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Jérémy Tournayre

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Documents

Présentation

Publications

MicroAnnot: A Dedicated Workflow for Accurate Microsporidian Genome Annotation

Jérémy Tournayre , Valérie Polonais , Ivan Wawrzyniak , Reginald Florian Akossi , Nicolas Parisot
International Journal of Molecular Sciences, 2024, 25 (2), pp.880. ⟨10.3390/ijms25020880⟩
Article dans une revue hal-04427987v1

Bovine extracellular matrix proteins and potential role in meat quality: First in silico Bos taurus compendium

Anne Listrat , Céline Boby , Jérémy Tournayre , Céline Jousse
Journal of Proteomics, 2023, 279, pp.104891. ⟨10.1016/j.jprot.2023.104891⟩
Article dans une revue hal-04092775v1
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Dataset on transcriptome signature of skeletal muscle of young, adult and aged mice

Anne Listrat , Kheng Lim Goh , Céline Jousse , Jérémy Tounayre , Huijuan Wang
Data in Brief, 2022, 43, pp.108321. ⟨10.1016/j.dib.2022.108321⟩
Article dans une revue hal-03691461v1
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The Plasma Oxylipin Signature Provides a Deep Phenotyping of Metabolic Syndrome Complementary to the Clinical Criteria

Céline Dalle , Jérémy Tournayre , Malwina Mainka , Alicja Basiak-Rasała , Mélanie Pétéra
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (19), pp.11688. ⟨10.3390/ijms231911688⟩
Article dans une revue hal-03839966v1
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Transcriptome profiling reveals stress-responsive gene networks in cattle muscles

Isabelle Cassar-Malek , Lise Pomiès , Anne de La Foye , Jérémy Tournayre , Céline Boby
PeerJ, 2022, 10, pp.e13150. ⟨10.7717/peerj.13150⟩
Article dans une revue hal-03632213v1
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When idiopathic male infertility is rooted in maternal malnutrition during the perinatal period in mice

Yuki Muranishi , Laurent Parry , Mélanie Vachette-Dit-Martin , Fabrice Saez , Cécile Coudy-Gandilhon
Biology of Reproduction, 2022, 106 (3), pp.463-476. ⟨10.1093/biolre/ioab222⟩
Article dans une revue hal-03474813v1
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"Do my qPCR calculation", a web tool

Jérémy Tournayre , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Laurent Parry , Pierre Fafournoux , Céline Jousse
Bioinformation, 2019, 15 (5), pp.369-372. ⟨10.6026/97320630015369⟩
Article dans une revue hal-02172518v1

Integrated data mining of transcriptomic and proteomic datasets to predict the secretome of adipose tissue and muscle in ruminants

Muriel Bonnet , Jérémy Tournayre , Isabelle Cassar-Malek
Molecular BioSystems, 2016, 12 (9), pp.2722-2734. ⟨10.1039/c6mb00224b⟩
Article dans une revue hal-02638660v1
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ProteINSIDE to easily investigate proteomics data from ruminants: Application to mine proteome of adipose and muscle tissues in bovine foetuses

Nicolas Kaspric , Brigitte B. Picard , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
PLoS ONE, 2015, 10 (5), pp.e0128086. ⟨10.1371/journal.pone.0128086⟩
Article dans une revue hal-02635637v1
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Protein function easily investigated by genomics data mining using the proteINSIDE online tool

Nicolas Kaspric , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
Genomics and Computational Biology, 2015, 1 (1), pp.e16. ⟨10.18547/gcb.2015.vol1.iss1.e16⟩
Article dans une revue hal-02631468v1

Metavir 2: new tools for viral metagenome comparison and assembled virome analysis.

Simon Roux , Jérémy Tournayre , Antoine Mahul , Didier Debroas , François Enault
BMC Bioinformatics, 2014, 15, pp.76. ⟨10.1186/1471-2105-15-76⟩
Article dans une revue hal-01017832v1

State of the art in understanding interorgan crosstalk and physiology in farm animals

Isabelle Cassar-Malek , Isabelle Louveau , Céline Boby , Jérémy Tournayre , Florence Gondret
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.484
Communication dans un congrès hal-04196318v1
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Update of ProteINSIDE: an online tool for proteome data mining

Jérémy Tournayre , Céline Boby , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Muriel Bonnet
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Communication dans un congrès hal-03283757v1

Investigating the effect of divergent residual feed intake phenotypes on the bovine rumen microbiota across contrasting diet in fattening bulls

Jérémy Tournayre , Pablo Guarnido , Dominique Graviou , Faure Pascal , Gonzalo Cantalapiedra-Hijar
12. International Symposium on Gut Microbiology, INRAE ; Rowett Institute UK, Oct 2021, En ligne, France
Communication dans un congrès hal-03395905v1
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Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types

Manon Connault , Jérémy Tournayre , Céline Boby , Muriel Bonnet , Nadia Goué
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Communication dans un congrès hal-03332116v1

Identification de marques épigénétiques marqueurs de prédisposition aux maladies métaboliques

Jérémy Tournayre
22. Journée de l’Ecole Doctorale Sciences de la vie, Santé, Agronomie & Environnement JED 2019, May 2019, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02161575v1
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Identification de marques épigénétiques marqueurs de prédisposition aux maladies métaboliques

Jérémy Tournayre , Laurent Parry , Anne-Catherine Maurin , Julien Averous , Alain Bruhat
JOBIM 2018 Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-01930383v1

Intégration de données "omics" provenant du tissu adipeux ou musculaire

Jérémy Tournayre , Isabelle Cassar-Malek , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Nicolas Kaspric
Journée AuDACES : Auvergne Développements et Calcul en Environnement Scientifique, May 2016, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02801646v1
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Proteome data mining using ProteINSIDE online tool

Nicolas Kaspric , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02740479v1
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Fat&MuscleDB: A database to understand tissue growth processes contributing to body or muscle composition

Jérémy Tournayre , Isabelle Cassar-Malek , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Nicolas Kaspric
JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02739407v1
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Protein function easily investigated by genomics data mining using the ProteINSIDE web service

Nicolas Kaspric , Brigitte B. Picard , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
2. International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO), Apr 2014, Grenade, Spain
Communication dans un congrès hal-02743910v1
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Exploiting the knowledge about model species and humans to revisit the biology of livestock animals

Isabelle Cassar-Malek , Brigitte B. Picard , Alain Boissy , Christine Leroux , Lenha Mobuchon
Workshop of translational biology in Agriculture and Medecine ‘From Bench to Bed in Medecine and from Pot to Plot in Agriculture', Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (1095)., Oct 2014, Aubière, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02799064v1
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Fat and Muscle DB: integrating ‘omics’ data from adipose tissue and muscle

Jérémy Tournayre , Isabelle Cassar-Malek , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Nicolas Kaspric
5. Management Committee Meeting and the 4. Meeting of Working Groups 1, 2, 3 of COST Action FA 1002, Nov 2014, Milan, Italy. pp.91-94
Communication dans un congrès hal-02739418v1

L’étude des protéomes de ruminants facilitée par l’utilisation du web service ProteINSIDE

Nicolas Kaspric , Brigitte B. Picard , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
Journée AuDACES : Auvergne Développements et Calcul en Environnement Scientifique, Jun 2014, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02800842v1
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Update of ProteINSIDE: an online tool for proteome data mining

Jérémy Tournayre , Céline Boby , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Muriel Bonnet
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Poster de conférence hal-03283142v1
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Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types

Manon Connault, , Jérémy Tournayre , Céline Boby , Muriel Bonnet , Nadia Goue
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Poster de conférence hal-03332138v2
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Proteomics data from ruminants easily investigated using ProteINSIDE

Nicolas Kaspric , Brigitte B. Picard , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Jérémy Tournayre , Muriel Bonnet
5. Management Committee Meeting and the 4. Meeting of Working Groups 1, 2, 3 of COST Action FA 1002, Nov 2014, Milan, Italy. pp.283-287, 2014
Poster de conférence hal-02743404v1
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ProteINSIDE: a web service to computerize an in-depth analysis of functions, sequences, secretions and interactions for proteins

Nicolas Kaspric , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Brigitte B. Picard , Muriel Bonnet , Jérémy Tournayre
11. Meeting on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Comparative Genomics, Oct 2013, Lyon, France. pp.32, 2013, Proceedings of Eleventh Annual Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Satellite Workshop on Comparative Genomics, Lyon, France, 17-19 October 2013
Poster de conférence hal-02746269v1
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Proteotools

Jérémy Tournayre , Matthieu Matthieu.Reichstadt@inrae.Fr Reichstadt , Isabelle Cassar-Malek , Brigitte Picard , Muriel Bonnet
Lifegrid : journée - L’informatique au service des Sciences du Vivant et de la Santé, Dec 2013, Aubière, France. pp.2, 2013
Poster de conférence hal-01196476v1