
Hubert Charles
Présentation
Etat Civil
Date et lieu de naissance : 3 novembre 1969 à Paris XIème
Situation familiale : marié, 2 enfants
Adresse personnelle :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
Site personnel : La biodiversité derrière ma porte ou retrouvez-moi sur iNaturalist
Adresse professionnelle :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Grades et Titres
2018 : Chevalier dans l’ordre des Palmes académiques (09/01/2018)
2012 : Professeur des Universités. UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Biologie Cellulaire.
2007 : Qualification aux fonctions de Professeur des Universités en sections CNU 65-Biologie Cellulaire (07165178138), 67-Biologie des Populations et écologie (07167178138) et 68-Biologie des organismes (07168178138).
2006 : Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 avril 2006 à l’INSA de Lyon. Analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola, la bactérie symbiotique du puceron Acyrthosiphon pisum.
Depuis le 1er octobre 1998 : Maître de Conférences. Laboratoire de Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions (Directeur, Y. Rahbé), Titularisation le 01/09/99.
1998 : Stage Post-Doctoral d’avril à septembre. UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard Lyon 1 (équipe de M. Gouy). Sujet : Méthodologie de reconstruction phylogénétique dans les symbioses intracellulaires (à fort taux de A+T et forte vitesse évolutive).
1997 : Stage Post-Doctoral d’octobre 97 à mars 98. Zoological Institute, Université de Tokyo, (équipe du Pr. H. Ishikawa). Sujet : Carte physique du génome de Buchnera aphidicola.
1997 : Thèse de Doctorat (Laboratoire de Biologie Appliquée INSA 406). Félicitations du Jury – Prix Malotau de Guerne 1997. Moniteur à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (Biomathématiques).
1994 : DEA : «Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques». Mention Très Bien.
1993 : Professeur du Contingent en Biologie au Lycée militaire d’Autun.
1992 : INSA de Lyon, département de Biochimie. Diplôme d'ingénieur biochimiste.
1989 : Premier cycle INSA en section Sport-Etudes (Handball).
Publications
Publications
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Evolution towards a two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosisInternational congress of Ecology and Evolution (SFE2), Société Française d'Ecologie et d'Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04753005
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Les enjeux du vivant pour l’ingénieur citoyenConférence invité pour l’association des ALUMNI de l’INSA-Lyon, Oct 2024, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04790863
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Les enjeux du vivant pour l’ingénieur citoyen.Conférence plénière de l’assemblée pour la transition écologique et Sociale de l’INSA, INSA-Lyon, Jun 2024, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04789608
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Les enjeux du vivant pour l’ingénieur citoyenAtelier pour la Fondation INSA, Mar 2024, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04790846
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Les Enjeux du vivant dans l’enseignement supérieurTable ronde à la conférence des directeurs des grandes écoles (CEDEFI), Jun 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04790854
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Functional analysis of interactions between bed bugs and their symbionts Wolbachia and BEV-likeInternational congress of Ecology and Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04805333
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Two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis3rd Joint Congress on Evolutionary Biology, Jul 2024, Montreal, Canada
Communication dans un congrès
hal-04753845
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Parle-moi de ton microbiote et je te dirai qui tu esConférence du festival Arts, Sciences et Sociétés (FASSIL) de l’INSA-Lyon, Dec 2024, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04791035
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Let’s look up! Les enjeux du vivant pour l’ingénieur / chercheur citoyen.Formation des enseignants de l’ESME par l’association Campus de la Transition., Mar 2024, Ivry sur Seine, France
Communication dans un congrès
hal-04790832
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Parle-moi de ton microbiote et je te dirai qui tu esConférence de la journée anniversaire des 65 ans du département Biosciences (Biosday)., Oct 2024, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04790999
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Let’s look up! Marcher sur les fils du vivantAtelier de la journée de l’évolution de la formation de l'INSA Lyon, INSA Lyon, Mar 2023, Villeurbane, France
Communication dans un congrès
hal-04524499
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A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdb13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04524595
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Study of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04524543
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Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04524579
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Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les puceronsJournée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbane, France
Communication dans un congrès
hal-04121080
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Let's look up : enseigner les enjeux du vivant en école d'ingénieurEnseignements Technologiques de niveau Licence Ouverts pour une industrie du futur compétitive et Soutenable (ET-LIOS), Jun 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03689719
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Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03741301
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LET'S LOOK UP ! Les enjeux du vivant pour l'ingénieur citoyenJournée de l'évolution de la formation, Mar 2022, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
hal-03617081
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The assembly of the rice weevil Sitophilus oryzae is dominated by transposable elements and shades light on the evolution of endosymbiosis in a major crop pest.Arthropod Genomics Symposium 2022, Jun 2022, Notre Dame (Indiana), United States
Communication dans un congrès
hal-04783673
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaciDECRYPthèse E2M2 Edition 20, May 2021, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514227
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)Webinaires du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
hal-03514239
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The Inhibitor of APoptosis (IAP) gene family in aphids: between expansion and functional diversificationWebinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
hal-03514209
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Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarumGDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03810311
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03514196
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les défis de l’agriculture de demainFête de la sciences 2020, Oct 2020, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03513103
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Quelques questions de société vues par la scienceAtelier scolaire de la Fête de la science 2020, Nov 2020, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03513111
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Quelques questions de sociétéFête de la science, Oct 2020, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04790808
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The challenge of annotating and reconstructing metabolic networks for the comprehension of the physiology of aphids and other insects2nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Nov 2019, Le Rheu, France
Communication dans un congrès
hal-03513078
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumINSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
hal-03514034
v1
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-03509938
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Atelier Bases de données génomiques et métaboliques : présentation des bases BioCyc développées dans l’UMR BF2I11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA),, Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03510598
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AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03510642
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03514026
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514078
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514051
v1
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03510629
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès
hal-03506807
v1
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506796
v1
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-03506790
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506794
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Animateur de la table ronde « Training the next generation ».1. Journée Visalys From data to models - a multi-scale view on living systems, Mar 2016, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506797
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Problèmes simples en bioinformatique pour les grands défis de la biologie à haut débitJournée Nationales de l’APMEP « A la lumière des mathématiques »,, Oct 2016, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03506792
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Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactionsFirst Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03506791
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Biologie systémique de la symbiose : de la génomique des partenaires à la physiologie des interactionsSéminaire SPE sur la Biologie des Systèmes, Mar 2016, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-03506781
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Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid developmentUK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-03506775
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Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux.Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-02801005
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208786
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CycADS, BioCyc et MetExplore, une suite d’outils pour la reconstruction, l’exploration et la comparaison de réseaux métaboliques1. Atelier Reconstruction de réseaux métaboliques : du génome à la matrice de stoechiométrie, BioSyL. Villeurbanne, FRA. PRES Université de Lyon., Feb 2014, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-02792176
v1
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-03513906
v1
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02795335
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SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208785
v1
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Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-03506758
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L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumRéunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506724
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Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506751
v1
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dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methodsCycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03506764
v1
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Organisation, gene expression regulation and DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera, the endosymbiont of aphids1. International Research Workshop Lyon- France / São Paulo - Brazil, Nov 2013, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506769
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The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases. Development of ad hoc BioCyc DB : AcypiCyc, ArthopodaCyc13. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA). Rennes, FRA., Jul 2012, Rennes, France. Pagination multiple
Communication dans un congrès
hal-02747415
v1
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Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506379
v1
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Key genes for symbiosis and development in an emerging genomic model, the pea aphidSéminaire invité au Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Universita degli studi di Pisa. Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Pisa, ITA., 2012, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-02804850
v1
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Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
Communication dans un congrès
hal-03506701
v1
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Analyse génomique des éléments régulateurs et des propriétés structurales intrinsèques de l'ADN dans le génome réduit de Buchnera5. Réunion Réseau BAPOA, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2012, Villeurbanne, France. 22 diapos
Communication dans un congrès
hal-02808160
v1
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Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02808863
v1
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-00748785
v1
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Absence of a core metabolic network common to symbiotic bacteria6. Meeting GDRE-RA Comparative genomics, Nov 2011, Lyon, France. 33 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02806316
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Metabolic network comparison of bacteria in the context of symbiosisOtto Warburg International Summer School and Research Symposium on Evolutionary Genomics, 2011, Berlin, Germany
Communication dans un congrès
hal-00748784
v1
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Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiquesJournée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02804281
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ArthropodaCyc: a BioCyc database powered by CycADS to study and compare the metabolism of arthropods5th Annual Arthropod Genomics Symposium "Arthropod Genomics 2011: Exploring Diversity, Relating Similarity", Jun 2011, Kansas City, United States
Communication dans un congrès
hal-00748601
v1
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The power of combining genome annotation and systems level modeling.5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2", Barcelona, Espagne, Juin 2009, Jun 2009, Spain
Communication dans un congrès
hal-00498405
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02818835
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Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02821530
v1
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Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), Catania, juin 2009, Italy, 2009, Italy
Communication dans un congrès
hal-00497625
v1
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Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphidIPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02814211
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Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid modelEMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01231279
v1
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Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
Communication dans un congrès
hal-02755293
v1
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Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesGenoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
Communication dans un congrès
hal-02824684
v1
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès
hal-02823073
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Chromosome organization and gene expression regulation in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular bacteria of the pea aphid Acyrthosiphon pisum58. Annual Meeting of the Entomological Society of America, Entomological Society of America (ESA). Annapolis, MD, USA., Dec 2010, San Diego, CA, United States
Communication dans un congrès
hal-02757719
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Genes regulated in early embryogenesis during the switch from parthenogenetic to sexual reproduction in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum)4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Kansas State University. Center for Genomic Studies on Arthropods Affecting Human, Animal & Plant Health, Manhattan, USA., Jun 2010, Kansas City, United States
Communication dans un congrès
hal-02755037
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Exploring the regulatory network of Buchnera aphidicola: a case-study of genome evolution in a symbiotic contextSéminaire Rhône-Alpin de Modélisation du Vivant, Jun 2010, Villeurbanne, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02814726
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Fate of transcription units in the reductive evolution of the genome of Buchnera aphidicola6th International Symbiosis Society Congress (6 ISS 2009) Madison, Wisconsin USA, August 9-15 2009, Aug 2009, United States
Communication dans un congrès
hal-00497818
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analysesRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
Communication dans un congrès
hal-02815123
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Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France
Communication dans un congrès
hal-00511624
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The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00498411
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391499
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès
hal-02820893
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
Communication dans un congrès
hal-02814342
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391280
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00496032
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Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotiqueSéance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos
Communication dans un congrès
hal-02824438
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos
Communication dans un congrès
hal-02822501
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Les réseaux métaboliques et génétiquesJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391271
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02821711
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02824972
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391519
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Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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TranscriptomiqueJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentielsRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391156
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Comparative analysis of gene expression in the aphid-Buchnera symbiosis: the role of Buchnera in the nutrition of aphid embryosSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2007 (SEB 2007), 2007, Glasgow (UK), avril 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391155
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IGOIM, une méthode d'inférence de réseaux génétiques utilisant l'information mutuelleJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite "Analyse statistique du transcriptome", 2007, Marseille (France), juillet 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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SymBioCyc: Metabolic data on endosymbiotic, parasitic and free bacteriaIntegrative Post-Genomics - IPG'07, 2007, Lyon (France), novembre 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
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Le transcriptome de Buchnera aphidicola, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons, est-il dégénéré ou hyperspécialisé ?Séminaires de Biostatistique - Faculté de Médecine Lyon Sud, 2007, Lyon (France), mars 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391270
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Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391505
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Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéréXVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00373311
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Recherche de précurseurs dans un réseau métaboliqueRéseaux d'interaction : analyse, modélisation et simulation (RIAMS), 2007, Villeurbanne (France), novembre 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391288
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaTheoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France
Communication dans un congrès
hal-00506911
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Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391524
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Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome "dégénéréRencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391278
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Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391262
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Transcriptomic and metabolic analysis of Buchnera aphidicolaFirst meeting GDRE-RA "Comparative genomics", 2006, Lyon (France), novembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391269
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Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006)Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391289
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaWorkshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391525
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Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genomeColloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391267
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Bioinformatics analysis of the nucleoid associated protein FIS in Buchnera aphidicola, the intracellular symbiotic bacteria of aphidsIntegrative Post-Genomics - IPG'06, 2006, Lyon (France), novembre-décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391257
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Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche
Communication dans un congrès
hal-00506826
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Transcriptome analysis of Buchnera aphidicola using ANOVA model in a crossed factorial experimentWorkshop on statistical analysis of postgenomic data - INAPG, 2005, Paris (France), avril 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391268
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Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosisSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233
Communication dans un congrès
hal-00391503
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Genomewide transcriptional changes associated with nutritional alterations affecting phenylalanine and tyrosine metabolism in Buchnera aphidicolaJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391274
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SITRANS: a web information system for microarray experimentsXIX International Congress of the European Federation for Medical Informatics, 2005, Genève (Suisse), août-septembre 2005, France. pp.33-38
Communication dans un congrès
hal-00391450
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Analyse transcriptomique de la réponse de Buchnera aphidicola à un stress métabolique subi par son hôte le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumJournées Reseau Ecologie et Interactions Durables (REID), 2005, Lyon (France), janvier 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391260
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Transcriptional responses of Buchnera aphidicola to combined amino acid and osmotic stress in the diet of its symbiotic partner, Acyrthosiphon pisumCOST853: Agricultural Biomarkers for Array-Technology - Combined WG4 & WG5 meetings "Chip production and analysis, and environmental monitoring", 2005, Lyon (France), novembre 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391276
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Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genomeIntegrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391266
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Global transcriptional responses of Buchnera aphidicola to aromatic amino acid limitation in the diet of its symbiotic partner, the phloem sap feeding insect Acyrthosiphon pisumSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S226
Communication dans un congrès
hal-00391261
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Gene expression measurements with microarray technology in bacteria: transcriptomic analysis af the symbiotic bacteria, Buchnera aphidicola, in nutritional stress conditions of its aphid host Acyrthosiphon pisumJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite Vicanne, 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391272
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Influence of probe sequence and strand lenght on the morphology and structuration of DNA chipNano 8 : 8. International Conference of nanometer scale science and technology, Jul 2004, Venise, Italy
Communication dans un congrès
hal-03506638
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Analyse statistique des données d'expression : utilisation des librairies bioconductor pour l'analyse des données de puces à ADNFormation CNRS : Puces à ADN, Dec 2004, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506628
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Buchnera aphidicola, bactérie endosymbiotique des pucerons : génomes et physiologie symbiotique4. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506623
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Choix des séquences sondes à déposer sur les pucesFormation CNRS : Puces à ADN, Jun 2003, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506603
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La symbiose bactérienne intracellulaire chez les insectes Dryophthoridés : aspects moléculaires et évolutifsRencontres 2003 des Microbiologistes de l'INRA, May 2003, Dourdan, France
Communication dans un congrès
hal-03506591
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Analyse du transcriptome de Buchnera, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons : une approche méthodologique14. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506495
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Origine des bactéries symbiotiques intracellulaires des Dryophtoridae : analyse phylogénétique basée sur un modèle d'évolution de l'ADN non homogène5. Conférence Internationale Francophone d'Entomologie., Jul 2002, Montréal, Canada
Communication dans un congrès
hal-03506478
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Origine des bactéries symbiotiques intracellulaires des Dryophtoridae : analyse phylogénétique basée sur un modèle d'évolution de l'ADN non homogèneALPHY 2002, Apr 2002, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-03506481
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ROSO: A software to search optimized oligonucleotide probes for microarraysCOST853: Agricultural Biomarkers for Array-Technology, Sep 2002, Waedenswill, Switzerland
Communication dans un congrès
hal-03506465
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Impact of endosymbiosis on the Dryophthoridae insect diversity7. European Congress of Entomology, Oct 2002, Thessaloniki, Greece
Communication dans un congrès
hal-03506469
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Présentation des données biologiques à l'attention des non biologistesJournées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03506444
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Caractérisation et phylogénie des bactéries symbiotiques intracellulaires des charançons de la famille des DryophthoridaeRéseau "Biodiversité et Ecologie Microbienne" : adaptation, variabilité, diversité, Sep 2001, Aussois, France
Communication dans un congrès
hal-03506432
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Caractérisation et phylogénie des bactéries symbiotiques intracellulaires des charançons de la famille des RhynchophoridaeJournées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'01, Apr 2001, villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03506427
v1
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Insects and intracellular bacterial associations: impact on insect development and evolution9. International Congress on Invertebrate Reproduction and Developement, Jul 2001, Grahamstown, South Africa
Communication dans un congrès
hal-03506440
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Coexistence de deux bactéries symbiotiques intracellulaires dans les charançons du genre Sitophilus : aspects physiologiques et évolutifsFonctions de la Biodiversité Microbienne : comprendre pour gérer, May 2000, Aussois, France
Communication dans un congrès
hal-03506410
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Biodiversité des Wolbachia et des effets que ces bactéries induisent chez leurs hôtesFonctions de la Biodiversité Microbienne : comprendre pour gérer, May 2000, Aussois, France
Communication dans un congrès
hal-03506407
v1
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Les bactéries intracellulaires des insectes : Phylogénie et évolution moléculaireRencontre des Microbiologistes de l'INRA, Apr 1999, Dourdan, France
Communication dans un congrès
hal-03506398
v1
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Comparative and phylogenetic aspects of two insect endocytobioses : aphids and weevilsCOST meeting : Bacterial symbionts on survival of entomopathogenic nematodes, Apr 1998, Wellesbourne, United States
Communication dans un congrès
hal-03506400
v1
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Un modèle de symbiose : Le charançon Sitophilus oryzae, implications évolutivesColloque, Jan 1996, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02770802
v1
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Density control of the principal endosymbiote of the weevil Sitophilus oryzae2. International Congress on Symbiosis, Apr 1997, Boston, United States
Communication dans un congrès
hal-03506396
v1
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A chaperonin-like in the principal endocytobiotes of the weevil Sitophilus6. International colloquium, Sep 1995, Tübingen, Germany
Communication dans un congrès
hal-02769149
v1
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Analysis of specific proteins of symbiosis in the weevil Sitophilus20.International Congress of Entomology, Aug 1996, Firenze, Italy
Communication dans un congrès
hal-03506388
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Modélisation : complexifier ou simplifier ?Modélisation : succès et limites, publication des actes du colloques de l’académie des technologies du 6/12/2016, CNRS, pp.81-88, 2016
Chapitre d'ouvrage
hal-03506007
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Définition des séquences sonde pour la PCR et pour les puces à ADNBioinformatique : Principes d’utilisation des outils, Editions Quae, 272 p., 2010, Savoir Faire (Quae), 978-2-7592-0870-8 978-2-7592-0870-8
Chapitre d'ouvrage
hal-02813659
v1
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Les données d’expressionInformatique pour l’analyse du transcriptome, Hermes Science Publications, pp.45-65, 2004, 2-7462-0850-4
Chapitre d'ouvrage
hal-03506005
v1
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Morphological aspects of symbiosisJoseph Seckbach. Cellular Origin and Life in Extreme Habitats, 4, Kluwer Academic Publishers, pp.13-44, 2002, Symbiosis, Mechanisms and Model Systems, ISBN: 978-94-017-3958-0
Chapitre d'ouvrage
hal-03506001
v1
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Comparative and phylogenetic aspects of two insect endosymbioses : aphids and weevilsCost 819. Entomopathogenic nematodes. Taxonomy, phylogeny and gnotobiological studies of entomopathogenic nematode bacterium complexes, 1999
Chapitre d'ouvrage
hal-02839808
v1
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Intracellular symbiotic bacteria within insectsEnigmatic Microorganisms and Life in Extreme Environments, Springer, pp.651-660, 1999, 978-0-7923-5492-5
Chapitre d'ouvrage
hal-03505998
v1
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Un modèle de symbiose : le charançon Sitophilus oryzae, implications evolutivesJean-Marie EXBRAYAT, Janine FLATIN. L'évolution Philosophique. Science, Histoire ou Philosophie, Librairie Philosophique, pp.297-305, 1997, 2-7116-8302-8
Chapitre d'ouvrage
hal-03505994
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A chaperonin-like in the principal endocytobiotes of the weevil Sitophilus.Hainfried E.A. Schenk Reinhold G. Herrmann Kwang W. Jeon Norbert E. Müller Werner Schwemmler. Eukaryotism and Symbiosis : intertaxonic combination versus symbiotic adaptation, Springer, pp.395-402, 1997, 978-3-540-63375-4
Chapitre d'ouvrage
hal-03505990
v1
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Aspects moléculaires de la bactérie symbiotique principale du charançon des céréales Sitophilus oryzae (Coléoptère, Curculionidae) et études de ses interactions avec l'hôte.Sciences du Vivant [q-bio]. INSA de Lyon, 1997. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-00482251
v1
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Analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola, la bactérie symbiotique du puceron Acyrthosiphon pisumSciences du Vivant [q-bio]. INSA de Lyon, 2006
HDR
tel-00482270
v1
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