Vincent Guillemot Biostatisticien

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IdHAL :

vguillemot

ORCID :

0000-0002-7421-0655

Présentation

Je suis actuellement biostatisticien au sein du Hub de bio-informatique et biostatistique. Avant cela, j'ai travaillé à l'Institut du Cerveau (Paris, France), NeuroSpin (Saclay, France) et à l'Université Ludwig Maximilian (Munich, Allemagne).

Mes domaines d'expertise incluent la biostatistique, les statistiques multivariées, la visualisation des données, l'intégration de données statistiques et l'apprentissage automatique.

Mes activités d'enseignement vont de l'introduction aux concepts de base en statistique jusqu'aux aspects théoriques de l'optimisation convexe.

Publications

Article dans une revue (27)

Sparse factor analysis for categorical data with the group-sparse generalized singular value decomposition Ju-Chi Yu,Julie Le Borgne,Anjali Krishnan,Arnaud Gloaguen,Cheng-Ta Yanget al. Computational Statistics and Data Analysis, 2025, 209, pp.108179. ⟨10.1016/j.csda.2025.108179⟩ Article dans une revue hal-05320163v3
Motivation to continue and the value of care work among French Red Cross volunteers and workers during the COVID-19 pandemic: a mixed methods study Leonardo Heyerdahl,Vincent Guillemot,Benedetta Lana,Gaston Bizel-Bizellot,Tamara Giles-Vernick BMC Public Health, 2025, 25 (1), pp.1305. ⟨10.1186/s12889-025-22406-y⟩ Article dans une revue pasteur-05105229v1
IL-23 tunes inflammatory functions of human mucosal-associated invariant T cells Laetitia Camard,Tharshana Stephen,Hanane Yahia-Cherbal,Vincent Guillemot,Sébastien Mellaet al. iScience, 2025, 28 (2), pp.111898. ⟨10.1016/j.isci.2025.111898⟩ Article dans une revue hal-04730346v2
From Plain to Sparse Correspondence Analysis: a Generalized SVD Approach Hervé Abdi,Vincent Guillemot,Ruiping Liu,Ndèye Niang,Gilbert Saportaet al. Statistica Applicata - Italian Journal of Applied Statistics, 2024, 35 (3), pp.301-338. ⟨10.26398/IJAS.0035-014⟩ Article dans une revue hal-04467589v1
Integrating multiomics and prior knowledge: a study of the Graphnet penalty impact Hamza Chegraoui,Vincent Guillemot,Amine Rebei,Arnaud Gloaguen,Jacques Grillet al. Bioinformatics, 2023, 39 (8), pp.btad454. ⟨10.1093/bioinformatics/btad454⟩ Article dans une revue hal-04493049v1
Sparse Multiple Factor Analysis, sparse STATIS, and sparse DiSTATIS with applications to sensory evaluation Ju‐chi Yu,Carlos Gómez-Corona,Hervé Abdi,Vincent Guillemot Journal of Chemometrics, 2022, pp.e3443. ⟨10.1002/cem.3443⟩ Article dans une revue pasteur-04096426v1
The genetic architecture of language functional connectivity Yasmina Mekki,Vincent Guillemot,Hervé Lemaître,Amaia Carrión-Castillo,Stephanie Forkelet al. NeuroImage, 2022, 249, pp.118795. ⟨10.1016/j.neuroimage.2021.118795⟩ Article dans une revue hal-03566120v1
High prevalence of small intestine bacteria overgrowth and asymptomatic carriage of enteric pathogens in stunted children in Antananarivo, Madagascar Jean-Marc Collard,Lova Andrianonimiadana,Azimdine Habib,Maheninasy Rakotondrainipiana,Prisca Andriantsalamaet al. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2022, 16 (5), pp.e0009849. ⟨10.1371/journal.pntd.0009849⟩ Article dans une revue pasteur-03677601v1
Multitrait GWAS to connect disease variants and biological mechanisms Hanna Julienne,Vincent Laville,Zachary Mccaw,Zihuai He,Vincent Guillemotet al. PLoS Genetics, 2021, 17 (8), pp.e1009713. ⟨10.1371/journal.pgen.1009713⟩ Article dans une revue pasteur-03526210v1
Host genetic control of Natural Killer cell diversity revealed in the Collaborative Cross Magali S J Dupont,Vincent Guillemot,Pascal Campagne,Nicolas Serafini,Solenne Marieet al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (10), ⟨10.1073/pnas.2018834118⟩ Article dans une revue pasteur-03144287v1
Dichotomous metabolic networks govern human ILC2 proliferation and function Laura Surace,Jean-Marc Doisne,Carys A Croft,Anna Thaller,Pedro Escollet al. Nature Immunology, 2021, 22 (11), pp.1367-1374. ⟨10.1038/s41590-021-01043-8⟩ Article dans une revue pasteur-03499188v1
Immune response profiling of patients with spondyloarthritis reveals signalling networks mediating TNF-blocker function in vivo Silvia Menegatti,Vincent Guillemot,Eleonora Latis,Hanane Yahia-Cherbal,Daniela Mittermülleret al. Annals of the Rheumatic Diseases, 2020, annrheumdis-2020-218304, ⟨10.1136/annrheumdis-2020-218304⟩ Article dans une revue pasteur-03046847v1
JASS: command line and web interface for the joint analysis of GWAS results Hanna Julienne,Pierre Lechat,Vincent Guillemot,Carla Lasry,Chunzi Yaoet al. NAR Genomics and Bioinformatics, 2020, 2 (1), pp.lqaa003. ⟨10.1093/nargab/lqaa003⟩ Article dans une revue pasteur-02635247v1
Adjusting for Principal Components of Molecular Phenotypes Induces Replicating False Positives Andy Dahl,Vincent Guillemot,Joel Mefford,Hugues Aschard,Noah Zaitlen Genetics, 2019, 211 (4), pp.1179-1189. ⟨10.1534/genetics.118.301768⟩ Article dans une revue pasteur-03278622v1
Continuation of Nesterov’s Smoothing for Regression with Structured Sparsity in High-Dimensional Neuroimaging Fouad Hadj-Selem,Tommy Lofstedt,Elvis Dohmatob,Vincent Frouin,Mathieu Duboiset al. IEEE Transactions on Medical Imaging, In press, 2018, ⟨10.1109/TMI.2018.2829802⟩ Article dans une revue cea-01883286v1
Modeling a linkage between blood transcriptional expression and activity in brain regions to infer the phenotype of schizophrenia patients El Chérif Ibrahim,Vincent Guillemot,Magali Comte,Arthur Tenenhaus,Xavier Yves Zendjidjianet al. npj Schizophrenia, 2017, 3, pp.27. ⟨10.1038/s41537-017-0027-3⟩ Article dans une revue hal-01583472v1
Covariate selection for association screening in multiphenotype genetic studies Hugues Aschard,Vincent Guillemot,Bjarni Vilhjalmsson,Chirag Patel,David Skurniket al. Nature Genetics, 2017, 49 (12), pp.1789-1795. ⟨10.1038/ng.3975⟩ Article dans une revue pasteur-03278705v1
Clinical-genetic model predicts incident impulse control disorders in Parkinson's disease Julia Kraemmer,Kara Smith,Daniel Weintraub,Vincent Guillemot,Mike A. Nallset al. Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry, 2016, ⟨10.1136/jnnp-2015-312848⟩ Article dans une revue hal-01306745v1
Transcriptome Analysis of Peripheral Blood in Chronic Inflammatory Demyelinating Polyradiculoneuropathy Patients Identifies TNFR1 and TLR Pathways in the IVIg Response Alexandra Richard,Jean-Christophe Corvol,Rabab Debs,Pauline Reach,Khadija Tahiriet al. Medicine, 2016, 95 (19), pp.e3370. ⟨10.1097/MD.0000000000003370⟩ Article dans une revue hal-01319866v1
Hypomorphic variants of cationic amino acid transporter 3 in males with autism spectrum disorders Caroline Nava,Johanna Rupp,Jean-Paul Boissel,Cyril Mignot,Agnès Rastetteret al. Amino Acids, 2015, 47 (12), pp.2647-2658. ⟨10.1007/s00726-015-2057-3⟩ Article dans une revue hal-01191525v1
Variable Selection for Generalized Canonical Correlation Analysis Arthur Tenenhaus,Cathy Philippe,Vincent Guillemot,Kim-Anh Lê Cao,Jacques Grillet al. Biostatistics, 2014, 15 (3), pp.569-583. ⟨10.1093/biostatistics/kxu001⟩ Article dans une revue hal-01071432v1
Significant correlation between a set of genetic polymorphisms and a functional brain network revealed by feature selection and sparse Partial Least Squares. Vincent Guillemot,Vincent Frouin,Philippe Pinel,Christophe Lalanne,Laura Trincheraet al. NeuroImage, 2012, 63 (1), pp.11-24. ⟨10.1016/j.neuroimage.2012.06.061⟩ Article dans une revue istex hal-00750902v1
Use of pretransformation to cope with extreme values in important candidate features Anne-Laure Boulesteix,Vincent Guillemot,W. Sauerbrei Biometrical Journal, 2011, 53 (4), pp.673-688 Article dans une revue hal-00623395v1
Graph Constrained Discriminant Analysis: A New Method for the Integration of a Graph into a Classification Process Vincent Guillemot,Arthur Tenenhaus,Laurent Le Brusquet,Vincent Frouin PLoS ONE, 2011, 6 (10), pp.e26146. ⟨10.1371/journal.pone.0026146⟩ Article dans une revue hal-00648336v1
Gene Association Networks from Microarray Data Using a Regularized Estimation of Partial Correlation Based on the PLS Regression Arthur Tenenhaus,Vincent Guillemot,Xavier Gidrol,Vincent Frouin IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2010, 7 (2), pp.251-262 Article dans une revue hal-00486420v1
Over-optimism in bioinformatics: an illustration Monika Jelizarow,Vincent Guillemot,Arthur Tenenhaus,K. Strimmer,Anne-Laure Boulesteix Bioinformatics, 2010, 26, pp.1990-1998 Article dans une revue hal-00514107v1
Distance between homologous chromosomes results from chromosome positioning constraints Claire Heride,Michelle Ricoul,Kiên Kiêu,Johann von Hase,Vincent Guillemotet al. Journal of Cell Science, 2010, 123, pp.4063-4075. ⟨10.1242/jcs.066498⟩ Article dans une revue hal-02663555v1

Communication dans un congrès (15)

Sparse DiSTATIS on categorical data Vincent Guillemot,Hervé Abdi,Victoire Baillet,Ju‐chi Yu CARME Correspondence Analysis and Related Methods, Universität Bonn, Sep 2023, Bonn, Germany Communication dans un congrès hal-05320319v1
CCQTL: facilitating QTL mapping in the Collaborative Cross Rémi Planel,Victoire Baillet,Vincent Guillemot,Jean Jaubert,Christian A. J. Vosshenrichet al. 20th Annual Meeting of the Complex Trait Community | Rat Genome & Models, University of Tennessee Health Science Center [Memphis, Tennessee], Oct 2023, Memphis, TN, United States Communication dans un congrès pasteur-04588091v1
Etude de la Pénalisation GraphNet en Analyse de Données Multi-blocs Annabelle Beaudoin,Natalia Pietrosemoli,Cathy Philippe,Hervé Abdi,Vincent Guillemot 53èmes Journées de Statistiques, Jun 2022, Lyon, France Communication dans un congrès pasteur-04131938v1
Introducing group-sparsity and orthogonality constraints in RGCCA Vincent Guillemot,Arnaud Gloaguen,Arthur Tenenhaus,Cathy Philippe,Hervé Abdi JdS2021 : 52èmes Journées de Statistique, Jun 2021, Nice, France Communication dans un congrès hal-03264640v1
Sparse Multiple Correspondence Analysis Vincent Guillemot,Julie Le Borgne,Arnaud Gloaguen,Arthur Tenenhaus,Gilbert Saportaet al. 52èmes Journées de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS), May 2020, Nice, France. pp.830-835 Communication dans un congrès pasteur-03037346v1
Network regularization in imaging genetics improves prediction performances and model interpretability on Alzheimers's disease Nicolas Guigui,C. Philippe,A. Gloaguen,S. Karkar,V. Guillemotet al. ISBI 2019 - Proceedings of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2019, Venice, Italy. ⟨10.1109/ISBI.2019.8759593⟩ Communication dans un congrès cea-02016625v1
Multiblock analysis of omics and imaging data with variable selection Cathy Philippe,Arthur Tenenhaus,Vincent Guillemot,Jacques Grill,Vincent Frouin Journées RITS 2015, Mar 2015, Dourdan, France. pp.P28-29 Section imagerie génétique Communication dans un congrès inserm-01145569v1
Structured variable selection for generalized canonical correlation analysis Tommy Lofstedt,Fouad Hadj-Selem,Vincent Guillemot,Cathy Philippe,Edouard Duchesnayet al. PLS’14, May 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-01084048v1
Multiblock Logistic Regression for High Dimensional Data Cathy Philippe,Arthur Tenenhaus,Vincent Frouin,Vincent Guillemot PLS 2014, May 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-01103734v1
A multi-block approach in imaging genetics Vincent Guillemot,Arthur Tenenhaus,Edouard Duchesnay,Jean-Baptiste Poline,Vincent Frouin 9th International Imaging Genetics Conference, Jan 2013, Irvine, California, United States. pp.Poster 13 Communication dans un congrès hal-00862310v1
Shrinkage Covariance Estimation Incorporating Prior Biological Knowledge with Applications to High-Dimensional Data Vincent Guillemot,Monika Jelizarow,Arthur Tenenhaus,Anne-Laure Boulesteix 58th World Statistics Congress of the International Statistical Institute (ISI'11), Aug 2011, Dublin, Ireland. 16 p Communication dans un congrès hal-00647792v1
Une variante des tests de sphéricité pour l'adéquation de données transcriptomiques à un graphe de régulations génétiques Vincent Guillemot,Arthur Tenenhaus,Vincent Frouin Journée Ouverte en Biologie et Mathématiques (JOBIM'09), Jun 2009, Nantes, France. pp.219-220 Communication dans un congrès hal-00421943v1
Grouping levels of exposure with same observable effects before class prediction in toxicogenomics. Vincent Guillemot,Cathy Philippe,Arthur Tenenhaus,Jérôme Rollin,Vincent Frouin IEEE Computer Society, Biotechno08, International Conference on Bioinformatics, and Biomedical Technologies, Digital Library, 2008, France. pp. 164-169, ⟨10.1109/BIOTECHNO.2008.17⟩ Communication dans un congrès hal-00321714v1
Graph-Constrained Discriminant Analysis of functional genomics data Vincent Guillemot,Laurent Le Brusquet,Arthur Tenenhaus,Vincent Frouin IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Worshops, Nov 2008, Philadelphia, United States. pp. 207-210, ⟨10.1109/BIBMW.2008.4686237⟩ Communication dans un congrès hal-00346450v1
Identification of differentially expressed genes: a comparison between wrapper and filter methods Vincent Guillemot,Vincent Frouin,Laurent Le Brusquet,Gilles Fleury Proceedings of the International Workshop on Machine Learning in Systems Biology, Sep 2007, Evry, France Communication dans un congrès hal-00257928v1

Chapitre d'ouvrage (2)

Structured Variable Selection for Regularized Generalized Canonical Correlation Analysis, The Multiple Facets of Partial Least Squares and Related Methods Tommy Lofstedt,Fouad Hadj-Selem,Vincent Guillemot,Cathy Philippe,Edouard Duchesnayet al. Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, pp.129-139, 2016, The Multiple Facets of Partial Least Squares and Related Methods, ⟨10.1007/978-3-319-40643-5_10⟩ Chapitre d'ouvrage hal-01396614v1
Dimension Reduction and Regularization Combined with Partial Least Squares in High Dimensional Imaging Genetics Studies Edith Le Floch,Laura Trinchera,Vincent Guillemot,Arthur Tenenhaus,Jean-Baptiste Polineet al. New Perspectives in Partial Least Squares and Related Methods, Springer, pp.147-158, 2013, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics, ⟨10.1007/978-1-4614-8283-3_9⟩ Chapitre d'ouvrage istex hal-01068983v1

Thèse (1)

Application de méthodes de classification supervisée et intégration de données hétérogènes pour des données transcriptomiques à haut-débit Vincent Guillemot Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Sud - Paris XI, 2010. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00481822v1

Poster de conférence (5)

Impact of joint Dimension Reduction methods for survival prediction - extension of a multi-omics benchmark study Vincent Le Goff,Vincent Guillemot,Cathy Philippe,Gwendoline Mendes,Jean‐françois Deleuzeet al. ISMB/ECCB 2025, Jul 2025, Liverpool, United Kingdom Poster de conférence hal-05318178v1
Impact of joint Dimension Reduction methods for survival prediction - Extension of a multi-omics benchmark study Vincent Le Goff,Vincent Guillemot,Cathy Philippe,Gwendoline Mendes,Jean-François Deleuzeet al. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jun 2024, Toulouse, France Poster de conférence cea-04734003v1
Sparse MDS and sparse DiSTATIS for brain connectivity data Vincent Guillemot,Hervé Abdi,Micaela Chan,Liang Han,Ju‐chi Yu OHBM, Jul 2023, Montreal, Canada Poster de conférence hal-05320333v1
Heritability of the language network using resting state fMRI data Yasmina Mekki,Cathy Philippe,Vincent Guillemot,Hervé Lemaître,Vincent Frouin COGNOMICS Conference 2019: Bridging Gaps, Sep 2019, Nijmegen, Netherlands Poster de conférence cea-02289470v1
Multidimensional Approaches in the Study of Autistic Traits using Behavioral and Imaging Data Angeline Mihailov,Cathy Philippe,Antoine Grigis,Vincent Guillemot,Charles Laidiet al. Organization of Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy Poster de conférence cea-02289422v1