Jonathan Rouzaud-Cornabas

Maitre de conférence à l'INSA de Lyon, CITI, EPC Inria BioTIC

Documents

Présentation

Jonathan Rouzaud-Cornabas est membre de l'équipe BioTIC d'Inria et du laboratoire CITI. Ses domaines de recherche sont l'évolution expérimentale, la biologie computationnelle, le calcul haute performance et les équations différentielles ordinaires.

Domaines de recherche

Bio-informatique [q-bio.QM] Calcul parallèle, distribué et partagé [cs.DC]

Publications

Mixed precision implicit numerical schemes for systems of ordinary differential equations

Mouhamad Al Sayed Ali , Samuel Bernard , Arsène Marzorati , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Numerical Algorithms, 2025, ⟨10.1007/s11075-025-02256-w⟩

Article dans une revue hal-05385014v1

Genome Streamlining: Effect of Mutation Rate and Population Size on Genome Size Reduction

Juliette Luiselli , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Nicolas Lartillot , Guillaume Beslon

Genome Biology and Evolution, 2024, 16, ⟨10.1093/gbe/evae250⟩

Article dans une revue hal-04905734v1

The complexity ratchet: Stronger than selection, stronger than evolvability, weaker than robustness

Vincent F Liard , David P. Parsons , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Guillaume Beslon

Artificial Life, 2020, 26 (1), pp.38-57. ⟨10.1162/artl_a_00312⟩

Article dans une revue hal-03136077v1

An Information Flow Approach for Preventing Race Conditions: Dynamic Protection of the Linux OS

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Patrice Clemente , Christian Toinard

International Journal On Advances in Software, 2011, 4 (1&2), pp.34-45

Article dans une revue hal-00658000v1

An Information Flow Approach for Preventing Race Conditions: Dynamic Protection of the Linux OS

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Patrice Clemente , Christian Toinard

International Journal On Advances in Software, 2011, 4 (1&2), pp.34-45

Article dans une revue hal-03226326v1

From a Generic Framework for Expressing Integrity Properties to a Dynamic MAC Enforcement for Operating Systems

Patrice Clemente , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard

Transactions on Computational Science, 2010, pp._

Article dans une revue hal-00511130v1

Classification of malicious distributed SELinux activities

Mathieu Blanc , Patrice Clemente , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard

Journal of Computers (JCP), 2009, 4 (5), pp.423-432. ⟨10.4304/jcp.4.5.423-432⟩

Article dans une revue hal-00459817v1

Mixed precision line search and trust region algorithms for solving large systems of ordinary dierential equations

Mouhamad Al-Sayed Ali , S Bernard , Arsene Marzorati , Jonathan Rouzaud-Cornabas

CANUM 2026, Jun 2026, Saint Jacut de la mer, France

Communication dans un congrès hal-05656545v1

Mixed precision numerical methods for solving large systems of ordinary differential equations

Mouhamad Al-Sayed Ali , Arsène Marzorati , Samuel Bernard , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Congrés National d'Analyse Numérique 2024, May 2024, Ile de ré, France

Communication dans un congrès hal-04953553v1

Aevol 4b: Bridging the gap between artificial life and bioinformatics

Hugo Daudey , David P. Parsons , Eric Tannier , Vincent Daubin , Bastien Boussau et al.

ALIFE 2024 - International Conference for Artificial Life, Jul 2024, Copenhague, Denmark. pp.41-49, ⟨10.1162/isal_a_00716⟩

Communication dans un congrès hal-04667220v1

Mixed precision and local error in ordinary differential equations

Arsène Marzorati , Mouhamad Al-Sayed Ali , Samuel Bernard , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Congrés National d'Analyse Numérique 2024, May 2024, Ile de Ré, France

Communication dans un congrès hal-04953537v1

X-Aevol: GPU implementation of an evolutionary experimentation simulator

Laurent Turpin , Thierry Gautier , Jonathan Rouzaud-Cornabas

GECCO 2021 - Genetic and Evolutionary Computation Conference, Jul 2021, Lille France, France. pp.1-9, ⟨10.1145/3449726.3463195⟩

Communication dans un congrès hal-03290799v1

Décrypter le dialogue moléculaire hôte-symbiote pour l’étude systémique des interactions symbiotiques chez les insectes d’intérêt agronomique

Nicolas Parisot , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Journée de l'Enjeu Santé Globale et Bioingénierie de l'INSA Lyon, Nov 2021, Villeurbanne, France

Communication dans un congrès hal-04784485v1

The Complexity Ratchet

Guillaume Beslon , Vincent F Liard , Jonathan Rouzaud-Cornabas

CCS 2021 - International Conference on Complex Systems, Oct 2021, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-03511442v1

P-Aevol: an OpenMP Parallelization of a Biological Evolution Simulator, Through Decomposition in Multiple Loops

Laurent Turpin , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Thierry Gautier , Christian Pérez

16th International Workshop on OpenMP, Sep 2020, Austin, United States. pp.52-66, ⟨10.1007/978-3-030-58144-2_4⟩

Communication dans un congrès hal-02962838v1

How to reduce a genome? ALife as a tool to teach the scientific method to school pupils

Quentin Carde , Marco Foley , Carole Knibbe , David P. Parsons , Jonathan Rouzaud-Cornabas et al.

ALIFE 2019 - Conference on Artificial Life, Jul 2019, Newcastle, United Kingdom. pp.497-504, ⟨10.1162/isal_a_00211⟩

Communication dans un congrès hal-02285718v1

The Complexity Ratchet: Stronger than selection, weaker than robustness

Vincent F Liard , David P. Parsons , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Guillaume Beslon

ALIFE 2018 - the 2018 conference on artificial Life, Jul 2018, Tokyo, Japan. pp.1-8, ⟨10.1162/isal_a_00051⟩

Communication dans un congrès hal-01882628v1

A 4-base model for the Aevol in-silico experimental evolution platform

Vincent Liard , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Nicolas Comte , Guillaume Beslon

European Conference on Artificial Life, Sep 2017, Villeurbanne, France

Communication dans un congrès hal-01569097v1

In Silico Experimental Evolution suggests a complex intertwining of selection, robustness and drift in the evolution of genetic networks complexity

Yoram Vadée-Le-Brun , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Guillaume Beslon

Artificial Life, Jul 2016, Cancun, Mexico

Communication dans un congrès hal-01375645v1

Secured Systems in Clouds with Model-Driven Orchestration

Eddy Caron , Arnaud Lefray , Jonathan Rouzaud-Cornabas

The 2nd IEEE Workshop on Security and Privacy in the Cloud (SPC 2016). In conjunction with the IEEE CNS conference. , IEEE, Oct 2016, Philadelphia, United States

Communication dans un congrès hal-01355681v1

Epigenetic inheritance speeds up evolution of artificial organisms

Yoram Vadée-Le-Brun , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Guillaume Beslon

European Conference on Artificial Life, Jul 2015, York, United Kingdom. ⟨10.7551/978-0-262-33027-5-ch078⟩

Communication dans un congrès hal-01248383v1

Microarchitecture-Aware Virtual Machine Placement under Information Leakage Constraints

Arnaud Lefray , Eddy Caron , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard

8th IEEE International Conference on Cloud Computing (IEEE Cloud 2015), http://www.thecloudcomputing.org/2015/, Jun 2015, New-York, United States. pp.588 - 595 ⟨10.1109/CLOUD.2015.84⟩

Communication dans un congrès hal-01240573v1

Modélisation d'un intergiciel de grille pour le déploiement auto-adaptatif

Eddy Caron , Maurice Djibril Faye , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Ousmane Thiaré

Colloque National sur la Recherche en Informatique et ses Applications (CNRIA2015) 28–31 Octobre 2015 à l’Ecole Polytechnique de Thiès (EPT), Thiès, Sénégal, Association Sénégalaise des Chercheurs en InformatIque (ASCII),, Oct 2015, THIES, Senegal

Communication dans un congrès hal-03973717v1

Enforcing Security and Assurance Properties in Cloud Environment

Aline Bousquet , Jérémy Briffaut , Eddy Caron , Eva María Dominguez , Javier Franco et al.

8th IEEE/ACM International Conference on Utility and Cloud Computing (UCC 2015), University of Cyprus, Dec 2015, Limassol, Cyprus

Communication dans un congrès hal-01240557v1

An Advanced Security-Aware Cloud Architecture

Laurent Bobelin , Aline Bousquet , Jérémy Briffaut , Eddy Caron , Jean-François Couturier et al.

HPCS 2014 - The 2014 International Conference on High Performance Computing & Simulation, Jul 2014, Bologne, Italy

Communication dans un congrès hal-01063852v1

Improving Users' Isolation in IaaS: Virtual Machine Placement with Security Constraints

Eddy Caron , Jonathan Rouzaud-Cornabas

7th IEEE International Conference on Cloud Computing (IEEE Cloud 2014), Jun 2014, Anchorage, United States. pp.8, ⟨10.1109/CLOUD.2014.19⟩

Communication dans un congrès hal-01240592v1

Grid Middleware Modelling for Self-Adaptive Deployment

Eddy Caron , Maurice-Djibril Faye , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Ousmane Thiare

The International Symposium on Autonomous Decentralized System (ISADS 2013), Universidad Panamerica, Mar 2013, Mexico City, Mexico. pp.51-56

Communication dans un congrès hal-00932400v1

Seeding the Cloud: An Innovative Approach to Grow Trust in Cloud Based Infrastructures

Stéphane Betge-Brezetz , Aline Bousquet , Jérémy Briffaut , Eddy Caron , Laurent Clévy et al.

The Future Internet - Future Internet Assembly 2013, 2013, Dublin, Ireland. pp.153-158, ⟨10.1007/978-3-642-38082-2_13⟩

Communication dans un congrès istex hal-00840730v1

Using the EXECO toolbox to perform automatic and reproducible cloud experiments

Matthieu Imbert , Laurent Pouilloux , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Adrien Lebre , Takahiro Hirofuchi

1st International Workshop on UsiNg and building ClOud Testbeds (UNICO, collocated with IEEE CloudCom 2013, Dec 2013, Bristol, United Kingdom. ⟨10.1109/CloudCom.2013.119⟩

Communication dans un congrès hal-00861886v1

HoneyCloud: elastic honeypots - On-attack provisioning of high-interaction honeypots

Patrice Clemente , Jean-François Lalande , Jonathan Rouzaud-Cornabas

SECRYPT 2012, Jul 2012, Rome, Italy. pp.434-439

Communication dans un congrès hal-00721415v1

SPTrack: Visual Analysis of Information Flows within SELinux Policies and Attack Logs

Patrice Clemente , Bangaly Kaba , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Marc Alexandre , Guillaume Aujay

Active Media Technology, Dec 2012, Chengdu, China. pp.596-605, ⟨10.1007/978-3-642-35236-2_60⟩

Communication dans un congrès hal-00766721v1

PIGA-OS : Retour sur le Système d'Exploitation Vainqueur du Défi Sécurité

Jérémy Briffaut , Martin Peres , Christian Toinard , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Benjamin Venelle et al.

RenPar'20 / SympA'14 / CFSE 8, 8ème Conférence Francaise en Systèmes d'Exploitation, RenPar'20 / SympA'14 / CFSE 8, May 2011, Saint-Malo, France

Communication dans un congrès hal-00671591v1

PIGA-Virt: an Advanced Distributed MAC Protection of Virtual Systems

Jérémy Briffaut , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard , Emilie Lefebvre

Euro-Par 2011 Parallel Processing Workshops, Lecture Notes in Computer Science, Aug 2011, Bordeaux, France. pp.8-19

Communication dans un congrès hal-00671592v1

PIGA-OS : retour sur le système d'exploitation vainqueur du défi sécurité

Jérémy Briffaut , Martin Peres , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Jigar Solanki , Christian Toinard et al.

RenPar'20 / SympA'14 / CFSE 8, 8ème Conférence Francaise en Systèmes d'Exploitation, May 2011, Saint-Malo, France

Communication dans un congrès hal-00804275v1

An integrity security property based on information flows : Application to the enforcement of a classical operating system

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Jérémy Briffaut , Christian Toinard , Patrice Clemente

Journée Informatique de la Région Centre 2009, Jan 2010, Blois, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-00459827v1

An Information Flow Approach for Preventing Race Conditions: Dynamic Protection of the Linux OS

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Patrice Clemente , Christian Toinard

SECURWARE'10, Jul 2010, Venise, Italy. pp.11-16

Communication dans un congrès hal-00474156v1

A Distributed and Collaborative Dynamic Load Balancer for Virtual Machine

Jonathan Rouzaud-Cornabas

Euro-Par 2010, Aug 2010, Ischia, Naples, Italy. pp._

Communication dans un congrès hal-00511129v1

A New Approach to Enforce the Security Properties of a Clustered High-Interaction Honeypot

Jérémy Briffaut , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard , Yacine Zemali

Workshop on Security and High Performance Computing Systems, Jun 2009, Leipzig, Germany. pp.184-192, ⟨10.1109/HPCSIM.2009.5194832⟩

Communication dans un congrès hal-00454467v1

SEC&SI: Un défi pour la réalisation d'un système d'exploitation cloisonné et sécurisé pour l'Internaute: Le Projet SPACLik

Jérémy Briffaut , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Christian Toinard

Symposium sur la Sécurité des Technologies de l'Information et de la Communication 2009, Jun 2009, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-00461281v1

Correlation of system events: High performance classification of selinux activities and scenarios

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Patrice Clemente , Christian Toinard

Workshop on Security and High Performance Computing Systems, Jun 2008, Cyprus, Cyprus. pp.171-177

Communication dans un congrès hal-00459822v1

Une architecture de bureaux graphiques distants sécurisée et distribuée

Jonathan Rouzaud-Cornabas

SSTIC 2008, Jun 2008, Rennes, France. pp.328-348

Communication dans un congrès hal-00459825v1

Secured Architecture for Remote Virtual Desktops

Jonathan Rouzaud-Cornabas , Nicolas Viot

Workshop on Collaboration and Security (COLSEC'07), May 2007, Orlando, United States. pp.80-87, ⟨10.1109/CTS.2007.4621741⟩

Communication dans un congrès hal-00147650v1

Towards alife-generated benchmarks for phylogeny

Marco Foley , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Eric Tannier , Guillaume Beslon

ALignements and PHYlogénie (Alphy), Jan 2023, Grenoble, France.

Poster de conférence hal-04398854v1

In silico experimental evolution shows that complexity can rise even in simple environments

Guillaume Beslon , Vincent F Liard , David P. Parsons , Jonathan Rouzaud-Cornabas

ICSB 2018 - 19th International Conference on Systems Biology, Oct 2018, Lyon, France. pp.1

Poster de conférence hal-01939365v1

The complexity ratchet: stronger than selection

Vincent F Liard , Jonathan Rouzaud-Cornabas , David P. Parsons , Guillaume Beslon

Beacon congress 2018, Aug 2018, east-lansing, United States. pp.1

Poster de conférence hal-01938802v1

Security-Aware Models for Clouds

Arnaud Lefray , Eddy Caron , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Zhang Huaxi Yulin , Aline Bousquet et al.

22th IEEE International Symposium on High Performance Distributed Computing, Jun 2013, New York, United States. 2013

Poster de conférence hal-00840734v1

Of Evolution, Systems and Complexity

Guillaume Beslon , Vincent F Liard , David P. Parsons , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Evolutionary Systems Biology II, 2021, ⟨10.1007/978-3-030-71737-7_1⟩

Chapitre d'ouvrage hal-03136122v1

Mandatory access protection within cloud systems

Mathieu Blanc , Aline Bousquet , Jérémy Briffaut , Laurent Clévy , Damien Gros et al.

Springer Berlin Heidelberg. Security, Privacy and Trust in Cloud Systems, Springer Berlin Heidelberg, pp 145-173, 2014, ⟨10.1007/978-3-642-38586-5_5⟩

Chapitre d'ouvrage hal-01212808v1

Beyond The Clouds, How Should Next Generation Utility Computing Infrastructures Be Designed?

Marin Bertier , Frédéric Desprez , Gilles Fedak , Adrien Lebre , Anne-Cécile Orgerie et al.

Mahmood, Zaigham. Cloud Computing: Challenges, Limitations and R&D Solutions, Springer, 2014, ISBN 978-3-319-10529-1

Chapitre d'ouvrage hal-01067888v1

Smart Resources Allocation to improve Cloud Security

Eddy Caron , Frédéric Desprez , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Nepal, Surya and Pathan, Mukaddim. Security, Privacy and Trust in Cloud Systems, Part 1, Springer Berlin Heidelberg, pp.103-143, 2014, 978-3-642-38585-8. ⟨10.1007/978-3-642-38586-5_4⟩

Chapitre d'ouvrage hal-00931144v1

PIGA-Cloud : une protection obligatoire des environnements d'informatique en nuage

Z. Afoulki , Aline Bousquet , Jérémy Briffaut , Laurent Clévy , Jonathan Rouzaud-Cornabas et al.

Krief, Francine and Pierson, Jean-Marc and Roose, Philippe. RNTI SM2. Ingénierie des protocoles et Nouvelles technologies de la répartition, RNTI, pp.59-78, 2013, 9782705687328

Chapitre d'ouvrage hal-00840731v1

Honeypot forensics for system and network SIEM design

Jérémy Briffaut , Patrice Clemente , Jean-François Lalande , Jonathan Rouzaud-Cornabas

Guillermo Suárez de Tangil and Esther Palomar. Advances in Security Information Management: Perceptions and Outcomes, Nova Science Publishers, pp.181-216, 2013, Computer Science, Technology and Applications, Computer Networks, 978-1-62417-221-2

Chapitre d'ouvrage hal-00677340v1

Corrélation d'événements et d'alarmes pour la détection d'intrusions dans les systèmes réparties

Jonathan Rouzaud-Cornabas

2007

Autre publication scientifique hal-00459828v1

Mixed-Precision in adaptive Runge-Kutta method for large ODE systems

Mouhamad Al-Sayed , Samuel Bernard , Arsène Marzorati , Jonathan Rouzaud-Cornabas

2026

Pré-publication, Document de travail hal-05629726v1

Mixed precision explicit numerical methods for ordinary differential equations

M Al Sayed Ali , S Bernard , A Marzorati , J Rouzaud-Cornabas

2026

Pré-publication, Document de travail hal-05681305v1

Aevol-9: A simulation platform to decipher the evolution of genome architecture

Juliette Luiselli , David Parsons , Romain Gallé , Paul Banse , Jonathan Rouzaud-Cornabas et al.

2025

Pré-publication, Document de travail hal-05357667v1

Accuracy of Mixed Precision Computation in Large Coupled Biological Systems

Aquilina Al Khoury , Samuel Bernard , Jonathan Rouzaud-Cornabas

2021

Pré-publication, Document de travail hal-03249828v1

Image Transfer and Storage Cost Aware Brokering Strat. for Multiple Clouds

Frédéric Desprez , Jose-Luis Lucas-Simarro , Rafael Moreno Vozmediano , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] RR-8445, INRIA. 2014

Rapport (rapport de recherche) hal-00924351v1

D3.1.1 - Upperware Prototype

Amin Bsila , Nicolàs Ferry , Geir Horn , Tom Kirkham , Maciej Malawski et al.

[Research Report] 2014

Rapport (rapport de recherche) hal-00991340v1

Improving users' isolation in IaaS: Virtual Machine Placement with Security Constraints

Eddy Caron , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] RR-8444, INRIA. 2014

Rapport (rapport de recherche) hal-00924296v1

Performance analysis and models for collocated VMs running on multi-core physical machines

Laurent Pouilloux , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] RR-8473, INRIA. 2014, pp.30

Rapport (rapport de recherche) hal-00945881v1

SimGrid Cloud Broker: Simulating the Amazon AWS Cloud

Frédéric Desprez , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] RR-8380, INRIA. 2013, pp.30

Rapport (rapport de recherche) hal-00909120v1

Comparison on OpenStack and OpenNebula performance to improve multi-Cloud architecture on cosmological simulation use case

Eddy Caron , Lamiel Toch , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] RR-8421, INRIA. 2013, pp.23

Rapport (rapport de recherche) hal-00916908v1

Security for Cloud Environment through Information Flow Properties Formalization with a First-Order Temporal Logic

Arnaud Lefray , Jonathan Rouzaud-Cornabas , Jérémy Briffaut , Christian Toinard

[Research Report] RR-8420, INRIA. 2013, pp.30

Rapport (rapport de recherche) hal-00916882v1

Beyond The Cloud, How Should Next Generation Utility Computing Infrastructures Be Designed?

Adrien Lebre , Jonathan Pastor , Marin Bertier , Frédéric Desprez , Jonathan Rouzaud-Cornabas et al.

[Research Report] RR-8348, INRIA. 2013

Rapport (rapport de recherche) hal-00854204v1

Security and Virtualization: a Survey

Patrice Clemente , Jonathan Rouzaud-Cornabas

2011

Rapport hal-00995214v1

From Manual Cyber Attacks Forensic to Automatic Characterization of Attackers' Profiles J. Briffaut, P. Clemente, J.-F. Lalande, J. Rouzaud-Cornabas

Jérémy Briffaut , Patrice Clemente , Jean-François Lalande , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] INSA CVL - Institut National des Sciences Appliquées - Centre Val de Loire; LIFO, Université d'Orléans, INSA Centre Val de Loire. 2011

Rapport (rapport de recherche) hal-00995211v1

Security and Virtualization: a Survey

Patrice Clemente , Jonathan Rouzaud-Cornabas

[Research Report] INSA CVL - Institut National des Sciences Appliquées - Centre Val de Loire; LIFO, Université d'Orléans, INSA Centre Val de Loire. 2011

Rapport (rapport de recherche) hal-03226336v1

Formalisation de propriétés de sécurité pour la protection des systèmes d'exploitation

Jonathan Rouzaud-Cornabas

Autre [cs.OH]. Université d'Orléans, 2010. Français. ⟨NNT : 2010ORLE2075⟩

Thèse tel-00623075v1

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