Valérie Hocher

Identifiants chercheurs

IdHAL :

valerie-hocher

ORCID :

0000-0002-5522-8104

Présentation

La fixation biologique de l'azote (FBA) est un mécanisme naturel réalisé par quelques groupes de végétaux, lorsqu'ils développent une symbiose avec des bactéries diazotrophes du sol. Ces symbioses concernent en particulier les Légumineuses (Fabacées) qui s’associent à des protéobactéries collectivement appelées rhizobia,.. La compréhension de cette acquisition évolutive est au cœur de nombreux projets internationaux avec pour ambition de développer de futures stratégies permettant de limiter l’utilisation d’intrants chimiques et de promouvoir une agriculture durable plus respectueuse de l’environnement, ce qui est un enjeu majeur pour les pays du SudJe m’intéresse à l’arachide (Arachis hypogaea L.), légumineuse peu étudiée sur l’aspect symbiose, malgré son importance agronomique pour les pays du Sud dont le Sénégal . (2ème légumineuse la plus cultivée après le soja). L’arachide en symbiose avec des bactéries du genre Bradyrhizobium forme des nodules fixateurs d’azote, capable de réaliser la Fixation Biologique de l’Azote (FBA), qui permet à la plante une autonomie vis-à-vis de la nutrition azotée. Cependant l'efficacité de cette symbiose n’est pas optimale et ce caractère a été négligé dans les stratégies de sélection variétale de l’arachide.Il s’agit d’avoir une approche intégrée combinant un travail sur l’espèce végétale, en utilisant des populations issues de croisements entre l’arachide cultivé et des parents sauvages développées au CERAAS (Sénégal) ainsi qu’une collection d’arachides cultivées en Afrique pour explorer les possibilités d’amélioration variétale en ce qui concerne la symbiose fixatrice d’azote, mais aussi de prendre en compte la dimension microbiome en recherchant les souches les plus performantes. Cette dernière approche a souvent été négligée dans les schémas d’amélioration mais sa prise en compte devient indispensable dans les projets qui seront développés dans le futur .En 2021, nous avons obtenu un financement Agropolis (https://divnfix.wordpress.com/) pour développer au Sénégal et en Argentine les activités du projet DIV-N-FIX en partenariat avec l’UMR AGAP, l’ISRA au Sénégal, l’INTA et l’Université de Cordoba (Argentine).L’ensemble de ces travaux est associé à des enseignements et à l’organisation de formations (écoles thématiques) dans les pays du Sud concernés. Je parraine un projet de Jeune Equipe Associée à l’IRD (JEAI), projet coordonné par D ; FALL (chercheur ISRA) obtenu en 2022. Ce projet tourne autour de la lutte contre la salinisation des sols au Sénégal. Nous développons aussi des projets avec le Cameroun pour soutenir de jeunes chercheurs camerounais qui travaillent sur l’arachide ou sur d’autres légumineuses. Ainsi, j’ai coordonné la demande de mobilité demandée par A. Zaiya Zazou, chercheur de l’IRAD, Cameroun (en 2022) et je suis impliquée dans la JEAI AVOSAN qui implique des partenaires au Sénégal

Publications

Article dans une revue (36)

Transcriptomic analysis reveals genetic factors underlying impaired symbiotic nitrogen fixation in lines derived from crosses between cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) and its wild ancestors Darius Tchoutang Nzepang,Maimouna Cissoko,Djamel Gully,Hocher V.,Jean-François Ramiet al. BMC Genomics, 2025, 26, pp.556. ⟨10.1186/s12864-025-11739-y⟩ Article dans une revue hal-05206266v1
Setting up Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of the tropical legume Aeschynomene evenia, a powerful tool for studying gene function in Nod Factor-independent symbiosis Pierre Tisseyre,Fabienne Cartieaux,Nathalie Chabrillange,Djamel Gully,Valérie Hocheret al. PLoS ONE, 2024, 19 (4), pp.e0297547. ⟨10.1371/journal.pone.0297547⟩ Article dans une revue hal-04935456v1
Comparative phylogenomics and phylotranscriptomics provide insights into the genetic complexity of nitrogen-fixing root-nodule symbiosis Yu Zhang,Yuan Fu,Wenfei Xian,Xiuli Li,Yong Fenget al. Plant Communications, 2024, 5 (1), pp.100671. ⟨10.1016/j.xplc.2023.100671⟩ Article dans une revue hal-04304532v2
Mapping of QTLs Associated with Biological Nitrogen Fixation Traits in Peanuts (Arachis hypogaea L.) Using an Interspecific Population Derived from the Cross between the Cultivated Species and Its Wild Ancestors Darius T Nzepang,Djamel Gully,Joël R Nguepjop,Arlette Zaiya Zazou,Hodo-Abalo Tossimet al. Genes, 2023, 14 (4), pp.797. ⟨10.3390/genes14040797⟩ Article dans une revue hal-04119347v1
Permanent draft genome sequence of Bradyrhizobium vignae, strain ISRA 400, an elite nitrogen-fixing bacterium, isolated from the groundnut growing area in Senegal Diariatou Niang,Abdellatif Gueddou,Nogaye Niang,Darius Nzepang,Aissatou Sambouet al. Journal of Genomics, 2023, 11, pp.52-57. ⟨10.7150/jgen.88302⟩ Article dans une revue hal-04936670v1
Density and diversity of arbuscular mycorrhizal fungi in Anacardium occidentale L. plantations in Senegal Marie Odile Khémes,Abdoulaye Soumare,Mohamed Mahamoud Charahabil,Landing Ndiaye,Fatou Ndoyeet al. African Journal of Microbiology Research, 2023, ⟨10.5897/AJMR2023.9712⟩ Article dans une revue hal-04936669v1
Effect of symbiotic associations with Frankia and arbuscular mycorrhizal fungi on antioxidant activity and cell ultrastructure in C. equisetifolia and C. obesa under salt stress Pape Ibrahima Djighaly,Nathalie Diagne,Daouda Ngom,Keren Cooper,Sarah Pignolyet al. Journal of Forest Research, 2022, 27 (2), pp.96-99. ⟨10.1080/13416979.2022.2037837⟩ Article dans une revue hal-03588336v1
Draft genome sequence of the symbiotic Frankia sp. strain B2 isolated from root nodules of Casuarina cunninghamiana found in Algeria K. Belaid,E. Swanson,A. Carré-Mlouka,Valérie Hocher,Sergio Svistoonoffet al. Journal of Genomics, 2020, 8, pp.11-15. ⟨10.7150/jgen.38461⟩ Article dans une revue hal-04662903v1
Roles of Arbuscular Mycorrhizal Fungi on Plant Growth and Performance: Importance in Biotic and Abiotic Stressed Regulation Nathalie Diagne,Mariama Ngom,Pape Ibrahima Djighaly,Dioumacor Fall,Valérie Hocheret al. Diversity, 2020, 12 (10), ⟨10.3390/d12100370⟩ Article dans une revue hal-03127168v1
Effect of Casuarina Plantations Inoculated with Arbuscular Mycorrhizal Fungi and Frankia on the Diversity of Herbaceous Vegetation in Saline Environments in Senegal Pape Ibrahima Djighaly,Daouda Ngom,Nathalie Diagne,Dioumacor Fall,Mariama Ngomet al. Diversity, 2020, 12, ⟨10.3390/d12080293⟩ Article dans une revue hal-04936674v1
Chitotetraose activates the fungal-dependent endosymbiotic signaling pathway in actinorhizal plant species Mireille Chabaud,Joëlle Fournier,Lukas Brichet,Iltaf Abdou-Pavy,Leandro Imanishiet al. PLoS ONE, 2019, 14 (10), pp.e0223149. ⟨10.1371/journal.pone.0223149⟩ Article dans une revue hal-02961598v1
Signalling in actinorhizal root nodule symbioses Valérie Hocher,Mariama Ngom,Alyssa Carré-Mlouka,Pierre Tisseyre,Hassen Gherbiet al. Antonie van Leeuwenhoek, 2019, 112 (1), pp.23-29. ⟨10.1007/s10482-018-1182-x⟩ Article dans une revue hal-02617947v1
Actinorhizal signaling molecules : Frankia root hair deforming factor shares properties with NIN inducing factor Maimouna Cissoko,Valérie Hocher,Hassen Gherbi,Djamel Gully,Alyssa Carré-Mloukaet al. Frontiers in Plant Science, 2018, 9, 12 p. ⟨10.3389/fpls.2018.01494⟩ Article dans une revue hal-01956101v1
Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis Maximilian Griesmann,Yue Chang,Xin Liu,Yue Song,Georg Habereret al. Science, 2018, 361 (6398), pp.1743. ⟨10.1126/science.aat1743⟩ Article dans une revue hal-02479077v1
Genetic diversity and symbiotic efficiency of rhizobial strains isolated from nodules of peanut ( Arachis hypogaea L.) in Senegal Arlette Zaiya Zazou,Daniel Fonceka,Saliou Fall,Adriana Fabra,Fernando Ibañezet al. Agriculture, Ecosystems & Environment, 2018, 265, pp.384-391. ⟨10.1016/j.agee.2018.06.001⟩ Article dans une revue hal-02628295v1
Selection of arbuscular mycorrhizal fungal strains to improve &lt;em&gt;Casuarina equisetifolia&lt;/em&gt; L. and &lt;em&gt;Casuarina glauca&lt;/em&gt; Sieb. tolerance to salinity Pape Ibrahima Djighaly,Nathalie Diagne,Mariama Ngom,Daouda Ngom,Valérie Hocheret al. Annals of Forest Science, 2018, 75 (3), 11 p. ⟨10.1007/s13595-018-0747-1⟩ Article dans une revue hal-02622849v1
Phylogenomics reveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis Maximilian Griesmann,Yue Chang,Xin Liu,Yue Song,Georg Habereret al. Science, 2018, 361 (6398), ⟨10.1126/science.aat1743⟩ Article dans une revue (data paper) hal-04721416v1
Cell remodeling and subtilase gene expression in the actinorhizal plant Discaria trinervis highlight host orchestration of intercellular Frankia colonization Joëlle Fournier,Leandro Imanishi,Mireille Chabaud,Iltaf Abdou-Pavy,Andrea Genreet al. New Phytologist, 2018, 219 (3), pp.1018-1030. ⟨10.1111/nph.15216⟩ Article dans une revue hal-02345211v1
Effect of peanut shells amendment on soil properties and growth of seedlings of Senegalia senegal (L.) Britton, Vachellia seyal (Delile) P. Hurter, and Prosopis juliflora (Swartz) DC in salt-affected soils Dioumacor Fall,Niokhor Bakhoum,Fatoumata Fall,Fatou Diouf,Cheikh Ndiayeet al. Annals of Forest Science, 2018, 75 (1), pp.32. ⟨10.1007/s13595-018-0714-x⟩ Article dans une revue hal-04602622v1
Effect of peanut shells amendment on soil properties and growth of seedlings of Senegalia senegal (L.) Britton, Vachellia seyal (Delile) P. Hurter, and Prosopis juliflora (Swartz) DC in salt-affected soils Dioumacor Fall,Niokhor Bakhoum,Fatoumata Fall,Fatou Diouf,Cheikh Ndiayeet al. Annals of Forest Science, 2018, 75 (1), pp.32. ⟨10.1007/s13595-018-0714-x⟩ Article dans une revue hal-02976509v1
Improvement of tree growth in salt-affected soils under greenhouse conditions using a combination of peanut shells and microbial inoculation Fall Dioumacor,Bakhoum Niokhor,Fall Fatoumata,Diouf Fatou,Ndigue Faye Mathieuet al. Journal of Agricultural Biotechnology and Sustainable Development, 2017, 9 (5), pp.36-44. ⟨10.5897/JABSD2017.0294⟩ Article dans une revue hal-04602629v1
Symbiotic performance of diverse Frankia strains on salt-stressed Casuarina glauca and Casuarina equisetifolia plants Mariama Ngom,Krystelle Gray,Nathalie Diagne,Rediet Oshone,Joël Fardouxet al. Frontiers in Plant Science, 2016, 7, 16 p. ⟨10.3389/fpls.2016.01331⟩ Article dans une revue hal-01606679v1
Intraspecies variation in sodium partitioning, potassium and proline accumulation under salt stress in &lt;em&gt;Casuarina equisetifolia&lt;/em&gt; Forst Rajendran Kamalabai Selvakesavan,N. N. Dhanya,Thushara Pillai,S. M. Abraham,R. S. C. Jayarajet al. Symbiosis, 2016, 70 (1-3), pp.117-127. ⟨10.1007/s13199-016-0424-9⟩ Article dans une revue hal-02633936v1
Germination, growth and physiological responses of Senegalia senegal (L.) Britton, Vachellia seyal (Delile) P. Hurter and Prosopis juliflora (Swartz) DC to salinity stress in greenhouse conditions Fall Dioumacor,Bakhoum Niokhor,Fall Fatoumata,Diouf Fatou,O. Ly Mamadouet al. African Journal of Biotechnology, 2016, 15 (37), pp.2017-2027. ⟨10.5897/AJB2016.15518⟩ Article dans une revue hal-04602644v1
Alnus peptides modify membrane porosity and induce the release of nitrogen-rich metabolites from nitrogen-fixing $Frankia$ Lorena Carro,Petar Pujic,Nicole Alloisio,Pascale Fournier,Hasna Boubakriet al. The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2015, 9 (8), pp.1723-33. ⟨10.1038/ismej.2014.257⟩ Article dans une revue hal-01436175v1
Assessment of lead tolerance and accumulation in metallicolous and non-metallicolous populations of Hirschfeldia incana Mouna Fahr,Laurent Laplaze,Mohammed El Mzibri,Patrick Doumas,Najib Bendaouet al. Environmental and Experimental Botany, 2015, 109, pp.186-192. ⟨10.1016/j.envexpbot.2014.07.010⟩ Article dans une revue istex hal-01137910v1
Inhibition of auxin signaling in Frankia species-infected cells in Casuarina glauca nodules leads to increased nodulation Antony Champion,Mikael Lucas,Alexandre Tromas,Virginie Vaissayre,Amandine Craboset al. Plant Physiology, 2015, 167 (3), pp.1149-1157. ⟨10.1104/pp.114.255307⟩ Article dans une revue hal-03186973v1
The Casuarina NIN gene is transcriptionally activated throughout Frankia root infection as well as in response to bacterial diffusible signals Fernando Clavijo,Issa Diedhiou,Virginie Vaissayre,Laurent Brottier,Jennifer Acolatseet al. New Phytologist, 2015, 208 (3), pp.887-903. ⟨10.1111/nph.13506⟩ Article dans une revue hal-02639550v1
Identification of potential transcriptional regulators of actinorhizal symbioses in Casuarina glauca and Alnus glutinosa Issa Diédhiou,Alexandre Tromas,Maïmouna Cissoko,Krystelle Gray,Boris Parizotet al. BMC Plant Biology, 2014, 14 (1), pp.342. ⟨10.1186/s12870-014-0342-z⟩ Article dans une revue hal-02487465v1
The independent acquisition of plant root nitrogen-fixing symbiosis in fabids recruited the same genetic pathway for nodule organogenesis Sergio Svistoonoff,Faiza Meriem Benabdoun,Mathish Nambiar-Veetil,Leandro Imanishi,Virginie Vaissayreet al. PLoS ONE, 2013, 8 (5), ⟨10.1371/journal.pone.0064515⟩ Article dans une revue hal-02651288v1
Silencing of the chalcone synthase gene in Casuarina glauca highlights the important role of flavonoids during nodulation Khalid Abdel-Lateif,Virginie Vaissayre,Hassen Gherbi,Clotilde Verries,Emmanuelle Meudecet al. New Phytologist, 2013, 199 (4), pp.1012 - 1021. ⟨10.1111/nph.12326⟩ Article dans une revue hal-01837685v1
Activation of the isoflavonoid pathway in actinorhizal symbioses Florence Auguy,Khalid Abdel-Lateif,Patrick Doumas,Pablo Badin,Vanessa Guerinet al. Functional Plant Biology, 2011, 38 (8-9), pp.690 - 696. ⟨10.1071/FP11014⟩ Article dans une revue hal-02649431v1
Transcriptomics of Actinorhizal Symbioses Reveals Homologs of the Whole Common Symbiotic Signaling Cascade Valerie Hocher,Nicole Alloisio,Florence Auguy,Pascale Fournier,Patrick Doumaset al. Plant Physiology, 2011, 156 (2), pp.700-711. ⟨10.1104/pp.111.174151⟩ Article dans une revue hal-00599363v1
Contribution of transgenic Casuarinaceae to our knowledge of the actinorhizal symbioses Sergio Svistoonoff,Hassen Gherbi,Mathish Nambiar-Veetil,Chonglu Zhong,Zuzanna Michalaket al. Symbiosis, 2010, 50 (1-2), pp.3-11. ⟨10.1007/s13199-009-0036-8⟩ Article dans une revue hal-01833620v1
Auxin carriers localization drives auxin accumulation in plant cells infected by Frankia in Casuarina glauca actinorhizal nodules. Francine Perrine-Walker,Patrick Doumas,Mikael Lucas,Virginie Vaissayre,Nicholas J Beaucheminet al. Plant Physiology, 2010, 154 (3), pp.1372-80. ⟨10.1104/pp.110.163394⟩ Article dans une revue hal-00554754v1
Auxin influx activity is associated with Frankia infection during actinorhizal nodule formation in Casuarina glauca. Benjamin Péret,Ranjan Swarup,Leen Jansen,Gaëlle Devos,Florence Auguyet al. Plant Physiology, 2007, 144 (4), pp.1852-62. ⟨10.1104/pp.107.101337⟩ Article dans une revue cea-00848586v1

Communication dans un congrès (2)

Variabilité des caractères liés à la fixation biologique d'azote et au rendement dans la core-collection du Réseau Africain pour l'Amélioration de l'Arachide Dupérier Loko,Joël Romaric Nguepjop,Aissatou Sambou,Valérie Hocher,Jean-François Ramiet al. 4. Rencontres francophones sur les légumineuses - RFL#4, CIRAD; INRAe; Terres Inovia; Terres Univia, Jan 2024, Saly, Sénégal. pp.86 Communication dans un congrès hal-05246284v1
Deciphering the genetic bases of peanut biological nitrogen fixation using an African peanut core-collection and GWAS approach Dupérier Loko,Joël Romaric Nguepjop,Daniel Foncéka,Valérie Hocher,Saliou Fallet al. 16. Rencontres Plantes-Bactéries, INRAE, Mar 2023, Aussois, France. pp.55-55 Communication dans un congrès hal-05181152v1

Poster de conférence (3)

Deciphering the genetic basis of biological nitrogen fixation in peanut (Arachis hypogaea L.) using an interspecific QTL-mapping population. Darius T Nzepang,Djamel Gully,Joël Romaric Nguepjop,Arlette Zaiya Zazou,Hodo-Abalo Tossimet al. 4. Conférence sur l’Intensification Durable (CID 2024), May 2024, Dakar, Senegal Poster de conférence hal-04936677v1
From wild to cultivated peanuts: exploring the soil microbial diversity to sustainably promote biological nitrogen fixation Maimouna Cissoko,Pablo Gonzalez,Joël Romaric Nguepjop,Loko Duperier,Arlette Zayia Zazouet al. 4. Conférence sur l’Intensification Durable (CID 2024), May 2024, Dakar, Senegal Poster de conférence hal-04936675v1
Genomic and phenotypic characterization of peanut (Arachis hypogaea) bradyrhizobia from Senegal Nogaye Niang,Babacar Dione,Djamel Gully,J Canguio,M Cissokoet al. 4. Conférence sur l’Intensification Durable (CID 2024), May 2024, Dakar, Senegal Poster de conférence hal-04936676v1

Chapitre d'ouvrage (4)

Advances in Frankia genome studies and molecular aspects of tolerance to environmental stresses Nathalie Diagne,Pape Ibrahima Djighaly,Mariama Ngom,Céline Pesce,Antony Championet al. Molecular Aspects of Plant Beneficial Microbes in Agriculture, Elsevier, pp.381-389, 2020, ⟨10.1016/B978-0-12-818469-1.00031-6⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03130305v1
Establishment of actinorhizal symbiosis in response to ethylene, salicylic acid, and jasmonate M. Ngom,M. Cissoko,K. Gray,Valérie Hocher,Laurent Laplazeet al. Champion, Antony (ed.); Laplaze, Laurent (ed.). Jasmonate in plant biology : methods and protocols, Humana Press, pp.117-130, 2020, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-0141-9. ⟨10.1007/978-1-0716-0142-6_9⟩ Chapitre d'ouvrage hal-03283087v1
Molecular Methods for Research on Actinorhiza Hassen Gherbi,Valerie Hocher,Mariama Ngom,Nathalie Diagne,Joëlle Fournieret al. Methods in Rhizosphere Biology Research, Chapter 4, Reinhardt D., Sharma A., pp.35-59, 2019, Rhizosphere Biology, ⟨10.1007/978-981-13-5767-1_4⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02345436v1
How Transcriptomics Revealed New Information on Actinorhizal Symbioses Establishment and Evolution Sergio Svistoonoff,Alexandre Tromas,Nathalie Diagne,Nicole Alloisio,Laurent Laplazeet al. Frans J. de Bruijn. Biological Nitrogen Fixation, John Wiley & Sons, Inc, pp.425-432, 2015, 9781119053095. ⟨10.1002/9781119053095.ch42⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02474531v1