Nils Paulhe

Publications

Article dans une revue (7)

FragHub: A Mass Spectral Library Data Integration Workflow Axel Dablanc,Solweig Hennechart,Amélie Perez,Guillaume Cabanac,Yann Guittonet al. Analytical Chemistry, 2024, 96 (30), pp.12489-12496. ⟨10.1021/acs.analchem.4c02219⟩ Article dans une revue hal-04721713v1
Challenges and perspectives for naming lipids in the context of lipidomics Michael Witting,Adnan Malik,Andrew Leach,Alan Bridge,Lucila Aimoet al. Metabolomics, 2024, 20 (1), pp.15. ⟨10.1007/s11306-023-02075-x⟩ Article dans une revue hal-04596970v1
Suggesting disease associations for overlooked metabolites using literature from metabolic neighbors Maxime Delmas,Olivier Filangi,Christophe Duperier,Nils Paulhe,Florence Vinsonet al. GigaScience, 2023, 12, pp.giad065. ⟨10.1093/gigascience/giad065⟩ Article dans une revue hal-04223426v1
PeakForest: a multi-platform digital infrastructure for interoperable metabolite spectral data and metadata management Nils Paulhe,Cécile Canlet,Annelaure Damont,Lindsay Peyriga,Stéphanie Durandet al. Metabolomics, 2022, 18 (6), pp.40. ⟨10.1007/s11306-022-01899-3⟩ Article dans une revue hal-03695453v1
FORUM: building a Knowledge Graph from public databases and scientific literature to extract associations between chemicals and diseases Maxime Delmas,Olivier Filangi,Nils Paulhe,Florence Vinson,Christophe Duperieret al. Bioinformatics, 2021, 37 (21), pp.3896-3904. ⟨10.1093/bioinformatics/btab627⟩ Article dans une revue hal-03361495v2
A computational solution to automatically map metabolite libraries in the context of genome scale metabolic networks Benjamin Merlet,Nils Paulhe,Florence Vinson,Clément Frainay,Maxime Chazalvielet al. Frontiers in Molecular Biosciences, 2016, 3, ⟨10.3389/fmolb.2016.00002⟩ Article dans une revue hal-02631089v1
Metavir: a web server dedicated to virome analysis. Simon Roux,Michaël Faubladier,Antoine Mahul,Nils Paulhe,Aurélien Bernardet al. Bioinformatics, 2011, 27 (21), pp.3074-5. ⟨10.1093/bioinformatics/btr519⟩ Article dans une revue hal-00841495v1

Communication dans un congrès (3)

Phénotypage multidimensionnel : intérêt de l’outil HDeeP Cécile Gladine,Nils Paulhe,Estelle Pujos-Guillot,Claire Sulmont-Rossé,Sophie Layéet al. 6èmes Assises régionales de Nutrition Santé, Oct 2024, Grenoble, France Communication dans un congrès hal-04817167v1
New developments for the database PhytoHub 2.0 on plant food bioactives: Health effects and analytics for metabolomics Mariem Achour,Franck Giacomoni,Letizia Bresciani,Danièle del Rio,Giuseppe Di Pedeet al. 3rd International Conference on ood Bioactives and Health - FBHC2023, Jun 2022, Parma, Italy Communication dans un congrès hal-04793068v1
PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses Nils Paulhe,Pierrick Roger,Marie-Françoise Olivier,Marie Lefebvre,Christophe Duperieret al. 9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France Communication dans un congrès hal-02742965v1

Poster de conférence (12)

FORVM Plants Guillaume Laisney,David Benaben,Thomas Bellembois,Kevin Billet,Alain Bouchereauet al. RFMF 2025 - 17èmes journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2025, Paris, France. pp.1-1, 2025 Poster de conférence hal-05121234v1
Metabolite reporting in large-scale studies within different metabolomics communities: DO WE SPEAK THE SAME LANGUAGE? Ghina Hajjar,David Benaben,Nils Paulhe,Christophe Duperier,Olivier Filangiet al. Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France Poster de conférence hal-03775474v1
Developments and opportunities with Workflow4Metabolomics Lain Pavot,Mélanie Pétéra,Nils Paulhe,Yann Guitton,Gildas Le Corguilléet al. Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France Poster de conférence hal-03781084v1
Optimization of metabolome extraction procedures and implementation of a PeakForest database for the identification of microorganisms compounds by LC-HRMS Wiam Mansouri,Cyril C. Jousse,Marie Lagrée,Nils Paulhe,Binta Diémé Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France Poster de conférence hal-03879175v1
Update on technological developments and opportunities with Workflow4Metabolomics Lain Pavot,Mélanie Pétéra,Nils Paulhe,Yann Guitton,Gildas Le Corguilléet al. Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France. Poster de conférence hal-03776462v1
Untargeted metabolomic approach by GC-QTOF : From low to high resolution Carole Migné,Nils Paulhe,Yann Guitton,Franck Giacomoni,Mélanie Pétéraet al. SMMAP 2017 (Spectrométrie de Masse, Métabolomique et Analyse Protéomique), Oct 2017, Marne-La-Vallée, France. , pp.476, 2017, SMMAP 2017-Livre des résumés Poster de conférence hal-01674479v1
Enrichissement de la base de données spectrale peakforest en LC-MS Sylvain Emery,Bernard Lyan,Charlotte Joly,Nils Paulhe,Franck Giacomoniet al. 10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, May 2016, Montpellier, France. 158 p., 2016, Livret des résumés 10JS RFMF Poster de conférence hal-01594987v1
PeakForest: a spectral database and its toolbox, dedicated to the Metabolomics’ community Nils Paulhe,Christophe Duperier,Marie Lefebvre,Pierrick Roger-Mele,Christophe Junotet al. 12. annual conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, United Kingdom. 2016 Poster de conférence hal-02744357v1
New tools and workflows on W4M, the Galaxy metabolomic infrastructure Marion Landi,Claire Lopez,Marie Tremblay-Franco,Cécile Canlet,Yann Guittonet al. 9e Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. , 2015 Poster de conférence hal-02743697v1
PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses Nils Paulhe,Pierrick Roger,Marie-Françoise Olivier,Marie Lefebvre,Christophe Duperieret al. 9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015 Poster de conférence hal-02742964v1
Vers une annotation RMN 1D et 2D ciblée à partir de matrices de référence Marie Lefebvre,Julie Pinelli,Nils Paulhe,Vanessa Zhendre,Claire Lopezet al. 9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015 Poster de conférence hal-02743576v1
Spectral Database: from data model to web interface Nils Paulhe,Christophe Duperier,Daniel Jacob,Etienne Thévenot,Jean-Francois Martinet al. 8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 2014 Poster de conférence hal-02742064v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Suggesting disease associations for overlooked metabolites using literature from metabolic neighbours M. Delmas,O. Filangi,Christophe Duperier,N. Paulhe,F. Vinsonet al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04188519v1