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Véronique LEFEBVRE

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Présentation

Je suis directrice de recherche à INRAE (France), dans l'unité GAFL en Avignon, responsable de l’équipe « Résistance aux bio-agresseurs : diversité et durabilité ». Mes travaux de recherche visent à décortiquer les bases génétiques et moléculaires des interactions plante-parasite-environnement. L’enjeu est de proposer des outils d’aide à la sélection variétale et à la transition agroécologique afin d’assurer la gestion durable de l’immunité des plantes vis-à-vis de leurs agents pathogènes. Ces travaux portent sur la résistance des Solanacées (piment, pomme de terre, tomate) vis-à-vis de leurs agents pathogènes, et plus particulièrement vis-à-vis des oomycètes *Phytophthora infestans* et *P. capsici*, responsables des mildious, de l’ascomycète *Leveillula taurica*, responsable des oïdiums, des virus (*Potato virus Y*, *Cucumber mosaic virus*) et des nématodes (*Globodera palida*, *Meloidogyne incognita*). Ils s’appuient sur les ressources génétiques scientifiques et patrimoniales des Solanacées, ce qui m’amène à conduire en parallèle des travaux génériques sur la génomique du piment et les processus de domestication de cette espèce. Mes travaux s’articulent autour de 3 thématiques : · Comprendre l’effet de l’environnement abiotique sur l’efficacité, la robustesse et la durabilité de l’immunité, · Comprendre le rôle des déterminants génétiques de l’hôte sur la dynamique adaptative des parasites et l’émergence de nouvelles épidémies, · Intégrer les connaissances génomiques et génétiques chez le piment pour accélérer la découverte de gènes d’intérêt.
I am a research director at INRAE (France), in the GAFL unit in Avignon, in charge of the team " Resistance to pests and pathogens, Diversity and Durability". My research work aims to unravel the genetic and molecular basis of plant-parasite-environment interactions. The challenge is to propose tools to assist varietal selection and agroecological transition in order to ensure the sustainable management of plant immunity to their pathogens. This work focuses on the resistance of Solanaceae (pepper, potato, tomato) to their pathogens, and more particularly to the oomycetes *Phytophthora infestans* and *P. capsici*, which are responsible for mildew, the ascomycete *Leveillula taurica*, which is responsible for powdery mildew, viruses (*Potato virus Y*, *Cucumber mosaic virus*) and nematodes (*Globodera palida*, *Meloidogyne incognita*). They are based on genetic resources of Solanaceae, which leads me to conduct in parallel generic work on the genomics of pepper and the domestication processes of this species. My work is organized in 3 axes: \- Understanding the effect of the abiotic environment on the efficiency, robustness and durability of immunity, \- Understanding the role of host genetic determinants on the adaptive dynamics of parasites and the emergence of new epidemics, \- Integrate genomic and genetic knowledge in pepper to accelerate the discovery of genes of agronomic interest.

Publications

kamegan
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Identification of reference genes for normalizing RNA expression in potato roots infected with cyst nematodes

Patricio Castro Quezada , Jawad Aarrouf , Michel Claverie , Bruno Favery , Didier Mugniery
Plant Molecular Biology Reporter, 2013, 31 (4), pp.936-945. ⟨10.1007/s11105-013-0566-3⟩
Article dans une revue hal-01208611v1
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Quelques exemples d’intérêts et de limites de la sélection assistée par marqueurs chez la pomme de terre

Marie-Claire Kerlan , Sylvie Marhadour , Bernard Caromel , E. Bonnel , Sarah Danan
Innovations Agronomiques, 2013, 27, pp.111-122
Article dans une revue hal-01208610v1
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Agrobacterium rhizogenes-dependent production of transformed roots from foliar explants of pepper (Capsicum annuum): a new and efficient tool for functional analysis of genes

Jawad Aarrouf , Patricio Castro Quezada , Simon Mallard , Bernard Caromel , Y Lizzi
Plant Cell Reports, 2012, 2 (31), pp.391-401. ⟨10.1007/s00299-011-1174-z⟩
Article dans une revue hal-01332298v1

The Helper component proteinase cistron of Potato virus Y induces hypersensitivity and resistance in potato genotypes carrying dominant resistance genes on chromosome IV

Benoît Moury , Bernard Caromel , Elisabeth Ida Johansen , Vincent Simon , Laura Chauvin
Molecular Plant-Microbe Interactions, 2011, 24 (7), pp.787-797. ⟨10.1094/MPMI-10-10-0246⟩
Article dans une revue hal-02652300v1

Major-effect QTLs for stem and foliage resistance to late blight in the wild potato relatives Solanum sparsipilum and S. spegazzinii are mapped to chromosome X

Sarah Danan , Jean-Eric Chauvin , Bernard Caromel , Jean Denis Moal , Roland Pellé
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2009, 119 (4), pp.705-719. ⟨10.1007/s00122-009-1081-7⟩
Article dans une revue hal-02661699v1

Are the polygenic architectures of resistance to Phytophthora capsici and P. parasitica independent in pepper

Julien Bonnet , Sarah Danan , Christine Boudet , Lorenzo Barchi , Anne-Marie Sage-Palloix
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2007, 115 (2), pp.253-264. ⟨10.1007/s00122-007-0561-x⟩
Article dans une revue hal-02659540v1

Identification of plant genes regulated in resistant potato Solanum sparsipilum during the early stages of infection by Globodera pallida

Katell Jolivet , Eric Grenier , Jean-Paul Bouchet , Magali Esquibet , Marie-Claire Kerlan
Genome, 2007, 50, pp.422-427. ⟨10.1139/G07-015⟩
Article dans une revue hal-02654200v1

Construction of a 10,000-marker ultradense genetic recombination map of potato: providing a framework for accelerated gene isolation and a genomewide physical map

Hans van Os , Sandra Andrzejewski , Erin Bakker , Imanol Barrena , Glenn J. Bryan
Genetics, 2006, 173 (2), pp.1075-1087. ⟨10.1534/genetics.106.055871⟩
Article dans une revue hal-02666069v1

Evaluation of genetic distances between pepper inbred lines for cultivar protection purposes : comparison of AFLP, RAPD and phenotypic data

Véronique Lefebvre , Bruno B. Goffinet , J.C. Chauvet , Bernard Caromel , Patrick Signoret
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2001, 102, pp.741-750
Article dans une revue hal-02676575v1
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The Human History of Chilli Peppers Told by 10,000 Genebank Samples

Mark Timothy Rabanus-Wallace , Pasquale Tripodi , Lorenzo Barchi , Sandip Mallikarjun Kale , Alberto Acquadro
Virtual Plant and Animal Genome XXIX Conference, Jan 2022, San Diego (CA), United States
Communication dans un congrès hal-03551615v1
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Screening tomato germplasm for resistance to late blight

Bernard Caromel , Coralie Hamers , Nasradin Touhami , Alexandre Renaudineau , Alexandre Bachellez
Innovation in Integrated & Organic Horticulture, INNOHORT 2015, Jun 2015, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-02744090v1

Chromosome landing at a quantitative trait locus involved in resistance to cyst nematode in potato.

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Paulo Castro , Jawad Aarrouf , Helene H. Berges
Cost 872 Workshop & MC Meeting,, May 2010, Lisbonne, Portugal
Communication dans un congrès hal-01332575v1
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Chromosome landing at a quantitative trait locus involved in resistance to cyst nematode in potato

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Patricio Castro Quezada , Jawad Aarrouf , Helene Berges
4. Annual Meeting; COST 872 workshop, May 2010, Lisbon, Portugal
Communication dans un congrès hal-01462645v1
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Re-evaluation of the Globodera pallida resistance QTLs originating from the wild potato species Solanum spegazzinii

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Sarah Danan , Didier Mugniery , Véronique Lefebvre
3. Annual Meeting, COST 872 Workshop & MC, May 2009, Toledo, Spain
Communication dans un congrès hal-02751896v1

Exploration of late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsipilum and Solanum spegazzinii

Véronique Lefebvre , Sarah Danan , Jean-Baptiste Veyrieras , Patrick Signoret , Bernard Caromel
14. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2009, Quebec, Canada
Communication dans un congrès hal-02757474v1

Late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsipilum and Solanum spegazzinii

Véronique Lefebvre , Sarah Danan , Jean-Baptiste Veyrieras , Bernard Caromel , Sophie Ewert
BioExploit Science Meeting 2009, Mar 2009, Wageningen, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02751645v1
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Exploration of late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsiplum and Solanum spegazzinii

Sarah Danan , Jean-Eric Chauvin , Bernard Caromel , Jean-Baptiste Veyrieras , Jean-Paul Dantec
5. Solanaceae Genome Workshop, Oct 2008, Cologne, Germany
Communication dans un congrès hal-02757139v1
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The combination of resistance alleles at a major and minor effect QTLs confers a broad spectrum resistance to Globodera pallida

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Jawad Aarrouf , Claudia Rouaux , Nadia Lama
5. Solanaceae Genome Workshop, Oct 2008, Cologne, Germany
Communication dans un congrès hal-02757105v1

Two resistance QTLs display induced and constitutive, as well as additive and epistatic effects, on transcription of defense-related genes

Michel Claverie , Véronique de Conto , Katell Jolivet , Marie-Claire Kerlan , Eric Grenier
1. Annual Meeting COST 872, May 2007, La Colle-sur Loup, France
Communication dans un congrès hal-02753013v1

Etude transcriptomique de la résistance quantitative de la pomme de terre au nématode à kyste Globoderra pallida : validation de TDFs et recherche de gènes candidats par Q-PCR

Michel Claverie , Véronique de Conto Haby , Katell Jolivet , Eric Grenier , Marie-Claire Kerlan
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02758296v1

Development of molecular bridge markers between Solanaceae species for comparative mapping of resistance loci to Phytophthora spp.

Sarah Danan , Patrick Signoret , Bernard Caromel , Véronique Lefebvre
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02752753v1

Cartographie haute résolution de QTL de résistance aux Phytophtora colinéaires entre le piment et la pomme de terre

Stephanie Mallard , Sarah Danan , Julien Bonnet , David Tricon , Patrick Signoret
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02757356v1

L'association de 2 QTL est nécessaire pour conférer une résistance de haut niveau et à large spectre au nématode à kyste G. pallida chez la pomme de terre

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Marie-Claire Kerlan , Michel Claverie , Laura Chauvin
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02750796v1

Vers une sélection assistée par marqueurs chez la pomme de terre pour la résistance au nématode à kyste Globodera pallida

Marie-Claire Kerlan , Bernard Caromel , Didier Mugniery , Laura Chauvin , Jean-Paul Dantec
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02754496v1

Towards the positional cloning of the QTL Phy-P5 affecting Phytophthora blight resistance in pepper

Julien Bonnet , David Tricon , Anne-Marie Sage-Palloix , Bernard Caromel , Abdelhafid A. Bendahmane
Rencontres Scientifiques du DGAP, Sep 2006, Batz sur mer, France
Communication dans un congrès hal-02752747v1

The synergic action of two resistance QTls originating from Solanum sparsipilum is required to enclose Globodera pallida juveniles in a necrosis

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Marie-Claire Kerlan , Nadia Lama , Jean-Paul Dantec
16. Triennal Conference of the EAPR, Jul 2005, Bilbao, Spain
Communication dans un congrès hal-02764137v1

CGIS: an information system used for designing primers of candidate genes using Arabidopsis whole genome and Solanaceae EST databases

Cécile Bres , Jean-Paul Bouchet , L. Nucci , Bernard Caromel , Véronique Lefebvre
16. Triennal Conference of the EAPR, Jul 2005, Bilbao, Spain
Communication dans un congrès hal-02762016v1

QTLs for resistance to the cyst nematode Globodera pallida, deriving from Solanum sparsipilum mapped in resistance gene clusters

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Marie-Claire Kerlan , Daniel Ellisèche , S. Andrzejewski
1. Solanaceae Genome Workshop 2004, Sep 2004, Wageningen, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02763266v1

Use of molecular markers to detect clones bearing QTLs derived from Solanum sparsipilum and Solanum spegazzinii conferring resistance to potato cyst nematode Globodera pallida

Laura Chauvin , Marie-Claire Kerlan , Didier Mugniery , Jean-Paul Dantec , Josiane Quéré
1. Solanaceae Genome Workshop 2004, Sep 2004, Wageningen, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02761893v1