
Magalie WEBER
- Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA)
Présentation
Magalie Weber exerce des activités d’ingénierie de connaissances au sein de l’unité de recherche INRAE BIA (Biopolymères, Interactions, Assemblages) située à Nantes et elle supervise la construction de l’ontologie de domaine couvrant les recherches du département Transform (ontologie PO2/TransformON) sur l’ingénierie des aliments, bioproduits et résidus issus des systèmes agri-alimentaires. Elle est également chargée de mission à la Direction pour la Science Ouverte (DipSO) au sein du pôle Numérique pour la Science (Num4Sci) où elle contribue aux projets en lien avec la sémantique et le partage des données de la recherche. Son projet de recherche au sein de l'équipe Interfaces Systèmes Dispersés de BIA s’articule autour de la représentation des connaissances et le raisonnement lié à l’exploration des interactions entre constituants alimentaires et leurs assemblages dans les matrices alimentaires, en particulier les interactions protéines-lipides et protéines-polyphénols, dans l'optique de formuler des aliments sains, durables et sensoriellement satisfaisants.
Compétences
Publications
Publications
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ConsomON, une ontologie pour structurer les connaissances et modéliser les comportements alimentaires des consommateurs8ème édition de l’Atelier INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies, dans le domaine des sciences du VIVant et de l’Environnement IN-OVIVE, adossé à la conférence Ingénierie des Connaissances @PFIA, AFIA- Association Française d’Intelligence Artificielle, Jul 2025, Dijon, France
Communication dans un congrès
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Coupling ontology and probabilistic models to enable knowledge integration and reverse engineering for sustainable food and bioproduct productionPhenoHarmonis Workshop, L'Institut Agro Montpellier, May 2024, Montpelier, France
Communication dans un congrès
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How the PO2/TransformON and FermentON domain ontologies can help us achieve interoperability and reuse of data on (bio)processes.BioIndustry 4.0 - Summer Webinar 2024, Aug 2024, online, France
Communication dans un congrès
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Quelle diversité d'espèces légumineuses à graines est utilisée par l'industrie agroalimentaire dans le monde ?RFL4, Jan 2024, Saly, Sénégal
Communication dans un congrès
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L’écosystème web sémantique PO2/TransformON : en route vers le FAIR by Design !Assises nationales des données de la recherche, amU (SCD); MESR; CEDRE, Nov 2024, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-04808273
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Poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyvalerate) production: Processes stored in data warehouse structured by an ontologySéminaire résidentiel INRAE Semantic Linked Data, Oct 2023, Cap d'Agde, France
Communication dans un congrès
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PO2/TransformON: a New Domain Ontology for Integrating Food, Feed, Bio-products and Waste in a Circular and Sustainable ApproachIFOW 2023 Integrated Food Ontology Workshop, 9th Joint Ontology Workshops (JOWO 2023), co-located with FOIS 2023, Jul 2023, Sherbrooke, Canada
Communication dans un congrès
hal-04256248
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Comment la Direction pour la Science Ouverte favorise l'adoption des approches sémantiques à INRAEAtelier SOSEM- Science ouverte et sémantique, Jul 2023, Strasbourg, France. ⟨10.15454/J8GANU⟩
Communication dans un congrès
hal-05091496
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PO2/TransformON : une nouvelle ontologie de domaine pour l'intégration des données sur les aliments, les bioproduits et les biodéchets dans une approche circulaire et durable des sytèmes agroalimentaires8ème édition de l’Atelier INtégration de sources/masses de données hétérogènes et Ontologies, dans le domaine des sciences du VIVant et de l’Environnement IN-OVIVE, adossé à la conférence Ingénierie des Connaissances @PFIA, AFIA- Association Française d’Intelligence Artificielle, Jul 2023, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
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PO2/TransformON : A new domain ontology to integrate data on food and bioproducts engineering in a circular and sustainable approach9th International Conference on Food Chemistry & Technology (FCT-2023), Nov 2023, Paris, France
Communication dans un congrès
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Besoins ontologiques pour la transformation des alimentsIC2023 : 34es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jul 2023, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
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Progress and prospects for the Compositional Dietary Nutrition Ontology (CDNO)The Joint Ontology WOrkshops (JOWO), The International Association for Ontology and its Applications (IAOA), Aug 2022, Jönköping, Sweden
Communication dans un congrès
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Alignement et enrichissement d’ontologies utilisées par deux systèmes d’informations gérant des données expérimentales sur les procédés de transformation : OpenSILEX-EnviBIS et PO2 BaGaTelAtelier IN-OVIVE, organisé dans le cadre de la conférence Ingénierie des connaissances IC-2022, PFIA., Jun 2022, Saint Etienne, France
Communication dans un congrès
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Adapting MEANS-InOut LCA software to food engineering, in relation to the PO² food ontology and PO²-BaGaTel food engineering database13th International Conference on Life Cycle Assessment of Food 2022 (LCA Foods 2022), Oct 2022, Lima, Peru
Communication dans un congrès
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Managing Incompleteness and Validating the Content of Nutritional Food Sources using FoodOn as Pivot Ontology12th International Conference on Biomedical Ontologies, Bolzano Summer of Knowledge 2021, Sep 2021, Bolzano, Italy. ⟨10.4018/ijaeis.20211001.oa4⟩
Communication dans un congrès
hal-05091500
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Obo foundry food ontology interconnectivityCEUR Workshop Proceedings, Sep 2021, Bolzano, Italy
Communication dans un congrès
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Hemp seed oil bodies for food applications2nn International Conference on Lipid Droplets and Oleosomes, Dec 2021, Strasbourg, France. ⟨10.1016/j.foodres.2021.110759⟩
Communication dans un congrès
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A new alignment method based on FoodOn as pivot ontology to integrate nutritional legacy data sourcesIFOW 2020 - Integrated Food Ontology Workshop @ ICBO, Sep 2020, Bolzano / Virtual, Italy. pp.1-2
Communication dans un congrès
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Food transformation process description using PO2 and FoodOnIFOW 2020 Integrated Food Ontology Workshop, Sep 2020, Bolzano (virtual), Italy
Communication dans un congrès
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Découverte des outils du web sémantiqueJournée des Techniques de l'Unité BIA, Mar 2018, Nantes, France
Communication dans un congrès
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Florilège: a database gathering microbial phenotypes of food interest2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès
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Le processus de publication: les points de vigilancePublier pour plus d'impact: les clefs de la réussite, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (1253)., Nov 2014, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Les revues scientifiques de l'Inra: des modalités de diffusion variées dans un contexte de compétition internationale4. Journées du réseau des métiers de l'édition scientifique publique (MEDICI), Apr 2013, Oléron, France
Communication dans un congrès
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FORVM PlantsRFMF 2025 - 17èmes journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2025, Paris, France. pp.1-1, 2025
Poster de conférence
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How the PO2/TransformON ontology enables knowledge integration for sustainable food production?Green Food Tech 2025, Apr 2025, Saint-Malo, France. 2025
Poster de conférence
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Knowledge Engineering to enhance the data, knowledge and scientific expertise of agro-ressource transformation platforms: the PowderLib platform (F5.1)GreenFoodTech 2025, Apr 2025, Saint Malo (Palais du Grand Large), France. 2025
Poster de conférence
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Projet ICAM (2024-26): Ingénierie des Connaissances et Analyse Multidimensionnelle de la Durabilité pour valoriser les données, les connaissances et l’expertise scientifique des plateformes de bioraffinerieSéminaire chercheurs Institut Carnod 3BCAR 2024, Jan 2024, Montpellier, France
Poster de conférence
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Le thésaurus INRAE : une ressource terminologique pour l’interopérabilité sémantiqueJournée du GdR Traitement automatique des langues (GDR TAL), Oct 2022, Rennes, France
Poster de conférence
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Obo foundry food ontology interconnectivityIFOW 2021 Integrated Food Ontology Workshop, Sep 2021, Bolzano, Italy. 2969, 2021
Poster de conférence
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Florilege : a database gathering microbial phenotypes of food interest4th International Conference on Microbial Diversity 2017, Oct 2017, Bari, Italy. , 2017
Poster de conférence
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Un glossaire panification aux standards du web sémantique68. Journées Techniques des Industries Céréalières (JTIC), Nov 2017, Paris, France. , 2017
Poster de conférence
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Production of Flavor Compounds by Lactic Acid Bacteria in Fermented FoodsBiotechnology of Lactic Acid Bacteria Novel Applications, John Wiley and Sons Ltd, 2015, 978-0-8138-1583-1
Chapitre d'ouvrage
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Les légumineuses dans les produits agroalimentaires2023, 6p. ⟨10.17180/xtcv-5b27⟩
Autre publication scientifique
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Which crop biodiversity is used by the food industry throughout the world? A first evidence for legume species.2024
Pré-publication, Document de travail
(preprint/prepublication)
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Des ontologies pour la science2018
Cours
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