Accéder directement au contenu

Pierrick Haffray

99
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

After 3 years as biologist in the INRA-Ifremer experimental station of marine salmonids (SEMII, Camaret, France) and in the rainbow trout companies Pisciculture Bellet (Angoulême, France) and Truite de Bretagne (Morlaix, France), I joined (1990) the French association of poultry and aquaculture breeders (SYSAAF, Rennes, France) to develop first commercial breeding programs in the French aquaculture, primarily in salmonids as rainbow trout or charrs, followed by marine fishes as sea bass, sea bream or meagre (1992), sturgeons (1996), Pacific or flat oyster and clam (2001) and shrimps (2009). I'm now managing a team of 6 geneticist and 3 PhD students at the Aquaculture section of SYSAAF that advise 25 breeding companies selecting 18 aquaculture species in France and in Madagascar, Mozambique, Mexico, Thailand and in the past in Indonesia. My main research interests were the adaptation of principles of domestication and genetic selection to aquaculture species in using DNA-parentage assignment in combining mass and sib-selection, the development of high through put technologies to phenotype quality traits (micro-wave, artificial vision, ultrasound, MRI, RMN), the optimisation of gametes collection and larval conservation and cryoconservation, the monosexing and the triploidisation and recently (since 2014) the improvement of disease resistances to nine different diseases based on challenge tests (OHsV1, IPN, VHS, VNN, F. psychrophilum, P. piscicidae, E. tarda, V. harveyi, V. tapetis) and sib selection. My current primary research interests are the development and the application of genomic tools in genomic selection in different species (rainbow trout, sea bass, sea bream, Pacific oyster, white leg shrimp), the application of spectrometry (NIR, Raman) to target new traits as fatty acid composition to improve aquaculture nutritional value and since the two years the breeding of pearl oyster. Past Board member of the European Forum for Farm Animal Breeders (EFFAB), the European platform on Farm Animal Breeding and REproduction (FABRE) and the Labogena genotyping laboratory, I'm co-authored over 100 scientific publications and I was awarded (2019) by the French Academy of Agriculture for my inputs in the development of breeding programs in aquaculture.

Publications

mathilde-dupont-nivet
Image document

Prediction of fatty acids composition in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss by using Raman micro-spectroscopy

E. Prado , Christophe Eklouh-Molinier , Florian Enez , David Causeur , C. Blay
Analytica Chimica Acta, 2022, 1191, ⟨10.1016/j.aca.2021.339212⟩
Article dans une revue hal-03445774v1
Image document

Realised genetic gains on growth, survival, feed conversion ratio and quality traits after ten generations of multi-trait selection in rainbow trout Oncorhynchus mykiss, fed a standard diet or a “future” fish-free and soy-free diet

Marc Vandeputte , Geneviève Corraze , Jérôme Doerflinger , Florian Enez , Frédéric Clota
Aquaculture Reports, 2022, 27, pp.101363. ⟨10.1016/j.aqrep.2022.101363⟩
Article dans une revue hal-03812229v1
Image document

Genetic architecture and genomic selection of fatty acid composition predicted by Raman spectroscopy in rainbow trout

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jonathan D’ambrosio , Enora Prado , Nicolas Dechamp
BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.788. ⟨10.1186/s12864-021-08062-7⟩
Article dans une revue hal-03432316v1
Image document

Genetic parameters and genome-wide association studies of quality traits characterised using imaging technologies in Rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Jonathan D’ambrosio , Nicolas Dechamp
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.1-17. ⟨10.3389/fgene.2021.639223⟩
Article dans une revue hal-03154333v1
Image document

How to genetically increase fillet yield in fish: Relevant genetic parameters and methods to predict genetic gain

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal
Aquaculture, 2020, 519, pp.734877. ⟨10.1016/j.aquaculture.2019.734877⟩
Article dans une revue hal-03150887v1

Genetic architecture and genomic selection of female reproduction traits in rainbow trout

J. D’ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , A. Acin Perez
BMC Genomics, 2020, 21 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s12864-020-06955-7⟩
Article dans une revue hal-02938176v1
Image document

First evidence of realized selection response on fillet yield in Rainbow trout Oncorhynchus mykiss, Using Sib selection or based on correlated ultrasound measurements

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamellou
Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2019.01225⟩
Article dans une revue hal-02627462v1
Image document

Genome-wide estimates of genetic diversity, inbreeding and effective size of experimental and commercial rainbow trout lines undergoing selective breeding

Jonathan D’ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , Sophie Brard-Fudulea
Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.26. ⟨10.1186/s12711-019-0468-4⟩
Article dans une revue hal-02151750v1

Accuracy of BLUP breeding values in a factorial mating design with mixed families and marker-based parentage assignment in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Pierrick Haffray , Florian Enez , Jérôme Bugeon , Hervé Chapuis , Mathilde Dupont-Nivet
Aquaculture, 2018, 490, pp.350-354. ⟨10.1016/j.aquaculture.2018.03.003⟩
Article dans une revue hal-01764389v1

How to genetically increase fillet yield in fish: New insights from simulations based on field data

Clémence Fraslin , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , Marc Vandeputte
Aquaculture, 2018, 486, pp.175-183. ⟨10.1016/j.aquaculture.2017.12.012⟩
Article dans une revue hal-01674984v1
Image document

Metapopulation patterns of additive and nonadditive genetic variance in the sea bass (Dicentrarchus labrax)

Bruno Guinand , Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Alain Vergnet , Pierrick Haffray
Ecology and Evolution, 2017, 7 (8), pp.2777-2790. ⟨10.1002/ece3.2832⟩
Article dans une revue hal-01606597v1

Multi-site evaluation of the rearing performances of 5 wild populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Marc Vandeputte , Romain R. Garouste , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Alain A. Vergnet
Aquaculture, 2014, 424-425, pp.239-248. ⟨10.1016/j.aquaculture.2014.01.005⟩
Article dans une revue hal-01004791v1

Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo
Aquaculture, 2013, 410-411, pp.236-244. ⟨10.1016/j.aquaculture.2013.06.016⟩
Article dans une revue hal-00877146v1

Heritabilities and correlations of deformities and growth related traits in the European sea bass (Dicentrarchus labrax, L.) in four different sites

Bilge B. Karahan , Béatrice B. Chatain , Hervé H. Chavanne , Alain A. Vergnet , Agnès A. Bardon
Aquaculture Research, 2013, 44 (2), pp.289-299. ⟨10.1111/j.1365-2109.2011.03082.x⟩
Article dans une revue hal-01000404v1

Negative genetic correlations between production traits and head or bony tissues in large all-female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Emmanuel Mazeiraud
Aquaculture, 2012, 368-369, pp.145-152. ⟨10.1016/j.aquaculture.2012.09.023⟩
Article dans une revue hal-01000352v1

Minimizing maternal effect in salmonid families mixed since eyed stage and a posteriori DNA-pedigreed

Pierrick Haffray , Marc Vandeputte , V. V. Petit , Cédric C. Pincent , Beatrice B. Chatain
Livestock Science, 2012, 150 (1-3), pp.170-178. ⟨10.1016/j.livsci.2012.08.017⟩
Article dans une revue hal-01000366v1

Side effects of sexual maturation on heritability estimates in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Mathilde Dupont-Nivet , Bernard Chevassus-Au-Louis , Stéphane Mauger , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
Aquaculture Research, 2010, 41 (11), pp.e878-e880. ⟨10.1111/j.1365-2109.2009.02448.x⟩
Article dans une revue hal-01193666v1

Genotype by environment interactions for growth in European seabass (Dicentrarchus labrax) are large when growth rate rather than weight is considered

Mathilde Dupont-Nivet , Bilge Karahan-Nomm , Alain Vergnet , Olivier Merdy , Pierrick Haffray
Aquaculture, 2010, 306 (1-4), pp.365-368. ⟨10.1016/j.aquaculture.2010.05.025⟩
Article dans une revue hal-01193440v1
Image document

Genetic variation for carcass quality traits in cultured sea bass (Dicentrarchus labrax)

Eric Saillant , Mathilde Dupont-Nivet , Marie Sabourault , Pierrick Haffray , Stanislas Laureau
Aquatic Living Resources, 2009, 22 (1), pp.105-112. ⟨10.1051/alr/2009010⟩
Article dans une revue hal-01193427v1

Response to domestication and selection for growth in the European sea bass (Dicentrarchus labrax) in separate and mixed tanks

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Hervé Chavanne , Silvia Cenadelli
Aquaculture, 2009, 286 (1-2), pp.20-27. ⟨10.1016/j.aquaculture.2008.09.008⟩
Article dans une revue hal-02663646v1
Image document

What is the heritable component of spinal deformities in the European sea bass (Dicentrarchus labrax)?

Agnès Bardon , Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Hervé Chavanne , Pierrick Haffray
Aquaculture, 2009, 294 (3-4), pp.194-201. ⟨10.1016/j.aquaculture.2009.06.018⟩
Article dans une revue hal-01193361v1

Heritabilities and GxE interactions for growth in the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) using a marker-based pedigree

Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Alain Vergnet , Olivier Merdy , Pierrick Haffray
Aquaculture, 2008, 275 (1-4), pp.81-87. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.12.032⟩
Article dans une revue hal-02666809v1

Effect of different mating designs on inbreeding, genetic variance and response to selection when applying individual selection in fish breeding programs.

Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Pierrick Haffray , B. Chevassus
Aquaculture, 2006, 252, pp.161-170
Article dans une revue hal-02654282v1

Estimates of heritability and genotype-environment interactions for body weight in sea bass (Dicentrarchus labrax L.) raised under communal rearing conditions.

E. Saillant , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Béatrice Chatain
Aquaculture, 2006, 254, pp.139-147
Article dans une revue hal-02656150v1
Image document

GENOME WIDE ASSOCIATION STUDIES OF PRODUCTION TRAITS IN RAINBOW TROUT USING WHOLE GENOME SEQUENCING

Valentin Thomas , Florian Enez , Pierrick Haffray , Boudjema Imarazene , Mathilde Dupont-Nivet
Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-04386683v1

Evolution des performances de la truite arc-en-ciel après 10 générations de sélection et réponse à un aliment standard ou « futur » sans produits de poisson ni soja

Marc Vandeputte , Geneviève Corraze , Jérôme Doerflinger , Florian Enez , Frédéric Clota
7èmes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04185413v1
Image document

GENETIC PARAMETERS AND GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY OF RESISTANCE TO ACUTE HYPERTHERMIA IN RAINBOW TROUT

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Pierre Patrice , Martin Prchal , Yoannah François
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-03779084v1
Image document

UNE SÉLÉCTION SUR LA PERFORMANCE TRIPLOÏDES EST-ELLE NÉCESSAIRE EN TRUTTICULTURE ?

Pierre Patrice , Yoannah François , Pierrick Haffray , Thierry Morin , Mathilde Dupont-Nivet
7emes Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04386701v1
Image document

Effect of 10 generations of selection on growth, feed efficiency, processing and lipid traits in rainbow trout fed a standard or a "future" fish-free, soy-free diet

Marc Vandeputte , Geneviève Corraze , Jérôme Doerflinger , Florian Enez , Frédéric Clota
International Symposium on Genetics In Aquaculture 2022, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-04178939v1
Image document

GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY OF HYPOXIA STRESS TOLERANCE IN RAINBOW TROUT

Martin Prchal , Delphine Lallias , Henri Lagarde , Jonathan D’ambrosio , Pierre Patrice
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal (Madeira), Portugal
Communication dans un congrès hal-03778912v1

Evaluation of genetic gain in rainbow trout fed standard of “future” diet after 10 generations of multi-trait selection in the Aqualande selective breeding program

Marc Vandeputte , Geneviève Corraze , Jérôme Doerflinger , Florian Enez , Frédéric Clota
Aquaculture Europe 2020 Online, Apr 2021, Cork, Ireland
Communication dans un congrès hal-03187469v1

Réponse à 10 générations de sélection multicaractères chez la truite chez Aqualande

Marc Vandeputte , Geneviève Corraze , Florian Enez , Pierrick Haffray , Jérôme Doerflinger
Journées techniques du Sysaaf, Dec 2020, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03187464v1

Prediction of fatty acids in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss: a Raman scattering spectroscopy approach

E. Prado , Christophe Eklouh-Molinier , Florian Enez , C. Blay , Mathilde Dupont-Nivet
22. International Conference on Transparent Optical Networks (ICTON), Jul 2020, Bari, Italy. pp.1-4, ⟨10.1109/ICTON51198.2020.9203514⟩
Communication dans un congrès hal-02948337v1

Successful realized selection response for fillet yield in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sébastien Courant
World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02264916v1
Image document

Factors of variation of genomic selection accuracy for female reproduction traits with a constant reference population size of rainbow trouts

Jonathan d'Ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray
Gordon Research Conference - Quantitative genetics and genomics, Feb 2019, Lucca, Italy
Communication dans un congrès hal-02788345v1

Réponse à la sélection sur le rendement de filet chez la truite arc-en-ciel

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamelou
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02734410v1
Image document

Development of genomic predictions for female reproduction traits in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Jonathan d'Ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray
Gordon Research conference - Quantitative genetics and genomics, Feb 2019, Lucca, Italy
Communication dans un congrès hal-02787972v1

How to genetically increase fillet yield in fish: relevant genetic parameters and methods for the estimation of genetic gain

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal
Aquaculture Europe 2019, Oct 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-03187446v1

Intégration de caractères de résistance à cinq pathologies dans les schémas de sélection commerciale de truite, bar et daurade

Anastasia Bestin , Yoannah François , Thierry Morin , Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02264929v1

Interaction génotype x aliment: que sait-on, où va-t-on ?

Marc Vandeputte , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal , Mathilde Dupont-Nivet
Journée du SFAM, Mar 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03187439v1

Genetic parameters of resistance to gastroenteritis (rtge) and rainbow trout fry syndrome (rtfs) in rainbow trout oncorhynchus mykiss and their genetic correlations with production traits

Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , Florian Enez , Sébastien Courant , Daniel Guemene
World Aquaculture 2018, Aug 2018, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02738108v1
Image document

A first demonstration of realized selection response for fillet yield in fish, in rainbow trout oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sebastien Courant
13. International Symposium for Genetics in Aquaculture (ISGA XIII), Jul 2018, Cairns, Australia
Communication dans un congrès hal-02264933v1
Image document

Heterogeneity of genetic diversity throughout the genome in rainbow trout populations

Jonathan d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin
International symposium of Genetics in Aquaculture, International Association for Genetics in Aquaculture (IAGA). INT., Jul 2018, Cairns, Australia
Communication dans un congrès hal-02735029v1

Genomic estimates of diversity between and within french rainbow trout populations

J. d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin
Aqua 2018 - World Aquaculture Society Meeting, Aug 2018, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02193895v1

Implementing successful aquaculture breeding programs: the keys to success in France

Marc Vandeputte , François Allal , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray
XVI congreso nacional de acuicultura - Journée Franco Espagnole, Oct 2017, Saragosse, Spain
Communication dans un congrès hal-02734602v1
Image document

Peut-on sélectionner sur le rendement de filet chez les poissons ? (et chez le bar en particulier)

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Jérôme Bugeon , François Allal , Antonio Puledda
Journée du SFAMN (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2017, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03155369v1

Can we select fish for improved fillet yield? A simulation study using base data from three different species

Clémence Fraslin , Mathilde Dupont-Nivet , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-01605575v1

How can we select for fillet yield in fish ? A simulation study

Clémence Fraslin , Mathilde Dupont-Nivet , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
Fish Breeders' Round Table, Jun 2016, Tromso, Norway
Communication dans un congrès hal-02799957v1
Image document

Genotype by diet interactions on growth and processing traits in rainbow trout ([i]Oncorhynchus mykiss[/i]), European sea bass ([i]Dicentrarchus labrax[/i]), gilthead sea bream ([i]Sparus aurata[/i]) and meagre [i](Argyrosomus regius)[/i] fed diets with almost complete substitution of both fish meal and fish oil by vegetal ingredients

Anastasia Bestin , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Françoise Médale , Edwige Quillet
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-01194150v1

SELTIC : SELection chez la Truite Arc-en-Ciel pour l'Indice de Conversion

Pierrick Haffray , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Jérôme Doerflinger , Benjamin Braud
20. Journées Techniques Piscicoles du SYSAAF, Mar 2013, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01019175v1

Genetic parameters of lipids heterogeneity estimated by direct (MRI) or indirect (artificial vision, Fat Meter) technologies in the fillet of large rainbow trout

Pierrick Haffray , Antoine Chevrel , Benjamin Quittet , F. Cachelou , G. Collewet
Aquaculture conference, Oct 2013, Gran Canaria, Spain
Communication dans un congrès hal-02598817v1
Image document

Domestication and selection for growth induce a genetic sex-ratio shift towards females in a European sea bass (Dicentrarchus labrax) population

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Hervé Chavanne , Pierrick Haffray , Edwige Quillet
Aqua 2012, Sep 2012, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02803375v1

Reprint of: Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i]

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2012, Auburn, United States. ⟨10.1016/j.aquaculture.2014.01.016⟩
Communication dans un congrès hal-01193810v1

Heart morphology and malformations genetic parameters in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), genetic correlations with production traits

Benjamin Quittet , Pierrick Haffray , Hervé H. Chapuis , Paul P. Rault , Emmanuel E. Mazeiraud
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.24
Communication dans un congrès hal-01001225v1

Selecting for processing yields: genetic parameters of non lethal indirect criteria in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Marc Vandeputte
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.37
Communication dans un congrès hal-01019822v1

"Qualitytruite" : l'IRM comme méthode de quantification rapide du gras intramusculaire et du tissu adipeux sous cutané des darnes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Guylaine G. Collewet , Jérôme Bugeon , Jérôme J. Idier , Stéphane S. Quellec , Benjamin Quittet
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.83
Communication dans un congrès hal-01000325v1

Remplacement des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité de la chair de truite et de bar

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01191201v1

Origine des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité des chairs de truite et de bar

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé
14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., Nov 2012, Caen, France
Communication dans un congrès hal-01190249v1
Image document

Modification of population sex ratios by domestication and artificial selection in the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.)

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , H Chavanne , A. Vergnet
Colloque de la Société Française de Génétique "Genetics, Epigenetics and Evolution of Sex Chromosomes", Jun 2011, Paris, France. pp.Poster
Communication dans un congrès hal-01019743v1

Interactions génotype-milieu sur la croissance chez le bar

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Alain Vergnet , A. Vidal , H. Chavanne
Journée Technique Piscicole Sysaaf, Jan 2011, Paris, France. 14 diapositives
Communication dans un congrès hal-01019347v1
Image document

Can we obtain monosex sea bass populations through selective breeding?

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , H. H. Chavanne , A. A. Vergnet
62. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway. pp.328
Communication dans un congrès hal-01001399v1

Comment sélectionner pour la qualité ? Quelles évolutions ?

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. H. Chavanne , Pierrick Haffray
Rencontres de l'aquaculture, May 2011, Le Touquet, France. 14 p
Communication dans un congrès hal-01001157v1

Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program

Jérôme Bugeon , Georges Choubert , Cédric Pincent , Béatrice Chatain , Vincent Petit
Digital imaging in fisheries biology, Sep 2010, Písek, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-01193650v1

Effect of culling on bias of BLUP estimates - case of fish species.

Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2010, Leipzig, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02819873v1
Image document

Selection for an improved disease resistance using factorial mating designs and molecular based pedigree in fish: a simulation study

Hervé Chapuis , Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Edwige Quillet
9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-01193740v1

Genetic parameters for growth and flesh quality traits in large freshwater-reared rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) groups, mass selected or not for growth

Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon
10. International Symposium on Genetics in Aquaculture (IAGA), Jun 2009, Bangkok, Thailand
Communication dans un congrès hal-01193550v1

Amélioration génétique du bar : performances en élevage de souches sauvages, réponses directes et corrélées à la sélection croissance

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Jean-Denis Porte , Romain Garouste , Sandie Millot
20. Journées Techniques du Sysaaf, Mar 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193733v1

Pas de modification de qualité technologique chez les poissons sélectionnés pour la croissance : exemples de la truite fario et du bar

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray
2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193498v1

Impact of non genetic maternal effects on juvenile growth in rainbow trout Oncorhynchus mykiss.

Pierrick Haffray , V. Petit , Cédric Pincent , Béatrice Chatain , Marc Vandeputte
5th fish & shellfish larviculture symposium, 7-10 September 2009, Sep 2009, Ghent, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02811566v1

Comparaison multilocale des performances en élevage de cinq populations naturelles de bar.

Marc Vandeputte , R. Garouste , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , A. Vergnet
2èmes Journées Recherche Filière Piscicole, 1-2 juillet 2009, Jul 2009, Paris, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-01193453v1

Effets de la domestication et de la sélection chez le bar

Béatrice Chatain , Mathilde Dupont-Nivet , Jean-Denis Porte , Benoît Aupérin , Alain Vergnet
Séminaire "Domestication et durabilité en aquaculture", Nov 2009, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01193737v1

Amélioration de la sélection individuelle par indexation sur collatéraux: application aux critères de qualité.

Pierrick Haffray , Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent
Congrès du SFAMN Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle, Mar 2009, Montpellier, France. n.p
Communication dans un congrès hal-01193566v1

Estimations de paramètres génétiques : attention aux effets de la maturation sexuelle !

Mathilde Dupont-Nivet , B. Chevassus-Au-Louis , S. Mauger , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
2èmes journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-01193398v1

Multi-local evaluation of the rearing performances of 5 natural populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax).

Marc Vandeputte , R. Garouste , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Hervé Chavanne
10th International Symposium for Genetics in Aquaculture, 23-26 juin 2009, Jun 2009, Bangkok, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02817012v1

"Qualitytruite" : Élaboration d'une méthode de sélection sur les rendements de découpe et la qualité de la chair combinant sélection massale et familiale

Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon
2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193466v1

Processing quality of selected fish: quasi-absence of correlated responses to selection for growth in the brown trout [i]Salmo trutta[/i] and in the sea bass [i]Dicentrarchus labrax[/i]

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray
Aquaculture Europe 09, Aug 2009, Trondheim, Norway
Communication dans un congrès hal-01193574v1

Quantitative genetic determinism of sex-ratio in the European seabass (Dicentrarchus labrax L.)

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , O. Merdy , Pierrick Haffray , H. Chavanne
9. International Symposium on Genetics in Aquaculture, 2007, Montpellier, France. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.07.195⟩
Communication dans un congrès hal-02754908v1

Le bar, une espèce à fort potentiel pour l'amélioration génétique.

Béatrice Chatain , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , A. Vergnet , Olivier Merdy
1ères Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2007, Paris, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02820014v1

La sélection sur le sexe chez le bar : comment produire des populations riches en femelles ?

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Hervé Chavanne , Pierrick Haffray , Béatrice Chatain
1ères Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2007, Paris, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02820053v1

Response of sea bass to selection.

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , A. Vergnet , Morgane Vidal , Pierrick Haffray
2nd Meeting of Project Competus, 2006, Milano, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02816551v1
Image document

Heritabilities and G×E interactions for growth in the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.)

Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Alain Vergnet , Olivier Merdy , Pierrick Haffray
9. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2006, Montpellier, France. pp.S253-S254, ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.07.053⟩
Communication dans un congrès hal-02753042v1

Prosper+/Qualitytruite : Evaluation et amélioration de la procédure de sélection PROSPER: optimisation des méthodes actuelles et introduction d'indexations sur collatéraux sur des critères de qualité.

Pierrick Haffray , H. Chapuis , M. Jegaden , V. Petit , J. Doerflinger
Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Oct 2006, Paris, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02823838v1

Premières estimations d'héritabilité et d'interactions génotype environnement pour le poids chez le bar.

E. Saillant , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Béatrice Chatain
Journée du SFAM, 10 mars 2005, Mar 2005, Montpellier, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02825358v1
Image document

IMPROVING RESISTANCE TO ACUTE HYPERTHERMIA BY GENOMIC SELECTION TO ADAPT RAINBOW TROUT LINES TO CLIMATE CHANGE

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Pierre Patrice , Martin Prchal , Yoannah François
International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile.
Poster de conférence hal-03778988v1
Image document

IS SELECTION ON TRIPLOID INDIVIDUALS PERFORMANCES USEFUL IN RAINBOW TROUT (ONCORHYNCHUS MYKISS) BREEDING PROGRAMS?

Pierre Patrice , Yoannah François , Alexandre Desgranges , G. Labbé , Pierrick Haffray
International Symposium on Genetics In Aquaculture 2022, Nov 2022, Puerta Varas, Chile.
Poster de conférence hal-04178952v1

Estimation de la diversité génétique entre et intra lignées françaises de truite arc en ciel

Jonathan d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019, Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-02264930v1
Image document

Factors of variation of genomic selection accuracy for female reproduction traits with a constant reference population size of rainbow trouts

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Sophie Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray
Gordon Research Conference on Quantitative Genetics and Genomics, Feb 2019, Lucca (Barga), France
Poster de conférence hal-04386586v1
Image document

Development of genomic predictions for female reproduction traits in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Sophie Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray
Gordon Research Conference on Quantitative Genetics and Genomics, Feb 2019, Lucca (Barga), Italy
Poster de conférence hal-04386578v1

Déterminisme génétique et sélection génomique des caractères de reproduction femelle chez la truite arc-en-ciel

J. d'Ambrosio , Romain Morvezen , A. Perez , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin
6. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019
Poster de conférence hal-02193908v1

Comparative additive genetic basis of high feed substitution by plant ingredients in four major fish species farmed in temperate and southern Europe

Anastasia Bestin , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Edwige Quillet , Marc Vandeputte
Aquaculture Europe 2014, Oct 2014, Saint Sébastien, Spain. , pp.136, 2014, Adding value. Abstracts
Poster de conférence hal-01193981v1

Variabilité génétique de la capacité de quatre espèces piscicoles à utiliser de l'aliment à forts taux de végétaux

Anastasia Bestin , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Edwige Quillet , Marc Vandeputte
4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2014, Paris, France. , 2014, 4èmes Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-01193851v1
Image document

Modélisation de l’efficacité d’une sélection contre la mortalité avec génotypage a posteriori des candidats et collatéraux soumis à un challenge

Hervé Chapuis , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte , Edwige Quillet
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.105-105, 2012, 3èmes Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-01190198v1
Image document

Quantification of intramuscular fat and subcutaneous adipose tissue in rainbow trout using MRI and vision

G. Collewet , Jérôme Bugeon , J. Idier , S. Quellec , Benjamin Quittet
1. Annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability, Sep 2012, Dublin, Ireland. 2012, First annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability
Poster de conférence hal-02600018v1

Genetic parameters of indirect criteria for improving feed efficiency in rainbow trout: body weight variations during feed deprivation and refeeding periods

Mathilde Dupont-Nivet , Benjamin Braud , Benjamin Quittet , J. Doerflinger , V. Petit
11th International Symposium for Genetics in Aquaculture, Jun 2012, Auburn, United States. , 2012
Poster de conférence hal-01190256v1

Paramètres génétiques de critères indirects pour améliorer l’efficacité alimentaire chez la truite arc-en-ciel : variations du poids pendant le jeune et la croissance compensatrice

Mathilde Dupont-Nivet , Benjamin Braud , Benjamin Quittet , J. Doerflinger , V. Petit
3èmes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. , 2012
Poster de conférence hal-01190255v1
Image document

Genotype x environment interactions for growth rate in European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Marc Vandeputte , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Alain Vergnet , Hervé Chavanne
Aquaculture Europe 2010 (EAS) « Seafarming tomorrow », Oct 2010, Porto, Portugal. pp.1-3, 2010
Poster de conférence hal-02813995v1

Effect of pre-selection for growth on the bias of BLUP estimates of breeding values for a secondary trait

Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte
Aquaculture Europe 2010, Oct 2010, Porto, Portugal. , 2010
Poster de conférence hal-02754971v1