Alain Vignal
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Presentation
Honeybee genomics
Publications
In search of the honey bee centromeres: regions with tandem repeats high at content and low recombination rates9th European Congress of Apidology, Sep 2022, Belgrade, Serbia
Conference papers
hal-03855207v1
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GENOME WIDE ASSOCIATION STUDY ON VARROA RESISTANCE TRAITS IN FRENCH HONEYBEE POPULATIONS9th European Congress of Apidology, Sep 2022, Belgrade, Serbia
Conference papers
hal-03855289v1
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Mise au point d'un panel d'assignation de parenté SNP unique pour deux espèces de canards et leur hybride14. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Itavi, Mar 2022, Tours, France. pp.628, ⟨10.1016/j.anscip.2022.05.026⟩
Conference papers
hal-03617695v1
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Statistics for an accurate genome wide association study on Varroa resistance trait in a French honeybeeWorld Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands
Conference papers
hal-03859236v1
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Avian Genomics in Animal Breeding: Do we still need model organisms?28. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2020, San Diego, United States
Conference papers
hal-02937603v1
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Statistical Imputation of Queen Genotype from Pool Sequencing of WorkersPLant and Animal Genome, Jan 2020, San Diego, United States
Conference papers
hal-02938108v1
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BeeStrong : towards a genomic tool for the selection of varroa resistant honey bees46. APIMONDIA - International Apicultural Congress, Sep 2019, Montreal, Canada
Conference papers
hal-02788639v1
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Development and validation of high-density SNP array in ducksXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic
Conference papers
hal-02460148v1
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Characterisation of the genotype of honey bee colonies from pool sequences46. APIMONDIA - International Apicultural Congress, Sep 2019, Montreal, Canada
Conference papers
hal-02789560v1
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NGS et Assemblage des génomes2. Workshop Génomique : structure et fonction des génomes, Université des Sciences et de la Technologie d’Oran, Jun 2019, Oran, Algérie
Conference papers
hal-02953942v1
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Practical applications of genomic assignment methods in the avian breeding industryXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic
Conference papers
hal-02460150v1
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Développement d’une puce de génotypage haute densité 600K pour le canard commun et le canard de Barbarie13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2019, Tours, France
Conference papers
hal-02738413v1
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Sauropsida ribosomal repeat : Deciphering of the intergenic spacer in chicken and terrapin37. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2019, Lleida, Spain
Conference papers
hal-02786983v1
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Caractérisation génétique et génomique des populations d’abeille par séquençage de génome2. Workshop Génomique : structure et fonction des génomes, Université des Sciences et de la Technologie d’Oran, Jun 2019, Oran, Algérie
Conference papers
hal-02953949v1
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Séquençage du génome entier et diversité génétique de populations sauvages et domestiques de pintade13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2019, Tours, France. 929 p
Conference papers
hal-02737420v1
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Développement d'un panel de marqueurs SNP pour détecter l'hybridation entre la caille des blés et la caille japonaise13. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI; INRA; ANSES, Mar 2019, Tours, France. pp.80-84
Conference papers
hal-02383509v1
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Whole-genome sequencing of Honeybees from New Caledonia46th APIMONDIA - International Apicultural Congress, Sep 2019, Montréal, Canada
Conference papers
hal-02736059v1
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De novo genome assembly of a western European Apis mellifera mellifera black bee8. Congress of Apidology (EurBee 8), Sep 2018, Ghent, Belgium
Conference papers
hal-02785743v1
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Improving the knowledge of microchromosome repeated sequences in chicken by the sequencing of BAC clones with Pacific Bio technology23. International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jun 2018, Saint-Petersburg, Russia. 360 p
Conference papers
hal-02733811v1
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The use of interspecific hybrid chromosomes as a tool for precise comparative mapping analysis23. International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. 360 p., ⟨10.3897/CompCytogen.v12i3.27448⟩
Conference papers
hal-02734313v1
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Explaining the resistance to Varroa destructor in the French honey bee population with VSH, SMR and colony dynamic data8. Congress of Apidology (EurBee 8), Sep 2018, Ghent, Belgium
Conference papers
hal-02785764v1
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Guinea fowl domestication : new insights from the first whole genome assembly and the pool sequencing of wild and domestic populationsII Joint Congress on Evolutionary Biology, Aug 2018, Montpellier, France
Conference papers
hal-02785577v1
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Genomics of Chicken Domestication10. European Symposium on Poultry Genetics, Jun 2017, Saint Malo, France
Conference papers
hal-02785437v1
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Analyse de populations d’abeilles par séquençage de génomes5. Journées de la Recherche Apicole, Feb 2017, Paris, France
Conference papers
hal-02791452v1
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Guinea fowl whole genome assembly and application for genetic diversity in African and European populations10. European Symposium on Poultry Genetics, Jun 2017, Saint Malo, France
Conference papers
hal-02785442v1
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GWAS analysis identifies 138 QTL for egg quality variance in layers receiving various diets9. European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Jun 2015, Tuusula, Finland
Conference papers
hal-01580651v1
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Population genomics and signatures of selection in resequenced honey bee drones66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland. 577 p
Conference papers
hal-01536475v1
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A linkage disequilibrium study in a layer chicken population9. European Symposium on Poultry Genetics, Jun 2015, Tuusula, Finland
Conference papers
hal-01580637v1
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Resistance to varroa and VSH behaviour in the honey beeResearch Network for Sustainable Bee Breeding/COLOSS WS, Feb 2015, Kirchhain, Germany
Conference papers
hal-02795145v1
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de novo Assembly of the Chinese Bamboo-Partridge Genome and Comparison with ChickenPlant and Animal Genome Conference, Jan 2015, San Diego, United States
Conference papers
hal-02791971v1
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Sequencing haploid drones from royal jelly and honey bee populations for detection of differentiation and selective sweepsThe Biology of Genomes, May 2015, New York, United States
Conference papers
hal-01536441v1
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Genetic and genomic characterization of french bee populationsResearch Network for Sustainable Bee Breeding/COLOSS WS, Feb 2015, Kirchhain, Germany
Conference papers
hal-02793154v1
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Sequencing haploid drones from royal jelly and honey bee populations for detection of differentiation and selective sweepsBiology and Genomics of Social Insects, Cold Spring Harbor (CSH), May 2015, Wisconsin-Madison, United States
Conference papers
hal-02794236v1
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Sequencing haploid drones from royaljelly and honey bee populations for detection of differentiation and selective sweepsBiology and Genomics of Social Insects, May 2015, New York, United States
Conference papers
hal-02792618v1
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Les QTL protéiques : un outil de compréhension de la qualité du foie gras ?11. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. 1241 p
Conference papers
hal-02738993v1
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Le séquençage de populations d’abeilles : vers la compréhension de la dynamique du génome3. Journées de la Recherche Apicole, Feb 2015, Paris, France
Conference papers
hal-02793409v1
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Effet du type de maïs en gavage et de la durée de jeûne avant abattage sur les caractéristiques biochimiques et génomiques fonctionnelles du foie gras chez le canard mulard11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. pp.5
Conference papers
hal-01158739v1
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De novo Assembly of the Chinese Bamboo-Partridge Genome and Comparison with ChickenPlant and Animal Genome (PAG), Jan 2015, San Diego, United States
Conference papers
hal-01194054v1
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Genetic parameters and QTL detection of social behaviors, fear behaviors and production traits in Japanese Quail14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway
Conference papers
hal-02740135v1
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Mule duck “foie gras” show different metabolic states according to their quality phenotypes by using a proteomic approach. Comparison of 2 statistical methods5. Management Committee Meeting and the 4. Meeting of Working Groups 1, 2, 3 of COST Action FA 1002, Nov 2014, Milan, Italy
Conference papers
hal-02742729v1
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Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken22. International Plant and Animal Genome (PAG), Jan 2014, San Diego, United States
Conference papers
hal-01193927v1
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Numerous interchromosomal rearrangements in spite of high synteny conservation between duck and chicken21. International Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene Mapping, Jun 2014, Ischia, Italy
Conference papers
hal-02793231v1
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Detection Of Pleiotropic QTL Related To Protein Expression And Foie Gras Quality Traits10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada
Conference papers
hal-02739759v1
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Evidence of genetic relationships between sociality, emotional reactivity and production traits in Japanese quail10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada
Conference papers
hal-02740153v1
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Avancées récentes en génomique des canards10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). Paris, FRA.; Comité Interprofessionnel des Palmipèdes à Foie Gras (CIFOG). Paris, FRA.; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Paris, FRA., Mar 2013, La Rochelle, France. 279 p
Conference papers
hal-01210409v1
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Analyse de transcriptomes de foies de canards par séquençage d’ARN (RNA-Seq)10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, La Rochelle., Mar 2013, La Rochelle, France
Conference papers
hal-01210404v1
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Optimisation d’une population expérimentale de canes communes (Anas platyrhynchos) et de leurs descendants mulards : utilisation de données de QTL10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA.; Comité Interprofessionnel des Palmipèdes à Foie Gras (CIFOG). Paris, FRA.; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Paris, FRA., Mar 2013, La Rochelle, France. 279 p
Conference papers
hal-02748711v1
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Mapping by RH sequencing: organizing NGS scaffolds into chromosomes21. P!ant and animal genome meeting (PAG XXI), Jan 2013, San Diego, Californie, United States
Conference papers
hal-02749835v1
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Detection de SNP chez la caille : production d'un outil commum pour des programmes scientifiques multiples10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). Nouzilly, FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA., Mar 2013, La Rochelle, France
Conference papers
hal-01190264v1
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SNP detection for QTL analysis of social behaviour and production traits in quail33rd Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2012, Cairns, Australia
Conference papers
hal-01191281v1
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Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken33. Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.75
Conference papers
hal-01000657v1
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SNP-BB : Recherche de QTL pour des caractères de comportement social et de production chez l'oiseauColloque Génomique Animale et Microbienne, AGENAE - Analyse du Génome des Animaux d'Elevage (AGENAE). Labo/service de l'auteur, FRA., Mar 2012, La Rochelle, France
Conference papers
hal-02746131v1
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Détection de QTLs liés à l'efficacité alimentaire de la poule pondeuse dans des lignées divergentes9. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France
Conference papers
hal-01189527v1
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Détection de QTLs liés à l'efficacité alimentaire de la poule pondeuse dans des lignées divergentes9. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France. pp.775-778
Conference papers
hal-01000377v1
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Développement de SNP chez la caille par séquençage haut-débit9. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France
Conference papers
hal-02750356v1
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Identification of a new QTL for resistance to Salmonella carrier-state9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Conference papers
hal-02750500v1
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Biology of fear in birds: multidisciplinary analysis of a genetic model5. European Conference on Behavioural Biology (ECBB), Jul 2010, Ferrara, Italy
Conference papers
hal-01193568v1
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Recherche de QTL chez le canard commum. Recherche de QTL impliqués dans le comportement, la résistance au portage de Salmonelles et la qualité des produits - foie gras et magret - du canard MulardVIII. Colloque AGENAE-GENEANIMAL, Nov 2010, Bordeaux, France
Conference papers
hal-02757579v1
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Primo-localisation de QTL d'aptitude au gavage et de qualité des produits du canard9. Journées de la Recherche sur les Palmipèdes à Foie Gras, Oct 2010, Bordeaux, France
Conference papers
hal-02755739v1
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Development of polymorphic markers in quail by new generation sequencing13. European Poultry Conference (EPC 2010), Aug 2010, Tours, France
Conference papers
hal-01193587v1
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Pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP (PYRESAVI) chez le canard9. Journées de la Recherche sur les Palmipèdes à Foie Gras, Oct 2010, Bordeaux, France
Conference papers
hal-02758288v1
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Identification de la mutation responsable de l'épilepsie réflexe photosensible chez le poulet8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Conference papers
hal-01193413v1
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Elaboration de la carte génétique du canard commun dans le cadre du programme de recherche GENECAN .8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Conference papers
hal-02752593v1
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Pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires8èmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France. pp.594-598
Conference papers
hal-00730058v1
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Stratégie de cartographie intégrée du microchromosome 16 porteur du Complexe Majeur d'Histocompatibilité et des régions organisatrices du nucléole chez la poule domestique (Gallus gallus).GDR de Cytogénomique, 2009, Rennes, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02822388v1
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Cartographie intégrée du microchromosome 16, porteur du complexe majeur d'histocompatibilité, chez la poule.8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Conference papers
hal-01193434v1
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Recherche de QTL chez le canard à gaver : dispositif et développements méthodologiques.Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Conference papers
hal-02752584v1
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Recherche de manifestations épigénétiques chez la pouleJournées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau, France
Conference papers
hal-02821618v1
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Completing the chicken genome coverage by radiation hybrid mapping.Plant & Animal Genomes, XVI Conference, 2008, Inconnu, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02818750v1
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Cartographie d'irradiation chez la poule : cartographie dense de SNP et localisation d'EST absentes de la séquence génomique.Séminaire AGENAE, La Rochelle, Oct 2008, France, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02816058v1
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Localisation of the causative gene for reflex epilepsy in chicken31. Conference of the International Society of Animal Genetics (ISAG), 2008, Amsterdam, Netherlands
Conference papers
hal-02816161v1
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Des QTL aux gènes de résistance au portage de salmonelles chez le poulet.Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Conference papers
hal-02753088v1
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Elaboration de la carte génétique du canard commun. Dans le cadre du programme de recherche "GENECAN"8. Journées de la Recherche sur les Palmipèdes à Foie Gras, Oct 2008, Arcachon, France
Conference papers
hal-02756303v1
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Projet de pyroséquençage pour le développement d'EST et de SNP aviaires.Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Conference papers
hal-02756545v1
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High resolution chicken radiation hybrid maps using the IlluminaTM technology.31st Conference of the International Society of Animal Genetics (ISAG), 2008, Amsterdam, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02815790v1
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Primo-localisation de QTL pour la qualité de la viande dans un croisement entre deux lignées de poulet divergentes pour la croissance.Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Conference papers
hal-02757963v1
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Identification de la mutation responsable de l'épilepsie réflexe photosensible chez le poulet.Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Conference papers
hal-02753026v1
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Des QTL aux gènes de résistance au portage de salmonelles chez le pouletJournées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau (FR), France
Conference papers
hal-00729117v1
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An integrated approach of genetic resistance to Salmonella carrier state in fowls: from genetics to genomics and modellingInternational Symposium on Animal Genomics for Animal Health (AGAH), World Organisation for Animal Health (OIE). INT., Oct 2007, Paris, France. ⟨10.1159/000317185⟩
Conference papers
hal-02752859v1
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Primo-localisation de QTLs pour la qualité de la viande dans un croisement entre deux lignées de poulet divergentes pour la croissance7. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2007, Tours, France
Conference papers
hal-02755621v1
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Localisation de QTL contrôlant les poids de gras abdominal et de filet sur le chromosome 5 du poulet7. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2007, Tours, France
Conference papers
hal-02755614v1
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Cartographie d'irradiation chez la poule : cartographie dense de SNP et localisation d'EST absentes de la séquence génomique.du séminaire AgenaeGenanimal, 15-16 octobre 2007, Oct 2007, Dourdan
Conference papers
hal-02756339v1
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An integrated approach of genetic resistance to salmonella carrier-state in fowls: from genetics to genomics and modelization.International Symposium on Animal Genomics for Animal Health (AGAH), 2007, Paris, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02815742v1
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Radiation hybrid and genetic maps of GGA25, a microchromosome absent from the first draft chicken genome assembly.The biology of genomes, 10-14 may 2006, May 2006, Inconnu, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02816507v1
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First QTLs for breast meat technological parameters in high or low growth chicken lines.8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, 2006, Brazil, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02814256v1
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A radiation hybrid map of GGA25, a microchromosome absent from the first draft chicken genome assembly.XXX International Conference on Animal Genetics, 20-25 august 2006, Aug 2006, Brazil, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02822684v1
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Etude des risques d'introgression génétique de la caille des blés (Coturnix coturnix coturnix) par la caille japonaise (C. c. japonica) : comparaison et intégration des données comportementales et moléculaires obtenues dans le sud-est de la France.Inconnu, Oct 2006, Inconnu
Conference papers
hal-02757540v1
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QTL analysis for meat quality traits and metabolic parameters in a F2 cross between low and high growth chicken lines14. Conference Plant and Animal Genomes, Jan 2006, San Diego, United States
Conference papers
hal-02755644v1
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Les marqueurs microsatellites du canard.7èmes Journées de la Recherche sur les Palmipèdes à Foie Gras, 2006, Arcachon, France
Conference papers
hal-02752665v1
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Microsatellite DNA markers for duck (Anas platyrhynchos and Cairina moschata).2006 Symposium COA/INRA Scientific Cooperation in Agriculture, 2006, Tainan, France
Conference papers
hal-02757574v1
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Mapping of quantitative trait loci for fatness and breast meat yield in a novel resource population of broiler chickens13. Conference Plant and Animal Genomes, Jan 2005, San Diego, United States
Conference papers
hal-02763137v1
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Sex by fatness QTL interaction with transgressive variation in fat and lean lines.Gordon Conference on Quantitative Genetics and Genomics, 2005, Ventura, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02830385v1
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Séquençage du génome de la poule et perspectives d'application en poule pondeuse.6èmes Journées de la Recherches Avicoles, Saint Malo, 2005, France
Conference papers
hal-02764307v1
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Construction of a genetic linkage map in the Japanese quail and mapping of its plumage color genes.103rd Conference of the Japanese Society of Animal Science, 2004, Tokyo
Conference papers
hal-02760949v1
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Molecular cytogenetic definition of the chicken geneome: the first complete avian karyotype.16th European Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene Mapping, 2004, Jouy-en-Josas, France
Conference papers
hal-02828732v1
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A radiation hybrid map chicken of chromosome 4.Plant and Animal Genome Conference XII, 2004, Inconnu, pp.Inconnu
Conference papers
hal-02829250v1
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Chicken RH maps as a new tool for vertebrate comparative mapping at high resolution.16th European Colloquium on Animal Cytogenetics and Gene Mapping, 2004, Jouy-en-Josas, France
Conference papers
hal-02828804v1
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Characterisation of quantitative trait loci affecting fatness on chicken chromosome 522. World's Poultry Congress, Jun 2004, Istanbul, Turkey
Conference papers
hal-02760168v1
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