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Dynamics of the viral community on the surface of a French smear-ripened cheese during maturation and persistence across production years
Thomas Paillet
,
Quentin Lamy-Besnier
,
Clarisse Figueroa
,
Marie-Agnès Petit
,
Eric Dugat-Bony
Article dans une revue
hal-04616642
v1
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T7 DNA polymerase treatment improves quantitative sequencing of both double-stranded and single-stranded DNA viruses
Maud Billaud
,
Ilias Theodorou
,
Quentin Lamy-Besnier
,
Shiraz Shah
,
François Lecointe
et al.
Article dans une revue
hal-04662155
v1
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Escherichia coli CRISPR arrays from early life fecal samples preferentially target prophages
Moïra Dion
,
Shiraz Shah
,
Ling Deng
,
Jonathan Thorsen
,
Jakob Stokholm
et al.
Article dans une revue
hal-04662284
v1
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Comparison of interferometric light microscopy with nanoparticle tracking analysis for the study of extracellular vesicles and bacteriophages
Romain Sausset
,
Zuzana Krupova
,
Eric Guédon
,
Sandrine Peron
,
Alice Grangier
et al.
Article dans une revue
hal-04003317
v2
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Phage production is blocked in the adherent-invasive Escherichia coli LF82 upon macrophage infection
Pauline Misson
,
Emma Bruder
,
Jeffrey Cornuault
,
Marianne de Paepe
,
Pierre Nicolas
et al.
Article dans une revue
hal-04017385
v1
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The infant gut virome is associated with preschool asthma risk independently of bacteria
Cristina Leal Rodríguez
,
Shiraz Shah
,
Morten Arendt Rasmussen
,
Jonathan Thorsen
,
Ulrika Boulund
et al.
Article dans une revue
hal-04557618
v1
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The book of Lambda does not tell us that naturally occurring lysogens of Escherichia coli are likely to be resistant as well as immune
Brandon Berryhill
,
Rodrigo Garcia
,
Ingrid Mccall
,
Joshua Manuel
,
Waqas Chaudhry
et al.
Article dans une revue
hal-04276102
v1
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Expanding known viral diversity in the healthy infant gut
Shiraz A Shah
,
Ling Deng
,
Jonathan Thorsen
,
Anders G Pedersen
,
Moïra B Dion
et al.
Article dans une revue
hal-04276100
v1
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Streptococcus pyogenes Φ1207.3 Is a Temperate Bacteriophage Carrying the Macrolide Resistance Gene Pair mef (A)- msr (D) and Capable of Lysogenizing Different Streptococci
Francesco Santoro
,
Gabiria Pastore
,
Valeria Fox
,
Marie-Agnès Petit
,
Francesco Iannelli
et al.
Article dans une revue
hal-04009741
v1
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PHROG: families of prokaryotic virus proteins clustered using remote homology
Paul Terzian
,
Eric Olo Ndela
,
Clovis Galiez
,
Julien Lossouarn
,
Rubén Enrique Pérez Bucio
et al.
Article dans une revue
hal-03580568
v1
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Virulent Phages Isolated from a Smear-Ripened Cheese Are Also Detected in Reservoirs of the Cheese Factory
Thomas Paillet
,
Julien Lossouarn
,
Clarisse Figueroa
,
Cédric Midoux
,
Olivier Rué
et al.
Article dans une revue
hal-03738602
v1
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Signals triggering prophage induction in the gut microbiota
Caroline Henrot
,
Marie-Agnès Petit
Article dans une revue
hal-04276105
v1
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Analysis of viromes and microbiomes from pig fecal sample reveals that phages and prophages rarely carry antibiotic resistance genes
Maud Billaud
,
Quentin Lamy-Besnier
,
Julien Lossouarn
,
Elisabeth Moncaut
,
Moira Dion
et al.
Article dans une revue
hal-03299373
v1
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Bacterial Consumption of T4 Phages
Jean-Jacques Godon
,
Ariane Bize
,
Hoang Ngo
,
Laurent Cauquil
,
Mathieu Almeida
et al.
Article dans une revue
hal-03386267
v1
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The enemy from within: a prophage of Roseburia intestinalis systematically turns lytic in the mouse gut, driving bacterial adaptation by CRISPR spacer acquisition
Jeffrey Cornuault
,
Elisabeth Moncaut
,
Valentin Loux
,
Aurélie Mathieu
,
Harry Sokol
et al.
Article dans une revue
hal-02504597
v1
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New insights into intestinal phages
Romain Sausset
,
Marie-Agnès Petit
,
V. Gaboriau-Routhiau
,
Marianne de Paepe
Article dans une revue
hal-02912995
v1
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Un siècle de recherche sur les bactériophages
Mireille Ansaldi
,
Pascale Boulanger
,
Charlotte Brives
,
Laurent Debarbieux
,
Nicolas Dufour
et al.
Article dans une revue
(article de synthèse)
hal-02530997
v1
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|
Les applications antibactériennes des bactériophages
Mireille Ansaldi
,
Pascale Boulanger
,
Charlotte Brives
,
Claire Le Hénaff
,
Laurent Debarbieux
et al.
Article dans une revue
(article de synthèse)
hal-02530998
v1
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|
The enemy from within: a prophage of Roseburia intestinalis systematically turns lytic in the mouse gut, driving bacterial adaptation by CRISPR spacer acquisition
Jeffrey Cornuault
,
Elisabeth Moncaut
,
Valentin Loux
,
Aurélie Mathieu
,
Harry Sokol
et al.
Article dans une revue
hal-03998790
v1
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|
Virulent coliphages in 1-year-old children fecal samples are fewer, but more infectious than temperate coliphages
Aurélie Mathieu
,
Moïra Dion
,
Ling Deng
,
Denise Tremblay
,
Elisabeth Moncaut
et al.
Article dans une revue
(data paper)
hal-04009707
v1
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|
Viral metagenomic analysis of the cheese surface: A comparative study of rapid procedures for extracting viral particles
Eric Dugat-Bony
,
Julien Lossouarn
,
Marianne de Paepe
,
Anne-Sophie Sarthou
,
Yasmina Fedala
et al.
Article dans une revue
hal-02623156
v1
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Enterococcus faecalis Countermeasures Defeat a Virulent Picovirinae Bacteriophage
Julien Lossouarn
,
Arnaud Briet
,
Elisabeth Moncaut
,
Sylviane Furlan
,
Astrid Bouteau
et al.
Article dans une revue
hal-02173127
v1
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|
Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG)
Simon Roux
,
Evelien M. Adriaenssens
,
Bas E. Dutilh
,
Eugene V. Koonin
,
Andrew M. Kropinski
et al.
Article dans une revue
pasteur-01977322
v1
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|
“French Phage Network”-Third Meeting Report
Mireille Ansaldi
,
Laurent Debarbieux
,
Sylvain Gandon
,
Marie-Agnès Petit
,
Paulo Tavares
et al.
Article dans une revue
pasteur-01827313
v1
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Phages infecting Faecalibacterium prausnitzii belong to novel viral genera that help to decipher intestinal viromes
Jeffrey K. Cornuault
,
Marie-Agnès Petit
,
Mahendra Mariadassou
,
Leandro Benevides
,
Elisabeth Moncaut
et al.
Article dans une revue
hal-01774632
v1
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Sak4 of Phage HK620 Is a RecA Remote Homolog With Single-Strand Annealing Activity Stimulated by Its Cognate SSB Protein
Geoffrey Hutinet
,
Arthur Besle
,
Olivier Son
,
Stephen Mcgovern
,
Raphaël Guérois
et al.
Article dans une revue
hal-02179070
v1
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Domestication of Lambda Phage Genes into a Putative Third Type of Replicative Helicase Matchmaker
Pierre Brézellec
,
Marie-Agnès Petit
,
Sophie Pasek
,
Isabelle Vallet-Gely
,
Christophe Possoz
et al.
Article dans une revue
hal-01579131
v1
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|
Phages rarely encode antibiotic resistance genes: a cautionary tale for virome analyses.
F Enault
,
A Briet
,
L Bouteille
,
Stéphane Roux
,
Mb Sullivan
et al.
Article dans une revue
hal-01557484
v1
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|
Bactériophages et dysbioses intestinales
Marianne de Paepe
,
Jeffrey Cornuault
,
Marie-Agnès Petit
Bulletin de l'Association des Anciens Elèves de l'Institut Pasteur, 2016, 58 (226), pp.7-10
Article dans une revue
(article de synthèse)
hal-01533893
v1
|
|
Phagonaute: A web-based interface for phage synteny browsing and protein function prediction
Hadrien Delattre
,
Oussema Souiai
,
Khema Fagoonee
,
Raphaël Guérois
,
Marie-Agnès Petit
Article dans une revue
hal-01357336
v1
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Complete Genome Sequences of Pseudomonas aeruginosa Phages vB_PaeP_PcyII-10_P3P1 and vB_PaeM_PcyII-10_PII10A.
Christine Pourcel
,
Cédric Midoux
,
Libera Latino
,
Marie-Agnès Petit
,
Gilles Vergnaud
Article dans une revue
hal-01439325
v1
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|
Bactériophages et microbiote intestinal
Marianne de Paepe
,
Marie-Agnès Petit
Bulletin de l'Association des Anciens Elèves de l'Institut Pasteur, 2016, 58 (226), pp.4-6
Article dans une revue
(article de synthèse)
hal-01533892
v1
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Bacterial genome remodeling through bacteriophage recombination
Rachid Menouni
,
Geoffrey Hutinet
,
Marie-Agnès Petit
,
Mireille Ansaldi
Article dans une revue
hal-01204494
v1
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Shifting the paradigm from pathogens to pathobiome: new concepts in the light of meta-omics
Muriel Vayssier Taussat
,
Emmanuel Albina
,
Christine Citti
,
Jean-Franҫois Cosson
,
Marie-Agnès Jacques
et al.
Article dans une revue
(article de synthèse)
hal-01153583
v1
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Bacteriophages: an underestimated role in human and animal health ?
Marianne de Paepe
,
Marion Leclerc
,
Marie-Agnès Petit
,
Colin R. Tinsley
Article dans une revue
hal-03665153
v1
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Small variable segments constitute a major type of diversity of bacterial genomes at the species level.
Fabrice Touzain
,
Erick Denamur
,
Claudine Médigue
,
Valérie Barbe
,
Meriem El Karoui
et al.
Article dans une revue
inserm-00622573
v1
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Organised genome dynamics in the Escherichia coli species results in highly diverse adaptive paths.
Marie Touchon
,
Claire Hoede
,
Olivier Tenaillon
,
Valérie Barbe
,
Simon Baeriswyl
et al.
Article dans une revue
hal-00390293
v1
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The lambda red proteins promote efficient recombination between diverged sequences: implications for bacteriophage genome mosaicism.
Jann T. Martinsohn
,
Miroslav Radman
,
Marie-Agnès Petit
Article dans une revue
inserm-00496049
v1
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UvrD helicase, unlike Rep helicase, dismantles RecA nucleoprotein filaments in Escherichia coli
Xavier Veaute
,
Stéphane Delmas
,
Marjorie Selva
,
Josette Jeusset
,
Eric Le Cam
et al.
Article dans une revue
hal-03065307
v1
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