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Anne-Gaëlle PLANSON

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Présentation

**Experience PROFESSIONNELLE** Depuis 2013 **Chercheur (CRCN) – Biologie de Synthèse chez *Bacillus Subtilis* – INRA,** MICALIS, Jouy-en-Josas, France 2012 - 2013 **Chercheur post-doctorant - Laboratoire d'Enzymologie et Biochimie Structurales (LEBS)-CNRS UPR 3082 Gif-sur-Yvette,** France *(11/2 an)* 2010 - 2012 **Chercheur post-doctorant - Institut de Biologie Systémique et Synthétique (iSSB), Université d’Evry-Val-d’Essonne**, France *(2 ans)* 2008 - 2010 **Chercheur post-doctorant - CEA Saclay,** iBiTecS, France *(2 ans)* 2004 - 2008 **Chercheur post-doctorant Harvard University - Harvard Medical School**, Boston (MA), USA Department of Microbiology and Molecular Genetics *(3 ans)* 2000 - 2004 **Doctorat Université Denis Diderot (Paris VII) - Institut Pasteur**, Paris, France - Département de Biologie Structurale et Chimie *(31/2 ans**)* **Thèse** - Caractérisation du fragment C-terminal de la protéine MSP1 (*Merozoite Surface Protein 1*) de *Plasmodium falciparum* 1999 - 2000 **DEA Université Denis Diderot (Paris VII) - Institut Pasteur**, Paris, France - Département de Biochimie et Génétique Moléculaire 1997 - 1999 **Stages : Institut Jacques Monod** (Université Denis Diderot, Paris VII) - **Laboratoire de Biologie Physico-Chimique** (Université Denis Diderot, Paris VII) - **Université de Stockholm** (Suède) - Département de Biologie Structurale (ERASMUS) FORMATION ========= 2000 - 2004 Doctorat Structure, Fonction, et Ingénierie des Protéines - Université Denis Diderot (Paris VII) *Mention très honorable avec les félicitations du jury* 1999 - 2000 DEA Structure, Fonction, et Ingénierie des Protéines – Université Denis Diderot (Paris VII) *Mention Bien* 1998 - 1999 Maîtrise de Biochimie - Université Denis Diderot (Paris VII) – *Mention Assez Bien* FORMATION CONTINUE ================== Ecoles thématiques : · Repliement des protéines : la prédiction et le mécanisme du repliement des protéines: de la topologie aux états intermédiaires · Microfluidique : laboratoires sur puces et technologies de microfluidique, fabrication de circuit microfluidique par technologie PDMS · Risques biologiques et chimiques - Radioprotection ENCADREMENT =========== 2019-present 2019 2017-present 2016 2016 2015 2014 2013 2012 2011 Encadrement d’un doctorant (25 % - SDSV) (Cédric Wolfender) Encadrement d'un Master (Cédric Wolfender) Encadrement d’une doctorante (50 % - SDSV) (Cécile Jacry) Encadrement d'un étudiant en 2ème année (Master 1) à l’AgroParisTech (Alexandre Lefranc) Encadrement d'un étudiant en Master 2 de l’UPMC (Nicolas Sene) Encadrement d'un étudiant en BTS de Biotechnologies au Lycée de la Vallée de Chevreuse (Gif-sur-Yvette) (Benjamin Guerrin) Encadrement d'une étudiante en BTS de Biotechnologies à l'ESTBA (Paris) (Alexia Bernaert) Encadrement d'une étudiante en Master 1 de Biologie des Systèmes et Bio-informatique (Claire Baudier) Encadrement d'une étudiante en BTS Bioanalyses et contrôles de l'ENCPB Paris (Mélanie Sabathier) Encadrement d'un étudiant en Master 2 "Systems and Synthetic Biology" (Frederick Greene) 2010 Encadrement d'un assistant ingénieur : Biologie moléculaire (Elodie Paillard) 2008- 2010 Encadrement d'un technicien supérieur : Biologie cellulaire (Gaël Palais) 2007 Encadrement d'une étudiante au laboratoire : Microbiologie/Biochimie - niveau Master (Priscila Castillo) = = = = = = = = = = = ENSEIGNEMENT ============ 2016-present 2016-present 2015-present Cours Master 2 Systems & Synthetic Biology (mSSB) Evry (3 heures/an) Rôle d'expert - table ronde d'étudiants (module Enjeux et Défis) AgroParisTech (1.5h/an) Cours Master 1 Matières-Premières naturelles Cosmétiques à l’UVSQ (3 heures/an) 2015-2018 Cours CentraleSupelec, électif 1A (4,5 heures) 2014 Cours Master 1 Matières-Premières naturelles Cosmétiques à l’UVSQ (3 heures) 2010- 2011 Co-responsable de cours de Biologie à l'Ecole Centrale de Paris, 15 heures / 60 élèves (2e année - niveau M1) 2009- 2010 Cours de Biologie à l'Ecole Centrale de Paris, 12 heures / 60 élèves (1ère année- niveau L3) 2005- 2007 Cours : Biophysique niveau Master 2, Biochimie niveau Master 2 2000- 2004 Monitorat au Palais de la Découverte - Département Sciences de la Vie – Paris 8ème - France 2001- 2002 Cours en Biophysique - niveau Master 1 (association ARIS) 1997- 1998 Tutorat à l'Université Denis-Diderot, PARIS VII - niveau DEUG SNV = = = = = = = = = = AUTRES ACTIVITES ================ Depuis 2018 : Animatrice du réseau ingénierie des génomes (MICA, INRAE) Depuis 2016 : Responsable du site web de l'équipe SyBER Depuis 2015 : Membre du conseil d’unité de MICALIS Depuis 2015 : Personne ressource en informatique (PRI) référent pour l’équipe Personne ressource en informatique (PRI) Micalis (formation 2014) Installation du laboratoire expérimental de biologie - iSSB (2010) Participation aux demandes de financement de projets (ANR (2014-present), Projet EU (BasynFactory, 2014), DSM (2014), TWB (2014), consortium européen (FP7-ICT-CADMAD, 2011), appels d'offres nationaux (Labex, Astre, 2011) Mise en place d'un projet en partenariat avec une entreprise : Chemtex (2011-2012) Participation à l'installation de la plateforme de Biologie de synthèse abSYNTH, iSSB (2010-2011) CONGRES (depuis 2014) ===================== \- Assises du département MICA 28 – 31 octobre 2019 à Nantes \- 19th international conference on Bacilli & Gram-Positive Bacteria 11 - 15 Juin 2017 à Berlin (Allemagne) \- Synthetic Biology Congress 20 - 21 octobre 2016 à Londres (UK) - Poster \- Biosynsys 27-29 juin 2016 à Bordeaux - Poster \- Biosynsys 07-09 septembre 2015 à Paris - Poster \- 8th International Conference on Gram-Positive Microorganisms à Montecatini Terme (Italy) 21-25 juin 2015 - Poster \- Synthetic Biology: Engineering, Evolution & Design (SEED) à Boston (MA, USA) 10-13 juin 2015 - Poster \- BEeSy 12-14 avril 2015 à Grenoble – Présentation orale (invitée) "Streamlining the *Bacillus subtilis* genome: from proof-of-concept to cell factories” \- Bacell 14-18 avril 2015 à Amsterdam (Pays-Bas) - Poster \- SB2 20-22 novembre 2014 à Bordeaux - Poster \- BioSynSys 02-04 juillet 2014 à Toulouse – Poster COMMUNICATIONS ORALES ===================== \- BEeSy 12-14 avril 2015 à Grenoble – (invitée) "Streamlining the *Bacillus subtilis* genome: from proof-of-concept to cell factories” \- Institut de Génétique et Microbiologie 5 juin 2012 à Orsay – (invitée) "Rétro-synthèse appliquée à la biologie pour la production de molécules thérapeutiques" \- ESF-EMBO Symposium - Synthetic Biology of Antibiotic Production, Spain, 2 -7 octobre 2011 (Bourse EMBO) " Therapeutic production in *Escherichia coli* using retrosynthetic design of metabolic pathways" COMITÉ DE RELECTURE DE REVUE ============================ Relecteur de journaux scientifiques internationaux à comité de lecture (*reviewer*) : Biotechnology and Bioengineering journal, Frontiers in Systems Biology, Biotechnology journal, Ecotoxicology and Environmental Safety Editrice au journal of Biotechnology and Bioengineering (Jacobs Edition)

Publications

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Greedy reduction of Bacillus subtilis genome yields emergent phenotypes of high resistance to a DNA damaging agent and low evolvability

Etienne Dervyn , Anne-Gaëlle Planson , Kosei Tanaka , Victor Chubukov , Cyprien Guérin
Nucleic Acids Research, 2023, 51 (6), pp.2974-2992. ⟨10.1093/nar/gkad145⟩
Article dans une revue hal-04094194v1

Bacterial growth physiology and RNA metabolism

Anne-Gaëlle Planson , Vincent Sauveplane , Etienne Dervyn , Matthieu M. Jules
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , 2020, 1863 (5), pp.194502. ⟨10.1016/j.bbagrm.2020.194502⟩
Article dans une revue hal-02940832v1

Pharmacological inhibition of Dock5 prevents osteolysis by affecting osteoclast podosome organization while preserving bone formation

Virginie Vives , Gaëlle Cres , Christian Richard , Muriel Busson , Yann Ferrandez
Nature Communications, 2015, 6 (1), ⟨10.1038/ncomms7218⟩
Article dans une revue hal-01883489v1
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Validation of RetroPath, a computer-aided design tool for metabolic pathway engineering.

Tamás Fehér , Anne-Gaëlle Planson , Pablo Carbonell , Alfred Fernández-Castané , Ioana Grigoras
Biotechnology Journal, 2014, 9 (11), pp.1446-1457. ⟨10.1002/biot.201400055⟩
Article dans une revue hal-02639677v1
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New Insights for Native Production of MSP1 19 , the Disulfide-Rich C-Terminal Fragment from Plasmodium falciparum Merozoite Surface Protein 1

Anne-Gaëlle Planson , J. Iñaki Guijarro , Alain F. Chaffotte
PLoS ONE, 2013, 8 (2), pp.57086 - 57086. ⟨10.1371/journal.pone.0057086⟩
Article dans une revue pasteur-01673642v1
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Inhibitory signalling to the Arp2/3 complex steers cell migration

Irene Dang , Roman Gorelik , Carla Sousa-Blin , Emmanuel Derivery , Christophe Guérin
Nature, 2013, 503 (7475), pp.281-4. ⟨10.1038/nature12611⟩
Article dans une revue hal-00920076v1
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A retrosynthetic biology approach to therapeutics: from conception to delivery

Anne-Gaëlle Planson , Pablo Carbonell , Ioana Grigoras , Jean-Loup Faulon
Current Opinion in Biotechnology, 2012, 23 (6), pp.948-956. ⟨10.1016/j.copbio.2012.03.009⟩
Article dans une revue hal-02651873v1

Compound toxicity screening and structure-activity relationship modeling in Escherichia coli

Anne-Gaëlle Planson , Pablo Carbonell , Elodie Paillard , Nicolas Pollet , Jean-Loup Faulon
Biotechnology and Bioengineering, 2012, 109 (3), pp.846-850. ⟨10.1002/bit.24356⟩
Article dans une revue hal-02941009v1
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A retrosynthetic biology approach to metabolic pathway design for therapeutic production

Pablo Carbonell , Anne-Gaëlle Planson , Davide Fichera , Jean-Loup Faulon
BMC Systems Biology, 2011, 5 (122), ⟨10.1186/1752-0509-5-122⟩
Article dans une revue hal-02652758v1

Sulfiredoxin protects mice from lipopolysaccharide-induced endotoxic shock.

Anne-Gaëlle Planson , Gaël Palais , Kahina Abbas , Matthieu Gerard , Linhdavanh Couvelard
Antioxidants and Redox Signaling, 2011, 14 (11), pp.2071-80. ⟨10.1089/ars.2010.3552⟩
Article dans une revue hal-00606130v1

Engineering antibiotic production and overcoming bacterial resistance

Anne-Gaëlle Planson , Pablo Carbonell , Ioana Grigoras , Jean-Loup Faulon
Biotechnology Journal, 2011, 6 (7), pp.812-825. ⟨10.1002/biot.201100085⟩
Article dans une revue hal-02647510v1

Glutathione revisited: a vital function in iron metabolism and ancillary role in thiol-redox control

Chitranshu Kumar , Aeid Igbaria , Benoît d'Autréaux , Anne-Gaëlle Planson , Christophe Junot
EMBO Journal, 2011, 30 (10), pp.2044-2056. ⟨10.1038/emboj.2011.105⟩
Article dans une revue hal-02650742v1
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Determinants of Activity in Glutaredoxins: An in vitro evolved Grx1-like Variant of E. coli Grx3

Tobias H Elgán , Anne-Gaëlle Planson , Jon Beckwith , Peter Güntert , Kurt D Berndt
Biochemical Journal, 2010, 430 (3), pp.487-495. ⟨10.1042/BJ20100289⟩
Article dans une revue hal-00512005v1

Reining in H2O2 for Safe Signaling

Michel B Toledano , Anne-Gaëlle Planson , Agnès Delaunay‐moisan
Cell, 2010, 140 (4), pp.454-456. ⟨10.1016/j.cell.2010.02.003⟩
Article dans une revue hal-02663732v1

Amino acid residues important for folding of thioredoxin are revealed only by study of the physiologically relevant reduced form of the protein

Damon Huber , Alain Chaffotte , Markus Eser , Anne-Gaëlle Planson , Jon Beckwith
Biochemistry, 2010, 49 (41), pp.8922-8928. ⟨10.1021/bi100784h⟩
Article dans une revue hal-02661236v1

Mutant AhpC Peroxiredoxins Suppress Thiol-Disulfide Redox Deficiencies and Acquire Deglutathionylating Activity

Yuji Yamamoto , Dani Ritz , Anne-Gaëlle Planson , Thomas J. Jönsson , Melinda J. Faulkner
Molecular Cell, 2008, 29 (1), pp.36-45. ⟨10.1016/j.molcel.2007.11.029⟩
Article dans une revue hal-02667824v1

A selection for mutants that interfere with folding of Escherichia coli thioredoxin-1 in vivo.

Damon Huber , Myoung-Il Cha , Laurent Debarbieux , Anne-Gaëlle Planson , Nelly Cruz
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2005, 102 (52), pp.18872-7. ⟨10.1073/pnas.0509583102⟩
Article dans une revue pasteur-00553620v1
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Assistance of maltose binding protein to the in vivo folding of the disulfide-rich C-terminal fragment from Plasmodium falciparum merozoite surface protein 1 expressed in Escherichia coli.

Anne-Gaëlle Planson , J. Iñaki Guijarro , Michel E. Goldberg , Alain F. Chaffotte
Biochemistry, 2003, 42 (45), pp.13202-11. ⟨10.1021/bi035321c⟩
Article dans une revue pasteur-00364798v1

Construction and directed evolution of Bacillus subtilis synthetic consortia

Nathalie Laforge , Léa Wagner , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
BioSynSys, Jul 2023, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-04316327v1

Mechanism of action of flavonoids as antibacterial compounds in the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis.

Cécile Jacry , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
EMBO workshop - Creating is Understanding: Synthetic Biology Masters Complexity, Sep 2019, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès hal-04316392v1

Mechanism of action of flavonoids in the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis

Cécile Jacry , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
MICROBES - 15ème congrès national de la SFM, Sep 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04316436v1
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Greedy reduction of Bacillus subtilis genome yields emergent phenotypes

Etienne Dervyn , Anne-Gaëlle Planson , Kosei Tanaka , Victor Chubukov , Cyprien Guérin
BACELL2023, Nov 2023, Kobe, Japan.
Poster de conférence hal-04316425v1

Engineering of synthetic microbial consortia of Bacillus subtilis for lignocellulose degradation

Léa Wagner , Nathalie Laforge , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
Congrès Junior Pluridisciplinaire, Sep 2022, Gif-sur-Yvette (École Normale Supérieure de Paris Saclay), France
Poster de conférence hal-04316369v1
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Construction of synthetic bacterial consortia based on metabolic mutualism

Nathalie Laforge , Léa Wagner , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
BioSynSys, Sep 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04316339v1

Mechanism of action of flavonoids as antibacterial compounds in the Gram-positive bacterium Bacillus subtilis.

Cécile Jacry , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
Biosynsys, Nov 2019, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-04316382v1

Development of screening methods to detect flavonoids from engineered Escherichia coli strains

Cécile Jacry , Matthieu Jules , Anne-Gaëlle Planson
BioSynSys, Oct 2017, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04316454v1

Bacillus subtilis genome engineering and streamlining

Anne-Gaëlle Planson , Etienne Dervyn , Kosei Tanaka , Philippe Noirot , Matthieu Jules
Synthetic Biology Congress, Oct 2016, Londres, United Kingdom
Poster de conférence hal-04316478v1

Genome engineering in Bacillus subtilis

Anne-Gaëlle Planson , Michael Mangan , Philippe Noirot , Etienne Dervyn , Matthieu Jules
BioSynSys, Jun 2016, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-04316527v1

Retrosynthetic design of heterologous pathways 2013

Pablo Carbonell , Anne-Gaëlle Planson , Jean-Loup Faulon
Systems Metabolic Engineering, 985, Humana Press, 2013, Methods in Molecular Biology, 978-1-62703-298-8. ⟨10.1007/978-1-62703-299-5_9⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01204312v1