SA

Sandrine Auger

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Présentation

Etude de la régulation de l’expression génétique et de l’adaptation du métabolisme bactérien en réponse à des variations environnementales : de la microbiologie expérimentale à la bioinformatique intégrative.

Projets de recherche

2018- Diversité des souches de F. prausnitzii dans le microbiote intestinal humain.

Responsable de la tâche bioinformatique WP1.2 dans le projet Carnot-Qualiment BP Acetate coordonné par E. Huillet. "Développement de co-cultures bactériennes pour

potentialiser la biomasse et les effets santé de bactéries intestinales anaérobie strictes".

2017-2018 Impact de la réponse nitrogène sur les bactéries du microbiote intestinal humain.

2010-2017 Interconnexions des réseaux de régulation de voies métaboliques chez B. subtilis.

Responsable de la tâche WP6 dans le programme Marie Curie Initial Training Network FP7/2012 AMBER coordonné par L. Hamoen. "Central carbon metabolism and main cellular processes in B. subtilis". 2013-2016.

Participation au projet européen BaSyntheccoordonné par P. Noirot. "Bacterial Synthetic minimal genomes for biotechnology". 2010-2013

Participation au projet européen BaSysBio coordonné par P. Noirot. "Towards an understanding of dynamic transcriptional regulation at global scale in bacteria: a systems biology approach". 2010-2011

2005-2009 Evolution des génomes au sein du groupe B. cereus.

Participation au projet national PNRA B. cereus coordonné par C. Nguyen. "Nouvelle approche et nouveaux outils pour étudier l’émergence d’une bactérie pathogène dans les filières alimentaires. Le cas de B. cereus dans les produits non stériles traités thermiquement". 2005-2008

2003-2005 Formation de biofilms par B. cereus sur substrats inertes.

1999-2003 Caractérisation de gènes impliqués dans le métabolisme du soufre chez B. subtilis.

Publications

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Faecalibacterium duncaniae as a novel next generation probiotic against influenza

Loïc Chollet , Séverine Heumel , Lucie Deruyter , Fabrice Bouilloux , Lou Delval et al.
Frontiers in Immunology, 2024, 15, pp.1347676. ⟨10.3389/fimmu.2024.1347676⟩
Article dans une revue hal-04786870 v1

The Tolerance of Gut Commensal Faecalibacterium to Oxidative Stress Is Strain Dependent and Relies on Detoxifying Enzymes

Tatiana Botin , Luis Ramirez-Chamorro , Jasmina Vidic , Philippe Langella , Isabelle Martin-Verstraete et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2023, 89 (7), pp.e00606-23. ⟨10.1128/aem.00606-23⟩
Article dans une revue hal-04189195 v1

Faecalibacterium : a bacterial genus with promising human health applications

Rebeca Martín , David Rios-Covian , Eugénie Huillet , Sandrine Auger , Sarah Khazaal et al.
FEMS Microbiology Reviews, 2023, 47 (4), pp. 1-18. ⟨10.1093/femsre/fuad039⟩
Article dans une revue hal-04189185 v1
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Exploring Disease Management and Control through Pathogen Diagnostics and One Health Initiative : A Concise Review

Riya Mukherjee , Jasmina Vidic , Sandrine Auger , Hsiao-Chuan Wen , Ramendra Pati Pandey et al.
Antibiotics, 2023, 13 (1), pp.17. ⟨10.3390/antibiotics13010017⟩
Article dans une revue hal-04664074 v1
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Colorimetric aptasensor for detection of Bacillus cytotoxicus spores in milk and ready-to-use food

Francesco Rizzotto , Marco Marin , Christine Péchoux , Sandrine Auger , Jasmina Vidic
Heliyon, 2023, 9 (7), pp.e17562. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e17562⟩
Article dans une revue hal-04189190 v1

Intraspecific Diversity of Microbial Anti-Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii

Sandrine Auger , Camille Kropp , Esther Borras-Nogues , Wasaporn Chanput , Gwenaelle Andre-Leroux et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (3), pp.1705. ⟨10.3390/ijms23031705⟩
Article dans une revue hal-03752257 v1
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Impact of Dietary Arachidonic Acid on Gut Microbiota Composition and Gut–Brain Axis in Male BALB/C Mice

Katleen Pinchaud , Zeeshan Hafeez , Sandrine Auger , Jean-Marc Chatel , Sead Chadi et al.
Nutrients, 2022, 14 (24), pp.5338. ⟨10.3390/nu14245338⟩
Article dans une revue hal-04083922 v1
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Gene co-expression network analysis of the human gut commensal bacterium Faecalibacterium prausnitzii in R-Shiny

Sandrine Auger , Virginie Mournetas , Hélène Chiapello , Valentin Loux , Philippe Langella et al.
PLoS ONE, 2022, 17 (11), pp. e0271847. ⟨10.1371/journal.pone.0271847⟩
Article dans une revue hal-04083924 v1
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Description of a Newly Isolated Blautia faecis Strain and Its Benefit in Mouse Models of Post-Influenza Secondary Enteric and Pulmonary Infections

Sophie Verstraeten , Valentin Sencio , Audrey Raise , Eugénie Huillet , Séverine Layec et al.
Nutrients, 2022, 14 (7), pp.1478. ⟨10.3390/nu14071478⟩
Article dans une revue hal-03649191 v1
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Metal oxide nanoparticles for safe active and intelligent food packaging

Maria Vesna Nikolic , Zorka Vasiljevic , Sandrine Auger , Jasmina Vidic
Trends in Food Science and Technology, 2021, 116, pp.655-668. ⟨10.1016/j.tifs.2021.08.019⟩
Article dans une revue hal-03798880 v1

Bacillus subtilis Regulators MntR and Zur Participate in Redox Cycling, Antibiotic Sensitivity, and Cell Wall Plasticity

Paola Randazzo , Jamila J. Anba-Mondoloni , Anne Aubert-Frambourg , Alain Guillot , Christine Péchoux et al.
Journal of Bacteriology, 2020, 202 (5), ⟨10.1128/JB.00547-19⟩
Article dans une revue hal-02889085 v1
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Prophylactic Faecalibacterium prausnitzii treatment prevents the acute breakdown of colonic epithelial barrier in a preclinical model of pelvic radiation disease

Alexia Lapiere , Mallia Geiger , Véronique Robert , Christelle Demarquay , Sandrine Auger et al.
Gut microbes, 2020, 12 (1), pp.1-15. ⟨10.1080/19490976.2020.1812867⟩
Article dans une revue hal-03194901 v1
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Synthesis and antibacterial activity of iron manganite (FeMnO 3 ) particles against the environmental bacterium Bacillus subtilis †

Zorka Z Vasiljevic , Milena P Dojcinovic , Jugoslav B Krstic , Vesna Ribic , Nenad B Tadic et al.
RSC Advances, 2020, 10, ⟨10.1039/d0ra01809k⟩
Article dans une revue hal-02889105 v1

Exploring the impact of Mg-doped ZnO nanoparticles on a model soil microorganism Bacillus subtilis

Sandrine Auger , Céline Henry , Christine Péchaux , Nathalie Lejal , Valentina Zanet et al.
Ecotoxicology and Environmental Safety, 2019, 182, ⟨10.1016/j.ecoenv.2019.109421⟩
Article dans une revue hal-02889082 v1

Activity evaluation of pure and doped zinc oxide nanoparticles against bacterial pathogens and saccharomyces cerevisiae

V. Zanet , Jasmina Vidic , Sandrine Auger , Priya Vizzini , G. Lippe et al.
Journal of Applied Microbiology, 2019, pp.1-12. ⟨10.1111/jam.14407⟩
Article dans une revue hal-02617964 v1
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Exploring multiple effects of Zn0.15Mg0.85O nanoparticles on Bacillus subtilis and macrophages

Sandrine Auger , Céline Henry , Christine Longin , Sneha Suman , Nathalie Lejal et al.
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-30719-9⟩
Article dans une revue hal-01867036 v1

Genetic engineering of the branched fatty acid metabolic pathway of Bacillus subtilis for the overproduction of surfactin C14 isoform

Debarun Dhali , François Coutte , Anthony Argüelles Arias , Sandrine Auger , Vladimir V. Bidnenko et al.
Biotechnology Journal, 2017, 12 (7), pp.23. ⟨10.1002/biot.201600574⟩
Article dans une revue hal-01502183 v1
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Revisiting the in vivo GlnR-binding sites at the genome scale in Bacillus subtilis

Paola Randazzo , Anne Aucouturier , Olivier Delumeau , Sandrine Auger
BMC Research Notes, 2017, 10 (1), pp.422. ⟨10.1186/s13104-017-2703-9⟩
Article dans une revue hal-05070787 v1

Revisiting the in vivo GlnR-binding sites at the genome scale in Bacillus subtilis

Paola Randazzo , Anne Aucouturier , Olivier Delumeau , Sandrine Auger
BMC Research Notes, 2017, 10 (1), ⟨10.1186/s13104-017-2703-9⟩
Article dans une revue hal-02889071 v1
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Termination factor Rho: From the control of pervasive transcription to cell fate determination in Bacillus subtilis.

Vladimir Bidnenko , Aleksandra Grylak-Mielnicka , Pierre Nicolas , Olivier Delumeau , Sandrine Auger et al.
PLoS Genetics, 2017, 13 (7), 47 p. ⟨10.1371/journal.pgen.1006909⟩
Article dans une revue hal-01608054 v1
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The MarR-like protein PchR (YvmB) regulates expression of genes involved in pulcherriminic acid biosynthesis and in the initiation of sporulation in Bacillus subtilis

Paola Randazzo , Anne Aubert , Alain Guillot , Sandrine Auger
BMC Microbiology, 2016, 16, ⟨10.1186/s12866-016-0807-3⟩
Article dans une revue hal-02637642 v1
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Genome-wide mapping of TnrA-binding sites provides new insights into the TnrA regulon in <em>Bacillus subtilis</em>

Nicolas N. Mirouze , Elena E. Bidnenko , Philippe P. Noirot , Sandrine Auger
MicrobiologyOpen, 2015, 4 (3), pp.423-435. ⟨10.1002/mbo3.249⟩
Article dans une revue hal-02634282 v1
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Genome-wide identification of [i]Bacillus subtilis[/i] Zur-binding sites associated with a Zur box expands its known regulatory network

Eric Prestel , Philippe Noirot , Sandrine Auger
BMC Microbiology, 2015, 15, ⟨10.1186/s12866-015-0345-4⟩
Article dans une revue hal-01204456 v1

[i]Bacillus cytotoxicus[/i] sp. nov. is a novel thermotolerant species of the [i]Bacillus cereus[/i] Group occasionally associated with food poisoning

Marie Helene M. H. Guinebretière , Sandrine Auger , Nathalie N. Galleron , Matthias M. Contzen , Benoit B. de Sarrau et al.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63, pp.31-40. ⟨10.1099/ijs.0.030627-0⟩
Article dans une revue hal-01000679 v1

Bacillus cytotoxicus sp. nov. is a new thermotolerant species of the Bacillus cereus Group occasionally associated with food poisoning.

Marie Helene Guinebretière , Sandrine Auger , Nathalie N. Galleron , Matthias M. Contzen , Benoit B. de Sarrau et al.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012
Article dans une revue hal-01329878 v1

Complete Genome Sequence of the Highly Hemolytic Strain Bacillus cereus F837/76

Sandrine Auger , Nathalie N. Galleron , Béatrice Segurens , Carole C. Dossat , Alexandre A. Bolotine et al.
Journal of Bacteriology, 2012, 194 (6), pp.1630 - 1630. ⟨10.1128/JB.06719-11⟩
Article dans une revue hal-01004271 v1

Adaptation of Bacillus cereus, an ubiquitous worldwide-distributed foodborne pathogen, to a changing environment

Frederic Carlin , Julien Brillard , Veronique Broussolle , Thierry Clavel , Catherine Duport et al.
Food Research International, 2009, 43 (7), pp.1885-1894. ⟨10.1016/j.foodres.2009.10.024⟩
Article dans une revue istex hal-01204240 v1

Biofilm formation and cell surface properties among pathogenic and nonpathogenic strains of the Bacillus cereus group.

Sandrine Auger , Nalini Ramarao , Christine Faille , Agnès Fouet , Stéphane Aymerich et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (20), pp.6616-8. ⟨10.1128/aem.00155-09⟩
Article dans une revue pasteur-00512106 v1

The genetically remote pathogenic strain NVH391-98 of the Bacillus cereus group is representative of a cluster of thermophilic strains

Sandrine Auger , Nathalie Galleron , Elena Bidnenko , S. Dusko Ehrlich , Alla Lapidus et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2008, 74 (4), pp.1276-1280. ⟨10.1128/AEM.02242-07⟩
Article dans une revue hal-02889116 v1

Extending the Bacillus cereus group genomics to putative food-borne pathogens of different toxicity

Alla Lapidus , Eugene Goltsman , Sandrine Auger , Nathalie Galleron , Béatrice Ségurens et al.
Chemico-Biological Interactions, 2008, 171 (2), pp.236-249. ⟨10.1016/j.cbi.2007.03.003⟩
Article dans une revue istex hal-04314336 v1

Global Control of Cysteine Metabolism by CymR in Bacillus subtilis

Sergine Even , Pierre Burguière , Sandrine Auger , Olga Soutourina , Antoine Danchin et al.
Journal of Bacteriology, 2006, 188 (6), pp.2184-2197. ⟨10.1128/JB.188.6.2184-2197.2006⟩
Article dans une revue hal-03292252 v1

Autoinducer 2 affects biofilm formation by Bacillus cereus

Sandrine Auger , Evelyne Krin , Stephane S. Aymerich , Michel M. Gohar
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (1), pp.937-941. ⟨10.1128/AEM.72.1.937-941.2006⟩
Article dans une revue hal-02663988 v1

Autoinducer 2 affects biofilm formation by Bacillus cereus

Sandrine Auger , E. Krin , Stéphane Aymerich , M. Gohar
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72, pp.937-941
Article dans une revue hal-00088709 v1

The PatB protein of Bacillus subtilis is a C-S-lyase

Sandrine Auger , M.P. Gomez , A. Danchin , I. Martin-Verstraete
Biochimie, 2005, 87 (2), pp.231-238. ⟨10.1016/j.biochi.2004.09.007⟩
Article dans une revue istex hal-02680864 v1

Regulation of the Bacillus subtilis ytmI operon, involved in sulfur metabolism

Pierre Burguière , Juliette Fert , Isabelle Guillouard , Sandrine Auger , Antoine Danchin et al.
Journal of Bacteriology, 2005, 87 (17), pp.6019-6030. ⟨10.1128/JB.187.17.6019-6030.2005⟩
Article dans une revue hal-02681047 v1

Conversion of methionine to cysteine in Bacillus subtilis and its regulation

Marie-Françoise Hullo , Sandrine Auger , Olga Soutourina , Octavian Barzu , Mireille Yvon et al.
Journal of Bacteriology, 2004, 189 (1), pp 187-197. ⟨10.1128/JB.01273-06⟩
Article dans une revue hal-04190311 v1

Three different systems participate in l-Cystine uptake in Bacillus subtilis

Pierre Burguière , Sandrine Auger , Marie-Françoise Hullo , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Journal of Bacteriology, 2004, 186 (15), pp.4875-4884. ⟨10.1128/JB.186.15.4875-4884.2004⟩
Article dans une revue hal-02889124 v1

The metNPQ operon of Bacillus subtilis encodes an ABC permease transporting methionine sulfoxide, D-and L-methionine.

Marie-Françoise Hullo , Sandrine Auger , Elie Dassa , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Research in Microbiology, 2004, 155 (2), pp.80-86. ⟨10.1016/j.resmic.2003.11.008⟩
Article dans une revue hal-00020363 v1

Identification of Bacillus subtilis CysL, a regulator of the cysJI Operon, which encodes sulfite reductase

Isabelle Guillouard , Sandrine Auger , Marie-Françoise Hullo , Farid Chetouani , Antoine Danchin et al.
Journal of Bacteriology, 2002, 184 (17), pp.4681-4689. ⟨10.1128/jb.184.17.4681-4689.2002⟩
Article dans une revue hal-02889129 v1

The metIC operon involved in methionine biosynthesis in Bacillus subtilis is controlled by transcription antitermination

Sandrine Auger , W. Yuen , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Microbiology, 2002, 148 (2), pp.507-518. ⟨10.1099/00221287-148-2-507⟩
Article dans une revue hal-02889132 v1

Global Expression Profile of Bacillus subtilis Grown in the Presence of Sulfate or Methionine

Sandrine Auger , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Journal of Bacteriology, 2002, 184 (18), pp.5179-5186. ⟨10.1128/jb.184.18.5179-5186.2002⟩
Article dans une revue hal-02889134 v1

Sulfur-limitation-regulated proteins in Bacillus subtilis: a two-dimensional gel electrophoresis study

Jean-Yves Coppée , Sandrine Auger , Evelyne Turlin , Agnieszka Sekowska , Jean-Pierre Le Caer et al.
Microbiology, 2001, 147 (6), pp.1631-1640. ⟨10.1099/00221287-147-6-1631⟩
Article dans une revue hal-02889151 v1