Julien Parelle

Maître de conférences - Ecophysiologiste des ligneux - UMR Chrono-environnement 6249 Université Marie et Louis Pasteur / CNRS

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Ecophysiologie - Bioremédiation - Phénotypage

Ecophysiologiste, mes recherches consistent à adapter des méthodes de phénotypage et de suivi des ligneux in situ et ex situ dans un contexte de sciences environnementales. Ces dernières années, j’ai travaillé principalement à des problématiques de phytomanagement de sols contaminés, et au suivi écophysiologique de sites de démonstration, m’amenant progressivement à m’intéresser à des méthodes globales de télédétection.

Projets en cours

EDAPHOS – Advanced mapping, risk assessment and nature-based depollution methods are combined to accelerate the recovery of contaminated soils and ensure that ecological restoration enters mainstream business (porteur M Chalot)
Observatoire des Forêts Comtoises (observatoires forestier - multipatenaires )

Enseignements

Licence "sciences de la vie": biologie cellulaire, physiologie végétale et projets professionels
Master International "Ecology Managment and Monitoring of Ecosystem": télédétection optique et SIG
Master "Qualité des eaux, des sols et traitements": télédétection optique

Publications

	A combined approach utilizing UAV 3D imaging methods, in-situ measurements, and laboratory experiments to assess water evaporation and trace element uptake by tree species growing in a red gypsum landfill Abdoulaye Mahamat Malabad , Fabienne Tatin-Froux , Gilles Gallinet , Jean-Michel Colin , Michel Chalot et al. Journal of Hazardous Materials, 2022, 425, pp.127977. ⟨10.1016/j.jhazmat.2021.127977⟩ Article dans une revue hal-03480999v1
	Digestate improved birch (Betula pendula) growth and reduced leaf trace element contents at a red gypsum landfill Abdoulaye Mahamat Malabad , José Zapata-Carbonell , Nicolas Maurice , Lisa Ciadamidaro , Stephane Pfendler et al. Ecological Engineering, 2022, 185, pp.106815. ⟨10.1016/j.ecoleng.2022.106815⟩ Article dans une revue hal-04954415v1
	Improving Silver Birch (Betula pendula) Growth and Mn Accumulation in Residual Red Gypsum Using Organic Amendments José Zapata-Carbonell , Lisa Ciadamidaro , Julien Parelle , Michel Chalot , Fabienne Tatin-Froux Frontiers in Environmental Science, 2020, 8, ⟨10.3389/fenvs.2020.00024⟩ Article dans une revue hal-03582114v1
	Early screening of new accumulating versus non-accumulating tree species for the phytomanagement of marginal lands Lisa Ciadamidaro , J. Parelle , F. Tatin-Froux , C. Moyen , A. Durand et al. Ecological Engineering, 2019, 130, pp.147-156. ⟨10.1016/j.ecoleng.2019.02.010⟩ Article dans une revue hal-02089637v1
	Trace Metal(oid) Accumulation in Edible Crops and Poplar Cuttings Grown on Dredged Sediment Enriched Soil Mohamad Assad , Michel Chalot , Fabienne Tatin-Froux , Valérie Bert , Julien Parelle Journal of Environmental Quality, 2018, 47 (6), pp.1496-1503. ⟨10.2134/jeq2018.03.0106⟩ Article dans une revue hal-02089640v1
	Accumulation of trace elements in edible crops and poplar grown on a titanium ore landfill Mohamad Assad , Fabienne Tatin-Froux , Damien Blaudez , Michel Chalot , Julien Parelle Environmental Science and Pollution Research, 2017, 24 (5), pp.5019 - 5031. ⟨10.1007/s11356-016-8242-4⟩ Article dans une revue hal-01512276v1
	Mercury uptake into poplar leaves Mohamad Assad , Julien Parelle , David Cazaux , Frederic Gimbert , Michel Chalot et al. Chemosphere, 2016, 146, pp.1-7. ⟨10.1016/j.chemosphere.2015.11.103⟩ Article dans une revue istex hal-01378616v1
	Production of micro-cuttings from acorns to test the plasticity of response to contrasting soil water regimes Julien Parelle , Belabbes Sara , Fabienne Tatin-Froux Journal of Forestry Research, 2016, 27 (5), pp.995-1001. ⟨10.1007/s11676-016-0226-1⟩ Article dans une revue hal-01355399v1
	Short-term response to waterlogging in Quercus petraea and Quercus robur: a study of the root hydraulic responses and the transcriptional pattern of aquaporins Claire Rasheed-Depardieu , Julien Parelle , Fabienne Tatin-Froux , Claire Parent , Nicolas Capelli Plant Physiology and Biochemistry, 2015, 97, pp.323-330. ⟨10.1016/j.plaphy.2015.10.016⟩ Article dans une revue istex hal-01378595v1
	Cause–effect relationship among morphological adaptations, growth, and gas exchange response of pedunculate oak seedlings to waterlogging Fabienne Tatin-Froux , Nicolas Capelli , Julien Parelle Annals of Forest Science, 2014, 71 (3), pp.363-369. ⟨10.1007/s13595-013-0340-6⟩ Article dans une revue hal-01101530v1
	Identification and Expression of Nine Oak Aquaporin Genes in the Primary Root Axis of Two Oak Species, Quercus petraea and Quercus robur Claire Rasheed-Depardieu , Claire Parent , Michèle Crèvecoeur , Julien Parelle , Fabienne Tatin-Froux et al. PLoS ONE, 2012, 7 (12), pp.11. ⟨10.1371/journal.pone.0051838⟩ Article dans une revue hal-00794717v1
	Quantitative trait loci of tolerance to waterlogging in a European Oak (<em>Quercus Robur</em> L.): physiological relevance and temporal effect patterns Julien Parelle , Marion Zapater , Caroline Scotti-Saintagne , Antoine Kremer , Yves Y. Jolivet et al. Plant, Cell and Environment, 2007, 30 (4), pp.422-434. ⟨10.1111/j.1365-3040.2006.01629.x⟩ Article dans une revue hal-02665582v1
	Intra- and interspecific diversity in the response to waterlogging of two co-occurring white oak species (Quercus robur and Q. petraea) Julien Parelle , Oliver Brendel , Yves Y. Jolivet , Erwin Dreyer Tree Physiology, 2007, 27 (8), pp.1027-1034. ⟨10.1093/treephys/27.7.1027⟩ Article dans une revue hal-02653679v1
	Differences in morphological and physiological responses to water-logging between two sympatric oak species (Quercus petraea [Matt.] Liebl., Quercus robur L.) Julien Parelle , Oliver Brendel , Catherine Bodénès , Daniel Berveiller , Pierre Dizengremel et al. Annals of Forest Science, 2006, 63 (8), pp.849-859 Article dans une revue hal-00884035v1
	Light acclimation and photosynthetic response of beech (Fagus sylvatica L.) saplings under artificial shading or natural Mediterranean conditions Julien Parelle , Jean-Philippe Roudaut , Michel Ducrey Annals of Forest Science, 2006, 63 (3), pp.257- 266 Article dans une revue hal-00883976v1
	Differences in morphological and physiological responses to water-logging between two sympatric oak species (Q. Petraea [Matt.] Lieb., Q. Robur L.) Julien Parelle , Oliver Brendel , Catherine Bodenes-Brezard Bodénès , Daniel Berveiller , Pierre P. Dizengremel et al. Annals of Forest Science, 2006, 63 (8), pp.849-859. ⟨10.1051/forest:2006068⟩ Article dans une revue hal-02656239v1
	Light acclimation and photosynthetic response of beech (Fagus sylvatica L.) saplings under artificial shading or natural mediterranean conditions Julien Parelle , Jean-Philippe Roudaut , Michel M. Ducrey Annals of Forest Science, 2006, 63 (3), pp.257-266. ⟨10.1051/forest:2006004⟩ Article dans une revue hal-02655467v1

	Contamination Mapping using Optical Remote Sensing in Phyto-management Trials Julien Parelle pHYBi Workshop: Soil Monitoring at Scale - Advances in Digital Methods and Modelling, pHYBi, Jun 2026, Remote Conference, France Communication dans un congrès hal-05679468v1
	EDAPHOS - Utilisation de l’imagerie hyperspectrale pour la caractérisation et le suivi de sols contaminés phytostabilisés en Europe Hugo Dorbes , Colette Badourdine , Solofoniaina Andriamihajason , Julien Parelle , Michel Chalot et al. 10e colloque scientifique du Groupe Hyperspectral de la Société Française de Photogrammétrie et de Télédétection, May 2025, Grasse, France Communication dans un congrès hal-05230331v1
	Estimation of foliar trace elements from spectroscopy in poplar within a context of phytomanagement Solofoniaina Andriamihajason , Julien Parelle , Sophie Fabre EARSeL Symposium 2025, May 2025, Prague, Czech Republic Communication dans un congrès hal-05639647v1
	LIVING LAB DU PARC DES ALLIAIRES : UN SITE PILOTE DE RECHERCHE DE DIFFUSION DU PHYTOMANAGEMENT POUR LA REHABILITATION DES FRICHES INDUSTRIELLES Philippe Binet , Cathy Kuhn , Jordan Collot , Benjamin Pauget , Nicolas Kieffer et al. SEFA Besançon 2024, Frédéric GIMBERT, Jul 2024, Besançon, France Communication dans un congrès hal-04708233v1
	Des nouvelles technologies au service de la gestion des espaces naturels. Discours et bilan du grand témoin Julien Parelle 12e journée des gestionnaires d’espaces naturels de Bourgogne-Franche-Comté., Jan 2023, Besançon, France Communication dans un congrès hal-05683793v1
	Managing water evaporation and trace element accumulation using tree species at a red gypsum landfill Abdoulaye Mahamat Malabad , Fabienne Tatin-Froux , Gilles Gallinet , Michel Chalot , Julien Parelle SETAC SciCon Online Meeting, SETAC Europe 30th Annual Meeting, Society of Environmental Toxicology and Chemistry, May 2020, Dublin, Ireland Communication dans un congrès hal-03233507v1
	Increasing the panel of tree species for the phytomanagement of marginal lands Michel Chalot , Lisa Ciadamidaro , Stéphane Pfendler , Cyril Zappelini , Alexis Durand et al. 15th phytotechnologies conference, Oct 2018, Novi Sad, Serbia Communication dans un congrès hal-03189728v1
	Increasing the panel of tree species in phytomanagement strategies Lisa Ciadamidaro , Julien Parelle , Fabienne Tatin-Froux , Christelle Moyen , Alexis Durand et al. ICOBTE, 14th International Conference on the Biogeochemistry of Trace Elements, Jul 2017, Zurich, Switzerland Communication dans un congrès hal-03525157v1
	Transfert d’éléments traces provenant de décharges de résidus dans des végétaux utilisés en jardinage : estimation du risque et bio-monitoring. Les agricultures urbaines durables : un vecteur de la transition écologique Mohamad Assad , Fabienne Tatin-Froux , Michel Chalot , Julien Parelle Colloque international sur l'agriculture urbaine, Jun 2017, Toulouse, France Communication dans un congrès hal-03525743v1
	Developing eco-innovative chemical processes to valorise phytoremediation-borne biomasses: the PHYTOCHEM initiative Michel Chalot , Maohamed Assad , Nicolas Brosse , Valérie Bert , Lisa Ciadamidaro et al. SETAC, May 2017, Bruxelles, France Communication dans un congrès hal-04153263v1
	Natural recolonization of tailings dumps by trees and microbes: a case study Cyril Zappelini , Mohamad Assad , Nicolas Capelli , Fabienne Tatin-Froux , Julien Parelle et al. 14th International Conference on the Biogeochemistry of Trace Elements (ICOBTE), Jul 2017, Zurich, Switzerland Communication dans un congrès hal-03189725v1

	A Transposable Hyperspectral Method To Estimate Zn Uptake by Poplars In Various Phyto-Management Contexts Solofoniaina Andriamihajason , Yoann Boisson , Manhattan Lebrun , Hugo Dorbes , Colette Badourdine et al. 14th EARSeL Workshop on Imaging Spectroscopy, Jun 2026, Helsinki Metropolitan area, Finland Poster de conférence hal-05677435v1
	EDAPHOS - Utilisation de l'imagerie hyperspectrale pour la caractérisation et le suivi de sols contaminés phytostabilisés en Europe Solofoniaina Andriamihajason , Sophie Fabre , Colette Badourdine , Guillaume Bertrand , Julien Parelle et al. 9e colloque scientifique du groupe SFPT-GH, May 2024, Rennes, France. 2024 Poster de conférence hal-04904664v1
	Observatoire des forêts comtoises : Approche multiscalaire et multidisciplinaire pour comprendre le dépérissement forestier et ses conséquences sur les écosystèmes, les paysages et la société Carole Bégeot , Julien Azuara , Lisa Beguinet , Eric Bernard , Coralie Bertheau-Rossel et al. Colloque international et interdisciplinaire : "Forêts en transitions. Concepts, méthodes, mesures et prospective", Jun 2024, Tours, France. Poster de conférence hal-04638939v1
	CO2-response QTL for leaf gas exchange in Quercus robur Oliver Brendel , Xavière Torti-Marcy , Antoine Kremer , Pierre Dizengremel , Julien Parelle et al. Genomics and Forest Tree Genetics Conference, May 2016, Arcachon, France. , Abstract Book Poster de conférence hal-04175022v1
	Mercury uptake into poplar leaves Mohamad Assad , Julien Parelle , Fabienne Tatin-Froux , Michel Chalot 18th International Conference on Heavy Metals in the Environment, ICHMET., Sep 2016, Ghen, Belgium Poster de conférence hal-03525729v1
	PHYOTOCHEM: Developing Eco-innovative Chemical Processes to Valorise Phytoremediation-Borne Biomasses End Fragment Michel Chalot , M. Assad , Nicolas Brosse , Valérie Bert , Lisa Ciadamidaro et al. 8th International Conference on Heavy Metals in the Environment, Sep 2016, Ghent, Belgium Poster de conférence hal-03779377v1

	Genetic variability and determinism of adaptation of plants to soil waterlogging Julien Parelle , Erwin Dreyer , Oliver Brendel Waterlogging signalling and tolerance in plants, Springer-Verlag, 2010, 978-3-642-10304-9 (Print) 978-3-642-10305-6 (Online). ⟨10.1007/978-3-642-10305-6_12⟩ Chapitre d'ouvrage hal-02821464v1

	Converting an urban wasteland into a sustainable and educational living-lab, based on a replicable phytomanagement approach M Chalot , C Bertheau , P Binet , L Ciadamidaro , J Collot et al. 2022 Autre publication scientifique hal-04735273v1

	Réponses de jeunes chênes de deux espèces (Quercus robur L., Q. petraea [Matt] Liebl.) à l'hypoxie racinaire : Marqueurs physiologiques, moléculaires et génétiques de sensibilité et application à la comparaison des deux espèces Julien Parelle Sylviculture, foresterie. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 2006. Français. ⟨NNT : 2006NAN10049⟩ Thèse tel-01746617v1

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Julien Parelle

Présentation

Publications

Publications

A combined approach utilizing UAV 3D imaging methods, in-situ measurements, and laboratory experiments to assess water evaporation and trace element uptake by tree species growing in a red gypsum landfill

Digestate improved birch (Betula pendula) growth and reduced leaf trace element contents at a red gypsum landfill

Improving Silver Birch (Betula pendula) Growth and Mn Accumulation in Residual Red Gypsum Using Organic Amendments

Early screening of new accumulating versus non-accumulating tree species for the phytomanagement of marginal lands

Trace Metal(oid) Accumulation in Edible Crops and Poplar Cuttings Grown on Dredged Sediment Enriched Soil

Accumulation of trace elements in edible crops and poplar grown on a titanium ore landfill

Mercury uptake into poplar leaves

Production of micro-cuttings from acorns to test the plasticity of response to contrasting soil water regimes

Short-term response to waterlogging in Quercus petraea and Quercus robur: a study of the root hydraulic responses and the transcriptional pattern of aquaporins

Cause–effect relationship among morphological adaptations, growth, and gas exchange response of pedunculate oak seedlings to waterlogging

Identification and Expression of Nine Oak Aquaporin Genes in the Primary Root Axis of Two Oak Species, Quercus petraea and Quercus robur

Quantitative trait loci of tolerance to waterlogging in a European Oak (<em>Quercus Robur</em> L.): physiological relevance and temporal effect patterns

Intra- and interspecific diversity in the response to waterlogging of two co-occurring white oak species (Quercus robur and Q. petraea)

Differences in morphological and physiological responses to water-logging between two sympatric oak species (Quercus petraea [Matt.] Liebl., Quercus robur L.)

Light acclimation and photosynthetic response of beech (Fagus sylvatica L.) saplings under artificial shading or natural Mediterranean conditions

Differences in morphological and physiological responses to water-logging between two sympatric oak species (Q. Petraea [Matt.] Lieb., Q. Robur L.)

Light acclimation and photosynthetic response of beech (Fagus sylvatica L.) saplings under artificial shading or natural mediterranean conditions

Contamination Mapping using Optical Remote Sensing in Phyto-management Trials

EDAPHOS - Utilisation de l’imagerie hyperspectrale pour la caractérisation et le suivi de sols contaminés phytostabilisés en Europe

Estimation of foliar trace elements from spectroscopy in poplar within a context of phytomanagement

LIVING LAB DU PARC DES ALLIAIRES : UN SITE PILOTE DE RECHERCHE DE DIFFUSION DU PHYTOMANAGEMENT POUR LA REHABILITATION DES FRICHES INDUSTRIELLES

Des nouvelles technologies au service de la gestion des espaces naturels. Discours et bilan du grand témoin

Managing water evaporation and trace element accumulation using tree species at a red gypsum landfill

Increasing the panel of tree species for the phytomanagement of marginal lands

Increasing the panel of tree species in phytomanagement strategies

Transfert d’éléments traces provenant de décharges de résidus dans des végétaux utilisés en jardinage : estimation du risque et bio-monitoring. Les agricultures urbaines durables : un vecteur de la transition écologique

Developing eco-innovative chemical processes to valorise phytoremediation-borne biomasses: the PHYTOCHEM initiative

Natural recolonization of tailings dumps by trees and microbes: a case study

A Transposable Hyperspectral Method To Estimate Zn Uptake by Poplars In Various Phyto-Management Contexts

EDAPHOS - Utilisation de l'imagerie hyperspectrale pour la caractérisation et le suivi de sols contaminés phytostabilisés en Europe

Observatoire des forêts comtoises : Approche multiscalaire et multidisciplinaire pour comprendre le dépérissement forestier et ses conséquences sur les écosystèmes, les paysages et la société

CO2-response QTL for leaf gas exchange in Quercus robur

Mercury uptake into poplar leaves

PHYOTOCHEM: Developing Eco-innovative Chemical Processes to Valorise Phytoremediation-Borne Biomasses End Fragment

Genetic variability and determinism of adaptation of plants to soil waterlogging

Converting an urban wasteland into a sustainable and educational living-lab, based on a replicable phytomanagement approach

Réponses de jeunes chênes de deux espèces (Quercus robur L., Q. petraea [Matt] Liebl.) à l'hypoxie racinaire : Marqueurs physiologiques, moléculaires et génétiques de sensibilité et application à la comparaison des deux espèces