Audrey Le Gouellec CV

Identifiants chercheurs

IdHAL :

sc-legouellec

ORCID :

0000-0002-4905-3854

IdRef :

134039823

ResearcherID :

http://www.researcherid.com/rid/AAC-3013-2019

Présentation

Dr Audrey Le Gouellec est Maitre de Conférence des Universités et Praticien Hospitalier en biochimie médicale à la Faculté de Médecine de l'Université Grenoble Alpes (UGA) et au Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble Alpes (CHUGA). Elle est la responsable scientifique de la plateforme de métabolomique par spectrométrie de masse GExiM. Recrutée depuis 2016, elle axe ses recherches au sein du laboratoire TIMC (UMR 5525 CNRS-UGA) sur l'étude de l'interaction hôte-pathogène et envisage à chaque fois des applications médicales. Au CHUGA, au sein du département de biochimie, biologie moléculaire et toxicologie environnementale, Audrey Le Gouellec est biologiste, responsable de 36 paramètres cliniques de soins biochimiques courants tels que l'inflammation et les marqueurs du LCR. Elle est présidente du &quot;Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF)&quot; et est directrice adjointe de l'école doctorale &quot;Ingenierie pour la Santé la Cognition et l'Environnement&quot;.

Publications

Article dans une revue (45)

Exploring the human small intestinal luminal microbiome via a newly developed ingestible sampling device Alexandre Tronel,Morgane Roger-Margueritat,Caroline Plazy,Salomé Biennier,Anthony Craspayet al. ISME Communications, 2026, 5 (1), ⟨10.1093/ismeco/ycaf224⟩ Article dans une revue hal-05467365v1
Microbial computing: Review and Perspectives Paul Ahavi,Audrey Le Gouellec,Jean-Loup Faulon Biotechnology Advances, 2026, 87, pp.108766. ⟨10.1016/j.biotechadv.2025.108766⟩ Article dans une revue hal-05507127v1
Identification of an extraction protocol from dried blood spots for untargeted metabolomics: application to phenylketonuria Sébastien Vézirian,Valérie Cunin,Carlos Dias,Audrey Le Gouellec,Patrice Faureet al. Metabolomics, 2025, 21 (5), pp.141. ⟨10.1007/s11306-025-02338-9⟩ Article dans une revue hal-05467410v1
Métabolomique clinique en biologie médicale : cartographie des pratiques, état de l’art et propositions du Groupe de Travail de la Société Française de Biologie Clinique Marie Lenski,Thibaud Lefebvre,Karim Chikh,Pierre-Edouard Grillet,Pascal Reynieret al. Annales de Biologie Clinique, 2025, 83 (5), pp.507-520. ⟨10.1684/abc.2025.1996⟩ Article dans une revue hal-05441198v1
Untargeted and semi-targeted metabolomics approach for profiling small intestinal and fecal metabolome using high-resolution mass spectrometry Alexandre Tronel,Morgane Roger-Margueritat,Caroline Plazy,Valérie Cunin,Ipsita Mohantyet al. Metabolomics, 2025, 21 (4), pp.84. ⟨10.1007/s11306-025-02288-2⟩ Article dans une revue hal-05467454v1
Tocilizumab-Based Treatment of Microvascular Inflammation in Kidney Transplant Recipients: A Retrospective Study Johan Noble,Giorgia Comai,Valeria Corredetti,Reda Laamech,Celine Dardet al. Transplant International, 2025, 38, ⟨10.3389/ti.2025.14502⟩ Article dans une revue hal-05467450v1
Pilot Study: Safety and Performance Validation of an Ingestible Medical Device for Collecting Small Intestinal Liquid in Healthy Volunteers Alexandre Tronel,Anne-Sophie Silvent,Elena Buelow,Joris Giai,Corentin Leroyet al. Methods and Protocols, 2024, 7 (1), pp.15. ⟨10.3390/mps7010015⟩ Article dans une revue hal-04886661v1
Acetyl-CoA synthetase (ACSS2) does not generate butyryl- and crotonyl-CoA Nour Zeaiter,Laura Belot,Valérie Cunin,Roland Abi Nahed,Malgorzata Tokarska-Schlattneret al. Molecular metabolism, 2024, 81, pp.101903. ⟨10.1016/j.molmet.2024.101903⟩ Article dans une revue hal-04731057v1
What clinical metabolomics will bring to the medicine of tomorrow Audrey Le Gouellec,Caroline Plazy,Bertrand Toussaint Frontiers in Analytical Science, 2023, 3, ⟨10.3389/frans.2023.1142606⟩ Article dans une revue hal-04886238v1
Multi-Method Quantification of Acetyl-Coenzyme A and Further Acyl-Coenzyme A Species in Normal and Ischemic Rat Liver Malgorzata Tokarska-Schlattner,Nour Zeaiter,Valérie Cunin,Stéphane Attia,Cécile Meunieret al. International Journal of Molecular Sciences, 2023, 24 (19), pp.14957. ⟨10.3390/ijms241914957⟩ Article dans une revue hal-04243491v1
Inulin Prebiotic Protects against Lethal Pseudomonas aeruginosa Acute Infection via γδ T Cell Activation Emilie Boucher,Caroline Plazy,Audrey Le Gouellec,Bertrand Toussaint,Dalil Hannani Nutrients, 2023, 15 (13), pp.3037. ⟨10.3390/nu15133037⟩ Article dans une revue hal-04297026v1
Fine Analysis of Lymphocyte Subpopulations in SARS-CoV-2 Infected Patients: Differential Profiling of Patients With Severe Outcome Giovanna Clavarino,Corentin Leroy,Olivier Epaulard,Tatiana Raskovalova,Antoine Vilotitchet al. Frontiers in Immunology, 2022, 13, pp.889813. ⟨10.3389/fimmu.2022.889813⟩ Article dans une revue hal-03808132v1
Bioengineering of Escherichia coli Nissle 1917 for Production and Excretion of Spermidine, a Key Metabolite in Human Health Clément Caffaratti,Caroline Plazy,Valérie Cunin,Bertrand Toussaint,Audrey Le Gouellec Metabolites, 2022, 12 (11), pp.1061. ⟨10.3390/metabo12111061⟩ Article dans une revue hal-04886062v1
What Is New in the Anti–Pseudomonas aeruginosa Clinical Development Pipeline Since the 2017 WHO Alert? Sébastien Reig,Audrey Le Gouellec,Sophie Bleves Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2022, 12, ⟨10.3389/fcimb.2022.909731⟩ Article dans une revue hal-03781230v1
The metabolite succinate inhibits influenza virus replication through succinylation and nuclear retention of the viral nucleoprotein Adeline Cezard,Antoine Guillon,Deborah Bréa-Diakite,Alan Wacquiez,Thomas Baraneket al. ERJ Open Research, 2022, 8, pp.119. ⟨10.1183/23120541.lsc-2022.119⟩ Article dans une revue hal-04494773v1
Host succinate inhibits influenza virus infection through succinylation and nuclear retention of the viral nucleoprotein Antoine Guillon,Deborah Bréa-Diakite,Adeline Cezard,Alan Wacquiez,Thomas Baraneket al. EMBO Journal, 2022, 41 (12), pp.e108306. ⟨10.15252/embj.2021108306⟩ Article dans une revue hal-03687124v2
Identification of a predictive metabolic signature of response to immune checkpoint inhibitors in non-small cell lung cancer: METABO-ICI clinical study protocol Sarah Sannicolo,Matteo Giaj Levra,Audrey Le Gouellec,Caroline Aspord,Julien Boccardet al. Respiratory Medicine and Research, 2021, 80, pp.100845. ⟨10.1016/j.resmer.2021.100845⟩ Article dans une revue hal-03418402v1
Ion identity molecular networking for mass spectrometry-based metabolomics in the GNPS environment Robin Schmid,Daniel Petras,Louis-Félix Nothias,Mingxun Wang,Allegra Aronet al. Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.3832. ⟨10.1038/s41467-021-23953-9⟩ Article dans une revue hal-04883951v1
Untargeted metabolomics approach to discriminate mistletoe commercial products Cécile Vanhaverbeke,David Touboul,Nicolas Elie,Martine Prévost,Cécile Meunieret al. Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.14205. ⟨10.1038/s41598-021-93255-z⟩ Article dans une revue hal-04886028v1
What We Know So Far about the Metabolite-Mediated Microbiota-Intestinal Immunity Dialogue and How to Hear the Sound of This Crosstalk Clément Caffaratti,Caroline Plazy,Geoffroy Mery,Abdoul-Razak Tidjani,Federica Fioriniet al. Metabolites, 2021, 11 (6), pp.406. ⟨10.3390/metabo11060406⟩ Article dans une revue hal-03267221v1
Metabotypes of Pseudomonas aeruginosa Correlate with Antibiotic Resistance, Virulence and Clinical Outcome in Cystic Fibrosis Chronic Infections Oriane Moyne,Florence Castelli,Dominique J. Bicout,Julien Boccard,Boubou Camaraet al. Metabolites, 2021, 11 (2), ⟨10.3390/metabo11020063⟩ Article dans une revue hal-03146820v1
Complement alternative and mannose-binding lectin pathway activation is associated with COVID-19 mortality Federica Defendi,Corentin Leroy,Olivier Epaulard,Giovanna Clavarino,Antoine Vilotitchet al. Frontiers in Immunology, 2021, 12, pp.742446. ⟨10.3389/fimmu.2021.742446⟩ Article dans une revue hal-03341868v1
Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment Louis-Félix Nothias,Daniel Petras,Robin Schmid,Kai Dührkop,Johannes Raineret al. Nature Methods, 2020, 17 (9), pp.905-908. ⟨10.1038/s41592-020-0933-6⟩ Article dans une revue hal-03012609v1
COVID-19: Underlying Adipokine Storm and Angiotensin 1-7 Umbrella Geoffroy Méry,Olivier Epaulard,Anne-Laure Borel,Bertrand Toussaint,Audrey Le Gouellec Frontiers in Immunology, 2020, 11, pp.1714. ⟨10.3389/fimmu.2020.01714⟩ Article dans une revue hal-04776554v1
Prebiotic role of softwood hemicellulose in healthy mice model Vivien Deloule,Claire Boisset,Dalil Hannani,Antonia Suau,Audrey Le Gouellecet al. Journal of Functional Foods, 2020, 64, pp.103688. ⟨10.1016/j.jff.2019.103688⟩ Article dans une revue hal-03013786v1
ReDU: a framework to find and reanalyze public mass spectrometry data Alan Jarmusch,Mingxun Wang,Christine Aceves,Rohit Advani,Shaden Aguirreet al. Nature Methods, 2020, 17 (9), pp.901-904. ⟨10.1038/s41592-020-0916-7⟩ Article dans une revue hal-04886483v1
Altered Humoral Immune Responses and IgG Subtypes in NOX2-Deficient Mice and Patients: A Key Role for NOX2 in Antigen-Presenting Cells Julien Cachat,Christine Deffert,Marco Alessandrini,Pascale Roux-Lombard,Audrey Le Gouellecet al. Frontiers in Immunology, 2018, 9, pp.1555. ⟨10.3389/fimmu.2018.01555⟩ Article dans une revue hal-01961808v1
Killed but metabolically active Pseudomonas aeruginosa -based vaccine induces protective humoral- and cell-mediated immunity against Pseudomonas aeruginosa pulmonary infections Elodie Meynet,David Laurin,Jean Luc Lenormand,Boubou Camara,Bertrand Toussaintet al. Vaccine, 2018, 36 (14), pp.1893-1900. ⟨10.1016/j.vaccine.2018.02.040⟩ Article dans une revue hal-03012574v1
Chemobacterial Synthesis of a Sialyl-Tn Cyclopeptide Vaccine Candidate. Emeline Richard,Carlo Pifferi,Michele Fiore,Eric Samain,Sébastien Fortet al. ChemBioChem, 2017, 18 (17), pp.1730-1734. ⟨10.1002/cbic.201700240⟩ Article dans une revue hal-01571659v1
Tryptophan catabolism in Pseudomonas aeruginosa and potential for inter-kingdom relationship. Perrine Bortolotti,Benjamin Hennart,Camille Thieffry,Guillaume Jausions,Emmanuel Faureet al. BMC Microbiology, 2016, pp.137 Article dans une revue hal-01464093v1
Targeted release of transcription factors for cell reprogramming by a natural micro-syringe. Lionel Berthoin,Bertrand Toussaint,Frédéric Garban,Audrey Le Gouellec,Benjamin Caulieret al. International Journal of Pharmaceutics, 2016, pp.678-687. ⟨10.1016/j.ijpharm.2016.09.081⟩ Article dans une revue istex hal-01464092v1
Poly-functional and long-lasting anticancer immune response elicited by a safe attenuated Pseudomonas aeruginosa vector for antigens delivery Xavier Chauchet,Dalil Hannani,Sophia Djebali,David Laurin,Benoit Polacket al. Molecular Therapy - Oncolytics, 2016, 3, pp.16033. ⟨10.1038/mto.2016.33⟩ Article dans une revue hal-01571680v1
Is tryptophan metabolism involved in sleep apnea-related cardiovascular co-morbidities and cancer progression? Lysiane Boulet,Patrice Flore,Audrey Le Gouellec,B Toussaint,Jean Louis Pépinet al. Medical Hypotheses, 2015, pp.415-23. ⟨10.1016/j.mehy.2015.06.022⟩ Article dans une revue istex hal-01464091v1
Scavenging of reactive oxygen species by tryptophan metabolites helps Pseudomonas aeruginosa escape neutrophil killing. Charlotte Genestet,Audrey Le Gouellec,Hichem Chaker,Benoit Polack,Benoit Gueryet al. Advances in Free Radical Biology & Medicine, 2014, pp.400-10. ⟨10.1016/j.freeradbiomed.2014.06.003⟩ Article dans une revue istex hal-01464090v1
Bacterial vectors for the delivery of tumor antigens. Yan Wang,Bertrand Toussaint,Audrey Le Gouellec Methods in Molecular Biology, 2014, 1139, pp.429-41. ⟨10.1007/978-1-4939-0345-0_33⟩ Article dans une revue hal-00979502v1
A Safe Bacterial Microsyringe for In Vivo Antigen Delivery and Immunotherapy Audrey Le Gouellec,Xavier Chauchet,David Laurin,Caroline Aspord,Julien Veroveet al. Molecular Therapy, 2013, 21 (5), pp.1076-1086. ⟨10.1038/mt.2013.41⟩ Article dans une revue hal-00813378v1
Live-attenuated bacteria as a cancer vaccine vector. Bertrand Toussaint,Xavier Chauchet,Yan Wang,Benoit Polack,Audrey Le Gouellec Expert Review of Vaccines, 2013, 12 (10), pp.1139-54. ⟨10.1586/14760584.2013.836914⟩ Article dans une revue hal-00918311v1
Bacterial vectors for active immunotherapy reach clinical and industrial stages. Audrey Le Gouellec,Xavier Chauchet,Benoit Polack,Laurent Buffat,Bertrand Toussaint Human Vaccines, 2012, 8 (10), pp.1454-8. ⟨10.4161/hv.21429⟩ Article dans une revue hal-00813376v1
Optimization of antitumor immunotherapy mediated by type III secretion system-based live attenuated bacterial vectors. Yan Wang,Audrey Le Gouellec,Hichem Chaker,Hoda Asrih,Benoit Polacket al. Journal of immunotherapy : official journal of the Society for Biological Therapy, 2012, 35 (3), pp.223-34. ⟨10.1097/CJI.0b013e31824747e5⟩ Article dans une revue hal-00849581v1
Optimal epitope composition after antigen screening using a live bacterial delivery vector: application to TRP-2. Madiha Derouazi,Yan Wang,Raphaël Marlu,Olivier Epaulard,Jean-François Mayolet al. Bioeng Bugs, 2010, 1 (1), pp.51-60. ⟨10.4161/bbug.1.1.9482⟩ Article dans une revue hal-00813353v1
Central domain of DivIB caps the C-terminal regions of the FtsL/DivIC coiled-coil rod. Soizic Masson,Thomas Kern,Audrey Le Gouellec,Cécile Giustini,Jean-Pierre Simorreet al. Journal of Biological Chemistry, 2009, pp.27687-700 Article dans une revue hal-01464089v1
Roles of pneumococcal DivIB in cell division. Audrey Le Gouellec,Laure Roux,Daniela Fadda,Orietta Massidda,Thierry Vernetet al. Journal of Bacteriology, 2008, pp.4501-11 Article dans une revue hal-01464088v1
Crystal structure of a peptidoglycan synthesis regulatory factor (PBP3) from Streptococcus pneumoniae. Cécile Morlot,Lucile Pernot,Audrey Le Gouellec,Anne-Marie Di Guilmi,Thierry Vernetet al. Journal of Biological Chemistry, 2005, pp.15984-91 Article dans une revue hal-01464084v1
In vitro reconstitution of a trimeric complex of DivIB, DivIC and FtsL, and their transient co-localization at the division site in Streptococcus pneumoniae. Marjolaine Noirclerc-Savoye,Audrey Le Gouellec,Cécile Morlot,Otto Dideberg,Thierry Vernetet al. Molecular Microbiology, 2004, pp.413-24 Article dans une revue hal-01464086v1
A PBP2x from a clinical isolate of Streptococcus pneumoniae exhibits an alternative mechanism for reduction of susceptibility to beta-lactam antibiotics. Lucile Pernot,Laurent Chesnel,Audrey Le Gouellec,Jacques Croizé,Thierry Vernetet al. Journal of Biological Chemistry, 2004, pp.16463-70. ⟨10.1074/jbc.M313492200⟩ Article dans une revue hal-01464081v1

Communication dans un congrès (4)

Contribution of multiblock methods for predicting the severity of COVID-19 from clinical, biochemical and metabolomic data Marion Brandolini-Bunlon,Benoit B. Jaillais,Audrey Le Gouellec,Jean-Michel J. -M. Roger,Estelle Pujos-Guillot Colloquium Chemiometricum Mediterraneum (CCM2025), Société Française de Statistiques - groupe Chimiométrie, Sep 2025, Porquerolles, France Communication dans un congrès hal-05265568v1
What will Metabolomics bring to the medicine of tomorrow Audrey Le Gouellec BIOMEDJ, Mar 2023, Paris, France Communication dans un congrès hal-04958141v1
Rôle des polyamines dans la virulence de Pseudomonas aeruginosa au cours de l’infection pulmonaire chronique chez les patients CF Abdoul-Razak Tidjani,Caroline Plazy,Eric Faudry,Ina Attrée,Bertrand Toussaintet al. Pseudomonas aeruginosa 2023, Oct 2023, Mittelwhir, France Communication dans un congrès hal-04958088v1
Pseudomonas aeruginosa-derived metabolites modulate immunity and correlate with respiratory functions in Cystic Fibrosis patients Caroline Plazy,Audrey Le Gouellec,Oriane Moyne,Max Maurin,Bertrand Toussaintet al. Colloque Pseudomonas, Oct 2021, Malbuisson, France Communication dans un congrès hal-04958159v1

Poster de conférence (3)

Evaluation of information processing capacity of bacterial metabolism through regression problem solving Paul Ahavi,Bastien Mollet,Antoine Cornuéjols,Evelyne Lutton,Alberto Tondaet al. BioSynSys 2023 - Symposium on Synthetic and Systems Biology, Jul 2023, Toulouse, France Poster de conférence hal-04287846v1
Solving regression problems using bacterial metabolism Paul Ahavi,Bastien Mollet,Antoine Cornuéjols,Evelyne Lutton,Alberto Tondaet al. 2023 Living Machines @ Work day, Oct 2023, Gif-sur-Yvette, France. Poster de conférence hal-04312498v1
Neural-like computation using bacterial metabolism to solve machine-learning problems Paul Ahavi,Bastien Mollet,Antoine Cornuéjols,Evelyne Lutton,Alberto Tondaet al. DIM BioConvS - Innovation Day, Nov 2023, St-Ouen, France Poster de conférence hal-04312782v1

Chapitre d'ouvrage (3)

The role of C-reactive protein levels on the association of physical activity with lung function in adults Elaine Fuertes,Anne-Elie Carsin,Vanessa Garcia-Larsen,Stefano Guerra,Isabelle Pinet al. Horizontal Gene Transfer, 14 (9), Springer US, pp.e0222578, 2019, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1371/journal.pone.0222578⟩ Chapitre d'ouvrage hal-04850540v1
La cellule procaryote en biotechnologies Sandrine Bourgoin-Voillard,Claire Durmort,Johannes Geiselmann,Audrey Le Gouellec,Delphine Roperset al. Introduction aux biotechnologies en santé, Tome 1, Tec & Doc Lavoisier, pp.318, 2015, Les biotechnologies en santé, 2743020857 Chapitre d'ouvrage hal-01577514v1
Regulation of the Expression of Type III Secretion Systems: an Example from Pseudomonas aeruginosa Audrey Le Gouellec,Benoit Polack,Dakang Shen,Bertrand Toussaint Regulation of Bacterial Virulence, ASM Press, pp.315-334, 2012, ⟨10.1128/9781555818524.ch17⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03012625v1

Brevet (3)

Attenuated strains of Pseudomonas aeruginosa as vaccine Meynet Elodie,Jean Luc Lenormand,Bertrand Toussaint,David Laurin,Audrey Le Gouellec France, Patent n° : EP17305173.1. 2017 Brevet hal-02002858v1
Implantable reactor for gut Philippe Cinquin,Dominique Schneider,Max Maurin,Abdelkader Zebda,Jean-Pierre Alcarazet al. France, Patent n° : WO 2016/156612 A1. 2016 Brevet hal-04950898v1
Attenuated and adapted strain of P. aeruginosa for delivering antigens Audrey Le Gouellec,Benoît Polack,Bertrand Toussaint France, Patent n° : WO 2013/087667. 2013 Brevet hal-04950908v1

Pré-publication, Document de travail (4)

Microbial computing: review and perspectives Paul Ahavi,Audrey Le Gouellec,Jean-Loup Faulon 2025 Pré-publication, Document de travail hal-05281013v1
Living bacterial reservoir computers for information processing and sensing Paul Ahavi,Thi-Ngoc-An Hoang,Philippe Meyer,Sylvie Berthier,Federica Fioriniet al. 2026 Pré-publication, Document de travail hal-05500853v1
Cytosolic acetyl-CoA synthetase (ACSS2) does not generate butyryl- and crotonyl-CoA Nour Zeaiter,Laura Belot,Valérie Cunin,Roland Abi Nahed,Malgorzata Tokarska-Schlattneret al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04982395v1
Multi-method quantification of acetyl-CoA and further acyl-CoA species in normal and ischemic rat liver Malgorzata Tokarska-Schlattner,Nour Zeaiter,Valérie Cunin,Stéphane Attia,Cécile Meunieret al. 2025 Pré-publication, Document de travail hal-04982407v1

Thèse (1)

Étude d?un complexe de trois protéines centrales de la division du pneumocoque: DivIB, DivIC et FtsL. Cible thérapeutique? Audrey Le Gouellec Sciences du Vivant [q-bio]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2008. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00303328v1

HDR (1)

Vers une approche holistique de l’étude de l’interaction hôte pathogène et applications médicales Audrey Le Gouellec Bactériologie. Université Grenoble Alpes, 2021 HDR tel-04955358v1