Bernard Caromel

Bernard CAROMEL - INRAE GAFL - Avignon

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Présentation

Diplômes

- 2004 : Doctorat de Génétique Multifactorielle. Université Paris XI. " Cartographie génétique et étude de QTL conférant la résistance au nématode à kyste Globodera pallida (Stone) chez la pomme de terre (Solanum tuberosum ssp. tuberosum L.)"

- 2000 : Diplôme de l'Ecole Pratique des Hautes Etudes (EPHE). Génétique Moléculaire.

- 1985 : Brevet de Technicien Supérieur Agricole option "Productions Végétales".

- 1983 : Brevet de technicien Agricole option générale (BTAg) et Baccalauréat D'.

Expérience

- 2024-... : : Ingénieur de recherche à INRAE Avignon, Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), équipe "Résistance aux bioagresseurs, Diversité et Durabilité (ReDD)". Cartographie génétique de locus impliqués dans la résistance aux bioagresseurs chez la tomate. Co-coordinatueur du projet PPR Protéger et cultiver autrement "Cap Zéro Phyto: Adaptation du concept d’immunité écologique à la protection des cultures". Formateur interne INRAE en génétique et en biologie moléculaire. Responsable de l’UE d’Amélioration des plantes en master 1 SDPV à Avignon Université. Encadrement de techniciens, stagiaires, apprentis. Codirection de thèse.

- 2013-2023 : : Ingénieur d'étude à INRAE Avignon, Unité de Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL), équipe "Résistance aux bioagresseurs, Diversité et Durabilité (ReDD)". Identification de nouvelles sources de résistance à Phytophthora infestans chez la tomate et cartographie génétique des locus impliqués. Adaptation du concept d’immunité écologique à la protection des cultures. Coordination de projets. Formateur interne INRA en génétique et en biologie moléculaire. Responsable de l’UE d’Amélioration des plantes en master 1 GQPV. TP à l’IUT d’Avignon. Encadrement de techniciens, stagiaires, apprentis.

- 2000-2013 : Ingénieur d'étude à INRA-GAFL, équipes "Caractérisation Fonctionnelle des Interactions Plantes-Bioagresseurs" puis "Resistance Durable chez les Solanacées" : Cartographie génétique et détection de gènes et de QTL de résistance aux bioagresseurs. Caractérisation moléculaire de QTL. Phytopathologie. Validation fonctionnelle de gènes candidats. Etude d'expression de gènes (qPCR). Coordination de projets. Encadrement d'un doctorant, de CDD et de stagiaires.

- 1995-2000 : Assistant ingénieur au laboratoire de biologie moléculaire, INRA-GAFL : marquage moléculaire, cartographie génétique et détection de gènes de résistance chez la pomme de terre.

- 1993-1994 : Technicien en biologie moléculaire, INRA, Station de Génétique Végétale du Moulon

- 1992-1993 : Technicien en culture in vitro, Laboratoire de biologie végétale de la Faculté des Sciences d'Angers.

- 1989-1991 : AFVP (France Volontaires). Délégation du mali. Responsable d'un programme de lutte antiérosive, financé par la Communauté Economique Européenne.

- 1987-1989 : Technicien en culture in vitro et transformation génétique. Laboratoire de biologie végétale de la Faculté des Sciences d'Angers.

Domaines de recherche

Sciences du Vivant [q-bio]

Compétences

Cartographie génétique Biologie moléculaire Interactions Plantes-Bioagresseurs

Publications

Untargeted metabolomic dataset of leaves from twenty-four accessions of wild and cultivated tomato plants

Komla Exonam Amegan , Florent Magot , Alan Kergunteuil , Bernard Caromel , Anne-Violette Lavoir et al.

Data in Brief, 2026, 66, pp.112828. ⟨10.1016/j.dib.2026.112828⟩

Article dans une revue (data paper) hal-05633888v1

When Metabolomics Meets Quantitative Genetics: An Integrative Strategy to Elucidate Plant Resistance Mechanisms

Romane Lapous , Komla Exonam Amegan , Bernard Caromel , Charles‐eric Durel , Anne‐violette Lavoir et al.

Plant, Cell and Environment, 2025, pp.1-16. ⟨10.1111/pce.70328⟩

Article dans une revue hal-05443704v1

Joint effects of inter-specific and intra-specific diversity of tomato volatile profiles on antixenosis against Tuta absoluta

Komla Exonam Amegan , Yasmine Fourati , Sylvia Del-Valle , Sylvia Salgon , Paola Ferrante et al.

Entomologia Generalis, 2024, 44 (2), pp.325-337. ⟨10.1127/entomologia/2024/2399⟩

Article dans une revue hal-04557514v1

Strive or thrive: Trends in Phytophthora capsici gene expression in partially resistant pepper

Gaëtan Maillot , Emmanuel Szadkowski , Anne Massire , Véronique Brunaud , Guillem Rigaill et al.

Frontiers in Plant Science, 2022, 13 (980587), pp.1-19. ⟨10.3389/fpls.2022.980587⟩

Article dans une revue hal-03908269v1

Global range expansion history of pepper (Capsicum spp.) revealed by over 10,000 genebank accessions

Pasquale Tripodi , Mark Timothy Rabanus-Wallace , Lorenzo Barchi , Sandip Kale , Salvatore Esposito et al.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (34), pp.e2104315118. ⟨10.1073/pnas.2104315118⟩

Article dans une revue hal-03414637v1

Quelles associations de QTL chez la pomme de terre pour une résistance efficace et durable au nématode à kyste globodera pallida ?

Marie-Claire Kerlan , Jean-Paul Dantec , Lionel Renault , D. Ruer , Catherine Souchet et al.

Innovations Agronomiques, 2016, 50, pp.87-100. ⟨10.15454/1.472109676217473E12⟩

Article dans une revue hal-02637067v1

Plant genetic background increasing the efficiency and durability of major resistance genes to root-knot nematodes can be resolved into a few resistance QTLs

Arnaud Barbary , Caroline Djian-Caporalino , Nathalie Marteu , Ariane Fazari , Bernard Caromel et al.

Frontiers in Plant Science, 2016, 7, 9 p. ⟨10.3389/fpls.2016.00632⟩

Article dans une revue hal-02639203v1

Production et purification rapide d'une Taq polymérase pour les applications routinières de biologie moléculaire

Jerome Olivares , Bernard Caromel

Cahier des Techniques de l'INRA, 2016, 87, 9 p

Article dans une revue hal-01605626v1

Quelques exemples d’intérêts et de limites de la sélection assistée par marqueurs chez la pomme de terre

Marie-Claire Kerlan , Sylvie Marhadour , Bernard Caromel , E. Bonnel , Sarah Danan et al.

Innovations Agronomiques, 2013, 27, pp.111-122. ⟨10.17180/8a3r-m431⟩

Article dans une revue hal-01208610v1

Identification of reference genes for normalizing RNA expression in potato roots infected with cyst nematodes

Patricio Castro Quezada , Jawad Aarrouf , Michel Claverie , Bruno Favery , Didier Mugniery et al.

Plant Molecular Biology Reporter, 2013, 31 (4), pp.936-945. ⟨10.1007/s11105-013-0566-3⟩

Article dans une revue istex hal-01208611v1

Genetic linkage map and diversity analysis of tahitian vanilla (Vanilla ×tahitensis, Orchidaceae)

Sandra Lepers-Andrzejewski , Sandrine Causse , Bernard Caromel , Maurice Wong , Michel Dron

Crop Science, 2012, 52 (2), pp.795-806. ⟨10.2135/cropsci2010.11.0634⟩

Article dans une revue hal-02650015v1

Agrobacterium rhizogenes-dependent production of transformed roots from foliar explants of pepper (Capsicum annuum): a new and efficient tool for functional analysis of genes

Jawad Aarrouf , Patricio Castro Quezada , Simon Mallard , Bernard Caromel , Y Lizzi et al.

Plant Cell Reports, 2012, 2 (31), pp.391-401. ⟨10.1007/s00299-011-1174-z⟩

Article dans une revue hal-01332298v1

The Helper component proteinase cistron of Potato virus Y induces hypersensitivity and resistance in potato genotypes carrying dominant resistance genes on chromosome IV

Benoît Moury , Bernard Caromel , Elisabeth Ida Johansen , Vincent Simon , Laura Chauvin et al.

Molecular Plant-Microbe Interactions, 2011, 24 (7), pp.787-797. ⟨10.1094/MPMI-10-10-0246⟩

Article dans une revue hal-02652300v1

La pomme de terre entre en résistance

Sylvain Fournet , Eric Grenier , Marie-Claire Kerlan , Bernard Caromel

Réussir Fruits et Légumes, 2009, 284, pp.34-35

Article dans une revue hal-02664774v1

Major-effect QTLs for stem and foliage resistance to late blight in the wild potato relatives Solanum sparsipilum and S. spegazzinii are mapped to chromosome X

Sarah Danan , Jean-Eric Chauvin , Bernard Caromel , Jean Denis Moal , Roland Pellé et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2009, 119 (4), pp.705-719. ⟨10.1007/s00122-009-1081-7⟩

Article dans une revue istex hal-02661699v1

La lutte contre les nématodes à kyste de la pomme de terre Globodera rostochiensis et Globodera pallida

Laura Chauvin , Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Elsa Rulliat , Sylvain Fournet et al.

Cahiers Agricultures, 2008, 17 (4), pp.368-374. ⟨10.1684/agr.2008.0217⟩

Article dans une revue hal-02660975v1

Are the polygenic architectures of resistance to Phytophthora capsici and P. parasitica independent in pepper

Julien Bonnet , Sarah Danan , Christine Boudet , Lorenzo Barchi , Anne-Marie Sage-Palloix et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2007, 115 (2), pp.253-264. ⟨10.1007/s00122-007-0561-x⟩

Article dans une revue istex hal-02659540v1

Evaluation de l'efficacité et de la durabilité des résistances à Globodera pallida PA2/3, provenant de Solanum vernei, S. Spegazzinii et S. sparsipilum.

Didier Mugniery , Olivier Plantard , Sylvain Fournet , Eric Grenier , Bernard Caromel et al.

Nematologia Mediterranea, 2007, 35 (2), pp.143-153

Article dans une revue hal-02659026v1

Identification of plant genes regulated in resistant potato Solanum sparsipilum during the early stages of infection by Globodera pallida

Katell Jolivet , Eric Grenier , Jean-Paul Bouchet , Magali Esquibet , Marie-Claire Kerlan et al.

Genome, 2007, 50, pp.422-427. ⟨10.1139/G07-015⟩

Article dans une revue hal-02654200v1

Construction of a 10,000-marker ultradense genetic recombination map of potato: providing a framework for accelerated gene isolation and a genomewide physical map

Hans van Os , Sandra Andrzejewski , Erin Bakker , Imanol Barrena , Glenn J. Bryan et al.

Genetics, 2006, 173 (2), pp.1075-1087. ⟨10.1534/genetics.106.055871⟩

Article dans une revue hal-02666069v1

A major gene mapped on chromosome XII is the main factor of a quantitatively inherited resistance to Meloidogyne fallax in Solanum sparsipilum

Abou Kouassi , Marie-Claire Kerlan , Bernard Caromel , Jean-Paul Dantec , Didier Fouville et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112 (4), pp.699-707. ⟨10.1007/s00122-005-0173-2⟩

Article dans une revue istex hal-02658411v1

Resistance quantitative trait loci originating from Solanum sparsipilum act independently on the sex ratio of Globodera pallida and together for developing a necrotic reaction

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Marie-Claire Kerlan , S. Andrzejewski , Alain Palloix et al.

Molecular Plant-Microbe Interactions, 2005, 18 (11), pp.1186-1194

Article dans une revue hal-02675626v1

Mapping QTLs for resistance against Globodera pallida (Stone) Pa2/3 in a diploid potato progeny originating from Solanum spegazzinii

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Véronique Lefebvre , S. Andrzejewski , D. Ellisèche et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2003, 106, pp.1517-1523

Article dans une revue hal-02674547v1

Toward a marker-dense meiotic map of the potato genome: lessons from linkage group 1

E. Isidore , H. van Os , S. Andrzejewski , Julie Bakker , I. Barrena et al.

Genetics, 2003, 165, pp.2107-2116

Article dans une revue hal-02672751v1

Evaluation of genetic distances between pepper inbred lines for cultivar protection purposes : comparison of AFLP, RAPD and phenotypic data

Véronique Lefebvre , Bruno B. Goffinet , J.C. Chauvet , Bernard Caromel , Patrick Signoret et al.

TAG Theoretical and Applied Genetics, 2001, 102, pp.741-750

Article dans une revue hal-02676575v1

The response of tomato plants to biocontrol can be improved through breeding -Late blight

Awa Sangare , Anne Massire , Jean-François Bourgeay , Magali Duffaud , Marc Bardin et al.

15. Rencontres de Phytopathologie – Mycologie, INRAE, Jan 2026, Aussois, France

Communication dans un congrès hal-05503754v1

Does plant genetics shape the protective efficacy of biocontrol against diseases?

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Anne Massire , Bernard Caromel , Marc Bardin

Promoting Integrated Pest Management in Protected Crops in a Changing Europe and Mediterranean Basin, IOBC, Sep 2025, Podgorica, Montenegro

Communication dans un congrès hal-05534383v1

La réponse de la tomate aux stimulateurs de défense des plantes a une composante génétique

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Anne Massire , Bernard Caromel , Marc Bardin

Journées Jeunes Chercheurs 2025 du département BAP, May 2025, Bordeaux (FR), France

Communication dans un congrès hal-05538736v1

Breeding tomatoes to improve their responsiveness to biocontrol products against powdery mildew?

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Anne Massire , Bernard Caromel , Marc Bardin

XXI Eucarpia Meeting of the Tomato Working Group, Jun 2025, Plovdiv, Bulgaria

Communication dans un congrès hal-05535324v1

Genetic effect of tomato response to the application of biocontrol products

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Bernard Caromel , Marc Bardin

14e Rencontres de Phytopathologie – Mycologie, INRAE, Jan 2024, Aussois (FR), France

Communication dans un congrès hal-05536839v1

Cartographie de locus de réponse des plantes de tomate à l'application de stimulateurs de défense des plantes

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Magali Duffaud , Bernard Caromel , Marc Bardin

Colloque annuel national de la recherche sur la tomate 2024 (Fous de tomate), INRAE, Oct 2024, Angers, France

Communication dans un congrès hal-05536802v1

Implication of the overexpression of PR genes and oxidative stress genes in the efficacy of natural substances against Oidium neolycopersici

Awa Sangare , Jean-François Bourgeay , Magali Duffaud , Bernard Caromel , Marc Bardin

Commission “Young IOBC-WPRS”, PhD Symposium “Biological Control of Arthropod Pests and Plant Diseases”, International organisation for Biological Control, Apr 2024, Cabrils, Spain. pp.1-2

Communication dans un congrès hal-05536824v1

The Human History of Chilli Peppers Told by 10,000 Genebank Samples

Mark Timothy Rabanus-Wallace , Pasquale Tripodi , Lorenzo Barchi , Sandip Mallikarjun Kale , Alberto Acquadro et al.

Virtual Plant and Animal Genome XXIX Conference, Jan 2022, San Diego (CA), United States

Communication dans un congrès hal-03551615v1

Change of paradigm for breeding disease resistant cultivars robust to varying environments: estimators of the robustness of plant immunity and promising genes for the future

William Billaud , Thibaud Jayet , Valentin Ribaut , Lucie Tamisier , Anne Massire et al.

European Scientific Conference – Towards Pesticide Free Agriculture “What research to meet the pesticides reduction objectives embedded in the European Green Deal?”, French Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE), Jun 2022, Dijon, France

Communication dans un congrès hal-03737211v1

Robustesse de l'immunité du piment à Phytophthora capsici face à une perturbation thermique

William Billaud , Thibaud Jayet , Valentin Ribaut , Lucie Tamisier , Anne Massire et al.

13. Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Sep 2022, Aussois (France), France. 1p

Communication dans un congrès hal-04133317v1

Impact of host partial resistance on the gene expression of Phytophthora capsici: consequences for pepper breeding

Véronique Lefebvre , Gaëtan Maillot , Emmanuel Szadkowski , Bernard Caromel , Anne Massire et al.

17. Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Capsicum and Eggplant (2019), Sep 2019, Avignon, France

Communication dans un congrès hal-02735621v1

Screening a priori durable resistance in tomato to Phytophthora infestans using its pathogenicity effectors

Emmanuel Szadkowski , Gaëtan Maillot , Alexandre Bachellez , Dorine Achard , Anne Massire et al.

Effectome meeting 2016, Nov 2016, Lauret, France

Communication dans un congrès hal-01595030v1

Plant genetic background increasing the efficiency and durability of major resistance genes to root knot nematodes can be resolved into a few resistance QTLs

Arnaud Barbary , Caroline Djian-Caporalino , Philippe Castagnone-Sereno , Nathalie Marteu , Ariane Fazari et al.

16. Eucarpia Capsicum and Eggplant Meeting, Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 4 p

Communication dans un congrès hal-02792960v1

A priori durable resistance in tomato to Phytophthora infestans using its pathogenicity effectors

Emmanuel Szadkowski , Gaëtan Maillot , Alexandre Bachellez , Anne Massire , Bernard Caromel et al.

Journées Jeunes Chercheurs du DBAP, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Institut Jean-Pierre BOURGIN (1318)., Apr 2016, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-01594732v1

Screening tomato germplasm for resistance to late blight

Bernard Caromel , Coralie Hamers , Nasradin Touhami , Alexandre Renaudineau , Alexandre Bachellez et al.

Innovation in Integrated & Organic Horticulture, INNOHORT 2015, Jun 2015, Avignon, France

Communication dans un congrès hal-02744090v1

Glycoalcaloid contents in a family from a cross between a diploid S. tuberosum and a diploid S. sparsipilum clone are under polygenic control

Marie-Claire Kerlan , E. Bonnel , Sylvie Marhadour , Bernard Caromel , Jean-Eric Chauvin

EAPR-EUCARPIA congress, Jun 2010, Wageningen, Netherlands

Communication dans un congrès hal-02754859v1

Chromosome landing at a quantitative trait locus involved in resistance to cyst nematode in potato.

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Paulo Castro , Jawad Aarrouf , Helene H. Berges et al.

Cost 872 Workshop & MC Meeting,, May 2010, Lisbonne, Portugal

Communication dans un congrès hal-01332575v1

QTL GpaVsspI Pdt/nématodes

Bernard Caromel

Rencontres Scientifiques du DGAP, Mar 2010, La Colle sur Loup, France

Communication dans un congrès hal-02815542v1

Séquençage d'un clone BAC de pomme de terre, afin de développer des marqueurs moléculaires pour la cartographie à haute résolution et l'atterrissage chromosomique au locus GpaVspl, impliqué dans la résistance au nématode à kyste Globodera pallida chez la pomme de terre

Bernard Caromel

Les rencontres scientifiques du DGAP, 2010, La Colle sur Loup, France

Communication dans un congrès hal-02815799v1

Chromosome landing at a quantitative trait locus involved in resistance to cyst nematode in potato

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Patricio Castro Quezada , Jawad Aarrouf , Helene Berges et al.

4. Annual Meeting; COST 872 workshop, May 2010, Lisbonne, Portugal

Communication dans un congrès hal-01462645v1

Exploration of late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsipilum and Solanum spegazzinii

Véronique Lefebvre , Sarah Danan , Jean-Baptiste Veyrieras , Patrick Signoret , Bernard Caromel et al.

14. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, Jul 2009, Quebec, Canada

Communication dans un congrès hal-02757474v1

Re-evaluation of the Globodera pallida resistance QTLs originating from the wild potato species Solanum spegazzinii

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Sarah Danan , Didier Mugniery , Véronique Lefebvre

3. Annual Meeting, COST 872 Workshop & MC, May 2009, Toledo, Spain

Communication dans un congrès hal-02751896v1

Late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsipilum and Solanum spegazzinii

Véronique Lefebvre , Sarah Danan , Jean-Baptiste Veyrieras , Bernard Caromel , Sophie Ewert et al.

BioExploit Science Meeting 2009, Mar 2009, Wageningen, Netherlands

Communication dans un congrès hal-02751645v1

Exploration of late blight quantitative resistance in potato diversity: QTL meta-analysis including the novel resistance sources Solanum sparsiplum and Solanum spegazzinii

Sarah Danan , Jean-Eric Chauvin , Bernard Caromel , Jean-Baptiste Veyrieras , Jean-Paul Dantec et al.

5. Solanaceae Genome Workshop, Oct 2008, Cologne, Germany

Communication dans un congrès hal-02757139v1

Durability of resistance to Globodera pallida from Solanum vernei, S. spegazzinii and S. sparsipilum

Didier Fouville , Didier Mugniery , Olivier Plantard , Sylvain Fournet , Bernard Caromel et al.

2. Annual Meeting of the COST 872, May 2008, Postojna, Slovenia

Communication dans un congrès hal-02752254v1

How different allelic combinations at resistance QTLs control the multiplication of Globodera pallida populations?

Bernard Caromel , Didier Mugniery , Marie-Claire Kerlan , Sylvain Fournet , Véronique Lefebvre

2. Annual Meeting of the COST 872, May 2008, Postojna, Slovenia

Communication dans un congrès hal-02751542v1

The combination of resistance alleles at a major and minor effect QTLs confers a broad spectrum resistance to Globodera pallida

Bernard Caromel , Marie-Claire Kerlan , Jawad Aarrouf , Claudia Rouaux , Nadia Lama et al.

5. Solanaceae Genome Workshop, Oct 2008, Cologne, Germany

Communication dans un congrès hal-02757105v1

Use of genomic information in a program of sustainable resistance to Globodera pallida

Marie-Claire Kerlan , Laura Chauvin , Eric Grenier , Didier Mugniery , Bernard Caromel

1. Annual Meeting COST 872, May 2007, La Colle-sur Loup, France

Communication dans un congrès hal-02752126v1

Two resistance QTLs display induced and constitutive, as well as additive and epistatic effects, on transcription of defense-related genes

Michel Claverie , Véronique de Conto , Katell Jolivet , Marie-Claire Kerlan , Eric Grenier et al.

1. Annual Meeting COST 872, May 2007, La Colle-sur Loup, France

Communication dans un congrès hal-02753013v1