Cecile CABASSON

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Présentation

Plus de 30 ans d'expérience dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche

Biographie

Je suis maître de conférences en Physiologie végétale à l'Université de Bordeaux depuis 2000. Mes travaux portent sur le métabolisme et la physiologie des fruits et leur impact sur la croissance, la production de biomasse et la qualité nutritionnelle. Mon lieu de recherche privilégié est l'INRAE, dans l'équipe de recherche Métabolisme, qui collabore avec plusieurs instituts professionnels (INVENIO, ASTHREDOR, CTIFL...). Actuellement, je suis impliquée dans un des Grands programmes de Recherche Bordeaux Plant Science de l'université de Bordeaux (axe "Phytostim"). Je suis membre depuis sa création de la Plateforme MetaboHUB Bordeaux, une structure dédiée à l’analyse du métabolome des plantes et j'adhère au réseau français de métabolomique et de fluxomique (RFMF). Depuis septembre 2021, je suis co-responsable Qualité du système management de la Plateforme Bordeaux Metabolome certifiée ISO 9001:2015. J'enseigne la biologie et la physiologie végétale et la biostatistique à l'Université de Bordeaux en Licence et en Master. J'ai été attachée temporaire à l’enseignement et à recherche (ATER) à l'Université de Bordeaux dans l'équipe de recherche Génie des Procédés de Périgueux (ERAP 1999 à 2001) et à l’Université de Montpellier dans l'équipe de recherche en horticulture à l'INRA d'Avignon (UGALF 1994/1995) ; doctorante à l'Université de Montpellier dans l'équipe de recherche BIOTROP au CIRAD (1990 à 1993). J'ai obtenu la bourse Dufrenoy de l'Académie d'Agriculture de France pour ses travaux sur l'hybridation des agrumes en collaboration avec le professeur J.W. Grosser du Citrus Research & Education Center de l’Université de Gainsville, USA (CREC 1992).Adresse UMR 1332

Coordonnées : Biologie du Fruit et Pathologie, Centre INRAE Bordeaux Nouvelle Aquitaine, 71, avenue Edouard Bourlaux, 33882 Villenave d'Ornon Cedex, France

TITRES

Doctorat en Physiologie, Université des Sciences & Techniques du Languedoc-Montpellier II (Décembre 1993) Mention très honorable

Ecole doctorale "Biologie des systèmes intégrés Agronomie-Environnement"
Laboratoire : CIRAD-BIOTROP
Titre de la thèse : Régénération de la Mandrine commune (Citrus deliciosa Ten.) par embryogenèse somatique en milieu liquide. Fusions somatiques et essais de transformation génétique.”
Directeur et co-directeur de thèse : Dr. Claude Teisson et Dr. Patrick Ollitrault, CIRAD Montpellier

EXPÉRIENCE EN ENSEIGNEMENT

Depuis 2018 Maître de conférences, UF Biologie, Collège Sciences & Technnologies, Université de Bordeaux
UF Biologie : Licence (Physiologie végétale), en Master (Biostatistique)
Responsable de cinq unités d'enseignement en Master et en Licence. Agronomie des plantes à valeurs santé, Complément alimentaire Securité & innovation, Biostatistique, Bio stage dating, Simulating life.

2000-2018 Maître de conférences, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Physiologie végétale, Ecologie, Statistique) et DUT2 (Ecophysiologie, Biotechnologie)
Responsable pédagogique du DUT1 (2001/2002)
UF Biologie : Master Biologie et Biotechnologie des plantes (Biostatistique)

1999-2000 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche, Dép.Génie biologique, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Ecologie, Statistique)

1993-1994 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche, Université de Montpellier II
UFR Biologie : Préparation au CAPES, DEUG B (Biologie végétale)

1996-1999 Chargée de mission, Université d'Avignon et des Pays du Vaucluse
Formation continue : DAEU-B (Biologie)
Département Génie biologique/IUT d'Avignon : Création de l'option Agronomie

1990-1993 Monitrice de l'enseignement supérieur, Université Montpellier II
UF Bioologie : DEUG B (Biologie végétale TP/TD)

EXPÉRIENCE EN RECHERCHE

Depuis 2002 UMR 1332 Biologie du fruit & Pathologie (UMR 619 Biologie du fruit jusqu'en 2010), Université de Bordeaux et INRAE
Rattachée à l'équipe Métabolisme sous la direction du Dr. Yves GIBON (Pr. D. ROLIN jusqu'en 2010), Département des Sciences de l'Environnement
Thématique de recherche : Etude de la régulation du métabolisme au cours des phases précoces du développement des fruits charnus dans le cadre d’une approche de génomique fonctionnelle chez la tomate.

2010/2011 UMR 5200, Laboratoire de Biogenèse membranaire, CNRS et Université de Bordeaux
Détachement dans l'équipe Métabolisme lipidique sous la direction du Dr JJ Bessoule et R. LESSIRE
Thématique de recherche : Etude du métabolisme des lipides dans la graine de tomate

1999-2000 Equipe de Recherche Appliquée de Périgueux
En collaboration avec l'Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux sous la direction du Pr. G. DEMAZEAU
Thématique de recherche : Application des Hautes Pressions à la conservation des végétaux

1993-1994 Station de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes, INRA Avignon
Rattachée à l'équipe Amélioration des Curcubitaceae sous la Direction des Dr. M. Pitrat et C. Dogimont
Thématique de recherche : Amélioration génétique du Melon par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt dans la résistance aux pathogènes.

1992 Citrus Research & Education Center, University of Florida
Stage doctoral dans le laboratoire de Plant Cell Genetics sous la direction du Pr J.W. Grosser
Thématique de recherche : Amélioration génétique des Citrus par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt pour la flaveur des fruits.

PROJETS

  • Participation à plusieurs projets nationaux et européens :

Grand Programme de Recherche [Bordeaux Plant Science] (axe "Phytostim") https://www.u-bordeaux.fr/recherche/ambition-scientifique/grands-programmes-de-recherche/BPS (2021-2015). Etude du métabolisme des plantes traitées avec biostimulant ou biocontrôle.

Projet Investissement infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique METABOHUB (2013-2024). Analyse et gestion des données.

Projet ANR FRIMOUSS (2015-2019) sur la modélisation du métabolisme des fruits. Quantification des isoprénoïdes et des nucléotides, gestion des données.

Projet FEDER OPTIFRAISE (2015-2018) sur la gestion de l'eau en culture hors-sol. Membre du COPIL, experte en physiologie végétale.

Projet Erasysbio+ Fruit Integrative Modelling (2011-2015). Participation l'échantillonnage et à l'analyse des données.

Projet européen STREP META-PHOR Metabolomics for Plants, Health and Outreach (2006-2009). Participation à l'échantillonnage et mise au point de protocoles d'extraction pour l'analyse RMN haut débit.

Projet Genoplante GEN036 - MetaboP (2004-2006). Contribution à la création de Mery-B a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles et interaction avec le Plant Ontology Consortium pour la mise en place d'une ontologie chez la tomate.

Projet Alliance (2005-2006). Collaboration avec la Dr M. Defernez de l'Institut of Food Research à Norwich (UK). Développement d'une méthodologie d'alignement des spectres RMN et d'analyse des données.

  • Porteuse de projets locaux :

Projet visiting scholars financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2017). Invitation du Pr J.W Grosser.

Projet d’innovation pédagogique financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2015). Création d'un enseignement hybride en Biostatistique.

RESPONSABILITES

Membre de la Plateforme METABOHUB Bordeaux depuis sa création en 2002, labellisée IBISA en 2008
*Co-responsable du management du système de qualité certifié ISO9001:2015

Membre élue à la section CNU 66 depuis 2015 (titulaire depuis 2019)

Membre élue au Comité Technique de l'Université de Bordeaux depuis 2018

Membre élue au Conseil d' Administration del'IUT de Périgueux de 2001 à 2004

Membre du groupe fonctionnel pour la mise en place de la Mission d'Appui à la Pédagogie et à l'Innovation de l'Université de Bordeaux (2014)

FORMATION

1990 - D.E.A. Sciences Agronomique, Université Montpellier II, Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie de Montpellier
Titre : La culture d'anthères chez le blé dur (Triticum aestivum turgidum ssp. durum L. : étape de l'androgenèse et variabilité)
Directeur et co-directeur : Dr. Marc Coumans et Pr. J.J. Macheix

1989 - Maîtrise Biolgie des Organismes et des Population option Recherche, Université Aix-Marseille III (mention Bien)

1988 - Licence Biologie des Organismes, Université Aix-Marseille III (mention Bien)

1987 - DUT Génie biologie option Agronomie, IUT Villers-lès-Nancy, Université Nancy I

1985 - Baccalauréat C, Académie de Strasbourg

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Enzyme‐based kinetic modelling of ASC–GSH cycle during tomato fruit development reveals the importance of reducing power and ROS availability

Guillaume Decros , Thomas Dussarrat , Pierre Baldet , Cédric Cassan , Cécile Cabasson et al.
New Phytologist, 2023, ⟨10.1111/nph.19160⟩
Article dans une revue hal-04178513 v1
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Multi-omics quantitative data of tomato fruit unveils regulation modes of least variable metabolites

Annick Moing , Thierry Berton , Léa Roch , Salimata Diarrassouba , Stéphane Bernillon et al.
BMC Plant Biology, 2023, 23 (365), ⟨10.1186/s12870-023-04370-0⟩
Article dans une revue hal-04183193 v1
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Impaired cell growth under ammonium stress explained by modeling the energy cost of vacuole expansion in tomato leaves

Théo Poucet , Bertrand Beauvoit , María Begoña González-Moro , Cecile Cabasson , Pierre Pétriacq et al.
The Plant Journal, 2022, 112 (4), pp.1014-1028. ⟨10.1111/tpj.15991⟩
Article dans une revue hal-03855200 v1

Ammonium supply induces differential metabolic adaptive responses in tomato according to leaf phenological stage

Théo Poucet , María Begoña González-Moro , Cecile Cabasson , Bertrand Beauvoit , Yves Gibon et al.
Journal of Experimental Botany, 2021, 72 (8), pp.3185-3199. ⟨10.1093/jxb/erab057⟩
Article dans une revue hal-03179910 v1
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The Evolution of Leaf Function during Development Is Reflected in Profound Changes in the Metabolic Composition of the Vacuole

Alice Destailleur , Théo Poucet , Cecile Cabasson , Ana Paula Alonso , Jean-Christophe Cocuron et al.
Metabolites, 2021, 11 (12), pp.848. ⟨10.3390/metabo11120848⟩
Article dans une revue hal-03505133 v1
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Central Metabolism Is Tuned to the Availability of Oxygen in Developing Melon Fruit

Kentaro Mori , Bertrand Beauvoit , Benoit Biais , Maxime Chabane , J. William Allwood et al.
Frontiers in Plant Science, 2019, 10, pp.594. ⟨10.3389/fpls.2019.00594⟩
Article dans une revue hal-02621412 v1
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Regulation of Pyridine Nucleotide Metabolism During Tomato Fruit Development Through Transcript and Protein Profiling.

Guillaume Decros , Bertrand Beauvoit , Sophie Colombie , Cecile Cabasson , Stéphane Bernillon et al.
Frontiers in Plant Science, 2019, 10, pp.1201. ⟨10.3389/fpls.2019.01201⟩
Article dans une revue hal-02620533 v1
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Respiration climacteric in tomato fruits elucidated by constraint-based modelling.

Sophie Colombié , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Bénard , Gilles Vercambre et al.
New Phytologist, 2016, 213 (4), pp.1726-1739. ⟨10.1111/nph.14301⟩
Article dans une revue hal-01445653 v1
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Metabolomic profiling in tomato reveals diel compositional changes in fruit affected by source-sink relationships.

Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Sonia Osorio , Mickael M. Maucourt et al.
Journal of Experimental Botany, 2015, 66 (11), pp.3391-404. ⟨10.1093/jxb/erv151⟩
Article dans une revue hal-02641303 v1

Impact of long-term cadmium exposure on mineral content of Solanum lycopersicum plants: Consequences on fruit production

Hédia Hédiji , Wahbi Djebali , Aïcha Belkadhi , Cécile Cabasson , Annick Moing et al.
South African Journal of Botany, 2015, 97, pp.176-181. ⟨10.1016/j.sajb.2015.01.010⟩
Article dans une revue hal-02640851 v1

Metabolomic and elemental profiling of melon fruit quality as affected by genotype and environment

Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson et al.
Metabolomics, 2013, 9 (1), pp.57-77. ⟨10.1007/s11306-012-0429-1⟩
Article dans une revue istex hal-02651407 v1
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1H-NMR metabolomics: Profiling method for a rapid and efficient screening of transgenic plants

Yosra Ben Akal-Ben Fatma , Katia Pianelli , Martine Dieuaide Noubhani , Aline Le Menn , Catherine Deborde et al.
African Journal of Biotechnology, 2012, 11 (52), pp.11386-11399. ⟨10.5897/AJB12.088⟩
Article dans une revue hal-02643145 v1

Effects of long-term cadmium exposure on growth and metabolomic profile of tomato plants

Hédia Hédiji , Wahbi Djebali , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Pierre Baldet et al.
Ecotoxicology and Environmental Safety, 2010, 73 (8), pp.1965-1974. ⟨10.1016/j.ecoenv.2010.08.014⟩
Article dans une revue istex hal-02668879 v1

La Métabolomique appliquée à l'étude de la physiologie de la tomate : démarche et perspectives

Cécile Cabasson , Stéphane Bernillon , Catherine Deborde
Spectra Analyse, 2009, 271, pp.26-31
Article dans une revue hal-02656881 v1

Prolonged root hypoxia induces ammonium accumulation and decreases the nutritional quality of tomato fruits

Faouzi Horchani , Philippe Gallusci , Pierre Baldet , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt et al.
Journal of Plant Physiology, 2008, 165 (13), pp.1352-1359. ⟨10.1016/j.jplph.2007.10.016⟩
Article dans une revue istex hal-02669168 v1

Quantitative metabolic profiles of tomato flesh and seeds during fruit development: complementary analysis with ANN and PCA

Fabien F. Mounet , Martine Lemaire , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Jean-Luc Giraudel et al.
Metabolomics, 2007, 3 (3), pp.273-288. ⟨10.1007/s11306-007-0059-1⟩
Article dans une revue hal-02667259 v1

Apport de l'hybridation somatique pour l'exploitation des ressources génétiques des agrumes

Patrick Ollitrault , D. Dambier , Yann Froelicher , Françoise Carreel , Angélique d'Hont et al.
Cahiers Agricultures, 2000, 9, pp.223-236
Article dans une revue hal-02694551 v1

Induction de cals embryogenes d'agrumes par culture d'ovules. Determination isoenzymatique de l'origine tissulaire des embryons

Patrick Ollitrault , Frédérique Ollitrault , Cecile Cabasson
Fruits, 1992, sp, pp.204-212
Article dans une revue hal-02715765 v1

Modeling the effect of biostimulants on horticultural crop performance, Poinsettia: an approach combining non-target plant analysis methods and data science

Nicolas Guibert , Sylvain Prigent , Pierre Pétriacq , Jean-Marc Deogratias , Cecile Cabasson
European Horticulture Congress, International Society for Horticultural Science, May 2024, Bucarest (Roumanie), Romania
Communication dans un congrès hal-04677528 v1

Biostimulants in horticulture: how difficult is it to value techno-economic compromises?

Cecile Cabasson , Nicolas Guibert , Maïder Saint Jean
XII International Agriculture Symposium "AGROSYM 2021", Oct 2021, Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Communication dans un congrès hal-03383185 v1

Flux balance modelling in developing tomato fruit: the respiration climacteric as an emergent property

Sophie S. Colombie , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Bénard , Cécile Cabasson et al.
10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., May 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02740471 v1

Integrative and predictive biology outside the plant: linking computational tools to fleshy fruit systems

Cecile Cabasson , Sophie Colombie , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Benard et al.
Colloque Biologie synthétique et systémique, BioSynSys, Jun 2016, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-02739719 v1

Cellular and subcellular metabolomics reveal changes during tomato leaf development

Clémence de Jaham , Benjamin Thiombiano , Camille Bénard , A.P. Alonso , J.C. Cocuron et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02740382 v1

Using metabolomic approaches and modelling of central metabolic to study fleshy fruit quality

Sophie S. Colombie , Bertrand Beauvoit , Dominique D. Rolin , Stéphane Bernillon , Camille Bénard et al.
1. International Symposium on Metabolomics in Mexico, Jun 2015, Guadalajara, Mexico. 2 p
Communication dans un congrès hal-02800371 v1

Using developmental and diurnal compositional changes of tomato to study metabolism

Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt et al.
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02793195 v1

La métabolomique : un outil de la génomique fonctionnelle au service de la biologie des systèmes

Dominique D. Rolin , Bertrand Beauvoit , Stéphane Bernillon , Camille Bénard , Patricia Ballias et al.
8e Congrès Jeunes Chercheurs de la SFBV, Société Française de Biologie Végétale (SFBV). FRA., Jun 2014, Tours, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02801036 v1

Diurnal compositional changes of tomato fruit and leaf

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais et al.
Metabolomics 2013, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom. 1 p
Communication dans un congrès hal-02803658 v1

Metabolomics data integration in tomato plant-fruit systems biology

Camille Bénard , Dominique D. Rolin , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais et al.
Metabolomics-2012, International Conference and Exhibition on Metabolomics & Systems Biology, Feb 2012, San Francisco, United States
Communication dans un congrès hal-02803433 v1

Compositional changes of tomato seeds during development and maturation

Cécile Cabasson , Ousmane Harouna Kore , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Annick Moing et al.
6. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), May 2012, Nantes, France. p. 60
Communication dans un congrès hal-02807332 v1
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Tools and applications in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome Fluxome Facility (PMFB; http://www.bordeaux.inra.fr/umr619/NMR.htm)

Catherine Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Benoit Biais et al.
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02749839 v1
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Profils métaboliques du fruit de tomate au cours de sa maturation en présence de cadmium

Hédia Hédiji , Cécile Cabasson , Wahbi Djebali , Annick Moing , Mickael M. Maucourt et al.
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02746272 v1
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Variation journalière de la composition métabolique de fruit de tomate en cours de maturation

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais , Sonia Osorio-Algar et al.
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02749748 v1

Plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility. Tools and applications at PMFB

Catherine Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Isabelle Quintana et al.
4. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, May 2010, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-02756773 v1

Impact d’une contamination à long terme au cadmium sur la qualité du fruit de tomate (Solanum lycopersicum)

H. Hediji , W. Djebali , Cécile Cabasson , Pierre Baldet , Renaud Brouquisse et al.
21. Forum des sciences biologiques, Mar 2010, Mahdia, Tunisie
Communication dans un congrès hal-02754676 v1

Applications and tools in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility

Catherine Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Patricia Ballias et al.
Metabolomics 2010, Jun 2010, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02757642 v1

Effets prolongés du cadmium sur certains métabolites primaires et secondaires à activités antioxydantes chez la tomate (Solanum lycopersicon)

H. Hediji , W. Djebali , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Pierre Baldet et al.
Third SMBBM International Congress of Biochemistry in parallel with the IUBMB Special Meeting on Plant stresses and The Sixth FASBMB Congress, Apr 2009, Marrakech, Maroc
Communication dans un congrès hal-02754417 v1

Metabolic profiling techniques to assess and manage fruit quality

Benoit Biais , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Y. Tadmor et al.
SMASH Meeting, Sep 2009, Chamonix, France
Communication dans un congrès hal-02751149 v1

Mery-B : management and analysis of plant metabolomics 1H-NMR profiles

Daniel Jacob , Hélène Ferry-Dumazet , Laurent Gil , Catherine Deborde , Stéphane Bernillon et al.
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02751144 v1
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NMR profiling for the characterisation of melon commercial varieties and genetic resources

Benoit Biais , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson et al.
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02753178 v1

Fruit metabolome changes of antisens transformants of fruit specific phosphenolpyruvate carboxylase (S1-ppc2) under various environmental conditions

Cécile Cabasson , Martine Dieuaide Noubhani , Y. Ben Akal-Ben Fatma , Mickael M. Maucourt , Catherine Deborde et al.
8. Colloque national de la SFBV, Jul 2009, Strasbourg, France
Communication dans un congrès hal-02754892 v1

Mery-B : Base de Données Métabolomiques dédiée au végétal et outils d’intégration, de visualisation et de traitement statistique de profils RMN 1H

Catherine Deborde , Hélène Ferry-Dumazet , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Laurent Gil et al.
2. Journée scientifique du réseau RMN aquitain, Apr 2009, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-02752654 v1

L'étude du métabolome de la tomate par RMN du proton

Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal , Hédia Hédiji , Dominique D. Rolin
14. Colloque de la recherche en IUT, May 2008, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-02758187 v1

1H NMR and LC-MS metabolomic analysis of tomato leaf

Stéphane Bernillon , Ethel Mendocilla Sato , Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal , Mickael M. Maucourt et al.
Metabomeeting 2008, Apr 2008, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-02756215 v1

Profils et empreintes métaboliques par RMN du proton pour évaluer les modifications attendues et inattendues de la composition de tomates transgéniques

Yosra Ben Akal , Ethel Mendocilla Sato , Gwenaelle Spieldenner , Raphael Henry , Catherine Deborde et al.
3.Journées Scientifiques, Feb 2008, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-02752709 v1

Analyse du profil métabolique chez des plants de tomate en réponse au stress cadmique

H. Hediji , Cécile Cabasson , Philippe Gallusci , W. Djebali , Mickael M. Maucourt et al.
3. Journées scientifiques RFMF, Feb 2008, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-02755981 v1

LC-MS metabolomic profiling of mesocarp tissue during tomato fruit development: comparison of different data pre-processing methods and analyses

Stéphane Bernillon , Fabien F. Mounet , Gwenaëlle Le Gall , Mickael M. Maucourt , Catherine Deborde et al.
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02756030 v1

1H-NMR metabolomic analysis of tomato leaf

Ethel Mendocilla Sato , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal-Ben Fatma , Hédia Hédiji et al.
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02756940 v1

Cell expansion in tomato mesocarp and locular tissues: integration of transcriptome and metabolome data

Fabien F. Mounet , Annick Moing , Johann J. Petit , Mickael M. Maucourt , Virginie V. Garcia et al.
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02754523 v1

The Metabolome pole of the Functional Genomics Platform of Bordeaux

Catherine Deborde , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson , Mickaël Maucourt , Christel Renaud-Gentié et al.
2. Journées, Dec 2006, Saint-Sauves-d'Auvergne, France
Communication dans un congrès hal-02753989 v1

Bioinformatics resources for the study of plant metabolomics

H. Ferry-Dumazet , A. Barre , D. Jacob , A. de Daruvar , Annick Moing et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02754398 v1

MétaboP: a French initiative supported by Génoplante for the development of analytical and bioinformatic tools for plant metabolomics

Annick Moing , Graham Noctor , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02754317 v1

1H-NMR metabolic profiling reveals tissue specificity in tomato fruit

Fabien F. Mounet , Martine Lemaire , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , J.L. Giraudel et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02757194 v1

Metabolome-Fluxome facility at the Plant Systems Biology Institute in Bordeaux, France

Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud , Monique Gaudillère , Cécile Cabasson et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02754805 v1

Metabolomic profiling of two tissues during tomato (Solanum lycopersicum) fruit development: cross-validation of LC, LC/MS and NMR approaches

Stéphane Bernillon , Fabien F. Mounet , Gwenaëlle Le Gall , Mickael M. Maucourt , Catherine Deborde et al.
2. Journées, Dec 2006, Saint Sauves d'Auvergne, France
Communication dans un congrès hal-02753431 v1

Profils quantitatifs et empreintes métaboliques par RMN pour étudier la qualité des fruits

Annick Moing , Catherine Deborde , Fabien F. Mounet , Martine Lemaire-Chamley , Cécile Cabasson et al.
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02759652 v1

Pôle Métabolome à l'IFR 103 Biologie Végétale Intégrative de Bordeaux

Catherine Deborde , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud , Monique Gaudillère et al.
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02764501 v1

Un outil informatique générique pour le stockage et le data-mining de données de métabolome de plantes

Hélène Ferry-Dumazet , Daniel Jacob , Aurélien Barré , Cécile Cabasson , Christel Renaud et al.
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02759485 v1

Chemical fingerprinting for the evaluation of polar and non polar metabolite changes during fruit development in tomato (Solanum lycopersicum) by means of H NMR

Catherine Deborde , G. Fourloubey , Daniel Jacob , Fabien F. Mounet , Cécile Cabasson et al.
6. Colloque national de la SFBV, Apr 2005, Arcachon, France
Communication dans un congrès hal-02762461 v1

Regulation of carbon metabolism in fruit through metabolomics and fluxomics

Annick Moing , M. Dieuaide-Noubhani , Catherine Deborde , P. Raymond , M. Maucourt et al.
France Israël Agro-Biotechnologies Workshop, Dec 2004, Auzeville, France
Communication dans un congrès hal-02761369 v1

Metabolic profiling by 1H NMR for detecting unintended effects in plant responses to pathogen, hormones and genetic variability

Annick Moing , Cédric Renaud , M. Maucourt , F. Belvert , Cecile Cabasson et al.
5. Colloque général, Jul 2003, Orsay, France
Communication dans un congrès hal-02760372 v1

Unveiling the Impact of Biostimulant Application on Tomato Metabolism through a metabolomics strategy

Cathleen Mirande-Ney , Nicolas Guibert , Millena Cristina Barros Santos , Adam Rochepeau , Théo Poucet et al.
16ème journées scientifiques du RFMF, Jun 2024, Saint malo, France
Poster de conférence hal-04677506 v1
Image document

A project-scale map of metadata to improve future data management

Mélanie Pétéra , Cecile Cabasson , Blandine Comte , Christophe Duperier , Olivier Filangi et al.
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France.
Poster de conférence hal-03776494 v1
Image document

The PHYTOSTIM Project (2021-2025): Toward an integrative Analysis of Phytostimulant Mode of Action and Acceptance

Cecile Cabasson , Nicolas Guibert , Sabri Najaï , Joana Jorly , C. Eyssan et al.
XII International Agriculture Symposium "AGROSYM 2021", Oct 2021, Sarajevo, Bosnia and Herzegovina. pp.P80, Agrosym 2021 - Book of proceedings
Poster de conférence hal-03383359 v1
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MetaboHUB-Bordeaux

Stéphane Bernillon , Cecile Cabasson , Cédric Cassan , Grégory da Costa , Catherine Deborde et al.
Journées Scientifiques INRA-BAP, Sep 2019, Hyères, France. , 2019
Poster de conférence hal-02570809 v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications

Catherine Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Thierry Berton et al.
10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, May 2016, Montpellier, France. 2016
Poster de conférence hal-02743906 v1

The timing of shifts in the transcriptome and proteome in relation to metabolic state during tomato fruit development

Isma Belouah , Thierry Balliau , Camille Benard , Bertrand Beauvoit , Sophie Colombie et al.
Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, Ireland. , 2016
Poster de conférence hal-01603579 v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications

Catherine Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Thierry Berton et al.
Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, Ireland. 2016
Poster de conférence hal-02741696 v1

Combining MS and proton NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism

Léa Roch , Stéphane Bernillon , Mickael Maucourt , Catherine Deborde , Camille Benard et al.
12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts
Poster de conférence hal-01606414 v1

Combining MS and NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism

Léa Roch , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Catherine Deborde , Camille Bénard et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Poster de conférence hal-02739251 v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications.

Annick Moing , Catherine Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Poster de conférence hal-02743630 v1

Primary metabolism intermediates of two tomato leaf tissues in contrasted light intensity conditions

Stéphane Bernillon , Stéphanie Arrivault , Manuela Guenther , Regina Feil , Patricia Ballias et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Poster de conférence hal-02740588 v1

Assessment of metabolome compartmentation changes during tomato leaf development using nonaqueous fractionation

Clémence de Jaham , Benjamin Thiombiano , Camille Benard , A. P. Alonso , J. C. Cocuron et al.
12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts
Poster de conférence hal-01603745 v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB IA project. Tools and Applications

Annick Moing , Catherine Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon et al.
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02799366 v1
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XEML Interactive designer

Benjamin Dartigues , Kenny Biliau , Cécile Cabasson , Yves Gibon , Joachim Kopka et al.
Bordeaux Computational Biology and Bioinformatics, Nov 2014, Bordeaux, France. , 1 p., 2014
Poster de conférence hal-01203290 v1

Combining metabolite and enzymatic profiling during tomato fruit development

Mickael M. Maucourt , Camille Bénard , Benoit Biais , Patricia Ballias , Catherine Deborde et al.
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02793996 v1

Influence of diurnal factor on compositional changes of tomato fruit and leaf

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais et al.
7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France. 2013
Poster de conférence hal-02805301 v1

Mery-B: a plant metabolomics database and knowledge base

Catherine Deborde , Annick Moing , Cécile Cabasson , Stéphane Bernillon , Dominique D. Rolin et al.
Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012
Poster de conférence hal-02801976 v1

Compositional changes in fruit pericarp of water-stressed tomato in greenhouse

Annick Moing , Benoit Biais , Mickael M. Maucourt , Camille Benard , Patricia Ballias et al.
Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012
Poster de conférence hal-02805488 v1

Diurnal compositional changes in pericarp of tomato fruit

Camille Bénard , Benoit Biais , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Sonia Osorio-Algar et al.
Metabomeeting 2011, Sep 2011, Helsinki, Finland. , 1 p., 2011
Poster de conférence hal-02747463 v1

Biological Controls in Horticulture

Nicolas Guibert , Maïder Saint-Jean , Claire Prigent Combaret , Jean-Marc Deogratias , Cecile Cabasson et al.
Claire Prigent-Combaret; Bernard Dumas. Biocontrol of Plant Disease: Recent Advances and Prospects in Plant Protection, 1, Wiley; ISTE Ltd, 2022, 9781789450989. ⟨10.1002/9781394188277.ch2⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03933715 v1

Untargeted Analysis of Semipolar Compounds by LC-MS and Targeted Analysis of Fatty Acids by GC-MS/GC-FID: From Plant Cultivation to Extract Preparation

Camille Benard , Sébastien Acket , Yannick Rossez , Olivier Fernandez , Thierry Berton et al.
Plant Metabolomics, 1778, Springer Science + Business Media B.V., pp.101-124, 2018, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-7818-2. ⟨10.1007/978-1-4939-7819-9_8⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01972166 v1

High-resolution 1H-NMR spectroscopy and beyond to explore plant metabolome

Dominique D. Rolin , Catherine Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Florence Fauvelle et al.
Metabolomics Coming of Age with its Technological Diversity, 67 (1ère éd.), Elsevier Ltd, 693 p., 2013, Advances in Botanical Research, 978-0-12-397922-3. ⟨10.1016/B978-0-12-397922-3.00001-0⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02811296 v1

Recherches sur le melon

Michel Pitrat , Catherine Dogimont , S. Baudracco-Arnas , Cecile Cabasson , J.C. Rode et al.
Rapport d'activités 1993-1994, INRA Editions, 1995, 2-7380-0631-0
Chapitre d'ouvrage hal-02849188 v1