet,Fabien Mareuil,Alix De Toisyet al. FEMS 2023 European Congress of Microbiology, Jul 2023, Congress Center Hamburg Hamburg, Germany, Germany Poster de conférence hal-04369134v1
Supports for imaging projects toward Open Science at AuBi platform Mateo Hiriart,David Grimbichler,Laurent Bouri,Pierre Pouchin,Sophie Dessetet al. JOBIM, Jul 2022, Rennes, France Poster de conférence hal-03716079v1
ABRomics - a digital platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data Pierre Marin,Julie Lao,Kenzo-Hugo Hillion,Aurélien Birer,Nadia Gouéet al. JOURNÉES OUVERTES EN BIOLOGIE, INFORMATIQUE ET MATHÉMATIQUES ( JOBIM ) 2022, Jul 2022, Rennes, France. Actes JOBIM 2022 Poster de conférence hal-04369049v1
Creation of an integrated molecular dynamics workflow on the Galaxy platform : Characterization of aquaporin pores Agnès-Elisabeth Petit,Jean-Stéphane Venisse,Philippe Label,Nadia Goué JOBIM, Jul 2022, Rennes, France. Poster de conférence hal-03716631v1
Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types Manon Connault,Jérémy Tournayre,Céline Boby,Muriel Bonnet,Nadia Goue JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France Poster de conférence hal-03332138v2
Auvergne Bioinformatics platform at UCA Mesocentre Nadia Goué,David Grimbichler,Pierre Peyret,Antoine Mahul JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France Poster de conférence hal-04166998v1
A Newly Opened Galaxy Platform at Clermont Auvergne University Nadia Goué,David Grimbichler,Pierre Peyret,Antoine Mahul Galaxy Community Conference, Jul 2019, Freiburg, Germany Poster de conférence hal-04166976v1
AuBi platform for biologists and bioinformaticians at UCA Mesocentre Nadia Goué,David Grimbichler,Pierre Peyret,Antoine Mahul JOBIM2018, Jul 2018, Marseille, France Poster de conférence hal-04166992v1
Biophysical and molecular determinants of vulnerability to cavitation in young poplars Eric Badel,Nadia Goue,Hervé Cochard,Tete Severien Barigah,Stéphane Herbette International Symposium on Wood Structure in Plant Biology and Ecology, Apr 2013, Naples, Italy. 2013 Poster de conférence hal-01190307v1
Gene expression in ray and fusiform cambial cells of hybrid poplar Nadia Goué,Elisabeth Magel,Philippe Label,Björn Sundberg Tree Biotechnology 2003, Jun 2003, Umea, France. 1 p., 2003 Poster de conférence hal-02831369v1
Contribution to the SAGE tag analysis by constitution of a potential-SAGE-tag database for poplar improving tag identification uniqueness Farid Ghazali,Nadia Goué,Philippe Label Tree Biotechnology 2003, Jun 2003, Umea, France. 1 p., 2003 Poster de conférence hal-02829733v1

Thèse (1)

Etude de l'expression de gènes par type cellulaire dans le cambium de peuplier (Populus trichocarpa x P. deltoides var Boelare) Nadia Goué Sciences du Vivant [q-bio]. Université d'Orléans; Umea Plant Science Centre, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-02834160v1

Mémoire d'étudiant (1)

Proposer un workflow généraliste pour identifier les interactions protéine-protéine entre deux tissus. Exemple des PPIs entre le sécrétome et le surfaceome pour comprendre le dialogue entre tissus chez les mammifères et en particulier chez le bovin Manon Connault,Nadia Goué,Muriel Bonnet Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. 2021 Mémoire d'étudiant hal-03332182v1