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Cecile CABASSON

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Plus de 30 ans d'expérience dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche ----------------------------------------------------------------- Biographie ----------- Je suis maître de conférences en Physiologie végétale à l'Université de Bordeaux depuis 2000. Mes travaux portent sur le métabolisme et la physiologie des fruits et leur impact sur la croissance, la production de biomasse et la qualité nutritionnelle. Mon lieu de recherche privilégié est l'INRAE, dans l'équipe de recherche Métabolisme, qui collabore avec plusieurs instituts professionnels (INVENIO, ASTHREDOR, CTIFL...). Actuellement, je suis impliquée dans un des Grands programmes de Recherche Bordeaux Plant Science de l'université de Bordeaux (axe "Phytostim"). Je suis membre depuis sa création de la Plateforme MetaboHUB Bordeaux, une structure dédiée à l’analyse du métabolome des plantes et j'adhère au réseau français de métabolomique et de fluxomique (RFMF). Depuis septembre 2021, je suis co-responsable Qualité du système management de la Plateforme Bordeaux Metabolome certifiée ISO 9001:2015. J'enseigne la biologie et la physiologie végétale et la biostatistique à l'Université de Bordeaux en Licence et en Master. J'ai été attachée temporaire à l’enseignement et à recherche (ATER) à l'Université de Bordeaux dans l'équipe de recherche Génie des Procédés de Périgueux (ERAP 1999 à 2001) et à l’Université de Montpellier dans l'équipe de recherche en horticulture à l'INRA d'Avignon (UGALF 1994/1995) ; doctorante à l'Université de Montpellier dans l'équipe de recherche BIOTROP au CIRAD (1990 à 1993). J'ai obtenu la bourse Dufrenoy de l'Académie d'Agriculture de France pour ses travaux sur l'hybridation des agrumes en collaboration avec le professeur J.W. Grosser du Citrus Research & Education Center de l’Université de Gainsville, USA (CREC 1992).Adresse UMR 1332 Coordonnées : Biologie du Fruit et Pathologie, Centre INRAE Bordeaux Nouvelle Aquitaine, 71, avenue Edouard Bourlaux, 33882 Villenave d'Ornon Cedex, France TITRES ------ **Doctorat en Physiologie**, *Université des Sciences & Techniques du Languedoc-Montpellier II (Décembre 1993) Mention très honorable* Ecole doctorale "Biologie des systèmes intégrés Agronomie-Environnement" Laboratoire : CIRAD-BIOTROP Titre de la thèse : Régénération de la Mandrine commune (Citrus deliciosa Ten.) par embryogenèse somatique en milieu liquide. Fusions somatiques et essais de transformation génétique.” Directeur et co-directeur de thèse : Dr. Claude Teisson et Dr. Patrick Ollitrault, CIRAD Montpellier EXPÉRIENCE EN ENSEIGNEMENT -------------------------- **Depuis 2018** **Maître de conférences**, *UF Biologie, Collège Sciences & Technnologies, Université de Bordeaux* UF Biologie : Licence (Physiologie **végétale),** en Master (Biostatistique) Responsable de cinq unités d'enseignement en Master et en Licence. Agronomie des plantes à valeurs santé, Complément alimentaire Securité & innovation, Biostatistique, Bio stage dating, Simulating life. **2000-2018 Maître de conférences**, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV *Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Physiologie végétale, Ecologie, Statistique) et DUT2 (Ecophysiologie, Biotechnologie)* *Responsable pédagogique du DUT1 (2001/2002)* *UF Biologie : Master Biologie et Biotechnologie des plantes (Biostatistique)* **1999-2000 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche**, Dép.Génie biologique, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV *Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Ecologie, Statistique)* **1993-1994 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche**, Université de Montpellier II *UFR Biologie : Préparation au CAPES, DEUG B (Biologie végétale)* **1996-1999** **Chargée de mission**, Université d'Avignon et des Pays du Vaucluse *Formation continue : DAEU-B (Biologie)* *Département Génie biologique/IUT d'Avignon : Création de l'option Agronomie* **1990-1993 Monitrice de l'enseignement supérieur**, Université Montpellier II *UF Bioologie : DEUG B (Biologie végétale TP/TD)* EXPÉRIENCE EN RECHERCHE ----------------------- **Depuis 2002 UMR 1332 Biologie du fruit & Pathologie (UMR 619 Biologie du fruit jusqu'en 2010), Université de Bordeaux et INRAE** *Rattachée à l'équipe Métabolisme sous la direction du Dr. Yves GIBON (Pr. D. ROLIN jusqu'en 2010), Département des Sciences de l'Environnement* *Thématique de recherche : Etude de la régulation du métabolisme au cours des phases précoces du développement des fruits charnus dans le cadre d’une approche de génomique fonctionnelle chez la tomate.* **2010/2011 UMR 5200, Laboratoire de Biogenèse membranaire, CNRS et Université de Bordeaux** *Détachement dans l'équipe Métabolisme lipidique sous la direction du Dr JJ Bessoule et R. LESSIRE* *Thématique de recherche : Etude du métabolisme des lipides dans la graine de tomate* **1999-2000 Equipe de Recherche Appliquée de Périgueux** *En collaboration avec l'Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux sous la direction du Pr. G. DEMAZEAU* *Thématique de recherche : Application des Hautes Pressions à la conservation des végétaux* **1993-1994 Station de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes, INRA Avignon** *Rattachée à l'équipe Amélioration des Curcubitaceae sous la Direction des Dr. M. Pitrat et C. Dogimont* *Thématique de recherche : Amélioration génétique du Melon par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt dans la résistance aux pathogènes.* **1992** **Citrus Research & Education Center, University of Florida** *Stage doctoral dans le laboratoire de Plant Cell Genetics sous la direction du Pr J.W. Grosser* *Thématique de recherche : Amélioration génétique des Citrus par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt pour la flaveur des fruits.* PROJETS ------- - *Participation à plusieurs projets nationaux et européens :* Grand Programme de Recherche [Bordeaux Plant Science] (axe "Phytostim") https://www.u-bordeaux.fr/recherche/ambition-scientifique/grands-programmes-de-recherche/BPS (2021-2015). Etude du métabolisme des plantes traitées avec biostimulant ou biocontrôle. Projet Investissement infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique [METABOHUB](https://www.metabohub.fr/) (2013-2024). Analyse et gestion des données. Projet [ANR FRIMOUSS](https://anr.fr/Projet-ANR-15-CE20-0009) (2015-2019) sur la modélisation du métabolisme des fruits. Quantification des isoprénoïdes et des nucléotides, gestion des données. Projet [FEDER OPTIFRAISE](https://www.invenio-fl.fr/experimentation-fraise/conduite-culturale/culture-sur-substrat/irrigation/projet-optifraise) (2015-2018) sur la gestion de l'eau en culture hors-sol. Membre du COPIL, experte en physiologie végétale. Projet Erasysbio+[ Fruit Integrative Modelling](https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/95JUTK) (2011-2015). Participation l'échantillonnage et à l'analyse des données. Projet européen STREP META-PHOR Metabolomics for Plants, Health and Outreach (2006-2009). Participation à l'échantillonnage et mise au point de protocoles d'extraction pour l'analyse RMN haut débit. Projet Genoplante GEN036 - MetaboP (2004-2006). Contribution à la création de [Mery-B](http://services.cbib.u-bordeaux.fr/MERYB/) a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles et interaction avec le Plant Ontology Consortium pour la mise en place d'une ontologie chez la tomate. Projet Alliance (2005-2006). Collaboration avec la Dr M. Defernez de l'Institut of Food Research à Norwich (UK). Développement d'une méthodologie d'alignement des spectres RMN et d'analyse des données. - *Porteuse de projets locaux :* Projet visiting scholars financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2017). Invitation du Pr J.W Grosser. Projet d’innovation pédagogique financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2015). Création d'un enseignement hybride en Biostatistique. RESPONSABILITES --------------- Membre de la **Plateforme METABOHUB Bordeaux** depuis sa création en 2002, labellisée IBISA en 2008 *Co-responsable du management du système de qualité certifié ISO9001:2015 Membre élue à la **section CNU 66** depuis 2015 (titulaire depuis 2019) Membre élue au **Comité Technique de l'Université de Bordeaux** depuis 2018 Membre élue au **Conseil d' Administration del'IUT de Périgueux** de 2001 à 2004 Membre du groupe fonctionnel pour la mise en place de la Mission d'Appui à la Pédagogie et à l'Innovation de l'Université de Bordeaux (2014) FORMATION --------- **1990 - D.E.A. Sciences Agronomique**, Université Montpellier II, Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie de Montpellier Titre : La culture d'anthères chez le blé dur (*Triticum aestivum turgidum ssp. durum* L. : étape de l'androgenèse et variabilité) Directeur et co-directeur : Dr. Marc Coumans et Pr. J.J. Macheix **1989 - Maîtrise Biolgie des Organismes et des Population** **option Recherche**, Université Aix-Marseille III (mention Bien) **1988 - Licence Biologie des Organismes**, Université Aix-Marseille III (mention Bien) **1987 - DUT Génie biologie option Agronomie**, IUT Villers-lès-Nancy, Université Nancy I **1985 - Baccalauréat C,** Académie de Strasbourg

Publications

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Enzyme‐based kinetic modelling of ASC–GSH cycle during tomato fruit development reveals the importance of reducing power and ROS availability

Guillaume Decros , Thomas Dussarrat , Pierre Baldet , Cédric Cassan , Cécile Cabasson
New Phytologist, 2023, ⟨10.1111/nph.19160⟩
Journal articles hal-04178513v1
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Multi-omics quantitative data of tomato fruit unveils regulation modes of least variable metabolites

Annick Moing , Thierry Berton , Léa Roch , Salimata Diarrassouba , Stéphane Bernillon
BMC Plant Biology, 2023, 23 (365), ⟨10.1186/s12870-023-04370-0⟩
Journal articles hal-04183193v1
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Impaired cell growth under ammonium stress explained by modeling the energy cost of vacuole expansion in tomato leaves

Théo Poucet , Bertrand Beauvoit , María Begoña González-Moro , Cecile Cabasson , Pierre Pétriacq
Plant Journal, 2022, 112 (4), pp.1014-1028. ⟨10.1111/tpj.15991⟩
Journal articles hal-03855200v1

Ammonium supply induces differential metabolic adaptive responses in tomato according to leaf phenological stage

Théo Poucet , María Begoña González-Moro , Cecile Cabasson , Bertrand Beauvoit , Yves Gibon
Journal of Experimental Botany, 2021, 72 (8), pp.3185-3199. ⟨10.1093/jxb/erab057⟩
Journal articles hal-03179910v1
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The Evolution of Leaf Function during Development Is Reflected in Profound Changes in the Metabolic Composition of the Vacuole

Alice Destailleur , Théo Poucet , Cecile Cabasson , Ana Paula Alonso , Jean-Christophe Cocuron
Metabolites, 2021, 11 (12), pp.848. ⟨10.3390/metabo11120848⟩
Journal articles hal-03505133v1
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Regulation of Pyridine Nucleotide Metabolism During Tomato Fruit Development Through Transcript and Protein Profiling.

Guillaume Decros , Bertrand Beauvoit , Sophie Colombie , Cecile Cabasson , Stéphane Bernillon
Frontiers in Plant Science, 2019, 10, pp.1201. ⟨10.3389/fpls.2019.01201⟩
Journal articles hal-02620533v1
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Central Metabolism Is Tuned to the Availability of Oxygen in Developing Melon Fruit

Kentaro Mori , Bertrand Beauvoit , Benoit Biais , Maxime Chabane , J. William Allwood
Frontiers in Plant Science, 2019, 10, pp.594. ⟨10.3389/fpls.2019.00594⟩
Journal articles hal-02621412v1
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Respiration climacteric in tomato fruits elucidated by constraint-based modelling.

Sophie Colombié , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Bénard , Gilles Vercambre
New Phytologist, 2016, 213 (4), pp.1726-1739. ⟨10.1111/nph.14301⟩
Journal articles hal-01445653v1
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Metabolomic profiling in tomato reveals diel compositional changes in fruit affected by source-sink relationships.

Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Sonia Osorio , Mickael M. Maucourt
Journal of Experimental Botany, 2015, 66 (11), pp.3391-404. ⟨10.1093/jxb/erv151⟩
Journal articles hal-02641303v1

Impact of long-term cadmium exposure on mineral content of Solanum lycopersicum plants: Consequences on fruit production

Hédia Hédiji , Wahbi Djebali , Aïcha Belkadhi , Cécile Cabasson , Annick Moing
South African Journal of Botany, 2015, 97, pp.176-181. ⟨10.1016/j.sajb.2015.01.010⟩
Journal articles hal-02640851v1

Metabolomic and elemental profiling of melon fruit quality as affected by genotype and environment

Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson
Metabolomics, 2013, 9 (1), pp.57-77. ⟨10.1007/s11306-012-0429-1⟩
Journal articles hal-02651407v1
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1H-NMR metabolomics: Profiling method for a rapid and efficient screening of transgenic plants

Yosra Ben Akal-Ben Fatma , Katia Pianelli , Martine Dieuaide Noubhani , Aline Le Menn , Catherine C. Deborde
African Journal of Biotechnology, 2012, 11 (52), pp.11386-11399. ⟨10.5897/AJB12.088⟩
Journal articles hal-02643145v1

Effects of long-term cadmium exposure on growth and metabolomic profile of tomato plants

Hédia Hédiji , Wahbi Djebali , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Pierre Baldet
Ecotoxicology and Environmental Safety, 2010, 73 (8), pp.1965-1974. ⟨10.1016/j.ecoenv.2010.08.014⟩
Journal articles hal-02668879v1

La Métabolomique appliquée à l'étude de la physiologie de la tomate : démarche et perspectives

Cécile Cabasson , Stéphane Bernillon , Catherine C. Deborde
Spectra Analyse, 2009, 271, pp.26-31
Journal articles hal-02656881v1

Prolonged root hypoxia induces ammonium accumulation and decreases the nutritional quality of tomato fruits

Faouzi Horchani , Philippe Gallusci , Pierre Baldet , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt
Journal of Plant Physiology, 2008, 165 (13), pp.1352-1359. ⟨10.1016/j.jplph.2007.10.016⟩
Journal articles hal-02669168v1

Quantitative metabolic profiles of tomato flesh and seeds during fruit development: complementary analysis with ANN and PCA

Fabien F. Mounet , Martine Lemaire , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Jean-Luc Giraudel
Metabolomics, 2007, 3 (3), pp.273-288. ⟨10.1007/s11306-007-0059-1⟩
Journal articles hal-02667259v1

Apport de l'hybridation somatique pour l'exploitation des ressources génétiques des agrumes

Patrick Ollitrault , D. Dambier , Yann Froelicher , Françoise Carreel , Angélique d'Hont
Cahiers Agricultures, 2000, 9, pp.223-236
Journal articles hal-02694551v1

Induction de cals embryogenes d'agrumes par culture d'ovules. Determination isoenzymatique de l'origine tissulaire des embryons

Patrick Ollitrault , Frédérique Ollitrault , Cecile Cabasson
Fruits, 1992, sp, pp.204-212
Journal articles hal-02715765v1

Biostimulants in horticulture: how difficult is it to value techno-economic compromises?

Cecile Cabasson , Nicolas Guibert , Maïder Saint Jean
XII International Agriculture Symposium "AGROSYM 2021", Oct 2021, Sarajevo, Bosnia and Herzegovina
Conference papers hal-03383185v1

Flux balance modelling in developing tomato fruit: the respiration climacteric as an emergent property

Sophie S. Colombie , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Bénard , Cécile Cabasson
10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., May 2016, Montpellier, France
Conference papers hal-02740471v1

Integrative and predictive biology outside the plant: linking computational tools to fleshy fruit systems

Cecile Cabasson , Sophie Colombie , Bertrand Beauvoit , Christine Nazaret , Camille Benard
Colloque Biologie synthétique et systémique, BioSynSys, Jun 2016, Bordeaux, France
Conference papers hal-02739719v1

Cellular and subcellular metabolomics reveal changes during tomato leaf development

Clémence de Jaham , Benjamin Thiombiano , Camille Bénard , A.P. Alonso , J.C. Cocuron
9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France
Conference papers hal-02740382v1

Using metabolomic approaches and modelling of central metabolic to study fleshy fruit quality

Sophie S. Colombie , Bertrand Beauvoit , Dominique D. Rolin , Stéphane Bernillon , Camille Bénard
1. International Symposium on Metabolomics in Mexico, Jun 2015, Guadalajara, Mexico. 2 p
Conference papers hal-02800371v1

La métabolomique : un outil de la génomique fonctionnelle au service de la biologie des systèmes

Dominique D. Rolin , Bertrand Beauvoit , Stéphane Bernillon , Camille Bénard , Patricia Ballias
8e Congrès Jeunes Chercheurs de la SFBV, Société Française de Biologie Végétale (SFBV). FRA., Jun 2014, Tours, France. 1 p
Conference papers hal-02801036v1

Using developmental and diurnal compositional changes of tomato to study metabolism

Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Benoit Biais , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p
Conference papers hal-02793195v1

Diurnal compositional changes of tomato fruit and leaf

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais
Metabolomics 2013, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom. 1 p
Conference papers hal-02803658v1

Metabolomics data integration in tomato plant-fruit systems biology

Camille Bénard , Dominique D. Rolin , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais
Metabolomics-2012, International Conference and Exhibition on Metabolomics & Systems Biology, Feb 2012, San Francisco, United States
Conference papers hal-02803433v1

Compositional changes of tomato seeds during development and maturation

Cécile Cabasson , Ousmane Harouna Kore , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Annick Moing
6. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), May 2012, Nantes, France. p. 60
Conference papers hal-02807332v1
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Profils métaboliques du fruit de tomate au cours de sa maturation en présence de cadmium

Hédia Hédiji , Cécile Cabasson , Wahbi Djebali , Annick Moing , Mickael M. Maucourt
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Conference papers hal-02746272v1
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Variation journalière de la composition métabolique de fruit de tomate en cours de maturation

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais , Sonia Osorio-Algar
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Conference papers hal-02749748v1
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Tools and applications in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome Fluxome Facility (PMFB; http://www.bordeaux.inra.fr/umr619/NMR.htm)

Catherine C. Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Benoit Biais
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Conference papers hal-02749839v1

Impact d’une contamination à long terme au cadmium sur la qualité du fruit de tomate (Solanum lycopersicum)

H. Hediji , W. Djebali , Cécile Cabasson , Pierre Baldet , Renaud Brouquisse
21. Forum des sciences biologiques, Mar 2010, Mahdia, Tunisie
Conference papers hal-02754676v1

Applications and tools in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility

Catherine C. Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Patricia Ballias
Metabolomics 2010, Jun 2010, Amsterdam, Netherlands
Conference papers hal-02757642v1

Plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility. Tools and applications at PMFB

Catherine C. Deborde , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Isabelle Quintana
4. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, May 2010, Marseille, France
Conference papers hal-02756773v1

Effets prolongés du cadmium sur certains métabolites primaires et secondaires à activités antioxydantes chez la tomate (Solanum lycopersicon)

H. Hediji , W. Djebali , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Pierre Baldet
Third SMBBM International Congress of Biochemistry in parallel with the IUBMB Special Meeting on Plant stresses and The Sixth FASBMB Congress, Apr 2009, Marrakech, Maroc
Conference papers hal-02754417v1

Mery-B : Base de Données Métabolomiques dédiée au végétal et outils d’intégration, de visualisation et de traitement statistique de profils RMN 1H

Catherine C. Deborde , Hélène Ferry-Dumazet , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Laurent Gil
2. Journée scientifique du réseau RMN aquitain, Apr 2009, Bordeaux, France
Conference papers hal-02752654v1

Mery-B : management and analysis of plant metabolomics 1H-NMR profiles

Daniel Jacob , Hélène Ferry-Dumazet , Laurent Gil , Catherine C. Deborde , Stéphane Bernillon
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Conference papers hal-02751144v1

Metabolic profiling techniques to assess and manage fruit quality

Benoit Biais , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Y. Tadmor
SMASH Meeting, Sep 2009, Chamonix, France
Conference papers hal-02751149v1
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NMR profiling for the characterisation of melon commercial varieties and genetic resources

Benoit Biais , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Conference papers hal-02753178v1

Fruit metabolome changes of antisens transformants of fruit specific phosphenolpyruvate carboxylase (S1-ppc2) under various environmental conditions

Cécile Cabasson , Martine Dieuaide Noubhani , Y. Ben Akal-Ben Fatma , Mickael M. Maucourt , Catherine C. Deborde
8. Colloque national de la SFBV, Jul 2009, Strasbourg, France
Conference papers hal-02754892v1

Analyse du profil métabolique chez des plants de tomate en réponse au stress cadmique

H. Hediji , Cécile Cabasson , Philippe Gallusci , W. Djebali , Mickael M. Maucourt
3. Journées scientifiques RFMF, Feb 2008, Bordeaux, France
Conference papers hal-02755981v1

Profils et empreintes métaboliques par RMN du proton pour évaluer les modifications attendues et inattendues de la composition de tomates transgéniques

Yosra Ben Akal , Ethel Mendocilla Sato , Gwenaelle Spieldenner , Raphael Henry , Catherine C. Deborde
3.Journées Scientifiques, Feb 2008, Bordeaux, France
Conference papers hal-02752709v1

1H NMR and LC-MS metabolomic analysis of tomato leaf

Stéphane Bernillon , Ethel Mendocilla Sato , Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal , Mickael M. Maucourt
Metabomeeting 2008, Apr 2008, Lyon, France
Conference papers hal-02756215v1

L'étude du métabolome de la tomate par RMN du proton

Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal , Hédia Hédiji , Dominique D. Rolin
14. Colloque de la recherche en IUT, May 2008, Lyon, France
Conference papers hal-02758187v1

LC-MS metabolomic profiling of mesocarp tissue during tomato fruit development: comparison of different data pre-processing methods and analyses

Stéphane Bernillon , Fabien F. Mounet , Gwenaëlle Le Gall , Mickael M. Maucourt , Catherine C. Deborde
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Conference papers hal-02756030v1

Cell expansion in tomato mesocarp and locular tissues: integration of transcriptome and metabolome data

Fabien F. Mounet , Annick Moing , Johann J. Petit , Mickael M. Maucourt , Virginie V. Garcia
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Conference papers hal-02754523v1

1H-NMR metabolomic analysis of tomato leaf

Ethel Mendocilla Sato , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson , Yosra Ben Akal-Ben Fatma , Hédia Hédiji
3. Annual international conference, Jun 2007, Manchester, United Kingdom
Conference papers hal-02756940v1

The Metabolome pole of the Functional Genomics Platform of Bordeaux

Catherine C. Deborde , Stéphane Bernillon , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud
2. Journées, Dec 2006, Saint Sauves d'Auvergne, France
Conference papers hal-02753989v1

Metabolomic profiling of two tissues during tomato (Solanum lycopersicum) fruit development: cross-validation of LC, LC/MS and NMR approaches

Stéphane Bernillon , Fabien F. Mounet , Gwenaëlle Le Gall , Mickael M. Maucourt , Catherine C. Deborde
2. Journées, Dec 2006, Saint Sauves d'Auvergne, France
Conference papers hal-02753431v1

Bioinformatics resources for the study of plant metabolomics

H. Ferry-Dumazet , A. Barre , D. Jacob , A. de Daruvar , Annick Moing
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Conference papers hal-02754398v1

MétaboP: a French initiative supported by Génoplante for the development of analytical and bioinformatic tools for plant metabolomics

Annick Moing , Graham Noctor , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Conference papers hal-02754317v1

Metabolome-Fluxome facility at the Plant Systems Biology Institute in Bordeaux, France

Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud , Monique Gaudillère , Cécile Cabasson
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Conference papers hal-02754805v1

1H-NMR metabolic profiling reveals tissue specificity in tomato fruit

Fabien F. Mounet , Martine Lemaire , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , J.L. Giraudel
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Conference papers hal-02757194v1

Chemical fingerprinting for the evaluation of polar and non polar metabolite changes during fruit development in tomato (Solanum lycopersicum) by means of H NMR

Catherine C. Deborde , G. Fourloubey , Daniel Jacob , Fabien F. Mounet , Cécile Cabasson
6. Colloque national de la SFBV, Apr 2005, Arcachon, France
Conference papers hal-02762461v1

Un outil informatique générique pour le stockage et le data-mining de données de métabolome de plantes

Hélène Ferry-Dumazet , Daniel Jacob , Aurélien Barré , Cécile Cabasson , Christel Renaud
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Conference papers hal-02759485v1

Pôle Métabolome à l'IFR 103 Biologie Végétale Intégrative de Bordeaux

Catherine C. Deborde , Cécile Cabasson , Mickael M. Maucourt , Christel Renaud , Monique Gaudillère
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Conference papers hal-02764501v1

Profils quantitatifs et empreintes métaboliques par RMN pour étudier la qualité des fruits

Annick Moing , Catherine C. Deborde , Fabien F. Mounet , Martine Lemaire-Chamley , Cécile Cabasson
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Conference papers hal-02759652v1

Regulation of carbon metabolism in fruit through metabolomics and fluxomics

Annick Moing , M. Dieuaide-Noubhani , Catherine Deborde , P. Raymond , M. Maucourt
France Israël Agro-Biotechnologies Workshop, Dec 2004, Auzeville, France
Conference papers hal-02761369v1

Metabolic profiling by 1H NMR for detecting unintended effects in plant responses to pathogen, hormones and genetic variability

Annick Moing , Cédric Renaud , M. Maucourt , F. Belvert , Cecile Cabasson
5. Colloque général, Jul 2003, Orsay, France
Conference papers hal-02760372v1
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A project-scale map of metadata to improve future data management

Mélanie Pétéra , Cecile Cabasson , Blandine Comte , Christophe Duperier , Olivier Filangi
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France.
Conference poster hal-03776494v1
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The PHYTOSTIM Project (2021-2025): Toward an integrative Analysis of Phytostimulant Mode of Action and Acceptance

Cecile Cabasson , Nicolas Guibert , Sabri Najaï , Joana Jorly , C. Eyssan
XII International Agriculture Symposium "AGROSYM 2021", Oct 2021, Sarajevo, Bosnia and Herzegovina. pp.P80, Agrosym 2021 - Book of proceedings
Conference poster hal-03383359v1
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MetaboHUB-Bordeaux

Stéphane Bernillon , Cecile Cabasson , Cédric Cassan , Grégory da Costa , Catherine Deborde
Journées Scientifiques INRA-BAP, Sep 2019, Hyères, France. , 2019
Conference poster hal-02570809v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications

Catherine C. Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Thierry Berton
Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, United Kingdom. 2016
Conference poster hal-02741696v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications

Catherine C. Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon , Thierry Berton
10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique RFMF 2016, May 2016, Montpellier, France. 2016
Conference poster hal-02743906v1

The timing of shifts in the transcriptome and proteome in relation to metabolic state during tomato fruit development

Isma Belouah , Thierry Balliau , Camille Benard , Bertrand Beauvoit , Sophie Colombie
Metabolomics 2016. 12. Annual Conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, Ireland. , 2016
Conference poster hal-01603579v1

Assessment of metabolome compartmentation changes during tomato leaf development using nonaqueous fractionation

Clémence de Jaham , Benjamin Thiombiano , Camille Benard , A. P. Alonso , J. C. Cocuron
12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts
Conference poster hal-01603745v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB and PHENOME IA projects. Tools and Applications.

Annick Moing , Catherine C. Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Conference poster hal-02743630v1

Primary metabolism intermediates of two tomato leaf tissues in contrasted light intensity conditions

Stéphane Bernillon , Stéphanie Arrivault , Manuela Guenther , Regina Feil , Patricia Ballias
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Conference poster hal-02740588v1

Combining MS and proton NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism

Léa Roch , Stéphane Bernillon , Mickael Maucourt , Catherine Deborde , Camille Benard
12. Solanaceae Conference SOL 2015, Oct 2015, Bordeaux, France. 2015, SOL 2015 - Book of abstracts
Conference poster hal-01606414v1

Combining MS and NMR metabolomic profiling during tomato fruit development to study environment effect on metabolism

Léa Roch , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Catherine C. Deborde , Camille Bénard
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Conference poster hal-02739251v1

Combining metabolite and enzymatic profiling during tomato fruit development

Mickael M. Maucourt , Camille Bénard , Benoit Biais , Patricia Ballias , Catherine C. Deborde
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014
Conference poster hal-02793996v1

Plant Metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility, a member of MetaboHUB IA project. Tools and Applications

Annick Moing , Catherine C. Deborde , Patricia Ballias , Camille Bénard , Stéphane Bernillon
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p., 2014
Conference poster hal-02799366v1
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XEML Interactive designer

Benjamin Dartigues , Kenny Biliau , Cécile Cabasson , Yves Gibon , Joachim Kopka
Bordeaux Computational Biology and Bioinformatics, Nov 2014, Bordeaux, France. , 1 p., 2014
Conference poster hal-01203290v1

Influence of diurnal factor on compositional changes of tomato fruit and leaf

Camille Benard , Stéphane Bernillon , Sonia Osorio-Algar , Mickael M. Maucourt , Benoit Biais
7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France. 2013
Conference poster hal-02805301v1

Mery-B: a plant metabolomics database and knowledge base

Catherine C. Deborde , Annick Moing , Cécile Cabasson , Stéphane Bernillon , Dominique D. Rolin
Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012
Conference poster hal-02801976v1

Compositional changes in fruit pericarp of water-stressed tomato in greenhouse

Annick Moing , Benoit Biais , Mickael M. Maucourt , Camille Benard , Patricia Ballias
Metabolomics 2012, Jun 2012, Washington, United States. 1 p., 2012
Conference poster hal-02805488v1

Diurnal compositional changes in pericarp of tomato fruit

Camille Bénard , Benoit Biais , Stéphane Bernillon , Mickael M. Maucourt , Sonia Osorio-Algar
Metabomeeting 2011, Sep 2011, Helsinki, Finland. , 1 p., 2011
Conference poster hal-02747463v1

Biological Controls in Horticulture

Nicolas Guibert , Maïder Saint-Jean , Claire Prigent Combaret , Jean-Marc Deogratias , Cecile Cabasson
Claire Prigent-Combaret; Bernard Dumas. Biocontrol of Plant Disease: Recent Advances and Prospects in Plant Protection, 1, Wiley; ISTE Ltd, 2022, 9781789450989. ⟨10.1002/9781394188277.ch2⟩
Book sections hal-03933715v1

Untargeted Analysis of Semipolar Compounds by LC-MS and Targeted Analysis of Fatty Acids by GC-MS/GC-FID: From Plant Cultivation to Extract Preparation

Camille Benard , Sébastien Acket , Yannick Rossez , Olivier Fernandez , Thierry Berton
Plant Metabolomics, 1778, Springer Science + Business Media B.V., pp.101-124, 2018, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-7818-2. ⟨10.1007/978-1-4939-7819-9_8⟩
Book sections hal-01972166v1

High-resolution 1H-NMR spectroscopy and beyond to explore plant metabolome

Dominique D. Rolin , Catherine C. Deborde , Mickael M. Maucourt , Cécile Cabasson , Florence Fauvelle
Metabolomics Coming of Age with its Technological Diversity, 67 (1ère éd.), Elsevier Ltd, 693 p., 2013, Advances in Botanical Research, 978-0-12-397922-3. ⟨10.1016/B978-0-12-397922-3.00001-0⟩
Book sections hal-02811296v1

Recherches sur le melon

Michel Pitrat , Catherine Dogimont , S. Baudracco-Arnas , Cecile Cabasson , J.C. Rode
Rapport d'activités 1993-1994, INRA Editions, 1995, 2-7380-0631-0
Book sections hal-02849188v1