Philippe Ruiz

Identifiants chercheurs

IdHAL :

phruiz

ORCID :

0000-0002-5149-9775

Publications

Pré-publication, Document de travail (1)

Escobase and AcR: Escherichia coli databases of genomes and acid resistance genes from isolates from cattle farms Lucile Martin,Philippe Ruiz,Sabine Leroy,Sapountzis Panagiotis 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04990599v1

Poster de conférence (4)

Microbial transfers in dairy systems under changing climate and farming practices Sébastien Theil,Mahendra Mariadassou,Philippe Ruiz,Guillaume Kon Kam King,Matthieu Bouchonet al. JOBIM 20025, Jul 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05168268v1
Microbial transfers in dairy systems under changing climate and farming practices Sébastien Theil,Mahendra Mariadassou,Philippe Ruiz,Guillaume Kon Kam King,Matthieu Bouchonet al. FROGS Days, Dec 2025, Toulouse, France Poster de conférence hal-05462857v1
The Genotoul-Bioinfo platform Florent Blaise,Philippe Bordron,Patrice Dehais,Vincent Dominguez,Christine Gaspinet al. JOBIM2025, Jul 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05163782v1
FAIRing Research Data to Live @AuBi Platform Francis Ogereau,Mateo Hiriart,Pierre Marin,Bérénice Batut,Cléa Siguretet al. JOBIM, Jun 2024, Toulouse (FR), France Poster de conférence hal-04643973v1

Article dans une revue (2)

Evaluation of esophageal tubing and buccal swabbing versus rumen cannula to characterize ruminal microbiota in cows fed contrasting diets Lysiane Dunière,Philippe Ruiz,Frédérique Chaucheyras-Durand,Mathieu Silberberg,Anne Boudonet al. Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.34582. ⟨10.1038/s41598-025-18063-1⟩ Article dans une revue hal-05310805v1
Transcriptomic analysis of the interactions between Fibrobacter succinogenes S85, Selenomonas ruminantium PC18 and a live yeast strain used as a ruminant feed additive Pauline Desvignes,Philippe Ruiz,Laurie Guillot,Jeanne Danon,Alexandra Durandet al. BMC Genomics, 2025, 26 (1), pp.721. ⟨10.1186/s12864-025-11894-2⟩ Article dans une revue hal-05212728v1

Logiciel (1)

metagWGS Jean Mainguy,Maïna Vienne,Joanna Fourquet,Pierre Martin,Vincent Darbotet al. 2024, ⟨swh:1:dir:4ac81dae5fd868ea7969796dea30de32c76ff170;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04694918;visit=swh:1:snp:2c5d39d733f88b185b285b21578d288c1f9d9ffa;anchor=swh:1:rel:a55bc4a3ca3ff027a6ded3b1de3fb7bcff1f0bc7;path=/⟩ Logiciel hal-04694918v1

Communication dans un congrès (2)

TANDEM : Flux microbiens au sein d’une chaîne alimentaire Anne-Laure Abraham,Juliette Bloor,Céline Delbès,Annick Bernalier Donadille,Matthieu Bouchonet al. Journées Portes Ouvertes UMRF, Jun 2023, Aurillac, France Communication dans un congrès hal-04221497v1
Packages R pour contrôler son travail et ainsi mieux optimiser, réutiliser et communiquer autour de ses analyses Cédric Midoux,Philippe Ruiz Journées du PEPI IBIS, PEPI IBIS, Sep 2023, Paris, France Communication dans un congrès hal-04229825v1