Olivier Gargominy

Publications

Rapport (20)

Inventaires naturalistes du Domaine national de Chambord incluant un test de recensement des Odonates par ADNe - Sortie de service 2024 Rémy Poncet,Aurélie Lacoeuilhe,Violette Lervy-Mayere,Antoine Lévêque,Julien Touroultet al. PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2025, 28 p Rapport hal-05140351v1
Référentiel des séquences génétiques des espèces de France : note pour la mise en place d'un nouvel outil national Aurélie Lacoeuilhe,Gaël P.J. Denys,Pascal Dupont,Anne-Sophie Archambeau,Bertrand Bed’homet al. PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2025, 25 p. + annexes Rapport hal-04931482v1
Synthèse sur les récoltes de mollusques continentaux dans le cadre commun de La Planète revisitée et de l'ABC de Poum Lilian Léonard,Olivier Gargominy Patrinat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2024, 23 p Rapport (rapport technique) hal-05002776v2
La Planète Revisitée en Corse. Expéditions terrestres 2021 - Côte orientale et &lt;i&gt;Capicorsu&lt;/i&gt; Jean Ichter,François Dusoulier,Jérôme Barbut,Cyril Berquier,Alain Canardet al. Muséum national d'Histoire naturelle. 2022 Rapport mnhn-04143025v1
Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur les genres Tacheocampylaea et Oxychilus Olivier Gargominy,Lilian Léonard,Sandrine Tercerie,Xavier Cucherat,Benoît Fontaineet al. PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 76 p Rapport hal-03953841v1
Enquête de satisfaction sur l'utilisation et les besoins de services associés au référentiel taxonomique national TAXREF Laure Idzack,Olivier Gargominy,Pascal Dupont PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 20 p Rapport mnhn-04133278v1
TAXREF, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Claire Régnier,Thibault Ramage,Pascal Dupontet al. PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 48 p Rapport (rapport technique) mnhn-04148966v1
La Planète Revisitée en Corse. Bilan scientifique des expéditions terrestres 2020 : Agriate, Capicorsu et Saint-Florent Jean Ichter,François Dusoulier,Jérôme Barbut,Alain Canard,Marie Canutet al. Muséum national d'Histoire naturelle; PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2021, 69 p Rapport mnhn-04166355v1
Base de connaissance &quot;Statuts&quot; des espèces en France. Version pour TAXREF v13.0 Olivier Gargominy,Claire Régnier PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020 Rapport mnhn-04254147v1
Guide d'utilisation de CardObs - v4.0 Olivier Gargominy,Claire Jacquet PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, pp.26 Rapport mnhn-04254123v1
TAXREF v14, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Claire Régnier,Thibault Ramage,Pauline Dupontet al. PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, 64 p Rapport mnhn-04254870v1
Base de données pour MALACO-GF, application Android d'aide à l'identification des escargots de Guyane française Olivier Gargominy PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020 Rapport mnhn-04254257v1
BiodiversiClés : Escargots de France métropolitaine (MALACO-FR) Olivier Gargominy PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020 Rapport mnhn-04254168v1
Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde Jean Ichter,Marie-France Leccia,Julien Touroult,Patrick Blandin,Pierre-Henri Aberlencet al. UMS Patrimoine Naturel (AFB-CNRS-MNHN); Inventaire National du Patrimoine Naturel (MNHN); Parc national du Mercantour. 2018, pp.1-61 Rapport mnhn-04271668v1
Diffusion des statuts des espèces : principes et objectifs Claire Régnier,Olivier Gargominy PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, 8 p Rapport mnhn-04276794v1
Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur le genre Tacheocampylaea Olivier Gargominy,Lilian Léonard,Sandrine Tercerie,Xavier Cucherat,Dario Zuccon PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, 55 p Rapport mnhn-04271593v1
Base de données des espèces protégées et réglementées en France. Version pour TAXREF v11.0 Olivier Gargominy,Claire Régnier PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017 Rapport mnhn-04287234v1
TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France. Partie 5 : Sources Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Claire Régnier,Thibault Ramage,Pascal Dupontet al. PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, pp.59-151 Rapport mnhn-04282269v1
TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Claire Régnier,Thibault Ramage,Pascal Dupontet al. PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, 60 p Rapport mnhn-04282282v1
Santo 2006 Progress Report Josep Antoni Alcover Tomas,Anne Bedos,Philippe Bouchet,Geoff Boxshall,Florence Brunoiset al. [0] MNHN. 2007 Rapport hal-02823400v1

Article dans une revue (25)

New species and new records of families, genera and species of land snails (Mollusca, Gastropoda) from French Guiana Olivier Gargominy,Benoît Fontaine,Sandrine Tercerie,Dario Zuccon Zookeys, 2025, 1230, pp.155-194. ⟨10.3897/zookeys.1230.133585⟩ Article dans une revue mnhn-04981139v1
BeeFunc, a comprehensive trait database for French bees Lucas Aubouin,David Genoud,Bérénice Givord-Coupeau,Sandrine Tercerie,Olivier Gargominyet al. Scientific Data , 2025, 12 (1), pp.1302. ⟨10.1038/s41597-025-05626-0⟩ Article dans une revue hal-05233153v1
In the Shadow of Medicine: The Glaring Absence of Occurrence Records of Human-Hosted Biodiversity Rémy Poncet,Olivier Gargominy Online Journal of Public Health Informatics, 2024, 16, pp.e60140. ⟨10.2196/60140⟩ Article dans une revue hal-04837272v1
Systématique, taxonomie, nomenclature, TAXREF et SINP : tour d’horizon des concepts, normes, référentiels et standards qui fondent le langage commun utilisé par les scientifiques et les naturalistes en France et à l’international Rémy Poncet,Océane Fogliani,Sandrine Tercerie,Noëlie Maurel,Solène Robertet al. Bulletin de l'Association française de Lichénologie, 2024, 42 (2), pp.197-208 Article dans une revue hal-04837252v1
Knowledge Base on Species Life Traits : A Spanish/French Plinian Core implementation use case Sophie Pamerlon,Anne-Sophie Archambeau,Francisco Pando de la Hoz,Olivier Gargominy,Franck Michelet al. Biodiversity Information Science and Standards, 2023, 7, pp.e111784. ⟨10.3897/biss.7.111784⟩ Article dans une revue hal-04198414v1
Pre-assessments of plant conservation status in islands: the case of French Overseas Territories Simon Véron,Arthur Bernard,Élise Lebreton,Carlos Rodrigues-Vaz,M Durandet al. Biodiversity and Conservation, 2023, 32 (4), pp.1165-1187. ⟨10.1007/s10531-023-02544-8⟩ Article dans une revue mnhn-03952485v1
Conservation assessment based on large-scale monitoring of eDNA: Application to freshwater mussels Vincent Prié,Alain Danet,Alice Valentini,Manuel Lopes-Lima,Pierre Taberletet al. Biological Conservation, 2023, 283, pp.110089. ⟨10.1016/j.biocon.2023.110089⟩ Article dans une revue hal-04894456v1
The first large-scale All Taxa Biodiversity Inventory in Europe: description of the Mercantour National Park ATBI datasets Jean Ichter,Olivier Gargominy,Marie-France Leccia,Solène Robert,Laurent Poncet Biodiversity Data Journal, 2022, 10, pp.e85901. ⟨10.3897/bdj.10.e85901⟩ Article dans une revue (data paper) hal-04133216v1
Les mollusques continentaux de Saül (Guyane). Bilan des missions 2018-2020 de l'Atlas de la biodiversité communale Olivier Gargominy,Benoît Fontaine,Sandrine Tercerie,Ahmed Abdou,Sébastien Sant Les Cahiers scientifiques du parc amazonien de Guyane, 2022, 7 (2), pp.83-99 Article dans une revue mnhn-03987857v1
An assessment of the endemic spermatophytes, pteridophytes and bryophytes of the French Overseas Territories: towards a better conservation outlook Simon Véron,Carlos Rodrigues-Vaz,Elise Lebreton,Claudine Ah-Peng,Vincent Boulletet al. Biodiversity and Conservation, 2021, 30 (7), pp.2097-2124. ⟨10.1007/s10531-021-02186-8⟩ Article dans une revue mnhn-03217441v1
Discovery of the only living population of Pupoidopsis hawaiensis (Gastropoda: Pupillidae) in the last 50 years Olivier Gargominy,Jean-François Butaud,Benoît Fontaine,Vincent Prié,Dario Zucconet al. American malacological Bulletin, 2020, 38 (1), pp.50. ⟨10.4003/006.038.0103⟩ Article dans une revue mnhn-03084456v1
Integration of Web APIs and Linked Data Using SPARQL Micro-Services - Application to Biodiversity Use Cases Franck Michel,Catherine Faron Zucker,Olivier Gargominy,Fabien Gandon Information, 2018, Special Issue "Semantics for Big Data Integration", 9 (12), ⟨10.3390/info9120310⟩ Article dans une revue hal-01947589v1
Breathing device of a new Streptaulus species from Vietnam extends understanding of the function and structure of respiratory tubes in cyclophoroids (Gastropoda: Caenogastropoda: Pupinidae) Barna Páll-Gergely,Olivier Gargominy,Benoît Fontaine,Takahiro Asami Journal of Molluscan Studies, 2017, 83 (2), pp.243-248. ⟨10.1093/mollus/eyx006⟩ Article dans une revue hal-03864281v1
De l'utilité d'un inventaire national Olivier Gargominy,Lilian Léonard,Vincent Prié,Xavier Cucherat MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2016, Actes du colloque national de malacologie continentale du 30 et 31 mars 2016 à Barenton-Bugny (Aisne) (12), pp.67-87 Article dans une revue mnhn-04431542v1
PESI - a taxonomic backbone for Europe Yde de Jong,Juliana Kouwenberg,Louis Boumans,Charles Hussey,Roger Hyamet al. Biodiversity Data Journal, 2015, 3, pp.e5848. ⟨10.3897/BDJ.3.e5848⟩ Article dans une revue hal-02060422v1
Biogeographic comparisons of herbivore attack, growth and impact of Japanese knotweed between Japan and France Noëlie Maurel,Maasaki Fujiyoshi,Audrey Muratet,Emmanuelle Porcher,Eric Motardet al. Journal of Ecology, 2013, 101 (1), pp.118-127. ⟨10.1111/1365-2745.12026⟩ Article dans une revue mnhn-02265411v1
New Species in the Old World: Europe as a Frontier in Biodiversity Exploration, a Test Bed for 21st Century Taxonomy Benoît Fontaine,Kees van Achterberg,Miguel Angel Alonso-Zarazaga,Rafael Araujo,Manfred Ascheet al. PLoS ONE, 2012, 7 (5), pp.e36881. ⟨10.1371/journal.pone.0036881⟩ Article dans une revue hal-04178075v1
National Inventory of Natural Heritage website: recent, historical and archaeological data Cécile Callou,Isabelle Baly,Olivier Gargominy,Elodie Rieb SAA Archaeological Record, 2011, 11 (1), pp.37-40 Article dans une revue mnhn-02103401v1
Foot mucus stored on FTA cards is a reliable and non-invasive source of DNA for genetics studies in molluscs. Claire Régnier,Olivier Gargominy,G. Falkner,Nicolas Puillandre Conservation Genetics Resources, 2011, 3(2), pp.377-382 Article dans une revue hal-00575851v1
Les noms scientifiques français des mollusques continentaux de France: processus d'établissement d'une liste de référence Benoît Fontaine,Jean-Michel Bichain,Xavier Cucherat,Olivier Gargominy,Vincent Prie Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 2010, 65 (4), pp.293-317 Article dans une revue hal-03530343v1
Quatre espèces nouvelles d'Endodontidae (Mollusca, Pulmonata) éteints de Rurutu (Îles Australes, Polynésie française) Gabrielle Zimmermann,Olivier Gargominy,Benoît Fontaine Zoosystema, 2009, 31 (4), pp.791-805 Article dans une revue hal-00455821v1
Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae) fait bien partie de la faune de France Occurrence in France confirmed for Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae) Olivier Gargominy,Theo E.J. Ripken,Alexis Matamoro-Vidal,Daniel Reboul MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2008 Article dans une revue hal-03925457v1
In memoriam - L'escargot de Corse, Helix ceratina Olivier Gargominy,Benoît Fontaine Le Courrier de l'environnement de l'INRA, 1999, 36 (36) Article dans une revue hal-01212998v1
Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie Olivier Gargominy,Philippe Bouchet,Michel Pascal,Tanguy Jaffré,Jean-Christophe Tourneur Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 1996, 51 (4), pp.375-402 Article dans une revue hal-03191921v1
Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie Olivier Gargominy,Philippe Bouchet,Michel Pascal,Tanguy Jaffre,Jean-Christophe Tourneur Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 1996, 51 (4), pp.375-402 Article dans une revue hal-03528969v1

Proceedings/Recueil des communications (1)

Actes du séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI) Jean Ichter,Henri-Pierre Aberlenc,Vincent Augé,Richard Bonet,Damien Combrissonet al. Séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI), PatriNat (OFB/MNHN) / Parc national des Écrins, 2024 Proceedings/Recueil des communications hal-04607210v2

Communication dans un congrès (10)

Des données aux résultats d’évaluation, retour sur la première Liste rouge des mollusques continentaux de France métropolitaine Guillaume Gigot,Olivier Gargominy 3ème Colloque national de malacologie continentale, Conservatoire botanique national de Franche-Comté – Observatoire régional des Invertébrés (CBNFC-ORI); PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Oct 2023, Besançon (Doubs), France Communication dans un congrès mnhn-05023480v1
Biodiversity Knowledge Graphs: Time to move up a gear! Franck Michel,Antonia Ettorre,Catherine Faron,Julien Kaplan,Olivier Gargominy TDWG 2021 annual virtual conference, Oct 2021, Virtual, France. pp.e73699, ⟨10.3897/biss.5.73699⟩ Communication dans un congrès hal-03373536v1
Unleash the Potential of your Website! 180,000 webpages from the French Natural History Museum marked up with Bioschemas/Schema.org biodiversity types Franck Michel,Olivier Gargominy,Benjamin Ledentec,Bioschemas Community TDWG 2020 annual conference, Oct 2020, Virtual, France. ⟨10.3897/biss.4.59046⟩ Communication dans un congrès hal-02976710v1
Assisting Biologists in Editing Taxonomic Information by Confronting Multiple Data Sources using Linked Data Standards Franck Michel,Sandrine Tercerie,Antonia Ettorre,Olivier Gargominy,Catherine Faron Zucker Biodiversity Next, Oct 2019, Leiden, Netherlands. ⟨10.3897/biss.3.37421⟩ Communication dans un congrès hal-02168164v1
Modelling Biodiversity Linked Data: Pragmatism May Narrow Future Opportunities Franck Michel,Catherine Faron Zucker,Sandrine Tercerie,Olivier Gargominy SPNHC+TDWG 2018 Conference, Aug 2018, Dunedin, New Zealand. ⟨10.3897/biss.2.26235⟩ Communication dans un congrès hal-01856363v1
Construction du référentiel taxonomique commun TAXREF, socle pour la connaissance et l'échange de données Olivier Gargominy,Franck Michel,Sandrine Tercerie Séminaire Interopérabilité des systèmes d'information sur l'eau (INSIDE 2017), Mar 2017, Paris, France Communication dans un congrès hal-01585294v1
A Model to Represent Nomenclatural and Taxonomic Information as Linked Data. Application to the French Taxonomic Register, TAXREF Franck Michel,Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Catherine Faron Zucker ISWC 2017 Workshop on Semantics for Biodiversity (S4Biodiv 2017), Oct 2017, Vienna, Austria. pp.1-12 Communication dans un congrès hal-01617708v1
TAXREF-LD: A Reference Thesaurus for Biodiversity on the Web of Linked Data Franck Michel,Catherine Faron Zucker,Sandrine Tercerie,Olivier Gargominy Biodiversity Information Standards (TDWG), Oct 2017, Ottawa, Canada. ⟨10.3897/tdwgproceedings.1.20232⟩ Communication dans un congrès hal-01612451v1
Projet de Liste rouge nationale des mollusques continentaux de France métropolitaine : état des lieux des données disponibles et mise en œuvre Claire Régnier,Olivier Gargominy,Guillaume Gigot Colloque national de malacologie continentale, ADREE - Association pour le Développement de la Recherche et de l'Enseignement sur l'Environnement; Service du Patrimoine Naturel (MNHN); Naturagora, Mar 2016, Barenton-Bugny, France Communication dans un congrès mnhn-05023906v1
Construction d’un référentiel taxonomique commun pour des études sur l’histoire de la zoologie, l’archéozoologie et la biologie Franck Michel,Cécile Callou,Catherine Faron Zucker,Olivier Gargominy,Chloé Martinet al. SemWeb.Pro 2016, Nov 2016, Paris, France Communication dans un congrès hal-01401357v1

Ouvrages (1)

À la rencontre des Mollusques (2023) Victor Robin-Havret,Florian Barnier,Sarah Figuet,Olivier Gargominy,Lilian Léonardet al. PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Paris. pp.16, 2023, La biodiversité en France Ouvrages (manuel) mnhn-04225071v1

Autre publication scientifique (1)

TAXREF v15.0, référentiel taxonomique pour la France Olivier Gargominy,Sandrine Tercerie,Claire Régnier,Pascal Dupont,Piotr Daszkiewiczet al. 2021 Autre publication scientifique mnhn-04165050v1

N°spécial de revue/special issue (1)

Actes du colloque national de malacologie continentale du 30 et 31 mars 2016 à Barenton-Bugny (Aisne) Jérome Canivé,Xavier Cucherat,Benoît Fontaine,Olivier Gargominy,Lilian Léonardet al. MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 12, 113 p., 2016 N°spécial de revue/special issue mnhn-04431467v1