Sylvain Jay Ingénieur de recherche en traitement du signal et des images pour la proxidétection des cultures

Identifiants chercheurs

IdHAL :

sylvain-jay

ORCID :

0000-0001-8488-834X

IdRef :

169883019

Présentation

Mes recherches portent sur le développement d’algorithmes de traitement du signal et des images permettant de caractériser les cultures à partir de données de phénotypage acquises au champ par proxidétection. Les cultures ciblées incluent à la fois des cultures annuelles (monocultures et mélanges d'espèces) et pérennes (vergers).Ces données de phénotypage à haute résolution spatiale (le plus souvent millimétrique ou centimétrique) sont acquises à l’aide de différents capteurs optiques (caméras RGB, multispectrales et hyperspectrales, LiDARs) embarqués sur divers vecteurs (système portatif, Phénomobile, drone). Les méthodes que je développe sont basées notamment sur le deep / machine learning, la modélisation du transfert radiatif et la stéréovision. Elles permettent d'estimer différents traits structuraux (par ex., la surface foliaire) et biochimiques (par ex., le contenu en chlorophylle) de la végétation de façon rapide et non-destructive sur un grand nombre de parcelles élémentaires pouvant regrouper une diversité de sites d’essai, d’espèces, de variétés et de conduites culturales.In fine, ces nouveaux outils de phénotypage doivent faciliter la sélection de variétés plus productives et/ou plus résilientes face aux stress (a)biotiques. Ils doivent également permettre d'identifier de nouveaux systèmes de culture agroécologiques reposant sur une économie d’intrants, la régulation des bioagresseurs par le contrôle biologique, tout en garantissant une production de qualité.

Publications

Article dans une revue (34)

NRT-GSF: A novel near-real-time ground-satellite fusion algorithm to retrieve daily green area index at field scale Wenjuan Li,Marie Weiss,Samuel Buis,Aleixandre Verger,Sylvain Jayet al. Remote Sensing of Environment, 2026, 333, pp.115160. ⟨10.1016/j.rse.2025.115160⟩ Article dans une revue hal-05447066v1
High-throughput phenotyping of wheat ear surface area and ear density in the field Marie-Pia d'Argaignon,Raul Lopez-Lozano,Sylvain Jay,Aurélien Ausset,Bruno Berthonet al. Plant Phenomics, 2026, 8 (2), pp.100199. ⟨10.1016/j.plaphe.2026.100199⟩ Article dans une revue hal-05561382v1
Estimating small-grain cereal plant density at early growth stages using leaf tip density dynamics derived from submillimeter-scale RGB imagery Tiancheng Yang,Sylvain Jay,Benoit de Solan,Yinglun Li,Chen Zhuet al. Computers and Electronics in Agriculture, 2025, 239, pp.111053. ⟨10.1016/j.compag.2025.111053⟩ Article dans une revue hal-05363376v1
Comparative analysis of aerial and terrestrial imaging techniques for assessing flowering intensity of diverse Malus cultivars Nathan Guilhot,Jeremy Labrosse,Isabelle Farrera,Guillaume Perez,Florence Meunieret al. Acta Horticulturae, 2025, 1439, pp.161-168. ⟨10.17660/ActaHortic.2025.1439.22⟩ Article dans une revue hal-05404160v1
Registration of close-range, multi-lens multispectral imagery by retrieving the scene 3D structure Sylvain Jay,Frédéric Baret,Samuel Thomas,Marie Weiss ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, 2025, 227, pp.125-144. ⟨10.1016/j.isprsjprs.2025.06.001⟩ Article dans une revue hal-05126456v1
Daily monitoring of Effective Green Area Index and Vegetation Chlorophyll Content from continuous acquisitions of a multi-band spectrometer over winter wheat Wenjuan Li,Marie Weiss,Sylvain Jay,Shanshan Wei,Na Zhaoet al. Remote Sensing of Environment, 2024, 300 (113883), pp.1-47. ⟨10.1016/j.rse.2023.113883⟩ Article dans une revue hal-04315243v1
The balance between spectral and spatial information to estimate straw cereal plant density at early growth stages from optical sensors Tiancheng Yang,Sylvain Jay,Yangmingrui Gao,Shouyang Liu,Frederic Baret Computers and Electronics in Agriculture, 2023, 215, pp.1-64. ⟨10.1016/j.compag.2023.108458⟩ Article dans une revue hal-04315227v1
Modeling and Unsupervised Unmixing Based on Spectral Variability for Hyperspectral Oceanic Remote Sensing Data with Adjacency Effects Yannick Deville,Salah-Eddine Brezini,Fatima Zohra Benhalouche,Moussa Sofiane Karoui,Mireille Guillaumeet al. Remote Sensing, 2023, 15, pp.4583. ⟨10.3390/rs15184583⟩ Article dans une revue hal-04209872v1
Development of a Large-Eddy Simulation Methodology for the Analysis of Cycle-to-Cycle Combustion Variability of a Lean Burn Engine O. Benoit,K. Truffin,S. Jay,J. van Oijen,Y. Drouvinet al. Flow, Turbulence and Combustion, 2022, 108 (2), pp.559-598. ⟨10.1007/s10494-021-00278-7⟩ Article dans une revue hal-03693904v1
A Double Swath Configuration for Improving Throughput and Accuracy of Trait Estimate from UAV Images Wenjuan Li,Alexis Comar,Marie Weiss,Sylvain Jay,Gallian Colombeauet al. Plant Phenomics, 2021, 2021, pp.1-11. ⟨10.34133/2021/9892647⟩ Article dans une revue hal-03583959v1
Scoring Cercospora Leaf Spot on Sugar Beet: Comparison of UGV and UAV Phenotyping Systems S. Jay,A. Comar,R. Benicio,J. Beauvois,D. Dutartreet al. Plant Phenomics, 2020, 2020, pp.1-18. ⟨10.34133/2020/9452123⟩ Article dans une revue hal-03583933v1
Mapping Benthic Habitats by Extending Non-Negative Matrix Factorization to Address the Water Column and Seabed Adjacency Effects Mireille Olwen Guillaume,Audrey Minghelli,Yannick Deville,Malik Chami,Louis Justeet al. Remote Sensing, 2020, remote sensing vol 12, 12 (13), 2072 (23p.). ⟨10.3390/rs12132072⟩ Article dans une revue hal-02888921v1
PHENOBET : Combinaison de données issues de capteurs de phénotypage avec des modèles de culture pour caractériser les variétés de betterave sucrière. F. Maupas,J. Adrian,F. Joudelat,F. Brun,Sylvain Jay Innovations Agronomiques, 2020, 79, pp.257-266. ⟨10.15454/rkkk-cw07⟩ Article dans une revue hal-03117858v1
Analysis and quantification of seabed adjacency effects in the subsurface upward radiance in shallow waters Malik Chami,Xavier Lenot,Mireille Guillaume,Bruno Lafrance,Xavier Briottetet al. Optics Express, 2019, 27 (8), pp.A319. ⟨10.1364/OE.27.00A319⟩ Article dans une revue insu-02077634v1
Characterization of building materials by means of spectral remote sensing: The example of Carcassonne's defensive wall (Aude, France) C. Sciuto,Dominique Allios,R. Bendoula,A. Cocoual,M.-E. Gardelet al. Journal of Archaeological Science: Reports, 2019, 23, pp.396-405. ⟨10.1016/j.jasrep.2018.10.030⟩ Article dans une revue hal-02188160v1
Exploiting the centimeter resolution of UAV multispectral imagery to improve remote-sensing estimates of canopy structure and biochemistry in sugar beet crops Sylvain Jay,Frédéric Baret,Dan Dutartre,Ghislain Malatesta,Stéphanie Hénoet al. Remote Sensing of Environment, 2019, 231, pp.110898. ⟨10.1016/j.rse.2018.09.011⟩ Article dans une revue hal-03583922v1
Estimating leaf mass per area and equivalent water thickness based on leaf optical properties: potential and limitations of physical modeling and machine learning. Jean-Baptiste Féret,G. Le Maire,S. Jay,D. Berveiller,Ryad Bendoulaet al. Remote Sensing of Environment, 2019, 231, pp.110959. ⟨10.1016/j.rse.2018.11.002⟩ Article dans une revue hal-02939160v1
Predicting minimum uncertainties in the inversion of ocean color geophysical parameters based on Cramer-Rao bounds Sylvain Jay,Mireille Guillaume,Malik Chami,Audrey Minghelli,Yannick Devilleet al. Optics Express, 2018, 26 (2), pp.A1-A18. ⟨10.1364/OE.26.0000A1⟩ Article dans une revue insu-01671185v1
Exploring the potential of PROCOSINE and close-range hyperspectral imaging to study the effects of fungal diseases on leaf physiology Julien Morel,S. Jay,Jean-Baptiste Féret,A. Bakache,R. Bendoulaet al. Scientific Reports, 2018, 8 (15933), 13 p. ⟨10.1038/s41598-018-34429-0⟩ Article dans une revue hal-01926500v1
Retrieving LAI, chlorophyll and nitrogen contents in sugar beet crops from multi-angular optical remote sensing: Comparison of vegetation indices and PROSAIL inversion for field phenotyping Sylvain Jay,Fabienne Maupas,Ryad Bendoula,Nathalie Gorretta Field Crops Research, 2017, 210, pp.33-46. ⟨10.1016/j.fcr.2017.05.005⟩ Article dans une revue hal-01730271v1
Hyperspectral remote sensing of shallow waters: Considering environmental noise and bottom intra-class variability for modeling and inversion of water reflectance Sylvain Jay,Mireille Guillaume,Audrey Minghelli,Yannick Deville,Malik Chamiet al. Remote Sensing of Environment, 2017, 200, pp.352 - 367. ⟨10.1016/j.rse.2017.08.020⟩ Article dans une revue hal-03133233v1
Estimating leaf chlorophyll content in sugar beet canopies using millimeter- to centimeter-scale reflectance imagery Sylvain Jay,Nathalie Gorretta,Julien Morel,Fabienne Maupas,Ryad Bendoulaet al. Remote Sensing of Environment, 2017, 198 (198), pp.173 - 186. ⟨10.1016/j.rse2017.06.008⟩ Article dans une revue hal-01603342v1
Near infrared spectra and hyperspectral imaging of medieval fortress walls in carcassonne: a comprehensive interdisciplinary field study D. Allios,N. Guermeur,A. Cocoual,J. Linderholm,C. Sciutoet al. NIR news, 2016, 27 (3), pp.16-20. ⟨10.1255/nirn.1602⟩ Article dans une revue hal-02609383v1
Regularized estimation of bathymetry and water quality using hyperspectral remote sensing Sylvain Jay,Mireille Olwen Guillaume International Journal of Remote Sensing, 2016, 37 (2), pp.263-289. ⟨10.1080/01431161.2015.1125551⟩ Article dans une revue hal-01279585v1
A physically-based model for retrieving foliar biochemistry and leaf orientation using close-range imaging spectroscopy S. Jay,R. Bendoula,X. Hadoux,Jean-Baptiste Féret,N. Gorretta Remote Sensing of Environment, 2016, 177, pp.220-236. ⟨10.1016/j.rse.2016.02.029⟩ Article dans une revue hal-01804958v1
In-field crop row phenotyping from 3D modeling performed using Structure from Motion S. Jay,Gilles Rabatel,X. Hadoux,Daniel Moura,N. Gorretta Computers and Electronics in Agriculture, 2015, 110, pp.70-77. ⟨10.1016/j.compag.2014.09.021⟩ Article dans une revue hal-01118700v1
A spectral-spatial approach for hyperspectral image classification using spatial regularization on supervised score image X. Hadoux,Sylvain Jay,Gilles Rabatel,Nathalie Gorretta IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, 2015, 8 (6), pp.2361-2369. ⟨10.1109/JSTARS.2014.2347414⟩ Article dans une revue hal-02600360v1
A novel maximum likelihood based method for mapping depth and water quality from hyperspectral remote-sensing data Sylvain Jay,Mireille Olwen Guillaume Remote Sensing of Environment, 2014, 147, pp.121-132. ⟨10.1016/j.rse.2014.01.026⟩ Article dans une revue hal-01279611v1
Underwater target detection with hyperspectral data : solutions for both known and unknown water quality&quot;, S. Jay, M. Guillaume, J. Blanc-Talon, , IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, 5 :1213-1221, 2012. IF 2.87 Sylvain Jay,Mireille Olwen Guillaume,Jacques Blanc Talon IEEE Journal of Selected Topics in Applied Earth Observations and Remote Sensing, 2012, 2012 (5), pp.1213-1221 Article dans une revue hal-01017603v1
Development of a FPI Detailed Chemistry Tabulation Methodology for Internal Combustion Engines C. Pera,O. Colin,S. Jay Oil & Gas Science and Technology - Revue d'IFP Energies nouvelles, 2009, 64 (3), pp.243-258. ⟨10.2516/ogst/2009002⟩ Article dans une revue hal-02001532v1
Quantitative Pollutant Modelling: an Essential Prerequisite for Diesel HCCI and LTC Engine Design V. Knop,H. Kircher,S. Jay,Ph. Béard,A. Pires da Cruzet al. Oil & Gas Science and Technology - Revue d'IFP Energies nouvelles, 2008, 63 (4), pp.495-515. ⟨10.2516/ogst:2008022⟩ Article dans une revue hal-02002030v1
Kinetic modelling of a surrogate diesel fuel applied to 3D auto-ignition in HCCI engines. Roda Bounaceur,Pierre-Alexandre Glaude,René Fournet,Frédérique Battin-Leclerc,S. Jayet al. International Journal Vehicle Design, 2007, 44 (1/2), pp.124 - 142 Article dans une revue hal-00139845v1
Towards Even Cleaner Diesel Engines: Contribution of 3D CFD Tools B. Reveille,A. Kleemann,S. Jay Oil & Gas Science and Technology - Revue d'IFP Energies nouvelles, 2006, 61 (1), pp.43-56. ⟨10.2516/ogst:2006003x⟩ Article dans une revue hal-02005790v1
Latest Developments in Gasoline Auto-Ignition Modelling Applied to an Optical CAI (Tm) Engine V. Knop,S. Jay Oil & Gas Science and Technology - Revue d'IFP Energies nouvelles, 2006, 61 (1), pp.121-137. ⟨10.2516/ogst:2006008x⟩ Article dans une revue hal-02005786v1

Ouvrages (1)

L'Enquete Permanente sur les Avalanches (EPA) et la Carte de Localisation des Phénoménes d'Avalanches (CLPA) - Edition nationale de mise à disposition des données. Lydiane Bélanger,G. Borrel,R. Burnet,Sylvain Escande,S. Garciaet al. 2004 Ouvrages hal-02584044v1

Chapitre d'ouvrage (2)

3D imaging systems for agricultural applications Frédéric Cointault,Simeng Han,Gilles Rabatel,Sylvain Jay,David Rousseauet al. Developing and applying optoelectronics in machine vision, IGI Global, 344 p., 2017, Advances in Computational Intelligence and Robotics (ACIR), 2327-0411 ISBN13: 9781522506324|ISBN10: 1522506322. ⟨10.4018/978-1-5225-0632-4.ch008⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01605252v1
3D imaging systems for agricultural applications: characterization of crop and root phenotyping Frédéric Cointault,Simeng Han,Gilles Rabatel,Sylvain Jay,D. Rousseauet al. Developing and applying optoelectronics in machine vision. Sergiyenko, O. and Rodriguez-Quiñonez, J.C., IGI Global, pp.236-272, 2016 Chapitre d'ouvrage hal-02604540v1

Autre publication scientifique (1)

Site internet www.avalanches.fr Lydiane Bélanger,S. Garcia,G. Bernard,R. Burnet,G. Borrelet al. 2004 Autre publication scientifique hal-02584071v1

Rapport (3)

GAI, fAPAR, FVC,and VCW From Optical Sensors (ATBD): Taking SENTINEL-2 as an example Sentinel-2 ATBD -Version 3.0 Marie Weiss,Hongliang Ma,Frédéric Baret,Sylvain Jay INRAE; EMMAH UMR 114, CAPTE. 2024 Rapport hal-04884986v1
S2ToolBox Level 2 products LAI, FAPAR, FCOVER Marie Weiss,Frederic Baret,Sylvain Jay [Research Report] EMMAH-CAPTE, INRAe Avignon. 2020 Rapport (rapport de recherche) hal-03584016v1
S2ToolBox Level 2 products: LAI, FAPAR, FCOVER. Version 2.1 Marie Weiss,Frédéric Baret,Sylvain Jay INRAE. 2020, pp.59 Rapport hal-05088193v1

Thèse (1)

Estimation et détection en imagerie hyperspectrale : application aux environnements côtiers. Sylvain Jay Traitement du signal et de l'image [eess.SP]. Ecole Centrale Marseille, 2012. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00789945v1