
Mathieu Giraud
Présentation
Mathieu Giraud, directeur de recherche CNRS en informatique au laboratoire CRIStAL (CNRS, Université de Lille, Centrale Lille), conçoit des méthodes algorithmiques pour étudier des séquences au service de projets culturels et de santé.
Mathieu dirige l'équipe d'informatique musicale Algomus qui travaille sur l'analyse, la modélisation, la visualisation et la génération de musique. Est-ce qu'un ordinateur peut aider à faire comprendre et même à faire apprécier la musique ? Ces travaux en humanités numériques concernent la mélodie, l'harmonie (accords, progressions d'accords, cadences), les rythmes, la texture musicale, pour finalement modéliser la structure et la forme musicale et proposer de nouvelles manières d'interagir et de valoriser le patrimoine et le matrimoine musical.
Mathieu a mené durant 15 ans des recherches sur l'analyse et la comparaison de séquences d'ADN et d'ARN, notamment dans l'équipe de bioinformatique Bonsai. Il continue de travailler sur des méthodes pour mieux connaître les populations de globules blancs, en particulier pour améliorer les diagnostics et les suivis de leucémie. Il est le responsable technique du consortium VidjilNet au sein d'Inria et s'intéresse à l'éthique des traitements de données médicales.
Mathieu collabore avec des musicien·nes (artistes, enseignant·es, grand public...) ainsi qu'avec des professionnel·les de santé. Il s'inscrit dans une démarche de science ouverte, en particulier sur les logiciels libres, et contribue à des politiques locales et nationales sur l'inclusivité et sur le genre, ainsi que sur les transports publics.
Publications
Publications
When Voices Interleave: Timing Deviations in Six Performances of Telemann's Fantasias for Solo FluteInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2025), 2025, Daejeon, South Korea
Communication dans un congrès
hal-05102415
v1
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Vers une taxonomie et une analyse des gestes guitaristiques dans le Brutal Death MetalJournées d'Informatique Musicale (JIM 2025), GRAME; Inria, Jun 2025, Lyon, France. pp.109-116
Communication dans un congrès
hal-05102344
v1
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What song now? Personalized Rhythm Guitar Learning in Western Popular MusicInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2025), 2025, Daejeon, South Korea
Communication dans un congrès
hal-05102412
v1
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Music with Numbers: Jianpu Number-Based Notation in Cultural Heritage and Digital HumanitiesMusic Encoding Conference (MEC 2025), 2025, London, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-05029666
v1
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Detection of orchestral blends in musical scoresSound and Music Computing (SMC 2025), 2025, Graz, Austria
Communication dans un congrès
hal-05049228
v1
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Suggestions pédagogiques personnalisées pour la guitareJournées d'Informatique Musicale (JIM 2024), May 2024, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-04564669
v1
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The CollabScore project – From Optical Recognition to Multimodal Music SourcesWoRMS 2024: 6th International Workshop on Reading Music Systems, Jorge Calvo-Zaragoza; Alexander Pacha; Elona Shatri, Nov 2024, Online, France. pp.33-37, ⟨10.48550/arXiv.2411.15741⟩
Communication dans un congrès
hal-04925968
v1
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Co-creative orchestration of Angeles with layer scores and orchestration plansInternational Conference on Artificial Intelligence in Music, Sound, Art and Design (EvoMUSART 2024), 2024, Aberystwyth, United Kingdom. ⟨10.1007/978-3-031-56992-0_15⟩
Communication dans un congrès
hal-04388097
v1
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Analyse et essai de reconstruction de structures arborescentes des grilles de jazzJournées d'Informatique Musicale (JIM 2023), May 2023, Paris, France. pp.62-67
Communication dans un congrès
hal-04196644
v1
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The Games We Play: Exploring The Impact of ISMIR on MusicologyInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2023), Nov 2023, Milano, Italy. pp.474-481, ⟨10.5281/zenodo.10265344⟩
Communication dans un congrès
hal-04142194
v1
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Adding descriptors to melodies improves pattern matching: a study on Slovenian folk songsInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2023), 2023, Milan, Italy. pp.474-481, ⟨10.5281/zenodo.10265328⟩
Communication dans un congrès
hal-04142315
v1
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The ‘Measure Map’: an inter-operable standard for aligning symbolic musicInternational Conference on Digital Libraries for Musicology (DLfM 2023), Nov 2023, Milano, Italy. ⟨10.1145/3625135.3625136⟩
Communication dans un congrès
hal-04197400
v1
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Soutenir en classe l'écoute active, l'autonomie et l'échange en analyse musicale avec la plateforme web DezrannJournées d'Informatique Musicale (JIM 2022) / Sound and Music Computing (SMC 2022), 2022, Saint-Étienne, France. pp.617-623, ⟨10.5281/zenodo.6800855⟩
Communication dans un congrès
hal-03618017
v1
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Modeling and Editing Cross-Modal Synchronization on a Label Web CanvasMusic Encoding Conference (MEC 2022), 2022, Halifax, Canada. pp.61-71, ⟨10.17613/krxd-pq66⟩
Communication dans un congrès
hal-03583179
v2
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Personalizing AI for Co-Creative Music Composition from Melody to StructureSound and Music Computing (SMC 2022), 2022, Saint-Étienne, France. pp.314-321, ⟨10.5281/zenodo.6573287⟩
Communication dans un congrès
hal-03618015
v1
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A Corpus Describing Orchestral Texture in First Movements of Classical and Early-Romantic SymphoniesDigital Libraries for Musicology (DLfM 2022), 2022, Prague, Czech Republic. pp.22-35
Communication dans un congrès
hal-03663112
v1
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What are the most used guitar positions?International Conference on Digital Libraries for Musicology (DLfM 2021), 2021, Online, United Kingdom. pp.84-92, ⟨10.1145/3469013.3469024⟩
Communication dans un congrès
hal-03279863
v1
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Symbolic Textural Features and Melody/Accompaniment Detection in String QuartetsInternational Symposium on Computer Music Multidisciplinary Research (CMMR 2021), Nov 2021, Online, Japan. pp.175-184
Communication dans un congrès
hal-03322543
v1
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Encodages de tablatures pour l'analyse de musique pour guitareJournées d'Informatique Musicale (JIM 2020), 2020, Strasbourg (en ligne), France
Communication dans un congrès
hal-02934382
v1
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Estimating keys and modulations in musical piecesSound and Music Computing Conference (SMC 2020), Simone Spagnol; Andrea Valle, Jun 2020, Torino, Italy
Communication dans un congrès
hal-02886399
v2
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L'informatique musicale : informatique et musique en interdisciplinaritéJournées d'Informatique Musicale (JIM 2019), May 2019, Bayonne, France
Communication dans un congrès
hal-02348292
v1
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Modeling and learning structural breaks in sonata formsInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2019), 2019, Delft, Netherlands. ⟨10.5281/zenodo.3527828⟩
Communication dans un congrès
hal-02162936
v2
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Realtime collaborative annotation of music scores with DezrannInternational Symposium on Computer Music Modeling and Retrieval (CMMR 2019), 2019, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-02162935
v1
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Génération photo-réaliste de défauts sur des images de surfaces extérieures d'avions acquises par un drone autonomeORASIS, journées francophones des jeunes chercheurs en vision par ordinateur, May 2019, Saint-Dié-des-Vosges, France
Communication dans un congrès
hal-02164953
v1
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Dezrann, a Web Framework to Share Music AnalysisInternational Conference on Technologies for Music Notation and Representation (TENOR 2018), May 2018, Montréal, Canada. pp.104-110
Communication dans un congrès
hal-01796787
v1
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Relevance of musical features for cadence detectionInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2018), 2018, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01801060
v1
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Sketching Sonata Form Structure in Selected Classical String Quartets ISMIR 2017 - International Society for Music Information Retrieval Conference, 2017, Suzhou, China
Communication dans un congrès
hal-01568703
v1
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Les pierres musicales, un dispositif pédagogique interactifJournées d'Informatique Musicale (JIM 2017), 2017, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01517519
v1
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Improving voice separation by better connecting contigsInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2016), Aug 2016, New York, United States
Communication dans un congrès
hal-01331551
v1
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Indexer un ensemble de séquences ADN annotéesJOBIM, Jun 2016, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-01576319
v1
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Modeling Musical Structure with Parametric GrammarsMathematics and Computation in Music (MCM 2015), Jun 2015, London, United Kingdom. pp.85-96, ⟨10.1007/978-3-319-20603-5_8⟩
Communication dans un congrès
hal-01205422
v1
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Modélisation et visualisation de schémas d'analyse musicale avec music21Journées d'Informatique Musicale (JIM 2015), 2015, Montréal, Canada
Communication dans un congrès
hal-01135118
v1
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Perfect Hashing Structures for Parallel Similarity SearchesInternational Workshop on High Performance Computational Biology (HiCOMB 2015) / International Parallel and Distributed Processing Symposium (IPDPS 2015), 2015, Hyderabad, India. pp.332-341, ⟨10.1109/IPDPSW.2015.105⟩
Communication dans un congrès
hal-01153893
v1
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Comparing Voice and Stream Segmentation AlgorithmsInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2015), Oct 2015, Malaga, Spain. pp.493-499
Communication dans un congrès
hal-01246693
v1
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Towards Modeling Texture in Symbolic DataInternational Society for Music Information Retrieval Conference - ISMIR, 2014, Taipei, Taiwan. pp.59-64
Communication dans un congrès
hal-01057017
v1
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Diagnostic et suivi des leucémies aiguës lymphoblastiques (LAL) par séquençage haut-débit (HTS)Congrès de la Société Française d'Hématologie (SFH), 2014, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01100152
v1
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Vers une analyse automatique des formes sonatesJournées d'Informatique Musicale (JIM 2014), 2014, Bourges, France. pp.113-118
Communication dans un congrès
hal-01009166
v1
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Searching for alternate RNA structures in genomic sequencesComputational Methods for Structural RNAs, CMSR'14, Sep 2014, Strasbourg, France. pp.13-24, ⟨10.15455/CMSR.2014.0002⟩
Communication dans un congrès
hal-01084319
v1
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Fragmentations with pitch, rhythm and parallelism constraints for variation matchingInternational Symposium on Computer Music Multidisciplinary Research (CMMR), Oct 2013, Marseille, France. pp.298-312, ⟨10.1007/978-3-319-12976-1_19⟩
Communication dans un congrès
hal-00906462
v2
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Suivi de la leucémie résiduelle par séquençage haut-débitJOBIM, Jul 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-00857581
v1
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Melodic contour representations in the analysis of children's songs3rd International Workshop on Folk Music Analysis, Jun 2013, Amsterdam, Netherlands. pp.40-43
Communication dans un congrès
hal-00826427
v1
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Subject and counter-subject detection for analysis of the Well-Tempered Clavier fuguesInternational Symposium on Computer Music Modelling and Retrieval (CMMR 2012), 2012, United Kingdom. pp.661-673
Communication dans un congrès
hal-00712554
v1
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Detecting Episodes with Harmonic Sequences for Fugue AnalysisISMIR - International Society for Music Information Retrieval Conference - 2012, 2012, Porto, Portugal
Communication dans un congrès
hal-00712565
v1
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Biomanycores, open-source parallel code for many-core bioinformaticsBioinformatics Open Source Conference (BOSC 2011), 2011, Vienne, Austria
Communication dans un congrès
inria-00623390
v1
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biomanycores.org: a repository of interoperable open-source code for many-core bioinformaticsJOBIM 2011, Jul 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-00637847
v1
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Bit-Parallel Multiple Pattern MatchingParallel Processing and Applied Mathematics / Parallel Biocomputing Conference (PPAM / PBC 11), 2011, Torun, Poland
Communication dans un congrès
inria-00637227
v1
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Rhythm extraction from polyphonic symbolic music12th International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2011), Oct 2011, United States. pp.375-380
Communication dans un congrès
hal-00636058
v1
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The Number of Runs in a Ternary WordPrague Stringology Conference 2010, Aug 2010, France. pp.178-181
Communication dans un congrès
hal-00533202
v1
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Biomanycores, a repository of interoperable open-source code for many-cores bioinformaticsBioinformatics Open Source Conference (BOSC), Jun 2009, Stockholm, Sweden
Communication dans un congrès
inria-00438224
v1
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Parallel Position Weight Matrices AlgorithmsInternational Symposium on Parallel and Distributed Computing (ISPDC 2009), Jul 2009, Lisboa, Portugal. pp.65-69, ⟨10.1109/ISPDC.2009.31⟩
Communication dans un congrès
inria-00438215
v1
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GPU Parallelization of Algebraic Dynamic ProgrammingParallel Processing and Applied Mathematics / Parallel Biocomputing Conference (PPAM / PBC 09), Sep 2009, Wroclaw, Poland
Communication dans un congrès
inria-00438219
v1
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Not so many runs in strings2nd International Conference on Language and Automata Theory and Applications (LATA 2008), Mar 2008, Tarragona, Spain
Communication dans un congrès
inria-00271630
v1
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Protein similarity search with subset seeds on a dedicated reconfigurable hardwareParallel Bio-Computing, Sep 2007, Gdansk,, Poland
Communication dans un congrès
inria-00178325
v1
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Seed-Based Exclusion Method for Non-coding RNA Gene Search13th Annual International Computing and Combinatorics Conference (COCOON 2007), Jul 2007, Banff, Canada. pp.27-39, ⟨10.1007/978-3-540-73545-8_6⟩
Communication dans un congrès
inria-00271642
v1
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Path-Equivalent Removal of Epsilon-Transitions2006, pp.23--33, ⟨10.1007/11812128_4⟩
Communication dans un congrès
istex
hal-00107094
v1
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Recherches de motifs et de similarités en bioinformatique : modélisations, solutions logicielles et matériellesMajecSTIC 2005 : Manifestation des Jeunes Chercheurs francophones dans les domaines des STIC, IRISA – IETR – LTSI, Nov 2005, Rennes/France, pp.18--37
Communication dans un congrès
inria-00001036
v1
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Organisation modulaire des séquences d'ADN répétées: application à l'étude des hélitrons non-autonomes dans le génome d'Arabidopsis thalianaXIIIe colloque Eléments Transposables, 2005, Orsay, France
Communication dans un congrès
hal-00015261
v1
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mreps: a program for exhaustive search for tandem repeats in DNA sequencesSixth Annual International Conference on Research in Computational Biology - RECOMB 2002, Apr 2002, Washington, DC, US
Communication dans un congrès
inria-00100869
v1
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Maximal Repetitions and Application to DNA sequencesJournées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'2000, 2000, Montpellier/France, pp.165--172
Communication dans un congrès
inria-00107854
v1
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One-Step Next-Generation Sequencing of Immunoglobulin and T-Cell Receptor Gene Recombinations for MRD Marker Identification in Acute Lymphoblastic LeukemiaAnton W. Langerak. Immunogenetics. Methods and Protocols, 2453, Springer, pp.43-59, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2115-8. ⟨10.1007/978-1-0716-2115-8_3⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03684695
v1
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Immunoglobulin Gene Mutational Status Assessment by Next Generation Sequencing in Chronic Lymphocytic LeukemiaAnton W. Langerak. Immunogenetics, 2453, Springer, pp.153-167, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-2115-8. ⟨10.1007/978-1-0716-2115-8_10⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03684717
v1
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Computational Analysis of Musical FormDavid Meredith. Computational Music Analysis, Springer, pp.113-136, 2016, 978-3-319-25929-1. ⟨10.1007/978-3-319-25931-4_5⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01231201
v1
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Manycore high-performance computing in bioinformaticsLaura Elnitski, Helen Piontkivska, Lonnie R Welch. Advances in Genomic Sequence Analysis and Pattern Discovery, World Scientific, chapter 8, 2011
Chapitre d'ouvrage
hal-00563408
v1
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Bioinformatics ApplicationsGokhale, Maya B., Graham, Paul S. Reconfigurable Computing. Accelerating Computation with Field-Programmable Gate Arrays, Springer, 2005, Foundation of computing, 0-387-26105-2
Chapitre d'ouvrage
inria-00000501
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Towards modeling alternating patterns through inter-notes relations23rd International Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2022), Late-Breaking Demo Session, Dec 2022, Bangalore, India. , pp.LV10
Poster de conférence
hal-03951420
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Towards Custom Dilated Convolutions on Pitch SpacesInternational Society for Music Information Retrieval Conference (ISMIR 2020), Late-Breaking Demo Session, 2020, Montréal, Canada. Extended Abstracts for the Late-Breaking Demo Session of the 21st Int. Society for Music Information Retrieval Conference
Poster de conférence
hal-02959676
v1
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Modelling Keys and Modulation with Scales and Harmonic ProgressionsDigital Music Research Network Workshop (DMRN+14), 2019, London, France
Poster de conférence
hal-02392389
v1
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Vers une recherche automatisée du parcours tonalLes sciences de la musique, 2019, Paris, France.
Poster de conférence
hal-01972701
v1
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Using Dezrann in Musicology and MIR ResearchDigital Libraries for Musicology (DLfM 2018), 2018, Paris, France
Poster de conférence
hal-01871713
v1
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Une application web interactive pour l'analyse musicaleEuropean Music Analysis Conference (EuroMAC 2017), 2017, Strasbourg, France. 2017
Poster de conférence
hal-01517517
v1
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Multiclonal Diagnosis and MRD Follow-up in ALL with HTS Coupled with a Bioinformatic AnalysisAmerican Society of Hematology Annual Meeting, 2014, San Francisco, France. , 2014
Poster de conférence
hal-01100290
v1
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Towards Detecting Interleaved Voices in Telemann Flute FantasiasDMRN+19: Digital Music Research Network One-day Workshop, 2024
Autre publication scientifique
hal-04923955
v1
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From local markers to global form: Computational modeling of musical structure2021
Autre publication scientifique
hal-03302275
v1
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As We Are BlindŒuvres et Recherches, 2019, pp.2019:01
Autre publication scientifique
hal-02379772
v1
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Algo-RythmeŒuvres et Recherches, 2019, pp.2019:05
Autre publication scientifique
hal-02379793
v1
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Fixing the Horse before the Cart: Reconstructing the Genesis of Classical Forms through Big Data and Computational Methods2018
Autre publication scientifique
hal-01972691
v1
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A dataset of sequences with manually curated V(D)J designations2016
Autre publication scientifique
hal-01331556
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Introducing The Digitised Dataset of Slovenian Folk Ballads2025
Pré-publication, Document de travail
hal-05040730
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Establishing a national research software award2023
Pré-publication, Document de travail
hal-04258977
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What does the Mongeau-Sankoff algorithm compute?2019
Pré-publication, Document de travail
hal-02340896
v1
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Compter les globules blancs, analyser les partitionsInformatique [cs]. Université de Lille 1 – Sciences et Technologies, 2016
HDR
tel-01577763
v1
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“Software and source codes” College: Minutes from the work session, November 30th 2023Comité pour la Science Ouverte. 2024
Rapport
hal-04683957
v1
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Highlights of the "Software Pillar of Open Science" workshopComité pour la Science Ouverte. 2024
Rapport
hal-04600258
v1
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Médiation Scientifique : une facette de nos métiers de la recherche[Interne] Inria. 2013, pp.34
Rapport
hal-00804915
v1
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DezrannLogiciel hal-04434328 v1 |
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VidjilLogiciel hal-04453057 v1 |