Hubert Charles
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Documents
Identifiants chercheurs
- hubert-charles
- ResearcherId : B-9392-2011
- 0000-0002-0809-4705
- ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-9392-2011
Présentation
Etat Civil
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*Date et lieu de naissance* : 3 novembre 1969 à Paris XIème
*Situation familiale* : marié, 2 enfants
*Adresse personnelle* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Site personnel** : [La biodiversité derrière ma porte ](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) ou retrouvez-moi sur [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Adresse professionnelle* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Grades et Titres
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> **2018 :** Chevalier dans l’ordre des Palmes académiques (09/01/2018)
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> **2012 :** Professeur des Universités. UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Biologie Cellulaire.
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> **2007** : Qualification aux fonctions de Professeur des Universités en sections CNU 65-Biologie Cellulaire (07165178138), 67-Biologie des Populations et écologie (07167178138) et 68-Biologie des organismes (07168178138).
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> **2006** : Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 avril 2006 à l’INSA de Lyon. Analyse du transcriptome de *Buchnera aphidicola*, la bactérie symbiotique du puceron *Acyrthosiphon pisum*.
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> **Depuis le** **1er octobre 1998 :** Maître de Conférences. Laboratoire de Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions (Directeur, Y. Rahbé), Titularisation le 01/09/99.
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> **1998** : Stage Post-Doctoral d’avril à septembre. UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard Lyon 1 (équipe de M. Gouy). *Sujet* : Méthodologie de reconstruction phylogénétique dans les symbioses intracellulaires (à fort taux de A+T et forte vitesse évolutive).
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> **1997** : Stage Post-Doctoral d’octobre 97 à mars 98. Zoological Institute, Université de Tokyo, (équipe du Pr. H. Ishikawa). *Sujet* : Carte physique du génome de *Buchnera aphidicola*.
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> **1997** : Thèse de Doctorat (Laboratoire de Biologie Appliquée INSA 406). Félicitations du Jury – Prix Malotau de Guerne 1997. Moniteur à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (Biomathématiques).
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> **1994** : DEA : «Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques». Mention Très Bien.
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> **1993** : Professeur du Contingent en Biologie au Lycée militaire d’Autun.
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> **1992** : INSA de Lyon, département de Biochimie. Diplôme d'ingénieur biochimiste.
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> **1989** : Premier cycle INSA en section Sport-Etudes (Handball).
Civil status
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*Date and place of birth* : November 3, 1969 in Paris XIth
*Family status* : married, 2 children
*Personal address* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Personnal website** : [La biodiversité derrière ma porte](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) or find me at [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Professional address* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Degrees and titles
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**2018** : Knight in the order of the Academic Palms (09/01/2018)
**2012** : Professor UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Cellular Biology.
**2007** : Qualification as University Professor in CNU sections 65-Cellular Biology (07165178138), 67-Population Biology and Ecology (07167178138) and 68-Organism Biology (07168178138).
**2006** : Habilitation to supervise research defended on April 12, 2006 at INSA Lyon. Analysis of the transcriptome of *Buchnera aphidicola*, the symbiotic bacterium of the aphid *Acyrthosiphon pisum*.
**Since October 1, 1998**: Senior Lecturer. Laboratory of Functional Biology of Insects and Interactions (Director, Y. Rahbé), Tenure on 01/09/99.
**1998** : Post-Doctoral internship from April to September. UMR CNRS 5558, University Claude Bernard Lyon 1 (M. Gouy's team). Subject : Methodology of phylogenetic reconstruction in intracellular symbioses (with high A+T rate and high evolutionary speed).
**1997** : Post-Doctoral internship from October 97 to March 98. Zoological Institute, University of Tokyo, (team of Pr. H. Ishikawa). Subject : Physical map of the genome of *Buchnera aphidicola*.
**1997** : PhD thesis (Laboratory of Applied Biology INSA 406). Congratulations of the Jury - Malotau de Guerne Prize 1997. Instructor at the University Claude Bernard Lyon 1 (Biomathematics).
**1994** : DEA : "Analysis and Modeling of Biological Systems". Mention Very Good.
**1993** : Professor of Biology at the Lycée militaire of Autun.
**1992** : INSA of Lyon, department of Biochemistry. Diploma of biochemical engineer.
**1989** : First cycle INSA in Sport-Etudes section (Handball).
Publications
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Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02808863v1
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Metabolic network comparison of bacteria in the context of symbiosisOtto Warburg International Summer School and Research Symposium on Evolutionary Genomics, 2011, Berlin, Germany
Communication dans un congrès
hal-00748784v1
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Absence of a core metabolic network common to symbiotic bacteria6. Meeting GDRE-RA Comparative genomics, Nov 2011, Lyon, France. 33 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02806316v1
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The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00498411v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
Communication dans un congrès
hal-02814342v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391280v1
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Communication dans un congrès
hal-00496032v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès
hal-02814863v1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analysesRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
Communication dans un congrès
hal-02815123v1
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Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391279v1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391519v1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391273v1
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentielsRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391259v1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02824972v1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
Communication dans un congrès
hal-02821711v1
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Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?"Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391505v1
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SymBioCyc: Metabolic data on endosymbiotic, parasitic and free bacteriaIntegrative Post-Genomics - IPG'07, 2007, Lyon (France), novembre 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391290v1
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Recherche de précurseurs dans un réseau métaboliqueRéseaux d'interaction : analyse, modélisation et simulation (RIAMS), 2007, Villeurbanne (France), novembre 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391288v1
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Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006)Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès
hal-00391289v1
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MetExplore: a web server to link metabolomic experiments and genome-scale metabolic networksJOBIM 2010, Sep 2010, Montpellier, France. , 1 p., 2010, JOBIM 2010 Montpellier, Journée Ouvertes Biologie Informatique Mathématique, Montpellier, France, 7 - 9 septembre 2010
Poster de conférence
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Annotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown, juillet 2008, United States. 2008
Poster de conférence
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