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Benoit Moury
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Documents
Presentation
**THEMATIQUES DE RECHERCHE**
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Mes travaux de recherche sont consacrés à la gestion durable de l’immunité des plantes cultivées vis-à-vis de leurs agents pathogènes, plus particulièrement des virus. J’aborde cette thématique de façon pluridisciplinaire grâce à la connaissance des interactions moléculaires entre plantes et virus, à la génétique et l’évolution des populations virales et à la modélisation. De façon plus générale, j’étudie certaines propriétés de l’évolution des virus des plantes (gamme d’hôtes, intensité de la dérive génétique lors du cycle infectieux viral, pressions de sélection exercées sur les virus).
**PARCOURS**
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• Depuis 2007 : Directeur de recherche. Unité Pathologie Végétale (UR0407), centre INRAE PACA, site de Montfavet.
• 1999-2006 : Chargé de recherche. Unité Pathologie Végétale (UR0407), centre INRA PACA, site de Montfavet.
• 1997-1999 : Chargé de recherche. Station de Pathologie Végétale, centre INRA d’Antibes
**CURSUS**
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• 2006 : HDR. Université de la Méditerranée, Faculté des Sciences de Luminy.
• 2000 : Chercheur visiteur au Danish Institute of Agricultural Sciences, Copenhague, Danemark. (collaboration avec E. Johansen).
• 1994-1997 : Thèse de Doctorat. Spécialité : Biologie et Agronomie. Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Rennes (direction: A. Palloix, G. Marchoux). Titre : Evaluation de sources de résistance au tomato spotted wilt virus chez le piment. Création d'outils d'aide à la sélection.
• 1993 : Coopérant du Service National. Sélectionneur cotonnier. CIRAD, Maroua et Garoua, Cameroun.
• 1992 : DEA “Biologie et Agronomie” option “Génétique et adaptation végétale”. Ecole National Supérieure Agronomique de Rennes / Université de Rennes I (direction: A. Palloix). Titre : Recherche de marqueurs RAPD à l’aide de lignées haplodiploïdes chez le piment (*Capsicum annuum* L.) et étude de résistances aux virus.
• 1989-1992 : Diplôme d'Ingénieur Agronome. Ecole National Supérieure Agronomique de Rennes. Spécialité “Génétique et amélioration des plantes”.
**FONCTIONS OCCUPEES**
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- ### **Fonctions actuelles**
• Depuis 2021 : Directeur de l’Unité Pathologie Végétale (UR0407), centre INRAE PACA, site de Montfavet.
- ### **Précédentes fonctions**
• 2016-2020 : Membre élu du Conseil Scientifique du Département SPE de l’INRA.
• 2016-2020 : Membre de la CSS BIHASC (Biologie des Interactions Hôtes-Agresseurs, Symbiotes et Commensaux) de l’INRA.
• 2013-2020 : Animateur de l’équipe ‘Virologie’. Unité Pathologie Végétale (UR0407), centre INRAE PACA.
• 2008-2012 : Membre du groupe de travail INRA Gestion durable de la résistance des plantes aux bioagresseurs.
**COORDINATION RECENTE DE RECHERCHES COLLABORATIVES**
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• ANR PRC (2019-2023). ArchiV Architecture génétique des caractères quantitatifs dans les interactions plante-virus: conséquences pour la gestion des variétés résistantes et/ou tolérantes à l’échelle du paysage.
• INRA SPE/BAP (2018-2019). ROBUSPIM Analyse de la robustesse de l’immunité des plantes face à des perturbations biotiques et/ou abiotiques.
• INRA/CSIRO Linkage proposals (2018). Developing a general framework to optimise the deployment of plant resistance across diverse pathosystems.
• INRA SPE (2017-2018). TOLVIR La tolérance des plantes aux virus : une piste pour la protection durable des cultures ?
• Ministère de l’Agriculture-CASDAR-ONEMA (2015-2017). PimSpot Alternatives durables à une résistance contournée : potentialités des résistances quantitatives au TSWV chez le piment.
• INRA Métaprogramme SMaCH (2013-2016). TakeControl Deployment strategies of plant quantitative resistance to take control of plant pathogen evolution.
**EXPERTISES, JURYS ET ENSEIGNEMENT**
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• Depuis 2017 : Recommandeur pour *Peer Community In Evolutionary Biology* (système alternatif de publication basé sur l’évaluation par les pairs et la recommandation de preprints).
• 2016 : Membre du comité HCERES chargé de l’évaluation de l’unité UMR1345 IRHS et de la SFR4207 Quasav (INRA, AgroCampus Ouest, Université d’Angers).
• Jurys de concours : Assistants Ingénieurs INRA (2005), Chargés de Recherche CIRAD (2008), Chargés de Recherche INRA (2008, 2016, 2021), Ingénieurs de Recherche hors classes INRA (2010, 2012), Directeurs de Recherche 2ème classe INRA (2018).
• Enseignement : Avignon Université, Institut Pasteur (Paris), AgroParisTech, Montpellier SupAgro.
• 2006 : Formation : Evolution des virus. Cours théoriques, études de cas, présentation de logiciels. CIRAD, La Réunion.
COMITES D’ORGANISATION OU SCIENTIFIQUE DE CONGRES
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• 2019 : Capsicum and eggplant EUCARPIA meeting, Avignon.
• 2016 : International Plant Virus Epidemiology meeting, Avignon.
• 2015 : Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Colmar.
• 2012 : Plant Resistance Sustainability International Conference, La Colle sur Loup.
• 2010-2020 : Rencontres de Virologie Végétale, Aussois.
Publications
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Thesis in progress : Understanding the role of natural reservoirs in the epidemic and evolutionary dynamics of generalist agricultural pathogens19èmes Rencontres de Virologie Végétale, Jan 2023, Aussois, France
Conference papers
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Change of paradigm for breeding disease resistant cultivars robust to varying environments: estimators of the robustness of plant immunity and promising genes for the futureEuropean Scientific Conference – Towards Pesticide Free Agriculture “What research to meet the pesticides reduction objectives embedded in the European Green Deal?”, French Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE), Jun 2022, Dijon, France
Conference papers
hal-03737211v1
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Robustesse de l'immunité du piment à Phytophthora capsici face à une perturbation thermique13. Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Sep 2022, Aussois (France), France. 1p
Conference papers
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Potato virus Y adaptation to various resistance QTL combinations in pepper and impact on host tolerance15. International symposium of plant virus epidemiology, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Madrid, spain, Jun 2022, Madrid, Spain
Conference papers
hal-03689572v1
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Durable resistance or efficient disease control? Adult Plant Resistance (APR) genes at the heart of the dilemmaRéunion annuelle du réseau E3GP3, Dec 2021, Visioconférence, France
Conference papers
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Outside the wild: Risks and mechanisms of host jumps of endive necrotic mosaic potyvirus18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), Cirad; INRAE, Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
hal-03368388v1
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Une structure emboîtée universelle pour les interactions quantitatives entre les plantes et leurs parasites ?Réunion annuelle du réseau E3GP3, Dec 2021, Visioconférence, France
Conference papers
hal-03553078v1
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Many different recipes but one flavor: A universal nested structure of quantitative interactions between plant genotypes and their parasites, including viruses18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), INRAE; CIRAD, Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
hal-03553180v1
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Selection and genetic drift effects exerted by solanaceous plants on PVY populationsFinal meeting of Research Infrastructure PlantUP. Nodes: Plant Health - Protection and Security of Natural Products, Oct 2021, Visioconférence, Greece
Conference papers
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Itinerary of a fluorescently labelled virus in a resistant plant18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
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Potato virus Y adaptation to various resistance QTL combinations in pepper and impact on host tolerance18. Rencontres de virologie végétale (RVV2021), Cirad; Inrae, Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
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Measuring viral load by fluorescence imaging: validation of a nondestructive method to phenotype plant resistance to virus accumulation18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
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Les apports de la phylodynamique à la compréhension de l’épidémiologie et de l’évolution des virus de plantes.Réunion annuelle du réseau PhyloMAP, Nov 2021, Paris, France
Conference papers
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Experimental evolution of a plant RNA virus: a warning about spurious correlations when studying fitness changes18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), INRAE; CIRAD, Sep 2021, Aussois, France
Conference papers
hal-03553147v1
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Genome-wide association mapping of loci involved in Potato virus Y resistance and tolerance in pepper germplasm17. Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Capsicum and Eggplant (2019), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL). FRA.; Terralia. FRA.; Groupe d'Etude et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES). FRA., Sep 2019, Avignon, France. 263 p
Conference papers
hal-02734819v1
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Geographic distribution and evolution of Cucurbitaceae and Solanaceae viruses in the French Mediterranean basin14. International Plant Virus Epidemiology Symposium (IPVE 2019), Korean Society for Plant Pathology (KSPP)., May 2019, Séoul, South Korea
Conference papers
hal-02736113v1
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Within-plant genetic drift to control virus adaptation5. Conférence Jacques Monod, Évolution virale sur le continuum mutualiste – parasite, Oct 2019, Roscoff, France
Conference papers
hal-03553334v1
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Geographic distribution and evolution of Cucurbitaceae and Solanaceae viruses in the French Mediterranean basin17. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019), Jan 2019, Aussois, France. 127 p
Conference papers
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Genome-wide association mapping of loci implied in Potato virus Y resistance and tolerance in the pepper germplasm17. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019), Jan 2019, Aussois, France. 127 p
Conference papers
hal-02734804v1
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Distribution and evolution of Cucurbitaceae and Solanaceae viruses in the Mediterranean basin: The French caseInternational Advances in Plant Virology 2019, Association of Applied Biologists. GBR., Oct 2019, Rome, Italy. 128 p
Conference papers
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Analysis of the Tomato spotted wilt virus RNA-dependent RNA polymerase adaptative evolution and constrained domains using homology protein structure modeling17. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019), Jan 2019, Aussois, France. 127 p
Conference papers
hal-02735593v1
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Impact of within-plant genetic drift and selection on virus adaptation.New Phytologist/DFG SPP1819 co-funded workshop "Molecular mechanisms underlying the rapid evolution of plant-microbe interactions", New Phytologist Foundation, Feb 2018, Vaals, Netherlands
Conference papers
hal-03553085v1
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Taking control of virus adaptation by choosing host plant genotype2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), European Society of Evolutionnary Biology (ESEB). INT., Aug 2018, Montpellier, France. 39 p
Conference papers
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Assessment of the viral protein VPg intrinsic disorder contribution to the Potato virus Y adaptation to eIF4E-mediated resistance of pepper (Capsicum annuum)16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). FRA., Jan 2017, Aussois, France. 137 p
Conference papers
hal-01608795v1
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A new eIF4E1 allele characterized by RNAseq data mining is associated with resistance to PVY in tomato albeit with a low durability16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). FRA., Jan 2017, Aussois, France. 137 p
Conference papers
hal-01595114v1
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Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). FRA., Jan 2017, Aussois, France. 137 p
Conference papers
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Sélectionner des fonds génétiques favorables à la durabilitéGIS Biotechnologies Vertes, Résistance génétique et durabilité, Jun 2017, Paris, France
Conference papers
hal-03553358v1
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La durabilité de la résistance aux potyvirus chez les plantes légumièresJournée de l’Association des Sélectionneurs Français, Feb 2017, Versailles, France
Conference papers
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Genetic determinism and evolutionary reconstruction of a host jump in a plant virus16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). FRA., Jan 2017, Aussois, France. 137 p
Conference papers
hal-01605232v1
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Recombination hotspots and positive selection in Deformed wing virus (DWV)EurBee, Sep 2016, Cluj, Romania
Conference papers
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Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p
Conference papers
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Stochastic epidemiological model for the analysis of plant resistance break- down to pathogens subjected to genetic driftEmerging trends in applied mathematics and mechanics (ETAMM 2016), May 2016, Perpignan, France
Conference papers
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Joint estimation of effective population size and selection coefficient without neutrel markers: method validation and application to experimental evolution of viruses13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p
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Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting, Szent István University. Gödöllo, HUN., Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 591 p
Conference papers
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Determinants of host species range in plant viruses13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p
Conference papers
hal-02738870v1
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Determinants of host species range in plant viruses |