CV HAL - Lise Pomiès

Échanges autour des recherches, des métiers, des parcours de formation et visite (UMR BOA, INRAE)

Magali Chesse , Nicolas Guyot , Pauline Javaloyes , Elisabeth Le Bihan-Duval , Xavier Leray et al.

2026

Autre publication scientifique hal-05543673v1

Réponse transcriptomique du Peuplier à une sollicitation mécanique : inférence de réseaux de régulations géniques à partir de données d’expression

Lise Pomies

2013, 25 p. + annexes

Autre publication scientifique hal-01269061v1

Mise en place d'un outil d'analyse de résultats de puces ADN (Affymetrix 61K Poplar) pour l'étude de la mécanoperception chez le Peuplier

Lise Pomies

2012, 20 p. + annexes

Autre publication scientifique hal-01269067v1

Transcriptome profiling reveals stress-responsive gene networks in cattle muscles

Isabelle Cassar-Malek , Lise Pomiès , Anne de La Foye , Jérémy Tournayre , Céline Boby et al.

PeerJ, 2022, 10, pp.e13150. ⟨10.7717/peerj.13150⟩

Article dans une revue hal-03632213v1

Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals

Lise Pomiès , Celine Brouard , Harold Duruflé , Élise Maigné , Clément Carré et al.

Bioinformatics, 2022, 38 (17), pp.4127-4134. ⟨10.1093/bioinformatics/btac445⟩

Article dans une revue hal-03776333v1

Données transcriptomiques de feuilles de huit lignées de tournesol et de leurs 16 hybrides soumis à un stress hydrique

Louise Gody , Harold Duruflé , Nicolas Blanchet , Clément Carré , Ludovic Legrand et al.

OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.48. ⟨10.1051/ocl/2020044⟩

Article dans une revue (data paper) hal-02974900v1

RNA expression dataset of 384 sunflower hybrids in field condition

Charlotte Penouilh-Suzette , Lise Pomies , Harold Duruflé , Nicolas Blanchet , Fanny Bonnafous et al.

OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.36. ⟨10.1051/ocl/2020027⟩

Article dans une revue (data paper) hal-02912579v1

Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli

Lise Pomies , Mélanie Decourteix , Jérôme Franchel , Bruno Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier

BMC Genomics, 2017, 18, 16 p. ⟨10.1186/s12864-017-3670-1⟩

Article dans une revue hal-01528849v1

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Lise Pomies , Louise Gody , Charlotte Penouilh-Suzette , Nicolas Langlade , Brigitte Mangin et al.

Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Jul 2018, Marseille, France. 664 p

Communication dans un congrès hal-02733671v1

Strategy for infering gene regulatory network from kinetic expression with unfavorable data-to-variables ratio.

Lise Pomies , Mélanie M. Decourteix , Jérôme Franchel , Bruno Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier

Journées Ouvertes en Biologie, Informatique & Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). Clermont-Ferrand, FRA., Jul 2015, Clermont-Fd, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-01269089v1

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Lise Pomies , Louise Gody , Charlotte Penouilh-Suzette , Nicolas Langlade , Brigitte Mangin et al.

17th European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. 2018

Poster de conférence hal-02734486v1

Acclimation of Populus to wind: kinetic of the transcriptomic response to single or repeated stem bending

Lise Pomies , Mélanie M. Decourteix , Jérôme J. Franchel , Bruno B. Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier

IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics Conference, May 2016, Arcachon, France. IUFRO, 1 p., 2016

Poster de conférence hal-02739238v1

La réponse transcriptomique au stress décortiquée a l'aide de la bioinformatique

Isabelle Cassar-Malek , Lise Pomies , Brigitte B. Picard

14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2012, Caen, France. Institut de l'Elevage - INRA, Viandes et Produits Carnés, 2012, 14èmes Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes

Poster de conférence hal-02745567v1

Sensibilité des peupliers à la flexion : analyse transcriptomique et inférence de réseau de gènes

Lise Pomiès

Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université Clermont Auvergne (UCA), 2017. Français. ⟨NNT : ⟩

Thèse tel-05461412v1

Lise Pomiès

Publications

Publications

Échanges autour des recherches, des métiers, des parcours de formation et visite (UMR BOA, INRAE)

Réponse transcriptomique du Peuplier à une sollicitation mécanique : inférence de réseaux de régulations géniques à partir de données d’expression

Mise en place d'un outil d'analyse de résultats de puces ADN (Affymetrix 61K Poplar) pour l'étude de la mécanoperception chez le Peuplier

Transcriptome profiling reveals stress-responsive gene networks in cattle muscles

Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals

Données transcriptomiques de feuilles de huit lignées de tournesol et de leurs 16 hybrides soumis à un stress hydrique

RNA expression dataset of 384 sunflower hybrids in field condition

Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Strategy for infering gene regulatory network from kinetic expression with unfavorable data-to-variables ratio.

Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Acclimation of Populus to wind: kinetic of the transcriptomic response to single or repeated stem bending

La réponse transcriptomique au stress décortiquée a l'aide de la bioinformatique

Sensibilité des peupliers à la flexion : analyse transcriptomique et inférence de réseau de gènes