Lucie Tamisier
- Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes (GAFL)
Présentation
Mes travaux de recherche visent à répondre à l’enjeu de la durabilité des résistances. En effet, l’utilisation de variétés de plantes génétiquement résistantes est un des principaux moyens d’action pour lutter contre les maladies des plantes. Néanmoins, la capacité des agents pathogènes à s’adapter à ces variétés après seulement quelques années de culture rend nécessaire la recherche de résistances à la fois efficaces et durables. Après avoir exploré cette thématique sur le modèle piment - Potato virus Y, j’étudie actuellement le modèle melon - Watermelon mosaic virus. Mes travaux allient la génétique quantitative appliquée à la plante et à l’agent pathogène (cartographie de QTL, GWAS et co-GWAS), la biologie évolutive (évolution expérimentale) ainsi que la bioinformatique.
Publications
Publications
Virus evolution faced to multiple host targets: The potyvirus—pepper case studyEsteban Domingo; Peter Schuster; Santiago F. Elena; Celia Perales. Viral fitness and evolution. Population dynamics and adaptive mechanisms, 439, Springer International Publishing, pp.121-138, 2023, Current Topics in Microbiology and Immunology, 978-3-031-15639-7. ⟨10.1007/978-3-031-15640-3_3⟩ |
|
Peut-on prédire la durabilité des résistances ? Le cas des virusL'immunité des plantes. Pour des cultures résistantes aux maladies, Editions Quae, pp.297-307, 2021, 9782759232338 |
|
|
Relations entre virulence, charge virale et transmission du potato virus Y (genre Potyvirus ; famille Potyviridae)20. Rencontres de virologie végétale (RVV 2025), Jan 2025, Aussois, France |
|
|
Uncovering the genetic basis of quantitative resistance to cucumber mosaic virus in Capsicum annuum using genome-wide association coupled with high-throughput image analysis20. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2025), UMR PHIM, Jan 2025, Aussois, France. pp.C-41 |
La robustesse de l’immunité végétale : une piste pour assurer la stabilité des productions agricoles face aux stress environnementaux ?Réunion plénière 2023 du réseau ENVIE, Nov 2023, Sète, France |
|
Revisiting high throughput sequencing data used for plant virus detection in order to find evidence of nonviralplant pathogens and pests12. International congress of plant pathology (ICPP). Satellite event: high-throughput Sequencing in plant virology: from Discovery to diagnostics, SFP; ISPP, Aug 2023, Lyon, France. pp.1259-1260 |
|
|
|
Potato virus Y adaptation to various resistance QTL combinations in pepper and impact on host tolerance15. International symposium of plant virus epidemiology, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Madrid, spain, Jun 2022, Madrid, Spain |
|
|
Change of paradigm for breeding disease resistant cultivars robust to varying environments: estimators of the robustness of plant immunity and promising genes for the futureEuropean Scientific Conference – Towards Pesticide Free Agriculture “What research to meet the pesticides reduction objectives embedded in the European Green Deal?”, French Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE), Jun 2022, Dijon, France |
|
|
Robustesse de l'immunité du piment à Phytophthora capsici face à une perturbation thermique13. Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Sep 2022, Aussois (France), France. 1p |
|
|
Experimental evolution of a plant RNA virus: a warning about spurious correlations when studying fitness changes18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), INRAE; CIRAD, Sep 2021, Aussois, France |
|
|
Potato virus Y adaptation to various resistance QTL combinations in pepper and impact on host tolerance18. Rencontres de virologie végétale (RVV 2021), Cirad; Inrae, Sep 2021, Aussois, France |
|
|
Within-plant genetic drift to control virus adaptation5. Conférence Jacques Monod, Évolution virale sur le continuum mutualiste – parasite, Oct 2019, Roscoff, France |
|
|
Genome-wide association mapping of loci implied in Potato virus Y resistance and tolerance in the pepper germplasm17. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019), Jan 2019, Aussois, France. 127 p |
|
|
Genome-wide association mapping of loci involved in Potato virus Y resistance and tolerance in pepper germplasm17. Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Capsicum and Eggplant (2019), Centre Technique Interprofessionnel des Fruits et Légumes (CTIFL). FRA.; Terralia. FRA.; Groupe d'Etude et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES). FRA., Sep 2019, Avignon, France. 263 p |
Experimental evolution of Barley yellow dwarf virus in cultivated and wild Poaceae species17e Rencontres de virologie végétale, Jan 2019, Aussois (France), France |
|
Taking control of virus adaptation by choosing host plant genotype2. Joint Congress on Evolutionary Biology (EVOLUTION 2018), European Society of Evolutionnary Biology (ESEB). INT., Aug 2018, Montpellier, France. 39 p |
|
|
|
Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus16. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2017), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (CIRAD). FRA., Jan 2017, Aussois, France. 137 p |
|
|
Quantitative trait loci in pepper genome control the effective population size of two RNA viruses at inoculation16. Eucarpia Capsicum and Eggplant meeting, Szent István University. Gödöllo, HUN., Sep 2016, Kecskemét, Hungary. 591 p |
|
|
Impact of selection, genetic drift and viral accumulation on the evolution of a plant RNA virus13. International plant virus epidemiology symposium, Jun 2016, Avignon, France. 165 p |
Rôle des parasites dans le succès d’invasion : approche corrélative sur deux communautés parasitaires dans le contexte de l’invasion de <em>Mus musculus domesticus</em> au Sénégal12th African Small mammals Symposium, Apr 2015, Mantasoa, Madagascar |
|
Utilisation de la métagénomique 16S pour la surveillance de l’émergence de zoonoses bactériennes dans les populations animales3. Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2015, Montpellier, France |
|
|
Deciphering the genetic architecture of plant-pathogen interactions using co-GWASJournées Jeunes Chercheurs du département BAP 2025, May 2025, Bordeaux, France |
|
|
Unravelling the genetic architecture of virus quantitative pathogenicity19. Rencontres de virologie végétale (RVV 2023), Jan 2023, Aussois (FR), France |
Impact of plant immunity on virus adaptation: what evolutionary forces should we rely upon in plant breeding?12. International congress of plant pathology (ICPP), Aug 2023, Lyon, France. , pp.1092-1093, Book of abstracts ICPP 2023. One healh for all plants, crops and trees. Lyon, 20-25 August, France |
|
Semi-artificial datasets as a resource for validation of bioinformatics pipelines for plant virus detectionInternational Advances in Plant Virology, Apr 2021, Avignon (en ligne), France |
|
Experimental evolution of Barley yellow dwarf virus in cultivated and wild Poaceae speciesInternational Advances in Plant Virology, Oct 2019, Rome, Italy |
|
|
Adaptation des populations virales aux résistances variétales et exploitation des ressources génétiques des plantes pour contrôler cette adaptationSciences agricoles. Université d'Avignon, 2017. Français. ⟨NNT : 2017AVIG0696⟩ |
Manipuler les forces évolutives exercées par les plantes sur les virus pour améliorer la durabilité des gènes de résistance2017, pp.63-74 |
|
|
Host-specific adaptation and fitness trade-off of Barley Yellow Dwarf Viruses suggested by experimental evolution through aphid inoculation on multiple Poaceae species2025 |
|
|
Semi-artificial datasets as a resource for validation of bioinformatics pipelines for plant virus detection2021 |