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Cecile CABASSON
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Documents
Researcher identifiers
- cecile-cabasson
- 0000-0002-9726-4891
- IdRef : 242410081
Presentation
Plus de 30 ans d'expérience dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche
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Biographie
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Je suis maître de conférences en Physiologie végétale à l'Université de Bordeaux depuis 2000. Mes travaux portent sur le métabolisme et la physiologie des fruits et leur impact sur la croissance, la production de biomasse et la qualité nutritionnelle. Mon lieu de recherche privilégié est l'INRAE, dans l'équipe de recherche Métabolisme, qui collabore avec plusieurs instituts professionnels (INVENIO, ASTHREDOR, CTIFL...). Actuellement, je suis impliquée dans un des Grands programmes de Recherche Bordeaux Plant Science de l'université de Bordeaux (axe "Phytostim").
Je suis membre depuis sa création de la Plateforme MetaboHUB Bordeaux, une structure dédiée à l’analyse du métabolome des plantes et j'adhère au réseau français de métabolomique et de fluxomique (RFMF). Depuis septembre 2021, je suis co-responsable Qualité du système management de la Plateforme Bordeaux Metabolome certifiée ISO 9001:2015.
J'enseigne la biologie et la physiologie végétale et la biostatistique à l'Université de Bordeaux en Licence et en Master. J'ai été attachée temporaire à l’enseignement et à recherche (ATER) à l'Université de Bordeaux dans l'équipe de recherche Génie des Procédés de Périgueux (ERAP 1999 à 2001) et à l’Université de Montpellier dans l'équipe de recherche en horticulture à l'INRA d'Avignon (UGALF 1994/1995) ; doctorante à l'Université de Montpellier dans l'équipe de recherche BIOTROP au CIRAD (1990 à 1993). J'ai obtenu la bourse Dufrenoy de l'Académie d'Agriculture de France pour ses travaux sur l'hybridation des agrumes en collaboration avec le professeur J.W. Grosser du Citrus Research & Education Center de l’Université de Gainsville, USA (CREC 1992).Adresse UMR 1332
Coordonnées :
Biologie du Fruit et Pathologie, Centre INRAE Bordeaux Nouvelle Aquitaine, 71, avenue Edouard Bourlaux, 33882 Villenave d'Ornon Cedex, France
TITRES
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**Doctorat en Physiologie**, *Université des Sciences & Techniques du Languedoc-Montpellier II (Décembre 1993) Mention très honorable*
Ecole doctorale "Biologie des systèmes intégrés Agronomie-Environnement"
Laboratoire : CIRAD-BIOTROP
Titre de la thèse : Régénération de la Mandrine commune (Citrus deliciosa Ten.) par embryogenèse somatique en milieu liquide. Fusions somatiques et essais de transformation génétique.”
Directeur et co-directeur de thèse : Dr. Claude Teisson et Dr. Patrick Ollitrault, CIRAD Montpellier
EXPÉRIENCE EN ENSEIGNEMENT
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**Depuis 2018** **Maître de conférences**, *UF Biologie, Collège Sciences & Technnologies, Université de Bordeaux*
UF Biologie : Licence (Physiologie **végétale),** en Master (Biostatistique)
Responsable de cinq unités d'enseignement en Master et en Licence. Agronomie des plantes à valeurs santé, Complément alimentaire Securité & innovation, Biostatistique, Bio stage dating, Simulating life.
**2000-2018 Maître de conférences**, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
*Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Physiologie végétale, Ecologie, Statistique) et DUT2 (Ecophysiologie, Biotechnologie)*
*Responsable pédagogique du DUT1 (2001/2002)*
*UF Biologie : Master Biologie et Biotechnologie des plantes (Biostatistique)*
**1999-2000 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche**, Dép.Génie biologique, IUT Périgueux, Université de Bordeaux IV
*Département Génie biologique : DUT1 (Biologie cellulaire, Ecologie, Statistique)*
**1993-1994 Attachée temporaire à l'Enseignement et à la Recherche**, Université de Montpellier II
*UFR Biologie : Préparation au CAPES, DEUG B (Biologie végétale)*
**1996-1999** **Chargée de mission**, Université d'Avignon et des Pays du Vaucluse
*Formation continue : DAEU-B (Biologie)*
*Département Génie biologique/IUT d'Avignon : Création de l'option Agronomie*
**1990-1993 Monitrice de l'enseignement supérieur**, Université Montpellier II
*UF Bioologie : DEUG B (Biologie végétale TP/TD)*
EXPÉRIENCE EN RECHERCHE
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**Depuis 2002 UMR 1332 Biologie du fruit & Pathologie (UMR 619 Biologie du fruit jusqu'en 2010), Université de Bordeaux et INRAE**
*Rattachée à l'équipe Métabolisme sous la direction du Dr. Yves GIBON (Pr. D. ROLIN jusqu'en 2010), Département des Sciences de l'Environnement*
*Thématique de recherche : Etude de la régulation du métabolisme au cours des phases précoces du développement des fruits charnus dans le cadre d’une approche de génomique fonctionnelle chez la tomate.*
**2010/2011 UMR 5200, Laboratoire de Biogenèse membranaire, CNRS et Université de Bordeaux**
*Détachement dans l'équipe Métabolisme lipidique sous la direction du Dr JJ Bessoule et R. LESSIRE*
*Thématique de recherche : Etude du métabolisme des lipides dans la graine de tomate*
**1999-2000 Equipe de Recherche Appliquée de Périgueux**
*En collaboration avec l'Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux sous la direction du Pr. G. DEMAZEAU*
*Thématique de recherche : Application des Hautes Pressions à la conservation des végétaux*
**1993-1994 Station de Génétique et d'Amélioration des Fruits et Légumes, INRA Avignon**
*Rattachée à l'équipe Amélioration des Curcubitaceae sous la Direction des Dr. M. Pitrat et C. Dogimont*
*Thématique de recherche : Amélioration génétique du Melon par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt dans la résistance aux pathogènes.*
**1992** **Citrus Research & Education Center, University of Florida**
*Stage doctoral dans le laboratoire de Plant Cell Genetics sous la direction du Pr J.W. Grosser*
*Thématique de recherche : Amélioration génétique des Citrus par hybridation somatique pour l'introgression de gènes d'intérêt pour la flaveur des fruits.*
PROJETS
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- *Participation à plusieurs projets nationaux et européens :*
Grand Programme de Recherche [Bordeaux Plant Science] (axe "Phytostim") https://www.u-bordeaux.fr/recherche/ambition-scientifique/grands-programmes-de-recherche/BPS (2021-2015). Etude du métabolisme des plantes traitées avec biostimulant ou biocontrôle.
Projet Investissement infrastructure nationale en métabolomique et fluxomique [METABOHUB](https://www.metabohub.fr/) (2013-2024). Analyse et gestion des données.
Projet [ANR FRIMOUSS](https://anr.fr/Projet-ANR-15-CE20-0009) (2015-2019) sur la modélisation du métabolisme des fruits. Quantification des isoprénoïdes et des nucléotides, gestion des données.
Projet [FEDER OPTIFRAISE](https://www.invenio-fl.fr/experimentation-fraise/conduite-culturale/culture-sur-substrat/irrigation/projet-optifraise) (2015-2018) sur la gestion de l'eau en culture hors-sol. Membre du COPIL, experte en physiologie végétale.
Projet Erasysbio+[ Fruit Integrative Modelling](https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/95JUTK) (2011-2015). Participation l'échantillonnage et à l'analyse des données.
Projet européen STREP META-PHOR Metabolomics for Plants, Health and Outreach (2006-2009). Participation à l'échantillonnage et mise au point de protocoles d'extraction pour l'analyse RMN haut débit.
Projet Genoplante GEN036 - MetaboP (2004-2006). Contribution à la création de [Mery-B](http://services.cbib.u-bordeaux.fr/MERYB/) a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant NMR metabolomic profiles et interaction avec le Plant Ontology Consortium pour la mise en place d'une ontologie chez la tomate.
Projet Alliance (2005-2006). Collaboration avec la Dr M. Defernez de l'Institut of Food Research à Norwich (UK). Développement d'une méthodologie d'alignement des spectres RMN et d'analyse des données.
- *Porteuse de projets locaux :*
Projet visiting scholars financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2017). Invitation du Pr J.W Grosser.
Projet d’innovation pédagogique financé par l’Initiative d'Excellence de Bordeaux (2015). Création d'un enseignement hybride en Biostatistique.
RESPONSABILITES
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Membre de la **Plateforme METABOHUB Bordeaux** depuis sa création en 2002, labellisée IBISA en 2008
*Co-responsable du management du système de qualité certifié ISO9001:2015
Membre élue à la **section CNU 66** depuis 2015 (titulaire depuis 2019)
Membre élue au **Comité Technique de l'Université de Bordeaux** depuis 2018
Membre élue au **Conseil d' Administration del'IUT de Périgueux** de 2001 à 2004
Membre du groupe fonctionnel pour la mise en place de la Mission d'Appui à la Pédagogie et à l'Innovation de l'Université de Bordeaux (2014)
FORMATION
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**1990 - D.E.A. Sciences Agronomique**, Université Montpellier II, Ecole Nationale Supérieure d'Agronomie de Montpellier
Titre : La culture d'anthères chez le blé dur (*Triticum aestivum turgidum ssp. durum* L. : étape de l'androgenèse et variabilité)
Directeur et co-directeur : Dr. Marc Coumans et Pr. J.J. Macheix
**1989 - Maîtrise Biolgie des Organismes et des Population** **option Recherche**, Université Aix-Marseille III (mention Bien)
**1988 - Licence Biologie des Organismes**, Université Aix-Marseille III (mention Bien)
**1987 - DUT Génie biologie option Agronomie**, IUT Villers-lès-Nancy, Université Nancy I
**1985 - Baccalauréat C,** Académie de Strasbourg
Publications
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Biological Controls in HorticultureClaire Prigent-Combaret; Bernard Dumas. Biocontrol of Plant Disease: Recent Advances and Prospects in Plant Protection, 1, Wiley; ISTE Ltd, 2022, 9781789450989. ⟨10.1002/9781394188277.ch2⟩
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Untargeted Analysis of Semipolar Compounds by LC-MS and Targeted Analysis of Fatty Acids by GC-MS/GC-FID: From Plant Cultivation to Extract PreparationPlant Metabolomics, 1778, Springer Science + Business Media B.V., pp.101-124, 2018, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-7818-2. ⟨10.1007/978-1-4939-7819-9_8⟩
Book sections
hal-01972166v1
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High-resolution 1H-NMR spectroscopy and beyond to explore plant metabolomeMetabolomics Coming of Age with its Technological Diversity, 67 (1ère éd.), Elsevier Ltd, 693 p., 2013, Advances in Botanical Research, 978-0-12-397922-3. ⟨10.1016/B978-0-12-397922-3.00001-0⟩
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hal-02811296v1
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Recherches sur le melonRapport d'activités 1993-1994, INRA Editions, 1995, 2-7380-0631-0
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hal-02849188v1
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