Philippe BIAGINI

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Présentation

ETAT CIVIL

Philippe BIAGINI

Né le 20 Septembre 1963 à Marseille (Bouches du Rhône)

Nationalité Française

Divorcé, 2 enfants

Directeur de Recherche Etablissement Français du Sang

UMR 7268 ADES - Aix-Marseille Université / CNRS / EFS

Adresse professionnelle : UMR 7268 ADES - EFS PACA Corse / Faculté de Médecine, 4ème étage aile rouge, 27, Bd. Jean Moulin, 13005 Marseille.

Adresse fonctionnelle 2022 : UMR 6134 SPE - Laboratoire Paléomicrobiologie / Université de Corse UCPP, Campus Grimaldi, BP 52, 20250 Corte.

Tél.: 06 60 53 26 02 ; E-mail : philippe.biagini@efs.sante.fr

TITRES ET DIPLOMES

2021 : Admis sur la liste de Qualification aux fonctions de Professeur des Universités, section CNU 65.

2002 : Habilitation à Diriger les Recherches (HDR) - spécialité Virologie. Université de la Méditerranée, Marseille.

1997 : Doctorat 3ème cycle - Formation doctorale « Chimie, Environnement et Santé », option: Santé; Université de la Méditerranée, Marseille.

1993 : Diplôme d’Etudes Approfondies (DEA) - « Biologie Cellulaire et Microbiologie ». Faculté des Sciences de Luminy, Université de la Méditerranée.

1988: Ingénieur ICPI Lyon - Institut de Chimie et Physique Industrielles de Lyon (ICPI/CPE) - spécialité Chimie : Génie chimique et Mircobiologique.

1986 : Maîtrise de Biochimie - Faculté des Sciences St Charles, Université de Provence, Marseille.

EXPERIENCE PROFESSIONNELLE

2009-actuel :

Directeur de Recherche : EFS PACA Corse, UMR 7268 équipe Biologie des Groupes Sanguins (précédemment EFS Alpes-Méditerranée, UMR 6578 équipe Emergence et Coévolution Virale).

1997 : Chargé de Recherche : EFS Alpes-Méditerranée, Laboratoire de Virologie Moléculaire.

1991 : Ingénieur de Recherche : EFS Alpes-Méditerranée, Laboratoire de Biologie Moléculaire.

1990 : Ingénieur Responsable de Laboratoire : Laboratoire Central de Marseille (Expertises / Analyses physico-chimiques - partenariat Port Autonome de Marseille).

RESPONSABILITES ADMINISTRATIVES

· Référent du Site « Recherche - Biologie des Groupes Sanguins » de l'EFS PACA Corse (Faculté de Médecine, Marseille) 2020-2022.

· Coordinateur du Site « Recherche - Virologie » de l’EFS PACA Corse (Faculté de Médecine, Marseille) de 2007 à 2018.

RESPONSABILITES SCIENTIFIQUES / ENCADREMENT

ACTIVITES D'EXPERTISE :

· Depuis 2019 : Expert auprès de la DGRI (Direction Générale de la Recherche et de l'Innovation) - Missions d’expertises (Service MEIRIES: Mission d’Expertise Internationale) pour des Projets de Recherche Internationaux.

· Depuis 2001 : Membre ICTV (Comité International pour la Taxonomie des Virus).

Direction / Membre des groupes de travail pour la classification des familles Anelloviridae et Circoviridae.

REVIEWER REVUES DE RANG A :

Sur les 5 dernières années: Archives of Virology; Blood Transfusion; Clinical Infectious Diseases; Emerging Infectious Diseases; Frontiers; Future Virology; Infection, Genetics and Evolution; International Journal of Infectious Diseases; The Journal of Infectious Diseases; The Lancet Infectious Diseases; New Microbiologica; PLoS; PLoS ONE; Virology; Virus Evolution; Virus Genes; Virus Research.

DIRECTION DE GROUPES DE TRAVAIL :

Depuis 2022 : « Pathogènes et prélèvements anciens - Paléomicrobiologie: partenariat Université de Corse UCPP - Etude des pathogènes des populations corses anciennes »

2018-2022 : « Interactions pathogènes - cellules de la cascade erythropoïétique »

« Pathogènes et prélèvements anciens - Paléomicrobiologie »

1997-2018: « Virus émergents transfusionnels »

« Pathogènes et prélèvements anciens - Paléomicrobiologie » (depuis 2009)

1991-1997: « Hormones gastro-intestinales et cancer - approches moléculaires »

PRODUCTION SCIENTIFIQUE :**

· 85 publications dans des revues à comité de lecture (1993 - 2021) / IF ~1 à ~91 / h-index 28

· 41 communications orales / posters / conférences invitées lors de congrès nationaux et internationaux.

· 9 chapitres d'ouvrages et revues.

· Prix IHU Méditerranée Infection - Meilleure publication 2012, Chercheur confirmé.

(Variola virus in a 300-year-old Siberian mummy, Biagini et al., New England Journal of Medicine 2012).

ENCADREMENT/CO-ENCADREMENT D'ETUDIANTS :

Doctorat 3ème cycle (bourses MRT)

- Meffray A. : « Infections du passé: développement et application d'une approche originale de paléoépidémiologie intégrative », Juin 2020, Aix-Marseille Université.

Actuellement en contrat post-doctoral Université de Corse UCPP - Etude des pathogènes des populations corses anciennes.

- Bedarida S. : « Histoire naturelle et diversité génétique des virus de la famille Anelloviridae: étude de prélèvements biologiques contemporains et anciens », Octobre 2014, Aix-Marseille Université.

Post-doctorat (bourses Fondation IHU Méditerranée Infection - Infectiopôle Sud)

- Khoder M. : « Analyse moléculaire et par cytométrie en flux de particules exosomales positives pour les virus anellovirus et pegivirus dans le contexte de la cascade erythropoïétique », (2019-2021).

- Bakour S. : « Analyse du microbiote bactérien issu d'échantillons sanguins à marqueurs viraux positifs », (2015-2017).

- Duraisamy R. : « Détection, prévalence et pathogénèse de l'infection à Marseille-like virus », (2015-2017).

- Cortey M. : « Métagénomique appliquée à des échantillons biologiques issus de primates non-humains (Afrique centrale de l'ouest) » (2012-2013).

Master Recherche - M2

- Lafolie S. : « Syphilis congénitale: approche paléopathologique et paléomicrobiologique », (2021).

- Le Provost E. : « L'ostéoarthropathie hypertrophiante pneumique en paléopathologie: à propos de cas médiévaux, modernes et contemporains », (2019).

- Cayre A. : « Etude de la charge infectieuse d'un échantillon ostéoarchéologique médiéval », (2018).

- Houriez E. : « Paléomicrobiologie de la lèpre: étude de cas médiévaux », (2017).

- Grenier Romero C. : « Paléovirologie du Parvovirus B19: étude de cas modernes et contemporains », (2016).

- Meffray A. : « Recherche de pathogènes dans des vestiges humains anciens: application à la Brucellose », (2016).

- Bergonzi C. : « Recherche du choléra dans des sédiments anciens: approches moléculaires », (2014).

- Le Goff C. : « Approches moléculaires dans la recherche de pathogènes à partir de prélèvements anciens », (2010).

- Bedarida S. : « Approches moléculaires dans la recherche de génomes viraux à partir de prélèvements anciens : application à des échantillons dentaires provenant d’un charnier de la Grande Armée de Napoléon à Kaliningrad », (2009).

MEMBRE DE COMITES :

Participation à des Jurys de Thèses

Meffray A. : co-directeur de la Thèse, Juin 2020.

Muhire B.M. : rapporteur de la Thèse en sciences intitulée « Evolutionary impacts of secondary structures within the genomes of eukaryote-infecting single stranded DNA viruses ». University of Cape Town, South-Africa, Novembre 2015.

Bernardo P. : rapporteur de la Thèse en sciences intitulée « Ecologie, diversité, et découverte de phytovirus à l'échelle de deux agro-écosystèmes dans un cadre spatio-temporel à l'aide de la géo-métagénomique ». Université Montpellier 2, Décembre 2014.

Bedarida S. : directeur de la Thèse, Octobre 2014.

Galmès J. : rapporteur de la Thèse en sciences intitulée « Isolement et caractérisation de nouvelles espèces de Torque Teno Mini Virus (TTMV): implication potentielle dans la pathogénèse de la pneumonie». Université de Lyon - Ecole Normale Supérieure, Avril 2013.

Heath L. : rapporteur de la Thèse en sciences intitulée « Molecular biological studies on beak and feather disease virus ». University of Cape Town, South-Africa, Novembre 2006.

Participation à des Comités de suivis de Thèses**

Bonfante B. : « Etude d'associations pangénomiques de caractéristiques morphologiques humaines ». Aix-Marseille Université, 2020.

Palmal S. : « Prediction of pigmentation phenotypes from genotype data: developments and applications ». Aix-Marseille Université, 2020.

Meffray A. : « Infections du passé: développement et application d'une approche originale de paléoépidémiologie intégrative ». Aix-Marseille Université, 2017 - 2018 - 2019.

Fromentier A. : « Concilier l'archéologie et la biologie: l'ADN ancien, une approche pour étudier le passé de l'homme ». Université Toulouse 2, 2017 – 2018.

RESPONSABILITES PEDAGOGIQUES

Activités d'enseignement et gestion de modules de formations universitaires et continues.

J’ai eu l’opportunité, grâce à mes contacts institutionnels et professionnels, de pouvoir participer à des enseignements de manière régulière depuis 1997:

- DCEM1-L3, module « Transfusion Sanguine », Aix-Marseille Université**

- Master « Biologie Santé », Aix-Marseille Université**

- Module « Virologie Générale et Transfusionnelle », EFS** (responsable)

- Module « Biologie Moléculaire : Outils-Applications », EFS**

FINANCEMENTS DE PROJETS DE RECHERCHE

2022: « Paléomicrobiologie Corse: étude des pathogènes des populations corses anciennes », 150.000 €, Ministère de l'Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l'Innovation (lancement projet, co-gestion/partenariat Prof. L. Berti - Université de Corse).

2015: « Analyse métagénomique virale d'échantillons sanguins à marqueurs positifs », 192.000 € / 3 ans, Conseil Scientifique de l’Etablissement Français du Sang (CS EFS).

2007: « Projet ViRes : recherche de nouveaux virus véhiculés par le sang », 160.000 € / 3 ans, CS EFS.

2004: « Projet PEER : développement d’une méthodologie innovante pour la recherche de nouveaux virus infectant l’homme », 57.000 € / 2 ans, CS EFS.

1999: « Développement d’outils diagnostiques pour l’étude du virus TT », 65.000 € / 2 ans, Fonds d’Orientation de la Recherche en Transfusion Sanguine.

1998: « Elaboration de tests diagnostiques permettant le dépistage du virus TT », 8.000 € / 1 an, Association Recherche et Transfusion (ART).

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Publications

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Summary of taxonomy changes ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) from the Animal DNA Viruses and Retroviruses Subcommittee, 2025

Arvind Varsani , Adly M.M. Abd-Alla , Niklas Arnberg , Kelly S Bateman , Mária Benkő et al.
Journal of General Virology, 2025, 106 (7), pp.002113. ⟨10.1099/jgv.0.002113⟩
Article dans une revue pasteur-05212164 v1
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À propos de deux cas de brucellose dans le sud de la France aux époques médiévale et moderne (Abbaye Saint-Sauveur, Aniane ; La Closeraie, Aix-en-Provence)

Avril Meffray , Philippe Biagini , Catherine Rigeade , Michel Panuel , Laurent Schneider et al.
Bulletins et Mémoires de la Société d'anthropologie de Paris, 2022, Entre vivants et morts : regards croisés sur une frontière relative et fluctuante, 34 (1), pp.117-131. ⟨10.4000/bmsap.9594⟩
Article dans une revue halshs-03708359 v1

Taxonomic updates for the genus Gyrovirus (family Anelloviridae): recognition of several new members and establishment of species demarcation criteria

Simona Kraberger , Tanja Opriessnig , Vladimir Celer , Fabrizio Maggi , Hiroaki Okamoto et al.
Archives of Virology, 2021, 166, pp.2937-2942. ⟨10.1007/s00705-021-05194-9⟩
Article dans une revue hal-03328382 v1
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Variola virus DNA in skeletal remains, 17th-18th centuries, southeastern France

Avril Meffray , Yann Ardagna , Bernard Sillano , Sandy Parmentier , Benoit Pouget et al.
Clinical Microbiology and Infection, In press, 27 (12), pp.1871-1872. ⟨10.1016/j.cmi.2021.09.015⟩
Article dans une revue hal-03356279 v1
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Detection of Mycobacterium leprae DNA from remains of a medieval individual, Amiens, France

Avril Meffray , Eloïse Houriez , Carole Fossurier , Annick Thuet , Philippe Biagini et al.
Clinical Microbiology and Infection, 2020, 26 (1), pp.127-129. ⟨10.1016/j.cmi.2019.09.011⟩
Article dans une revue hal-02305297 v1

Molecular detection of Treponema pallidum subspecies pallidum in 150-year-old foetal remains, southeastern France

Avril Meffray , Marie Perrin , Anne Richier , Aurore Schmitt , Yann Ardagna et al.
Journal of Medical Microbiology, 2019, ⟨10.1099/jmm.0.000978⟩
Article dans une revue hal-02108523 v1
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Human pegivirus isolates characterized by deep sequencing from hepatitis C virus‐RNA and human immunodeficiency virus‐RNA–positive blood donations, France

François Jordier , Marie-Laurence Deligny , Romain Barré , Catherine Robert , Vital Galicher et al.
Journal of Medical Virology, 2018, 91 (1), pp.38-44. ⟨10.1002/jmv.25290⟩
Article dans une revue hal-01869364 v1

Detection of novel RNA viruses from free-living gorillas, Republic of the Congo: genetic diversity of picobirnaviruses

Raja Duraisamy , Jean Akiana , Bernard Davoust , Oleg Mediannikov , Caroline Michelle et al.
Virus Genes, 2018, 54 (2), pp.256 - 271. ⟨10.1007/s11262-018-1543-6⟩
Article dans une revue hal-01760083 v1

Revisiting the taxonomy of the family Circoviridae: establishment of the genus Cyclovirus and removal of the genus Gyrovirus

Karyna Rosario , Mya Breitbart , Balázs Harrach , Joaquim Segalés , Eric Delwart et al.
Archives of Virology, 2017, ⟨10.1007/s00705-017-3247-y⟩
Article dans une revue hal-01477139 v1

Analysis of Anelloviridae sequences characterized from serial human and animal biological samples

Sandra Bédarida , Bertrand Dussol , Michel Signoli , Philippe Biagini
Infection, Genetics and Evolution, 2017, 53, pp.89-93. ⟨10.1016/j.meegid.2017.05.017⟩
Article dans une revue hal-03060490 v1

Analysis of Anelloviridae sequences characterized from serial human and animal biological samples

Sandra Bédarida , Bertrand Dussol , Michel Signoli , Philippe Biagini
Infection, Genetics and Evolution, 2017, 53, pp.89-93. ⟨10.1016/j.meegid.2017.05.017⟩
Article dans une revue hal-03851555 v1

Analysis of Anelloviridae sequences characterized from serial human and animal biological samples.

Sandra Bédarida , Bertrand Dussol , Michel Signoli , Philippe Biagini
Infection, Genetics and Evolution, 2017, 53, pp.89-93. ⟨10.1016/j.meegid.2017.05.017⟩
Article dans une revue hal-01536641 v1
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Non-contiguous finished genome sequence and description of Streptococcus varani sp. nov.

Sofiane Bakour , Jaishriram Rathored , Cheikh Ibrahima Lo , Oleg Mediannikov , Mamadou Beye et al.
New Microbes and New Infections, 2016, 11, pp.93-102. ⟨10.1016/j.nmni.2016.03.004⟩
Article dans une revue hal-01303332 v1

Identification of virulence factors and antibiotic resistance markers using bacterial genomics.

Sofiane Bakour , Senthil Alias Sankar , Jaishriram Rathored , Philippe Biagini , Didier Raoult et al.
Future Microbiology, 2016, 11, pp.455-66
Article dans une revue hal-01297321 v1

History of Smallpox and Its Spread in Human Populations

Catherine Thèves , Eric Crubézy , Philippe Biagini
Microbiology Spectrum, 2016, 4 (4), ⟨10.1128/microbiolspec.PoH-0004-2014⟩
Article dans une revue hal-01382482 v1
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Novel Single-Stranded DNA Circular Viruses in Pericardial Fluid of Patient with Recurrent Pericarditis

Sébastien Halary , Raja Duraisamy , Laura Fancello , Sonia Monteil-Bouchard , Priscilla Jardot et al.
Emerging Infectious Diseases, 2016, 22 (10), pp.1839 - 1841. ⟨10.3201/eid2210.160052⟩
Article dans une revue hal-01447667 v1

Distribution of Parvovirus 4 and KI/WU polyomaviruses in HIV-positive blood donations, France.

Mhammed Touinssi , Vital Galicher , Philippe de Micco , Philippe Biagini
Journal of Clinical Virology, 2015, 74, pp.43-4
Article dans une revue hal-01252699 v1
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Divergent Gemycircularvirus in HIV-Positive Blood, France.

Rathviro Uch , Pierre-Edouard Fournier , Catherine Robert , Caroline Blanc-Tailleur , Vital Galicher et al.
Emerging Infectious Diseases, 2015, 21 (11), pp.2096-8. ⟨10.3201/eid2111.150486⟩
Article dans une revue hal-01235994 v1

Revisiting the taxonomical classification of Porcine Circovirus type 2 (PCV2): still a real challenge

Giovanni Franzo , Martí Cortey , Alex Olvera , Dinko Novosel , Alessandra Marnie Martins Gomes de Castro et al.
Journal of Human Virology, 2015, 12 (1), ⟨10.1186/s12985-015-0361-x⟩
Article dans une revue hal-01213881 v1
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The rediscovery of smallpox

Catherine Thèves , Philippe Biagini , Eric Crubézy
Clinical Microbiology and Infection, 2014, 20 (3), pp.210-218. ⟨10.1111/1469-0691.12536⟩
Article dans une revue hal-00967567 v1
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Human gyrovirus in healthy blood donors, france.

Philippe Biagini , Sandra Bédarida , Mhammed Touinssi , Vital Galicher
Emerging Infectious Diseases, 2013, 19 (6), pp.1014-5. ⟨10.3201/eid1906.130228⟩
Article dans une revue hal-00831443 v1

Molecular epidemiology of KI and WU polyomaviruses in healthy blood donors, south-eastern France.

Mhammed Touinssi , Vital Galicher , Philippe de Micco , Philippe Biagini
Journal of Medical Virology, 2013, 85 (8), pp.1444-6. ⟨10.1002/jmv.23602⟩
Article dans une revue istex hal-00838191 v1
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Variola virus in a 300-year-old Siberian mummy.

Philippe Biagini , Catherine Thèves , Patricia Balaresque , Annie Geraut , Catherine Cannet et al.
New England Journal of Medicine, 2012, 367 (21), pp.2057-9. ⟨10.1056/NEJMc1208124⟩
Article dans une revue hal-00967584 v1

Evolution of Anelloviridae strains distribution in serial blood and biopsy samples from a renal transplant patient

Philippe Biagini , S. Bédarida , B. Dussol , L. Daniel , Y. Berland et al.
Journal of Medical Virology, 2012, 84 (1), pp.96-98. ⟨10.1002/jmv.22259⟩
Article dans une revue istex hal-00679275 v1
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KIs virus and blood donors, France.

P. Biagini , M. Touinssi , V. Galicher , P. de Micco
Emerging Infectious Diseases, 2012, 18 (8), pp.1374-5. ⟨10.3201/eid1808.120442⟩
Article dans une revue hal-00760008 v1
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KIs virus and blood donors, France.

Philippe Biagini , Mhammed Touinssi , Vital Galicher , Philippe de Micco
Emerging Infectious Diseases, 2012, 18 (8), pp.1374-1375. ⟨10.3201/eid1808.120442⟩
Article dans une revue hal-00763185 v1
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Parvovirus 4 in French in-patients: a study of haemodialysis and lung transplant cohorts

Mhammed Touinssi , Martine Reynaud-Gaubert , Carine Gomez , Pascal Thomas , Bertrand Dussol et al.
Journal of Medical Virology, 2011, 83 (4), pp.717-721. ⟨10.1002/jmv.22003⟩
Article dans une revue istex hal-00614692 v1

Identification of viral DNA (Anelloviridae) in a 200-year-old dental pulp sample (Napoleon's Great Army, Kaliningrad, 1812)

Sandra Bedarida , Philippe Biagini , Alexandra Buzhilova , Philippe de Micco , Olivier Dutour
Infection, Genetics and Evolution, 2011, 11, pp.358-362. ⟨10.1016/j.meegid.2010.11.007⟩
Article dans une revue istex halshs-00637666 v1
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Recombination in eukaryotic single stranded DNA viruses

Darren P. Martin , Philippe Biagini , Pierre Lefeuvre , Michael Golden , Philippe Roumagnac et al.
Viruses, 2011, 3 (9), pp.1699-1738. ⟨10.3390/v3091699⟩
Article dans une revue halshs-00637518 v1
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Seroprevalence of Toscana virus in blood donors, France, 2007

Nadège Brisbarre , Houssam Attoui , P. Gallian , P. Dibonito , Colomba Giorgi et al.
Emerging Infectious Diseases, 2011, 17 (5), pp.941-3. ⟨10.3201/eid1705.101052⟩
Article dans une revue hal-00678516 v1

Seroprevalence of Toscana Virus in Blood Donors, France, 2007

Nadège Brisbarre , Houssam Attoui , Pierre Gallian , Paola Di Bonito , Colomba Giorgi et al.
Emerging Infectious Diseases, 2011, 17 (5), pp.941 - 943. ⟨10.3201/eid1705.101052⟩
Article dans une revue hal-01817716 v1
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Parvovirus 4 in blood donors, France

Mhammed Touinssi , Nadège Brisebarre , Christophe Picard , Coralie Frassati , Bertrand Dussol et al.
Emerging Infectious Diseases, 2010, 16 (1), pp.165-166. ⟨10.3201/eid1601.090517⟩
Article dans une revue halshs-00638944 v1

La famille des Anelloviridae : virus TTV et genres apparentés

Philippe Biagini , Philippe de Micco
Virologie, 2010, 14 (1), pp.3-16
Article dans une revue halshs-00637946 v1

Analysis of hepatitis C virus strains circulating in republic of the Congo

Jean-François Cantaloube , Pierre Gallian , Amelia Bokilo , François Jordier , Philippe Biagini et al.
Journal of Medical Virology, 2010, 82 (4), pp.562-567. ⟨10.1002/jmv.21724⟩
Article dans une revue istex halshs-00637600 v1

Classification of TTV and related viruses (anelloviruses)

Philippe Biagini
Current Topics in Microbiology and Immunology, 2009, 331, pp.21-33. ⟨10.1007/978-3-540-70972-5_2⟩
Article dans une revue halshs-00637837 v1

Les anellovirus (TTV et variants ) : données actuelles dix ans après leur découverte

Philippe Biagini , Philippe de Micco
Transfusion Clinique et Biologique, 2008, 15, pp.406-415. ⟨10.1016/j.tracli.2008.10.003⟩
Article dans une revue istex halshs-00637762 v1

Human parvovirus 4 in kidney transplant patient, France

Philippe Biagini , Bertrand Dussol , Mhammed Touinssi , Philippe Brunet , Christophe Picard et al.
Emerging Infectious Diseases, 2008, 14 (11), pp.1811-1812. ⟨10.1002/jmv.21069⟩
Article dans une revue istex halshs-00637967 v1

Complete characterisation of the American grass carp reovirus genome (genus Aquareovirus: family Reoviridae) reveals an evolutionary link between aquareoviruses and coltiviruses

Fauziah Mohd Jaafar , Andrew Goodwin , Mourad Belhouchet , Gwenn Merry , Qin Fang et al.
Virology, 2008, 373 (2), pp.310 - 321. ⟨10.1016/j.virol.2007.12.006⟩
Article dans une revue hal-01817723 v1

Molecular characterization of genotype 2 and 4 hepatitis C virus isolates in French blood donors

Jean-François Cantaloube , Pierre Gallian , Syria Laperche , Marie-Hélène Elghouzzi , Yves Piquet et al.
Journal of Medical Virology, 2008, 80, pp.1732-1739
Article dans une revue halshs-00616851 v1

Circular genomes related to anelloviruses identified in human and animal samples by using a combined rolling-circle amplification/sequence-independent single primer amplification approach

Philippe Biagini , Rathviro Uch , Mourad Belhouchet , Houssam Attoui , Jean-François Cantaloube et al.
Journal of General Virology, 2007, 88, pp.2696-2701. ⟨10.1099/vir.0.83071-0⟩
Article dans une revue hal-01076924 v1

Effective detection of highly divergent viral genomes in infected cell lines using a new subtraction strategy (primer extension enrichment reaction—PEER)

Philippe Biagini , Xavier de Lamballerie , Philippe de Micco
Journal of Virological Methods, 2007, 139 (1), pp.106 - 110. ⟨10.1016/j.jviromet.2006.09.010⟩
Article dans une revue istex hal-01817729 v1

Complete nucleotide sequence of Middelburg virus, isolated from the spleen of a horse with severe clinical disease in Zimbabwe

Houssam Attoui , C. Sailleau , F. Mohd Jaafar , M. Belhouchet , P. Biagini et al.
Journal of General Virology, 2007, 88 (11), pp.3078 - 3088. ⟨10.1099/vir.0.83076-0⟩
Article dans une revue hal-01817726 v1

Distribution and genetic analysis of TTV and TTMV major phylogenetic groups in French blood donors

Philippe Biagini , Pierre Gallian , Jean-François Cantaloube , Houssam Attoui , Philippe de Micco et al.
Journal of Medical Virology, 2006, 78 (2), pp.298 - 304. ⟨10.1002/jmv.20539⟩
Article dans une revue istex hal-01817732 v1

Identification of a third member of the Anellovirus genus (“small anellovirus”) in French blood donors

P. Biagini , P. de Micco , X. de Lamballerie
Archives of Virology, 2006, 151 (2), pp.405 - 408. ⟨10.1007/s00705-005-0660-4⟩
Article dans une revue istex hal-01817734 v1

Evolution of hepatitis C virus in blood donors and their respective recipients

Jean-François Cantaloube , Philippe Biagini , Houssam Attoui , Pierre Gallian , Philippe de Micco et al.
Journal of General Virology, 2003
Article dans une revue hal-05295395 v1

Common evolutionary origin of aquareoviruses and orthoreoviruses revealed by genome characterization of Golden shiner reovirus, Grass carp reovirus, Striped bass reovirus and golden ide reovirus (genus Aquareovirus, family Reoviridae)

Houssam Attoui , Qin Fang , Mohd Jaafar Fauziah , Jean-François Cantaloube , Philippe Biagini et al.
Journal of General Virology, 2002
Article dans une revue hal-05295406 v1

Genetic analysis of full-length genomes and subgenomic sequences of TT virus-like mini virus human isolates

Philippe Biagini , Pierre Gallian , Houssam Attoui , Mhammed Touinssi , Jean-François Cantaloube et al.
Journal of General Virology, 2001
Article dans une revue hal-05295518 v1

Lessons from a multicentre study of the detectability of viral genomes based on a two-round quality control of GB virus C (GBV-C)/hepatitis G virus (HGV) polymerase chain reaction assay

Jean-Jacques Lefrère , Joëlle Lerable , Martine Mariotti , Marc Bogard , V. Thibault et al.
Journal of Virological Methods, 2000, 85 (1-2), pp.117-124. ⟨10.1016/s0166-0934(99)00160-3⟩
Article dans une revue istex pasteur-03252077 v1

Complete sequence determination and genetic analysis of Banna virus and Kadipiro virus: proposal for assignment to a new genus (Seadornavirus) within the family Reoviridae

Houssam Attoui , Frédérique Billoir , Philippe Biagini , Philippe de Micco , Xavier de Lamballerie
Journal of General Virology, 2000
Article dans une revue hal-05295760 v1

Determination and phylogenetic analysis of partial sequences from TT virus isolates

Philippe Biagini , Pierre Gallian , Houssam Attoui , Jean-François Cantaloube , Philippe de Micco et al.
Journal of General Virology, 1999
Article dans une revue hal-05295817 v1

GEMHEP multicenter quality control study of PCR detection of GB virus C/hepatitis G virus RNA in serum

Marc Bogard , Claudine Buffet-Janvresse , Jean-François Cantaloube , Philippe Biagini , Gilles Duverlie et al.
Journal of Clinical Microbiology, 1997, 35 (12), pp.3298-3300. ⟨10.1128/jcm.35.12.3298-3300.1997⟩
Article dans une revue pasteur-03252056 v1

GEMHEP multicenter quality control study of PCR detection of GB virus C/hepatitis G virus RNA in serum

M Bogard , C Buffet-Janvresse , J Cantaloube , P Biagini , G Duverlie et al.
Journal of Clinical Microbiology, 1997, 35 (12), pp.3298-3300. ⟨10.1128/jcm.35.12.3298-3300.1997⟩
Article dans une revue hal-03613708 v1