Hubert Charles
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Documents
Identifiants chercheurs
- hubert-charles
- ResearcherId : B-9392-2011
- 0000-0002-0809-4705
- ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/B-9392-2011
Présentation
Etat Civil
==========
*Date et lieu de naissance* : 3 novembre 1969 à Paris XIème
*Situation familiale* : marié, 2 enfants
*Adresse personnelle* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Site personnel** : [La biodiversité derrière ma porte ](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) ou retrouvez-moi sur [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Adresse professionnelle* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Grades et Titres
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> **2018 :** Chevalier dans l’ordre des Palmes académiques (09/01/2018)
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> **2012 :** Professeur des Universités. UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Biologie Cellulaire.
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> **2007** : Qualification aux fonctions de Professeur des Universités en sections CNU 65-Biologie Cellulaire (07165178138), 67-Biologie des Populations et écologie (07167178138) et 68-Biologie des organismes (07168178138).
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> **2006** : Habilitation à Diriger des Recherches soutenue le 12 avril 2006 à l’INSA de Lyon. Analyse du transcriptome de *Buchnera aphidicola*, la bactérie symbiotique du puceron *Acyrthosiphon pisum*.
>
> **Depuis le** **1er octobre 1998 :** Maître de Conférences. Laboratoire de Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions (Directeur, Y. Rahbé), Titularisation le 01/09/99.
>
> **1998** : Stage Post-Doctoral d’avril à septembre. UMR CNRS 5558, Université Claude Bernard Lyon 1 (équipe de M. Gouy). *Sujet* : Méthodologie de reconstruction phylogénétique dans les symbioses intracellulaires (à fort taux de A+T et forte vitesse évolutive).
>
> **1997** : Stage Post-Doctoral d’octobre 97 à mars 98. Zoological Institute, Université de Tokyo, (équipe du Pr. H. Ishikawa). *Sujet* : Carte physique du génome de *Buchnera aphidicola*.
>
> **1997** : Thèse de Doctorat (Laboratoire de Biologie Appliquée INSA 406). Félicitations du Jury – Prix Malotau de Guerne 1997. Moniteur à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (Biomathématiques).
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> **1994** : DEA : «Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques». Mention Très Bien.
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> **1993** : Professeur du Contingent en Biologie au Lycée militaire d’Autun.
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> **1992** : INSA de Lyon, département de Biochimie. Diplôme d'ingénieur biochimiste.
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> **1989** : Premier cycle INSA en section Sport-Etudes (Handball).
Civil status
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*Date and place of birth* : November 3, 1969 in Paris XIth
*Family status* : married, 2 children
*Personal address* :
38, rue Guillaume Apollinaire
69330 Meyzieu
Tel: 06 31 06 75 04
**Personnal website** : [La biodiversité derrière ma porte](http://biodiversite-derriere-ma-porte.fr) or find me at [iNaturalist](https://www.inaturalist.org/lifelists/hub69330?view=tree&details_view=observations&tree_mode=full_taxonomy)
*Professional address* :
Laboratoire de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I), UMR INRA/INSA de Lyon 203, INSA Bât Louis Pasteur, 69 621 Villeurbanne.
Tel : 04-72-43-80-74, Email : hubert.charles@insa-lyon.fr
Degrees and titles
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**2018** : Knight in the order of the Academic Palms (09/01/2018)
**2012** : Professor UMR BF2I, INRA, INSA-Lyon 203. Section CNU 65-Cellular Biology.
**2007** : Qualification as University Professor in CNU sections 65-Cellular Biology (07165178138), 67-Population Biology and Ecology (07167178138) and 68-Organism Biology (07168178138).
**2006** : Habilitation to supervise research defended on April 12, 2006 at INSA Lyon. Analysis of the transcriptome of *Buchnera aphidicola*, the symbiotic bacterium of the aphid *Acyrthosiphon pisum*.
**Since October 1, 1998**: Senior Lecturer. Laboratory of Functional Biology of Insects and Interactions (Director, Y. Rahbé), Tenure on 01/09/99.
**1998** : Post-Doctoral internship from April to September. UMR CNRS 5558, University Claude Bernard Lyon 1 (M. Gouy's team). Subject : Methodology of phylogenetic reconstruction in intracellular symbioses (with high A+T rate and high evolutionary speed).
**1997** : Post-Doctoral internship from October 97 to March 98. Zoological Institute, University of Tokyo, (team of Pr. H. Ishikawa). Subject : Physical map of the genome of *Buchnera aphidicola*.
**1997** : PhD thesis (Laboratory of Applied Biology INSA 406). Congratulations of the Jury - Malotau de Guerne Prize 1997. Instructor at the University Claude Bernard Lyon 1 (Biomathematics).
**1994** : DEA : "Analysis and Modeling of Biological Systems". Mention Very Good.
**1993** : Professor of Biology at the Lycée militaire of Autun.
**1992** : INSA of Lyon, department of Biochemistry. Diploma of biochemical engineer.
**1989** : First cycle INSA in Sport-Etudes section (Handball).
Publications
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A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdbBAPOA 2023 - 13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling3e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les puceronsJournée de l'Enjeu Santé Globale et Bioingénierie de l'INSA, Apr 2023, Villeurbane, France
Communication dans un congrès
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
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Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarumGDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès
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The challenge of annotating and reconstructing metabolic networks for the comprehension of the physiology of aphids and other insects2. Annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Nov 2019, Le Rheu, France
Communication dans un congrès
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumInternational Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
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Atelier Bases de données génomiques et métaboliques : présentation des bases BioCyc développées dans l’UMR BF2I11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA),, Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
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AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
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Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactionsFirst Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès
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SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
Communication dans un congrès
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Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France
Communication dans un congrès
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Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France
Communication dans un congrès
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The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases. Development of ad hoc BioCyc DB : AcypiCyc, ArthopodaCyc13. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (INRIA). Rennes, FRA., Jul 2012, Rennes, France. Pagination multiple
Communication dans un congrès
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
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ArthropodaCyc: a BioCyc database powered by CycADS to study and compare the metabolism of arthropods5th Annual Arthropod Genomics Symposium "Arthropod Genomics 2011: Exploring Diversity, Relating Similarity", Jun 2011, Kansas City, United States
Communication dans un congrès
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Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiquesJournée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
Communication dans un congrès
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Communication dans un congrès
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