Cécile Guichard

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A comprehensive map of preferentially located motifs reveals distinct proximal cis -regulatory elements in plants

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.976371. ⟨10.3389/fpls.2022.976371⟩
Article dans une revue hal-04400803 v1
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Extensive nuclear reprogramming and endoreduplication in mature leaf during floral induction

Stefania del Prete , Anne Molitor , Delphine Charif , Nadia Bessoltane-Bentahar , Ludivine Soubigou-Taconnat et al.
BMC Plant Biology, 2019, 19, pp.135. ⟨10.1186/s12870-019-1738-6⟩
Article dans une revue hal-02618994 v1
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A systems biology approach uncovers a gene co-expression network associated with cell wall degradability in maize

Clément Cuello , Aurélie Baldy , Véronique Brunaud , Johann Joets , Etienne Delannoy et al.
PLoS ONE, 2019, 14 (12), pp.e0227011. ⟨10.1371/journal.pone.0227011⟩
Article dans une revue hal-02429157 v1
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A new version of the grapevine reference genome assembly (12X.v2) and of its annotation (VCost.v3)

Aurelie Canaguier , Jérome Grimplet , Gabriele Di Gaspero , Simone Scalabrin , Eric Duchêne et al.
Genomics Data, 2017, 14, pp.56-62. ⟨10.1016/j.gdata.2017.09.002⟩
Article dans une revue (data paper) hal-01619926 v1

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joëlle Amselem , Tina Alaeitabar , Valérie Barbe et al.
Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩
Article dans une revue istex hal-01579667 v1
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GEM2Net: from gene expression modeling to -omics networks, a new CATdb module to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response

Rim Zaag , Jean-Philippe Tamby , Cecile Guichard , Zakia Tariq , Guillem Rigaill et al.
Nucleic Acids Research, 2015, 43 (Database issue), pp.D1010-D1017. ⟨10.1093/nar/gku1155⟩
Article dans une revue hal-01137554 v1
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Exploration of plant genomes in the FLAGdb++ environment

Sandra S. Derozier , Franck F. Samson , Jean-Philippe Tamby , Cecile C. Guichard , Veronique V. Brunaud et al.
Plant Methods, 2011, 7 (8), 10 p. ⟨10.1186/1746-4811-7-8⟩
Article dans une revue hal-02652189 v1
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Patterns of sequence polymorphism in the fleshless berry locus in cultivated and wild Vitis vinifera accessions

Cléa Houel , Rémi Bounon , Jamila Chaïb , Cecile C. Guichard , Jean-Pierre Peros et al.
BMC Plant Biology, 2010, 10 (284), pp.1-15. ⟨10.1186/1471-2229-10-284⟩
Article dans une revue hal-02657182 v1
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A physical map of the heterozygous grapevine 'Cabernet Sauvignon' allows mapping candidate genes for disease resistance

Marco Moroldo , Sophie Paillard , Raffaella Marconi , Fabrice Legeai , Aurélie Canaguier et al.
BMC Plant Biology, 2008, 8 (66), pp.1-14. ⟨10.1186/1471-2229-8-66⟩
Article dans une revue inria-00329169 v1
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UTILLdb, a Pisum sativum in silico forward and reverse genetics tool

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.
Genome Biology, 2008, 9 (2), R43, 12p. ⟨10.1186/gb-2008-9-2-r43⟩
Article dans une revue hal-02666957 v1
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Plant-PLMview: a web-tool and in silico method for identifying cis-regulatory elements in gene-proximal regions of plants

Julien Rozière , Franck Samson , Cécile Guichard , Margot Correa , Sylvie Coursol et al.
Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), SFBI, Jul 2025, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-05163963 v1

Detection of preferentially located DNA motifs reveals distinct cis-regulatory sequences in gene-proximal regions of Arabidopsis thaliana and maize

Julien Rozière , Franck Samson , Cécile Guichard , Margot Correa , Véronique Brunaud et al.
65th Annual Maize Genetics Meeting, Maize Genetics Cooperation, Inc, Mar 2023, Saint-Louis (M0), United States
Communication dans un congrès hal-05161597 v1
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A MAP OF GENE-PROXIMAL CIS-REGULATORY SEQUENCES IN THE ARABIDOPSIS AND MAIZE GENOMES

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol
13th International Conference of the French Society of Plant Biology, Christian Dubos, Aug 2022, Montpellier (Centre Agropolis), France
Communication dans un congrès hal-05161601 v1

PLMdetect: a bioinformatic approach to identify cis-regulatory motifs in promoters of Plant genomes.

Julien Rozière , Cecile C. Guichard , Margot Correa , Sylvie Coursol , Marie-Laure Martin-Magniette et al.
2nd International Conference on Plant & Molecular Biology, Oct 2019, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02955246 v1

From gene expression modeling to gene network to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response

Rim Zaag , Jean-Philippe Tamby , Cécile Guichard , Zakia Tariq , Sébastien Aubourg et al.
The 26th international conference on Arabidopsis research (ICAR2015), Jul 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04671451 v1

Toward the deciphering of chromosome structure in Vitis vinifera

Aurelie A. Canaguier , Isabelle I. Le Clainche , Aurélie A. Berard , Aurelie A. Chauveau , Marie-Stéphanie Vernerey et al.
10. International Conference on Grapevine Breeding and Genetics, Aug 2010, Geneva, New York, United States
Communication dans un congrès hal-02739605 v1

Sequencing allelic BACs for exploring the level of genome heterozygosity in oak

Patricia P. Faivre-Rampant , Nathalie N. Pavy , Isabelle I. Le Clainche , Aurelie A. Canaguier , Cecile C. Guichard et al.
IUFRO working group "Genetics of Quercus and Nothofagus", Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-00964429 v1

Physical mapping and re-sequencing of a set of resistance related genes in grapevine

Marco Moroldo , Sophie Paillard , R. Marconi , Fabrice Legeai , Aurelie Canaguier et al.
17. Conference Plant and Animal Genomes, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jan 2009, San Diego, United States. 1 p
Communication dans un congrès hal-01462667 v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Patricia P. Faivre-Rampant , Alois Bresson , Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane R. El-Malki et al.
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. 84 p
Communication dans un congrès hal-02750107 v1

Allele mining in grape for the analysis of complex traits

Roberto Bacilieri , Stephane Nicolas , Richard Bounon , Alexis Dereeper , Marie-Christine Le Paslier et al.
18. Conference, Jan 2010, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02754346 v1

Structural and functional genomics in grapevine through FLAGdb++

Sandra S. Derozier , Cecile C. Guichard , Franck F. Samson
Jobim2010, Sep 2010, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02757685 v1

Genomic ressources for pea

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.
6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. 199 p
Communication dans un congrès hal-02754438 v1
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A comprehensive map of preferentially located motifs reveals novel proximal cis-regulatory elements in plants

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol
Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. , 2022
Poster de conférence hal-05161617 v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Alois Bresson , Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane R. El-Malki , Vincent Segura et al.
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, 84 p., 2011, Les ressources génétiques face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociaux
Poster de conférence hal-02749127 v1

Pea TILLING platform

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.
6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. European Conference on Grain Legumes, 199 p., 2007
Proceedings/Recueil des communications hal-02822350 v1