Hubert Charles
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Researcher identifiers
hubert-charles- ResearcherId : B-9392-2011
-
0000-0002-0809-4705
- ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-9392-2011
Presentation
Etat Civil
==========
*Date et lieu de naissance* : 3 novembre 1969 à Paris XIème
*Situation familiale* : marié, 2 enfants
*Adresse personnelle* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Site personnel** : [La biodiversité derrière ma porte ](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) ou retrouvez-moi sur [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Adresse professionnelle* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Grades et Titres
================
> **2018 :** Chevalier dans l’ordre des Palmes académiques (09/01/2018)
>
> **2012 :** Professeur des Universités. UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Biologie Cellulaire.
>
> **2007** : Qualification aux fonctions de Professeur des Universités en sections CNU 65-Biologie Cellulaire (07165178138), 67-Biologie des Populations et écologie (07167178138) et 68-Biologie des organismes (07168178138).
>
> **2006** : Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 avril 2006 à l’INSA de Lyon. Analyse du transcriptome de *Buchnera aphidicola*, la bactérie symbiotique du puceron *Acyrthosiphon pisum*.
>
> **Depuis le** **1er octobre 1998 :** Maître de Conférences. Laboratoire de Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions (Directeur, Y. Rahbé), Titularisation le 01/09/99.
>
> **1998** : Stage Post-Doctoral d’avril à septembre. UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard Lyon 1 (équipe de M. Gouy). *Sujet* : Méthodologie de reconstruction phylogénétique dans les symbioses intracellulaires (à fort taux de A+T et forte vitesse évolutive).
>
> **1997** : Stage Post-Doctoral d’octobre 97 à mars 98. Zoological Institute, Université de Tokyo, (équipe du Pr. H. Ishikawa). *Sujet* : Carte physique du génome de *Buchnera aphidicola*.
>
> **1997** : Thèse de Doctorat (Laboratoire de Biologie Appliquée INSA 406). Félicitations du Jury – Prix Malotau de Guerne 1997. Moniteur à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (Biomathématiques).
>
> **1994** : DEA : «Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques». Mention Très Bien.
>
> **1993** : Professeur du Contingent en Biologie au Lycée militaire d’Autun.
>
> **1992** : INSA de Lyon, département de Biochimie. Diplôme d'ingénieur biochimiste.
>
> **1989** : Premier cycle INSA en section Sport-Etudes (Handball).
Civil status
============
*Date and place of birth* : November 3, 1969 in Paris XIth
*Family status* : married, 2 children
*Personal address* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Personnal website** : [La biodiversité derrière ma porte](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) or find me at [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Professional address* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Degrees and titles
==================
**2018** : Knight in the order of the Academic Palms (09/01/2018)
**2012** : Professor UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Cellular Biology.
**2007** : Qualification as University Professor in CNU sections 65-Cellular Biology (07165178138), 67-Population Biology and Ecology (07167178138) and 68-Organism Biology (07168178138).
**2006** : Habilitation to supervise research defended on April 12, 2006 at INSA Lyon. Analysis of the transcriptome of *Buchnera aphidicola*, the symbiotic bacterium of the aphid *Acyrthosiphon pisum*.
**Since October 1, 1998**: Senior Lecturer. Laboratory of Functional Biology of Insects and Interactions (Director, Y. Rahbé), Tenure on 01/09/99.
**1998** : Post-Doctoral internship from April to September. UMR CNRS 5558, University Claude Bernard Lyon 1 (M. Gouy's team). Subject : Methodology of phylogenetic reconstruction in intracellular symbioses (with high A+T rate and high evolutionary speed).
**1997** : Post-Doctoral internship from October 97 to March 98. Zoological Institute, University of Tokyo, (team of Pr. H. Ishikawa). Subject : Physical map of the genome of *Buchnera aphidicola*.
**1997** : PhD thesis (Laboratory of Applied Biology INSA 406). Congratulations of the Jury - Malotau de Guerne Prize 1997. Instructor at the University Claude Bernard Lyon 1 (Biomathematics).
**1994** : DEA : "Analysis and Modeling of Biological Systems". Mention Very Good.
**1993** : Professor of Biology at the Lycée militaire of Autun.
**1992** : INSA of Lyon, department of Biochemistry. Diploma of biochemical engineer.
**1989** : First cycle INSA in Sport-Etudes section (Handball).
Publications
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Study of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Conference papers
hal-04524543v1
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Let’s look up! Marcher sur les fils du vivantAtelier de la journée de l’évolution de la formation de l'INSA Lyon, INSA Lyon, Mar 2023, Villeurbane, France
Conference papers
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A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdbBAPOA 2023 - 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Nov 2023, Villeurbanne, France
Conference papers
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Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling3e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Conference papers
hal-04524579v1
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Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les puceronsJournée de l'Enjeu Santé Globale et Bioingénierie de l'INSA, Apr 2023, Villeurbane, France
Conference papers
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Let's look up : enseigner les enjeux du vivant en école d'ingénieurEnseignements Technologiques de niveau Licence Ouverts pour une industrie du futur compétitive et Soutenable (ET-LIOS), Jun 2022, Lyon, France
Conference papers
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LET'S LOOK UP ! Les enjeux du vivant pour l'ingénieur citoyenJournée de l'évolution de la formation, Mar 2022, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Conference papers
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Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Conference papers
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaciDECRYPthèse E2M2 Edition 20, May 2021, Villeurbanne, France
Conference papers
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)G-RREMI 2021 - Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Conference papers
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Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarumGDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France
Conference papers
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Analysis of the Inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsWebinaires BAPOA 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Conference papers
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Role of symbionts in insects' ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae).DECRYPthèse E2M2, May 2021, Villeurbanne, France
Conference papers
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Conference papers
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les défis de l’agriculture de demainFête de la sciences 2020, Oct 2020, Villeurbanne, France
Conference papers
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Quelques questions de société vues par la scienceAtelier scolaire de la Fête de la science 2020, Nov 2020, Villeurbanne, France
Conference papers
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The challenge of annotating and reconstructing metabolic networks for the comprehension of the physiology of aphids and other insects2. Annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Nov 2019, Le Rheu, France
Conference papers
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphidsUK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Conference papers
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
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AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumInternational Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Conference papers
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Conference papers
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Atelier Bases de données génomiques et métaboliques : présentation des bases BioCyc développées dans l’UMR BF2I11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA),, Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Conference papers
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Conference papers
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Conference papers
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
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Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactionsFirst Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
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Biologie systémique de la symbiose : de la génomique des partenaires à la physiologie des interactionsSéminaire SPE sur la Biologie des Systèmes, Mar 2016, Toulouse, France
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
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Problèmes simples en bioinformatique pour les grands défis de la biologie à haut débitJournée Nationales de l’APMEP « A la lumière des mathématiques »,, Oct 2016, Villeurbanne, France
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Conference papers
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Animateur de la table ronde « Training the next generation ».1. Journée Visalys From data to models - a multi-scale view on living systems, Mar 2016, Lyon, France
Conference papers
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
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Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux.Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France
Conference papers
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Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid developmentUK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France
Conference papers
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Conference papers
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
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SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
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CycADS, BioCyc et MetExplore, une suite d’outils pour la reconstruction, l’exploration et la comparaison de réseaux métaboliques1. Atelier Reconstruction de réseaux métaboliques : du génome à la matrice de stoechiométrie, BioSyL. Villeurbanne, FRA. PRES Université de Lyon., Feb 2014, Villeurbanne, France
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France
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dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methodsCycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy
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Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France
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L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumRéunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France
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Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France
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Organisation, gene expression regulation and DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera, the endosymbiont of aphids1. International Research Workshop Lyon- France / São Paulo - Brazil, Nov 2013, Lyon, France
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Analyse génomique des éléments régulateurs et des propriétés structurales intrinsèques de l'ADN dans le génome réduit de Buchnera5. Réunion Réseau BAPOA, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2012, Villeurbanne, France. 22 diapos
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Key genes for symbiosis and development in an emerging genomic model, the pea aphidSéminaire invité au Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Universita degli studi di Pisa. Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Pisa, ITA., 2012, Pisa, Italy
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Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France
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Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
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The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases. Development of ad hoc BioCyc DB : AcypiCyc, ArthopodaCyc13. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA). Rennes, FRA., Jul 2012, Rennes, France. Pagination multiple
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Metabolic network comparison of bacteria in the context of symbiosisOtto Warburg International Summer School and Research Symposium on Evolutionary Genomics, 2011, Berlin, Germany
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Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphidIPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
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Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
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Absence of a core metabolic network common to symbiotic bacteria6. Meeting GDRE-RA Comparative genomics, Nov 2011, Lyon, France. 33 diapositives
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
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ArthropodaCyc: a BioCyc database powered by CycADS to study and compare the metabolism of arthropods5th Annual Arthropod Genomics Symposium "Arthropod Genomics 2011: Exploring Diversity, Relating Similarity", Jun 2011, Kansas City, United States
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Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesGenoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
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Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
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Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid modelEMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
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Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
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Genes regulated in early embryogenesis during the switch from parthenogenetic to sexual reproduction in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum)4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Kansas State University. Center for Genomic Studies on Arthropods Affecting Human, Animal & Plant Health, Manhattan, USA., Jun 2010, Kansas City, United States
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Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiquesJournée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
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Chromosome organization and gene expression regulation in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular bacteria of the pea aphid Acyrthosiphon pisum58. Annual Meeting of the Entomological Society of America, Entomological Society of America (ESA). Annapolis, MD, USA., Dec 2010, San Diego, CA, United States
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Exploring the regulatory network of Buchnera aphidicola: a case-study of genome evolution in a symbiotic contextSéminaire Rhône-Alpin de Modélisation du Vivant, Jun 2010, Villeurbanne, France. n. p
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
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Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotiqueSéance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos
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The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
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Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), Catania, juin 2009, Italy, 2009, Italy
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analysesRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
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Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France
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The power of combining genome annotation and systems level modeling.5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2", Barcelona, Espagne, Juin 2009, Jun 2009, Spain
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
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Fate of transcription units in the reductive evolution of the genome of Buchnera aphidicola6th International Symbiosis Society Congress (6 ISS 2009) Madison, Wisconsin USA, August 9-15 2009, Aug 2009, United States
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
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Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
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Les réseaux métaboliques et génétiquesJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
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TranscriptomiqueJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentielsRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
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SymBioCyc: Metabolic data on endosymbiotic, parasitic and free bacteriaIntegrative Post-Genomics - IPG'07, 2007, Lyon (France), novembre 2007, France. pp.1-1
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Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?"Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
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Le transcriptome de Buchnera aphidicola, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons, est-il dégénéré ou hyperspécialisé ?Séminaires de Biostatistique - Faculté de Médecine Lyon Sud, 2007, Lyon (France), mars 2007, France. pp.1-1
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Comparative analysis of gene expression in the aphid-Buchnera symbiosis: the role of Buchnera in the nutrition of aphid embryosSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2007 (SEB 2007), 2007, Glasgow (UK), avril 2007, France. pp.1-1
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IGOIM, une méthode d'inférence de réseaux génétiques utilisant l'information mutuelleJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite "Analyse statistique du transcriptome", 2007, Marseille (France), juillet 2007, France. pp.1-1
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Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéréXVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1
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Recherche de précurseurs dans un réseau métaboliqueRéseaux d'interaction : analyse, modélisation et simulation (RIAMS), 2007, Villeurbanne (France), novembre 2007, France. pp.1-1
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