Nathalie Vialaneix

Présentation

Publications

Article dans une revue (78)

A single-cell atlas of transcriptome changes in the intestinal epithelium at the suckling-to-weaning transition in male rabbits Tania Malonga,Christelle Knudsen,Julie Alberge,Emeline Lhuillier,Patrick Aymardet al. Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2026, 20 (1), pp.101628. ⟨10.1016/j.jcmgh.2025.101628⟩ Article dans une revue hal-05528807v1
Serum metabolomic signatures associated with frailty-related phenotypes in a cohort of older people Céline Bougel,Rémi Servien,Nathalie Vialaneix,Elise Maigne,Yves Boirieet al. GeroScience, In press, ⟨10.1007/s11357-026-02116-y⟩ Article dans une revue hal-05524168v1
No detectable impact of chronic oral lactic acid exposure on honey bee health: Insights from survival, lactate accumulation and head transcriptome Caroline Vilarem,Vincent Piou,Lucie Bouly,Frédéric Julien,Rachel Fourdinet al. Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, 303, pp.118807. ⟨10.1016/j.ecoenv.2025.118807⟩ Article dans une revue hal-05314855v1
Phoenics: a novel statistical approach for longitudinal metabolomic pathway analysis Camille Guilmineau,Marie Tremblay-Franco,Nathalie Vialaneix,Rémi Servien BMC Bioinformatics, 2025, 26 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12859-025-06118-z⟩ Article dans une revue hal-05037118v1
A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data Elise Jorge,Sylvain Foissac,Pierre Neuvial,Matthias Zytnicki,Nathalie Vialaneix Briefings in Bioinformatics, 2025, 26 (2), ⟨10.1093/bib/bbaf074⟩ Article dans une revue hal-04989132v1
Metabolomic analysis of the endometrium of Large White and Meishan pigs reveals differences in biological processes during late gestation Agnes Bonnet,Alyssa Imbert,Laure Gress,Nathalie Marty-Gasset,Annabelle Meynadieret al. BMC Genomics, 2025, 27 (1), pp.11. ⟨10.1186/s12864-025-12276-4⟩ Article dans une revue hal-05461714v1
NMFProfiler: a multi-omics integration method for samples stratified in groups Aurélie Mercadié,Éléonore Gravier,Gwendal Josse,Isabelle Fournier,Cécile Viodéet al. Bioinformatics, 2025, 41 (2), pp.btaf066. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf066⟩ Article dans une revue hal-04992913v1
The CRAN Task View Initiative Achim Zeileis,Roger Bivand,Dirk Eddelbuettel,Kurt Hornik,Julia Piaskowskiet al. The R Journal, 2025, 17 (2), pp.4-14. ⟨10.32614/RJ-2025-011⟩ Article dans une revue hal-05332611v1
A random forest approach for interval selection in functional regression Rémi Servien,Nathalie Vialaneix Statistical Analysis and Data Mining, 2024, 17 (4), pp.e11705. ⟨10.1002/sam.11705⟩ Article dans une revue hal-04663826v1
RNA-seq data of pig placenta and endometrium during late gestation Sarah Maman-Haddad,Laure Gress,Amandine Suin,Nathalie Vialaneix,Agnès Bonnet Data in Brief, 2024, 57, pp.111178. ⟨10.1016/j.dib.2024.111178⟩ Article dans une revue (data paper) hal-04831303v1
Should we really use graph neural networks for transcriptomic prediction? Céline Brouard,Raphaël Mourad,Nathalie Vialaneix Briefings in Bioinformatics, 2024, 25 (2), pp. bbae027. ⟨10.1093/bib/bbae027⟩ Article dans une revue hal-04459067v1
BEST4 + cells in the intestinal epithelium Tania Malonga,Nathalie Vialaneix,Martin Beaumont American Journal of Physiology - Cell Physiology, 2024, 326 (5), pp.C1345-C1352. ⟨10.1152/ajpcell.00042.2024⟩ Article dans une revue hal-04572846v1
A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals Pierre Neuvial,Nathanaël Randriamihamison,Marie Chavent,Sylvain Foissac,Nathalie Vialaneix Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2024, pp.qlae011. ⟨10.1093/jrsssc/qlae011⟩ Article dans une revue hal-04516167v1
ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné,Céline Noirot,Julien Henry,Yaa Adu Kesewaah,Ludovic Badinet al. BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.391. ⟨10.1186/s12859-023-05504-9⟩ Article dans une revue hal-04248315v1
Plasma 1H-NMR metabolic and amino acid profiles of newborn piglets from two lines divergently selected for residual feed intake Laurence Liaubet,Camille Guilmineau,Gaëlle Lefort,Yvon Billon,Sébastien Reigneret al. Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.7127. ⟨10.1038/s41598-023-34279-5⟩ Article dans une revue hal-04091374v1
Feature selection for kernel methods in systems biology Celine Brouard,Jérôme J. Mariette,Rémi Flamary,Nathalie Vialaneix NAR Genomics and Bioinformatics, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/nargab/lqac014⟩ Article dans une revue hal-03601435v1
Network analyses reveal negative link between changes in adipose tissue GDF15 and BMI during dietary-induced weight loss Alyssa Imbert,Nathalie Vialaneix,Julien Marquis,Julie Vion,Aline Charpagneet al. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2022, 107 (1), pp.e130-e142. ⟨10.1210/clinem/dgab621⟩ Article dans une revue hal-03540946v1
R-miss-tastic: a unified platform for missing values methods and workflows Imke Mayer,Aude Sportisse,Nicholas Tierney,Nathalie Vialaneix,Julie Josse The R Journal, 2022, 14 (2), pp.244-266. ⟨10.32614/RJ-2022-040⟩ Article dans une revue hal-02879337v3
Major reorganization of chromosome conformation during muscle development in pig Maria Marti-Marimon,Nathalie Vialaneix,Yvette Lahbib Mansais,Matthias Zytnicki,Sylvie Camutet al. Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.19 P. ⟨10.3389/fgene.2021.748239⟩ Article dans une revue hal-03367056v1
Applicability and interpretability of Ward's hierarchical agglomerative clustering with or without contiguity constraints Nathanaël Randriamihamison,Nathalie Vialaneix,Pierre Neuvial Journal of Classification, 2021, 38, pp.363-389. ⟨10.1007/s00357-020-09377-y⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02294847v2
Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Nathalie Marty-Gasset,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneixet al. Analytical Chemistry, 2021, 93 (5), pp.2861-2870. ⟨10.1021/acs.analchem.0c04232⟩ Article dans une revue hal-03224485v1
The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach Gaëlle Lefort,Rémi Servien,Hélène Quesnel,Yvon Billon,Laurianne L. Canarioet al. Scientific Reports, 2020, 10, pp.19912. ⟨10.1038/s41598-020-76709-8⟩ Article dans une revue hal-03034560v1
ASICS: an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Patrick Tardivel,Marie-Christine Pereet al. Bioinformatics, 2019, 35 (21), pp.4356-4363. ⟨10.1093/bioinformatics/btz248⟩ Article dans une revue hal-02626125v1
Interpretable sparse SIR for functional data Victor Picheny,Rémi Servien,Nathalie Vialaneix Statistics and Computing, 2019, 29 (2), pp.255 - 267. ⟨10.1007/s11222-018-9806-6⟩ Article dans une revue hal-02618466v1
Reprise atypique de la cyclicité ovarienne chez la vache laitière : une forte association avec la cétose Sylvie S. Chastant-Maillard,Claire Saby,Wenting Zhang,René Fournier,Rémi Servienet al. Le Point vétérinaire, 2019, 393 Article dans une revue hal-02617694v1
Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals Sylvain Foissac,Sarah Djebali,Kylie Munyard,Nathalie Vialaneix,Andrea Rauet al. BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩ Article dans une revue hal-02437599v1
Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to Genomics Christophe Ambroise,Alia Dehman,Pierre Neuvial,Guillem Rigaill,Nathalie Vialaneix Algorithms for Molecular Biology, 2019, 14, pp.22. ⟨10.1186/s13015-019-0157-4⟩ Article dans une revue hal-02006331v2
A new approach of gene co-expression network inference reveals significant biological processes involved in porcine muscle development in late gestation Maria Marti-Marimon,Nathalie Vialaneix,Valentin Voillet,Martine Bouissou-Matet,Yvette Lahbib Mansaiset al. Scientific Reports, 2018, 8, ⟨10.1038/s41598-018-28173-8⟩ Article dans une revue hal-02622725v1
Décrire, prendre en compte, imputer et évaluer les valeurs manquantes dans les études statistiques : une revue des approches existantes Alyssa Imbert,Nathalie Vialaneix Journal de la Société Française de Statistique, 2018, 159 (2), pp.1-55 Article dans une revue (article de synthèse) hal-02618033v1
Cutting edge bioinformatics and biostatistics approaches are bringing precision medicine and nutrition to a new era Sanjeena Dang,Nathalie Vialaneix Lifestyle Genomics, 2018, 11 (2), pp.73-76. ⟨10.1159/000494131⟩ Article dans une revue hal-02624369v1
Self-Organizing Maps, theory and applications Marie Cottrell,Madalina Olteanu,Fabrice Rossi,Nathalie N. Villa-Vialaneix Revista de Investigacion Operacional, 2018, 39 (1), pp.1-22 Article dans une revue hal-01796059v1
Unsupervised multiple kernel learning for heterogeneous data integration Jérôme J. Mariette,Nathalie Vialaneix Bioinformatics, 2018, 34 (6), pp.1009-1015. ⟨10.1093/bioinformatics/btx682⟩ Article dans une revue hal-01738461v1
Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data Alyssa Imbert,Armand Valsesia,Caroline Le Gall,Claudia Armenise,Gregory Lefebvreet al. Bioinformatics, 2018, 34 (10), pp.1726 - 1732. ⟨10.1093/bioinformatics/btx819⟩ Article dans une revue hal-01794575v1
(NMR)-N-1H-Based metabolomic profiling method to develop plasma biomarkers for sensitivity to chronic heat stress in growing pigs Samir Dou,Nathalie Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Yvon Billon,Mario Giorgiet al. PLoS ONE, 2017, 12 (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0188469⟩ Article dans une revue hal-02626025v1
Random Forests for Big Data Robin Genuer,Jean-Michel Poggi,Christine Tuleau-Malot,Nathalie Vialaneix Big Data Research, 2017, 9, pp.28-46. ⟨10.1016/j.bdr.2017.07.003⟩ Article dans une revue hal-01233923v2
Efficient interpretable variants of online SOM for large dissimilarity data Jérôme J. Mariette,Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix Neurocomputing, 2017, 225, pp.31-48. ⟨10.1016/j.neucom.2016.11.014⟩ Article dans une revue hal-01465340v1
Time course study of the response to LPS targeting the pig immune gene networks Elena Terenina,Valérie Sautron,Caroline Ydier,Darya Bazovkina,Amélie Sevin-Pujolet al. BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4363-5⟩ Article dans une revue hal-02627295v1
Molecular biomarkers for weight control in obese individuals subjected to a multiphase dietary intervention Jennifer Bolton,Emilie Montastier,Jérôme Carayol,Sophie Bonnel,Lucile Miret al. Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2017, 102 (8), pp.2751-2761. ⟨10.1210/jc.2016-3997⟩ Article dans une revue hal-01608397v1
On combining wavelets expansion and sparse linear models for Regression on metabolomic data and biomarker selection Nathalie Vialaneix,Noslen Hernández,Alain Paris,Céline Domange,Nathalie Priymenkoet al. Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2016, 45 (1), pp.282-298. ⟨10.1080/03610918.2013.862273⟩ Article dans une revue hal-01270963v1
Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC Avner Bar-Hen,Hubert Javaux,Nathalie N. Villa-Vialaneix Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2016, 12 (1-2), pp.11-22 Article dans une revue hal-02630053v1
Beyond multidimensional data in model visualization: High-dimensional and complex nonnumeric data Nathalie Vialaneix,Anne Ruiz-Gazen Statistical Analysis and Data Mining, 2015, 8 (4), pp.232-239. ⟨10.1002/sam.11274⟩ Article dans une revue hal-01182932v1
On-line relational and multiple relational SOM Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix Neurocomputing, 2015, 147, pp.15-30. ⟨10.1016/j.neucom.2013.11.047⟩ Article dans une revue hal-01063831v1
Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC Avner Bar-Hen,Hubert Javaux,Nathalie Vialaneix Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22 Article dans une revue hal-01270885v1
Using SOMbrero for clustering and visualizing graphs Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix Journal de la Société Française de Statistique, 2015, 156 (3), pp.95-119 Article dans une revue hal-01232672v1
Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study Valérie Sautron,Elena Terenina,Laure Gress,Yannick Lippi,Yvon Billonet al. BMC Genomics, 2015, 16 (961), pp.PMC4650497. ⟨10.1186/s12864-015-2118-8⟩ Article dans une revue hal-01271063v1
System Model Network for Adipose Tissue Signatures Related to Weight Changes in Response to Calorie Restriction and Subsequent Weight Maintenance Emilie Montastier,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Sylvie Caspar-Bauguil,Petr Hlavaty,Eva Tvrzickaet al. PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004047. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004047⟩ Article dans une revue inserm-02150615v1
Statistical Analysis of the profiles and of the activity of participants of MOOC Avner Bar-Hen,Hubert Javaux,Nathalie N. Villa-Vialaneix Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22. ⟨10.18162/ritpu-2015-v12n12-03⟩ Article dans une revue hal-02636153v1
A non parametric approach for calibration with functional data Noslen Hernández,Rolando Biscay,Nathalie Vialaneix,Isneri Talavera Statistica Sinica, 2015, 22 (4), pp.1547-1566. ⟨10.5705/ss.2013.242⟩ Article dans une revue hal-01199287v1
Statistical exploratory analysis of agent-based simulations in a social context Nathalie Villa-Vialaneix,Christophe Sibertin-Blanc,Pascal Roggero Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2014, 5 (2), pp.132-149 Article dans une revue hal-02629776v2
Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO Nathalie N. Villa-Vialaneix,Matthieu Vignes,Nathalie Viguerie,Magali San Cristobal Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60 Article dans une revue hal-02641674v1
Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods Fabrice Rossi,Nathalie Vialaneix,Florent Hautefeuille Digital Medievalist, 2014, 9, pp.2013 Article dans une revue hal-01053673v1
Le metabolome, un moyen pour trouver de nouveaux biomarqueurs ? Magali San Cristobal,Marie-Pierre Sanchez,Marie‐josé Mercat,Florian Rohart,Laurence Liaubetet al. La revue française de la recherche en viandes et produits carnés, 2014, Février, pp.1-5 Article dans une revue hal-01222422v1
Inferring networks from multiple samples with Consensus LASSO Nathalie Villa-Vialaneix,Matthieu Vignes,Nathalie Viguerie,Magali San Cristobal Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60 Article dans une revue hal-00971458v1
Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods Fabrice Rossi,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Florent Hautefeuille Digital Medievalist, 2013, 9 Article dans une revue hal-02648351v1
Spatial correlation in bipartite networks Nathalie Villa-Vialaneix,Bertrand Jouve,Fabrice Rossi,Florent Hautefeuille Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, pp.97-110 Article dans une revue hal-00761081v1
The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs Nathalie Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Thibault Laurent,Pierre Cherel,Adrien Gamotet al. PLoS ONE, 2013, pp.e60045 Article dans une revue hal-00817655v1
J'ai testé pour vous... un MOOC Nathalie Villa-Vialaneix Statistique et Enseignement, 2013, 4 (2), pp.3-17 Article dans une revue hal-00940787v1
The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs Nathalie N. Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Thibault Laurent,Pierre Cherel,Adrien Gamotet al. PLoS ONE, 2013, 8, online (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0060045⟩ Article dans une revue hal-02646005v1
Determinants of human adipose tissue gene expression: impact of diet, sex, metabolic status, and cis genetic regulation. Nathalie Viguerie,Emilie Montastier,Jean-José Maoret,Balbine Roussel,Marion Combeset al. PLoS Genetics, 2012, 8 (9), pp.e1002959. ⟨10.1371/journal.pgen.1002959⟩ Article dans une revue hal-00757837v1
Phenotypic prediction based on metabolomic data on the growing pig from three main European breeds. F. Rohart,Alain Paris,Béatrice Laurent,Cécile Canlet,Jerome Molinaet al. Journal of Animal Science, 2012, 90 (13), epub ahead of print. ⟨10.2527/jas.2012-5338⟩ Article dans une revue hal-00757827v1
A comparison of eight metamodeling techniques for the simulation of N2O fluxes and N leaching from corn crops Nathalie Villa-Vialaneix,Marco Follador,Marco Ratto,Adrian Leip Environmental Modelling and Software, 2012, 34, pp.51-66. ⟨10.1016/j.envsoft.2011.05.003⟩ Article dans une revue hal-00654753v1
Neural Networks for Complex Data Marie Cottrell,Madalina Olteanu,Fabrice Rossi,Joseph Rynkiewicz,Nathalie Villa-Vialaneix KI - Künstliche Intelligenz, 2012, 26 (4), pp.373-380. ⟨10.1007/s13218-012-0207-2⟩ Article dans une revue hal-00744929v1
Recherche et représentation de communautés dans un grand graphe. Une approche combinée Nathalie Villa-Vialaneix,Taoufiq Dkaki,Sébastien Gadat,Jean-Michel Inglebert,Quoc-Dinh Truong Document numérique - Revue des sciences et technologies de l'information. Série Document numérique, 2011, 14 (1), pp.59-80. ⟨10.3166/dn.14.1.59-80⟩ Article dans une revue hal-00590612v1
Représentation d'un grand réseau à partir d'une classification hiérarchique de ses sommets Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix Journal de la Société Française de Statistique, 2011, 152 (3), pp.34-65 Article dans une revue hal-00651577v1
Consistency of functional learning methods based on derivatives Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix Pattern Recognition Letters, 2011, 32 (8), pp.1197-1209. ⟨10.1016/j.patrec.2011.03.001⟩ Article dans une revue hal-00589738v1
Using spatial indexes for labeled network analysis Thibault Laurent,Nathalie Villa-Vialaneix Revue I3 - Information Interaction Intelligence, 2011, 11 (1), pp.1 Article dans une revue hal-00654754v1
A Simulation Study of Functional Density-Based Inverse Regression Noslen Hernández,Rolando Biscay,Nathalie Villa-Vialaneix,Isneri Talavera Revista Investigacion Operacional, 2011, 32 (2), pp.146-159 Article dans une revue hal-00654751v1
What is a good (gene) network? Nathalie Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Magali San Cristobal Journal of Animal Breeding and Genetics, 2011, 128 (1), pp.1-2. ⟨10.1111/j.1439-0388.2010.00916.x⟩ Article dans une revue hal-00658814v1
Optimizing an Organized Modularity Measure for Topographic Graph Clustering: a Deterministic Annealing Approach Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix Neurocomputing, 2010, 73 (7-9), pp.Pages 1142-1163. ⟨10.1016/j.neucom.2009.11.023⟩ Article dans une revue hal-00515892v1
Batch kernel SOM and related Laplacian methods for social network analysis Romain Boulet,Bertrand Jouve,Fabrice Rossi,Nathalie Villa Neurocomputing, 2008, 71 (7-9), pp.1257-1273. ⟨10.1016/j.neucom.2007.12.026⟩ Article dans une revue hal-00202339v1
Storms prediction : Logistic regression vs random forest for unbalanced data Anne Ruiz-Gazen,Nathalie Villa Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2007, 1 (2), pp.91-101 Article dans une revue hal-00270176v1
Various Approaches for Predicting Land Cover in Mountain Areas Nathalie Villa,Martin Paegelow,Maria T. Camacho Olmedo,Laurence Cornez,Frédéric Ferratyet al. Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2007, 36 (1), pp.73-86. ⟨10.1080/03610910601096379⟩ Article dans une revue hal-00144147v1
Support vector machine for functional data classification Fabrice Rossi,Nathalie Villa Neurocomputing, 2006, 69 (7-9), pp.730-742. ⟨10.1016/j.neucom.2005.12.010⟩ Article dans une revue hal-00144141v1
Un résultat de consistance pour des SVM fonctionnels par interpolation spline Nathalie Villa,Fabrice Rossi Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2006, 343 (8), pp.555-560. ⟨10.1016/j.crma.2006.09.025⟩ Article dans une revue hal-00144142v1
Multilayer Perceptron with Functional Inputs: an Inverse Regression Approach Louis Ferré,Nathalie Villa Scandinavian Journal of Statistics, 2006, 33 (4), pp.807-823. ⟨10.1111/j.1467-9469.2006.00496.x⟩ Article dans une revue hal-00144144v1
Discrimination de courbes par régression inverse fonctionnelle Louis Ferré,Nathalie Villa Revue de Statistique Appliquée, 2005, LIII (1), pp.39-57 Article dans une revue hal-00144140v1
Modélisations prospectives de l'occupation du sol. Le cas d'une montagne méditerranéenne Martin Paegelow,Nathalie Villa,Laurence Cornez,Frédéric Ferraty,Louis Ferréet al. Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 15 p Article dans une revue hal-00144134v2
Modélisation prospective de l’occupation du sol. Le cas d’une montagne méditerrannéenne. Martin Paegelow,Nathalie Villa,Laurence Cornez,Frédéric Ferraty,Louis Ferréet al. Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 21 p. en ligne Article dans une revue hal-03160711v1

Communication dans un congrès (118)

Inférence post hoc pour l'analyse différentielle de données Hi-C Élise Jorge,Pierre Neuvial,Nathalie Vialaneix,Sylvain Foissac 56e Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.446 Communication dans un congrès hal-05113438v1
phoenics : une nouvelle approche statistique pour l'analyse différentielle longitudinale de voies métaboliques Camille Guilmineau,Rémi Servien,Marie Tremblay-Franco,Nathalie Vialaneix 56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.463 Communication dans un congrès hal-05113439v1
Analyse de la spécificité des associations génétiques dans les études multi-population Jeong Hwan Ko,Andrea Rau,Nathalie Vialaneix Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04593233v1
Analyse différentielle longitudinale des voies métaboliques Camille Guilmineau,Rémi Servien,Marie Tremblay-Franco,Nathalie Vialaneix 56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04595237v1
Réseaux de gènes : inférence, évaluation, utilisation et au-delà Nathalie Vialaneix Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04593166v1
Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peau Aurélie Mercadié,Eleonore Gravier,Gwendal Josse,Nathalie Vialaneix,Celine Brouard Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04595238v1
La transcriptomique en cellule unique révèle les processus de maturation induits dans chaque type de cellule épithéliale intestinale lors de l'introduction de l'alimentation solide Tania Malonga,Christelle Knudsen,Emeline Lhuillier,Patrick Aymard,Elodie Riantet al. CECED 2024, Club des Cellules Epithéliales Digestives, Mar 2024, Montpellier, France. pp.P12 Communication dans un congrès hal-04527178v1
Procédure de test hiérarchique pour l'analyse différentielle de données Hi-C Élise Jorge,Pierre Neuvial,Nathalie Vialaneix,Sylvain Foissac Journées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-04593207v1
Modélisation de données métabolomiques longitudinales par voies métaboliques Camille Guilmineau,Marie Tremblay-Franco,Nathalie Vialaneix,Rémi Servien 54. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgique Communication dans un congrès hal-04154758v1
Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques Aurélie Mercadié,Eleonore Gravier,Gwendal Josse,Nathalie Vialaneix,Celine Brouard Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgium Communication dans un congrès hal-04154752v1
ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné,Céline Noirot,Julien Henry,Yaa Adu Kesewaah,Sébastien D Éjeanet al. Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France. ⟨10.57745/TCKSTD⟩ Communication dans un congrès hal-04746181v1
Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques Aurélie Mercadié,Eléonore Gravier,Gwendal Josse,Nathalie Vialaneix,Celine Brouard Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-04746164v1
ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné,Céline Noirot,Jérôme Mariette,Yaa Adu Kesewaah,Sébastien Déjeanet al. Les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France Communication dans un congrès hal-03697843v1
Sélection d'intervalles pour des prédicteurs fonctionnels à partir de forêts aléatoires Rémi Servien,Nathalie Vialaneix Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2022, Lyon, France Communication dans un congrès hal-03697845v1
Multi-omics data integration methods: kernel and other machine learning approaches Nathalie Vialaneix Machine Learning for Life Sciences, Key Initiative MUSE, Université de Montpellier, Nov 2022, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-03856931v1
CRAN Task Views para Guiar a usuaries de paquetes de R Rocío Joo,Nathalie Vialaneix,Roger Bivand,Dirk Eddelbuettel,David Meyeret al. LatinR, Oct 2022, Online, Francia Communication dans un congrès hal-03809780v1
Plasmatic and ruminal metabolomes of lambs divergently selected on residual feed intake Florian Touitou,Flavie Tortereau,Nathalie Marty-Gasset,Nathalie Vialaneix,Gaëlle Lefortet al. EAAP – European Federation of Animal Science 2021, Aug 2021, Davos, Switzerland Communication dans un congrès hal-03547250v1
ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Nathalie Villa,Rémi Servien European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02737383v1
Analyse différentielle de données Hi-C via la classification ascendante hiérarchique sous contrainte de contiguïté Nathanaël Randriamihamison,Marie Chavent,Sylvain Foissac,Nathalie Vialaneix,Pierre Neuvial JDS2020 : 52èmes Journées de Statistique de la Société Française de Statistique (SFdS), Société Française de Statistique, May 2020, Nice, France. pp.655-660 Communication dans un congrès hal-02892664v1
Chromatin accessibility conservation across four livestock species Sarah Djebali Quelen,Sylvain Foissac,Nathalie Vialaneix,Kylie Munyard,Andrea Rauet al. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain Communication dans un congrès hal-02788732v1
Unsupervised variable selection for kernel methods in systems biology Jérôme J. Mariette,Celine Brouard,Remi Flamary,Nathalie Vialaneix Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02787253v1
Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc Yvette Lahbib Mansais,Maria Marti-Marimon,Nathalie Vialaneix,Sylvain Foissac,Martine Bouissou-Matetet al. 5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p Communication dans un congrès hal-02736301v1
Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes Nathanaël Randriamihamison,Pierre Neuvial,Nathalie Vialaneix 51èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2019, Nancy, France Communication dans un congrès hal-02734011v1
ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneix,Rémi Servien 51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France Communication dans un congrès hal-02737497v1
Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expression Sylvain Foissac,Sarah Djebali,Kylie Munyard,Nathalie Vialaneix,Andrea Rauet al. ASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩ Communication dans un congrès hal-02735898v1
Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and function Sylvain Foissac,Sarah Djebali Quelen,Nathalie Vialaneix,Matthias Zytnicki,Andrea Rauet al. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain Communication dans un congrès hal-02788476v1
Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data Alyssa Imbert,Armand Valsesia,Claudia Armenise,Gregory Lefebvre,Pierre-Antoine Gourraudet al. European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece Communication dans un congrès hal-02788524v1
Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Patrick Tardivel,Cécile Canlet,Marie Tremblay-Francoet al. Journée des Plateformes BioInfo et BioStat du Génotoul, Jan 2018, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02788399v1
Random forests for big data Robin Genuer,Jean-Michel Poggi,Christine Tuleau-Malot,Nathalie Villa-Vialaneix Data Science, Statistics & Visualization (DSSV) 2018, Jul 2018, Vienne, Austria Communication dans un congrès hal-02787208v1
ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Nathalie Villa-Vialaneix,Rémi Servien 7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02791362v1
RNAseqNet : un package pour l'inférence de réseaux à partir de données RNA-seq Alyssa Imbert,Nathalie Villa-Vialaneix 7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02791466v1
An innovative method of gene co expression network inference reveals significant biological processes involved in fetal porcine muscle development Maria Marti-Marimon,Nathalie Villa-Vialaneix,Valentin Voillet,Martine Yerle-Bouissou,Laurence Liaubetet al. 23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. pp.2 Communication dans un congrès hal-02734342v1
Learning from (dis)similarity data Nathalie Vialaneix European R Users Meeting (eRum 2018), May 2019, Budapest, Hungary. 70 p Communication dans un congrès hal-02785273v1
Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics Christophe Ambroise,Alia Dehman,Michel Koskas,Pierre Neuvial,Guillem Rigaillet al. Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Dec 2018, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02788245v1
Accelerating stochastic kernel SOM Jérôme J. Mariette,Fabrice Rossi,Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. 6 p Communication dans un congrès hal-02734663v1
Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle Maria Eugenia Marti Marimon,Hervé Acloque,Matthias Zytnicki,David Robelin,Sarah Djebali Quelenet al. 36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43 Communication dans un congrès hal-02868765v1
Random forests for big data Robin Genuer,Jean-Michel Poggi,Christine Tuleau-Malot,Nathalie Villa-Vialaneix 10th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02785199v1
Progesterone and betahydroxybutyrate in line measurements for a better description and understanding of Holstein cows fertility in field conditions Claire Saby,Wenting Zhang,René Fournier,Rémi Servien,Nathalie Villa-Vialaneixet al. 8th European Conference on Precision Livestock Farming (EC-PLF), Sep 2017, Nantes, France. 7 p Communication dans un congrès hal-01607267v1
Stochastic Self-Organizing Map variants with the R package SOMbrero Nathalie Villa-Vialaneix 12th International Workshop on Self-Organizing Maps and Learning Vector Quantization, Clustering and Data Visualization (WSOM), Jun 2017, Nancy, France. 7 p., ⟨10.1109/WSOM.2017.8020014⟩ Communication dans un congrès hal-01605663v1
Unsupervised multiple kernel learning to integrate various metagenomic sources Jérôme J. Mariette,Nathalie Villa-Vialaneix 4ème colloque de Génomique Environnementale, Sep 2017, Marseille, France Communication dans un congrès hal-01604708v1
Accelerating stochastic kernel SOM Jérôme J. Mariette,Fabrice Rossi,Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. pp.269-274 Communication dans un congrès hal-01516660v1
Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix 9th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2016, Séville, Spain Communication dans un congrès hal-01604379v1
Multiway-SIR for longitudinal multi-table data integration Valérie Sautron,Marie Chavent,Nathalie Viguerie,Nathalie N. Villa-Vialaneix 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain. pp.1 Communication dans un congrès hal-02796270v1
Integrating Tara oceans data sets using multiple kernels Jérôme J. Mariette,Helene H. Chiapello,Nathalie N. Villa-Vialaneix 15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, The Hague, Netherlands. pp.3 Communication dans un congrès hal-02792439v1
Sparse online self-organizing maps for large relational data Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_6⟩ Communication dans un congrès hal-01270710v1
3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells Yvette Lahbib Mansais,Maria Marti-Marimon,Valentin Voillet,Harmonie Barasc,Florence Mompartet al. 22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p Communication dans un congrès hal-02743243v1
Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq Alyssa Imbert,Nathalie N. Villa-Vialaneix Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France. 2 p Communication dans un congrès hal-02739876v1
Aggregating Self-Organizing Maps with Topology Preservation Jérôme J. Mariette,Nathalie Vialaneix WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_2⟩ Communication dans un congrès hal-01270640v1
Random forests for big data Nathalie N. Villa-Vialaneix,Robin Genuer,Jean-Michel Poggi,Christine Tuleau-Malot Journées de Statistique de Rennes (JSTAR), Oct 2016, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02796431v1
3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes Yvette Lahbib Mansais,Maria Marti-Marimon,Valentin Voillet,Harmonie Barasc,Florence Mompartet al. 35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States Communication dans un congrès hal-02742818v1
Interval sparsity for functional inverse regression Rémi Servien,Victor Picheny,Nathalie N. Villa-Vialaneix 2016 CRoNoS Summer Course, 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain Communication dans un congrès hal-02799603v1
Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix CMStatistics, Dec 2016, Séville, Spain Communication dans un congrès hal-01519707v1
Parcimonie par intervalle pour la régression inverse par tranche fonctionnelle Victor Picheny,Rémi Servien,Nathalie Vialaneix 48e Journées de Statistique de la SFdS, May 2016, Montpellier, France. pp.6 Communication dans un congrès hal-01325538v1
Interpretable sparse sliced inverse regression for functional data Victor Picheny,Rémi Servien,Nathalie N. Villa-Vialaneix Workshop Learning with Functional Data, Oct 2016, Lille, France Communication dans un congrès hal-02799481v1
Outils pour chercher de l'information sur R et se former Nathalie Vialaneix,Christophe Bontemps,Sébastien Dejean Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-01352178v1
Imputation de données manquantes pour l'inférence de r éseau à partir de données RNA-seq Alyssa Imbert,Caroline Le Gall,Claudia Armenise,Gregory Lefebvre,Jorg Hageret al. 48e Journées de la Société Française de Statistique, May 2016, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-01325523v1
Theoretical and applied aspects of the self-organizing maps Marie Cottrell,Madalina Olteanu,Fabrice Rossi,Nathalie Vialaneix WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.3-26, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_1⟩ Communication dans un congrès hal-01270701v1
Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées Philippe Besse,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Anne Ruiz-Gazen 47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2015, Lille, France Communication dans un congrès hal-02742204v1
Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées Philippe Besse,Nathalie Villa-Vialaneix,Anne Ruiz-Gazen 47èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2015, Lille, France Communication dans un congrès hal-01160638v1
Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero Madalina Olteanu,Nathalie N. Villa-Vialaneix Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France. pp.2 Communication dans un congrès hal-02795287v1
Multiple dissimilarity SOM for clustering and visualizing graphs with node and edge attributes Nathalie Vialaneix,Madalina Olteanu International Conference on Machine Learning, Workshop FEAST, Jul 2015, Lille, France. 1p Communication dans un congrès hal-01175731v1
What is a MOOC? Nathalie N. Villa-Vialaneix 15th Annual Conference of ENBIS, Sep 2015, Prague, Czech Republic Communication dans un congrès hal-02792063v1
Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France Communication dans un congrès hal-01171557v1
Random forests and big data Robin Genuer,Jean-Michel Poggi,Christine Tuleau-Malot,Nathalie Villa-Vialaneix 47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jun 2015, Lille, France Communication dans un congrès hal-01160643v1
Self-organizing maps for clustering and visualization of bipartite graphs Madalina Olteanu,Nathalie N. Villa-Vialaneix 46e Journées de la Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. pp.109 Communication dans un congrès hal-02739820v1
Adipose tissue signatures related to weight changes in response to calorie restriction and subsequent weight maintenance using lipidome and gene profiling network analysis Emilie Montastier,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Ignacio González,Sylvie Caspar-Bauguil,Wim H.M. Sariset al. Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France. 2 p Communication dans un congrès hal-02797111v1
J'ai testé pour vous... un MOOC Nathalie Vialaneix Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.90 Communication dans un congrès hal-01001759v1
Self-Organizing Maps for clustering and visualization of bipartite graphs Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix 46e Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.109 Communication dans un congrès hal-01001991v1
Bagged kernel SOM Jérôme J. Mariette,Madalina Olteanu,Julien Boelaert,Nathalie Vialaneix 10th International Workshop, WSOM 2014, Hochschule Esslingen University of Applied Sciences. DEU., Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.45-54, ⟨10.1007/978-3-319-07695-9⟩ Communication dans un congrès hal-01018374v1
Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO Nathalie Vialaneix,Matthieu Vignes,Nathalie Viguerie,Magali San Cristobal ENBIS Spring Meeting, Apr 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-02793667v1
SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric self-organizing maps Julien Boelaert,Laura Bendhaiba,Madalina Olteanu,Nathalie N. Villa-Vialaneix WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-07695-9_21⟩ Communication dans un congrès hal-02743631v1
Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed Victor Picheny,Jimmy Vandel,Matthieu Vignes,Nathalie Villa-Vialaneix Seventeenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AI & Statistics 2014), Apr 2014, Reykjavik, Iceland. pp.L014 Communication dans un congrès hal-00982758v1
SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric Self-Organizing Maps Julien Boelaert,Laura Bendhaiba,Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix 10th International Workshop, WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.219-228 Communication dans un congrès hal-01018732v1
Blood transcriptome response to LPS in pigs Elodie Merlot,Armelle Prunier,Marie Damon,Florence Vignoles,Nathalie Villa-Vialaneixet al. 65. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2014, Copenhague, Denmark. pp.274 Communication dans un congrès hal-01210717v1
Genetics systems of stress responses in pigs Valérie Sautron,Elena Mormede Terenina,Pierre Mormède,Nathalie N. Villa-Vialaneix Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02793146v1
J'ai testé pour vous... un MOOC Nathalie N. Villa-Vialaneix 46e Journées de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2014, Rennes, France Communication dans un congrès hal-02740506v1
Data Analysis of Social Simulations Outputs - Focus on variables dispersion Christophe Sibertin-Blanc,Nathalie Vialaneix Workshop on Multi-Agent-Based Simulation, May 2014, Paris, France. Paper session 3, paper 2 Communication dans un congrès hal-00990219v1
Data analysis of social simulations outputs: Interpreting the dispersion of variables Christophe Sibertin-Blanc,Nathalie Vialaneix 15th International Workshop on Multi-Agent-Based Simulation (MBAS 2014 @ AAMAS), May 2014, Paris, France. pp.133-150, ⟨10.1007/978-3-319-14627-0_10⟩ Communication dans un congrès hal-01270802v1
sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner Damien Leroux,Nathalie Villa-Vialaneix 2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.103-104 Communication dans un congrès hal-00850516v1
SOMbrero : Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités Laura Bendhaiba,Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix 2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.99-100 Communication dans un congrès hal-00850514v1
Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés. Nathalie Villa-Vialaneix,Madalina Olteanu,Christine Cierco-Ayrolles Atelier Fouilles de Grands Graphes (FGG) - EGC'2013, Jan 2013, Toulouse, France. pp.Article numéro 4 Communication dans un congrès hal-00783860v1
Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study Sébastien Massoni,Madalina Olteanu,Nathalie N. Villa-Vialaneix International Workshop on Artificial Neural Networks, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain Communication dans un congrès hal-02806089v1
Multiple kernel self-organizing maps Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix,Christine Cierco-Ayrolles European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2013, Bruges, Belgium. pp.83 Communication dans un congrès hal-00817920v1
On-line relational SOM for dissimilarity data Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix,Marie Cottrell WSOM 2012, Dec 2012, Santiago, Chile. pp.13-22 Communication dans un congrès hal-00768948v1
Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples Nathalie Villa-Vialaneix,Magali San Cristobal 45èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2013, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-00829157v1
Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés Nathalie N. Villa-Vialaneix,Madalina Olteanu,Christine Cierco-Ayrolles Atelier Fouilles de Grands Graphes - EGC, Jan 2013, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-02807496v1
Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs Florian Brunet,Jérôme J. Mariette,Christine Cierco-Ayrolles,Christine Gaspin,Philippe Bardouet al. MARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1 Communication dans un congrès hal-00877561v1
Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study Sébastien Massoni,Madalina Olteanu,Nathalie Villa-Vialaneix IWANN 2013, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain. session 12-1A, paper 2 Communication dans un congrès hal-00854302v1
Multiple kernel self-organizing maps Madalina Olteanu,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Christine Cierco-Ayrolles 21. European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2013), Apr 2013, Bruges, Belgium Communication dans un congrès hal-02747111v1
Exploration relationnelle d'un corpus d'actes notariés médiévaux Nathalie Villa-Vialaneix,Fabrice Rossi,Florent Hautefeuille Colloque Configuration(s), Jun 2012, Paris, France Communication dans un congrès hal-00721403v1
Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference Nathalie Villa-Vialaneix,Nicolas A. Edwards,Laurence Liaubet,Nathalie Viguerie,Magali San Cristobal 1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.93-94 Communication dans un congrès hal-00714444v1
Analyse de données pour des graphes étiquetés Thibault Laurent,Nathalie Villa-Vialaneix 44èmes Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.196 Communication dans un congrès hal-00707779v1
Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference Nathalie Villa-Vialaneix,Nicolas A. Edwards,Laurence Liaubet,Nathalie Viguerie,Magali San Cristobal 1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-00717549v1
Genetic and phenotypic fine characterizations of French porcine reference populations Magali San Cristobal,Simon Boitard,Maria Inès Fariello Rico,Hélène Gilbert,Laurence Liaubetet al. ISAG, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.1 Communication dans un congrès hal-01019125v1
Exploration of a Large Database of French Charters with Social Network Methods Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix,Florent Hautefeuille International Medieval Congress (IMC 2011), Jul 2011, Leeds, United Kingdom Communication dans un congrès hal-00668229v1
L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt Nathalie Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Thibault Laurent,Adrien Gamot,Pierre Cherelet al. Journées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172 Communication dans un congrès hal-00666613v1
Diversité et biologie intégrative : des pistes à explorer pour combler le gap entre diversité génétique et diversité phénotypique Magali San Cristobal,Simon S. Boitard,Marcel M. Bouffaud,Cécile Canlet,Leonor L. Chaltielet al. COLLOQUE FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-01000087v1
Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parameters Adrian Leip,Marco Follador,Stefano Tarantola,Mirko Busto,Nathalie Villa-Vialaneix Nitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Apr 2011, Edinburgh, United Kingdom. pp.S10 Communication dans un congrès hal-00674167v1
Classification and regression based on derivatives : a consistency result Nathalie Villa-Vialaneix,Fabrice Rossi II Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Dec 2010, Valparaiso, Chile Communication dans un congrès hal-00668212v1
A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leaching Nathalie Villa-Vialaneix,Marco Follador,Adrian Leip Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Jun 2010, Lille, France. pp.57-66 Communication dans un congrès hal-00491583v1
A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration Noslen Hernández,Rolando Biscay,Nathalie Villa-Vialaneix,Isneri Talavera 15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP 2010), Nov 2010, Sao Paulo, Brazil. pp.450-457, ⟨10.1007/978-3-642-16687-7_60⟩ Communication dans un congrès hal-00658811v1
Analysis of the inﬂuence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes. Thibault Laurent,Nathalie Villa-Vialaneix Modèles et l′Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2010, Toulouse, France. pp.Session 1 - 1 Communication dans un congrès hal-00668202v1
Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet transformation Florian Rohart,Nathalie Villa-Vialaneix,Alain Paris,Cécile Canlet,J. Molinaet al. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.3-55 Communication dans un congrès hal-00658819v1
The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pig Laurence Liaubet,Nathalie Villa-Vialaneix,Adrien Gamot,Fabrice Rossi,Pierre Cherelet al. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.0147 Communication dans un congrès hal-00666597v1
Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes Nathalie Villa,Taoufiq Dkaki,Sébastien Gadat,Jean-Michel Inglebert,Quoc-Dinh Truong Veille Stratégique Scientifique & Technologique, Mar 2009, Nancy, France. Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes Communication dans un congrès hal-00371956v1
Topologically Ordered Graph Clustering via Deterministic Annealing Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2009, Bruges, Belgium. pp.529-534 Communication dans un congrès hal-00666602v1
Are gene networks always meaningful ? Adrien Gamot,Nathalie Villa,Laurence Liaubet,F. Rossi,Gwenola Tosser-Kloppet al. EADGENE Genomics for Animal Health: Outlook for the Future, Oct 2009, Paris, France Communication dans un congrès hal-02816128v1
Méthode de classification organisée pour la recherche de communautés dans les réseaux sociaux Nathalie Villa,Fabrice Rossi 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France Communication dans un congrès inria-00386797v1
Are gene networks always meaningful? Adrien Gamot,Nathalie Villa,Laurence Liaubet,Fabrice Rossi,Gwenola Tosser-Kloppet al. European Animal Disease Genomics Network of Excellence for Animal Health and Food Safety (EADGENE Days 2009), Oct 2009, Paris, France Communication dans un congrès hal-00668239v1
Mining a medieval social network by kernel SOM and related methods Nathalie Villa,Fabrice Rossi,Quoc-Dinh Truong MASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Jun 2008, Créteil, France Communication dans un congrès hal-00278196v1
Consistency of Derivative Based Functional Classifiers on Sampled Data Fabrice Rossi,Nathalie Villa-Vialaneix ESANN 2008, 16th European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2008, Bruges, Belgium. pp.445-450 Communication dans un congrès hal-00666609v1
A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graph Nathalie Villa-Vialaneix,Fabrice Rossi WSOM'07 - Workshop on Self-Organizing Maps, Sep 2007, Bielefeld, Germany. pp.WeP-1 Communication dans un congrès hal-00674189v1
Sur l'analyse de réseaux de sociabilité de la société paysanne médiévale Romain Boulet,Florent Hautefeuille,Bertrand Jouve,Pascale Kuntz,Bleuenn Le Gofficet al. Computational Methods for Modelling and learning in Social and Human Sciences (MASHS), May 2007, Brest, France. pp.3b-3 Communication dans un congrès hal-00674238v1
Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measure Nathalie Villa,Romain Boulet European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2007, Bruges, Belgium. pp.31-36 Communication dans un congrès hal-00145117v1
SVM fonctionnels par interpolation spline Nathalie Villa,Fabrice Rossi Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2006, Clamart (FR), France Communication dans un congrès hal-04176653v1
Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, Guatemala Roberto Bruno,Marco Follador,Martin Paegelow,Fernanda Renno,Nathalie Villa IAMG'2006 Annual Conference on Quantitative Geology from Multiple Sources, Sep 2006, Liège, Belgium. pp.Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Pe Communication dans un congrès hal-00372648v1
Support Vector Machine For Functional Data Classification Nathalie Villa,Fabrice Rossi XIIIth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2005), Apr 2005, Bruges, Belgium. pp.467-472 Communication dans un congrès hal-04176766v1
Classification in Hilbert Spaces with Support Vector Machines Fabrice Rossi,Nathalie Villa XIth International Symposium on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA 2005), May 2005, Brest, France. pp.635-642 Communication dans un congrès hal-04176760v1

Poster de conférence (34)

A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data Élise Jorge,Sylvain Foissac,Pierre Neuvial,Matthias Zytnicki,Nathalie Vialaneix ISMB/ECCB, Jul 2025, Liverpool, United Kingdom Poster de conférence hal-05185342v1
The Genotoul-Bioinfo platform Florent Blaise,Philippe Bordron,Patrice Dehais,Vincent Dominguez,Christine Gaspinet al. JOBIM2025, Jul 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05163782v1
P13-31 Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment Arnaud Tête,L. Arnaud,H. Le Mentec,N. Poupin,I. Gallaiset al. 58th Congress of the European Societies of Toxicology (EUROTOX 2024), Sep 2024, Copenhague, Denmark. 399, pp.S222-S223, 2024, ⟨10.1016/j.toxlet.2024.07.547⟩ Poster de conférence hal-04690388v1
Neonatal metabolic profiling shows relationships between metabolites and biometric phenotypes related to piglet maturity at birth Laurence Liaubet,Gaëlle Lefort,Yvon Billon,Sébastien Reigner,Jean Baillyet al. 11. International Conference on Pig Reproduction (ICPR), Jun 2023, Ghent, Belgium. 90 (7), p. 732, n°49, 2023 Poster de conférence hal-04121651v1
Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part2 - sow endometrium Agnès Bonnet,Sarah Maman,Laure Gress,Amandine Suin,Sabrina Legoueixet al. Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.21 Poster de conférence hal-04193444v1
1H-NMR metabolomic study of Large White and Meishan pigs in late gestation: part 2 - sow endometrium Alyssa Imbert,Nassim Duprat,Nathalie Marty-Gasset,Laure Gress,Cécile Canletet al. Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.22 Poster de conférence hal-04193451v1
Characterization of the endometrial metabolome in late gestation Alyssa Imbert,Nathalie Marty-Gasset,Laure Gress,Cecile Bonnefont,Nathalie Vialaneixet al. International Conference on Pig Reproduction 2023, Jun 2023, Ghent, Belgium Poster de conférence hal-04126140v1
Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part1fetal placenta Agnès Bonnet,Sarah Maman,Laure Gress,Amandine Suin,Céline Bravoet al. Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.20 Poster de conférence hal-04193423v1
Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment Arnaud Tête,Liana C. Arnaud,Hélène Le Mentec,Isabelle Gallais,Nathalie Poupinet al. Society of Toxicology Annual Meeting (SOT 2022), Mar 2022, San Diego, United States. , 3579, pp.P204 Poster de conférence hal-03637792v1
Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis Léa Grima,Celine Brouard,Simon De Givry,Anne Goelzer,Élise Maignéet al. Journée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France. Poster de conférence hal-03882985v1
ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné,Céline Noirot,Jérôme J. Mariette,Yaa Adu Kesewaah,Sébastien Dejeanet al. ECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩ Poster de conférence hal-03890660v1
Identification par une approche de métabolomique des voies métaboliques associées à la fragilité dans une cohorte de personnes âgées Céline Bougel,Rémi Servien,Nathalie Vialaneix,Cécile Canlet,Laurent Debrauweret al. Journées Francophones de Nutrition (JFN 2022), Nov 2022, Toulouse, France Poster de conférence hal-03856941v1
ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data Élise Maigné,Céline Noirot,Jérôme J. Mariette,Yaa Adu Kesewaah,Sébastien Dejeanet al. Journée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France Poster de conférence hal-03882998v1
Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment Arnaud Tête,Liana C. Arnaud,Hélène Le Mentec,Isabelle Gallais,Noémie Tournadreet al. Congrès Annuel de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, Jul 2021, Paris, France Poster de conférence hal-03279912v1
Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide Gaëlle Lefort,Nathalie Vialaneix,Hélène Quesnel,Marie-Christine Pere,Yvon Billonet al. 52. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2020, Paris, France. IFIP - Institut du Porc, Journées de la Recherche Porcine en France, pp.411-412, 2020, 52èmes journées de la recherche porcine Poster de conférence hal-02479994v1
Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Nathalie Marty-Gasset,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneixet al. Metabolomics 2020, Oct 2020, Online, France Poster de conférence hal-02984360v1
ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Hélène Quesnel,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneixet al. 15th Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019 Poster de conférence hal-02790207v1
ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneix,Rémi Servien Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France. 2019 Poster de conférence hal-02788670v1
Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics Christophe Ambroise,Alia Dehman,Pierre Neuvial,Guillem Rigaill,Nathalie Vialaneix Statistical Methods for Post-Genomic Data (SMPGD), Jan 2019, Barcelona, Spain. 2019 Poster de conférence hal-02790995v1
ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Hélène Quesnel,Nathalie Vialaneixet al. useR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. , 2019 Poster de conférence hal-02788659v1
Study of fetal pig maturity in relation with neonatal survival using a multi-fluids metabolomic approach Gaëlle Lefort,Nathalie Vialaneix,Hélène Quesnel,Marie-Christine Pere,Nathalie Iannuccelliet al. 15. Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019 Poster de conférence hal-02791588v1
Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes Nathanaël Randriamihamison,Pierre Neuvial,Nathalie Vialaneix Conférence sur l'Apprentissage Automatique (CAp 2019), Jul 2019, Toulouse, France. , 2019 Poster de conférence hal-02786174v1
Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomes Camille Mestre,Sarah Djebali Quelen,Thomas Faraut,Nathalie Vialaneix,Andrea Rauet al. European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018 Poster de conférence hal-02784857v1
Developpement de biomarqueurs sanguins pour évaluer la sensibilité des porcs à la chaleur Samir Dou,Nathalie Villa-Vialaneix,Laurence Liaubet,Hélène Gilbert,Jean-Luc Gourdineet al. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés Poster de conférence hal-02736216v1
ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra Gaëlle Lefort,Laurence Liaubet,Cécile Canlet,Nathalie Vialaneix,Rémi Servien European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018 Poster de conférence hal-02789726v1
Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle Maria Marti-Marimon,Hervé Acloque,Matthias Zytnicki,Sarah Djebali Quelen,Nathalie Villa-Vialaneixet al. 36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book Poster de conférence hal-01608046v1
Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions Sarah Djebali Quelen,Kylie Munyard,Nathalie Villa-Vialaneix,Cédric Cabau,Andrea Rauet al. 36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book Poster de conférence hal-01603033v1
Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project] Sylvain Foissac,Sarah Djebali Quelen,Hervé Acloque,Philippe Bardou,Fany Blancet al. 36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book Poster de conférence hal-01608449v1
Reprise de cyclicité post partum et performances de reproduction chez la vache laitière Prim'Holstein en France Claire Saby,Wenting Zhang,René Fournier,Rémi Servien,Nathalie Villa-Vialaneixet al. Journées Nationales des GTV 2017, May 2017, Reims, France. , 7 p., 2017, Recueil des Journées Nationales des GTV 2017 Poster de conférence hal-01607513v1
Estimating nitrous oxide fluxes from agricultural soils at European scale using a crop generic meta-model Lily Paniagua,Adrian Leip,Nathalie N. Villa-Vialaneix,Wim de Vries 19th Nitrogen Workshop, Jun 2016, Skara, Sweden. , 2016 Poster de conférence hal-02796798v1
Multiway SIR for biological data integration Valérie Sautron,Marie Chavent,Nathalie Viguerie,Nathalie N. Villa-Vialaneix Statistical Methods for Post Genomic Data, Feb 2016, Lille, France. , 2016 Poster de conférence hal-02791870v1
3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells Yvette Lahbib Mansais,Maria Marti-Marimon,Valentin Voillet,Harmonie Barasc,Florence Mompartet al. Conference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016 Poster de conférence hal-02794242v1
Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study Valérie Sautron,Elena Mormede Terenina,Laure Gress,Yannick Lippi,Yvon Billonet al. 35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, 94 (S4), 2016, 35th Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG) Poster de conférence hal-02740976v1
Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed Victor Picheny,Jimmy Vandel,Matthieu Vignes,Nathalie N. Villa-Vialaneix 17th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AI & Statistics 2014, Apr 2014, Reykjavik, Iceland. , pp.1, 2014, AISTATS 2014 Talks and Papers Poster de conférence hal-02739296v1

Chapitre d'ouvrage (10)

Comprendre l'organisation spatiale de l'ADN à l'aide de la statistique Pierre Neuvial,Sylvain Foissac,Nathalie Vialaneix Martina Knoop, Stéphane Blanc, Mokrane Bouzeghoub. L’Interdisciplinarité, CNRS Editions, pp.178-182, 2023 Chapitre d'ouvrage hal-03930070v1
Des noyaux pour les omiques Jérôme J. Mariette,Nathalie Vialaneix Intégration de Données Biologiques, 2022 Chapitre d'ouvrage hal-03809784v1
Kernel and dissimilarity methods for exploratory analysis in a social context Jérôme J. Mariette,Madalina Olteanu,Nathalie Vialaneix Advances in Contemporary Statistics and Econometrics. Festschrift in Honor of Christine Thomas-Agnan, 2021 Chapitre d'ouvrage hal-03279887v1
Apprentissage connexionniste Nathalie Villa-Vialaneix,Stéphane Canu Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824 Chapitre d'ouvrage hal-01849298v1
Large-Scale Measurement of mRNA Degradation in Escherichia coli: To Delay or Not to Delay Sandrine Laguerre,Ignacio González,Sébastien Nouaille,Annick Moisan,Nathalie Villa-Vialaneixet al. High-density sequencing applications in microbial molecular genetics, 612, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.47-66, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.07.003⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02107623v1
Méthodes pour l’apprentissage de données massives Nathalie Villa-Vialaneix,Fabrice Rossi Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824 Chapitre d'ouvrage hal-01849297v1
Depicting gene co-expression networks underlying eQTLs Nathalie Vialaneix,Laurence Liaubet,Magali San Cristobal Haja N. Kadarmideen. Systems Biology in Animal Production and Health vol 2, 2, Springer International Publishing, pp.1-31, 2016, 978-3-319-43330-1. ⟨10.1007/978-3-319-43332-5_1⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01390589v1
Recent advances in the use of SVM for functional data classification Fabrice Rossi,Nathalie Villa Sophie Dabo-Niang, Frédéric Ferraty. Functional and operatorial statistics, Physica-Verlag/Springer, pp.273-280, 2008, Contrib. Statist., ⟨10.1007/978-3-7908-2062-1_41⟩ Chapitre d'ouvrage istex hal-00635480v1
Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala. Marco Follador,Nathalie Villa,Martin Paegelow,Fernanda Renno,Roberto Bruno Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.77-108, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_3⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00667122v1
Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changes Martin Paegelow,Maria T. Camacho Olmedo,Frédéric Ferraty,Louis Ferré,Pascal Sardaet al. Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.141-168, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_5⟩ Chapitre d'ouvrage hal-00667123v1

Autre publication scientifique (3)

Note de lecture : &quot; Régression avec R &quot; (P.-A. Cornillon et E. Matzner-Løber, 2011) Nathalie Villa-Vialaneix 2013, pp.87-89 Autre publication scientifique hal-00942821v1
Éditorial du numéro spécial RNTI - MASHS 2011/2012 : Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales Marie Cottrell,Madalina Olteanu,Juliette Rouchier,Nathalie Villa-Vialaneix 2013 Autre publication scientifique hal-00761082v1
Note de lecture : &quot; Méthodes de Monte-Carlo avec R &quot; (Chr. P. Robert et G. Casella, 2011) Nathalie Villa-Vialaneix 2012, pp.113-114 Autre publication scientifique hal-00721409v1

Pré-publication, Document de travail (2)

Livestock genome annotation: transcriptome and chromatin structure profiling in cattle, goat, chicken and pig Sylvain Foissac,Sarah Djebali,Kylie Munyard,Nathalie Vialaneix,Andrea Rauet al. 2018 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02791029v1
Statistique et Big Data Analytics; Volumétrie, L'Attaque des Clones Philippe Besse,Nathalie Vialaneix 2014 Pré-publication, Document de travail hal-00995801v3

Rapport (3)

Plan de gestion des données CO-LOcATION Version Finale Laure Gress,Sarah Maman-Haddad,Nathalie Marty-Gasset,Nathalie Vialaneix,Agnès Bonnet INRAE - UMR GenPhySE. 2025 Rapport (plan de gestion de données/data management plan) hal-05009536v1
Note de consultation : ``Analyse des données multidimensionnelles'' (MOOC, F. Husson et al., 2015) Nathalie N. Villa-Vialaneix [0] 2015, pp.6 Rapport hal-02793538v1
Adaptation to heat in pig production : the genetic pathway Jean-Luc Gourdine,Hélène Gilbert,Juliette Riquet,David Renaudeau,Jean Pierre Bidanelet al. [Contract] ANR-12-ADAP-0015, INRA. 2012, pp.43 Rapport (rapport contrat/projet) hal-01193706v1

HDR (2)

Contributions à l’analyse de données non vectorielles Nathalie Villa-Vialaneix Applications [stat.AP]. Université Toulouse 1 Capitole (UT1 Capitole), 2014 HDR tel-01523743v1
Contributions à l'analyse de données non vectorielles Nathalie Villa-Vialaneix Statistiques [math.ST]. Université de Toulouse, 2014 HDR tel-01088152v1

Logiciel (9)

SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs Nathalie Vialaneix,Elise Maigne,Jerome Mariette,Madalina Olteanu,Fabrice Rossi 2025, ⟨swh:1:dir:2c4ce9bae19759371e679016f079da846add3fa6⟩ Logiciel hal-04860539v1
NMFProfiler Aurélie Mercadié,Eric Casellas,Eléonore Gravier,Gwendal Josse,Nathalie Vialaneixet al. 2024, ⟨swh:1:dir:c0d51e57654a925b2a813c4e573c77370d1c2d16⟩ Logiciel hal-04683370v1
ASTERICS Elise Maigné,Céline Noirot,Julien Henry,Yaa Adu Kesewaah,Ludovic Badinet al. 2022, ⟨swh:1:dir:313f6ac758c7daab63c6b81a0fe5717de3da7b08;origin=https://forgemia.inra.fr/asterics/asterics;visit=swh:1:snp:241132a0f4b9dc0a22a1f6df8ac9be0f7035428b;anchor=swh:1:rev:fce1072b8cc351d499edf7f700351732ce81a29d⟩ Logiciel hal-04095877v1
RNAseqNet: Log-Linear Poisson Graphical Model with Hot-Deck Multiple Imputation (R package, available on CRAN) Nathalie Vialaneix,Alyssa Imbert 2018 Logiciel hal-02788053v1
ASICS: Automatic Statistical Identification in Complex Spectra (R package, available on Bioconductor) Gaëlle Lefort,Rémi Servien,Patrick Tardivel,Nathalie Vialaneix 2017 Logiciel hal-02790128v1
mixKernel: Omics Data Integration Using Kernel Methods Jérôme J. Mariette,Nathalie Vialaneix 2017 Logiciel hal-02791779v1
adjclust: Adjacency-Constrained Clustering of a Block-Diagonal Similarity Matrix (R package, available on CRAN) Pierre Neuvial,Christophe Ambroise,Shubham Chaturvedi,Alia Dehman,Michel Koskaset al. 2017 Logiciel hal-02791370v1
SISIR: Sparse Interval Sliced Inverse Regression (R package, available on CRAN) Nathalie Vialaneix,Victor Picheny,Rémi Servien 2016 Logiciel hal-02794207v1
SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs (R package, available on CRAN) Nathalie Vialaneix,Jérôme J. Mariette,Madalina Olteanu,Fabrice Rossi,Laura Bendhaibaet al. 2015 Logiciel hal-02794474v1