Cécile Guichard

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A comprehensive map of preferentially located motifs reveals distinct proximal cis -regulatory elements in plants

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol

Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.976371. ⟨10.3389/fpls.2022.976371⟩

Article dans une revue hal-04400803v1
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Extensive nuclear reprogramming and endoreduplication in mature leaf during floral induction

Stefania del Prete , Anne Molitor , Delphine Charif , Nadia Bessoltane-Bentahar , Ludivine Soubigou-Taconnat et al.

BMC Plant Biology, 2019, 19, pp.135. ⟨10.1186/s12870-019-1738-6⟩

Article dans une revue hal-02618994v1
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A systems biology approach uncovers a gene co-expression network associated with cell wall degradability in maize

Clément Cuello , Aurélie Baldy , Véronique Brunaud , Johann Joets , Etienne Delannoy et al.

PLoS ONE, 2019, 14 (12), pp.e0227011. ⟨10.1371/journal.pone.0227011⟩

Article dans une revue hal-02429157v1
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A new version of the grapevine reference genome assembly (12X.v2) and of its annotation (VCost.v3)

Aurelie Canaguier , Jérome Grimplet , Gabriele Di Gaspero , Simone Scalabrin , Eric Duchêne et al.

Genomics Data, 2017, 14, pp.56-62. ⟨10.1016/j.gdata.2017.09.002⟩

Article dans une revue (data paper) hal-01619926v1

Decoding the oak genome: public release of sequence data, assembly, annotation and publication strategies.

Christophe Plomion , Jean-Marc Aury , Joëlle Amselem , Tina Alaeitabar , Valérie Barbe et al.

Molecular Ecology Resources, 2015, 16 (1), pp.254-265. ⟨10.1111/1755-0998.12425⟩

Article dans une revue istex hal-01579667v1
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GEM2Net: from gene expression modeling to -omics networks, a new CATdb module to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response

Rim Zaag , Jean-Philippe Tamby , Cecile Guichard , Zakia Tariq , Guillem Rigaill et al.

Nucleic Acids Research, 2015, 43 (Database issue), pp.D1010-D1017. ⟨10.1093/nar/gku1155⟩

Article dans une revue hal-01137554v1
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Exploration of plant genomes in the FLAGdb++ environment

Sandra S. Derozier , Franck F. Samson , Jean-Philippe Tamby , Cecile C. Guichard , Veronique V. Brunaud et al.

Plant Methods, 2011, 7 (8), 10 p. ⟨10.1186/1746-4811-7-8⟩

Article dans une revue hal-02652189v1
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Patterns of sequence polymorphism in the fleshless berry locus in cultivated and wild Vitis vinifera accessions

Cléa Houel , Rémi Bounon , Jamila Chaïb , Cecile C. Guichard , Jean-Pierre Peros et al.

BMC Plant Biology, 2010, 10 (284), pp.1-15. ⟨10.1186/1471-2229-10-284⟩

Article dans une revue hal-02657182v1
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A physical map of the heterozygous grapevine 'Cabernet Sauvignon' allows mapping candidate genes for disease resistance

Marco Moroldo , Sophie Paillard , Raffaella Marconi , Fabrice Legeai , Aurélie Canaguier et al.

BMC Plant Biology, 2008, 8 (66), pp.1-14. ⟨10.1186/1471-2229-8-66⟩

Article dans une revue inria-00329169v1
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UTILLdb, a Pisum sativum in silico forward and reverse genetics tool

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.

Genome Biology, 2008, 9 (2), R43, 12p. ⟨10.1186/gb-2008-9-2-r43⟩

Article dans une revue hal-02666957v1
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Plant-PLMview: a web-tool and in silico method for identifying cis-regulatory elements in gene-proximal regions of plants

Julien Rozière , Franck Samson , Cécile Guichard , Margot Correa , Sylvie Coursol et al.

Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), SFBI, Jul 2025, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-05163963v1

Detection of preferentially located DNA motifs reveals distinct cis-regulatory sequences in gene-proximal regions of Arabidopsis thaliana and maize

Julien Rozière , Franck Samson , Cécile Guichard , Margot Correa , Véronique Brunaud et al.

65th Annual Maize Genetics Meeting, Maize Genetics Cooperation, Inc, Mar 2023, Saint-Louis (M0), United States

Communication dans un congrès hal-05161597v1
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A MAP OF GENE-PROXIMAL CIS-REGULATORY SEQUENCES IN THE ARABIDOPSIS AND MAIZE GENOMES

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol

13th International Conference of the French Society of Plant Biology, Christian Dubos, Aug 2022, Montpellier (Centre Agropolis), France

Communication dans un congrès hal-05161601v1

PLMdetect: a bioinformatic approach to identify cis-regulatory motifs in promoters of Plant genomes.

Julien Rozière , Cecile C. Guichard , Margot Correa , Sylvie Coursol , Marie-Laure Martin-Magniette et al.

2nd International Conference on Plant & Molecular Biology, Oct 2019, Amsterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-02955246v1

From gene expression modeling to gene network to investigate Arabidopsis thaliana genes involved in stress response

Rim Zaag , Jean-Philippe Tamby , Cécile Guichard , Zakia Tariq , Sébastien Aubourg et al.

The 26th international conference on Arabidopsis research (ICAR2015), Jul 2015, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04671451v1

Toward the deciphering of chromosome structure in Vitis vinifera

Aurelie A. Canaguier , Isabelle I. Le Clainche , Aurélie A. Berard , Aurelie A. Chauveau , Marie-Stéphanie Vernerey et al.

10. International Conference on Grapevine Breeding and Genetics, Aug 2010, Geneva, New York, United States

Communication dans un congrès hal-02739605v1

Sequencing allelic BACs for exploring the level of genome heterozygosity in oak

Patricia P. Faivre-Rampant , Nathalie N. Pavy , Isabelle I. Le Clainche , Aurelie A. Canaguier , Cecile C. Guichard et al.

IUFRO working group "Genetics of Quercus and Nothofagus", Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-00964429v1

Physical mapping and re-sequencing of a set of resistance related genes in grapevine

Marco Moroldo , Sophie Paillard , R. Marconi , Fabrice Legeai , Aurelie Canaguier et al.

17. Conference Plant and Animal Genomes, Labo/service de l'auteur, Ville service, Pays service., Jan 2009, San Diego, United States. 1 p

Communication dans un congrès hal-01462667v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Patricia P. Faivre-Rampant , Alois Bresson , Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane R. El-Malki et al.

Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. 84 p

Communication dans un congrès hal-02750107v1

Allele mining in grape for the analysis of complex traits

Roberto Bacilieri , Stephane Nicolas , Richard Bounon , Alexis Dereeper , Marie-Christine Le Paslier et al.

18. Conference, Jan 2010, San Diego, United States

Communication dans un congrès hal-02754346v1

Structural and functional genomics in grapevine through FLAGdb++

Sandra S. Derozier , Cecile C. Guichard , Franck F. Samson

Jobim2010, Sep 2010, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02757685v1

Genomic ressources for pea

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.

6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. 199 p

Communication dans un congrès hal-02754438v1
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A comprehensive map of preferentially located motifs reveals novel proximal cis-regulatory elements in plants

Julien Rozière , Cécile Guichard , Véronique Brunaud , Marie-Laure Martin , Sylvie Coursol

Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. , 2022

Poster de conférence hal-05161617v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Alois Bresson , Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane R. El-Malki , Vincent Segura et al.

Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, 84 p., 2011, Les ressources génétiques face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociaux

Poster de conférence hal-02749127v1

Pea TILLING platform

Marion M. Dalmais , Julien Schmidt , Christine Le Signor , Francoise Moussy , Judith Burstin et al.

6. European Conference on Grain Legumes "Integrating legume biology for sustainable agriculture", Nov 2007, Lisbon, Portugal. European Conference on Grain Legumes, 199 p., 2007

Proceedings/Recueil des communications hal-02822350v1