Stéphanie Bougeard

Identifiants chercheurs

IdHAL :

stephanie-bougeard

ORCID :

0009-0002-4729-5355

IdRef :

120587297

VIAF :

213240957

ISNI :

0000000358822739

Publications

Article dans une revue (65)

Co-inoculation of broilers by Campylobacter and Salmonella : effect on colonization, cecal microbiota, and serum metabolome Muriel Guyard-Nicodème,Cyrielle Payen,Guillaume Larivière-Gauthier,Sophie Mompelat,Ségolène Quesneet al. Microbiology Spectrum, 2026, 14 (3), ⟨10.1128/spectrum.01102-25⟩ Article dans une revue hal-05557902v1
PRRS management by European swine veterinarians: a descriptive insight into practices and profiles Charlotte Teixeira Costa,Arnaud Lebret,Stéphanie Bougeard,Nicolas Rose Porcine health management, 2025, 11 (1), pp.55. ⟨10.1186/s40813-025-00467-0⟩ Article dans une revue anses-05387651v1
Multiblock Analysis of Risk Factors and Management Areas of Calf Mortality in Large-Scale Dairy Herds Dagni-Alice Viidu,Triin Rilanto,Stéphanie Bougeard,Tanel Kaart,Kerli Mõtus Animals, 2025, 15 (19), pp.2780. ⟨10.3390/ani15192780⟩ Article dans une revue anses-05354022v1
Investigating the role of environmental factors in the French highly pathogenic avian influenza epizootic in 2022-2023 Maryem Ben Salem,Mathieu Andraud,Stéphanie Bougeard,Virginie Allain,Morgane Salineset al. Frontiers in Veterinary Science, 2025, 12, ⟨10.3389/fvets.2025.1541019⟩ Article dans une revue anses-05111396v1
The clinical value and most informative threshold of polygenic risk score in the Quebec City Case-Control Asthma Cohort Martin Pariès,Stéphanie Bougeard,Aida Eslami,Zhonglin Li,Michel Lavioletteet al. BMC Pulmonary Medicine, 2025, 25 (1), pp.21. ⟨10.1186/s12890-025-03486-3⟩ Article dans une revue anses-04982026v1
Pan-immune system, mobilome and resistome in Streptococcus suis Manon Dechêne-Tempier,Stéphanie Bougeard,Valentin Loux,Hélène Chiapello,Virginie Libanteet al. Microbial Genomics, 2025, 11 (9), pp.001521. ⟨10.1099/mgen.0.001521⟩ Article dans une revue hal-05289975v1
Polygenic inheritance and its interplay with smoking history in predicting lung cancer diagnosis: a French-Canadian case-control cohort Véronique Boumtje,Hasanga D Manikpurage,Zhonglin Li,Nathalie Gaudreault,Victoria Saavedra Armeroet al. EBioMedicine, 2024, 106, pp.105234. ⟨10.1016/j.ebiom.2024.105234⟩ Article dans une revue anses-04678882v1
Virulence genes, resistome and mobilome of Streptococcus suis strains isolated in France Manon Dechêne-Tempier,Claire de Boisséson,Pierrick Lucas,Stéphanie Bougeard,Virginie Libanteet al. Microbial Genomics, 2024, 10 (3), pp.001224. ⟨10.1099/mgen.0.001224⟩ Article dans une revue hal-04528772v1
Application of multiblock analysis to identify key areas and risk factors for dairy cow persistence Kerli Mõtus,Dagni-Alice Viidu,Triin Rilanto,Tarmo Niine,Toomas Orroet al. Preventive Veterinary Medicine, 2024, 222, pp.106081. ⟨10.1016/j.prevetmed.2023.106081⟩ Article dans une revue anses-04416135v1
A retrospective multivariate case-control approach to investigate factors influencing the sanitary quality of raw milk cheeses Alisia Chiado Rana,Géraldine Cazeau,Stéphanie Bougeard,Kevin Bethune,Vincent Chochoiset al. Applied Food Research, 2024, 4 (2), pp.100617. ⟨10.1016/j.afres.2024.100617⟩ Article dans une revue anses-04816878v1
Distribution of infectious and parasitic agents among three sentinel bee species across European agricultural landscapes Aurélie Babin,Frank Schurr,Sabine Delannoy,Patrick Fach,Minh Huyen Ton Nu Nguyetet al. Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.3524. ⟨10.1038/s41598-024-53357-w⟩ Article dans une revue hal-04481521v1
Novel indices reveal that pollinator exposure to pesticides varies across biological compartments and crop surroundings Marion Laurent,Stéphanie Bougeard,Lucile Caradec,Florence Ghestem,Matthias Albrechtet al. Science of the Total Environment, 2024, 927, pp.172118. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.172118⟩ Article dans une revue hal-04540908v1
Benchmarking multiblock methods with canonical factorization Stéphanie Bougeard,Caroline Peltier,Benoît Jaillais,Jean-Claude Boulet,Mohamed Hanafi Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2024, 254, pp.105240. ⟨10.1016/j.chemolab.2024.105240⟩ Article dans une revue hal-04945817v1
Infectious bursal disease virus: predicting viral pathotype using machine learning models focused on early changes in total blood cell counts Annonciade Molinet,Céline Courtillon,Stéphanie Bougeard,Alassane Keita,Béatrice Graslandet al. Veterinary Research, 2023, 54, pp.101. ⟨10.1186/s13567-023-01222-5⟩ Article dans une revue hal-04272844v1
Prediction model for multiblock data with or without intermediate blocks. Estimation by PLS Path Modeling Stéphanie Bougeard,Pasquale Dolce,Véronique Cariou,Mohamed Hanafi Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2023, 243, pp.105016. ⟨10.1016/j.chemolab.2023.105016⟩ Article dans une revue anses-04350825v1
Building composite indices in the age of big data – Application to honey bee exposure to infectious and parasitic agents Minh Huyen Ton Nu Nguyet,Stéphanie Bougeard,Aurélie Babin,Eric Dubois,Christine Druesneet al. Heliyon, 2023, 9 (4), pp.e15244. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e15244⟩ Article dans une revue anses-04068240v1
Application of Machine Learning Prediction of Individual SARS-CoV-2 Vaccination and Infection Status to the French Serosurveillance Survey From March 2020 to 2022: Cross-Sectional Study Stéphanie Bougeard,Adeline Huneau-Salaun,Mikael Attia,Jean-Baptiste Richard,Caroline Demeretet al. JMIR Public Health and Surveillance, 2023, 9, pp.e46898. ⟨10.2196/46898⟩ Article dans une revue anses-04395611v1
Antimicrobial resistance profiles of Streptococcus suis isolated from pigs, wild boars, and humans in France between 1994 and 2020 Manon Dechêne-Tempier,Eric Jouy,Marie-Hélène Bayon-Auboyer,Stéphanie Bougeard,Claire Chauvinet al. Journal of Clinical Microbiology, 2023, 61 (9), pp.e0016423. ⟨10.1128/jcm.00164-23⟩ Article dans une revue anses-04228454v1
Study of the effect of administration of narasin or antibiotics on in vivo selection of a narasin- and multidrug-resistant Enterococcus cecorum strain Jeanne Laurentie,Gwenaelle Mourand,Eric Jouy,Stéphanie Bougeard,Alassane Keitaet al. Veterinary Microbiology, 2023, 282, pp. 109757. ⟨10.1016/j.vetmic.2023.109757⟩ Article dans une revue hal-04083477v1
MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination Martin Pariès,Evelyne Vigneau,Adeline Huneau,Olivier Lantz,Stéphanie Bougeard The international journal of biostatistics, 2023, ⟨10.1515/ijb-2023-0062⟩ Article dans une revue anses-04661219v1
Monophasic Variant of Salmonella Typhimurium Infection Affects the Serum Metabolome in Swine Guillaume Larivière-Gauthier,Annaëlle Kerouanton,Sophie Mompelat,Stéphanie Bougeard,Martine Deniset al. Microorganisms, 2023, 11 (10), pp.2565. ⟨10.3390/microorganisms11102565⟩ Article dans une revue hal-04258691v1
Controlled Experimental Infection in Pigs with a Strain of Yersinia enterocolitica Harboring Genetic Markers for Human Pathogenicity: Colonization and Stability Emilie Esnault,Alicia Rouaud,Annie Labbé,Catherine Houdayer,Yann Baillyet al. Infection and Immunity, 2023, 91 (7), pp.e0015723. ⟨10.1128/iai.00157-23⟩ Article dans une revue anses-04228409v1
High antigenic diversity of serotype 1 infectious bursal disease virus revealed by antigenic cartography Liliana L Cubas-Gaona,Céline Courtillon,Francois-Xavier Briand,Higor Cotta,Stephanie Bougeardet al. Virus Research, 2023, 323, pp.198999. ⟨10.1016/j.virusres.2022.198999⟩ Article dans une revue anses-03966233v1
Clusterwise elastic-net regression based on a combined information criterion Xavier Bry,Ndèye Niang,Thomas Verron,Stéphanie Bougeard Advances in Data Analysis and Classification, 2023, 17, pp.75-107. ⟨10.1007/s11634-021-00489-w⟩ Article dans une revue hal-03541125v1
Efficacy of passive immunization in broiler chicks via an inactivated Escherichia coli autogenous vaccine administered to broiler breeder hens Alassane Keita,Laetitia Le Devendec,Michel Amelot,Julie Puterflam,Camille Lucaset al. Avian Pathology, 2022, 51 (5), pp.445-456. ⟨10.1080/03079457.2022.2084362⟩ Article dans une revue hal-03700012v1
Avian metapneumovirus: A five-plex digital droplet RT-PCR method for identification of subgroups A, B, C, and D Evelyne Lemaitre,Stéphanie Bougeard,Chantal Allée,Nicolas Eterradossi,Céline Courtillonet al. Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.1058294. ⟨10.3389/fvets.2022.1058294⟩ Article dans une revue anses-03965626v1
Colisée - Maîtrise de la colibacillose du poulet : quelles pistes d’action ? Julie Puterflam,Rozenn Souillard,Loïc Balaine,P. Galliot,Pierrick Lucaset al. Innovations Agronomiques, 2022, 85, pp.83-92. ⟨10.17180/ciag-2022-vol85-art07⟩ Article dans une revue hal-03727784v1
Multivariate analysis of Just-About-Right data with optimal scaling approach Martin Pariès,Stéphanie Bougeard,Evelyne Vigneau Food Quality and Preference, 2022, 102, pp.104681. ⟨10.1016/j.foodqual.2022.104681⟩ Article dans une revue anses-03967913v1
Description and validation of a new set of PCR markers predictive of avian pathogenic Escherichia coli virulence Camille Lucas,Sabine Delannoy,Catherine Schouler,Rozenn Souillard,Laetitia Le Devendecet al. Veterinary Microbiology, 2022, 273, 7 p. ⟨10.1016/j.vetmic.2022.109530⟩ Article dans une revue hal-03768115v1
Blood B Cell Depletion Reflects Immunosuppression Induced by Live-Attenuated Infectious Bursal Disease Vaccines Céline Courtillon,Chantal Allée,Michel Amelot,Alassane Keita,Stéphanie Bougeardet al. Frontiers in Veterinary Science, 2022, 9, pp.871549. ⟨10.3389/fvets.2022.871549⟩ Article dans une revue anses-03798831v1
Do Rubber Floor Mats Prevent Lameness in Gestating Sows Housed in Large Groups? A Field Experiment on Three Commercial Farms in France Adeline Huneau-Salaün,Stéphanie Bougeard,Loïc Balaine,Florent Eono,Éric Evenoet al. Animals, 2021, 11 (11), pp.3160. ⟨10.3390/ani11113160⟩ Article dans une revue anses-03462283v1
Spatiotemporal clustering and Random Forest models to identify risk factors of African swine fever outbreak in Romania in 2018–2019 Mathieu Andraud,Stéphanie Bougeard,Theodora Chesnoiu,Nicolas Rose Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.2098. ⟨10.1038/s41598-021-81329-x⟩ Article dans une revue anses-03455221v1
Genome Evolution of Two Genetically Homogeneous Infectious Bursal Disease Virus Strains During Passages in vitro and ex vivo in the Presence of a Mutagenic Nucleoside Analog Liliana Cubas-Gaona,Alexandre Flageul,Céline Courtillon,Francois-Xavier Briand,Maud Contrantet al. Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.678563. ⟨10.3389/fmicb.2021.678563⟩ Article dans une revue anses-03455514v1
Mortality of marine mussels Mytilus edulis and M. galloprovincialis : systematic literature review of risk factors and recommendations for future research Coralie Lupo,Stephanie Bougeard,Véronique Le Bihan,Jean Louis Blin,Gwenhael Allainet al. Reviews in Aquaculture, 2021, 13 (1), pp.504-536. ⟨10.1111/raq.12484⟩ Article dans une revue hal-03411037v1
Diversity of Escherichia coli strains isolated from day-old broiler chicks, their environment and colibacillosis lesions in 80 flocks in France Sabine Delannoy,Catherine Schouler,Rozenn Souillard,Léna Yousfi,Laetitia Le Devendecet al. Veterinary Microbiology, 2021, 252, pp.108923. ⟨10.1016/j.vetmic.2020.108923⟩ Article dans une revue hal-03107169v1
Impact of Escherichia coli probiotic strains ED1a and Nissle 1917 on the excretion and gut carriage of extended-spectrum beta-lactamase-producing E. coli in pigs Gwénaëlle Mourand,Frédéric Paboeuf,Pauline Grippon,Pierrick Lucas,Stéphanie Bougeardet al. Veterinary and Animal Science, 2021, 14, pp.100217. ⟨10.1016/j.vas.2021.100217⟩ Article dans une revue anses-04423941v1
DUGMO: tool for the detection of unknown genetically modified organisms with high-throughput sequencing data for pure bacterial samples Julie Hurel,Sophie S. Schbath,Stéphanie Bougeard,Mathieu Rolland,Mauro Petrilloet al. BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), ⟨10.1186/s12859-020-03611-5⟩ Article dans une revue hal-02914869v1
Régression multibloc sur classes latentes. Application à l’usage d’antibiotiques en élevages de lapins Stéphanie Bougeard,Claire Chauvin,Gilbert Saporta,Ndèye Niang Epidémiologie et Santé Animale, 2019, 76, pp.43-53 Article dans une revue hal-02919886v1
Multi-block PLS discriminant analysis for the joint analysis of metabolomic and epidemiological data Marion Brandolini-Bunlon,Mélanie Pétéra,P. Gaudreau,Blandine Comte,S. Bougeardet al. Metabolomics, 2019, 15 (10), ⟨10.1007/s11306-019-1598-y⟩ Article dans une revue hal-02308942v1
Clusterwise analysis for multiblock component methods Stéphanie Bougeard,Hervé Abdi,Gilbert Saporta,Ndèye Niang Advances in Data Analysis and Classification, 2018, 12 (2), pp.285-313. ⟨10.1007/s11634-017-0296-8⟩ Article dans une revue hal-02470765v1
A New Micro-Batch Approach for Partial Least Square Clusterwise Regression Gaël Beck,Hanane Azzag,Stéphanie Bougeard,Mustapha Lebbah,Ndèye Niang Procedia Computer Science, 2018, 144, pp.239-250. ⟨10.1016/j.procs.2018.10.525⟩ Article dans une revue hal-02471601v1
Application of multiblock modelling to identify key drivers for antimicrobial use in pig production in four European countries Lucie Collineau,Stéphanie Bougeard,Annette Backhans,Jeroen Dewulf,Ulf Emanuelsonet al. Epidemiology and Infection, 2018, 146 (08), pp.1003-1014. ⟨10.1017/S0950268818000742⟩ Article dans une revue hal-02621581v1
Prediction for regularized clusterwise multiblock regression Stéphanie Bougeard,Véronique Cariou,Gilbert Saporta,Ndèye Niang Applied Stochastic Models in Business and Industry, 2018, 34 (6), pp.852-867. ⟨10.1002/asmb.2335⟩ Article dans une revue hal-02470028v1
Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework Stéphanie Bougeard,Ndeye Niang Keita,Xavier Bry,Thomas Verron Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2018, 182, pp.131-148. ⟨10.1016/j.chemolab.2018.09.003⟩ Article dans une revue hal-01962769v1
Supervised Multiblock Analysis in R with the ade4 Package Stéphanie Bougeard,Stéphane Dray Journal of Statistical Software, 2018, 86 (1), ⟨10.18637/jss.v086.i01⟩ Article dans une revue hal-02325703v1
Campylobacter coli in Organic and Conventional Pig Production in France and Sweden: Prevalence and Antimicrobial Resistance Isabelle Kempf,Annaelle Kerouanton,Stéphanie Bougeard,Bérengère Nagard,Valérie Roseet al. Frontiers in Microbiology, 2017, 8, ⟨10.3389/fmicb.2017.00955⟩ Article dans une revue hal-04258469v1
A pan-European epidemiological study reveals honey bee colony survival depends on beekeeper education and disease control Antoine Jacques,Marion Laurent,Magali Ribière-Chabert,Mathilde Saussac,Stéphanie Bougeardet al. PLoS ONE, 2017, 12 (3), pp.e0172591. ⟨10.1371/journal.pone.0172591⟩ Article dans une revue anses-03793136v1
Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance Marie-Pierre Chauzat,Antoine Jacques,Marion Laurent,Stéphanie Bougeard,Pascal Hendrikxet al. Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩ Article dans une revue anses-03793139v1
Risk indicators affecting honeybee colony survival in Europe: one year of surveillance Marie-Pierre Chauzat,Antoine Jacques,Marion Laurent,Stéphanie Bougeard,Pascal Hendrikxet al. Apidologie, 2016, 47 (3), pp.348-378. ⟨10.1007/s13592-016-0440-z⟩ Article dans une revue hal-01532482v1
Impact of colistin sulfate treatment of broilers on the presence of resistant bacteria and resistance genes in stored or composted manure Laetitia Le Devendec,Gwénaëlle Mourand,Stéphanie Bougeard,Julien Léaustic,Eric Jouyet al. Veterinary Microbiology, 2016, 194, pp.98-106. ⟨10.1016/j.vetmic.2015.11.012⟩ Article dans une revue istex hal-02488665v1
Multiblock modeling for complex preference study. Application to European preferences for smoked salmon Stephanie Bougeard,Mireille Cardinal Food Quality and Preference, 2014, 32 (Part A), pp.56-64. ⟨10.1016/j.foodqual.2013.06.002⟩ Article dans une revue hal-04499517v1
Algorithms for multi-group PLS Aïda Eslami,El Mostafa Qannari,Achim Kohler,Stéphanie Bougeard Journal of Chemometrics, 2014, 28 (3), pp.192-201. ⟨10.1002/cem.2593⟩ Article dans une revue istex hal-02634546v1
Multivariate analysis of multiblock and multigroup data A. Eslami,E. M. Qannari,A. Kohler,S. Bougeard Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems, 2014, 133, pp.63-69. ⟨10.1016/j.chemolab.2014.01.016⟩ Article dans une revue hal-05013509v1
General overview of methods of analysis of multi-group datasets Aida Eslami,Achim Kohler,El Mostafa Qannari,Stéphanie Bougeard Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, Advances in Theory and Applications of High Dimensional and Symbolic Data Analysis, RNTI-E-25, pp.108-123 Article dans une revue hal-05014438v1
Analyses factorielles de données structurées en groupes d'individus Aida Eslami,El Mostafa Qannari,Achim Kohler,Stéphanie Bougeard Journal de la Société Française de Statistique, 2013 Article dans une revue hal-05014378v1
Multiblock redundancy analysis: interpretation tools and application in epidemiology Stéphanie Bougeard,El Mostafa Qannari,Nicolas Rose Journal of Chemometrics, 2011, 25 (9), pp.467-475. ⟨10.1002/cem.1392⟩ Article dans une revue hal-05017104v1
Campylobacter from sows in farrow-to-finish pig farms: Risk indicators and genetic diversity Martine Denis,Emmanuelle Henrique,Bérengère Chidaine,Annie Tircot,Stéphanie Bougeardet al. Veterinary Microbiology, 2011, 154 (1-2), pp.163-170. ⟨10.1016/j.vetmic.2011.07.001⟩ Article dans une revue istex hal-04258588v1
Multiblock redundancy analysis from a user's perspective. Application in veterinary epidemiology. Stéphanie Bougeard,El Mostafa Qannari,Coralie Lupo,Claire Chauvin Electronic Journal of Applied Statistical Analysis, 2011, 4 (2), ⟨10.1285/i20705948v4n2p203⟩ Article dans une revue hal-05017030v1
Replication efficiency of rolling-circle replicon-based plasmids derived from porcine circovirus 2 in eukaryotic cells. Florence Faurez,Daniel Dory,Aurélie Henry,Stéphanie Bougeard,André Jestin Journal of Virological Methods, 2010, 165 (1), pp.27-35. ⟨10.1016/j.jviromet.2009.12.013⟩ Article dans une revue hal-00493407v1
Detection of Listeria monocytogenes in raw and pasteurized liquid whole eggs and characterization by PFGE. Katell Rivoal,Stéphane Quéguiner,Evelyne Boscher,Stéphanie Bougeard,Gwennola Ermelet al. International Journal of Food Microbiology, 2010, 138 (1-2), pp.56-62. ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2010.01.013⟩ Article dans une revue istex hal-00473747v1
Influence of pesticide residues on honey bee (Hymenoptera: Apidae) colony health in France. Marie-Pierre Chauzat,Patrice Carpentier,Anne-Claire Martel,Stéphanie Bougeard,Nicolas Cougouleet al. Environmental Entomology, 2009, 38 (3), pp.514-23. ⟨10.1603/022.038.0302⟩ Article dans une revue hal-00417646v1
Temperature sensitivity on growth and/or replication of H1N1, H1N2 and H3N2 influenza A viruses isolated from pigs and birds in mammalian cells. Pascale Massin,Gaëlle Kuntz-Simon,Cyril Barbezange,Céline Deblanc,Aurélie Ogeret al. Veterinary Microbiology, 2009, epub ahead of print. ⟨10.1016/j.vetmic.2009.10.012⟩ Article dans une revue istex pasteur-00457734v1
Impact of deoxynivalenol on the intestinal microflora of pigs Yann Wache,Charlotte Valat,Gilbert Postollec,Stephanie Bougeard,Christine Burelet al. International Journal of Molecular Sciences, 2008, 10 (1), pp.1-17. ⟨10.3390/ijms10010001⟩ Article dans une revue hal-01985348v1
ACPVI multibloc. Application en épidémiologie animale Stéphanie Bougeard,Mohamed Hanafi,El Mostafa Qannari Journal de la Société Française de Statistique, 2007, 148 (4), pp.78-94 Article dans une revue hal-04506070v1
Multiblock latent root regression. Application to epidemiological data Stéphanie Bougeard,Mohamed Hanafi,El Mostafa Qannari Computational Statistics, 2007, 22 (2), pp.209-222. ⟨10.1007/s00180-007-0036-1⟩ Article dans une revue istex hal-04506046v1

Communication dans un congrès (35)

Multiblock Analysis of Distributional Data Paula Brito,Ndèye Niang,A. Pedro Duarte Silva,Stéphanie Bougeard Symbolic Data Analysis Workshop 2025, Jun 2025, Varaždin, Croatia Communication dans un congrès hal-05153737v1
Explorer les structures d’observations communes, partiellement communes et spécifiques à plusieurs blocs de variables Stéphanie Bougeard,Jean-Michel Galharret,Mohamed Hanafi Rencontres de la Société Francophone de Classification (SFC25), Jun 2025, Dijon, France Communication dans un congrès anses-05509505v1
Multiblock Analysis of Distributional Data Paula Brito,Ndèye Niang,A. Pedro Duarte Silva,Stéphanie Bougeard 9th conference of Data Science, Statistics, and Visualisation (DSSV 2025), Jul 2025, Kruger National Park, South Africa Communication dans un congrès hal-05153676v1
Prevalence and diversity of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis Manon Dechêne-Tempier,Stéphanie Bougeard,Valentin Loux,Hélène Chiapello,Virginie Libanteet al. International Conference on type IV secretion system, UMR1128 DynAMic; PROPULS', Feb 2025, Nancy, France Communication dans un congrès hal-05286237v1
Salmonella strikes harder in the presence of Campylobacter, fueling chicken colonization Muriel Guyard-Nicodème,Guillaume Larivière-Gauthier,Cyrielle Payen,Laëtitia Bonifait,Sophie Mompelatet al. I3S 2025, INNOZH, Jun 2025, Saint-Malo, France Communication dans un congrès anses-05191637v1
Principal Components Analysis with Optimal Scaling: A way to integrate sensory analysis, physico-chemical measurements and experimental factors. Evelyne Vigneau,Stéphanie Bougeard AgroStat 2024, Société Française de Statistique (SFdS) & Polytechnic Institute of Bragança (IPB), Sep 2024, Bragança, Portugal Communication dans un congrès hal-05039113v1
Performance of infrared spectroscopy to predict serogroup and ability of adhesion of Listeria monocytogenes compared to genomic analysis Evelyne Boscher,Stéphanie Bougeard,M. Guy,Emmanuelle Houard,Arnaud Feltenet al. ISOPOL XXI, Matthew Gilmour, Sep 2024, Norwich, UK, United Kingdom Communication dans un congrès anses-04811451v1
Epizootie d’Influenza Aviaire Hautement Pathogène en France en 2022-2023 : importance des facteurs environnementaux Maryem Ben Salem,Mathieu Andraud,Stéphanie Bougeard,Sophie Le Bouquin,Virginie Allainet al. 15. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2024, Tours, France. pp.236-240 Communication dans un congrès hal-04539486v1
Honey bee health in a world of pathogens and pesticides: measurement and interpretation of large data sets Marie-Pierre Chauzat,Marion Laurent,Minh Huyen Ton Nu Nguyet,Lucile Caradec,Florence Ghestemet al. Bee Health Symposium, Jun 2024, Madrid, Spain Communication dans un congrès anses-04805742v1
MBPCA-OS: an exploratory multiblock method for variables of different measurement levels. Application to study the immune response to SARS-CoV-2 infection and vaccination Martin Pariès,Evelyne Vigneau,Adeline Huneau,Olivier Lantz,Stéphanie Bougeard CARME (Correspondence Analysis and Related Methods), Sep 2023, Bonn, Germany Communication dans un congrès anses-05040102v1
Mobile genetic elements that carry macrolide-lincosamide and tetracycline resistance genes in Streptococcus suis strains isolated in France Manon Dechêne-Tempier,Eric Jouy,Virginie Libante,Stéphanie Bougeard,Sophie Payotet al. 5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand Communication dans un congrès hal-04232467v1
Relationships between intensity, Just-About-Right and liking variables using PLS-PM approach Evelyne Vigneau,Martin Paries,Stéphanie Bougeard AgroStat 2022, Société Française de Statistique (SFdS), Jun 2022, Lyon, France Communication dans un congrès hal-05469463v1
Multiblock analysis of mixed data with Optimal Scaling. Application in epidemiology. Martin Pariès,Evelyne Vigneau,Stéphanie Bougeard 24th International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT2022), University of Bologna, Italy, Aug 2022, Bologna (ITALY), France Communication dans un congrès hal-05470179v1
Control of Salmonella in Powdered Infant Formula Pauline Kooh,Moez Sanaa,Mickaël Boni,Stéphanie Bougeard,Bernard Caronet al. International Symposium Salmonella and Salmonellosis, Jun 2022, Saint-Malo, France. pp.90 Communication dans un congrès hal-03845650v1
Multivariate analysis of Just-About-Right scale data with optimal scaling Martin Pariès,Stéphanie Bougeard,Evelyne Vigneau AgroStat 2021, Société Française de Statistique (SFdS), Sep 2021, Virtual conference (Covid), France Communication dans un congrès hal-05473663v1
Apparition et sélection de variants d'un avibirnavirus soumis à diverses pressions de sélection lors de culture ex vivo basée sur des lymphocytes B aviaires Liliana L Cubas-Gaona,Alexandre Flageul,Céline Courtillon,François‐xavier Briand,Maud Contrantet al. XXIIIèmes Journées Francophones de Virologie, société française de virologie, Apr 2021, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-04738985v1
Antigenic cartography sheds new light on infectious bursal disease virus diversity Liliana L Cubas-Gaona,Céline Courtillon,François‐xavier Briand,Stéphanie Bougeard,Edouard Hirchaudet al. Avian infectious diseases 2021, British microbiology society, Sep 2021, Pirbright, United Kingdom Communication dans un congrès hal-04738984v1
Combined-information criterion for clusterwise elastic-net regression. Application to omic data Stéphanie Bougeard,Xavier Bry,Thomas Verron,Ndèye Niang 8th Channel Network Conference, Cnam, Apr 2021, Paris, France Communication dans un congrès hal-03541298v1
Component-based method for mixed data. Application in biology Martin Pariès,Evelyne Vigneau,Stéphanie Bougeard 19th Conference of the Applied Stochastic Models and Data Analysis International Society, ASMDA2021, Jun 2021, Virtual conference (Covid), Greece Communication dans un congrès hal-05473628v1
A new tool for multi-block PLS discriminant analysis: application to metabolomic data in systems epidemiology Marion Brandolini-Bunlon,Mélanie Pétéra,Pierrette Gaudreau,Blandine Comte,Stéphanie Bougeardet al. Conférence Chimiométrie 2020, Jan 2020, Liège, Belgium Communication dans un congrès hal-02790379v1
A new tool for multi-block PLS discriminant analysis of metabolomic data: application to systems epidemiology Marion Brandolini-Bunlon,Mélanie Pétéra,Pierrette Gaudreau,Blandine Comte,Stephanie Bougeardet al. 12. Journées Scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2019, Clermont-Ferrand, France Communication dans un congrès hal-02154660v1
Quantifier, expliquer et réduire l’usage des antibiotiques en élevage porcin en Europe : bilan du projet MINAPIG Lucie Collineau,Stéphanie Bougeard,Stéphane Krebs,Claire Chauvin,Catherine Belloc 50. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2018, Paris, France Communication dans un congrès hal-02734654v1
Current multiblock methods: competition or complementarity? A comparative study in a unified framework Stéphanie Bougeard,Ndeye Niang Keita,Thomas Verron,Xavier Bry Agrostat 2018, Mar 2018, Marseille, France Communication dans un congrès hal-02065531v1
Clusterwise multiblock PLS Ndèye Niang,Stéphanie Bougeard,Gilbert Saporta SFC 2018, Sep 2018, Paris, France Communication dans un congrès hal-02471608v1
Clusterwise Sparse PLS Stéphanie Bougeard,Ndeye Niang-Keita,Cristian Preda,Gilbert Saporta PLS'17, Jun 2017, Macao, Macau SAR China Communication dans un congrès hal-02475001v1
Prédiction en régression clusterwise PLS Ndèye Niang,Stéphanie Bougeard,Gilbert Saporta 48 èmes Journées de Statistique, May 2016, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02500605v1
Regularized clusterwise multiblock regression Stéphanie Bougeard,Ndèye Niang,Gilbert Saporta Compstat 2016, Aug 2016, Oviedo, Spain Communication dans un congrès hal-02500591v1
Some Sparse Methods for High Dimensional Data Gilbert Saporta,Anne Bernard,Stéphanie Bougeard,Ndèye Niang,Cristian Preda H2DM International Workshop on High Dimensional Data Mining, Jun 2016, Naples, Italy Communication dans un congrès hal-02500643v1
Clusterwise multiblock PLS Ndeye Niang-Keita,Stéphanie Bougeard,Gilbert Saporta,Hervé Abdi CARME 2015: Correspondence Analysis and Related Methods, Sep 2015, Napoli, Italy Communication dans un congrès hal-02507449v1
Les méthodes « clusterwise » : principes et applications Gilbert Saporta,Stéphanie Bougeard,Ndeye Niang-Keita XXII èmes rencontres de la Société Francophone de Classification, Sep 2015, Nantes, France Communication dans un congrès hal-02507509v1
Clusterwise multiblock PLS regression Ndeye Niang-Keita,Stéphanie Bougeard,Gilbert Saporta CFE-CMStats, Dec 2015, London, United Kingdom Communication dans un congrès hal-02507429v1
Analyse de (K+1) tableaux avec le logiciel ade4. Application en épidémiologie. Stéphanie Bougeard,Stéphane Dray 1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France Communication dans un congrès hal-00717559v1
Etudes des lésions pulmonaires chez le porc : una analyse symbolique sur des concepts issus de l'approche classique Christelle Fablet,Carole Toque,Stéphanie Bougeard,Edwin Diday 42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France Communication dans un congrès inria-00494799v1
ACPVI multibloc qualitative. Application en épidémiologie vétérinaire. Stéphanie Bougeard,El Mostafa Qannari,Christelle Fablet 41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France Communication dans un congrès inria-00386614v1
Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies Exemptes d'Organismes Pathogènes Spécifiques (EOPS) Roland Cariolet,Isabelle P. Oswald,Gérald Le Diguerher,Stéphanie Bougeard,Anne Marie Cossalteret al. 39. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2007, Paris, France Communication dans un congrès hal-02756742v1

Poster de conférence (9)

Bacterial and farm management risk factors in raw milk cheese production Alisia Chiadò Rana,Géraldine Cazeau,Stéphanie Bougeard,Kevin Bethune,Vincent Chochoiset al. Conference Society for Veterinary Epidemiology and Preventive Medicine (SVEPM), Mar 2025, Berlin, Germany. 86, 2018 Poster de conférence anses-05151336v1
Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in Streptococcus suis strains isolated in France, under a “One Health” approach. Manon Dechêne-Tempier,Virginie Libante,Eric Jouy,Claire de Boisséson,Pierrick Lucaset al. The One Health challenges to tackle infectious diseases, Jun 2024, Saint-Brieuc, France, France Poster de conférence hal-05286331v1
Factors contributing to the prevalence of Integrative and Conjugative or Mobilizable Elements carrying antimicrobial resistance genes in Streptococcus suis Stéphanie Bougeard,Manon Dechêne-Tempier,Valentin Loux,Hélène Chiapello,Virginie Libanteet al. 5th International Workshop on Streptococcus suis, Jun 2023, Bangkok / Thailand, Thailand Poster de conférence hal-04232466v1
Improvement of maldi-tof for the identification of Aeromonas salmonicida and Aeromonas bestiarum : two important fish pathogen Jean-Sébastien Py,Maureen Feucherolles,Yann Vanrobaeys,Eric Jouy,Laetitia Le Devendecet al. 13. International Symposium on Aeromonas and Plesiomonas (ISAP), Jun 2023, Wroclaw, Poland. 2023 Poster de conférence anses-04168208v1
Control of Salmonella and Cronobacter spp. in powdered infant formula Pauline Kooh,Moez Sanaa,M. Boni,Stephanie Bougeard,Bernard Caronet al. FoodMicro2022, Aug 2022, Athene, Greece. , 2022 Poster de conférence anses-03903055v1
Les facteurs déclenchants de la colibacillose du poulet de chair : étude épidémiologique dans 80 élevages en France Julie Puterflam,Pascal Galliot,Loïc Balaine,Isabelle Kempf,Laetitia Le Devendecet al. 14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours, France Poster de conférence hal-03775530v1
Immunisation passive des poussins par l'administration d'un autovaccin aux poules reproductrices Alassane Keita,Laetitia Le Devendec,Michel Amelot,Julie Puterflam,Camille Lucaset al. 14èmes Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2022, Tours (France), France. 2022 Poster de conférence anses-04082645v1
Detection of unknown genetically modified organisms (GMO) by statistical analysis of high throughput sequencing data Julie Hurel,Mathieu Roland,Sophie Schbath,Stéphanie Bougeard,Mauro Petrilloet al. JOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France. , 2019 Poster de conférence hal-02734732v1
Acquisition de l'immunité passive chez des porcelets issus de truies exemptes d'organismes pathogènes spécifiques &quot;EOPS R Cariolet,Isabelle P. Oswald,G Le Diguerher,S Bougeard,Anne Marie Cossalteret al. Journées de la Recherche Porcine, 2007, France. pp.Inconnu, 2007 Poster de conférence hal-02815333v1

Logiciel (1)

ade4: Analysis of Ecological Data: Exploratory and Euclidean Methods in Environmental Sciences Stéphane Dray,Anne-Béatrice Dufour,Jean Thioulouse,Aurélie Siberchicot,Thibaut Jombartet al. 2024, ⟨swh:1:dir:95f239f062befdbdcdafff9f7481b8c21fdeff6c⟩ Logiciel hal-04690682v1

Rapport (2)

Expérimentation de vaccination des canards mulards en élevage contre un virus influenza aviaire hautement pathogène A(H5N1) clade 2.3.4.4b Béatrice Grasland,Audrey Schmitz,Éric Niqueux,Rachel Busson,Nadège Morinet al. Anses; ENVT. 2023, 30 p Rapport hal-04158032v1
Revue systématique de la littérature relative aux facteurs de risque de mortalité des moules exploitées en France - Rapport du Conseil scientifique et technique du programme de recherche en santé des coquillages : étude éco-épidémiologique Coralie Lupo,Stéphanie Bougeard,Claire Chauvin,Morgane Danion,Gwenhael Allainet al. [Rapport de recherche] Anses. 2019 Rapport (rapport de recherche) hal-02087720v1

HDR (1)

Statistical analysis of links between blocks of variables Stéphanie Bougeard Statistics [stat]. Université Rennes 2, 2019 HDR tel-04723882v1

Thèse (1)

Description et prédiction à partir de données structurées en plusieurs tableaux : Application en épidémiologie animale. Stéphanie Bougeard domain_other. Université Rennes 2, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00267595v1