Sophie Lorber Chargée de Recherche Hors Classe INRAE TOXALIM Equipe Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines

Identifiants chercheurs

IdHAL :

sophie-lorber

ORCID :

0000-0003-0231-6394

IdRef :

180520636

Présentation

Sophie Lorber est chargée de recherche hors classe à INRAE au sein de l’UMR ToxAlim. Elle fait partie de l’équipe Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines depuis 2016, dans le groupe mycotoxinogenèse. Elle est co-auteur de 46 publications et 42 communications et a dirigé 6 doctorants (3 sur la thématique des mycotoxines). Elle possède une double expertise sur le devenir des contaminants organiques dans les plantes et sur la biosynthèse et la régulation des mycotoxines chez les champignons filamenteux. Ses principaux thèmes de recherche actuels concernent l’élucidation des voies de biosynthèse de la patuline et des bases moléculaires de sa régulation chez le champignon filamenteux Penicillium expansum, responsable de la pourriture bleue de la pomme. Plus généralement, elle s'intéresse à la caractérisation du métabolome spécialisé de plusieurs genres d’ascomycètes (Aspergillus sp., Penicillium sp., Fusarium sp.). Elle s’intéresse également au contrôle de la production des mycotoxines majeures de ces champignons par l'utilisation d'agents biologiques ou de molécules actives issues de micro-organismes ou d'extraits végétaux et à comprendre les mécanismes d'inhibition par des analyses transcriptomiques. Elle participe régulièrement à des projets régionaux et nationaux (Région Occitanie-Toulouse et Occitanie-Montpellier, ANR, ANSES, CASDAR), développe des collaborations avec des industriels et a fait partie de comités d’organisation de congrès.

CURSUS UNIVERSITAIRE (Université Louis Pasteur de Strasbourg I)

1989-1992	Doctorat en Biochimie, soutenu le 4 décembre 1992Titre : « Biosynthèse des phytostérols (Zea mays) : identification et caractérisation des systèmes enzymatiques impliqués dans les déméthylations en position 4 »Directeur de thèse	Professeur Pierre BENVENISTELaboratoire	Institut de Biologie Moléculaire des Plantes - Strasbourg

1989	DEA de Biologie Cellulaire et MoléculaireTitre : « La méthylène-24-cycloartanol-4-méthyl-déméthylase : enzymologie et mécanisme moléculaire »1988	Maîtrise de Biochimie1987	Licence de Biochimie1986	DEUG de Biologie

PARCOUR PROFESSIONNEL

Depuis le 01/01/2016 INRAE UMR 1331 TOXALIM ToulouseEquipe E5 Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines (Chef d’équipe, Olivier PUEL)

01/01/2011 - 31/12/2015 USC 1400 Ecolab Toulouse (CNRS, UPS, INPT-ENSAT), convention INRA-CNRS-UPS-INPT

17/10/1994 - 31/12/2010 INRA UMR 1089 Xénobiotiques ToulouseDepuis le 01/01/2020	Chargée de Recherche hors classe01/01/2000 – 31/12/2019	Chargée de Recherche première classe01/10/1995 - 01/01/2000	Chargée de Recherche deuxième classe17/10/1994 - 30/09/1995	Stage post-doctoralThème de recherche	« Caractérisation et purification des glutathion transférases de blé et d’arabette »

01/08/1993 – 01/09/1994	Stage post-doctoral à la B.A.S.F. (Limburgerhof, Allemagne)« Métabolisation de la bentazone in vitro et in vivo par des systèmes oxydatifs de plantes »Directeur	Dr Alan AKERS

THEMATIQUES DE RECHERCHE

Depuis le 01/01/2016 Champignons filamenteux : élucidation des voies de biosynthèse des mycotoxines et de leur régulation, caractérisation du métabolome spécialisé, biocontrôle.

1994-2015 Devenir des produits phytosanitaires chez les plantes en vue de l’évaluation du risque des contaminants organiques et de leurs résidus vis-à-vis de l’environnement et de la santé humaine.1994-2001 Aspects enzymologiques : purification et caractérisation chez le blé des glutathion transférases (GST), isoenzymes impliquées dans la détoxication de composés électrophiles exogènes et endogènes.2001-2015 Etablissement de cartes métaboliques : détermination de la nature des résidus et de leur répartition à l’intérieur de la plante, identification de métabolites, biodisponibilité des résidus végétaux chez l’animal (plantes cultivées), devenir dans l’environnement (plantes non cibles).

1988-1994 Caractérisation de systèmes enzymatiques chez les plantes1988-1992 Caractérisation de systèmes enzymatiques impliqués dans la biosynthèse de métabolites spécialisés, les phytostérols.1993-1994 Caractérisation d’un système enzymatique impliqué dans le devenir métabolique d’un herbicide, la bentazone.

Publications

Article dans une revue (32)

Implantation of Aspergillus Section Flavi in French Maize and Consequences on Aflatoxin Contamination of Maize at Harvest: Three-Year Survey Sylviane Bailly,Anwar Elmahgubi,Olivier Puel,Sophie Lorber,Jean-Denis Baillyet al. Toxins, 2025, 17, pp.155. ⟨10.3390/toxins17040155⟩ Article dans une revue hal-05004802v1
Role of the osaA Gene in Aspergillus fumigatus Development, Secondary Metabolism and Virulence Apoorva Dabholkar,Sandesh Pandit,Ritu Devkota,Sourabh Dhingra,Sophie Lorberet al. Journal of Fungi, 2024, 10, pp.103. ⟨10.3390/jof10020103⟩ Article dans une revue hal-04642969v1
Homeobox transcription factor HbxA influences expression of over one thousand genes in the model fungus Aspergillus nidulans Sandesh S Pandit,Jinfang Zheng,Yanbin Yin,Sophie Lorber,Olivier Puelet al. PLoS ONE, 2023, 18 (7), pp.e0286271. ⟨10.1371/journal.pone.0286271⟩ Article dans une revue hal-04169210v1
Effect of Streptomyces roseolus Cell-Free Supernatants on the Fungal Development, Transcriptome, and Aflatoxin B1 Production of Aspergillus flavus Louise Maud,Florian Boyer,Julie Bornot,Julie Bornot,Yannick Lippiet al. Toxins, 2023, 15 (7), pp.428. ⟨10.3390/toxins15070428⟩ Article dans une revue hal-04148843v1
Implication of VelB in the development, pathogenicity, and secondary metabolism of Penicillium expansum Nadia Tahtah,Chrystian Zetina-Serrano,Ophélie Rocher,Claire Naylies,Yannick Lippiet al. Postharvest Biology and Technology, 2023, 195, pp.112121. ⟨10.1016/j.postharvbio.2022.112121⟩ Article dans une revue hal-03835274v1
Mycotoxines majeures et émergentes dans les filières cidre et vin : observatoire, lutte biologique au champ et devenir au cours des procédés. Morvan Coarer,Olivier Puel,Sophie Lorber,H. Guichard,Jean J. Lemaguetet al. Innovations Agronomiques, 2021, 82, pp.246-261. ⟨10.15454/6z4f-7s10⟩ Article dans une revue hal-03499869v1
Regulation of Secondary Metabolism in the Penicillium Genus Christelle El Hajj Assaf,Chrystian Zetina-Serrano,Nadia Tahtah,André El Khoury,Ali Atouiet al. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (24), pp.9462. ⟨10.3390/ijms21249462⟩ Article dans une revue hal-03064407v1
Diversity within Aspergillus niger Clade and Description of a New Species: Aspergillus vinaceus sp. nov. Josué J. da Silva,Beatriz T. Iamanaka,Larissa S. Ferranti,Fernanda P. Massi,Marta H. Taniwakiet al. Journal of Fungi, 2020, 6 (4), pp.371. ⟨10.3390/jof6040371⟩ Article dans une revue hal-03080830v1
Aflatoxin biosynthesis and genetic regulation: A review Isaura Caceres,Anthony Al Khoury,Rhoda El Khoury,Sophie Lorber,Isabelle P. Oswaldet al. Toxins, 2020, 12 (3), pp.150. ⟨10.3390/toxins12030150⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02623009v1
The brlA Gene Deletion Reveals That Patulin Biosynthesis Is Not Related to Conidiation in Penicillium expansum Chrystian Zetina-Serrano,Ophélie Rocher,Claire Naylies,Yannick Lippi,Isabelle P. Oswaldet al. International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (18), pp.6660. ⟨10.3390/ijms21186660⟩ Article dans une revue hal-02944746v1
Application of MALDI-TOF MS to species complex differentiation and strain typing of food related fungi: Case studies with Aspergillus section Flavi species and Penicillium roqueforti isolates Laura Quéro,Priscillia Courault,Beatrice Cellière,Sophie Lorber,Jean-Luc Janyet al. Food Microbiology, 2020, 86, pp.103311. ⟨10.1016/j.fm.2019.103311⟩ Article dans une revue hal-02271931v1
The Transcriptional Regulator HbxA Governs Development, Secondary Metabolism, and Virulence in Aspergillus fumigatus Timothy Satterlee,Binita Nepal,Sophie Lorber,Olivier Puel,Ana Calvo Applied and Environmental Microbiology, 2020, 86 (3), 37 p. ⟨10.1128/AEM.01779-19⟩ Article dans une revue hal-02613971v1
Morphologic, molecular and metabolic characterization of Aspergillus section Flavi in spices marketed in Lebanon Joya Makhlouf,Amaranta Carvajal-Campos,Arlette Querin,Souria Tadrist,Olivier Puelet al. Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41704-1⟩ Article dans une revue hal-02625983v1
Occurrence and diversity of Aspergillus in commercial yerba mate elaborated for the Brazilian beverage ‘chimarrão’ Josué José Silva,Olivier Puel,Sophie Lorber,Larissa S. Ferranti,Luryan F. Ortizet al. Food Research International, 2019, 121, pp.940-946. ⟨10.1016/j.foodres.2019.01.023⟩ Article dans une revue istex hal-02628919v1
Does intraspecific variability matter in ecological risk assessment? Investigation of genotypic variations in three macrophyte species exposed to copper Eva Roubeau Dumont,Camille Larue,Sophie Lorber,Hervé Gryta,Elise Billoiret al. Aquatic Toxicology, 2019, 211, pp.29-37. ⟨10.1016/j.aquatox.2019.03.012⟩ Article dans une revue hal-02324925v1
Occurrence and identification of &lt;em&gt;Aspergillus&lt;/em&gt; section &lt;em&gt;Flavi&lt;/em&gt; in the context of the emergence of aflatoxins in french maize Sylviane Bally,Anwar El Mahgubi,Amaranta Carvajal-Campos,Sophie Lorber,Olivier Puelet al. Toxins, 2018, 10 (12), ⟨10.3390/toxins10120525⟩ Article dans une revue hal-02624195v1
Growth parameters influencing uptake of chlordecone by Miscanthus species Yohan Liber,Clarisse Létondor,Sophie Lorber,Francois Laurent Science of the Total Environment, 2018, 624, pp.831-837. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.12.071⟩ Article dans une revue istex hal-01678089v1
Impact of veA on the development, aggressiveness, dissemination and secondary metabolism of Penicillium expansum Christelle El Hajj Assaf,Selma Snini,Souria Tadrist,Sylviane Bally,Claire Naylieset al. Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (8), pp.1971-1983. ⟨10.1111/mpp.12673⟩ Article dans une revue hal-02061925v1
&lt;em&gt;Aspergillus korhogoensis&lt;/em&gt;, a novel aflatoxin producing species from the Côte d’Ivoire Amaranta Carvajal-Campos,Ama Lethicia Manizan,Souria Tadrist,David Koffi Akaki,Rose Koffi-Nevryet al. Toxins, 2017, 9 (12), ⟨10.3390/toxins9110353⟩ Article dans une revue hal-02625529v1
Uptake and distribution of chlordecone in radish: different contamination routes in edible roots Clarisse Létondor,Sophie Lorber,Francois Laurent Chemosphere, 2015, 118, pp.20-28. ⟨10.1016/j.chemosphere.2014.03.102⟩ Article dans une revue hal-02634225v1
Metabolic Fate of 2,4-Dichlorophenol and Related Plant Residues in Rats Sophie Lorber,Sabrina Despoux,Emilien L. Jamin,Cécile Canlet,Jean Pierre J. P. Cravediet al. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2012, 60 (7), pp.1728-1736. ⟨10.1021/jf203666k⟩ Article dans une revue hal-01137073v1
Metabolic Fate of [C-14]Diuron and [C-14]Linuron in Wheat (Triticum aestivum) and Radish (Raphanus sativus) Sophie Lorber,Haifaa Al-Sayeda,Isabelle Jouanin,Laurent Debrauwer,Cécile Canletet al. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2010, 58 (20), pp.10935-10944. ⟨10.1021/jf101937x⟩ Article dans une revue hal-02668715v1
Metabolic fate of [14C] chlorophenols in radish ([i]Raphanus sativus[/i]), lettuce ([i]Lactuca sativa[/i]), and spinach ([i]Spinacia oleracea[/i]) Sophie Lorber,Sabrina Despoux,Estelle Rathahao-Paris,Cécile Canlet,Laurent Debrauweret al. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2008, 56 (18), pp.8461-8469. ⟨10.1021/jf8016354⟩ Article dans une revue istex hal-01321084v1
Transfer of the insecticide [14C] imidacloprid from soil to tomato plants Haifaa Al-Sayeda,Sophie Lorber,Nallanthigal Shirdhara Chary,Laurent Debrauwer,Francois Laurent Environmental Chemistry Letters, 2008, 6 (4), pp.229-234. ⟨10.1007/s10311-007-0121-2⟩ Article dans une revue istex hal-02666129v1
Phytotoxicity to and uptake of RDX by rice Mireille Vila,S. Mehier,Sophie Lorber,Francois Laurent Environmental Pollution, 2007, 145 (3), pp.813-817. ⟨10.1016/j.envpol.2006.05.009⟩ Article dans une revue istex hal-02665852v1
Fate of RDX and TNT in agronomic plants Mireille Vila,Sophie Lorber,Francois Laurent Environmental Pollution, 2007, 148 (1), pp.148-154. ⟨10.1016/j.envpol.2006.10.030⟩ Article dans une revue istex hal-02666646v1
Metabolic fate of [14c]-2,4-dichlorophenol in tobacco cell suspension cultures Francois Laurent,Cécile Canlet,Laurent Debrauwer,Sophie Lorber Environmental Toxicology and Chemistry, 2007, 26 (11), pp.2299-2307. ⟨10.1897/07-036R.1⟩ Article dans une revue istex hal-02655577v1
Metabolism of [14C]-2,4-dichlorophenol in edible plants Francois Laurent,Laurent Debrauwer,Sophie Lorber Pest Management Science, 2006, 62 (6), pp.558-564. ⟨10.1002/ps.1213⟩ Article dans une revue istex hal-02655576v1
Metabolism of [14C]-2,4,6-trinitrotoluene in tobacco cell suspension cultures Mireille Vila,Sophie Lorber,Estelle Rathahao-Paris,Laurent Debrauwer,Cécile Canletet al. Environmental Science and Technology, 2005, 39 (2), pp.663-72 Article dans une revue hal-01763222v1
Metabolic fate of [14C]-2,4-dichlorophenol in macrophytes Sophie Lorber,Estelle Rathahao-Paris,Jean Pierre J. P. Cravedi,Francois Laurent Chemosphere, 2004, 56 (3), pp.275-84. ⟨10.1016/j.chemosphere.2004.02.017⟩ Article dans une revue istex hal-01763221v1
Uptake and metabolic fate of [14C]-2,4-dichlorophenol and [14C]-2,4-dichloroaniline in wheat (Triticum aestivum) and soybean (Glycine max) Sophie Lorber,Estelle Rathahao-Paris,Jean Pierre J. P. Cravedi,Francois Laurent Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2003, 51 (16), pp.4712-4718. ⟨10.1021/jf034230j⟩ Article dans une revue istex hal-01763224v1
Selective induction of glutathione s-transferase subunits in wheat plants exposed to the herbicide acifluorfen Sophie Lorber,Gabor Gullner,Tamäs Kömives,René Scalla Zeitschrift fur Naturforschung C, 2000, 55c, pp.37-39. ⟨10.1515/znc-2000-1-208⟩ Article dans une revue hal-02103883v1

Communication dans un congrès (2)

Phytotoxicity to and uptake of TNT by rice Mireille Vila,Sophie Lorber,Francois Laurent 4th International Workshop on Bioavailability of Pollutants and Soil Remediation, Sep 2006, Seville, Spain. 4 p., ⟨10.1007/s10653-008-9145-1⟩ Communication dans un congrès istex hal-02758323v1
Influence of the complexity of aquatic test systems on the fate of vinclozolin and its reprotoxic effects in Lymnaea stagnalis. Laurent Lagadic,Julian Bursztyka,Maryse Baradat,Sophie Lorber,Micheline Heydorffet al. 15. Europe Annual Meeting of SETAC, May 2005, Lille, France. pp.Inconnue Communication dans un congrès hal-01453616v1

Chapitre d'ouvrage (5)

Limiter les contaminations par les mycotoxines à l'aide de solutions de biocontrôle Caroline Strub,Sophie Lorber,F. Richard-Forget,Angelique Fontana-Tachon Isabelle Oswald; Florence Forget; Olivier Puel. Les mycotoxines : connaissances actuelles et futurs enjeux, Editions Quae, pp.212-222, 2024, 978-2-7592-3975-7 Chapitre d'ouvrage hal-05153540v1
La patuline Olivier Puel,Sophie Lorber,Chrystian Zetina-Serrano,Sabine Schorr-Galindo,Thierry Gauthier Isabelle OSWALD, Florence FORGET, Olivier PUEL. Les mycotoxines: Connaissances actuelles et futurs enjeux, QUAE, pp.38-48, 2024, 978-2-7592-3975-7 Chapitre d'ouvrage hal-05013608v1
Facteurs et mécanismes de régulation de la biosynthèse des mycotoxines Olivier Puel,Chrystian Zetina-Serrano,Sophie Lorber Isabelle Oswald; Florence Forget; Olivier Puel. Les mycotoxines : connaissances actuelles et futurs enjeux, Éditions Quæ, pp.167-177, 2024, Synthèses, 978-2-7592-3975-7 Chapitre d'ouvrage hal-05153466v1
Biodiversity of Aflatoxigenic Aspergillus section Flavi Species According to Food Matrices and Geographic Areas Amaranta Carvajal-Campos,Ama Lethicia Manizan,Didier Montet,Sophie Lorber,Olivier Puelet al. Mycotoxins in Food and Beverages Innovations and Advances Part I Food Biology Series, 2021, 978-0-367-42209-7 Chapitre d'ouvrage hal-03773672v1
Phytoremediation techniques for pesticide contaminations Sophie Lorber,Francois Laurent Alternative Farming Systems, Biotechnology, Drought Stress and Ecological Fertilisation, Chapter 4, Editions Springer, 2011, 978-94-007-0185-4. ⟨10.1007/978-94-007-0186-1_4⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02807075v1

Autre publication scientifique (1)

Exudates secreted: Penicillium expansum's means of conquering the external environment Ophélie Rocher,Chrystian Zetina-Serrano,Carole Pichereaux,Claire Naylies,Yannick Lippiet al. 2025, pp.113614. ⟨10.1016/j.postharvbio.2025.113614⟩ Autre publication scientifique hal-05056223v1

Pré-publication, Document de travail (1)

Homeobox Transcription Factor HbxA Influences Expression of over One Thousand Genes in the Model Fungus Aspergillus nidulans S.S. Pandit,J. Zheng,Y. Yi,Sophie Lorber,Olivier Puelet al. 2023 Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-04148836v1

Rapport (1)

Caractérisation écodynamique et écotoxicologique des polluants œstrogènes (œstradiol et éthynilœstradiol) contenus dans des eaux résiduaires urbaines Dominique Patureau,Guillermina Hernandez-Raquet,Jean-Philippe Delgenès,Mathieu Muller,François Laurentet al. [Rapport de recherche] Rapport final 2003-2007, ECODYN. 2007, pp.15 Rapport (rapport de recherche) hal-03494273v1

HDR (1)

Devenir des contaminants organiques dans les plantes Sophie Lorber Sciences du Vivant [q-bio]. Institut National Polytechnique (Toulouse), 2010 HDR tel-02819129v1