Mathieu Bolteau

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Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N)
Combinatoire et Bioinformatique (LS2N - équipe COMBI)
Nantes Université (Nantes Univ)

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Publications

Deep exploration of logical models of cell differentiation in human preimplantation embryos

Mathieu Bolteau , Célia Messaoudi , Laurent David , Jérémie Bourdon , Carito Guziolowski

npj Systems Biology and Applications, 2025, 11 (1), pp.57. ⟨10.1038/s41540-025-00537-7⟩

Article dans une revue hal-05124943v1

Seed2LP: seed inference in metabolic networks for reverse ecology applications

Chabname Ghassemi Nedjad , Mathieu Bolteau , Lucas Bourneuf , Loïc Paulevé , Clémence Frioux

Bioinformatics, 2025, 41 (4), pp.btaf140. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf140⟩

Article dans une revue hal-04713829v1

Boolean Network Models of Human Preimplantation Development

Mathieu Bolteau , Lokmane Chebouba , Laurent David , Carito Guziolowski , Jérémie Bourdon

Journal of Computational Biology, 2024, 31 (6), pp.513-523. ⟨10.1089/cmb.2024.0517⟩

Article dans une revue hal-04673351v1

Predicting weighted unobserved nodes in a regulatory network using answer set programming

Sophie Le Bars , Carito Guziolowski , Jérémie Bourdon , Mathieu Bolteau

BMC Bioinformatics, 2023, 24 (S1), pp.321. ⟨10.1186/s12859-023-05429-3⟩

Article dans une revue hal-04601023v1

The SSV‐Seq 2.0 PCR‐Free Method Improves the Sequencing of Adeno‐Associated Viral Vector Genomes Containing GC‐Rich Regions and Homopolymers

Emilie Lecomte , Sylvie Saleun , Mathieu Bolteau , Aurélien Guy‐duché , Oumeya Adjali et al.

Biotechnology Journal, 2020, 16 (1), pp.e2000016. ⟨10.1002/biot.202000016⟩

Article dans une revue inserm-03190100v1

Boolean Network Models of Human Preimplantation Development

Mathieu Bolteau , Lokmane Chebouba , Laurent David , Jérémie Bourdon , Carito Guziolowski

2024

Pré-publication, Document de travail hal-04579386v1

Inferring Boolean Networks from Single-Cell Human Embryo Datasets

Mathieu Bolteau , Jérémie Bourdon , Laurent David , Carito Guziolowski

2023

Pré-publication, Document de travail hal-04206397v1

Predicting weighted unobserved nodes in a regulatory network using Answer Set Programming

Sophie Le Bars , Mathieu Bolteau , Jérémie Bourdon , Carito Guziolowski

2023

Pré-publication, Document de travail hal-04047587v1

Logic programs to infer computational models of human embryonic development

Mathieu Bolteau

Computation and Language [cs.CL]. Nantes Université, 2024. English. ⟨NNT : 2024NANU4046⟩

Thèse tel-04991558v1

Inferring Boolean Networks from Single-Cell Human Embryo Datasets

Mathieu Bolteau , Jérémie Bourdon , Laurent David , Carito Guziolowski

19th International Symposium on Bioinformatics Research and Applications, ISBRA 2023, Oct 2023, Wrocław, Poland. pp.431-441, ⟨10.1007/978-981-99-7074-2_34⟩

Communication dans un congrès hal-04601243v1

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