Sébastien Pion Chargé de Recherche

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sebastienpion

Présentation

Curriculum vitae - narratif

Développement de la connaissance et sélection de productions scientifiquesFormé en écologie, j’ai complété mes études, en 1998-1999, par un DEA de Biomathématique afin d’aller plus loin dans les méthodes de modélisation du vivant. Lors de ma recherche de stage, une équipe de l’IRD m’a proposé d’étudier des aspects quantitatifs du cycle biologique du ver parasite Loa loa en zone rurale du Cameroun. Et 25 ans plus tard, j’y suis encore.Depuis le début des années 1990, ce parasite représente un obstacle aux programmes internationaux de lutte contre l’onchocercose et la filariose lymphatique en Afrique centrale. En effet, ces programmes reposent sur des traitements de masse de toute la population par un médicament, l’ivermectine, partiellement curatif et préventif. Or, si une personne est fortement parasitée par L. loa, elle a environ 1 chance sur 10 de développer des effets secondaires graves neurologiques, parfois mortels, si elle reçoit de l’ivermectine. Afin d’éviter ce problème, nous avons suivi deux pistes. La première est de continuer à utiliser l’ivermectine mais en écartant les sujets à risque. Pour cela, nous avons développé un dispositif formé d’un téléphone cellulaire et d’un dispositif de grossissement qui permet de quantifier, en 2 minutes, la charge parasitaire de L. loa dans le sang de la personne et ainsi, décider de la traiter ou pas. J’ai été un acteur majeur du développement de la stratégie Test and not Treat for onchocerciasis. L’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) soutient cette stratégie. Ces travaux ont notamment été valorisés, en 2017, par une publication dans le New England Journal of Medicine, où je suis co-premier auteur avec mon collègue camerounais Joseph Kamgno. La seconde piste consistait à remplacer l’ivermectine par un médicament actif sur les filaires mais sans effet secondaire chez les personnes fortement parasitées par L. loa. Contre la filariose lymphatique, nous avons testé un régime de traitements communautaires semestriels par l’albendazole, qui s’est avéré efficace pour éliminer la filariose et réduire les parasites intestinaux. Là encore, l’OMS soutient cette stratégie et, à titre personnel, j’ai été un des acteurs principaux (et premier signataire de nombreux articles, notamment dans Lancet Infectious Diseases) en réalisant deux essais communautaires, en République du Congo, et en République Démocratique du Congo. Pour la loase, j’ai démontré, avec un étudiant médecin alors en thèse, qu’elle entrainait une réduction de l’espérance de vie. Cela a constitué la première étape vers la reconnaissance de cette infection comme problème de santé publique (publié dans Lancet Infectious Diseases), et nous a amené à développer un projet clinique pour expliquer cette surmortalité (actuellement en cours avec un financement European Research Council).

Contribution au développement des individus (collègues, étudiants…)En 25 ans d’activité, j’ai accompagné une vingtaine d’étudiant(e)s en les supervisant ou parfois en les formant à des disciplines telles que les statistiques et l’épidémiologie, en insistant sur la rigueur dans l’exécution des différentes tâches. Certains ont persévéré dans la science ou la santé publique, et je suis toujours en contact avec bon nombre d’entre eux/elles. Deux d’entre eux font désormais partie de mon équipe. Au sein de celle-ci, mes collègues ont suivi des formations médicales (médecin et pharmacien) ; en tant que biologiste, j’apporte un éclairage complémentaire en intégrant la dimension évolutive des systèmes biologiques dans nos problématiques, selon le fameux précepte de Theodosius Dobzhansky: « Rien n’a de sens en biologie, si ce n’est à la lumière de l’évolution ».

Contribution à la communauté recherche au sens largeTrès vite après avoir publié mes premiers articles, j’ai été sollicité pour évaluer des articles soumis à des journaux traitant de parasitologie, ou de médecine tropicale, activité qui est allée en croissant. J’ai également été évaluateur de projets européens. Un peu plus récemment, j’ai été expert dans des comités consultatifs pour l’OMS et pour le Programme de Donation du Mectizan (qui permet de traiter plus de 400 millions de personnes par an contre le filarioses). Enfin, après plusieurs tentatives infructueuses, j’ai été élu, en 2024, membre de la présente commission afin de contribuer au bien-fondé du fonctionnement de l’Institut.

Contribution à la société dans son ensembleDepuis janvier 2021, je co-pilote le groupe de travail « mobilité » au sein du réseau &quot;réduction impact environnemental des activités de la Direction Régionale Occitanie (DRO)&quot;. En concertation avec la direction de la DRO, nous mettons régulièrement en place des animations afin de promouvoir les mobilités éco-responsables: stands d’information sur les réseaux de transport en commun, la participation des employeurs aux abonnements, les aides à l’acquisition de vélo à assistance électrique (VAE), mais également des stands où il était possible de tester des vélos atypiques (cargo, triporteur, long-tail, pliants, avec ou sans assistance électrique) et des trottinettes électriques, ainsi que des ateliers d’accompagnement à la réparation ou à l’entretien de son vélo. Les actions que nous avons mises en place ont permis à la DRO d’obtenir, en 2024, la labellisation « Employeur Pro-Vélo » à son niveau le plus élevé : l’or.A titre officieux, j’accompagne, depuis une dizaine d’années, toute personne souhaitant trouver une bicyclette pour ses déplacements quotidiens en les conseillant et en les aidant à trouver du matériel de qualité de seconde main. Je mets également à disposition une petite flotte de vélos recyclés à destination des étudiants effectuant des séjours de courte durée au sein de la DRO. Mon engagement dans ce domaine ne se limite pas à mon cadre professionnel: j’ai créé une association (loi 1901) de promotion du vélo dans mon bassin de résidence (pays viganais).Ayant opté pour un cursus universitaire en biologie-écologie dans les années 1990, il va sans dire que la notion d’éco-responsabilité a toujours été intégrée dans ma pratique de la recherche: ne prendre l’avion que quand cela est absolument nécessaire et qu’il n’existe pas d’alternative, optimiser la consommation, faire durer le matériel et recycler autant que possible, gérer convenablement ses déchets lors des études de terrain… J’ai été récemment nommé référent développement durable pour mon unité de recherche. Ainsi, mon rôle sera également d’accompagner, officiellement, les collègues qui le souhaitent à s’informer sur les enjeux et les moyens disponibles pour adopter des comportements plus vertueux.

Curriculum vitae - Classique

Epidemiologie et contrôle des maladies tropicales négligées, Parasitologie quantitative

STATUT CIVIL

50 ans, né le 10/07/1974 à Villers-Semeuse (08), divorcé, 2 enfantsNationalité françaiseSituation militaire : Service National effectué en coopération du 1/10/ 2000 au 31/01/2002

FORMATION ET QUALIFICATIONSDepuis 12/2007: Chargé de Recherche à l’IRD2006 – 2007: Post-doctorat à l’Institut d’Epidémiologie et de Neurologie Tropicale, Faculté de Médecine de Limoges, France2005 – 2006: Post-doctorat au Department of Infectious Disease Epidemiology, Imperial College London, Londres, Royaume-Uni1999 – 2004 : Doctorat en Sciences de la Vie et de la Santé, Parasitologie, Université Paris XII, réalisé au Centre Pasteur du Cameroun, Yaoundé, Cameroun1998 – 1999 : Diplôme d’Etudes Approfondies de Biomathématiques, Université Paris VI-VII1997 – 1998 : Maîtrise de Biologie des Populations et des Ecosystèmes, Université Lille I1996 – 1997 : Licence de Biologie des Organismes, Université Lille I1994 – 1996 : Diplôme d’Etudes Universitaires Générales de Sciences de la Vie, Université Lille I

LANGUES ETRANGERESAnglais : courantAllemand et espagnol : notions

AFFECTATIONS STRUCTURALES A L’IRD (DEPUIS 12/2007, DATE DU RECRUTEMENT)Depuis 01/01/2011 : UMI233 « Recherches translationnelles appliquées au VIH et aux Maladies Infectieuses » (nouveau projet quadriennal proposé par l’ex UMR145), IRD Montpellier2009 – 2010 : UMR145 « VIH/SIDA et maladies associées », IRD Montpellier12/2007 – 31/12/2008 : UR024 « Epidémiologie et prévention » (unité non renouvelée au-delà du projet quadriennal), IRD Montpellier

SEJOURS SUR LE TERRAIN DANS LE CADRE DE PROJETS DE L’IRDCameroun : 1999 (3 mois), 2000-2002 (22 mois, VSN), 2007 (3 mois), 2008 (2 mois), 2010 (3 mois), 2011 (2mois), 2012-2014 (2 ans, expatriement), 2015, 2016, 2017, 2018, 2019, 2021, 2022 (plusieurs séjours de quelques semaines)Gabon : 2010 (1 mois)République du Congo : 2011 (1 mois), 2012 (1 mois), 2013 (1 mois), 2014 (1 mois), 2015 (1 mois), 2019 (1 mois), 2022 (1 mois), 2023 (1 mois)République Démocratique du Congo : 2014 (1 mois), 2015 (1 mois), 2016 (1 mois), 2017 (1 mois), 2018 (1 mois), 2024 (3 semaines)

THEMATIQUES DES PROJETS DE RECHERCHE PRINCIPAUX REALISES OU EN COURS

Evaluation de l’impact à long terme des traitements de masse par ivermectine dans le cadre de la lutte contre l’onchocercose (cécité des rivières) ;

Prévention des effets secondaires graves survenant lors des traitements de masse par ivermectine chez les personnes fortement infectées par la filaire Loa loa ;

Evaluation du développement possible de la résistance d’Onchocerca volvulus (parasite agent de l’onchocercose) à l’ivermectine ;

Mise en évidence de la relation causale entre onchocercose et épilepsie ;

Evaluation du poids global de l’onchocercose et de celui de la loase ;

Optimisation des protocoles de diagnostic et de traitement en vue de l’élimination de la filariose lymphatique et de l’onchocercose en Afrique centrale ;

Génétique de population du parasite Loa loa, agent causatif de la loase ;

Potentiel anthropozoonotique de parasites de primates non humains d’Afrique centrale.

FINANCEMENTS OBTENUS (REDACTION DES PROJETS PUIS PILOTAGE IRD PAR NOTRE EQUIPE)

Projet RESONIV « Evaluation du développement de la résistance d’Onchocerca volvulus à l’ivermectine », période 2006-2009, programme Santé Environnement – Santé Travail de l’Agence Nationale de la Recherche (ANR), 210 000 euros (PI : M Boussinesq);

Projet Test and Treat « Rapid identification of high levels of Loa loa microfilaremia: a “test and treat” strategy for mass drug administration », 2012-2018, Bill and Melinda Gates Foundation, 3 millions US$ (PI : M Boussinesq);

Collaboration sur le projet DOLF « Death to Onchocerciasis and Lymphatic Filariasis », période 2010-2020, Washington University, Saint-Louis (MO, USA), environ 600 000 US$ (co-PI : M Boussinesq/S. Pion);

Projet d’évaluation de la surmortalité associée à la loase, 2016, DNDi, 35 000 euros (PI : C. Chesnais, ex-doctorant dans notre équipe);

ANR JCJC EoLoa « Développement d’outils pour éliminer l'onchocercose en zone de co-endémie à Loa loa » 2018-2022, 360 000 euros (PI: C. Chesnais);

Task Force for Global Health « Field friendly biometry to ease cohort studies in resource-limited settings » 2019, 50 000 US$ (PI: S. Pion);

ERC Starting grant « Morbidity due to Loiasis: population-wide evaluation and identification of pathogenic mechanisms » 2020-2025, 1.5 millions d’euros (PI : C. Chesnais)

ANR LoaGen “Unveiling the population dynamics of the filarial worm Loa loa using population genetics”, 2021-2024, 244 000 euros (PI: S. Pion)

ANR STOP-FiLAR “Seeking Therapeutic Options to Prevent Filarial infectionsand post-Ivermectin Loa-related Adverse Reactions”, 2023-2024, 542 000 euros (PI: J Campillo, ex-doctorant dans notre équipe, actuellement post-doc sur le projet ERC sus-cité)

PRODUCTION SCIENTIFIQUEenviron 105 articles scientifiques publiés dans des revues à comité de lecture, 2 chapitres d’ouvrage

EXPERTISE SCIENTIFIQUE

membre du Comité d’Experts du Mectizan (

https://mectizan.org/how/mec/

)

membre du comité d’experts de l’OMS &quot;Onchocerciasis Technical Scientific commitee&quot;

Publications

Article dans une revue (16)

Temporal variability of Loa loa microfilaraemia Jérémy Campillo,Marlhand C Hemilembolo,Frédéric Louya,Paul Bikita,Sébastien Pionet al. Parasites & Vectors, 2023, 16 (1), pp.23. ⟨10.1186/s13071-022-05612-0⟩ Article dans une revue hal-03954400v1
Loa loa and Mansonella perstans microfilaremia in the department of Lékoumou, Republic of Congo Marlhand Hemilembolo,Jérémy Campillo,Ange Clauvel Niama,Sébastien Pion,François Missamouet al. Parasites & Vectors, 2023, 16 (1), pp.451. ⟨10.1186/s13071-023-06056-w⟩ Article dans une revue hal-05250417v1
Factors associated with variation in single-dose albendazole pharmacokinetics: A systematic review and modelling analysis Charles Whittaker,Cédric B Chesnais,Sébastien Pion,Joseph Kamgno,Martin Walkeret al. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2022, 16 (10), pp.e0010497. ⟨10.1371/journal.pntd.0010497⟩ Article dans une revue hal-05533279v1
Impact of Semi-Annual Albendazole on Lymphatic Filariasis and Soil-Transmitted Helminth Infection: Parasitological Assessment after 14 Rounds of Community Treatment Sébastien Pion,Cédric B Chesnais,Frédéric Louya,Gary J. Weil,Michel Boussinesqet al. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2022, 106 (2), pp.729-731. ⟨10.4269/ajtmh.21-0731⟩ Article dans une revue hal-05540182v1
Status of Onchocerca volvulus (Spirurida: Onchocercidae) Transmission and Effect of Climatic Variables on the Vector Population Dynamics After Two Decades of Ivermectin-based Preventive Chemotherapy in the Mbam Valley (Centre Region, Cameroon) André Domche,Philippe B. Nwane,Hugues Nana-Djeunga,Guy R. Njitchouang,Sébastien Pionet al. Journal of Medical Entomology, 2022, 59 (6), pp.2130-2138. ⟨10.1093/jme/tjac133⟩ Article dans une revue hal-05533533v1
Adverse reactions with levamisole vary according to its indications and misuse: A systematic pharmacovigilance study Jérémy Campillo,Céline Eiden,Michel Boussinesq,Sébastien Pion,Jean-Luc Faillieet al. British Journal of Clinical Pharmacology, 2022, 88 (3), pp.1094-1106. ⟨10.1111/bcp.15037⟩ Article dans une revue hal-03853323v1
Changes in Onchocerciasis Ov16 IgG4 Rapid Diagnostic Test Results Over One-Month Follow-up: Lessons for Reading Timeframe and Decision-Making Hugues Nana-Djeunga,Capucine Sicard,Aude Mogoung-Wafo,Cédric Chesnais,Hugo Delégliseet al. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2022, 107 (3), pp.658-661. ⟨10.4269/ajtmh.21-1201⟩ Article dans une revue hal-05086213v1
Limitations of PCR detection of filarial DNA in human stools from subjects non-infected with soil-transmitted helminths Maxime Doret,Hugues Nana-Djeunga,Narcisse Nzune-Toche,Sébastien Pion,Cédric Chesnaiset al. Parasite, 2021, 28, pp.47. ⟨10.1051/parasite/2021046⟩ Article dans une revue hal-03653045v1
Economic evaluations of onchocerciasis interventions: a systematic review and research needs Hugo C.Turner,Martin Walker,Sebastien D S Pion,Deborah A. Mcfarland,Donald A. P. Bundyet al. Tropical Medicine and International Health, 2019, 24 (7), pp.788-816. ⟨10.1111/tmi.13241⟩ Article dans une revue hal-02464906v1
Effect of a Single Standard Dose (150–200 μg/kg) of Ivermectin on Loa loa Microfilaremia: Systematic Review and Meta-analysis Sébastien D. Pion,Jules Brice Tchatchueng-Mbougua,Cédric B. Chesnais,Joseph Kamgno,Jacques Gardonet al. Open Forum Infectious Diseases, 2019, 6 (4), pp.ofz019. ⟨10.1093/ofid/ofz019⟩ Article dans une revue hal-02263718v1
Macrofilaricidal Efficacy of Repeated Doses of Ivermectin for the Treatment of River Blindness Martin Walker,Sébastien Pion,Hanwei Fang,J. Gardon,Joseph Kamgnoet al. Clinical Infectious Diseases, 2017, 65 (12), pp.2026-2034. ⟨10.1093/cid/cix616⟩ Article dans une revue hal-02429016v1
Years lived with disability (YLDs) for 1160 sequelae of 289 diseases and injuries 1990-2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Theo Vos,Abraham D Flaxman,Mohsen Naghavi,Rafael Lozano,Catherine Michaudet al. The Lancet, 2012, 380 (9859), pp.2163-96. ⟨10.1016/S0140-6736(12)61729-2⟩ Article dans une revue hal-00921555v1
Disability-adjusted life years (DALYs) for 291 diseases and injuries in 21 regions, 1990-2010: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2010. Christopher J L Murray,Theo Vos,Rafael Lozano,Mohsen Naghavi,Abraham D Flaxmanet al. The Lancet, 2012, 380 (9859), pp.2197-223. ⟨10.1016/S0140-6736(12)61689-4⟩ Article dans une revue istex hal-00827610v1
Meta-analysis of the association between cysticercosis and epilepsy in Africa. Fabrice Quet,Maëlenn Guerchet,Sebastien D S Pion,Edgard Brice Ngoungou,Alessandra Nicolettiet al. Epilepsia, 2010, 51 (5), pp.830-7. ⟨10.1111/j.1528-1167.2009.02401.x⟩ Article dans une revue hal-00608283v1
Epilepsy in Onchocerciasis Endemic Areas: Systematic Review and Meta-analysis of Population-Based Surveys. Sébastien Pion,Christoph Kaiser,Fernand Boutros-Toni,Amandine Cournil,Melanie M Tayloret al. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2009, 3 (6), pp.e461. ⟨10.1371/journal.pntd.0000461⟩ Article dans une revue hal-00408205v1
Microfilarial distribution of Loa loa in the human host: population dynamics and epidemiological implications Sébastien Pion,J.A.N. Filipe,J. Kamgno,Jacques Gardon,Maria-Gloria Basáñezet al. Parasitology, 2006, 133 (01), pp.101. ⟨10.1017/S0031182006000035⟩ Article dans une revue hal-04840020v1