Olivier Lepais Chargé de recherche

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olivier-lepais

ORCID :

0000-0002-6102-9478

IdRef :

129616028

Présentation

Publications

Article dans une revue (53)

Genetic diversity of aquatic macrophytes in Aquitaine lakes Debailleul Estelle-Marie,Jamoneau Aurélien,Lepais Olivier Conservation Genetics, 2026, 27 (1), pp.20. ⟨10.1007/s10592-025-01746-7⟩ Article dans une revue hal-05508554v1
Evidences that host genetic background more than the environment shapes the microbiota of the snail Bulinus truncatus , an intermediate host of Schistosoma species Mathilde J Jaquet,Philippe Douchet,Eve Toulza,Thierry Lefevre,Bruno Senghoret al. Molecular Ecology, 2026, 35 (6), pp.e70318. ⟨10.1111/mec.70318⟩ Article dans une revue hal-04879778v1
High-throughput sequence-based microsatellite genotyping for the non-model Neotropical tree species Anadenanthera colubrina (Leguminosae) Alejandra Lorena Goncalves,María Victoria García,Emilie Chancerel,Olivier Lepais,Myriam Heuertz Plant Ecology and Evolution, 2025, 158 (1), pp.43 - 52. ⟨10.5091/plecevo.138834⟩ Article dans une revue hal-05006488v1
Correction: Tracking repeat spawning anadromous fish migrations over multiple years in a fragmented river suggests philopatry and sex‑linked variation in space use Peter Davies,J. Robert Britton,Demetra Andreou,Charles Crundwell,Jamie R Doddet al. Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2025, 87 (2), pp.51. ⟨10.1007/s00027-025-01176-0⟩ Article dans une revue hal-04997981v1
Counting the Invisible: New Tools to Estimate the Number of Contributors From Sequence‐Based Microsatellite Genotyping of Environmental DNA Samples Olivier Lepais,Ivan Paz‐vinas Molecular Ecology Resources, 2025, ⟨10.1111/1755-0998.70051⟩ Article dans une revue hal-05300732v1
Restricted Dispersal in the Late Successional Forest Tree Species &lt;i&gt;Nothofagus Pumilio&lt;/i&gt;: Consequences Under Global Change C. Soliani,J. Sekely,C Zamora‐ballesteros,K. Heer,Olivier Lepaiset al. Ecology and Evolution, 2025, 15 (5), ⟨10.1002/ece3.71002⟩ Article dans une revue hal-05168694v1
Low-frequency somatic mutations are heritable in tropical trees Dicorynia guianensis and Sextonia rubra Sylvain Schmitt,Patrick Heuret,Valérie Troispoux,Mélanie Beraud,Jocelyn Cazalet al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024, 121, ⟨10.1073/pnas.2313312121⟩ Article dans une revue hal-04481461v1
Offspring sex ratio increases with paternal reproductive success in a colony of southern elephant seals Hassen Allegue,Christophe Guinet,Samantha C Patrick,Cécile Ribout,Coraline Bichetet al. Marine Mammal Science, 2024, 40 (3), ⟨10.1111/mms.13108⟩ Article dans une revue hal-04640059v1
Tracking repeat spawning anadromous fish migrations over multiple years in a fragmented river suggests philopatry and sex-linked variation in space use Peter Davies,J. Robert Britton,Demetra Andreou,Charles Crundwell,Jamie Doddet al. Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2024, 86 (2), pp.34. ⟨10.1007/s00027-024-01048-z⟩ Article dans une revue hal-04640042v1
Genetic diversity and population structure of Botryosphaeria dothidea and Neofusicoccum parvum on English walnut (Juglans regia L.) in France Marie Belair,Adeline Picot,Olivier Lepais,Cyrielle Masson,Marie-Neige Hébrardet al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.19817. ⟨10.1038/s41598-024-67613-6⟩ Article dans une revue hal-04841244v1
Development and characterization of microsatellite markers for the French endemic Angelica heterocarpa (Apiaceae) and congeneric sympatric species Emmanuelle Revardel,Olivier Lepais BMC Research Notes, 2022, 15 (1), pp.15. ⟨10.1186/s13104-021-05903-2⟩ Article dans une revue hal-04028545v1
Joint analysis of microsatellites and flanking sequences enlightens complex demographic history of interspecific gene flow and vicariance in rear-edge oak populations Olivier Lepais,Abdeldjalil Aissi,Errol Véla,Yassine Beghami Heredity, 2022, 129, pp.169-182. ⟨10.1038/s41437-022-00550-0⟩ Article dans une revue hal-03705508v1
Iguana insularis (Iguanidae) from the southern Lesser Antilles: An endemic lineage endangered by hybridization Michel Breuil,David Schikorski,Barbara Vuillaume,Ulrike Krauss,Jennifer Daltryet al. Zookeys, 2022, 1086, pp.137 - 161. ⟨10.3897/zookeys.1086.76079⟩ Article dans une revue hal-03608735v1
Sea trout ( Salmo trutta ) straying rate decreases as distance from river mouth increases Joelle Chat,Amaia Lamarins,Olivier Lepais Journal of Fish Biology, 2022, 8 p. ⟨10.1111/jfb.15152⟩ Article dans une revue hal-03766572v1
Population genomic and historical analysis suggests a global invasion by bridgehead processes in Mimulus guttatus Mario Vallejo-Marín,Jannice Friedman,Alex D Twyford,Olivier Lepais,Stefanie M Ickert-Bondet al. Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.1-12. ⟨10.1038/s42003-021-01795-x⟩ Article dans une revue hal-03310344v1
Analyse morphologique et taxonomique du complexe Quercus faginea (Fagaceae) en Algérie Abdeldjalil Aissi,Yassine Beghami,Olivier Lepais,Errol Véla Botany / Botanique, 2021, 99 (2), pp.99-113. ⟨10.1139/cjb-2020-0075⟩ Article dans une revue hal-03146455v1
Microhaplotype genotyping-by-sequencing of 98 highly polymorphic markers in three chestnut tree species Benoît Laurent,Clément Larue,Emilie Chancerel,Erwan Guichoux,Rémy J. Petitet al. Conservation Genetics Resources, 2020, ⟨10.1007/s12686-020-01157-5⟩ Article dans une revue hal-02882025v1
Variable outcomes of hybridization between declining Alosa alosa and Alosa fallax Laura Taillebois,Stephen Sabatino,Aurélie Manicki,Françoise Daverat,David José Nachonet al. Evolutionary Applications, 2020, 13 (4), pp.636-651. ⟨10.1111/eva.12889⟩ Article dans une revue hal-02437628v1
Fast sequence-based microsatellite genotyping development workflow Olivier Lepais,Emilie Chancerel,Christophe Boury,Franck Salin,Aurélie Manickiet al. PeerJ, 2020, 8, pp.1-28. ⟨10.7717/peerj.9085⟩ Article dans une revue hal-02936408v1
Estimating the effective number of breeders from single parr samples for conservation monitoring of wild populations of Atlantic salmon Salmo salar Cécile Fanny Emilie Bacles,Colin Bouchard,Frédéric Lange,Aurélie Manicki,Cédric Tentelieret al. Journal of Fish Biology, 2018, 92 (3), pp.699-726. ⟨10.1111/jfb.13537⟩ Article dans une revue hal-01716615v1
Disentangling individual movement between populations from effective dispersal in the facultative anadromous Salmo trutta L. Séverine Masson,Olivier Lepais,Aurélie Manicki,Etienne Prévost,Joëlle Chat Ecology of Freshwater Fish, 2018, 27 (1), pp.323-338. ⟨10.1111/eff.12349⟩ Article dans une revue hal-01604159v1
DNA methylation of the promoter region of bnip3 and bnip3l genes induced by metabolic programming Vincent Veron,Lucie Marandel,Jingwei Liu,Emilio J. Vélez,Olivier Lepaiset al. BMC Genomics, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12864-018-5048-4⟩ Article dans une revue hal-01880453v1
Testing mate choice and overdominance at MH in natural families of Atlantic salmon Salmo salar Cédric Tentelier,O. Barroso-Gomila,Olivier Lepais,Aurélie Manicki,I. Romero Garmendiaet al. Journal of Fish Biology, 2017, 90 (4), pp.1644-1659. ⟨10.1111/jfb.13260⟩ Article dans une revue hal-01606516v1
Genetic architecture of threshold reaction norms for male alternative reproductive tactics in Atlantic salmon (Salmo salar L.) Olivier Lepais,Aurélie Manicki,Stéphane Glise,Mathieu Buoro,Agnes Bardonnet Scientific Reports, 2017, 7 (43552), ⟨10.1038/srep43552⟩ Article dans une revue hal-01607585v1
With our powers combined: integrating behavioral and genetic data to estimate mating success and sexual selection Zoé Gauthey,Cédric Tentelier,Olivier Lepais,Arturo Elosegi,Laura Royeret al. Rethinking Ecology, 2017, 2, pp.1-26. ⟨10.3897/rethinkingecology.2.14956⟩ Article dans une revue hal-01588622v1
Sexual selection leads to a tenfold difference in reproductive success of alternative reproductive tactics in male Atlantic salmon Cédric Tentelier,Olivier Lepais,Nicolas Larranaga,Aurélie Manicki,Frédéric Langeet al. The Science of Nature Naturwissenschaften, 2016, 103 (5-6), 13 p. ⟨10.1007/s00114-016-1372-1⟩ Article dans une revue hal-01901385v1
Remodelling of the hepatic epigenetic landscape of glucose-intolerant rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) by nutritional status and dietary carbohydrates Lucie Marandel,Olivier Lepais,Eva Arbenoits,Vincent Veron,Karine Diaset al. Scientific Reports, 2016, 6, 12 p. ⟨10.1038/srep32187⟩ Article dans une revue hal-01901393v1
Space use and its effects on reproductive success of anadromous Atlantic salmon Cédric Tentelier,Nicolas Larranaga,Olivier Lepais,Aurélie Manicki,Jacques Riveset al. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 2016, 73 (10), pp.1461-1471. ⟨10.1139/cjfas-2015-0518⟩ Article dans une revue hal-01901387v1
Genetic Structure of a Natural Oak Community in Central Italy: Evidence of Gene Flow between Three Sympatric White Oak Species (Quercus, Fagaceae) Gaby Antonecchia,Paola Fortini,Olivier Lepais,Sophie Gerber,Patrick Legéret al. Annals of Forest Research, 2015, 58 (2), pp.205-216-216. ⟨10.15287/afr.2015.415⟩ Article dans une revue hal-02139663v1
The concentration of plasma metabolites varies throughout reproduction and affects offspring number in wild brown trout (Salmo trutta) Zoé Gauthey,Marine Freychet,Aurélie Manicki,Alexandre Herman,Olivier Lepaiset al. Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology, 2015, 184, pp.90-96. ⟨10.1016/j.cbpa.2015.01.025⟩ Article dans une revue istex hal-01901347v1
Genetic evidence of hybridization between the endangered native species Iguana delicatissima and the invasive Iguana iguana (Reptilia, Iguanidae) in the Lesser Antilles: management Implications Barbara Vuillaume,Victorien Valette,Olivier Lepais,Frederic Grandjean,Michel Breuil PLoS ONE, 2015, 10 (6), ⟨10.1371/journal.pone.0127575⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-01901355v1
Two are better than one: combining landscape genomics and common gardens for detecting local adaptation in forest trees Olivier Lepais,Cécile Fanny Emilie Bacles Molecular Ecology, 2014, 23 (19), pp.4671-4673. ⟨10.1111/mec.12906⟩ Article dans une revue hal-02630547v1
SimRAD: an R package for simulation-based prediction of the number of loci expected in RADseq and similar genotyping by sequencing approaches. Olivier Lepais,Jason T Weir Molecular Ecology Resources, 2014, 14 (6), pp.1314-1321. ⟨10.1111/1755-0998.12273⟩ Article dans une revue istex hal-02633536v1
High genetic diversity and distinctiveness of rear-edge climate relicts maintained by ancient tetraploidisation for Alnus glutinosa Olivier Lepais,Serge D Muller,Samia Ben Saad-Limam,Mohamed Benslama,Laïla Rhaziet al. PLoS ONE, 2013, 8 (9), 11 p. ⟨10.1371/journal.pone.0075029⟩ Article dans une revue hal-02644159v1
Strength and variability of postmating reproductive isolating barriers between four European white oak species Olivier Lepais,Guy G. Roussel,Hubert François,Antoine Kremer,Sophie Gerber Tree Genetics and Genomes, 2013, 9 (3), pp.841-853. ⟨10.1007/s11295-013-0602-3⟩ Article dans une revue istex hal-02650757v1
Leaf shape and size differentiation in white oaks : assessment of allometric relationships among three sympatric species and their hybrids Vincenzo Viscosi,Gaby Antonecchia,Olivier Lepais,Paola Fortini,Sophie Gerberet al. International Journal of Plant Sciences, 2012, 173 (8), pp.875-884. ⟨10.1086/667234⟩ Article dans une revue hal-02647636v1
Triploid bumblebees indicate a direct cost of inbreeding in fragmented populations B. Darvill,Olivier Lepais,L.C. Woodall,D. Goulson Molecular Ecology, 2012, 21 (16), pp.3988-3995. ⟨10.1111/j.1365-294X.2012.05679.x⟩ Article dans une revue istex hal-02651484v1
Genetic variation and population decline of an endangered hoverfly Blera fallax (Diptera : Syrphidae) E.L. Rotheray,Olivier Lepais,A. Nater,M. Krützen,M. Gremingeret al. Conservation Genetics, 2012, 13 (5), pp.1283-1291. ⟨10.1007/s10592-012-0371-9⟩ Article dans une revue istex hal-02651829v1
Reconstructing demographic events from population genetic data: the introduction of bumblebees to New Zealand G. C. Lye,Olivier Lepais,D. Goulson Molecular Ecology, 2011, 20 (14), pp.2888-2900. ⟨10.1111/j.1365-294X.2011.05139.x⟩ Article dans une revue istex hal-02649972v1
De Novo Discovery and Multiplexed Amplification of Microsatellite Markers for Black Alder (Alnus glutinosa) and Related Species Using SSR-Enriched Shotgun Pyrosequencing Olivier Lepais,Cécile Fanny Emilie Bacles Journal of Heredity, 2011, 102 (5), pp.627-632. ⟨10.1093/jhered/esr062⟩ Article dans une revue hal-02649970v1
Reproductive patterns shape introgression dynamics and species succession within the european white oak species complex Olivier Lepais,Sophie Gerber Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2011, 65 (1), pp.156-170. ⟨10.1111/j.1558-5646.2010.01101.x⟩ Article dans une revue hal-02651325v1
Thirteen microsatellites developed by SSR-enriched pyrosequencing for Solanum rostratum (Solanaceae) and related species M. Vallejo-Marin,L. Solis-Montero,Cécile Fanny Emilie Bacles,Olivier Lepais American Journal of Botany, 2011, 98 (10), pp.e296-e299. ⟨10.3732/ajb.1100159⟩ Article dans une revue hal-02646317v1
Population structure, dispersal and colonization history of the garden bumblebee Bombus hortorum in the Western Isles of Scotland D. Goulson,J. C. Kaden,Olivier Lepais,G. C. Lye,B. Darvill Conservation Genetics, 2011, 12 (4), pp.867-879. ⟨10.1007/s10592-011-0190-4⟩ Article dans une revue istex hal-02652253v1
Comparison of random and SSR-enriched shotgun pyrosequencing for microsatellite discovery and single multiplex PCR optimization in Acacia harpophylla F. Muell. Ex Benth Olivier Lepais,Cécile Fanny Emilie Bacles Molecular Ecology Resources, 2011, 11 (4), pp.711-724. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.03002.x⟩ Article dans une revue istex hal-02644253v1
Current trends in microsatellite genotyping Erwan Guichoux,Lelia L. Lagache,Stefanie Wagner,Philippe Chaumeil,Patrick P. Légeret al. Molecular Ecology Resources, 2011, 11 (4), pp.591-611. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.03014.x⟩ Article dans une revue istex hal-02652759v1
Effects of land use at a landscape scale on bumblebee nest density and survival Dave Goulson,Olivier Lepais,Stéphanie O’connor,Juliet L. Osborne,Roy A. Sandersonet al. Journal of Applied Ecology, 2010, 47 (6), pp.1207-1215. ⟨10.1111/j.1365-2664.2010.01872.x⟩ Article dans une revue hal-02666152v1
Cryptic differences in dispersal lead to differential sensitivity to habitat fragmentation in two bumblebee species B. Darvill,S. O’connor,G. C. Lye,J. Waters,Olivier Lepaiset al. Molecular Ecology, 2010, 19 (1), pp.53-63. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04423.x⟩ Article dans une revue istex hal-02666965v1
Estimation of bumblebee queen dispersal distances using sibship reconstruction method Olivier Lepais,Ben Darvill,Stéphanie O’connor,Juliet L. Osborne,Roy A. Sandersonet al. Molecular Ecology, 2010, 19 (4), pp.819-831. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04500.x⟩ Article dans une revue istex hal-02661910v1
Leaf morphological analyses in four European oak species (Quercus) and their hybrids: A comparison of traditional and geometric morphometric methods Vincenzo Viscosi,Olivier Lepais,Sophie Gerber,P. Fortini Plant Biosystems, 2009, 143 (3), pp.564-574. ⟨10.1080/11263500902723129⟩ Article dans une revue hal-02668459v1
Species relative abundance and direction of introgression in oaks Olivier Lepais,Remy R. Petit,Erwan Guichoux,J. E. Lavabre,Florian Albertoet al. Molecular Ecology, 2009, 18 (10), pp.2228 - 2242. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04137.x⟩ Article dans une revue istex hal-02665530v1
Phylogeography of north african atlas cedar (cedrus atlantica, pinaceae): combined molecular and fossil data reveal a complex quaternary history Anass Terrab,Arndt Hampe,Olivier Lepais,Salvador Talavera,Errol Velaet al. American Journal of Botany, 2008, 95 (10), pp.1262-1269. ⟨10.3732/ajb.0800010⟩ Article dans une revue hal-02660991v1
Characterization and identification of tunisian olive tree varieties by microsatellite markers Imen Rekik,Amelia Salimonti,Sophie Gerber,Olivier Lepais,Enzo Perriet al. HortScience, 2008, 43 (5), pp.1371-1376 Article dans une revue hal-02662168v1
High throughput microsatellite genotyping in oak species Olivier Lepais,Valérie V. Léger,Sophie Gerber Silvae Genetica, 2006, 55 (4-5), pp.238-240 Article dans une revue hal-02661668v1

Communication dans un congrès (28)

Diversité génétique des communautés à isoétides des lacs et des étangs du littoral Aquitain Estelle Debailleul,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais Journée des doctorants de l'école doctorale Sciences et environnements, Ecole doctorale Sciences et Environnement n°304, Feb 2025, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-05226978v1
Les travaux d’ECOVEA sur les espèces exotiques envahissantes Aurélien Jamoneau,Vincent Bertrin,Gwilherm Jan,Olivier Lepais Journées Techniques sur la gestion des déchets des plantes exotiques envahissantes, Oct 2025, Cestas, Gazinet, France Communication dans un congrès hal-05320312v1
Microbiome-Metabolome association approach to unravel the relationship between taxonomic and functional biodiversity in freshwater periphyton facing global change Nicolas Creusot,Arthur Medina,Alidou Sana,Mélissa Eon,Zoé Delporteet al. 20. Annuel conference of the Metabolomics Society, Metabolomics Society, Jun 2024, Osaka (JP), Japan Communication dans un congrès hal-04734680v1
Biodiversity of the isoetid communities in Aquitaine shallow lakes: a conservation genetic perspective Estelle-Marie Debailleul,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais 6èmes Journées Internationales de Limnologie et Océanographie, Association Française de Limnologie, Oct 2024, Pessac (33), France Communication dans un congrès hal-05226989v1
Feline ecology in French Guiana: a Participatory Sciences and molecular non-invasive approach Niklas Tysklind,Stéphanie Barthe,Valérie Troispoux,Maxime Galan,Erwan Guichouxet al. Labex CEBA annual meeting 2024, LabEx CEBA, Oct 2024, Cayenne, French Guiana Communication dans un congrès hal-04736342v1
Conserving genomic diversity in tropical trees from French Guiana Myriam Heuertz,Julien Bonnier,Sylvain Schmitt,Olivier Lepais,Emilie Chancerelet al. 7th European Congress on Conservation Biology, SCB, Jun 2024, Bologna, Italy Communication dans un congrès hal-04702058v1
Food for models : knowledge on metapopulation functioning and marine use of European shads (Alosa alosa and Alosa fallax Françoise Daverat,Marie-Laure Acolas,C Antunes,,Agnes Bardonnet,Gilles Bareilleet al. Annual ICES Meeting, International Council for the Exploration of the Sea, Sep 2023, Bilbao, Spain Communication dans un congrès hal-04235807v1
Genetic and taxonomic diversity of isoetid communities in Aquitaine shallow lakes Estelle-Marie Blanquart,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais 16. International Symposium on Aquatic Plants, International Aquatic Plants Group, Nov 2023, Antwerp, Belgium Communication dans un congrès hal-04382438v1
Plant mutations: slaying beautiful hypotheses by surprising evidence Niklas Tysklind,Sylvain Schmitt,Patrick Heuret,Valérie Troispoux,Mélanie Beraudet al. EVOLTREE Conference 2023 - Resilient Forests for the Future, UNITBV, Brașov, Romania, Sep 2023, Brasov, Romania. ⟨10.31926/evoltree.2023⟩ Communication dans un congrès hal-04664198v1
NGS : New-genotyping strategies Olivier Lepais,Eric Petit Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2019, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02791697v1
Estimation du nombre de reproducteurs efficaces : un nouvel indicateur de l’état des populations Olivier Lepais,Cécile Fanny Emilie Bacles,Frédéric Lange,Aurélie Manicki Journée Scientifique et technique du Pôle Migrateurs INRA AFB, Jun 2019, Paris, France. 12 p Communication dans un congrès hal-02791159v1
Approches moléculaires pour étudier l'effet de l'utilisation des terres d'un paysage agricole sur les populations de bourdons Olivier Lepais Rencontre d'écologie des paysages, Nov 2019, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-02791503v1
Hybridation entre l’alose vraie et la grande alose sur la façade Atlantique Française : causes et conséquences pour leur conservation Olivier Lepais,Laura Taillebois Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2019, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02791213v1
Génotypage de microsatellites par séquençage : aspects méthodologiques et analytiques Olivier Lepais,Christophe Boury,Emilie Chancerel,Aurélie Manicki,Franck Salinet al. Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2018, Avignon, France Communication dans un congrès hal-02791698v1
Estimation du nombre de reproducteurs efficaces (NombReEff) : un nouvel indicateur de l'état des populations Cécile Fanny Emilie Bacles,Frédéric Lange,Aurélie Manicki,Olivier Lepais Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Jun 2017, Orléans, France. 16 diapos Communication dans un congrès hal-01603135v1
Cost-efficient estimation of effective population size from single parr sample for Atlantic salmon conservation monitoring of rear-edge populations in southern France Olivier Lepais,Frédéric Lange,Aurélie Manicki,Cécile Fanny Emilie Bacles Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2017, Exeter, United Kingdom Communication dans un congrès hal-01605318v1
Développement rapide de marqueurs SNP pour l’aide à la gestion de la truite commune (Salmo trutta L.) dans le bassin de l’Adour Charlotte Urien,Joëlle Chat,Aurélie Manicki,Christophe Boury,Franck Salinet al. 38. Réunion Annuelle du Groupe d'Etude de Biologie et Génétique des Populations, Jun 2017, Paris Saclay, France Communication dans un congrès hal-01603236v1
Estimating movement and effective dispersal in a partially migratory fish Séverine Masson,Joëlle Chat,Aurélie Manicki,Francois Gueraud,Jacques Riveset al. Annual Meeting of the Ecological Genetics Group, Apr 2016, Aberystwyth, United Kingdom Communication dans un congrès hal-01608138v1
Population genomics of early male parr maturation in Atlantic salmon natural populations Olivier Lepais,Aurélie Manicki,Stéphane Glise,Agnes Bardonnet Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2016, Bangor, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02741168v1
Planification d’expérience RADseq : approche par simulation. Olivier Lepais Approches RADseq pour l'étude de la biodiversité, Groupement de Recherche Génomique Environnementale (GDR3692). FRA., Nov 2016, Paris, France Communication dans un congrès hal-02799371v1
Génétique de la maturation chez le saumon Atlantique Olivier Lepais,Stéphane Glise,Francois Gueraud,Jacques Rives,Aurélie Manickiet al. Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Oct 2015, Rennes, France. 13 diapos Communication dans un congrès hal-02797408v1
Aspects génomiques de la maturation précoce chez les tacons mâles Olivier Lepais Réunion du Réseau Spam Salmonades du Département EFPA, Nov 2015, Thonon-les-Bains, France. 16 diapos Communication dans un congrès hal-02798305v1
Des Pyrénées aux Alpes, la sélection sexuelle dans tous ses états chez la truite commune Zoé Gauthey,Jordi Gil,Marine Freychet,Laura Royer,Elie Chantriauxet al. Réunion du Réseau Spam Salmonades du Département EFPA, Nov 2015, Thonon les Bains, France. 35 diapos Communication dans un congrès hal-01901378v1
Do sea trout migrations promote interbasin connectivity between populations? Joëlle Chat,Séverine Masson,Aurélie Manicki,Francois Gueraud,Jacques Riveset al. 2. International Sea Trout Symposium, Inland Fisheries Ireland. IRL., Oct 2015, Dundalk, Ireland Communication dans un congrès hal-02742521v1
Simulation pour la prévision du nombre de locus ciblés par les approches de Génotypage par Séquençage Olivier Lepais,Franck F. Salin,Christophe C. Boury,Erwan Guichoux,Yec'Han Laizetet al. Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Nov 2014, Nancy, France Communication dans un congrès hal-02799259v1
Paternal inheritance of alternative mating tactics in male Atlantic salmon: Toward an integrated population genomics perspective. Olivier Lepais,Stéphane Glise,Francois Gueraud,Jacques Rives,Aurélie Manickiet al. 2. International Conference on Integrative Salmonid Biology, Jun 2014, Vancouver, Canada Communication dans un congrès hal-02797180v1
Paternal inheritance of alternative mating tactics in male Atlantic salmon Olivier Lepais,Stéphane Glise,Francois Gueraud,Jacques Rives,Aurélie Manickiet al. BES-SFE Joint 2014 Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France Communication dans un congrès hal-02798280v1
Diversité et structuration génétique des chênes à l’échelle de deux paysages : impact de l’écologie, de l’histoire et de la gestion Olivier Lepais,Jessica Lavabre,Maya Gonzalez,Jerome Willm,Alain A. Cabanetteset al. 6. Colloque national du BRG. Ressources génétiques : des ressources partagées, Oct 2006, La Rochelle, France Communication dans un congrès hal-02758287v1

Poster de conférence (10)

La génétique pour la sauvegarde des lacs aquitains Estelle-Marie Debailleul,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais Journée des doctorants de la région Aquitaine, Nov 2025, Bordeaux, France. 1 p Poster de conférence hal-05600583v1
Diversité taxonomique et génétique des communautés à isoétides des lacs du littoral aquitain Estelle-Marie Blanquart,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais Doctoriales de la biodiversité 2023, Feb 2023, Biarritz, France Poster de conférence hal-04382428v1
Genetic and taxonomic diversity of Aquitaine coast lakes isoetid communities Estelle-Marie Blanquart,Aurélien Jamoneau,Olivier Lepais 13th Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2023, Newcastle, United Kingdom. 2023 Poster de conférence hal-04207311v1
Fast sequence-based microsatellite genotyping development workflow for any non-model species Olivier Lepais,Emilie Chancerel,Christophe Boury,Franck Salin,Aurélie Manickiet al. 5. Colloque du GDR Génomique environnementales, 2019, La Rochelle, France. 2019 Poster de conférence hal-02791502v1
Impact of low flow on y-o-y Atlantic salmon : density-dependent and density-independent factors interact to decrease population resilience Agnes Bardonnet,Olivier Lepais,Valérie Bolliet,Stéphane Panserat,Jean-Claude Salvadoet al. Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2017, Exeter, United Kingdom. 162 p., 2017, Understanding fish populations. Symposium handbook Poster de conférence hal-01604281v1
Sea trout migrations and management practices Joëlle Chat,Séverine Masson,Aurélie Manicki,Francois Gueraud,Jacques Riveset al. FSBI 2016. Annual symposium of the Fisheries Society of the British Isles, Jul 2016, Bangor, United Kingdom. , 1 p., 2016 Poster de conférence hal-01901394v1
Effects of density, environment and parental origin on Y-O-Y Atlantic salmon survival, growth and early maturation Agnes Bardonnet,Olivier Lepais Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4 Poster de conférence hal-01901357v1
Sex in space : how space use affects reproductive success of anadromous Atlantic salmon Cédric Tentelier,Olivier Lepais,Nicolas Larranaga Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4 Poster de conférence hal-01901361v1
Individual reproductive success of Atlantic salmon male alternative mating tactics in the wild Cédric Tentelier,Olivier Lepais,Nicolas Larranaga Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4 Poster de conférence hal-01901360v1
Genotyping By Sequencing development for Salmo salar: A simulation-based predictive approach using the R package SimRAD. Olivier Lepais,Franck F. Salin,Christophe C. Boury,Erwan Guichoux,Yec'Han Laizetet al. 2. International Conference on Integrative Salmonid Biology, Jun 2014, Vancouver, Canada. , 2014 Poster de conférence hal-02799311v1

Pré-publication, Document de travail (3)

Species-level identification of the critically endangered European sturgeon Acipencer sturio using DNA-based approaches Emilie Chancerel,Marie-Laure Acolas,Olivier Lepais 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04172353v1
Plant mutations: slaying beautiful hypotheses by surprising evidence Sylvain Schmitt,Patrick Heuret,Valérie Troispoux,Mélanie Beraud,Jocelyn Cazalet al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04338228v1
Offspring sex ratio increases with male reproductive success in the polygynous southern elephant seals Hassen Allegue,Christophe Guinet,Samantha Patrick,Cécile Ribout,Coraline Bichetet al. 2023 Pré-publication, Document de travail hal-04172327v1

Rapport (9)

Rapport intermédiaire du projet Vigie-Lacs Vincent Bertrin,Sébastien Boutry,Estelle-Marie Debailleul,Alain Dutartre,Carine Fortinet al. INRAE - EABX. 2025, pp.24 Rapport hal-05228361v1
Rapport final du projet DIGEMAC &quot;Diversité génétique dans le Massif central &quot;. Mission d’accompagnement technique et méthodologique pour étudier la résilience des forêts face au changement climatique dans 3 parcs naturels régionaux (PNR) du Massif central. Financement dans le cadre du projet « Biodiversité de l’inter-parcs du Massif central ». Opération « Forêts anciennes volet 4 ». Catherine Bodénès,Frédéric Jean,Olivier Lepais,Rémy Petit,Mehdi Pringarbeet al. INRAE. 2025 Rapport hal-05228696v1
Projet CRIJEST : Connectivité, cRoissance et Installation des Juvéniles de poissons dans les nourriceries ESTuariennes - Rapport final Nils Teichert,Anne Lizé,Laure-Sarah Virag,Hélène Tabouret,Jézabel Lamoureuxet al. Muséum national d'Histoire naturelle; Station marine de Dinard; Office français de la biodiversité. 2024, 130 p Rapport hal-04803899v1
Projet CRIJEST : Connectivité, cRoissance et Installation des Juvéniles de poissons dans les nourriceries ESTuariennes Nils Teichert,Anne Lizé,Éric Feunteun,Alexandre Carpentier,Laure-Sarah Viraget al. Station marine de Dinard, Muséum National d’Histoire Naturelle. 2024 Rapport hal-05488647v1
Les populations de truites de la Garonne (affluents girondins) et de la Leyre : génétique et scalimétrie Joëlle Chat,Marin Tetillon,Aurélie Manicki,Francois Gueraud,Olivier Lepais [Contrat] Fédération Départementale des Associations Agréées de Pêche et de Protection du Milieu Aquatique de la Gironde. 2018, 14 p. + annexes Rapport (rapport contrat/projet) hal-02025839v1
Estimation du nombre de reproducteurs efficaces : un nouvel indicateur de l’état des populations Olivier Lepais [Contrat] Inconnu. 2017, 42 p Rapport (rapport contrat/projet) hal-02187476v1
Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents Eric Petit,Anthony Acou,Didier Azam,Agnes Bardonnet,Dominique D. Barloyet al. [Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2016, pp.18 Rapport (rapport de recherche) hal-03357109v1
Continuité écologique et conservation de la diversité génétique et écotypique d'un grand migrateur (Salmo trutta). Rapport final Joëlle Chat,Aurélie Manicki,Francois Gueraud,Olivier Lepais [Contrat] Inconnu. 2015, 55 p Rapport (rapport contrat/projet) hal-01901356v1
Étude comparée de la structuration génétique des chênes à l’échelle d’un paysage Olivier Lepais [Stage] Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), Talence, FRA.; Université de Bordeaux Ségalen (Bordeaux 2), Bordeaux, FRA. 2004, 23 p Rapport hal-02832233v1

Thèse (1)

Dynamique d'hybridation dans le complexe d'espèces des chênes blancs européens (Chênes pédonculés - Quercus robur L., sessiles - Q. petraea (Matt.) Liebl., pubescents -Q. pubescens Willd. et tauzins - Q. pyrenaica Willd.) Olivier Lepais Sciences du Vivant [q-bio]. Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), 2008. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-02821939v1

HDR (1)

Diversité génétique au sein des populations : histoires évolutives, processus écologiques et implications pour la gestion Olivier Lepais Génétique des populations [q-bio.PE]. Université de Bordeaux, 2023 HDR tel-04672811v1

Vidéo (1)

Vidéo de présentation - Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux (PGTB) Erwan Le Gac,Préscillia Alves Gomes,Christophe Boury,Emilie Chancerel,Zoé Compagnieet al. 2025 Vidéo hal-05426257v1

Logiciel (1)

R package SimRAD: Simulations to predict the number of loci expected in RAD and GBS approaches Olivier Lepais,Jason T Weir 2014 Logiciel hal-02793040v1