Lise Pomiès

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Transcriptome profiling reveals stress-responsive gene networks in cattle muscles

Isabelle Cassar-Malek , Lise Pomiès , Anne de La Foye , Jérémy Tournayre , Céline Boby et al.
PeerJ, 2022, 10, pp.e13150. ⟨10.7717/peerj.13150⟩
Article dans une revue hal-03632213 v1
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Gene regulatory network inference methodology for genomic and transcriptomic data acquired in genetically related heterozygote individuals

Lise Pomiès , Celine Brouard , Harold Duruflé , Élise Maigné , Clément Carré et al.
Bioinformatics, 2022, 38 (17), pp.4127-4134. ⟨10.1093/bioinformatics/btac445⟩
Article dans une revue hal-03776333 v1
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Données transcriptomiques de feuilles de huit lignées de tournesol et de leurs 16 hybrides soumis à un stress hydrique

Louise Gody , Harold Duruflé , Nicolas Blanchet , Clément Carré , Ludovic Legrand et al.
OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.48. ⟨10.1051/ocl/2020044⟩
Article dans une revue (data paper) hal-02974900 v1

RNA expression dataset of 384 sunflower hybrids in field condition

Charlotte Penouilh-Suzette , Lise Pomies , Harold Duruflé , Nicolas Blanchet , Fanny Bonnafous et al.
OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.36. ⟨10.1051/ocl/2020027⟩
Article dans une revue (data paper) hal-02912579 v1
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Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli

Lise Pomies , Mélanie Decourteix , Jérôme Franchel , Bruno Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier
BMC Genomics, 2017, 18, 16 p. ⟨10.1186/s12864-017-3670-1⟩
Article dans une revue hal-01528849 v1
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Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Lise Pomies , Louise Gody , Charlotte Penouilh-Suzette , Nicolas Langlade , Brigitte Mangin et al.
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM 2018), Jul 2018, Marseille, France. 664 p
Communication dans un congrès hal-02733671 v1

Strategy for infering gene regulatory network from kinetic expression with unfavorable data-to-variables ratio.

Lise Pomies , Mélanie M. Decourteix , Jérôme Franchel , Bruno Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique & Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). Clermont-Ferrand, FRA., Jul 2015, Clermont-Fd, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01269089 v1
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Building artificial genetical genomic datasets to optimize the choice of gene regulatory network inference methods

Lise Pomies , Louise Gody , Charlotte Penouilh-Suzette , Nicolas Langlade , Brigitte Mangin et al.
17th European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. 2018
Poster de conférence hal-02734486 v1
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Acclimation of Populus to wind: kinetic of the transcriptomic response to single or repeated stem bending

Lise Pomies , Mélanie M. Decourteix , Jérôme J. Franchel , Bruno B. Moulia , Nathalie Leblanc-Fournier
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics Conference, May 2016, Arcachon, France. IUFRO, 1 p., 2016
Poster de conférence hal-02739238 v1

La réponse transcriptomique au stress décortiquée a l'aide de la bioinformatique

Isabelle Cassar-Malek , Lise Pomies , Brigitte B. Picard
14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2012, Caen, France. Institut de l'Elevage - INRA, Viandes et Produits Carnés, 2012, 14èmes Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes
Poster de conférence hal-02745567 v1
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Sensibilité des peupliers à la flexion : analyse transcriptomique et inférence de réseau de gènes

Lise Pomiès
Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université Clermont Auvergne (UCA), 2017. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-05461412 v1