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Alain Rincé

Professeur des universités en Microbiologie Université de Caen Normandie Directeur de l'école doctorale 497 EDnBISE
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# **Formations** **2002 Diplôme d’Habilitation à Diriger des Recherches** ; Université de Caen Normandie, Sujet : Etude moléculaire de la réponse d’Enterococcus faecalis face à des variations de conditions physico-chimiques de son environnement. **1996 Doctorat mention Sciences Biologiques** ; Université de Rennes I, Sujet : Analyse des déterminants génétiques de la Lactococcine DR, une bactériocine produite par une souche de Lactococcus lactis. **1992 D.E.A. de Microbiologie Appliquée à l’Agro-Alimentaire** ; Université de Rennes I, **1991 Maîtrise de Biochimie** ; Université de Rennes I. **1990 Licence de Biochimie** et **Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie** ; Université de Toulouse. **1989 B.T.S. de Biochimiste** ; Institution Notre Dame - Le Mans. # **Expériences professionnelles** **Depuis 2011 : Professeur des Universités - CNU 64**, Université de Caen Normandie **De 1998 à 2011 : Maître de conférences - CNU 64**, Université de Caen Normandie **De 1996 à 1998 : Post-doctorat**, University College Cork (Ireland) **De 1992 à 1196 : Doctorat**, Université de Rennes I # ***Activités de recherche*** Depuis 2022 : Activités de recherche au sein de l’unité BIOTARGEN concernant l’étude des mécanismes de pathogénicité de *Rhodococcus equi*, une bactérie responsable d’infection chez le cheval et développement de stratégies innovantes pour le diagnostic, la prévention et le traitement de la rhodococcose équine. De 1998 à 2022 : Activités de recherche au sein de l’unité U2RM portant principalement sur l’étude de la réponse de la bactérie *Enterococcus faecalis* aux stress environnementaux et la virulence de cette bactérie opportuniste. Parallèlement, une partie de mes travaux visaient à mettre au point des procédés d’identification des sources de pollution fécale des eaux et des coquillages et à étudier les risques associés aux pollutions fécales du littoral. De 1996 à 1998 : Etude d’un mécanisme de résistance aux bactériophages chez *Lactococcus lactis*. De 1992 à 1996 : Etude d’un mécanisme de production d’une bactériocine par *Lactococcus lactis*. # ***Activités d’enseignement*** Enseignements de microbiologie et de biologie moléculaire (CM, TD, TP) à l’UFR des Sciences principalement dans les licences du portail biologie et sciences de la terre et en master microbiologie. # ***Principales responsabilités*** **Responsabilités au sein d’unité de recherche :** De 2012 à 2016 : Directeur de l’Unité de Recherche Risques Microbien (EA4655) Depuis 2002 : Responsable scientifique de projets de recherche (dont 2 projets Interreg IVA et 1 projet FEAMP). **Responsabilités liées aux enseignements** Responsable d’unités d’enseignement de licence et de master. De 2008 à 2021 : Coordinateur d’échanges internationaux avec différentes universités (Aberystwyth au Royaume-Uni, Joensuu en Finlande et Bergen en Norvège). De 2012 à 2016 : Responsable du parcours microbiologie de la licence de biologie. De 2012 à 2022 : Responsable caennais du master microbiologie. **Responsabilités administratives et fonctions électives :** De 2015 à 2016 : Membre du conseil d’administration et Directeur adjoint de l’Institut de Biologie Fondamentale et Appliquée. De 2016 à 2021 : Membre du conseil d’administration et Directeur adjoint de l’UFR des Sciences. De 2016 à 2021 : Directeur adjoint de l’école doctorale normande Biologie Intégrative, Santé, Environnement (ED497 : EDnBISE). Depuis 2021 : Directeur de l’école doctorale EDnBISE. **Autres activités :** Membre du Conseil Scientifique des structures suivantes : - Groupement d’Intérêt Public (GIP) LABEO (depuis 2011), - Centre d’expertise agroalimentaire ACTALIA (depuis 2011), - Groupement d’Intérêt Public (GIS) Des Fromages AOP Laitiers Normands (depuis 2015).

Research domains

Bacteriology

Publications

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Comparative Analysis of Campylobacter jejuni and C. coli Isolated from Livestock Animals to C. jejuni and C. coli Isolated from Surface Water Using DNA Sequencing and MALDI-TOF

Martine Denis , Valérie Rose , Bérengère Nagard , Amandine Thépault , Pierrick Lucas
Pathogens, 2023, 12 (9), pp.1069. ⟨10.3390/pathogens12091069⟩
Journal articles hal-04196825v1
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The NagY regulator: A member of the BglG/SacY antiterminator family conserved in Enterococcus faecalis and involved in virulence

Diane Soussan , Marine Salze , Pierre Ledormand , Nicolas Sauvageot , Amine Boukerb
Frontiers in Microbiology, 2023, 13, ⟨10.3389/fmicb.2022.1070116⟩
Journal articles hal-04158940v1
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Development of a microsphere-based immunoassay for the serological diagnosis of equine trypanosomosis

Mylène Verney , Morgane Gautron , Charlène Lemans , Alain Rincé , Aymeric Hans
Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.1308. ⟨10.1038/s41598-022-05356-y⟩
Journal articles anses-03927497v1
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Study of key RNA metabolism proteins in Enterococcus faecalis

Marine Salze , Cécile Muller , Benoit Bernay , Axel Hartke , Thomas Clamens
RNA Biology, 2020, 17 (6), pp.794 - 804. ⟨10.1080/15476286.2020.1728103⟩
Journal articles hal-03722608v1

Identification of the general stress stimulon related to colonization in Enterococcus faecalis

Marine Salze , Jean-Christophe Giard , Eliette Riboulet-Bisson , Torsten Hain , Alain Rincé
Archives of Microbiology, 2019, ⟨10.1007/s00203-019-01735-8⟩
Journal articles hal-02395869v1

The role of the CroR response regulator in resistance of Enterococcus faecalis to D-cycloserine is defined using an inducible receiver domain

Cécile Muller , Sébastien Massier , Yoann Le Breton , Alain Rincé
Molecular Microbiology, 2018, 107 (3), pp.416-427. ⟨10.1111/mmi.13891⟩
Journal articles hal-04158338v1
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Occurrence of Bacterial Pathogens and Human Noroviruses in Shellfish-Harvesting Areas and Their Catchments in France

Alain Rincé , Charlotte Balière , Dominique Hervio-Heath , Joëlle Cozien , Solen Lozach
Frontiers in Microbiology, 2018, 9, pp.2443. ⟨10.3389/fmicb.2018.02443⟩
Journal articles hal-02155425v1

Relevance of F-Specific RNA Bacteriophages in Assessing Human Norovirus Risk in Shellfish and Environmental Waters

C. Hartard , S. Banas , J. Loutreul , A. Rincé , Fabienne Benoit
Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82 (18), pp.5709 - 5719. ⟨10.1128/AEM.01528-16⟩
Journal articles hal-01891139v1

Molecular Profiling of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli and Enteropathogenic E. coli Strains Isolated from French Coastal Environments

Charlotte Baliere , Alain Rincé , Jorge Blanco , Ghizlane Dahbi , Josée Harel
Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82 (13), pp.3913-3927. ⟨10.1128/AEM.00271-16⟩
Journal articles pasteur-03260951v1
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Prevalence and Characterization of Shiga Toxin-Producing and Enteropathogenic Escherichia coli in Shellfish-Harvesting Areas and Their Watersheds

Charlotte Baliere , Alain Rincé , Jorge Blanco , Ghizlane Dahbi , Josée Harel
Frontiers in Microbiology, 2015, 6, pp.1356. ⟨10.3389/fmicb.2015.01356⟩
Journal articles pasteur-03260946v1

Loss of Antibiotic Tolerance in Sod-Deficient Mutants Is Dependent on the Energy Source and Arginine Catabolism in Enterococci

Rabia Ladjouzi , Alain Bizzini , Willem van Schaik , Xinglin Zhang , Alain Rincé
Journal of Bacteriology, 2015, 197 (20), pp.3283-3293. ⟨10.1128/JB.00389-15⟩
Journal articles hal-02180631v1

Successful detection of pathogenic Shiga-toxin-producing Escherichia coli in shellfish, environmental waters and sediment using the ISO/TS-13136 method

C. Balière , A. Rincé , Delphine Thevenot-Sergentet , M. Gourmelon
Letters in Applied Microbiology, 2015, 60 (4), pp.315-320. ⟨10.1111/lam.12386⟩
Journal articles hal-02487309v1

The host model Galleria mellonella is resistant to taylorellae infection

L. Hébert , I. Rincé , C. Sanna , C. Laugier , A. Rincé
Letters in Applied Microbiology, 2014, 59 (4), pp.438-442. ⟨10.1111/lam.12297⟩
Journal articles hal-04158332v1

Effects of a pulsed light-induced stress on Enterococcus faecalis

S. Massier , E. Bouffartigues , A. Rincé , O. Maillot , M.G.J. Feuilloley
Journal of Applied Microbiology, 2013, 114 (1), pp.186-195. ⟨10.1111/jam.12029⟩
Journal articles hal-02366325v1

Analysis of the tolerance of pathogenic enterococci and Staphylococcus aureus to cell wall active antibiotics

Rabia Ladjouzi , Alain Bizzini , François Lebreton , Nicolas Sauvageot , Alain Rincé
Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2013, 68 (9), pp.2083-2091. ⟨10.1093/jac/dkt157⟩
Journal articles hal-02180919v1

Redox Balance via Lactate Dehydrogenase Is Important for Multiple Stress Resistance and Virulence in Enterococcus faecalis

Nosheen Fatima Rana , Nicolas Sauvageot , Jean-Marie Laplace , Yinyin Bao , Ingolf Nes
Infection and Immunity, 2013, 81 (8), pp.2662-2668. ⟨10.1128/IAI.01299-12⟩
Journal articles hal-02180922v1

Adaptation of Pseudomonas aeruginosa to a pulsed light-induced stress

S. Massier , A. Rincé , O. Maillot , M.G.J. Feuilloley , N. Orange
Journal of Applied Microbiology, 2012, 112 (3), pp.502-511. ⟨10.1111/j.1365-2672.2011.05224.x⟩
Journal articles hal-02366329v1

Revue des principales méthodes d'identification des sources de pollutions fécales des eaux et coquillages

Alain Jadas-Hécart , L. Jeanneau , Stéphanie La Carbona , Leslie Ogorzaly , Alain Rincé
TSM. Techniques Sciences Méthodes – Génie urbain, génie rural, 2012, pp.16-35. ⟨10.1051/tsm/201203016⟩
Journal articles hal-00935323v1

Aerobic glycerol dissimilation via the Enterococcus faecalis DhaK pathway depends on NADH oxidase and a phosphotransfer reaction from PEP to DhaK via EIIADha

Nicolas Sauvageot , Rabia Ladjouzi , Abdellah Benachour , Alain Rincé , Josef Deutscher
Microbiology, 2012, 158 (Pt_10), pp.2661-2666. ⟨10.1099/mic.0.061663-0⟩
Journal articles hal-02180950v1

Genetic modifications and introduction of heterologous pdc genes in Enterococcus faecalis for its use in production of bioethanol

N. Rana , S. Gente , A. Rincé , Y. Auffray , J. Laplace
Biotechnology Letters, 2012, 34 (9), pp.1651-1657. ⟨10.1007/s10529-012-0964-x⟩
Journal articles hal-04158326v1

The prolipoprotein diacylglyceryl transferase (Lgt) of Enterococcus faecalis contributes to virulence

Fany F. Reffuveille , Pascale Serror , Sylvie Chevalier , Aurelie A. Budin-Verneuil , Rabia R. Ladjouzi
Microbiology, 2012, 158 (3), pp.816-825. ⟨10.1099/mic.0.055319-0⟩
Journal articles hal-02528181v1

Lipoproteins of Enterococcus faecalis: bioinformatic identification, expression analysis and relation to virulence

Fany Reffuveille , Charlène Leneveu , Sylvie Chevalier , Yanick Auffray , Alain Rincé
Microbiology, 2011, 157 (Pt 11), pp.3001-13. ⟨10.1099/mic.0.053314-0⟩
Journal articles hal-00741326v1

Cleavage Specificity of Enterococcus faecalis EnpA (EF1473), a Peptidoglycan Endopeptidase Related to the LytM/Lysostaphin Family of Metallopeptidases

François Reste de Roca , Caroline Duché , Shengli Dong , Alain Rincé , Lionel Dubost
Journal of Molecular Biology, 2010, 398 (4), pp.507-517. ⟨10.1016/j.jmb.2010.03.033⟩
Journal articles hal-04157426v1

The (p)ppGpp synthetase RelA contributes to stress adaptation and virulence in Enterococcus faecalis V583.

Xue Yan , Chen Zhao , Aurélie Budin-Verneuil , Axel Hartke , Alain Rincé
Microbiology, 2009, 155 (Pt 10), pp.3226-3237. ⟨10.1099/mic.0.026146-0⟩
Journal articles hal-00455464v1

Validation of host-specific Bacteriodales 16S rRNA genes as markers to determine the origin of faecal pollution in Atlantic Rim countries of the European Union

Andrew Gawler , Jean Beecher , João Brandão , Nora Carroll , Leonor Falcão
Water Research, 2007, 41 (16), pp.3780-3784. ⟨10.1016/j.watres.2007.01.028⟩
Journal articles hal-04157385v1

Characterization of Two Signal Transduction Systems Involved in Intracellular Macrophage Survival and Environmental Stress Response in Enterococcus faecalis

Cécile Muller , Maurizio Sanguinetti , Eliette Riboulet , Laurent Hébert , Brunella Posteraro
Advances in Microbial Physiology, 2007, 14 (1-3), pp.59-66. ⟨10.1159/000106083⟩
Journal articles hal-04158891v1

New insights into the Enterococcus faecalis CroRS two-component system obtained using a differential-display random arbitrarily primed PCR approach

Yoann Le Breton , Cécile Muller , Yannick Auffray , Alain Rincé
Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73 (11), pp.3738-3741. ⟨10.1128/AEM.00390-07⟩
Journal articles hal-02668378v1

Identification of new genes associated with intermediate resistance of Enterococcus faecalis to divercin V41, a pediocin-like bacteriocin

Ségolène Calvez , Alain Rincé , Yannick Auffray , Herve H. Prévost , Djamel Drider
Microbiology, 2007, 153 (Pt 5), pp.1609-1618. ⟨10.1099/mic.0.2006/004812-0⟩
Journal articles hal-02661749v1

Evaluation of Two Library-Independent Microbial Source Tracking Methods To Identify Sources of Fecal Contamination in French Estuaries

Michèle Gourmelon , Marie Paule Caprais , Raphaël Ségura , Cécile Le Mennec , Solen Lozach
Applied and Environmental Microbiology, 2007, 73 (15), pp.4857-4866. ⟨10.1128/AEM.03003-06⟩
Journal articles hal-04157390v1

The response regulator CroR modulates expression of the secreted stress-induced SalB protein in Enterococcus faecalis

Cécile Muller , Yoann Le Breton , Thierry Morin , Abdellah Benachour , Yannick Auffray
Journal of Bacteriology, 2006, 188 (7), pp.2636-2645. ⟨10.1128/JB.188.7.2636-2645.2006⟩
Journal articles hal-02662598v1

Maltose utilization in Enterococcus faecalis

Yves Le Breton , Vianney Pichereau , Nicolas Sauvageot , Alain Rincé , Yannick Auffray
Journal of Applied Microbiology, 2005, 98 (4), pp.806-813. ⟨10.1111/j.1365-2672.2004.02468.x⟩
Journal articles hal-02683322v1

The Enterococcus faecalis SigV Protein Is an Extracytoplasmic Function Sigma Factor Contributing to Survival following Heat, Acid, and Ethanol Treatments

Abdellah Benachour , Cécile Muller , Monika Dabrowski-Coton , Yoann Le Breton , Jean-Christophe Giard
Journal of Bacteriology, 2005, 187 (3), pp.1022-1035. ⟨10.1128/JB.187.3.1022-1035.2005⟩
Journal articles hal-02182246v1

Implication of hypR in the virulence and oxidative stress response of Enterococcus faecalis

Nicolas Verneuil , Alain Rincé , Maurizio Sanguinetti , Yanick Auffray , Axel Hartke
FEMS Microbiology Letters, 2005, 252 (1), pp.137-141. ⟨10.1016/j.femsle.2005.08.043⟩
Journal articles hal-02182211v1
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Contribution of a PerR-like regulator to the oxidative-stress response and virulence of Enterococcus faecalis

Nicolas Verneuil , Alain Rincé , Maurizio Sanguinetti , Brunella Posteraro , Giovanni Fadda
Microbiology, 2005, 151 (12), pp.3997-4004. ⟨10.1099/mic.0.28325-0⟩
Journal articles hal-02181961v1

Workshop report: Developing pollution source tracking for recreational and shellfish waters

K.R. Pond , R. Rangdale , W. Meyer , J. Brandao , L. Falcao
Environmental Forensics, 2004, pp.237-247
Journal articles hal-04157367v1

Proteomics Analysis: A Powerful Tool to Identify Proteome Phenotype and Proteome Signature in Enterococcus faecalis

Jean-Christophe Giard , Yanick Auffray , Abdellah Benachour , Axel Hartke , Jean-Marie Laplace
Current Proteomics, 2004, 1 (4), pp.273-282. ⟨10.2174/1570164043152795⟩
Journal articles hal-04157376v1

Physiological and molecular aspects of bile salt response in Enterococcus faecalis

Alain A. Rince , Yoann Le Breton , Nicolas Verneuil , Jean-Christophe J.-C. Giard , Axel Hartke
International Journal of Food Microbiology, 2003, 88 (2-3), pp.207-213. ⟨10.1016/S0168-1605(03)00182-X⟩
Journal articles hal-02187639v1

Lacticin 481: an antimicrobial peptide of the lantibiotic family produced by Lactococcus lactis.

Alain Dufour , Alain Rincé , Thomas Hindré , Dominique Haras , Jean-Paul Le Pennec
Recent Research Developments in Microbiology, 2003, 1, pp.219-234
Journal articles hal-04157278v1

The response to environmental stresses in Enterococcus faecalis.

Jean-Christophe J.-C. Giard , Alain Rincé , Abdellah Benachour , Axel Hartke , Jean-Marie Laplace
Recent Research Developments in Microbiology, 2003, 7, pp.325-339
Journal articles hal-04157305v1

Molecular characterization of Enterococcus faecalis two-component signal transduction pathways related to environmental stresses

Yoann Le Breton , Gregory Boel , Abdellah Benachour , Herve Prevost , Yannick Auffray
Environmental Microbiology, 2003, 5 (5), pp.329-337. ⟨10.1046/j.1462-2920.2003.00405.x⟩
Journal articles hal-04157315v1

The Enterococcus faecalis gene encoding the novel general stress protein Gsp62

Alain Rincé , Marilyne Uguen , Yoann Le Breton , Jean-Christophe Giard , Sigrid Flahaut
Microbiology, 2002, 148 (3), pp.703-711. ⟨10.1099/00221287-148-3-703⟩
Journal articles hal-04157221v1

Identification of the Enterococcus faecalis Tyrosine Decarboxylase Operon Involved in Tyramine Production

Nathalie Connil , Yoann Le Breton , Xavier Dousset , Yanick Auffray , Alain Rincé
Applied and Environmental Microbiology, 2002, 68 (7), pp.3537-3544. ⟨10.1128/AEM.68.7.3537-3544.2002⟩
Journal articles hal-04157250v1

Identification of new genes related to osmotic adaptation in Enterococcus faecalis

Yoann Le Breton , Vianney Pichereau , Sigrid Flahaut , Yannick Auffray , Alain Rincé
Sciences des aliments = Food science : an international journal of food science and technology, 2002, 22 (1-2), pp.87-96. ⟨10.3166/sda.22.87-96⟩
Journal articles hal-04157235v1

Isolation and Characterization of Bile Salts-Sensitive Mutants of Enterococcus faecalis

Yoann Le Breton , Alain Mazé , Axel Hartke , Sylviane Lemarinier , Yanick Auffray
Current Microbiology, 2002, 45 (6), pp.0434-0439. ⟨10.1007/s00284-002-3714-3⟩
Journal articles hal-02182342v1

The stress proteome of Enterococcus faecalis.

J. C. Giard , J. M. Laplace , A. Rincé , Vianney Pichereau , A. Benachour
Electrophoresis, 2001, 22 (14), pp.2947-2954. ⟨10.1002/1522-2683(200108)22:14<2947::AID-ELPS2947>3.0.CO;2-K⟩
Journal articles hal-00455452v1

Identification and Characterization of gsp65 , an Organic Hydroperoxide Resistance ( ohr ) Gene Encoding a General Stress Protein in Enterococcus faecalis

Alain Rincé , Jean-Christophe Giard , Vianney Pichereau , Sigrid Flahaut , Yanick Auffray
Journal of Bacteriology, 2001, 183 (4), pp.1482-1488. ⟨10.1128/JB.183.4.1482-1488.2001⟩
Journal articles hal-04157210v1

IS 1675 , a Novel Lactococcal Insertion Element, Forms a Transposon-Like Structure Including the Lacticin 481 Lantibiotic Operon

Alain Dufour , Alain Rincé , Patricia Uguen , Jean-Paul Le Pennec
Journal of Bacteriology, 2000, 182 (19), pp.5600-5605. ⟨10.1128/JB.182.19.5600-5605.2000⟩
Journal articles hal-04157202v1

Identification of general stress genes in Enterococcus faecalis

Alain Rince , Sigrid Flahaut , Yanick Auffray
International Journal of Food Microbiology, 2000, 55 (1-3), pp.87-91. ⟨10.1016/s0168-1605(00)00180-x⟩
Journal articles hal-04157189v1

Identification of a DNA region from lactococcal phage sk1 protecting phage 712 from the abortive infection mechanism AbiF

Alain Rincé , Mark Tangney , Gerald Fitzgerald
FEMS Microbiology Letters, 2000, 182 (1), pp.185-191. ⟨10.1111/j.1574-6968.2000.tb08894.x⟩
Journal articles hal-04157164v1

Inactivation of the Stress- and Starvation-Inducible gls24 Operon Has a Pleiotrophic Effect on Cell Morphology, Stress Sensitivity, and Gene Expression in Enterococcus faecalis

J.-C. Giard , A. Rincé , H. Capiaux , Y. Auffray , A. Hartke
Journal of Bacteriology, 2000, 182 (16), pp.4512-4520. ⟨10.1128/jb.182.16.4512-4520.2000⟩
Journal articles hal-02187608v1

pBLA8, from Brevibacterium linens, belongs to a Gram-positive subfamily of ColE2-related plasmids

Veronique Leret , Annie Trautwetter , Alain Rincé , Carlos Blanco
Microbiology, 1998, 144 (10), pp.2827-2836. ⟨10.1099/00221287-144-10-2827⟩
Journal articles hal-04158314v1

Identification of a recA homolog (recALP) on the conjugative lactococcal phage resistance plasmid pNP40: evidence of a role for chromosomally encoded recAL in abortive infection

P Garvey , A Rincé , C Hill , G Fitzgerald
Applied and Environmental Microbiology, 1997, 63 (4), pp.1244-1251. ⟨10.1128/aem.63.4.1244-1251.1997⟩
Journal articles hal-04157145v1

Characterization of the lacticin 481 operon: the Lactococcus lactis genes lctF, lctE, and lctG encode a putative ABC transporter involved in bacteriocin immunity

A Rincé , A Dufour , P Uguen , J Le Pennec , D Haras
Applied and Environmental Microbiology, 1997, 63 (11), pp.4252-4260. ⟨10.1128/aem.63.11.4252-4260.1997⟩
Journal articles hal-04158309v1

Cloning, expression, and nucleotide sequence of genes involved in production of lactococcin DR, a bacteriocin from lactococcus lactis subsp. lactis

A Rincé , A Dufour , S Le Pogam , D Thuault , C Bourgeois
Applied and Environmental Microbiology, 1994, 60 (5), pp.1652-1657. ⟨10.1128/aem.60.5.1652-1657.1994⟩
Journal articles hal-04158304v1